从植物脂质生产工业产品的方法与流程

本发明涉及从植物脂质，特别是从植物的营养性部分生产工业产品的方法。特别地，本发明提供油产品如生物柴油和合成柴油以及生产这些的方法，以及具有升高水平的一种或多种非极性脂质如三酰甘油和增加的总非极性脂质含量的植物。在一特定实施方案中，本发明涉及脂质操作酶、油体蛋白(oilbodyprotein)、减少脂质分解代谢酶和/或调节脂质生物合成的转录因子中的两种或更多种的修饰的组合，以便提高植物或其任何部分中的一种或多种非极性脂质和/或总非极性脂质含量和/或单不饱和脂肪酸含量的水平。在一实施方案中，本发明涉及一种提取脂质的方法。在另一实施方案中，在收获的植物营养性部分中将脂质转化为一种或多种烃类产品以产生脂肪酸的烷基酯，其适合用作可再生的生物柴油燃料。发明背景世界能源的大部分，特别是用于运输的能源，是由石油衍生燃料所提供，其供应有限。需要可再生的替代来源，如来自生物学产生的油。三酰甘油生物合成三酰甘油(TAG)构成了种子中脂质的主要形式并且由酯化至甘油骨架的三个酰基链所组成。脂肪酸在质体中作为酰基-酰基载体蛋白(ACP)中间体合成，在此其可经历第一次催化的去饱和。此反应由硬脂酰基-ACP去饱和酶催化并产生油酸(C18：1Δ9)。随后，酰基链作为酰基辅酶(CoA)硫酯被转移至细胞质和内质网(ER)。在进入主要TAG生物合成途径之前，也已知为Kennedy或甘油-3-磷酸(G3P)途径，酰基链通常被整合至ER膜的磷脂中，在此其可经历进一步去饱和。多不饱和脂肪酸生产中的两种关键酶是膜结合的FAD2和FAD3去饱和酶，其分别产生亚油酸(C18：2Δ9，12)和α-亚麻酸(C18：3Δ9，12，15)。经Kennedy途径的TAG生物合成由一系列相继的酰基化所组成，每个均使用酰基-CoA酯作为酰基-供体。第一个酰基化步骤通常在G3P骨架的sn1-位置处发生并由甘油-3-磷酸酰基转移酶(sn1-GPAT)催化。产物sn1-溶血磷脂酸(sn1-LPA)作为溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT)的底物，其将第二个酰基链连接至sn2-位置以形成磷脂酸。PA进一步被磷脂酸磷酸酶(PAP)去磷酸化成二酰甘油(DAG)，由此提供用于最后的酰基化步骤的底物。最后，第三个酰基链在由二酰甘油酰基转移酶(DGAT)催化的反应中被酯化至DAG的sn3-位置，以形成在油体中聚集的TAG。第二个酶反应，磷脂酰甘油酰基转移酶(PDAT)，也导致DAG被转化成TAG。此反应与DGAT无关并且使用磷脂作为酰基-供体。为了最大程度提高脂质商业生产的产率，需要提高转基因生物或其部分诸如植物、种子、叶、藻类和真菌中脂质(尤其是非极性脂质诸如DAG和TAG)水平的更多措施。提高植物中的中性脂质产量的尝试主要集中在脂肪酸生物合成或TAG组装中所涉及的单个关键酶促步骤。然而这些策略已导致种子或叶中油含量一般程度的提高。最近在产油酵母解脂耶氏酵母(Yarrowialipolytica)中的代谢工程工作已证实提高甘油-3-磷酸生产和防止TAG经β-氧化破坏的组合手段导致总脂质含量的累积增加(Dulermoeta1.，2011)。植物脂质诸如种子油三酰甘油(TAG)具有许多用途，例如烹饪用途(起酥油、质地、调味)、工业用途(用于肥皂、蜡烛、香水、化妆品、适合作为干燥剂、绝缘体、润滑剂)，以及提供营养价值。使用植物脂质生产生物燃料的兴趣也在不断增长。为了最大程度提高脂质商业生物生产的产率，需要提高转基因生物或其部分诸如植物、种子、叶、藻类和真菌中脂质(尤其是非极性脂质诸如DAG和TAG)水平的更多措施。发明概述本发明人已发现一种从营养性植物部分生产油产品的方法。在第一方面，本发明提供一种生产油产品的方法，所述方法包括以下步骤：(i)在反应器中处理组合物，所述组合物包含(a)营养性植物部分，其干重为至少2g，并且在干重基础上其具有至少5重量％的总非极性脂质含量，(b)溶剂，其包含水、醇或两者，以及(c)任选存在的催化剂，其中所述处理包括在氧化、还原或惰性环境中于约50℃-约450℃的温度和5-350巴的压力下加热所述组合物1-120分钟，(ii)以相对于所述营养性植物部分的干重至少35重量％的收率从所述反应器回收油产品，从而生产所述油产品。在一实施方案中，所述营养性植物部分具有至少1kg的干重。在一实施方案中，在干重基础上，所述营养性植物部分具有至少10％、至少15％、至少20％、约25％、约30％、约35％、10％-75％、20％-75％或优选30％-75％的总非极性脂质含量。在一实施方案中，所述组合物具有5％-90％，优选15％-50％(干重/重量)的固体浓度。可以使用任何合适的催化剂。在一实施方案中，所述催化剂为碱、酸或贵金属催化剂。例如，在一实施方案中，所述催化剂包含NaOH或KOH或两者，优选浓度为0.1M-2M。在一实施方案中，所述处理时间为1-60分钟，优选10-60分钟，更优选15-30分钟。在一实施方案中，当压力少于50巴时，反应时间可以长达24小时或甚至长达7天。在一优选实施方案中，温度为275℃-360℃，压力为100-200巴，并且反应发生在10-60min中。在一实施方案中，如果所述溶剂为水，则所述方法产生最小36重量％、37重量％、38重量％、39重量％或40重量％以及最大55重量％或优选60重量％(相对于所述营养性植物部分的干重)之间的油产品收率。在这个实施方案中，所述油产品包含比脂肪酰基酯多至少2-倍，优选至少3-倍的碳氢化合物。优选地，所述油产品包含35％，更优选40％C13-C22碳氢化合物。在另一实施方案中，如果所述溶剂包含醇，优选甲醇，则所述方法产生最小36重量％、37重量％、38重量％、39重量％或40重量％以及最大65重量％或优选70重量％(相对于所述营养性植物部分的干重)之间的油产品收率。在这个实施方案中，所述油产品包含比碳氢化合物多至少1.5-倍，优选至少2-倍的脂肪酰基酯。优选地，所述油产品包含40％，更优选50％脂肪酸甲基酯。在另一实施方案中，如果所述溶剂包含约80％水，则所述油产品包含约30％的C13-C22碳氢化合物，优选约35％，更优选约40％C13-C22碳氢化合物。在另一实施方案中，如果所述溶剂包含约50％甲醇，则所述油产品包含约50％脂肪酸甲基酯(FAME)。在另一实施方案中，回收的油产品具有少于约15重量％，优选少于5重量％的水含量。在另一实施方案中，相对于利用相应营养性植物部分(在干重基础上其非极性脂质含量少于2％)的相应方法，油产品的收率大至少2重量％，优选大至少4重量％。在一实施方案中，已通过干燥、劈砍(chopping)、切碎(shredding)、磨制(milling)、辗压(rolling)、压榨(pressing)、破碎(crashing)或研磨(grinding)中的一种或多种物理加工步骤(i)(a)中的营养性植物部分。在一可选实施方案中，所述营养性植物部分在制备所述组合物之前尚未干燥至少于10％的水分含量。例如，所述营养性植物部分具有至少20％或至少30％的水分含量，或者所述营养性植物部分保留在它们收获时具有的至少50％的水含量。在一实施方案中，所述方法进一步包括以下一个或多个：(i)回收的油产品的加氢脱氧，(ii)用氢处理回收的油产品以降低所述油产品中的酮或糖水平，(iii)从回收的油产品生产合成气，以及(iv)分级分离回收的油产品以生产燃料油、柴油、煤油或汽油中的一种或多种。例如，分级分离步骤是通过分馏的。在一实施方案中，所述营养性植物部分包含植物叶、茎或两者。在一实施方案中，所述营养性植物部分包含如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰的组合。本发明人还证实通过操纵脂肪酸生物合成、脂质组装和脂质包装途径，以及减少的脂质分解代谢，生物体的脂质含量显著增加，特别是在植物的营养性部分和种子中。基因的各种组合和基因表达的减少用来实现油含量的大幅增加，其对于生物燃料和其它衍生自油的工业产品具有重要意义。在第二方面，本发明提供一种重组真核细胞，其包含：a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，以及以下任何一种或两种或全部三种c)第一遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，d)第三外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少第四外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述细胞质体，以及e)第四外源多核苷酸，其编码增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的第二转录因子多肽，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。在一实施方案中，所述细胞包含a)、b)和c)，以及任选存在的d)或e)。在一实施方案中，所述细胞包含a)、b)和d)，以及任选存在的c)或e)。在一实施方案中，所述细胞包含a)、b)和e)，以及任选存在的c)或d)。在一实施方案中，所述细胞进一步包含以下一种或多种或全部：a)第五多核苷酸，其编码油体包衣(0BC)多肽，优选脂滴相关蛋白(LDAP)，b)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽的内源生成和/或活性，以及c)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，所述重组真核细胞包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，以及c)第一遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子，并且任选地所述细胞进一步包含以下一种或多种或全部：d)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(0BC)多肽，优选LDAP，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述细胞质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽的内源生成和/或活性，g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，所述细胞是来自植物的营养性部分或植物的营养性部分中的植物细胞，并且一种或多种或全部启动子在所述营养性部分中以相对于植物的种子更高的水平表达。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第二外源多核苷酸但缺少每个c)、d)和e)的相应细胞，c)、d)或e)的存在，连同第一和第二外源多核苷酸增加所述细胞的总非极性脂质含量，优选营养性植物部分如叶或茎中的细胞。更优选地，所述增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且参与所述细胞中TAG的分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一实施方案中，当存在时，两个转录因子为WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在上述实施方案中，优选所述细胞在植物的营养性部分中，其生长在土壤中或者其生长在土壤中且随后收获所述植物部分，并且其中在重量基础上，所述细胞包含至少8％TAG(％干重)，例如8％-75％或8％-30％。更优选地，TAG含量为至少10％，例如10％-75％或10％-30％。优选地，这些TAG水平在植物开花之前或开花时或者在植物发育的结实期之前存在于营养性部分中。在这些实施方案中，优选叶中的TAG含量比植物茎中的TAG含量的比例为1∶1-10∶1，和/或所述比例相对于包含第一和第二外源多核苷酸且缺少第一遗传修饰的相应细胞增加。在上述实施方案中，所述细胞优选包含编码DGAT的外源多核苷酸和下调外源SDP1脂肪酶生成的遗传修饰。更优选地，所述细胞不含编码PDAT的外源多核苷酸，和/或是除本氏烟草(Nicotianabenthamiana)细胞以外的细胞，和/或WRI1是除拟南芥(Arabidopsisthaliana)WRI1(SEQIDNO：21或22)以外的WRI1。最优选地，所述细胞中至少一种外源多核苷酸表达自不是组成型启动子的启动子，例如优先在植物的绿色组织或茎中表达或者在开始开花之后或衰老期间上调的启动子。在第三方面，本发明提供一种重组真核细胞，其包含：a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，以及c)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选脂滴相关多肽(LDAP)，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子，并且其中相对于包含第三外源多核苷酸(其核苷酸序列与SEQIDNO：176提供的序列互补)的相应细胞，所述重组真核细胞具有升高水平的一种或多种非极性脂质，和/或增加量的OBC多肽。在一实施方案中，上述方面的细胞进一步包含以下一种或多种或全部：d)第一遗传修饰，与缺少所述第一遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述细胞质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽的内源生成和/或活性，g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，所述细胞包含编码两种不同转录因子多肽的两种外源多核苷酸，所述转录因子多肽增加所述细胞中一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因的表达，如WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第二外源多核苷酸但缺少第三外源多核苷酸的相应植物细胞，编码OBC多肽(优选LDAP)的第三外源多核苷酸的存在，连同第一和第二外源多核苷酸增加植物细胞的总非极性脂质含量，优选营养性植物部分如叶或茎中的细胞。更优选地，所述增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在第四方面，本发明提供一种重组真核细胞，其包含质体和第一外源多核苷酸，所述第一外源多核苷酸编码增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及以下一个或多个或全部；a)第二外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第二外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述细胞质体，b)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽的内源生成和/或活性，c)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。在一实施方案中，所述细胞，优选植物细胞，包含a)以及任选存在的b)或c)。在一实施方案中，上述方面的细胞进一步包含以下一个或多个或全部：d)第三外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，e)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，以及f)第四外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP。在一优选实施方案中，所述细胞，优选植物细胞，包含第一、第二和第三外源多核苷酸以及任选存在的第三遗传修饰或第四外源多核苷酸。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第三(如果存在)外源多核苷酸但缺少第二外源多核苷酸的相应植物细胞，编码增加脂肪酸输出所述细胞质体的多肽(优选脂肪酰基硫酯酶如FATA多肽)的第二外源多核苷酸的存在，连同第一和第三(如果存在)外源多核苷酸增加植物细胞的总非极性脂质含量，优选营养性植物部分如叶或茎中的细胞。更优选地，第二外源多核苷酸提供的增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1-样多肽，优选除拟南芥WRI1(SEQIDNO：21或22)以外的转录因子，并且增加脂肪酸输出所述细胞质体的多肽是脂肪酸硫酯酶，优选FATA或FATB多肽，更优选除中链脂肪酸硫酯酶以外的FATA多肽或脂肪酸硫酯酶。相对于缺少编码硫酯酶的外源多核苷酸的相应细胞，所述细胞的总脂肪酸含量中的C12：0和/或C14：0脂肪酸的百分比不相上下，表明除中链硫酯酶以外的硫酯酶的存在。优选地，所述细胞进一步包含编码DGAT的外源多核苷酸和下调外源SDP1脂肪酶生成的遗传修饰。在一实施方案中，减少的SDP1脂肪酶生成与转录因子和脂肪酸硫酯酶协同作用以增加所述细胞中的总非极性脂质含量。更优选地，所述细胞不含编码PDAT的外源多核苷酸，和/或是除本氏烟草细胞以外的细胞。最优选地，所述细胞中至少一种外源多核苷酸表达自不是组成型启动子的启动子，例如优先在植物的绿色组织或茎中表达或者在衰老期间上调的启动子。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽是TGD多肽。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，增加脂肪酸输出所述细胞质体的多肽是脂肪酸硫酯酶，优选FATA或FATB多肽，并且参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽是TGD多肽。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，增加脂肪酸输出所述细胞质体的多肽是脂肪酸硫酯酶，优选FATA或FATB多肽，并且参与二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一实施方案中，增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽是TGD多肽，并且参与二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一实施方案中，所述细胞包含编码两种不同转录因子多肽的两种外源多核苷酸，所述转录因子多肽增加所述细胞中一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因的表达，如WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在第二、第三和第四方面的实施方案中，当所述细胞包含编码脂肪酸硫酯酶如FATA或FATB多肽的外源多核苷酸时，所述硫酯酶优选是FATA多肽或除中链脂肪酸硫酯酶以外的脂肪酸硫酯酶。在第五方面，本发明提供一种重组真核细胞，其包含：a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，优选WRI转录因子，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，所述多肽是对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性的LPAAT，以及c)第三外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第三外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加C8-C14脂肪酸输出所述细胞质体，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。在一实施方案中，所述第三外源多核苷酸编码硫酯酶，优选对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性的FATB硫酯酶。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第二外源多核苷酸但缺少第三外源多核苷酸的相应植物细胞，编码增加C8-C14脂肪酸输出所述细胞质体的多肽的第三外源多核苷酸的存在，连同第一和第二外源多核苷酸增加所述细胞的总MCFA含量，优选营养性植物部分如叶、根或茎中的细胞。更优选地，第三外源多核苷酸提供的增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，编码对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性的FATB硫酯酶的外源多核苷酸包含序列如SEQIDNO：193-199中任一个所示的氨基酸，或者其任一个的生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：193-199中的任一个或多个至少30％相同的多肽。更优选地，编码对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性的FATB硫酯酶的外源多核苷酸包含序列如SEQIDNO：193-199所示的氨基酸，或者其任一个的生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：193-199中的任一个或两个至少30％相同的多肽。在第五方面的一实施方案中，所述转录因子不是拟南芥WRI1(SEQIDNO：21或22)。在第五方面的一实施方案中，编码LPAAT的外源多核苷酸包含序列如SEQIDNO：200所示的氨基酸，或者其生物活性片段，或者氨基酸序列与其至少30％相同的多肽。在第五方面的一实施方案中，所述细胞进一步包含以下一个或多个或全部：d)第四外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的另一多肽，e)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，f)第五外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，g)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽的内源生成和/或活性，h)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。在第五方面的一实施方案中，所述细胞是来自植物的营养性部分或植物的营养性部分中的植物细胞，并且一种或多种或全部启动子在所述营养性部分中以相对于植物的种子更高的水平表达。在第五方面的一实施方案中，具有中链长度的脂肪酸至少是肉豆蔻酸。在一优选实施方案中，所述细胞包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、8％-25％、8％-20％、10％-25％、11％-25％、约15％-25％、约20％-25％(w/w干重)的肉豆蔻酸含量。在第三、第四和第五方面的实施方案中，优选所述细胞在植物的营养性部分中，其生长在土壤中或者其生长在土壤中且随后收获所述植物部分，并且其中在重量基础上，所述细胞包含至少8％TAG(％干重)，例如8％-75％或8％-30％。更优选地，TAG含量为至少10％，例如10％-75％或10％-30％。优选地，这些TAG水平在植物开花之前或开花时或者在植物发育的结实期之前存在于营养性部分中。在这些实施方案中，优选叶中的TAG含量比植物茎中的TAG含量的比例为1∶1-10∶1，和/或所述比例相对于包含第一和第二外源多核苷酸且缺少第一遗传修饰的相应细胞增加。在第二、第三、第四和第五方面的实施方案中，所述细胞优选包含编码DGAT的外源多核苷酸和下调外源SDP1脂肪酶生成的遗传修饰。在一优选实施方案中，所述细胞不含编码PDAT的外源多核苷酸，和/或是除本氏烟草细胞以外的细胞和/或是除欧洲油菜(Brassicanapus)细胞以外的细胞。最优选地，所述细胞中至少一种外源多核苷酸表达自不是组成型启动子的启动子，例如优先在植物的绿色组织或茎中表达或者在衰老期间上调的启动子。在一实施方案中，本发明的细胞(包括第二、第三、第四和第五方面)具有以下特征中的一种或多种或全部(适用时)；i)所述细胞相对于缺少第一外源多核苷酸的相应细胞具有增加的总脂肪酸合成，或者相对于缺少第一外源多核苷酸的相应细胞具有减少的总脂肪酸分解代谢，或者两者，从而相对于缺少第一外源多核苷酸的相应细胞其具有升高水平的总脂肪酸，ii)相对于具有第一外源多核苷酸且缺少编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽的外源多核苷酸的相应细胞，所述细胞具有增加的脂肪酰基酰基转移酶表达和/或活性，所述脂肪酰基酰基转移酶催化TAG、DAG或MAG的合成，优选TAG，iii)相对于具有第一外源多核苷酸且缺少下调参与细胞质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰的相应细胞，所述细胞在其质体中具有减少的从酰基-ACP和G3P生成溶血磷脂酸(LPA)，iv)相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应细胞，所述细胞在其总脂肪酸含量和/或其半乳糖脂含量中具有改变的C16∶3-C18∶3脂肪酸比例，优选减少的比例，v)所述细胞在植物的营养性部分中，并且包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，vi)所述细胞在植物的营养性部分中，并且包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的TAG含量，vii)所述转录因子多肽选自由Wrinkled1(WRI1)、LeafyCotyledon1(LEC1)、LEC1样、LeafyCotyledon2(LEC2)、BABYBOOM(BBM)、FUS3、ABI3、ABI4、ABI5、Dof4和Dof11组成的组，或者由MYB73、bZIP53、AGL15、MYB115、MYB118、TANMEI、WUS、GFR2a1、GFR2a2和PHR1组成的组，viii)油酸包含细胞中的总脂肪酸含量的至少20％(mol％)、至少22％(mol％)、至少30％(mol％)、至少40％(mol％)、至少50％(mol％)或至少60％(mol％)，优选约65％(mol％)或20％-约65％，ix)所述细胞中的非极性脂质包含脂肪酸，所述脂肪酸包含羟基、环氧基、环丙烷基、双碳-碳键、三碳-碳键、缀合的双键、支链如甲基化或羟基化的支链，或者它们中两种或更多种的组合，或者上述基团、键或支链中的任何两种、三种、四种、五种或六种，x)所述细胞中的非极性脂质包含一种或多种多不饱和脂肪酸，其选自二十碳二烯酸(EDA)、花生四烯酸(ARA)、十八碳四烯酸(SDA)、二十碳三烯酸(ETE)、二十碳四烯酸(ETA)、二十碳五烯酸(EPA)、二十二碳五烯酸(DPA)、二十二碳六烯酸(DHA)、或者它们中两种或更多种的组合，xi)所述细胞在植物或其部分中，优选营养性植物部分，或者所述细胞是藻细胞如硅藻(硅藻类(bacillariophyte))、绿藻(绿藻类(chlorophyte))、蓝绿藻(蓝藻类(cyanophyte))、金褐藻(金藻类(chrysophyte))、定鞭藻类(haptophyte)、褐藻类和异鞭毛藻类，或者所述细胞来自或是适合发酵的生物体如真菌，xii)一种或多种或全部启动子选自除组成型启动子以外的启动子，优选组织特异性启动子如叶和/或茎特异性启动子，发育调节启动子如衰老特异性启动子如SAG12启动子，诱导型启动子，或者昼夜节律调节启动子，优选其中至少一个可操作地连接至编码转录因子多肽的外源多核苷酸的启动子是除组成型启动子以外的启动子，xiii)所述细胞包含总脂肪酸含量(其包含中链脂肪酸，优选C12：0、C14：0或两者，水平为总脂肪酸含量的至少5％)以及任选存在的编码LPAAT的外源多核苷酸，所述LPAAT对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性，优选C12：0或C14：0，xiv)所述细胞包含这样的总脂肪酸含量，相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应细胞，其油酸水平和/或棕榈酸水平升高至少2％，和/或相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应细胞，其α-亚麻酸(ALA)水平和/或亚油酸水平降低至少2％，xv)相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应细胞中的非极性脂质，所述细胞中的非极性脂质包含修改水平的总固醇，优选游离(非酯化的)固醇、硬脂酰酯、硬脂酰糖苷，xvi)所述细胞中的非极性脂质包含蜡和/或蜡酯，xvii)所述细胞是至少约1000个这类细胞的群体或集合的成员之一，优选在营养性植物部分或种子中，xviii)所述细胞包含编码沉默抑制子的外源多核苷酸，其中将所述外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子，xix)在重量基础上，所述细胞的一种或多种非极性脂质和/或总非极性脂质含量的水平比包含编码拟南芥WRI1(SEQIDNO：21)和拟南芥DGAT1(SEQIDNO：1)的外源多核苷酸的相应细胞高至少2％，以及xx)相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应细胞的总PUFA含量减少的总多不饱和脂肪酸(PUFA)含量。以下实施方案应用于本发明的细胞(包括第二、第三、第四和第五方面)以及产生所述细胞的方法和使用所述细胞的方法。在这些实施方案中，当所述细胞在植物的营养性部分中时，优选所述植物生长在土壤中。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是参与细胞中的TAG、DAG或单酰甘油(MAG)生物合成的脂肪酰基酰基转移酶，优选细胞中的TAG生物合成，例如DGAT、PDAT、LPAAT、GPAT或MGAT，优选DGAT或PDAT。在一实施方案中，参与细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶、Cgi58多肽、酰基-CoA氧化酶如ACX1或ACX2、或者参与细胞中脂肪酸的β-氧化的多肽如PXA1过氧化物酶体ATP-结合盒转运蛋白，优选SDP1脂肪酶。在一实施方案中，所述油体包衣(OBC)多肽是油质蛋白，如聚油质蛋白(polyoleosin)或油体钙蛋白(caleosin)，或者优选脂滴相关蛋白(LDAP)。在一实施方案中，增加脂肪酸输出所述细胞质体的多肽是C16或C18脂肪酸硫酯酶如FATA多肽或FATB多肽、脂肪酸转运蛋白如ABCA9多肽或长链酰基-CoA合成酶(LACS)。在一实施方案中，参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽是脂肪酸转运蛋白或其亚基，优选TGD多肽，例如，TGD1多肽、TGD2多肽、TGD3多肽或TGD4多肽。在一实施方案中，参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT、质体LPAAT或质体PAP。在一实施方案中，所述细胞来自或在16：3植物中，或者在其营养性部分或种子中，并且包含以下一个或多个或全部；a)外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述细胞质体，b)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽的内源生成和/或活性，c)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中所述外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。在一可选实施方案中，所述细胞来自或在18：3植物中，或者在其营养性部分或种子中。在一实施方案中，所述细胞来自或在植物叶、茎或根中，在植物开花之前，并且所述细胞包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、8％-15％或9％-12％(w/w干重)的总非极性脂质含量。在一实施方案中，所述细胞的总非极性脂质含量比用编码WRI1和DGAT的基因转化但缺少如本文中对第二、第三、第四和第五方面描述的其他外源多核苷酸和遗传修饰的相应细胞中的总非极性脂质含量大至少3％，更优选至少5％。更优选地，增加的程度是在植物的茎或根中的细胞中。在一实施方案中，添加一种或多种外源多核苷酸或遗传修饰，优选编码OBC或脂肪酰基硫酯酶的外源多核苷酸或者下调参与细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰，更优选编码FATA硫酯酶或LDAP或者减少内源TAG脂肪酶如SDP1TAG脂肪酶在细胞中的表达的外源多核苷酸，当添加至转基因WRI1和DGAT对时导致细胞的总非极性脂质含量的协同增加，特别是在植物开花之前，甚至更特别是在植物的茎和/或根中。例如，参见实施例8、11和15。在一优选实施方案中，相对于用编码WRI1和DGAT1的基因转化但缺少FATA硫酯酶、LDAP和下调参与细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰的相应细胞，植物的茎或根中的细胞的TAG含量增加至少2-倍，更优选至少3-倍。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。所述遗传修饰可以是达到期望效果的对天然存在的细胞的任何改变。遗传修饰细胞的方法是本领域公知的。在一实施方案中，所述一个或多个或全部遗传修饰中的每个是部分或完全失活基因的内源基因突变，优选引入的突变，如点突变、插入或缺失(或者它们中的一种或多种的组合)。点突变可以是减少基因或所编码的多肽的活性的提前终止密码子、剪接位点突变、移码突变或氨基酸取代。缺失可以是基因的转录外显子或启动子内的一个或多个核苷酸的缺失，或者延伸跨过或进入一个以上外显子，或者延伸至整个基因的缺失。优选地，通过使用ZF、TALEN或CRISPR技术引入缺失。在一实施方案中，一个或多个或全部遗传修饰是编码抑制内源基因表达的RNA分子的外源多核苷酸，其中将所述外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。减少内源基因表达的外源多核苷酸的实例选自反义多核苷酸、有义多核苷酸、microRNA、编码结合内源酶的多肽的多核苷酸、双链RNA分子和由其衍生的加工的RNA分子。在一实施方案中，所述细胞包含是内源基因中的引入突变的遗传修饰以及编码减少另一内源基因表达的RNA分子的外源多核苷酸。在一实施方案中，编码WRI1的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：21-75或205-210中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：21-75或205-210中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)和/或ii)的核苷酸。优选地，所述WRI1多肽是除拟南芥WRI1(SEQIDNO：21或22)以外的WRI1多肽。更优选地，所述WRI1多肽包含序列如SEQIDNO：208所示的氨基酸或其生物活性片段，或者氨基酸序列与其至少30％相同的多肽。在第二、第三、第四或第五方面的一实施方案中，所述重组细胞是马铃薯(Solanumtuberosum)块茎的细胞、甜菜(Betavulgaris)根或叶的细胞、甘蔗(Saccharumsp.)或两色高粱(Sorghumbicolor)茎或叶的细胞、单子叶植物的胚乳细胞，其中相对于相应的野生型胚乳细胞，所述细胞具有增加的总脂肪酸含量，例如小麦(Triticumaestivum)谷粒、稻(稻属(Oryzasp.))谷粒或玉米(Zeamays)粒的细胞，具有增加的总脂肪酸含量的芸苔属(Brassicasp.)种子如油菜种子的细胞，或者具有增加的总脂肪酸含量的豆类种子如大豆(Glycinemax)种子的细胞。在第六方面，本发明提供一种非人生物体或其部分，包含或由本发明的一种或多种细胞组成。在一实施方案中，所述非人生物体的部分是种子、果实或者植物的营养性部分如地表植物部分或绿色部分如叶或茎。在另一实施方案中，所述非人生物体是光合生物如植物或藻类，或者适合发酵的生物体如真菌。在第七方面，本发明提供一种转基因植物或其部分，优选营养性植物部分，其包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，以及以下任何一种或两种或全部三种c)一种遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，d)第三外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少第四外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物的细胞质体，以及e)第四外源多核苷酸，其编码增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的第二转录因子多肽，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子。在一实施方案中，所述植物或其部分包含a)、b)和c)，以及任选存在的d)或e)。在一实施方案中，所述植物或其部分包含a)、b)和d)，以及任选存在的c)或e)。在一实施方案中，所述植物或其部分包含a)、b)和e)，以及任选存在的c)或d)。在一优选实施方案中，相对于包含a)和b)但缺少每个c)、d)和e)的相应植物或其部分，c)、d)或e)的存在，连同a)和b)增加所述植物或其部分的总非极性脂质含量，优选营养性植物部分如叶、根或茎。更优选地，所述增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，所述植物或其部分进一步包含以下一个或多个或全部：a)第五外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，b)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及c)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，所述转基因植物或其部分包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，优选表达自除组成型启动子以外的启动子，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，以及c)一种遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子，并且任选地所述植物或其部分进一步包含以下一种或多种或全部：d)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应植物相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物的质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，所述部分是营养性部分，并且相对于所述植物的种子，一种或多种或全部启动子在所述营养性部分中以更高水平表达。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且参与所述植物中TAG的分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与所述植物中三酰甘油(TAG)的分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且参与所述植物中三酰甘油(TAG)的分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一实施方案中，当存在时，两个转录因子为WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在上述实施方案中，优选所述植物正在土壤中生长或者在土壤中生长并且随后收获其部分。优选地，在重量基础上，所述植物的营养性部分包含至少8％TAG(％干重)，例如8％-75％或8％-30％。更优选地，TAG含量为至少10％，例如10％-75％或10％-30％。优选地，这些TAG水平在植物开花之前或开花时或者在植物发育的结实期之前存在于营养性部分中。在这些实施方案中，优选叶中的TAG含量比植物茎中的TAG含量的比例为1∶1-10∶1，和/或所述比例相对于包含第一和第二外源多核苷酸且缺少第一遗传修饰的相应细胞增加。在上述实施方案中，所述植物或其部分的总非极性脂质含量优选比用编码WRI1和DGAT的基因转化但缺少如本文描述的其他外源多核苷酸和遗传修饰的相应植物或其部分中的总非极性脂质含量大至少3％，更优选至少5％。更优选地，该程度的增加是在植物的茎或根组织中。在上述实施方案中，优选添加一种或多种外源多核苷酸或遗传修饰，优选编码OBC或脂肪酸硫酯酶的外源多核苷酸或者下调参与细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰，更优选编码LDAP或FATA硫酯酶或者减少内源TAG脂肪酶如SDP1TAG脂肪酶在细胞中的表达的外源多核苷酸，当添加至转基因WRI1和DGAT对时导致所述植物或其部分的总非极性脂质含量的协同增加，特别是在植物开花之前，甚至更特别是在植物的茎和/或根组织中。例如，参见实施例8、11和15。在一优选实施方案中，相对于用编码WRI1和DGAT1的基因转化但缺少编码OBC或脂肪酸硫酯酶的外源多核苷酸以及下调参与细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰的相应部分，所述植物的叶、茎或根组织或者全部三种的TAG含量增加至少2-倍，更优选至少3-倍。在上述实施方案中，所述植物或其部分优选包含编码DGAT的第二外源多核苷酸和下调外源SDP1脂肪酶生成的第一遗传修饰。更优选地，所述植物或其部分不含编码PDAT的外源多核苷酸，和/或是除本氏烟草和/或欧洲油菜以外的植物或其部分，和/或WRI1是除拟南芥WRI1(SEQIDNOs：21或22)以外的WRI1。在一实施方案中，所述植物不是甘蔗。更优选地，所述植物中至少一种外源多核苷酸表达自不是组成型启动子的启动子，例如优先在植物的绿色组织或茎中表达或者在开始开花之后或衰老期间上调的启动子。优选地，至少第一外源多核苷酸(编码转录因子)表达自这样的启动子。在第八方面，本发明提供一种转基因植物或其部分，优选营养性植物部分，其包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，以及c)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子，并且其中相对于包含第三外源多核苷酸(其核苷酸序列与SEQIDNO：176提供的序列互补)的相应植物，所述植物具有升高水平的一种或多种非极性脂质和/或增加量的OBC多肽。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第二外源多核苷酸但缺少第三外源多核苷酸的相应植物部分，编码OBC多肽的第三外源多核苷酸的存在，连同第一和第二外源多核苷酸增加所述植物或其部分的总非极性脂质含量，优选营养性植物部分如叶、根或茎。更优选地，所述增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在第八方面的一实施方案中，所述植物或其部分进一步包含以下一个或多个或全部：d)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应植物相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物的质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，所述细胞包含编码两种不同转录因子多肽的两种外源多核苷酸，所述转录因子多肽增加所述植物中一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因的表达，如WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在第九方面，本发明提供一种转基因植物或其部分，优选营养性植物部分，其包含第一外源多核苷酸，所述第一外源多核苷酸编码增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及以下一个或多个或全部；a)第二外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第二外源多核苷酸的相应植物相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物的质体，b)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物质体的多肽的内源生成和/或活性，c)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子。在一实施方案中，所述植物或其部分，优选营养性植物部分，包含a)以及任选存在的b)或c)。在第九方面的一实施方案中，所述植物或其部分进一步包含以下一个或多个或全部：d)第三外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，e)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，以及f)第四外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP。在一优选实施方案中，所述植物或其部分，优选营养性植物部分，包含第一、第二和第三外源多核苷酸以及任选存在的第三遗传修饰或第四外源多核苷酸。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第三(如果存在)外源多核苷酸但缺少第二外源多核苷酸的相应植物部分，编码增加脂肪酸输出所述植物质体的多肽(优选脂肪酰基硫酯酶如FATA多肽)的第二外源多核苷酸的存在，连同第一和第三(如果存在)外源多核苷酸增加所述植物部分的总非极性脂质含量，优选营养性植物部分如叶、根或茎。更优选地，第二外源多核苷酸提供的增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽是TGD多肽。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且参与二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，增加脂肪酸输出所述植物质体的多肽是脂肪酸硫酯酶，优选FATA或FATB多肽，并且参与将脂肪酸输入所述植物质体的多肽是TGD多肽。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，增加脂肪酸输出所述植物质体的多肽是脂肪酸硫酯酶，优选FATA或FATB多肽，并且参与二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一实施方案中，增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与将脂肪酸输入所述植物质体的多肽是TGD多肽，并且参与二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一实施方案中，所述植物包含编码两种不同转录因子多肽的两种外源多核苷酸，所述转录因子多肽增加细胞中一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因的表达，如WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在第七、第八和第九方面的实施方案中，当所述植物包含编码脂肪酸硫酯酶如FATA或FATB多肽的外源多核苷酸时，所述硫酯酶优选是FATA多肽或除中链脂肪酸硫酯酶以外的脂肪酸硫酯酶。在第十方面，本发明提供一种转基因植物或其部分，优选营养性部分，其包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，优选WRI转录因子，b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，所述多肽是对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性的LPAAT，以及c)第三外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第三外源多核苷酸的相应植物相比时，所述多肽增加C8-C14脂肪酸输出所述植物的质体，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子。在一优选实施方案中，相对于包含第一和第二外源多核苷酸但缺少第三外源多核苷酸的相应植物部分，编码增加C8-C14脂肪酸输出所述植物质体的多肽的第三外源多核苷酸的存在，连同第一和第二外源多核苷酸增加所述植物部分的总MCFA含量，优选营养性植物部分如叶、根或茎。更优选地，第三外源多核苷酸提供的增加是协同性的。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在第十方面的一实施方案中，所述转基因植物或其部分进一步包含以下一个或多个或全部；d)第四外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的另一多肽，e)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，f)第五外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，g)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及h)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子。在第十方面的一实施方案中，所述转录因子不是拟南芥WRI1(SEQIDNO：21或22)，和/或所述植物不是本氏烟草(N.benthamiana)。在第十方面的一实施方案中，编码LPAAT的外源多核苷酸包含序列如SEQIDNO：200所示的氨基酸，或者其生物活性片段，或者氨基酸序列与其至少30％相同的LPAAT多肽。在第十方面的一实施方案中，一种或多种或全部启动子在所述营养性部分中以相对于所述植物的种子更高的水平表达，优选至少包括表达第一外源多核苷酸的启动子。在第十方面的一实施方案中，具有中链长度的脂肪酸至少是肉豆蔻酸(C14：0)。在一优选实施方案中，所述植物部分，优选营养性植物部分，包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、8％-25％、8％-20％、10％-25％、11％-25％、约15％-25％、约20％-25％(w/w干重)的肉豆蔻酸含量。在第六、第七、第八、第九和第十方面的实施方案中，优选所述植物生长在土壤中或者生长在土壤中且随后收获所述植物部分，优选营养性植物部分，并且其中在重量基础上，所述植物部分包含至少8％TAG(％干重)，例如8％-75％或8％-30％。更优选地，TAG含量为至少10％，例如10％-75％或10％-30％。优选地，这些TAG水平在植物开花之前或开花时或者在植物发育的结实期之前存在于营养性部分中。在这些实施方案中，优选叶中的TAG含量比植物茎中的TAG含量的比例为1∶1-10∶1，和/或所述比例相对于包含第一和第二外源多核苷酸且缺少第一遗传修饰的相应细胞增加。在第六、第七、第八、第九和第十方面的实施方案中，所述植物或其部分优选包含编码DGAT的外源多核苷酸和下调外源SDP1脂肪酶生成的遗传修饰。在一优选实施方案中，所述植物或其部分不含编码PDAT的外源多核苷酸，和/或是除本氏烟草植物以外的植物。最优选地，所述植物或其部分中的至少一种外源多核苷酸表达自不是组成型启动子的启动子，例如优先在所述植物的绿色组织或茎中表达或者在衰老期间上调的启动子。在第十一方面，本发明提供一种包含营养性部分的植物或其营养性部分，其中所述营养性部分具有至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，其中所述非极性脂质包含至少90％三酰甘油(TAG)。在优选的实施方案中，所述营养性植物部分的特征在于如第七、第八、第九和第十方面中描述的特性。所述植物优选18：3植物。在上述方面的一实施方案中，已处理所述植物细胞或植物部分，所以其不再能够繁殖或产生活的植物，即其是死的。例如，已将所述植物细胞或植物部分干燥和/或研磨。在第十二方面，本发明提供一种包含营养性部分的植物或其营养性部分，其中所述营养性部分具有至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的TAG含量，其中所述非极性脂质包含至少90％三酰甘油(TAG)。所述植物优选18：3植物。在第十三方面，本发明提供一种包含营养性部分的植物或其营养性部分，其中所述营养性部分具有至少8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，其中所述非极性脂质包含至少90％三酰甘油(TAG)，并且其中所述植物是16：3植物或其营养性部分。在第十四方面，本发明提供一种包含营养性部分的植物或其营养性部分，其中所述营养性部分具有至少8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的TAG含量，其中所述非极性脂质包含至少90％三酰甘油(TAG)，并且其中所述植物是16：3植物或其营养性部分。在一实施方案中，本发明(包括第二、第三、第四和第五方面)的细胞是以下物种或属的细胞，或者本发明(包括第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三和第十四方面)的植物或其部分是刺干椰(Acrocomiaaculeata(macaubapalm))、拟南芥、花生(Aracinishypogaea，花生(peanut))、木鲁星果棕(Astrocaryummurumuru(murumuru))、Astrocaryumvulgare(tucuma)、Attaleageraensis(Indaia-rateiro)、Attaleahumilis(美洲油棕(Americanoilpalm))、Attaleaoleifera(andaia)、Attaleaphalerata(uricuri)、Attaleaspeciosa(babassu)、燕麦(Avenasativa，燕麦(oats))、甜菜(甜菜(sugarbeet))、芸苔属如Brassicacarinata、Brassicajuncea、Brassicanapobrassica、欧洲油菜(油菜)、亚麻荠(Camelinasativa，亚麻荠(falseflax))、大麻(Cannabissativa，大麻(hemp))、红花(Carthamustinctorius，红花(safflower))、Caryocarbrasiliense(pequi)、椰子(Cocosnucifera，椰子(Coconut))、海甘蓝(Crambeabyssinica，海甘蓝(Abyssiniankale))、甜瓜(Cucumismelo，甜瓜(melon))、油棕(Elaeisguineensis，非洲棕榈(Africanpalm))、大豆(大豆(soybean))、陆地棉(Gossypiumhirsutum，棉花)、向日葵属(Helianthussp.)如向日葵(Helianthusannuus，向日葵(sunflower))、大麦(Hordeumvulgare，大麦(barley))、麻风树(Jatrophacurcas，麻风树(physicnut))、Joannesiaprinceps(araranut-tree)、浮萍属(Lemnasp.，浮萍(duckweed))如青萍(Lemnaaequinoctialis)、Lemnadisperma、Lemnaecuadoriensis、膨胀浮萍(Lemnagibba，膨胀浮萍swollenduckweed)、日本浮萍(Lemnajaponica)、浮萍(Lemnaminor)、单脉萍(Lemnaminuta)、Lemnaobscura、稀脉萍(Lemnapaucicostata)、稀脉浮萍(Lemnaperpusilia)、Lemnatenera、吕藻(Lemnatrisulca)、鳞根萍(Lemnatrisulca)、Lemnavaldiviana、Lemnayungensis、奥蒂树(Licaniarigida，奥蒂(oiticica))、亚麻(Linumusitatissimum，亚麻(flax))、羽扇豆(Lupinusangustifolius，羽扇豆(lupin))、曲叶矛榈(Mauritiaflexuosa，buriti棕榈)、摩帝椰子(Maximilianamaripa，inaja棕榈)、芒属(Miscanthussp.)如异源三倍体芒草奇岗(Miscanthusxgiganteus)和中国芒(Miscanthussinensis)，烟草属(Nicotianasp.，烟草(tabacco))如红花烟草(Nicotianatabacum)或本氏烟草、巴卡巴酒实棕(Oenocarpusbacaba，巴卡巴酒实棕(bacaba-do-azeite))、巴套阿酒实棕(Oenocarpusbataua，pataua)、Oenocarpusdistichus(bacaba-de-leque)，稻属(稻(rice))如水稻(Oryzasativa)和光稃稻(Oryzaglaberrima)、柳枝稷(Panicumvirgatum，柳枝稷(switchgrass))、Paraqueibaparaensis(mari)、鳄梨(Perseaamencana，鳄梨(avocado))、水黄皮(Pongamiapinnata，印度山毛榉(Indianbeech))、毛果杨(Populustrichocarpa)、蓖麻(Ricinuscommunis，蓖麻(castor))，甘蔗(甘蔗(sugarcane))、芝麻(Sesamumindicum，芝麻(sesame))、马铃薯(马铃薯(potato))、高粱属(Sorghumsp.)如两色高粱(Sorghumbicolor)、高粱(Sorghumvulgare)、大花可可(Theobromagrandiforum，cupuassu)、三叶草属(Trifoliumsp.)、巴西针棕(Trithrinaxbrasiliensis，巴西针棕(Brazilianneedlepalm))、小麦属(Triticumsp.，小麦(wheat))如小麦(Triticumaestivum)和玉米(玉米(corn))。在第十五方面，本发明提供一种马铃薯植物或其部分，优选块茎，其具有至少2cm的直径，并且具有在干重基础上至少0.5％的TAG含量和/或在干重基础上至少1％，优选至少1.5％或至少2.0％的脂肪酸含量。当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应马铃薯块茎相比时，所述马铃薯块茎优选在总脂肪酸含量和总脂肪酸含量的TAG部分中具有升高水平的单不饱和脂肪酸(MUFA)和/或较低水平的多不饱和脂肪酸(PUFA)，如升高水平的油酸和降低水平的ALA。优选地，当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应马铃薯块茎相比时，所述块茎的总脂肪酸含量中的ALA水平降低至少于10％和/或总脂肪酸含量中的油酸水平升高至至少5％，优选至少10％或更优选至少15％。此外，在一实施方案中，当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应马铃薯块茎相比时，所述块茎的总脂肪酸含量中的棕榈酸水平升高和/或所述块茎的总脂肪酸含量中的硬脂酸(18：0)水平降低。在一实施方案中，当它们在相同条件下研磨时，相对于野生型块茎，所述块茎的淀粉含量在重量基础上为约90％-100％。在一实施方案中，本发明的马铃薯植物或其部分，优选块茎包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述块茎中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至能够在所述马铃薯植物生长期间指导所述多核苷酸在所述块茎中的表达的启动子。在一优选实施方案中，所述马铃薯块茎进一步包含以下一个或多个或全部：c)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，d)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应块茎相比时，其下调参与所述块茎中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，例如当所述多肽是SDP1时，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应块茎相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述块茎的质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应块茎相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述块茎的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应块茎相比时，其下调参与所述块茎的质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在其他实施方案中，所述块茎中额外的遗传修饰如本发明的细胞或植物的上下文中定义的。在第十六方面，本发明提供一种高粱或甘蔗植物，或者其部分，优选茎或叶，其具有在干重基础上至少6％或至少8％的总脂肪酸含量和/或在干重基础上至少2％或至少3％的茎中的TAG含量和/或在重量基础上茎中的TAG含量增加至少50-倍和/或叶中增加至少100-倍。在实施方案中，所述高粱或甘蔗植物，或者其部分，优选茎或叶，其特征在于如本发明的细胞或植物或其部分的上下文中定义的特性。在第十七方面，本发明提供一种高粱或甘蔗植物，或者其部分，优选茎或叶，其包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够在所述植物生长期间指导所述多核苷酸在所述植物或其部分中的表达的启动子。优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除稻泛素启动子(Rubi3)以外的启动子。更优选地，所述启动子不是泛素启动子或任何其他组成型启动子。优选地，所述第一和第二外源多核苷酸以及它们各自的启动子连接在整合入所述植物基因组的一个遗传构建体上。在一实施方案中，当它们在相同条件下研磨时，相对于野生型甘蔗茎，所述甘蔗茎的糖含量在重量基础上为约70％-100％。或者，糖含量为50％-70％。在一实施方案中，本发明的高粱或甘蔗植物，或者其部分，优选茎或叶包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物的茎中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，其中至少一个外源多核苷酸，优选至少第一外源多核苷酸可操作地连接至在所述植物生长期间相对于叶优先在茎中表达的启动子。在一实施方案中，本发明的高粱或甘蔗植物或其部分进一步包含以下一个或多个或全部：c)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，d)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应植物或其部分相比时，其下调参与所述植物或其部分中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应植物或其部分相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物或其部分的质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物或其部分相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物或其部分的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物或其部分相比时，其下调参与所述植物或其部分的质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应植物或其部分相比时，本发明的高粱或甘蔗植物或其部分优选在总脂肪酸含量和总脂肪酸含量的TAG部分中具有升高水平的单不饱和脂肪酸(MUFA)和/或较低水平的多不饱和脂肪酸(PUFA)，如升高水平的油酸和降低水平的ALA。优选地，当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应植物或其部分相比时，总脂肪酸含量中的ALA水平少于10％和/或总脂肪酸含量中的油酸水平为至少5％，优选至少10％或更优选至少15％。在其他实施方案中，所述高粱或甘蔗植物或其部分中的额外的遗传修饰如本发明的细胞或植物的上下文中定义的。在第十八方面，本发明提供一种转基因单子叶植物或其部分，优选叶、谷粒、茎、根或胚乳，其具有与相应的非转基因单子叶植物或其部分相比时在重量基础上增加至少5-倍的总脂肪酸含量或TAG含量。或者，本发明提供一种转基因单子叶植物，其胚乳具有在重量基础上至少2.0％，优选至少3％，更优选至少4％或至少5％的TAG含量，或者所述植物的部分，优选叶、茎、根、谷粒或胚乳。在一实施方案中，所述胚乳具有至少2％的TAG含量，其相对于相应的非转基因胚乳增加至少5-倍。优选地，所述植物是完全雄性或雌性繁殖的，其花粉是基本上100％可存活的，并且相对于相应的野生型谷粒，其谷粒具有70％-100％的发芽率。在一实施方案中，所述转基因植物是源自初始转基因小麦植物至少两代的子代植物，并且对于所述转基因优选是纯合的。在实施方案中，所述单子叶植物或其部分，优选叶、茎、谷粒或胚乳，其进一步特征在于如本发明的细胞或植物的上下文中定义的一个或多个特性。在第十九方面，本发明提供一种单子叶植物或其部分，优选叶、谷粒、茎或胚乳，其包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够在所述植物生长期间指导所述多核苷酸在所述植物或其部分中的表达的启动子。优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，当获得谷粒的植物在相同条件下生长时，相对于野生型谷粒，本发明的单子叶植物的谷粒的淀粉含量在重量基础上为约70％-100％。以上两个方面中的优选单子叶植物是小麦、稻、高粱和玉米(corn)(玉米(maize))。在一实施方案中，本发明的单子叶植物或其部分，优选叶、谷粒或胚乳包含a)第一外源多核苷酸，其编码增加所述植物的胚乳中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，以及b)第二外源多核苷酸，其编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽，其中至少一个外源多核苷酸，优选至少第一外源多核苷酸可操作地连接至在所述植物生长期间在胚乳中以相对于叶更高的水平表达的启动子。在一优选实施方案中，所述单子叶植物或其部分进一步包含以下一个或多个或全部：c)第三外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，优选LDAP，d)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应植物或其部分相比时，其下调参与所述植物或其部分中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，e)第四外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第四外源多核苷酸的相应植物或其部分相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物或其部分的质体，f)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物或其部分相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物或其部分的质体的多肽的内源生成和/或活性，以及g)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应植物或其部分相比时，其下调参与所述植物或其部分的质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，所述单子叶植物包含特性a)、b)，d)和e)中的一种或两种，以及任选存在的c)、f)和g)中的一种。当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应植物或其部分相比时，本发明的单子叶植物或其部分，优选叶、谷粒、茎或胚乳，优选在总脂肪酸含量和总脂肪酸含量的TAG部分中具有升高水平的单不饱和脂肪酸(MUFA)和/或较低水平的多不饱和脂肪酸(PUFA)，例如升高水平的油酸和降低水平的LA(18：2)。优选地，当与缺少所述遗传修饰和/或外源多核苷酸的相应植物或其部分相比时，相对于相应的野生型植物或其部分，所述谷粒或胚乳的总脂肪酸含量中的亚油酸(LA，18：2)水平降低至少5％和/或总脂肪酸含量中的油酸水平升高至少5％，优选至少10％或更优选至少15％。以下实施方案应用于第十五、第十六、第十七、第十八和第十九方面的各植物或其部分。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，增加所述植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽，并且参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT。在一实施方案中，增加所述植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，增加所述植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且OBC多肽是油质蛋白。或者，OBC多肽是LDAP。在一实施方案中，所述植物或其部分包含编码两种不同转录因子多肽的两种外源多核苷酸，所述转录因子多肽增加细胞中一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因的表达，如WRI1和LEC2，或者WRI1和LEC1。在本发明的细胞、植物或其部分(包括第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十五、第十六、第十七、第十八和第十九方面)的每个实施方案中，优选增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在本发明的细胞、植物或其部分(包括第二、第三、第五、第六、第七、第八、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十五、第十六、第十七、第十八和第十九方面，但不包括第五和第十方面)的每个实施方案中，优选增加所述细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是WRI1多肽、LEC2多肽、LEC1多肽或LEC1样多肽，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT或PDAT，并且增加脂肪酸输出细胞质体的多肽是脂肪酸硫酯酶，优选FATA或FATB多肽，更优选FATA多肽或除中链脂肪酸硫酯酶以外的脂肪酸硫酯酶。在本发明的细胞、植物或其部分(包括第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十五、第十六、第十七、第十八和第十九方面)的每个上述实施方案中，优选增加所述植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽是至少两种多肽的组合，优选WRI1多肽和LEC2多肽。更优选地，所述至少两种转录因子多肽表达自不同的启动子。最优选地，编码所述至少两种多肽的外源多核苷酸连接在整合入所述细胞或植物基因组的单个遗传构建体上。在上述每个实施方案中，当所述植物是双子叶植物时，所述转录因子可以是单子叶植物转录因子。相反地，当所述植物是单子叶植物时，所述转录因子可以是双子叶植物转录因子。所述转录因子优选是除拟南芥(A.thaliana)WRI1(SEQIDNO：21或22)以外的转录因子。在上述每个实施方案中，优选所述植物是源自初始转基因植物至少两代的转基因子代植物，并且对于所述转基因优选是纯合的。在其他实施方案中，所述植物或其部分中额外的遗传修饰如本发明的细胞的上下文中定义的。在一实施方案中，本发明的植物或其部分(包括第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十五、第十六、第十七、第十八和第十九方面)具有以下特性中的一种或多种或全部(当适用时)；i)所述植物包含部分，优选营养性部分，相对于缺少第一外源多核苷酸的相应部分其具有增加的总脂肪酸合成，或者相对于缺少第一外源多核苷酸的相应部分其具有减少的总脂肪酸分解代谢，或者两者，从而相对于缺少第一外源多核苷酸的相应部分其具有升高水平的总脂肪酸，ii)所述植物包含部分，优选营养性部分，相对于具有第一外源多核苷酸且缺少编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽的外源多核苷酸的相应部分，其具有增加的脂肪酰基酰基转移酶表达和/或活性，所述脂肪酰基酰基转移酶催化TAG、DAG或MAG的合成，优选TAG，iii)所述植物包含部分，优选营养性部分，相对于具有第一外源多核苷酸且缺少下调参与所述植物部分中的质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰的相应部分，所述部分在其质体中具有减少的从酰基-ACP和G3P生成溶血磷脂酸(LPA)，iv)所述植物包含部分，优选营养性部分，相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应部分，所述部分在其总脂肪酸含量和/或其半乳糖脂含量中具有改变的C16∶3-C18∶3脂肪酸比例，优选减少的比例，v)所述植物的营养性部分包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，优选在开花之前，vi)所述植物的营养性部分包含至少约8％、至少约10％、至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的TAG含量，优选在开花之前，vii)所述转录因子多肽选自由WRI1、LEC1、LEC1样、LEC2、BBM、FUS3、ABI3、ABI4、ABI5、Dof4和Dof11组成的组，优选WRI1、LEC1或LEC2，或者由MYB73、bZIP53、AGL15、MYB115、MYB118、TANMEI、WUS、GFR2a1、GFR2a2和PHR1组成的组，viii)油酸包含所述植物或其部分中的总脂肪酸含量的至少20％(mol％)、至少22％(mol％)、至少30％(mol％)、至少40％(mol％)、至少50％(mol％)或至少60％(mol％)，优选约65％(mol％)或20％-约65％，ix)所述植物或其部分，优选营养性部分中的非极性脂质包含升高水平的一种或多种脂肪酸，所述脂肪酸包含羟基、环氧基、环丙烷基、双碳-碳键、三碳-碳键、缀合的双键、支链如甲基化或羟基化的支链，或者它们中两种或更多种的组合，或者上述基团、键或支链中的任何两种、三种、四种、五种或六种，x)所述植物或其部分，优选营养性部分中的非极性脂质包含一种或多种多不饱和脂肪酸，其选自二十碳二烯酸(EDA)、花生四烯酸(ARA)、十八碳四烯酸(SDA)、二十碳三烯酸(ETE)、二十碳四烯酸(ETA)、二十碳五烯酸(EPA)、二十二碳五烯酸(DPA)、二十二碳六烯酸(DHA)、或者它们中两种或更多种的组合，xi)所述部分是营养性植物部分，如叶或茎或其部分，xii)一种或多种或全部启动子选自除组成型启动子以外的启动子，优选组织特异性启动子如叶和/或茎特异性启动子，发育调节启动子如衰老特异性启动子如SAG12启动子，诱导型启动子，或者昼夜节律调节启动子，优选其中至少一个可操作地连接至编码转录因子多肽的外源多核苷酸的启动子是除组成型启动子以外的启动子，xiii)所述植物或其部分，优选营养性部分包含总脂肪酸含量(其包含中链脂肪酸，优选C12：0、C14：0或两者，水平为总脂肪酸含量的至少5％)以及任选存在的编码LPAAT的外源多核苷酸，所述LPAAT对具有中链长度(C8-C14)的脂肪酸具有偏好活性，优选C12：0或C14：0，xiv)所述植物或其部分，优选营养性部分包含这样的总脂肪酸含量，相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应植物或其部分，其油酸水平和/或棕榈酸水平升高至少2％，和/或相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应植物或其部分，其α-亚麻酸(ALA)水平和/或亚油酸水平降低至少2％，xv)相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应植物或其部分中的非极性脂质，所述植物或其部分，优选营养性部分中的非极性脂质包含修改水平的总固醇，优选游离(非酯化的)固醇、硬脂酰酯、硬脂酰糖苷，xvi)所述植物或其部分中的非极性脂质包含蜡和/或蜡酯，xvii)所述植物或其部分，优选营养性部分是至少约1000个这类植物或其部分的群体或集合的成员之一，xviii)所述植物包含编码沉默抑制子的外源多核苷酸，其中所述外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物中的表达的启动子，xix)在重量基础上，所述植物或其部分，优选营养性部分的一种或多种非极性脂质和/或总非极性脂质含量的水平分别比包含编码拟南芥WRI1(SEQIDNO：21)和拟南芥DGAT1(SEQIDNO：1)的外源多核苷酸的相应植物或部分高至少2％，xx)相对于缺少外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应植物的总PUFA含量减少的总多不饱和脂肪酸(PUFA)含量，xxi)所述植物部分是马铃薯(Solanumtuberosum)块茎、甜菜(Betavulgaris)根、甘蔗(甘蔗属)或高粱(两色高粱)茎、在其胚乳中具有增加的总脂肪酸含量的单子叶植物种子如小麦(Triticumaestivum)谷粒或玉米(Zeamays)粒、烟草属叶、或者具有增加的总脂肪酸含量的豆类种子如芸苔属种子或大豆(Glycinemax)种子，xxii)如果所述植物部分是种子，所述种子以与相应的野生型种子基本上相同的速度发芽，或者当播种在土壤中时产生这样的植物，其种子以与相应的野生型种子基本上相同的速度发芽，xxiii)所述植物是藻类植物，如来自硅藻(硅藻类(bacillariophyte))、绿藻(绿藻类(chlorophyte))、蓝绿藻(蓝藻类(cyanophyte))、金褐藻(金藻类(chrysophyte))、定鞭藻类(haptophyte)、褐藻类和异鞭毛藻类。在上述实施方案中，优选的植物部分是具有至少1cm2的表面积的叶片或具有至少1cm的长度的茎段。在上述方面的一实施方案中，已处理所述植物或植物部分，所以其不再能够繁殖或产生活的植物，即其是死的。例如，已将所述植物或植物部分干燥和/或研磨。在上述实施方案中，优选所述植物部分的总非极性脂质含量比用编码WRI1和DGAT的基因转化但缺少如本文对上述方面描述的其他外源多核苷酸和遗传修饰的相应植物中的总非极性脂质含量大至少3％，更优选至少5％。更优选地，增加的程度是在所述植物的茎或根中。在一实施方案中，添加一种或多种外源多核苷酸或遗传修饰，优选编码OBC或脂肪酰基硫酯酶的外源多核苷酸或者下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰，更优选编码FATA硫酯酶或LDAP或者减少内源TAG脂肪酶如SDP1TAG脂肪酶在所述植物中的表达的外源多核苷酸，当添加至转基因WRI1和DGAT对时导致所述植物部分的总非极性脂质含量的协同增加，特别是在所述植物开花之前，甚至更特别是在所述植物的茎和/或根中。例如，参见实施例8、11和15。在一优选实施方案中，相对于用编码WRI1和DGAT1的基因转化但缺少FATA硫酯酶、LDAP和下调参与所述植物中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的遗传修饰的相应部分，所述植物的茎或根中的TAG含量增加至少2-倍，更优选至少3-倍。最优选地，至少指导第一外源多核苷酸表达的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十六、第十八和第十九方面，优选所述植物或其部分是表型正常的，因为当与未修饰的植物或其部分相比时其生长和繁殖的能力未显著降低。优选地，当在相同条件下生长时，产生的生物质、生长速度、发芽率、贮藏器官大小、种子大小和/或活种子的数量不少于相应野生型植物的90％。在一实施方案中，所述植物是与相应的野生型植物同样雄性或雌性繁殖的，并且其花粉(如果产生)是如相应的野生型植物花粉可存活的，优选约100％可存活的。在一实施方案中，当所述植物物种产生种子时，相对于野生型植物的相应种子的发芽率，所述植物产生具有至少90％发芽率的种子。在一实施方案中，本发明的植物具有相对于在相同条件下生长的相应野生型植物的高度至少90％的植物高度。设想这些特性中的每个的组合。在一可选实施方案中，本发明的植物具有相对于在相同条件下生长的相应野生型植物的高度60％-90％的植物高度。在一实施方案中，本发明的植物或其部分，优选植物叶不表现出增加的坏死，即如果存在，坏死的程度与在相同的条件下生长和在相同的植物发育阶段的相应野生型植物或其部分所表现出的相同。这种特性特别应用于包含编码脂肪酸硫酯酶如FATB硫酯酶的外源多核苷酸的植物或其部分。以下实施方案应用于本发明的植物或其部分(包括第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十六、第十八和第十九方面)，以及产生所述植物或其部分的方法或使用所述植物或部分的方法。在一实施方案中，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是参与所述植物或其部分中的TAG、DAG或单酰甘油(MAG)生物合成的脂肪酰基酰基转移酶，优选所述植物或其部分中的TAG生物合成，如DGAT、PDAT、LPAAT、GPAT或MGAT，优选DGAT或PDAT。在另一实施方案中，参与所述植物或其部分中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶、Cgi58多肽、酰基-CoA氧化酶如ACX1或ACX2、或者参与所述植物中脂肪酸的β-氧化的多肽如PXA1过氧化物酶体ATP-结合盒转运蛋白，优选SDP1脂肪酶。在一实施方案中，所述油体包衣(OBC)多肽是油质蛋白，如聚油质蛋白或油体钙蛋白(caleosin)，或者优选脂滴相关蛋白(LDAP)。在一实施方案中，增加脂肪酸输出所述植物的质体的多肽是C16或C18脂肪酸硫酯酶如FATA多肽或FATB多肽、脂肪酸转运蛋白如ABCA9多肽或长链酰基-CoA合成酶(LACS)。在一实施方案中，参与将脂肪酸输入所述植物的质体的多肽是脂肪酸转运蛋白或其亚基，优选TGD多肽，例如，TGD1多肽、TGD2多肽、TGD3多肽或TGD4多肽。在一实施方案中，参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT、质体LPAAT或质体PAP。在一实施方案中，本发明的植物或其部分是16：3植物或其部分，并且其包含以下一个或多个或全部；a)外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述外源多核苷酸的相应植物相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述植物的质体，b)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述植物的质体的多肽的内源生成和/或活性，c)第二遗传修饰，当与缺少所述第二遗传修饰的相应植物相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中将所述外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物或其部分中的表达的启动子。在一可选实施方案中，本发明的植物或其部分是18：3植物或其部分。在一实施方案中，在所述植物开花之前，所述植物的营养性部分包含至少约8％、至少约10％、约11％、8％-15％或9％-12％(w/w干重)的总非极性脂质含量。在一实施方案中，一个或多个或全部遗传修饰是部分或完全失活基因的内源基因突变，如点突变、插入或缺失(或者它们中的一种或多种的组合)，优选引入的突变。点突变可以是减少基因或所编码的多肽的活性的提前终止密码子、剪接位点突变、移码突变或氨基酸取代。缺失可以是基因的转录外显子或启动子内的一个或多个核苷酸的缺失，或者延伸跨过或进入一个以上外显子，或者延伸至整个基因的缺失。优选地，通过使用ZF、TALEN或CRISPR技术引入缺失。在一可选实施方案中，一个或多个或全部遗传修饰是编码抑制内源基因表达的RNA分子的外源多核苷酸，其中将所述外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述植物或其部分中的表达的启动子。在一实施方案中，编码WRI1的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：21-75或205-210中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：21-75或205-210中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)和/或ii)的核苷酸。优选地，所述WRI1多肽是除拟南芥WRI1(SEQIDNO：21或22)以外的WRI1多肽。更优选地，所述WRI1多肽包含序列如SEQIDNO：208所示的氨基酸或其生物活性片段，或者氨基酸序列与其至少30％相同的多肽。在一实施方案中，所述植物或其部分中的总非极性脂质含量、或者一种或多种非极性脂质、和/或油酸或PUFA的水平可通过利用获得自所述植物或其营养性部分的脂肪酸甲基酯的气相色谱分析确定。在另一实施方案中，其中所述植物部分是叶，并且所述叶的总非极性脂质含量可通过利用核磁共振(NMR)分析确定。在一实施方案中，所述植物或其部分是至少约1000个这类植物或部分的群体或集合的成员之一。在另一方面，本发明提供至少约1000个植物的群体，每个是本发明的植物，生长在田间。在另一方面，本发明提供至少约1000个营养性植物部分的集合，每个是本发明的营养性植物部分，其中所述营养性植物部分已从生长在田间的植物收获。在本发明的细胞、非人生物体、植物或其部分的实施方案中，增加一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因在所述细胞中的表达的转录因子多肽是WRI1转录因子，参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽是DGAT如DGAT1或DGAT2、或者PDAT，并且参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽是SDP1脂肪酶。在一优选实施方案中，油体包衣(OBC)多肽是油质蛋白，增加脂肪酸输出所述细胞质体的多肽是脂肪酸硫酯酶如FATA或FATB硫酯酶，参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽是TGD多肽，优选TGD1多肽，并且参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽是质体GPAT。在一更优选的实施方案中，所述细胞在营养性植物部分中，并且在所述植物开花之前，所述营养性植物部分的TAG含量为至少8％(％干重)。在一实施方案中，所述植物、营养性植物部分、非人生物体或其部分、种子或马铃薯块茎包括编码WRI1的第一外源多核苷酸、编码DGAT或PDAT(优选DGAT1)的第二外源多核苷酸、编码RNA(其减少编码SDP1多肽的基因表达)的第三外源多核苷酸以及编码油质蛋白的第四外源多核苷酸。在优选的实施方案中，所述营养性植物部分、非人生物体或其部分、种子或马铃薯块茎具有以下特性中的一种或多种或全部：i)至少8％、至少10％、至少12％、至少14％或至少15.5％(％重量)的总脂质含量，ii)相对于缺少所述外源多核苷酸的相应营养性植物部分或非人生物体，在所述营养性植物部分或非人生物体中高至少3倍、至少5倍、至少7倍、至少8倍或至少10倍的总脂质含量，iii)至少5％。、至少6％、至少6.5％或至少7％(干重或种子重量的重量％)的总TAG含量，iv)相对于缺少所述外源多核苷酸的相应营养性植物部分或非人生物体高至少40、至少50倍、至少60倍、或至少70倍、至少100倍、或至少120-倍的总TAG含量，v)油酸包含TAG中的至少15％、至少19％或至少22％(干重或种子重量的重量％)的脂肪酸，vi)相对于缺少所述外源多核苷酸的相应营养性植物部分或非人生物体，TAG中高至少10倍、至少15倍或至少17倍水平的油酸，vii)棕榈酸包含TAG中的至少20％、至少25％、至少30％或至少33％(％重量)的脂肪酸，viii)相对于缺少所述外源多核苷酸的相应营养性植物部分或非人生物体，TAG中高至少1.5倍水平的棕榈酸，ix)亚油酸包含TAG中的至少22％、至少25％、至少30％或至少34％(％重量)的脂肪酸，x)α-亚麻酸包含TAG中的少于20％、少于15％、少于11％或少于8％(％重量)的脂肪酸，xi)相对于缺少所述外源多核苷酸的相应营养性植物部分或非人生物体，TAG中低至少5倍或至少8倍水平的α-亚麻酸，以及xii)对于马铃薯块茎，在干重基础上至少0.5％的TAG含量和/或在干重基础上至少1％，优选至少1.5％或至少2.0％的总脂肪酸含量。还提供本发明的植物的种子或获得自本发明的植物的种子。在另一方面，本发明提供一种转基因植物茎，或者至少1g干重的茎的部分，在重量基础上(干重)，其TAG含量为至少5％，优选至少6％，更优选至少7％。在一实施方案中，所述转基因植物茎或茎部分是双子叶植物的，或者优选收获自双子叶植物。或者，所述转基因植物茎或茎部分是单子叶植物的，或者优选收获自单子叶植物。在一实施方案中，所述植物茎或茎部分是除甘蔗以外的植物的，或者来自除甘蔗以外的植物。在实施方案中，所述植物茎或茎部分的进一步特征在于如本发明的细胞或植物的上下文中定义的一个或多个特性。在另一方面，本发明提供植物细胞，其包含a)编码PDAT的第一外源多核苷酸，b)第一遗传修饰，当与缺少所述第一遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与将脂肪酸输入所述细胞质体的多肽(优选TGD多肽)的内源生成和/或活性，以及以下一个或多个c)第二遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与所述细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽(优选SDP1多肽)的内源生成和/或活性，d)第二外源多核苷酸，其编码这样的多肽，当与缺少所述第二外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出所述细胞质体，优选脂肪酰基硫酯酶，以及e)第三遗传修饰，当与缺少所述第三遗传修饰的相应细胞相比时，其下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，其中每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述多核苷酸在所述细胞中的表达的启动子。在一优选实施方案中，当与具有PDAT但缺少额外的遗传修饰或外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述细胞中第一、第二或第三遗传修饰或者第二外源多核苷酸的存在协同地增加所述细胞的总非极性脂质含量。更优选地，至少一个外源多核苷酸表达自除组成型启动子以外的启动子。在另一方面，本发明提供一种获得本发明的重组真核细胞的方法，所述方法包括以下步骤：i)将如本文定义的至少一个外源多核苷酸和/或至少一个遗传修饰引入真核细胞以产生包含一组如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰的真核细胞，ii)在所述细胞或其子代细胞中表达所述外源多核苷酸，iii)分析所述细胞或子代细胞的脂质含量，以及iv)选择本发明的细胞。在一实施方案中，将所述一个或多个外源多核苷酸稳定地整合入所述细胞或子代细胞的基因组。在一实施方案中，所述方法进一步包括从包含所述一个或多个外源多核苷酸的细胞或子代细胞再生转基因植物的步骤。在另一实施方案中，再生转基因植物的步骤在所述细胞或其子代细胞中表达所述一个或多个外源多核苷酸的步骤之前进行，和/或在分析所述细胞或子代细胞的脂质含量的步骤之前进行，和/或在选择具有升高水平的一种或多种非极性脂质的细胞或子代细胞的步骤之前进行。在另一实施方案中，所述方法进一步包括从所述转基因植物获得种子或子代植物的步骤，其中所述种子或子代植物包含所述一个或多个外源多核苷酸。在另一实施方案中，所选细胞或由其再生的植物，或者再生植物的营养性植物部分或种子具有如本文定义的一种或多种特性。在另一方面，本发明提供一种产生具有整合入其基因组的一组如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰的植物的方法，所述方法包括以下步骤i)杂交两种亲本植物，其中一种植物包含如本文定义的至少一个外源多核苷酸和/或至少一个遗传修饰，并且另一种植物包含如本文定义的至少一个外源多核苷酸和/或至少一个遗传修饰，并且其中在它们之间，所述两种亲本植物包含一组如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰，ii)筛选来自杂交的一个或多个子代植物中存在或不存在如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰的组，以及iii)选择包含如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰的组的子代植物，从而产生所述植物。还提供一种利用本发明的方法获得的转基因细胞或转基因植物，或者由其获得的部分，其包含如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰的组。还提供一组如本文定义的外源多核苷酸和/或遗传修饰在制备转基因细胞、转基因非人生物体或其部分或者种子中的用途，相对于缺少该组外源多核苷酸和/或遗传修饰的相应细胞、非人生物体或其部分或者种子，所述转基因细胞、转基因非人生物体或其部分或者种子具有增强的产生一种或多种非极性脂质的能力，其中将每个外源多核苷酸可操作地连接至能够指导所述外源多核苷酸在所述转基因细胞、转基因非人生物体或其部分或者种子中的表达的启动子。优选地，至少一个可操作地连接至编码转录因子多肽的外源多核苷酸的启动子是除组成型启动子以外的启动子。在一实施方案中，所述转基因细胞、非人生物体或其部分、或者种子包含本文定义的一种或多种特性。在另一方面，本发明提供一种生产工业产品的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，以及ii)通过在所述非人生物体或其部分中原位向脂质施用热、化学或酶促方式，或者它们的任何组合，将所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子中的至少一些脂质转化为工业产品，以及iii)回收所述工业产品，从而生产所述工业产品。在另一方面，本发明提供一种生产工业产品的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，以及ii)物理加工步骤i)的细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分或者种子，iii)通过向加工的细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子中的脂质施用热、化学或酶促方式，或者它们的任何组合，同时或随后将加工的细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子中的至少一些脂质转化为工业产品，以及iv)回收所述工业产品，从而生产所述工业产品。在上述两个方面的一实施方案中，所述植物部分是营养性植物部分。在另一方面，本发明提供一种生产工业产品的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得营养性植物部分，其具有至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，ii)通过在所述营养性植物部分中原位向脂质施用热、化学或酶促方式，或者它们的任何组合，将所述营养性植物部分中的至少一些脂质转化为工业产品，以及iii)回收所述工业产品，从而生产所述工业产品。在另一方面，本发明提供一种生产工业产品的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得营养性植物部分，其具有至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，ii)物理加工步骤i)的营养性植物部分，iii)通过向加工的营养性植物部分中的脂质施用热、化学或酶促方式，或者它们的任何组合，同时或随后将加工的营养性植物部分中的至少一些脂质转化为工业产品，以及iv)回收所述工业产品，从而生产所述工业产品。在另一方面，本发明提供一种生产工业产品的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得营养性植物部分，其具有至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，其中所述植物是16：3植物或其营养性部分，ii)通过在所述营养性植物部分中原位向脂质施用热、化学或酶促方式，或者它们的任何组合，将所述营养性植物部分中的至少一些脂质转化为工业产品，以及iii)回收所述工业产品，从而生产所述工业产品。在另一方面，本发明提供一种生产工业产品的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得营养性植物部分，其具有至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，其中所述植物是16：3植物或其营养性部分，ii)物理加工步骤i)的营养性植物部分，iii)通过向加工的营养性植物部分中的脂质施用热、化学或酶促方式，或者它们的任何组合，同时或随后将加工的营养性植物部分中的至少一些脂质转化为工业产品，以及iv)回收所述工业产品，从而生产所述工业产品。在一实施方案中，物理加工所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子的步骤包括碾压、压榨、破碎或研磨所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子，在一实施方案中，所述方法包括以下步骤：(a)提取所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子的至少一些非极性脂质含量为非极性脂质，以及(b)回收提取的非极性脂质，其中在将所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分、或者种子中的至少一些脂质转化为工业产品的步骤之前进行步骤(a)和(b)。在一实施方案中，提取的非极性脂质包含三酰甘油，其中所述三酰甘油包含提取的脂质的至少90％，优选至少95％。在一实施方案中，所述工业产品是烃类产品如脂肪酸酯，优选脂肪酸甲基酯和/或脂肪酸乙基酯，烷如甲烷、乙烷或较长链烷，较长链烷的混合物，烯，生物燃料，一氧化碳和/或氢气，生物醇(bioalcohol)如乙醇、丙醇或丁醇，生物炭，或者一氧化碳、氢和生物炭的组合。在一优选实施方案中，所述营养性植物部分的总脂肪酸含量包含至少5％C12：0、C14：0，或者C12：0和C14：0的总和是总脂肪酸含量的至少5％，并且产生自所述营养性植物部分中的脂质的工业产品是航空燃料中的组分。在另一方面，本发明提供一种生产提取的脂质的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，ii)从所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分或者种子提取脂质，以及iii)回收提取的脂质，从而生产提取的脂质。在另一方面，本发明提供一种生产提取的脂质的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得营养性植物部分，其具有至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，ii)从所述营养性植物部分提取脂质，以及iii)回收提取的脂质，从而生产提取的脂质。在另一方面，本发明提供一种生产提取的脂质的方法，所述方法包括以下步骤：i)获得营养性植物部分，其具有至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，其中所述植物是16：3植物或其营养性部分，ii)从所述营养性植物部分提取脂质，以及iii)回收提取的脂质，从而生产提取的脂质。在一实施方案中，提取的方法包括干燥、碾压、压榨、破碎或研磨所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分或者种子中的一种或多种，和/或纯化提取的脂质或种子油。在一实施方案中，所述方法在提取方法中使用有机溶剂以提取油。在另一实施方案中，所述方法包括通过在容器中收集来回收提取的脂质或油和/或脱胶、除臭、脱色、干燥、分级分离提取的脂质或油中的一种或多种，从提取的脂质或油去除至少一些蜡和/或蜡酯，或者分析提取的脂质或油的脂肪酸组成。在一实施方案中，提取的脂质或油的体积为至少1升。在另一实施方案中，以下特性中的一种或多种或全部应用：(i)提取的脂质或油包含三酰甘油，其中所述三酰甘油包含提取的脂质或油的至少90％，优选至少95％或至少96％，(ii)提取的脂质或油包含游离的固醇、硬脂酰酯、硬脂酰糖苷、蜡或蜡酯，或者它们的任何组合，以及(iii)提取的脂质或油的总固醇含量和/或组成显著不同于产生自相应的细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分或者种子的提取的脂质或油的固醇含量和/或组成。在一实施方案中，所述方法进一步包括将提取的脂质或油转化为工业产品。在一实施方案中，所述工业产品是烃类产品如脂肪酸酯，优选脂肪酸甲基酯和/或脂肪酸乙基酯，烷如甲烷、乙烷或较长链烷，较长链烷的混合物，烯，生物燃料，一氧化碳和/或氢气，生物醇如乙醇、丙醇或丁醇，生物炭，或者一氧化碳、氢和生物炭的组合。在一优选实施方案中，所述营养性植物部分的总脂肪酸含量包含至少5％C12：0、C14：0，或者C12：0和C14：0的总和是总脂肪酸含量的至少5％，并且产生自所述营养性植物部分中的脂质的工业产品是航空燃料中的组分。在另一实施方案中，所述植物部分是地表植物部分或绿色植物部分，优选营养性植物部分如植物叶或茎。在一可选实施方案中，所述植物部分是块茎或根，如马铃薯(Solanumtuberosum)块茎或甜菜根。在另一实施方案中，所述方法进一步包括收获所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分如块茎或根或者种子的步骤，优选用机械收割机，或者通过包括藻类或真菌生物的过滤、离心、沉降、浮选或絮凝的方法。在另一实施方案中，所述细胞、非人生物体或其部分、植物或其部分或者种子和/或提取的脂质或油中的脂质水平可通过利用制备自提取的脂质或油的脂肪酸甲基酯的气相色谱分析确定。在另一实施方案中，所述方法进一步包括从植物收获所述部分。在一实施方案中，所述植物部分是营养性植物部分，其包含至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量。在另一实施方案中，所述植物部分是营养性植物部分，其包含至少约18％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、18％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总TAG含量。在另一实施方案中，所述植物部分是营养性植物部分，其包含至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总非极性脂质含量，并且其中所述营养性植物部分来自16：3植物。在另一实施方案中，所述植物部分是营养性植物部分，其包含至少约11％、至少约12％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、8％-75％、10％-75％、11％-75％、约15％-75％、约20％-75％、约30％-75％、约40％-75％、约50％-75％、约60％-75％或约25％-50％(w/w干重)的总TAG含量，并且其中所述营养性植物部分来自16：3植物。还提供一种产生种子的方法，所述方法包括：i)使本发明的植物生长，以及ii)从所述植物收获种子。在一实施方案中，上述方法包括使至少约1000个植物的群体生长，每个是本发明的植物，并且从所述植物群体收获种子。在另一方面，本发明提供一种发酵方法，其包括以下步骤：i)提供一种容器，其包含脂质组合物，所述脂质组合物包含本发明的重组真核细胞或本发明的转基因非人生物体，其中所述细胞或非人生物体适合发酵，以及发酵和脂肪酸生物合成需要的成分，以及ii)提供有助于所述容器中包含的脂质组合物的发酵的条件。还提供可获得自本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，或者可通过本发明的方法获得的回收或提取的脂质。在另一方面，本发明提供通过本发明的方法生产的工业产品，其是烃类产品如脂肪酸酯，优选脂肪酸甲基酯和/或脂肪酸乙基酯，烷如甲烷、乙烷或较长链烷，较长链烷的混合物，烯，生物燃料，一氧化碳和/或氢气，生物醇如乙醇、丙醇或丁醇，生物炭，或者一氧化碳、氢和生物炭的组合。还提供本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，或者本发明的回收或提取的脂质在制造工业产品中的用途。本发明的工业产品的实例包括但不限于烃类产品如脂肪酸酯，优选脂肪酸甲基酯和/或脂肪酸乙基酯，烷如甲烷、乙烷或较长链烷，较长链烷的混合物，烯，生物燃料，一氧化碳和/或氢气，生物醇如乙醇、丙醇或丁醇，生物炭，或者一氧化碳、氢和生物炭的组合。在另一方面，本发明提供一种生产燃料的方法，所述方法包括：i)使本发明的脂质任选地在催化剂的存在下与醇反应，以便产生烷基酯，以及ii)任选地，混合所述烷基酯与基于石油的燃料。在上述方法的一实施方案中，所述烷基酯是甲基酯。在另一方面，本发明提供一种生产合成柴油燃料的方法，所述方法包括：i)通过包括热解或水热处理的方法将本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分转化为生物油，或者通过气化将其转化为合成气，以及ii)通过包括分级分离的方法将所述生物油转化为合成柴油燃料，优选选择在约150℃-约200℃或约200℃-约300℃下缩合(condense)的碳氢化合物，或者利用金属催化剂或微生物催化剂将合成气转化为生物燃料。在另一方面，本发明提供一种生产生物燃料的方法，所述方法包括通过热解将本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分中的脂质转化为生物油，通过发酵将其转化为生物醇，或者通过气化或厌氧消化将其转化为沼气。在上述方法的一实施方案中，所述部分是营养性植物部分。还提供一种生产饲料的方法，所述方法包括混合本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，或者可通过本发明的方法获得，或者其提取物或部分，与至少一种其他食品成分。在另一方面，本发明提供饲料、化妆品或化学品，其包含本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分，或者可通过本发明的方法获得，或者其提取物或部分。在另一方面，本发明提供一种饲养动物的方法，所述方法包括向所述动物提供本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因植物或其部分、或者本发明的回收或提取的脂质。除非另有特别说明，本文的任何实施方案应当准用于任何其他实施方案。本发明的范围并不限于本文所述的具体实施方案，其仅为了示例的目的。明确地，功能等同的产物、组合物和方法在如本文所述的发明的范围内。在这个说明书中，除非另有特别说明或上下文另有要求，提到单一步骤、物质的组合物、步骤的组或物质的组合物的组应当涵盖那些步骤、物质的组合物、步骤的组或物质的组合物的组中的一个或许多(即一个或多个)。此后本发明通过以下非限制性实施例并参考附图来描述。附图简述图1.真核细胞中脂质合成的图示，示出质体中合成的一些脂肪酸通过质体相关膜(PLAM)输出至内质网(ER)，以及一些脂肪酸从ER输入质体用于真核半乳糖脂合成。缩写：乙酰基-CoA和丙二酰基-CoA：乙酰基-辅酶A和丙二酰基-辅酶A；ACCase：乙酰基-CoA羧化酶；FAS：脂肪酸合酶复合物；16：0-ACP、18：0-ACP和18：1-ACP：C16：0-酰基载体蛋白(ACP)、C18：0-酰基载体蛋白、C18：1-酰基载体蛋白；KASII：酮脂酰-ACP合酶II(EC2.3.1.41)；PLPAAT：质体LPAAT；PGPAT：质体GPAT；PAP：PA磷酸化酶(EC3.1.3.4)；G3P：甘油-3-磷酸；LPA：溶血磷脂酸；PA：磷脂酸；DAG：二酰甘油；TAG：三酰甘油；酰基-CoA和酰基-PC：酰基-辅酶A和酰基-磷脂酰胆碱；PC：磷脂酰胆碱；GPAT：甘油-3-磷酸酰基转移酶；LPAAT：溶血磷脂酸酰基转移酶(EC2.3.1.51)；LPCAT：酰基-CoA：溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶；或者同义词1-酰基甘油磷酸胆碱O-酰基转移酶；酰基-CoA：1-酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱O-酰基转移酶(EC2.3.1.23)；CPT：CDP-胆碱：二酰甘油胆碱磷酸转移酶；或者同义词1-烷基-2-乙酰基甘油胆碱磷酸转移酶；烷基酰基甘油胆碱磷酸转移酶；胆碱磷酸转移酶；磷酰胆碱-甘油酯转移酶(EC2.7.8.2)；PDCT：磷脂酰胆碱：二酰甘油胆碱磷酸转移酶；PLC：磷脂酶C(EC3.1.4.3)；PLD：磷脂酶D；胆碱磷酸酶；卵磷脂酶D；磷脂二酯酶II(EC3.1.4.4)；PDAT：磷脂：二酰甘油酰基转移酶；或者同义词磷脂：1，2-二酰基-sn-甘油O-酰基转移酶(EC2.3.1.158)；FAD2：脂肪酸Δ12-去饱和酶；FAD3，脂肪酸Δ15-去饱和酶；UDP-Gal：尿苷二磷酸半乳糖；MGDS：单半乳糖基二酰甘油合酶；MGDG：单半乳糖基二酰甘油；DGDG：二半乳糖基二酰甘油FAD6，7，8：分别为在低温下诱导的质体脂肪酸Δ12-去饱和酶、质体ω3-去饱和酶、质体ω3-去饱和酶。图2.增加双子叶植物中的种子油含量的构建体的遗传示意图。缩写：PROPissa-豌豆球蛋白，豌豆(Pisumsativum)的豌豆球蛋白启动子和5′UTR；TMV前导区，烟草花叶病毒的5’UTR；Arath-DGAT1，编码拟南芥DGAT1的蛋白编码区；TERGlyma-凝集素，栽培大豆(G.max)凝集素基因的3’终止子/多腺苷酸化区；PROPhavu-菜豆蛋白，来自菜豆(Phaseolusvulgaris)的菜豆蛋白基因的启动子；Arath-WRI1，编码拟南芥WRI1的蛋白编码区；TERAgrtu-NOS，根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)Nos基因的3’终止子/多腺苷酸化区；PROPhavu-PHA，菜豆的菜豆蛋白基因的启动子；Sesin-油质蛋白，编码芝麻(Sesameindicum)油质蛋白基因的蛋白编码区；TERPhavu-PHA，菜豆的菜豆蛋白基因的3’终止子/多腺苷酸化区。图3.载体pOIL122的示意图。缩写：TERAgrtu-Nos，根癌农杆菌胭脂碱合酶终止子；NPTII，新霉素磷酸转移酶蛋白编码区；PROCaMV35S-Ex2，具有双增强子区的花椰菜花叶病毒35S启动子；Arath-DGAT1，拟南芥DGAT1酰基转移酶蛋白编码区；PROArath-RubiscoSSU，拟南芥Rubisco小亚基启动子；Arath-FATA2，拟南芥FATA2硫酯酶蛋白编码区；Arath-WRI，拟南芥WRI1转录因子蛋白编码区；TERGlyma-凝集素，大豆凝集素终止子；enTCUP2启动子，红花烟草隐蔽性组成型启动子；attB1和attB2，Gateway重组位点；NBSDP1片段，hpRNAi沉默靶向的本氏烟草SDP1区；OCS终止子，根癌农杆菌(A.tumefaciens)章鱼碱合酶终止子。T-DNA区外的骨架特征源自pORE04(Coutuetal.，2007)。图4.说明WRI1+DGAT1介导的高油背景对本氏烟草叶中的MCFA生成的影响的总脂肪酸甲基酯(FAME)谱(重量％)(n＝4)。在添加Arath-WRI1之后观察到最高的MCFA生成。图5.说明WRI1对MCFA积累的影响的叶总FAME谱(重量％)(n＝4)。相对于以前单独添加Cocnu-LPAAT，添加Arath-WRI1大大增加相关脂肪酸(C12：0、C14：0或C16：0)的生成。图6.在表达3种油棕DGAT与FATB、LPAAT和WRI1的组合之后植物细胞中的TFA水平(重量％)、TAG水平、TFA中的MCFA(C16：0和C14：0，总脂肪酸的％)和TAG中的MCFA(TAG中的脂肪酸含量的％)的水平。数字1-10如文中所列(实施例9)。图7.本氏烟草叶组织中的TAG水平(％叶干重)，用编码不同WRI1多肽的基因渗透，有(右边的条)或无(左边的条)DGAT1的共表达(n＝3)。所有样品还用P19构建体渗透。图8.本氏烟草SDP1发夹构建体的示意图。示出的遗传片段如实施例11所述。缩写如图3。attB位点代表来自pHELLSGATE12载体的重组位点。图9.用来自pOIL51的T-DNA转化的烟草植物的绿叶样品中的TAG含量，品系#61和#69，在开花之前收获。对照(亲本)样品来自用来自pJP3502的T-DNA转化的植物。图10.野生型(wt)以及包含单独的来自pJP3502的T-DNA或额外地具有来自pOIL051的T-DNA的转基因红花烟草(N.tabacum)植物的根和茎组织中的TAG水平(％干重)。图11.野生型(wt)以及包含单独的来自pJP3502的T-DNA或额外地具有来自pOIL049的T-DNA的转基因红花烟草植物的根和茎组织中的TAG水平(％干重)。图12.处于生长的结实期的转化的烟草植物的叶样品中的TAG含量，用来自pOIL049的T-DNA转化，品系#23c和#32b。对照(亲本)样品来自用来自pJP3502的T-DNA转化的植物。上线示出TAG中的18∶2百分比，而下线示出脂肪酸含量中的18：3(ALA)百分比。图13.A.来自野生型植物(WT)以及包含来自pJP3502的T-DNA(HO对照)或者来自pJP3502和pOIL051(pOIL51.61和pOIL51.69)或者pJP3502和pOIL049(pOIL49.32b)的T-DNA的转基因植物的叶组织中的淀粉含量。数据代表来自至少3个单独植物的合并结果。B.野生型植物(WT)以及包含来自pJP3502的T-DNA(HO对照)或者来自pJP3502和pOIL051(pOIL51.61和pOIL51.69)或者pJP3502和pOIL049(pOIL49.32b)的T-DNA的转基因植物的叶组织中的淀粉和TAG含量之间的相关性。数据代表来自至少3个单独植物的合并结果。图14.pTV55二元载体的示意图。缩写：PRO，启动子；TER，3’终止/多腺苷酸化区；Arath，拟南芥；Linus，亚麻；Nicta，红花烟草；Glyma，栽培大豆；Cnl1，来自亚麻的conlinin1；Cnl2，来自亚麻的Conlinin2；MARNicat-RB7，来自烟草RB7的基质结合区，或者如图3。基因缩写MGAT2、DGAT1、GPAT4、WRI1如文中。图15.如通过NMR确定的用pTV55、pTV56和pTV57转化的亚麻荠(C.sativa)T2种子的油含量(％)。每个数据点代表每个转基因品系的3个独立批次的50mg种子的平均油含量。阴性对照种子是在温室中于相同条件下生长的野生型(未转化的)亚麻荠种子。N表示每个构建体的独立转基因事件的数量。图16.LDAP多肽的系统树(实施例15)。图17.在左右边界之间包括T-DNA区的遗传构建体pJP3506的示意图。缩写如图3以及：Sesin-油质蛋白，芝麻油质蛋白蛋白编码区。图18.野生型和转基因高油烟草营养植物材料作为原料的通过HTP的生物油生产的收率和热值变化。序列表的标注SEQIDNO：1拟南芥DGAT1多肽(CAB44774.1)SEQIDNO：2拟南芥DGAT2多肽(NP_566952.1)SEQIDNO：3蓖麻DGAT2多肽(AAY16324.1)SEQIDNO：4油桐(Verniciafordii)DGAT2多肽(ABC94474.1)SEQIDNO：5拉曼被孢霉(Mortierellaramanniana)DGAT2多肽(AAK84179.1)SEQIDNO：6智人(Homosapiens)DGAT2多肽(Q96PD7.2)SEQIDNO：7智人DGAT2多肽(Q58HT5.1)SEQIDNO：8家牛(Bostaurus)DGAT2多肽(Q70VZ8.1)SEQIDNO：9小家鼠(Musmusculus)DGAT2多肽(AAK84175.1)SEQIDNO：10YFP三肽-保守的DGAT2和/或MGAT1/2序列基序SEQIDNO：11HPHG四肽-保守的DGAT2和/或MGAT1/2序列基序SEQIDNO：12EPHS四肽-保守的植物DGAT2序列基序SEQIDNO：13RXGFX(K/R)XAXXXGXXX(L/V)VPXXXFG(E/Q)-DGAT2的长保守序列基序，其是推定的甘油磷脂结构域的部分SEQIDNO：14FLXLXXXN-小鼠DGAT2和MGAT1/2的保守序列基序，其是推定的中性脂质结合结构域SEQIDNO：15GPAT的plsC酰基转移酶结构域(PF01553)SEQIDNO：16GPAT的HAD样水解酶(PF12710)超家族结构域SEQIDNO：17磷酸丝氨酸磷酸酶结构域(PF00702)。GPAT4-8包含与这个结构域同源的N-端区域SEQIDNO：18保守的GPAT氨基酸序列GDLVICPEGTTCREPSEQIDNO：19保守的GPAT/磷酸酶氨基酸序列(基序I)SEQIDNO：20保守的GPAT/磷酸酶氨基酸序列(基序III)SEQIDNO：21拟南芥WRI1多肽(A8MS57)SEQIDNO：22拟南芥WRI1多肽(Q6X5Y6)SEQIDNO：23琴叶拟南芥琴叶亚种(Arabidopsislyratasubsp.lyrata)WRI1多肽(XP_002876251.1)SEQIDNO：24欧洲油菜WRI1多肽(ABD16282.1)SEQIDNO：25欧洲油菜WRI1多肽(ADO16346.1)SEQIDNO：26大豆WRI1多肽(XP_003530370.1)SEQIDNO：27麻风树WRI1多肽(AEO22131.1)SEQIDNO：28蓖麻WRI1多肽(XP_002525305.1)SEQIDNO：29毛果杨WRI1多肽(XP_002316459.1)SEQIDNO：30葡萄(Vitisvinifera)WRI1多肽(CBI29147.3)SEQIDNO：31二穗短柄草(Brachypodiumdistachyon)WRI1多肽(XP_003578997.1)SEQIDNO：32大麦(Hordeumvulgaresubsp.Vulgare)WRI1多肽(BAJ86627.1)SEQIDNO：33水稻WRI1多肽(EAY79792.1)SEQIDNO：34两色高粱WRI1多肽(XP_002450194.1)SEQIDNO：35玉米WRI1多肽(ACG32367.1)SEQIDNO：36二穗短柄草WRI1多肽(XP_003561189.1)SEQIDNO：37小颖短柄草(Brachypodiumsylvaticum)WRI1多肽(ABL85061.1)SEQIDNO：38水稻WRI1多肽(BAD68417.1)SEQIDNO：39两色高粱WRI1多肽(XP_002437819.1)SEQIDNO：40两色高粱WRI1多肽(XP_002441444.1)SEQIDNO：41大豆WRI1多肽(XP_003530686.1)SEQIDNO：42大豆WRI1多肽(XP_003553203.1)SEQIDNO：43毛果杨WRI1多肽(XP_002315794.1)SEQIDNO：44葡萄WRI1多肽(XP_002270149.1)SEQIDNO：45大豆WRI1多肽(XP_003533548.1)SEQIDNO：46大豆WRI1多肽(XP_003551723.1)SEQIDNO：47蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)WRI1多肽(XP_003621117.1)SEQIDNO：48毛果杨WRI1多肽(XP_002323836.1)SEQIDNO：49蓖麻WRI1多肽(XP_002517474.1)SEQIDNO：50葡萄WRI1多肽(CAN79925.1)SEQIDNO：51二穗短柄草WRI1多肽(XP_003572236.1)SEQIDNO：52水稻WRI1多肽(BAD10030.1)SEQIDNO：53两色高粱WRI1多肽(XP_002444429.1)SEQIDNO：54玉米WRI1多肽(NP_001170359.1)SEQIDNO：55琴叶拟南芥琴叶亚种WRI1多肽(XP_002889265.1)SEQIDNO：56拟南芥WRI1多肽(AAF68121.1)SEQIDNO：57拟南芥WRI1多肽(NP_178088.2)SEQIDNO：58琴叶拟南芥琴叶亚种WRI1多肽(XP_002890145.1)SEQIDNO：59小盐芥(Thellungiellahalophila)WRI1多肽(BAJ33872.1)SEQIDNO：60拟南芥WRI1多肽(NP_563990.1)SEQIDNO：61大豆WRI1多肽(XP_003530350.1)SEQIDNO：62二穗短柄草WRI1多肽(XP_003578142.1)SEQIDNO：63水稻WRI1多肽(EAZ09147.1)SEQIDNO：64两色高粱WRI1多肽(XP_002460236.1)SEQIDNO：65玉米WRI1多肽(NP_001146338.1)SEQIDNO：66大豆WRI1多肽(XP_003519167.1)SEQIDNO：67大豆WRI1多肽(XP_003550676.1)SEQIDNO：68蒺藜苜蓿WRI1多肽(XP_003610261.1)SEQIDNO：69大豆WRI1多肽(XP_003524030.1)SEQIDNO：70大豆WRI1多肽(XP_003525949.1)SEQIDNO：71毛果杨WRI1多肽(XP_002325111.1)SEQIDNO：72葡萄WRI1多肽(CBI36586.3)SEQIDNO：73葡萄WRI1多肽(XP_002273046.2)SEQIDNO：74毛果杨WRI1多肽(XP_002303866.1)SEQIDNO：75葡萄WRI1多肽(CBI25261.3)SEQIDNO：76Sorbi-WRL1SEQIDNO：77Lupan-WRL1SEQIDNO：78Ricco-WRL1SEQIDNO：79狭叶羽扇豆(Lupinangustifolius)WRI1多肽SEQIDNO：80烟曲霉(Aspergillusfumigatus)DGAT1多肽(XP_755172.1)SEQIDNO：81蓖麻DGAT1多肽(AAR11479.1)SEQIDNO：82油桐DGAT1多肽(ABC94472.1)SEQIDNO：83斑鸠菊(Vernoniagalamensis)DGAT1多肽(ABV21945.1)SEQIDNO：84斑鸠菊DGAT1多肽(ABV21946.1)SEQIDNO：85卫矛(Euonymusalatus)DGAT1多肽(AAV31083.1)SEQIDNO：86秀丽隐杆线虫(Caenorhabditiselegans)DGAT1多肽(AAF82410.1)SEQIDNO：87褐鼠(Rattusnorvegicus)DGAT1多肽(NP_445889.1)SEQIDNO：88智人DGAT1多肽(NP_036211.2)SEQIDNO：89WRI1基序(RGVT/SRHRWTGR)SEQIDNO：90WRI1基序(F/YEAHLWDK)SEQIDNO：91WRI1基序(DLAALKYWG)SEQIDNO：92WRI1基序(SXGFS/ARGX)SEQIDNO：93WRI1基序(HHH/QNGR/KWEARIGR/KV)SEQIDNO：94WRI1基序(QEEAAAXYD)SEQIDNO：95欧洲油菜油质蛋白多肽(CAA57545.1)SEQIDNO：96欧洲油菜油质蛋白S1-1多肽(ACG69504.1)SEQIDNO：97欧洲油菜油质蛋白S2-1多肽(ACG69503.1)SEQIDNO：98欧洲油菜油质蛋白S3-1多肽(ACG69513.1)SEQIDNO：99欧洲油菜油质蛋白S4-1多肽(ACG69507.1)SEQIDNO：100欧洲油菜油质蛋白S5-1多肽(ACG69511.1)SEQIDNO：101花生(Arachishypogaea)油质蛋白1多肽(AAZ20276.1)SEQIDNO：102花生油质蛋白2多肽(AAU21500.1)SEQIDNO：103花生油质蛋白3多肽(AAU21501.1)SEQIDNO：104花生油质蛋白5多肽(ABC96763.1)SEQIDNO：105蓖麻油质蛋白1多肽(EEF40948.1)SEQIDNO：106蓖麻油质蛋白2多肽(EEF51616.1)SEQIDNO：107大豆油质蛋白同种型a多肽(P29530.2)SEQIDNO：108大豆油质蛋白同种型b多肽(P29531.1)SEQIDNO：109亚麻油质蛋白低分子量同种型多肽(ABB01622.1)SEQIDNO：110亚麻油质蛋白高分子量同种型多肽的氨基酸序列(ABB01624.1)SEQIDNO：111向日葵油质蛋白多肽(CAA44224.1)SEQIDNO：112玉米油质蛋白多肽(NP_001105338.1)SEQIDNO：113欧洲油菜油体固醇蛋白多肽(ABM30178.1)SEQIDNO：114欧洲油菜油体固醇蛋白SLO1-1多肽(ACG69522.1)SEQIDNO：115欧洲油菜油体固醇蛋白SLO2-1多肽(ACG69525.1)SEQIDNO：116芝麻油体固醇蛋白多肽(AAL13315.1)SEQIDNO：117玉米油体固醇蛋白多肽(NP_001152614.1)SEQIDNO：118欧洲油菜油体钙蛋白CLO-1多肽(ACG69529.1)SEQIDNO：119欧洲油菜油体钙蛋白CLO-3多肽(ACG69527.1)SEQIDNO：120芝麻油体钙蛋白多肽(AAF13743.1)SEQIDNO：121玉米油体钙蛋白多肽(NP_001151906.1)SEQIDNO：122pJP3502TDNA(插入基因组)序列SEQIDNO：123pJP3507载体序列SEQIDNO：124接头序列SEQIDNO：125选择用于hpRNAi沉默的部分本氏烟草CGI-58序列(pTV46)SEQIDNO：126选择用于hpRNAi沉默的部分红花烟草AGPase序列(pTV35)SEQIDNO：127GXSXG脂肪酶基序SEQIDNO：128HX(4)D酰基转移酶基序SEQIDNO：129VX(3)HGF可能的脂质结合基序SEQIDNO：130拟南芥CGi58多核苷酸(NM_118548.1)SEQIDNO：131二穗短柄草CGi58多核苷酸(XM_003578402.1)SEQIDNO：132大豆CGi58多核苷酸(XM_003523590.1)SEQIDNO：133玉米CGi58多核苷酸(NM_001155541.1)SEQIDNO：134两色高粱CGi58多核苷酸(XM_002460493.1)SEQIDNO：135蓖麻CGi58多核苷酸(XM_002510439.1)SEQIDNO：136蒺藜苜蓿CGi58多核苷酸(XM_003603685.1)SEQIDNO：137拟南芥LEC2多核苷酸(NM_102595.2)SEQIDNO：138蒺藜苜蓿LEC2多核苷酸(X60387.1)SEQIDNO：139欧洲油菜LEC2多核苷酸(HM370539.1)SEQIDNO：140拟南芥BBM多核苷酸(NM_121749.2)SEQIDNO：141蒺藜苜蓿BBM多核苷酸(AY899909.1)SEQIDNO：142拟南芥LEC2多肽(NP_564304.1)SEQIDNO：143蒺藜苜蓿LEC2多肽(CAA42938.1)SEQIDNO：144欧洲油菜LEC2多肽(ADO16343.1)SEQIDNO：145拟南芥BBM多肽(NP_197245.2)SEQIDNO：146蒺藜苜蓿BBM多肽(AAW82334.1)SEQIDNO：147可诱导的黑曲霉(Aspergilusniger)alcA启动子SEQIDNO：148在乙醇存在下激活AlcA启动子的AlcR诱导物SEQIDNO：149拟南芥LEC1；(AAC39488)SEQIDNO：150琴叶拟南芥(Arabidopsislyrata)LEC1(XP_002862657)SEQIDNO：151欧洲油菜LEC1(ADF81045)SEQIDNO：152蓖麻LEC1(XP_002522740)SEQIDNO：153大豆LEC1(XP_006582823)SEQIDNO：154蒺藜苜蓿LEC1(AFK49653)SEQIDNO：155玉米LEC1(AAK95562)SEQIDNO：156花生LEC1(ADC33213)SEQIDNO：157拟南芥LEC1样(AAN15924)SEQIDNO：158欧洲油菜LEC1样(AHI94922)SEQIDNO：159荷包豆(Phaseoluscoccineus)LEC1样(AAN01148)SEQIDNO：160拟南芥FUS3(AAC35247)SEQIDNO：161欧洲油菜FUS3SEQIDNO：162蒺藜苜蓿FUS3SEQIDNO：163拟南芥SDP1cDNA序列，登录号NM_120486，3275ntSEQIDNO：164欧洲油菜SDP1cDNA；登录号GN078290SEQIDNO：165二穗短柄草SDP1cDNA，2670ntSEQIDNO：166毛果杨SDP1cDNA，3884ntSEQIDNO：167蒺藜苜蓿SDP1cDNA；XM_003591377；2490ntSEQIDNO：168大豆SDP1cDNAXM_003521103；2783ntSEQIDNO：169两色高粱SDP1cDNAXM_002458486；2724ntSEQIDNO：170玉米SDP1cDNA，NM_001175206；2985ntSEQIDNO：171小立碗藓(Physcomitrellapatens)SDP1cDNA，XM_001758117；1998ntSEQIDNO：172大麦SDP1cDNA，AK372092；3439ntSEQIDNO：173本氏烟草SDP1cDNA，Nbv5tr6404201SEQIDNO：174hpRNAi沉默靶向的本氏烟草SDP1cDNA区域SEQIDNO：175拟南芥SDP1基因的启动子，1.5kbSEQIDNO：176pJP3502的T-DNA中的pSSU-Oleosin基因补体的核苷酸序列。顺序为(互补序列)：大豆凝集素终止子348nt，3’外显子255nt，UBQ10内含子304nt，5’外显子213nt，SSU启动子1751ntSEQIDNO：177拟南芥质体GPATcDNA，NM_179407SEQIDNO：178拟南芥质体GPAT多肽，NM_179407SEQIDNO：179毛果杨质体GPATcDNA，XP_006368351SEQIDNO：180麻风树质体GPATcDNA，ACR61638SEQIDNO：181蓖麻质体GPATcDNA，XP_002518993SEQIDNO：182向日葵质体GPATcDNA，ADV16382SEQIDNO：183蒺藜苜蓿质体GPATcDNA，XP_003612801SEQIDNO：184大豆质体GPATcDNA，XP_003516958SEQIDNO：185红花质体GPATcDNA，CAHG3PACTRSEQIDNO：186马铃薯质体GPATcDNA，XP_006352898SEQIDNO：187水稻，粳稻质体GPATcDNA，NM_001072027SEQIDNO：188两色高粱质体GPATcDNA，XM_002467381SEQIDNO：189玉米质体GPATcDNA，NM_001158637SEQIDNO：190大麦质体GPATcDNA，AK371419SEQIDNO：191小立碗藓质体GPATcDNA，XM_001771247SEQIDNO：192莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii)质体GPATcDNA，XM_001694925SEQIDNO：193樟树(Cinnamomumcamphora)14：0-ACP硫脂酶(Cinca-TE)，叶绿体，382aa，(登录号Q39473.1)SEQIDNO：194椰子酰基-ACP硫酯酶FatB1(Cocnu-TE1；417aa，登录号AEM72519.1SEQIDNO：195椰子酰基-ACP硫酯酶FatB2(Cocnu-TE2；423aa，登录号AEM72520.1)SEQIDNO：196椰子酰基-ACP硫酯酶FatB3(Cocnu-TE3；414aa，登录号AEM72521.1)SEQIDNO：197披针叶萼距花(Cuphealanceolata)酰基-(ACP)硫酯酶B型(Cupla-TE，419aa，登录号CAB60830.1)SEQIDNO：198粘毛萼距花(Cupheaviscosissima)FatB1(Cupvi-TE；419aa，登录号AEM72522.1)SEQIDNO：199加州月桂(Umbellulariacalifornica)12：0-ACP硫酯酶(月桂酰-酰基载体蛋白硫酯酶)(Umbca-TE，382aa；登录号Q41635.1)SEQIDNO：200椰子LPAAT(Cocnu-LPAAT，308aa，登录号Q42670.1)SEQIDNO：201拟南芥质体LPAAT1(Arath-PLPAAT；356aa，登录号AEE85783.1)SEQIDNO：202拟南芥FATA1SEQIDNO：203拟南芥FATA2SEQIDNO：204拟南芥FATBSEQIDNO：205拟南芥WR43SEQIDNO：206拟南芥WRI4SEQIDNO：207燕麦WRI1SEQIDNO：208两色高粱WRI1SEQIDNO：209玉米WRI1SEQIDNO：210乌臼(Triadicasebifera)WRI1SEQIDNO：211马铃薯(S.tuberosum)PatatinB33启动子序列SEQIDNOs212-215和245-254寡核苷酸引物SEQIDNO：216玉米(Z.mays)SEE1启动子区(来自登录号AJ494982的1970nt)SEQIDNO：217马伴草(A.littoralis)AlSAP启动子序列，登录号DQ885219SEQIDNO：218发根农杆菌(A.rhizogenes)ArRolC启动子序列，登录号DQ160187SEQIDNO：219包含本氏烟草质体GPAT的732bp片段的hpRNAi构建体SEQIDNO：220油棕(Elaeisguineensis，油棕(oilpalm))DGAT1SEQIDNO：221栽培大豆MYB73，登录号ABH02868SEQIDNO：222拟南芥bZIP53，登录号AAM14360SEQIDNO：223拟南芥AGL15，登录号NP_196883SEQIDNO：224拟南芥MYB118，登录号AAS58517SEQIDNO：225拟南芥MYB115，登录号AAS10103SEQIDNO：226拟南芥TANMEI，登录号BAE44475SEQIDNO：227拟南芥WUS，登录号NP_565429SEQIDNO：228欧洲油菜(B.napus)GFR2a1，登录号AFB74090SEQIDNO：229欧洲油菜GFR2a2，登录号AFB74089SEQIDNO：230拟南芥PHR1，登录号AAN72198SEQIDNO：231本氏烟草TGD1片段SEQIDNO：232马铃薯SDP1氨基酸SEQIDNO：233马铃薯SDP1核苷酸序列SEQIDNO：234马铃薯AGPase小亚基SEQIDNO：235马铃薯AGPase小亚基核苷酸序列SEQIDNO：236乌桕(Sapiumsebiferum)LDAP-1核苷酸序列SEQIDNO：237乌桕LDAP-1氨基酸序列SEQIDNO：238乌桕LDAP-2核苷酸序列SEQIDNO：239乌桕LDAP-2氨基酸序列SEQIDNO：240乌桕LDAP-3核苷酸序列SEQIDNO：241乌桕LDAP-3氨基酸序列SEQIDNO：242两色高粱(S.bicolor)SDP1(登录号XM_002463620)SEQIDNO：243小麦(T.aestivum)SDP1核苷酸序列(登录号AK334547)SEQIDNO：244两色高粱SDP1hpRNAi片段发明详述一般技术除非另外明确限定，否则本文所用的所有科技术语应采取本领域(如，细胞培养、分子遗传学、植物生物学、细胞生物学、蛋白化学、脂质和脂肪酸化学、生物燃料生产和生物化学领域)技术人员通常所理解的相同含义。除非另外指明，否则本发明所用的重组蛋白、细胞培养和免疫学技术是本领域技术人员熟知的标准程序。此类技术在诸如以下文献资源中有所描述和解释：J.Perbal，APracticalGuidetoMolecularCloning，JohnWileyandSons(1984)，J.Sambrook等，MolecularCloning：ALaboratoryManual，ColdSpringHarbourLaboratoryPress(1989)，T.A.Brown(编者)，EssentialMolecularBiology：APracticalApproach，卷1和2，IRLPress(1991)，D.M.Glover和B.D.Hames(编者)，DNACloning：APracticalApproach，卷1-4，IRLPress(1995和1996)，F.M.Ausubel等(编者)，CurrentProtocolsinMolecularBiology，GreenePub.AssociatesandWiley-Interscience(1988，包括到目前为止的所有更新)，EdHarlow和DavidLane(编者)Antibodies：ALaboratoryManual，ColdSpringHarbourLaboratory，(1988)，和J.E.Coligan等(编者)CurrentProtocolsinImmunology，JohnWiley&Sons(包括到目前为止的所有更新)。所选的定义术语“转基因非人生物体”是指例如包含一个或多个外源多核苷酸(转基因)或多肽的整个植物藻类、非人动物或适合发酵的生物体如酵母或真菌。在一实施方案中，转基因非人生物体不是动物或其部分。在一个实施方案中，转基因非人生物体是能够由阳光获得能量以合成有机化合物作为营养的光养生物体(例如，植物或藻类)。在多核苷酸或多肽背景下的术语“外源”是指当存在于天然不含所述多核苷酸或多肽的细胞中时的多核苷酸或多肽。这样的细胞在本文中称作“重组细胞”或“转基因细胞”。在一实施方案中，外源多核苷酸或多肽来自与包含所述外源多核苷酸或多肽的细胞不同的属。在另一实施方案中，外源多核苷酸或多肽来自不同的物种。在一实施方案中，外源多核苷酸或多肽在宿主植物或植物细胞中表达，并且外源多核苷酸或多肽来自不同的物种或属。所述外源多核苷酸或多肽可以是非天然存在的，例如，由重组DNA方法所产生的合成DNA分子。所述DNA分子可以(通常优选)包括已经过密码子优化用于在该细胞中表达的蛋白编码区，由此产生具有与天然存在的多肽相同的氨基酸序列的多肽，尽管所述蛋白编码区的核苷酸序列并不是天然存在的。所述外源多核苷酸可以编码、或所述外源多肽可以是：二酰甘油酰基转移酶(DGAT)如DGAT1或DGAT2、Wrinkled1(WRI1)转录因子、OBC如油质蛋白或优选LDAP、脂肪酸硫酯酶如FATA或FATB多肽、或者沉默抑制子多肽。如本文所用，术语“提取的脂质”是指从包含至少60％(w/w)脂质的转基因生物或其部分提取的组合物。如本文所用，术语“非极性脂质”是指可溶于有机溶剂但不溶于水的脂肪酸及其衍生物。脂肪酸可以为游离脂肪酸和/或为酯化形式。酯化形式的实例包括但不限于三酰甘油(TAG)、二酰甘油(DAG)、单酰甘油(MAG)。非极性脂质还包括固醇、固醇酯和蜡酯。非极性脂质也称为“中性脂质”。非极性脂质在室温下通常为液体。优选地，非极性脂质主要(＞50％)包含长度为至少16个碳的脂肪酸。更优选地，非极性脂质中总脂肪酸的至少50％为C18脂肪酸，例如油酸。优选地，非极性脂质中总脂肪酸的至少5％为C12或C14脂肪酸，或者两者。在一实施方案中，本发明的非极性脂质中脂肪酸的至少50％、更优选至少70％、更优选至少80％、更优选至少90％、更优选至少91％、更优选至少92％、更优选至少93％、更优选至少94％、更优选至少95％、更优选至少96％、更优选至少97％、更优选至少98％、更优选至少99％可作为TAG存在。非极性脂质可以例如通过用强碱水解以释放游离脂肪酸或通过分馏、蒸馏等方法进一步纯化或处理。非极性脂质可存在于或得自植物部分如种子、叶、块茎、根或果实、得自重组细胞或得自非人生物体如酵母。本发明的非极性脂质如果得自种子则可形成“种子油”的一部分。提取的脂质中的游离和酯化固醇(例如，谷固醇、菜油固醇、豆固醇、芸苔固醇、D5-燕麦固醇(D5-avenasterol)、谷甾烷醇(sitostanol)、菜油甾烷醇(campestanol)和胆固醇)浓度可如Phillips等，2002中所述。植物油中的固醇存在为：游离醇、与脂肪酸的酯(酯化的固醇)、固醇的糖苷和酰化的糖苷。天然存在的植物油(种子油)中的固醇浓度范围在高达最大约1100mg/100g。氢化的棕榈油具有天然存在的植物油的最低浓度之一，约60mg/100g。本发明的回收或提取的种子油优选具有约100至约1000mg的总固醇/100g的油。对于作为食品或饲料的用途，优选固醇主要作为游离或酯化的形式存在而不是糖基化的形式。在本发明的种子油中，优选油中至少50％的固醇作为酯化的固醇存在，除了大豆种子油外(其有约25％的固醇被酯化)。本发明的油菜油和油菜籽(rapeseed)油优选具有约500至约800mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇而菜油固醇其次。本发明的玉米种子油优选具有约600至约800mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。本发明的大豆种子油优选具有约150至约350mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇而豆固醇其次，并且具有比酯化的固醇多的游离固醇。本发明的棉花种子油优选具有约200至约350mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。本发明的椰子油和棕榈油优选具有约50至约100mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。本发明的红花种子油优选具有约150至约250mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。本发明的花生种子油优选具有约100至约200mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。本发明的芝麻种子油优选具有约400至约600mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。本发明的向日葵种子油优选具有约200至400mg的总固醇/100g，其中谷固醇为主要固醇。得自本发明的营养性植物部分的油优选具有低于200mg的总固醇/100g，更优选低于100mg的总固醇/100g，以及最优选低于50mg的总固醇/100g，其中固醇的大部分为游离固醇。如本文所用，术语“种子油”是指从包含至少60％(w/w)脂质的植物的种子/谷粒获得的或者在种子油仍存在于种子/谷粒中时可从种子/谷粒获得的组合物。也就是说，本发明的种子油包括存在于种子/谷粒或其部分中的种子油，以及已从种子/谷粒中提取出来的种子油。种子油优选为提取的种子油。种子油在室温下通常为液体。优选地，种子油中的总脂肪酸(TFA)含量主要(＞50％)包含长度为至少16个碳的脂肪酸。更优选地，种子油中的总脂肪酸的至少50％为C18脂肪酸，例如油酸。脂肪酸通常为酯化形式，例如TAG、DAG、酰基-CoA或磷脂。脂肪酸可以为游离脂肪酸和/或为酯化形式。在一实施方案中，本发明的种子油中脂肪酸的至少50％、更优选至少70％、更优选至少80％、更优选至少90％、更优选至少91％、更优选至少92％、更优选至少93％、更优选至少94％、更优选至少95％、更优选至少96％、更优选至少97％、更优选至少98％、更优选至少99％可作为TAG存在。在一实施方案中，本发明的种子油是已从在种子中或粗提取物中与其相关的一种或多种其他脂质、核酸、多肽或其他污染分子分离的“基本上纯化的”或“纯化的”油。优选的是，基本上纯化的种子油至少60％、更优选至少75％、更优选至少90％不含在种子或提取物中与其相关的其他组分。本发明的种子油可进一步包含非脂肪酸分子，例如但不限于固醇。在一实施方案中，所述种子油是油菜油(芸苔属如Brassicacarinata、Brassicajuncea、Brassicanapobrassica、欧洲油菜)、芥子油(芥菜(Brassicajuncea))，其它芸苔油(例如，Brassicanapobrassica，Brassicacamelina)，向日葵油(向日葵属如向日葵)，亚麻油(亚麻)，大豆油(大豆)，红花油(红花)，玉米油(玉米)，烟草油(烟草属如红花烟草或本氏烟草)，花生油(花生)，棕榈油(油棕)，棉花种子油(陆地棉)，椰子油(椰子)，鳄梨油(鳄梨(Perseaamericana))，橄榄油(橄榄(Oleaeuropaea))，腰果油(腰果(Anacardiumoccidentale))，澳大利亚坚果油(澳大利亚坚果(Macadamiaintergrifolia))，杏仁油(杏仁(Prunusamygdalus))，燕麦种子油(燕麦)，米油(稻属如水稻和光稃稻)，拟南芥种子油(拟南芥)，或者来自以下的种子的油：刺干椰(Acrocomiaaculeate)，花生(Aracinishypogaea)，木鲁星果棕(murumuru)，星实榈(Astrocaryumvulgare，)，Attaleageraensis(Indaiá-rateiro)，Attaleahumilis(美洲油棕)，Attaleaoleifera(andaiá)，Attaleaphalerata(uricuri)，Attaleaspeciosa(babassu)，甜菜，亚麻荠，Caryocarbrasiliense(pequi)，海甘蓝(Abyssiniankale)，甜瓜，大麦，麻风树(physicnut)，Joannesiaprinceps(araranut-tree)，奥蒂树(oiticica)，羽扇豆，曲叶矛榈，摩帝椰子，芒属如异源三倍体芒草奇岗和中国芒，巴卡巴酒实棕，巴套阿酒实棕，Oenocarpusdistichus(bacaba-de-leque)，柳枝稷(Panicumvirgatum，柳枝稷(switchgrass))，Paraqueibaparaensis(mari)，鳄梨，水黄皮(印度山毛榉)，毛果杨，蓖麻，蔗类(甘蔗)，芝麻，马铃薯，高粱属如两色高粱、高粱，大花可可，三叶草属，巴西针棕和小麦属如小麦。种子油可通过本领域已知的任何方法从种子/谷粒中提取。这通常涉及使用通常与种子的第一次破碎相关的非极性溶剂诸如乙醚、石油醚、氯仿/甲醇或丁醇混合物进行提取。谷粒中与淀粉相关的脂质可使用水饱和的丁醇提取。种子油可以通过本领域已知的方法“脱胶”以除去多糖，或者以其他方式处理以除去污染物或者改善纯度、稳定性或色泽。可以将种子油中的TAG和其他酯水解以释放游离脂肪酸，或者如本领域所已知将种子油氢化、化学处理或酶法处理。如本文所用，术语“脂肪酸”是指饱和或不饱和的具有长度为至少8个碳原子的长脂族尾部的羧酸。优选的脂肪酸具有长度为至少12个碳的碳-碳键合链。大多数天然存在的脂肪酸具有偶数个碳原子，因为它们的生物合成涉及具有两个碳原子的乙酸酯。脂肪酸可以为游离状态(非酯化)或酯化形式，例如TAG、DAG、MAG、酰基-CoA(硫代酯)键合、酰基-ACP键合或其他共价键合形式的一部分。当以酯化形式共价键合时，脂肪酸在本文中称作“酰基”基团。脂肪酸可以酯化为磷脂，例如磷脂酰胆碱(PC)、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰甘油、磷脂酰肌醇或双磷脂酰甘油。饱和脂肪酸沿着链不含任何双键或其他官能团。术语“饱和”是指氢，因为所有的碳(除了羧酸[-COOH]基团)都包含尽可能多的氢。换句话说，omega(ω)端包含3个氢(CH3-)，并且链内的每个碳包含2个氢(-CH2-)。不饱和脂肪酸具有与饱和脂肪酸相似的形式，不同的是一个或多个烯烃官能团沿着链存在，而每个烯烃用双键的″-CH＝CH-″部分(即，以双键键合到另一个碳的碳)取代链的单键″-CH2-CH2-″部分。结合到双键任一侧的链中的两个紧邻碳原子可以按顺式或反式构型存在。如本文所用，术语“单不饱和脂肪酸”或“MUFA”是指包含其碳链中的至少12个碳原子以及仅一个烯烃基团(碳-碳双键)的脂肪酸，其可以是酯化或非酯化(游离)的形式。如本文所用，术语“多不饱和脂肪酸”或″PUFA″是指包含其碳链中的至少12个碳原子以及至少两个烯烃基团(碳-碳双键)的脂肪酸，其可以是酯化或非酯化(游离)的形式。如本文所用，也称作“MCFA”的具有“中链长度”的脂肪酸包含8-14个碳的酰基链。所述酰基链可以是修饰的(例如其可以包含一个或多个双键、羟基、环氧树脂基团等)或未修饰的(饱和的)。这个术语至少包括辛酸(C10：0)、月桂酸(C12：0)和肉豆蔻酸(C14：0)中的一种或多种或全部。“单酰基甘油酯”或″MAG″是其中甘油被一个脂肪酸酯化的甘油酯。如本文所用，MAG包含位于sn-1/3(本文中也称为sn-1MAG或1-MAG或1/3-MAG)或sn-2位(本文中也称为2-MAG)的羟基，因此MAG不包括磷酸化的分子如PA或PC。MAG因此是细胞中的中性脂质的组分。“二酰基甘油酯”或″DAG″是其中甘油被两个脂肪酸酯化的甘油酯，所述两个脂肪酸可以是相同的、或优选不同的。如本文所用，DAG包含位于sn-1，3或sn-2位的羟基，因此DAG不包括磷酸化的分子如PA或PC。DAG因此是细胞中的中性脂质的组分。在DAG合成的Kennedy途径中(图1)，前体sn-甘油-3-磷酸(G3P)在sn-1位通过甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)催化的第一反应中酯化到两个酰基(每个来自脂肪酸辅酶A酯)形成LysoPA，然后在通过溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT)催化的sn-2位的第二酰化形成磷脂酸(PA)。这个中间体然后通过PAP去磷酰化形成DAG。DAG还可通过脂肪酶移除酰基由TAG形成，或者通过PDCT、PLC或PLD中的任一种酶移除胆碱头基而基本上由PC形成(图1)。“三酰基甘油酯”或″TAG″是其中甘油被三个脂肪酸酯化的甘油酯，所述三个脂肪酸可以是相同的(如甘油三油酸酯(tri-olein)中)、或者更常见的是不同的。在TAG合成的Kennedy途径中，DAG如上文所述形成，然后通过DGAT的活性将第三酰基酯化到甘油骨架。形成TAG的可选途径包括酶PDAT催化的途径(图1)和本文所述的MGAT途径。如本文所用，术语“野生型”或其变化是指营养性植物部分、细胞或者非人生物体或其部分如块茎或根，根据本发明，其尚未被遗传修饰，如包含外源多核苷酸。术语“相应”是指营养性植物部分、细胞、种子或者非人生物体或其部分(如块茎或根)，其具有与本发明的营养性植物部分、细胞、种子或者非人生物体或其部分相同或相似的遗传背景，但是尚未如本文所述进行修饰(例如，缺少外源多核苷酸和/或缺少遗传修饰的营养性植物部分、细胞、种子或者非人生物体或其部分)。在一优选实施方案中，相应的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分处于与本发明的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分相同的发育阶段。例如，如果非人生物体是开花植物，则优选相应的植物也正在开花。相应的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分可以用作对照以与如本文所述修饰的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分比较核酸或蛋白表达水平，或者性状修饰的程度和性质，例如非极性脂质生成和/或含量。本领域技术人员能够很容易地确定适当的“相应的”营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分、组织、器官或生物体用于这样的比较。如本文所用，“与……比较”或“相对于”是指表达一种或多种外源多核苷酸或外源多肽的营养性植物部分、真核细胞、种子、非人生物体或其部分(如块茎或根)与缺少一种或多种外源多核苷酸或外源多肽的营养性植物部分、真核细胞、种子、非人生物体或其部分的非极性脂质、总非极性脂质含量、脂肪酸含量或其他参数的比较水平。如本文所用，“增强的产生非极性脂质的能力”是相对术语，其指本发明的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分(如块茎或根)产生的非极性脂质的总量相对于相应的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分增加。在一实施方案中，TAG和/或多不饱和脂肪酸含量或者非极性脂质的总脂肪酸含量中的油酸含量增加，或者非极性脂质的总脂肪酸含量的亚麻酸含量减少，例如按绝对值计算至少2％。如本文所用，“协同作用”、“协同的”、“协同地作用”和相关术语每个都是比较术语，其表示本发明的细胞、植物或其部分中的存在的元件的组合，例如元件A和B的组合的效果大于元件单独在相应的细胞、植物或其部分中的效果的总和，例如A的效果和B的效果的总和。当两个以上的元件存在于细胞、植物或其部分中时，例如元件A、B和C，其表示所有元件的组合的效果大于元件的单独效果的效果总和。在一优选实施方案中，其表示元件A、B和C的组合的效果大于合并的元件A和B的效果以及元件C的效果的总和。在这样的情况下，可以说元件C与元件A和B协同作用。如会理解的，在例如于相同条件下生长和处于生物发育的相同阶段的相应的细胞、植物或其部分中测量效果。如本文所用，“以与相应的野生型植物基本上相同的速度发芽”是指当与缺少定义的外源多核苷酸的野生型植物的种子相比时，本发明的植物的种子相对地能够发芽。发芽可以体外在组织培养基上测量，或者可以在土壤中当田中出现时测量。在一实施方案中，例如在植物物种的最佳温室条件下生长时，发芽的种子数量在与相应的野生型种子相比时是至少75％，更优选至少90％。在另一实施方案中，例如在植物物种的最佳温室条件下生长时，当与相应的野生型种子相比时，发芽、产生以一定速度生长的幼苗的种子是至少75％，更优选至少90％。这称作“幼苗活力”。在一实施方案中，本发明的幼苗的初始根生长和新梢生长的速度与在相同条件下生长的相应的野生型幼苗相比基本上相同。在一实施方案中，相对于在相同条件下，优选在田中生长的相应的野生型植物，本发明的植物的叶生物质(干重)是至少80％，优选至少90％的叶生物质。在一实施方案中，相对于在相同条件下，优选在田中生长且优选成熟的相应的野生型植物，本发明的植物的高度是至少70％，优选至少80％，更优选至少90％的植物高度。如本文所用，术语“下调内源多肽的生成和/或活性的外源多核苷酸”或其变化是指编码下调生成和/或活性的RNA分子(例如，编码amiRNA或hpRNAi)的多核苷酸，或者其本身下调内源多肽的生成和/或活性(例如，是可以直接递送至例如细胞的amiRNA或hpRNA)，所述内源多肽例如为SDP1TAG脂肪酶、质体GPAT、质体LPAAT、TGD多肽、AGPase或δ-12脂肪酸去饱和酶(FAD2)或者它们中的两种或更多种的组合。通常，所述RNA分子减少编码多肽的内源基因的表达。如本文所用，术语“在重量基础上”是指作为包含物质的组合物(例如，种子、叶)的重量百分比的物质(例如，TAG、DAG、脂肪酸)的重量。例如，如果转基因种子具有25μg总脂肪酸每120μg种子重量；则总脂肪酸的百分比在重量基础上为20.8％。如本文所用，术语“在相对基础上”是指参数如包含物质的组合物中物质的量与相应组合物的参数比较，为百分比。例如，从3单位减少至2单位是在相对基础上减少33％。如本文所用，“质体”是植物(包括藻类)中的细胞器，其是从光合作用制造包括糖、淀粉和脂肪酸在内的碳基化合物的地点。质体包括含有叶绿素并进行光合作用的叶绿体，是叶绿体的前身的黄化质体，以及特化的质体如用于色素的合成和储存的有色质体，在衰老期间控制光合作用装置的拆除的老质体(gerontoplast)，用于淀粉合成和储存的造粉体，用于脂质的储存的油质体，用于储存和修饰蛋白的蛋白质体。如本文所用，术语“生物燃料”是指任何类型的燃料，通常用于动力机械如汽车、飞机、船、卡车或石油动力的发动机，其能量从生物碳固定递送。生物燃料包括源自生物质转化的燃料，以及固体生物质，液体燃料和生物气。生物燃料的实例包括生物醇、生物柴油、合成柴油、植物油、生物醚(bioether)、生物气、合成气、固体生物燃料、藻类衍生燃料、生物氢气，生物甲醇、2，5-二甲基呋喃(DMF)、生物二甲基醚(bioDME)、Fischer-Tropsch柴油、生物氢气柴油、混合醇和木柴油(wooddiesel)。如本文所用，术语“生物醇”是指生物学产生的醇类，例如，乙醇、丙醇和丁醇。生物醇由微生物和/或酶通过糖、半纤维素或纤维素的发酵的作用产生。如本文所用，术语“生物柴油”是指包含脂肪酸甲基-或乙基-酯(通过酯交换衍生自脂质)的组合物。如本文所用，术语“合成柴油”是指衍生自可再生原料而不是大多数柴油燃料中使用的化石原料的柴油燃料形式。如本文所用，术语“植物油”包括纯的植物的油(或者无添加(straight)的植物油)或者废物植物油(其它产业的副产品)，包括营养性植物部分或种子中产生的油。如本文所用，术语“生物气”是指通过厌氧生物对有机材料厌氧消化而产生的甲烷或者甲烷与其它气体的可燃混合物。如本文所用，术语“合成气”是指含有变化量的一氧化碳和氢气以及可能的其它烃的气体混合物，其由生物质的部分燃烧所产生。合成气可以在催化剂(通常是铜基的)的存在下转化为甲醇，随后在不同催化剂(例如，硅-铝)的存在下甲醇脱水。如本文所用，术语“Fischer-Tropsch”是指一系列化学反应，其将一氧化碳和氢气的混合物转化为液态烃。可以利用例如水气迁移(watergasshift)首先调节合成气以实现所需的H2/CO比例。转化在催化剂的存在下进行，通常是铁或钴。温度、压力和催化剂决定是产生轻合成油还是重合成油。例如在330℃下主要产生汽油和石蜡，而在180°-250℃下主要产生柴油和蜡。合成气产生的液体(其包含各种烃部分)是非常清洁的(无硫)直链烃。如本文所用，术语“生物炭”是指从生物质制备的炭，例如，通过生物质的热解。如本文所用，术语“原料”是指当用于产生产品(例如，生物燃料如生物柴油或合成柴油)时所用的材料，例如，生物质或其转化产物(例如，合成气)。如本文所用，术语“工业产品”是指主要由碳和氢组成的烃产品，如脂肪酸甲基-和/或乙基-酯或者烷烃如甲烷，较长链的烷烃(在室温通常为液态)的混合物，生物燃料，一氧化碳和/或氢气，或者生物醇如乙醇、丙醇或丁醇，或者生物炭。术语“工业产品”意图包括可以转化为其他工业产品的中间产品，例如，合成气本身被认为是工业产品，其可以用于合成也被认为是工业产品的烃产品。如本文所用，术语工业产品包括上述化合物的纯的形式，或者更常见地是各种化合物和组分的混合物，例如烃产品可以含有一定范围的碳链长度，这是本领域熟知的。如本文所用，“子代”表示产生自亲代的后代的中间和所有随后的世代，例如第二、第三或后来的世代后代。在整个说明书中，单词包含“(comprise)”或者变化形式如“包含(comprises)”或“comprising”会理解为简单地包括所述元素、整数或步骤，或者元素、整数或步骤的组，但是不排除任何其他元素、整数或步骤，或者元素、整数或步骤的组。术语“和/或”，例如“X和/或Y”应当理解为表示“X和Y”或者“X或Y”，并且应当用来提供对两种含义或任一种含义的明确支持。如本文所用，除非另有相反的说明，术语约指指定值的+/-10％、更优选+/-5％、更优选+/-2％、更优选+/-1％、更优选+/-0.5％。非极性脂质和三酰甘油的产生本发明是基于这样的发现，重组真核细胞中的非极性脂质含量可以通过选自本文中命名如下的那些的修饰的组合增加：(A).推，(B).拉，(C).保护，(D).包装，(E).质体输出，(F).质体输入和(G).原核途径。如本文所述，没有质体的细胞可以包含A-D的各种组合，而具有质体的细胞如植物和藻类细胞可以包含A-G的各种组合。因此本发明的重组细胞、转基因非人动物或其部分以及转基因植物或其部分具有外源多核苷酸和/或遗传修饰的许多组合，每个提供修饰之一。这些外源多核苷酸和/或遗传修饰包括：(A)外源多核苷酸，其编码增加细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽，提供“推”修饰，(B)外源多核苷酸，其编码参与细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分中的一种或多种非极性脂质生物合成的多肽，提供“拉”修饰，(C)遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分相比时，其下调参与细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性，提供“保护”修饰，(D)外源多核苷酸，其编码油体包衣(OBC)多肽，提供“包装”修饰，(E)外源多核苷酸，其编码当与缺少所述外源多核苷酸的相应细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分相比时，增加脂肪酸输出细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分的质体的多肽，提供“质体输出”修饰，(F)遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分相比时，其下调参与将脂肪酸输入细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分的质体的多肽的内源生成和/或活性，提供“质体输入”修饰，以及G)遗传修饰，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分相比时，其下调参与细胞、转基因非人动物或其部分或者转基因植物或其部分的质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性，提供“原核途径”修饰。本发明的外源多核苷酸和/或遗传修饰的优选组合(在本文中也称作组)是；1)A、B以及任选存在的C、D、E、F或G之一；2)A、C以及任选存在的D、E、F或G之一；3)A、D以及任选存在的E、F或G之一；4)A、E以及任选存在的F或G；5)A、F和任选存在的G；6)A和G；7)A、B、C以及任选存在的D、E、F或G之一；8)A、B、D以及任选存在的E、F或G之一；9)A、B、E以及任选存在的F或G；10)A、B、F和任选存在的G；11)A、B、C、D以及任选存在的E、F或G之一；12)A、B、C、E以及任选存在的F或G；13)A、B、C、F和任选存在的G；14)A、B、D、E以及任选存在的F或G；15)A、B、D、F和任选存在的G；16)A、B、E、F和任选存在的G；17)A、C、D以及任选存在的E、F或G之一；18)A、C、E以及任选存在的F或G；19)A、C、F和任选存在的G；20)A、C、D、E以及任选存在的F或G；21)A、C、D、F和任选存在的G；22)A、C、E、F和任选存在的第五修饰G；23)A、D、E以及任选存在的F或G；24)A、D、F和任选存在的G；25)A、D、E、F和任选存在的G；26)A、E、F和任选存在的G；27)A、B、C、D、E、F和G中的6个，省略A、B、C、D、E、F或G之一，以及28)上述1-26中的任一种，其中有两种或更多种外源多核苷酸，其编码增加细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的两种或更多种不同的转录因子多肽，例如编码WRI1的一种外源多核苷酸和编码LEC2的另一种外源多核苷酸。在每个上述优选组合中，可以有至少两种不同的外源多核苷酸，其编码增加细胞、转基因动物或其部分或者转基因植物或其部分中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的至少两种不同的转录因子多肽。这些修饰描述如下：A.“推”修饰的特征在于真核细胞的质体中的总脂肪酸合成增加。在一实施方案中，这通过调节质体中的脂肪酸合成的转录因子的表达和/或活性增加而发生。在一实施方案中，这可以通过在转基因细胞中表达外源多核苷酸来实现，所述外源多核苷酸编码增加细胞中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽。在一实施方案中，增加的脂肪酸合成不是由向细胞提供改变的ACCase所引起的，相对于细胞中的内源ACCase，所述改变的ACCase的活性较少受到脂肪酸抑制。在一实施方案中，所述细胞包含编码转录因子的外源多核苷酸，所述转录因子优选在除组成型启动子以外的启动子的控制下。转录因子可以选自由WRI1、LEC1、LEC1样、LEC2、BBM、FUS3、ABI3、ABI4、ABI5、Dof4、Dof11组成的组，或者由MYB73、bZIP53、AGL15、MYB115、MYB118、TANMEI、WUS、GFR2a1、GFR2a2和PHR1组成的组，并且优选WRI1、LEC1或LEC2。在另一实施方案中，增加的总脂肪酸合成是相对于相应的野生型细胞。在一实施方案中，有编码两种或更多种不同的转录因子多肽的两种或更多种外源多核苷酸。B.“拉”修饰的特征在于细胞中的催化细胞中的TAG、DAG或MAG合成的脂肪酰基酰基转移酶的表达和/或活性增加，如DGAT、PDAT、LPAAT、GPAT或MGAT，优选DGAT或PDAT。在一实施方案中，这可以通过在转基因细胞中表达外源多核苷酸来实现，所述外源多核苷酸编码参与一种或多种非极性脂质的生物合成的多肽。在一实施方案中，酰基转移酶是膜结合的酰基转移酶，在DGAT、LPAAT、GPAT或MGAT的情况下其使用酰基-CoA底物作为酰基供体，或者在PDAT的情况下其使用来自PC的酰基作为酰基供体。拉修饰可以是相对于相应的野生型细胞，或者优选地，相对于具有推修饰的相应细胞。在一实施方案中，所述细胞包含编码脂肪酰基酰基转移酶的外源多核苷酸。C.“保护”修饰的特征在于细胞中的三酰甘油(TAG)的分解代谢减少。在一实施方案中，这可以通过细胞中的遗传修饰实现，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞相比时，所述遗传修饰下调参与细胞中的三酰甘油(TAG)分解代谢的多肽的内源生成和/或活性。在实施方案中，所述细胞具有减少的细胞中的内源TAG脂肪酶表达和/或活性，优选SDP1脂肪酶，Cgi58多肽，酰基-CoA氧化酶如ACX1或ACX2，或者参与细胞中脂肪酸的β-氧化的多肽如PXA1过氧化物酶体ATP-结合盒转运蛋白。这可以通过在细胞中表达编码RNA分子的外源多核苷酸而发生，所述RNA分子减少例如编码TAG脂肪酶如SDP1脂肪酶、酰基CoA氧化酶或参与细胞中脂肪酸的β-氧化的多肽的内源基因的表达，或者通过编码例如TAG脂肪酶、酰基-CoA氧化酶或参与脂肪酸的β-氧化的多肽的内源基因中的突变而发生。在一实施方案中，减少的表达和/或活性是相对于相应的野生型细胞或者相对于具有推修饰的相应细胞。D.“包装”修饰的特征在于油体包衣(OBC)多肽的表达和/或积累增加。在一实施方案中，这可以通过在转基因细胞中表达编码油体包衣(OBC)多肽的外源多核苷酸来实现。OBC多肽可以是油质蛋白，例如聚油质蛋白、油体钙蛋白或油体固醇蛋白，或者优选LDAP。在一实施方案中，所述真核细胞中积累的油质蛋白的水平相对于包含来自pJP3502的T-DNA的油质蛋白基因的相应细胞高至少2-倍。在一实施方案中，增加的OBC多肽的表达或积累不是仅由推修饰引起的。在一实施方案中，表达和/或积累是相对于相应的野生型细胞，或者优选地，相对于具有推修饰的相应细胞。E.“质体输出”修饰的特征在于真核细胞的质体的总脂肪酸输出速度增加。在一实施方案中，这可以通过在转基因细胞中表达外源多核苷酸来实现，所述外源多核苷酸编码这样的多肽，当与缺少所述外源多核苷酸的相应细胞相比时，所述多肽增加脂肪酸输出细胞质体。在一实施方案中，这通过脂肪酸硫酯酶(TE)、脂肪酸转运蛋白多肽如ABCA9多肽、或者长链酰基-CoA合成酶(LACS)的表达和/或活性增加而发生。在一实施方案中，所述细胞包含编码TE、脂肪酸转运蛋白多肽或LACS的外源多核苷酸。TE可以是FATB多肽或优选FATA多肽。在一实施方案中，TE优选对MCFA具有特异性的TE。在一实施方案中，质体输出修饰是相对于相应的野生型细胞，或者优选地，相对于具有推修饰的相应细胞。F.“质体输入”修饰的特征在于脂肪酸从质体外输入细胞质体的速度减少。在一实施方案中，这可以通过细胞中的遗传修饰实现，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞相比时，所述遗传修饰下调参与将脂肪酸输入细胞质体的多肽的内源生成和/或活性。例如，这可以通过在细胞中表达编码RNA分子的外源多核苷酸而发生，所述RNA分子减少编码转运蛋白多肽如TGD多肽(例如TGD1、TGD2、TGD3或TGD4多肽)的内源基因的表达，或者通过编码TGD多肽的内源基因中的突变而发生。在一实施方案中，减少的输入速度是相对于相应的野生型细胞或者相对于具有推修饰的相应细胞。G.“原核途径”修饰的特征在于细胞质体中的DAG量或DAG生成速度减少。在一实施方案中，这可以通过细胞中的遗传修饰实现，当与缺少所述遗传修饰的相应细胞相比时，所述遗传修饰下调参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的内源生成和/或活性。在一实施方案中，减少的DAG生成量或速度通过质体中从酰基-ACP和G3P生成LPA减少而发生。减少的DAG生成量或速度可以通过在细胞中表达编码RNA分子的外源多核苷酸而发生，所述RNA分子减少编码质体GPAT、质体LPAAT或质体PAP(优选质体GPAT)的内源基因的表达，或者同编码质体多肽的内源基因中的突变而发生。在一实施方案中，减少的DAG生成量或速度是相对于相应的野生型细胞，或者优选地，相对于具有推修饰的相应细胞。推修饰对于本发明是必要的，而拉修饰是优选的。保护和包装修饰可以是互补的，即两个之一可以是足够的。所述细胞可以包含质体输出、质体输入和原核途径修饰中的一个、两个或全部三个。在一实施方案中，所述细胞中的至少一个外源多核苷酸，优选至少编码调节质体中的脂肪酸合成的转录因子的外源多核苷酸在(H)除组成型启动子以外的启动子的控制下表达，例如，发育相关启动子，优先在光合作用细胞中活化的启动子，组织特异性启动子，已通过相对于相应的天然启动子减少其表达水平来修饰的启动子，或者优选衰老特异性启动子。更优选地，至少编码调节质体中的脂肪酸合成的转录因子的外源多核苷酸在除组成型启动子以外的启动子的控制下表达，并且编码下调参与三酰甘油分解代谢的多肽的内源生成和/或活性的RNA分子的外源多核苷酸也在除组成型启动子以外的启动子的控制下表达，所述启动子可以相同或不同。植物通过所谓的原核途径在质体中产生它们的一些但不是全部膜脂质如MGDG(图1)。在植物中，还有用于半乳糖脂和甘油脂合成的真核途径，其首先在质体中合成FA，然后在ER中将FA组装为甘油脂。通过真核途径合成的MGDG包含在MGDG的sn-2位置酯化的C18：3(ALA)脂肪酸。包括ALA用于通过这个途径的MGDG合成的DAG骨架在ER中组装，然后输入质体。相比之下，通过原核途径合成的MGDG包含在MGDG的sn-2位置酯化的C16：3脂肪酸。在产生MGDG(16：3)对MGDG(18：3)中原核途径相对于真核途径的分布的比例是不同植物物种的特征和区别性特性(Mongrandetal.1998)。MGDG的这种区别性脂肪酸组成允许将所有高等植物(被子植物)分类为所谓的16：3或18：3植物。通过拟南芥(Arabidopsis)和欧洲油菜示例的16：3物种一般具有MGDG合成操作的原核和真核途径，而通过红花烟草、豌豆和大豆示例的18：3物种一般仅(或几乎全部)具有MGDG合成的真核途径，在营养性组织中提供很少或没有C16：3脂肪酸积累。如本文所用，“16：3植物”或“16：3物种”是在其光合作用组织的总脂肪酸含量中具有超过2％C16：3脂肪酸的植物。如本文所用，“18：3植物”或“18：3物种”是在其光合作用组织的总脂肪酸含量中具有少于2％C16：3脂肪酸的植物。如本文所述，通过合适的遗传修饰可以将植物从16：3植物转化为18：3植物。原核和真核途径之间的流量比例在不同植物物种或组织中不是保守的。在16：3物种中，叶中多达40％的流量通过真核途径发生(Browseetal.，1986)，而在18：3物种中，如豌豆和大豆，将质体中合成的约90％的FA输出质体至ER以供应FA的来源用于真核途径(OhlroggeandBrowse，1995；Somervilleetal.，2000)。因此在不同植物物种的糖脂内发现了不同量的18：3和16：3脂肪酸。这用来区分其具有3个双键的脂肪酸几乎全部是C18脂肪酸的18：3植物与包含具有3个双键的C16-和C18-脂肪酸的16：3植物。在18：3植物的叶绿体中，催化磷脂酸转化为二酰甘油和二酰甘油转化为单半乳糖基二酰甘油(MGD)的酶促活性明显比16：3叶绿体中更不活跃。在18：3植物的叶中，叶绿体在基质中合成硬脂酰基-ACP2，将第一双键引入饱和烃链，然后通过硫酯酶水解硫酯(图1)。释放的油酸通过叶绿体被膜输出进入细胞的真核部分的膜，可能是内质网，在这里将其并入PC。PC连接的油酰基在这些膜中去饱和，随后回到叶绿体。MGD连接的酰基是用于引入第三双键的底物，以便获得具有两个亚麻酰基残基的MGD。这种半乳糖脂是18：3植物如菊科和豆科的特征。在例如伞形科和十字花科成员代表的16：3植物的光合作用活性细胞中，两种途径平行操作以提供具有MGD的类囊体。在一实施方案中，本发明的营养性植物部分、真核细胞、种子或者转基因非人生物体或其部分(如块茎或根)产生比缺少遗传修饰或外源多核苷酸的相应的营养性植物部分、真核细胞、种子或者非人生物体或其部分高水平的非极性脂质如TAG，或者总脂肪酸(TFA)含量，优选两者。在一实例中，当与相应的种子、叶、表面积至少1cm2的叶部分、茎或块茎相比时，本发明的植物产生具有增加的非极性脂质含量如TAG或TFA含量(优选两种)的种子，叶，或者具有表面积至少1cm2的叶部分，茎和/或块茎。在另一实施方案中，营养性植物部分、转基因非人生物体或其部分(如块茎或根)，优选植物、块茎、根或种子，产生富集一种或多种特定脂肪酸的TAG。可以将广谱的脂肪酸并入TAG，包括饱和和不饱和脂肪酸以及短链和长链脂肪酸。可以并入TAG并且可以水平升高的脂肪酸的一些非限制性实例包括：羊蜡酸(10：0)、月桂酸(12：0)、肉豆蔻酸(14：0)、棕榈酸(16：0)、棕榈油酸(16：1)、硬脂酸(18：0)、油酸(18：1)、异油酸(18：1)、亚油酸(18：2)、桐油酸(18：3)、γ-亚麻酸(18：3)、α-亚麻酸(18：3ω3)、十八碳四烯酸(18：4ω3)、花生酸(20：0)、二十碳二烯酸(20：2)、二高-γ-亚油酸(20：3)、二十碳三烯酸(20：3)、花生四烯酸(20：4)、二十碳四烯酸(20：4)、二十碳五烯酸(20：5ω3)、二十二烷酸(22：0)、二十二碳五烯酸(22：5ω)、二十二碳六烯酸(22：6ω3)、二十四烷酸(24：0)、神经酸(24：1)、蜡酸(26：0)和褐煤酸(28：0)脂肪酸。在本发明的一实施方案中，营养性植物部分、真核细胞、种子或者转基因生物体或其部分(如块茎或根)富集包含油酸的TAG，和/或亚麻酸(ALA)减少，优选在绝对基础上至少2％或至少5％。优选地，用一种或多种嵌合DNA(外源多核苷酸)转化本发明的营养性植物部分、真核细胞、种子或者转基因非人生物体或其部分。在多种嵌合DNA的情况下，优选将这些共价连接在一个DNA分子如单个T-DNA分子上，并且优选整合在宿主细胞基因组的单个基因座。或者，嵌合DNA在可以在宿主基因组中不连接的两个或更多个DNA分子上，或者不将DNA分子整合入宿主基因组，如瞬时表达实验中出现的。植物、营养性植物部分、真核细胞、种子或者转基因非人生物体或其部分优选对于插入其基因组的一个DNA分子是纯合的。转录因子在真核细胞中各种转录因子参与脂肪酸的合成和脂质并入脂肪酸如TAG，因此可以操作用于推修饰。优选的转录因子是WRI1。如本文所用，术语“Wrinkled1”或“WRI1”或“WRL1”是指AP2/ERWEBP类的转录因子，其调节参与糖酵解和从头脂肪酸生物合成的几种酶的表达。WRI1具有两个植物特异性(AP2/EREB)DNA-结合结构域。至少拟南芥中的WRI1还调节蔗糖经糖酵解的断裂，从而调节脂肪酸生物合成前体的供应。换句话说，其控制从光合作用至储存脂质的碳流。至少拟南芥中的wri1突变体具有褶皱(wrinkled)种子表型，这是由于将蔗糖和葡糖糖并入TAG的缺陷。由WRI1转录的基因实例包括但不限于编码以下的基因中的一种或多种，优选全部：丙酮酸激酶(At5g52920、At3g22960)，丙酮酸脱氢酶(PDH)E1α亚基(At1g01090)，乙酰基-CoA羧化酶(ACCase)，BCCP2亚基(At5g15530)，烯酰基-ACP还原酶(At2g05990；EAR)，磷酸甘油酸变位酶(At1g22170)，胞质果糖激酶，和胞质磷酸甘油酸变位酶，蔗糖合酶(SuSy)(参见，例如，Liu等，2010b；Baud等，2007；Ruuska等，2002)。WRI1包含保守结构域AP2(cd00018)。AP2是在植物里转录调节因子中发现的DNA-结合结构域如APETALA2和EREBP(乙烯反应元件结合蛋白)。在EREBP中该结构域特异性地结合乙烯反应元件(ERE，乙烯反应中必要的启动子元件)的11bpGCC盒。参与应激应答的EREBP和C-重复序列结合因子CBF1包含单拷贝的AP2结构域。在植物发育中发挥作用的APETALA2样蛋白包含两个拷贝。WRI1及其功能同源物中可以找到的其它序列基序包括：1.RGVT/SRHRWTGR(SEQIDNO：89).2.F/YEAHLWDK(SEQIDNO：90).3.DLAALKYWG(SEQIDNO：91).4.SXGFS/ARGX(SEQIDNO：92).5.HHH/QNGR/KWEARIGR/KV(SEQIDNO：93).6.QEEAAAXYD(SEQIDNO：94).如本文所用，术语“Wrinkled1”或“WRI1”还包括“Wrinkled1样”或“WRI1样”蛋白。WRI1蛋白的实例包括登录号：Q6X5Y6，(拟南芥；SEQIDNO：22)，XP_002876251.1(琴叶拟南芥琴叶亚种；SEQIDNO：23)，ABD16282.1(欧洲油菜；SEQIDNO：24)，ADO16346.1(欧洲油菜；SEQIDNO：25)，XP_003530370.1(大豆；SEQIDNO：26)，AEO22131.1(麻风树；SEQIDNO：27)，XP_002525305.1(蓖麻；SEQIDNO：28)，XP_002316459.1(毛果杨；SEQIDNO：29)，CBI29147.3(葡萄；SEQIDNO：30)，XP_003578997.1(二穗短柄草；SEQIDNO：31)，BAJ86627.1(大麦；SEQIDNO：32)，EAY79792.1(水稻；SEQIDNO：33)，XP_002450194.1(两色高粱；SEQIDNO：34)，ACG32367.1(玉米；SEQIDNO：35)，XP_003561189.1(二穗短柄草；SEQIDNO：36)，ABL85061.1(小颖短柄草；SEQIDNO：37)，BAD68417.1(水稻；SEQIDNO：38)，XP_002437819.1(两色高粱；SEQIDNO：39)，XP_002441444.1(两色高粱；SEQIDNO：40)，XP_003530686.1(大豆；SEQIDNO：41)，XP_003553203.1(大豆；SEQIDNO：42)，XP_002315794.1(毛果杨；SEQIDNO：43)，XP_002270149.1(葡萄；SEQIDNO：44)，XP_003533548.1(大豆；SEQIDNO：45)，XP_003551723.1(大豆；SEQIDNO：46)，XP_003621117.1(蒺藜苜蓿；SEQIDNO：47)，XP_002323836.1(毛果杨；SEQIDNO：48)，XP_002517474.1(蓖麻；SEQIDNO：49)，CAN79925.1(葡萄；SEQIDNO：50)，XP_003572236.1(二穗短柄草；SEQIDNO：51)，BAD10030.1(水稻；SEQIDNO：52)，XP_002444429.1(两色高粱；SEQIDNO：53)，NP_001170359.1(玉米；SEQIDNO：54)，XP_002889265.1(琴叶拟南芥琴叶亚种；SEQIDNO：55)，AAF68121.1(拟南芥；SEQIDNO：56)，NP_178088.2(拟南芥；SEQIDNO：57)，XP_002890145.1(琴叶拟南芥琴叶亚种；SEQIDNO：58)，BAJ33872.1(小盐芥；SEQIDNO：59)，NP_563990.1(拟南芥；SEQIDNO：60)，XP_003530350.1(大豆；SEQIDNO：61)，XP_003578142.1(二穗短柄草；SEQIDNO：62)，EAZ09147.1(水稻；SEQIDNO：63)，XP_002460236.1(两色高粱；SEQIDNO：64)，NP_001146338.1(玉米；SEQIDNO：65)，XP_003519167.1(大豆；SEQIDNO：66)，XP_003550676.1(大豆；SEQIDNO：67)，XP_003610261.1(蒺藜苜蓿；SEQIDNO：68)，XP_003524030.1(大豆；SEQIDNO：69)，XP_003525949.1(大豆；SEQIDNO：70)，XP_002325111.1(毛果杨；SEQIDNO：71)，CBI36586.3(葡萄；SEQIDNO：72)，XP_002273046.2(葡萄；SEQIDNO：73)，XP_002303866.1(毛果杨；SEQIDNO：74)以及CBI25261.3(葡萄；SEQIDNO：75)。其他实例包括Sorbi-WRL1(SEQIDNO：76)、Lupan-WRL1(SEQIDNO：77)、Ricco-WRL1(SEQIDNO：78)和狭叶羽扇豆WRI1(SEQIDNO：79)。优选的WRI1是玉米WRI1或高粱WRI1。最近，WRI1样转录因子的一个子集已重新分类为WRI2、WRI3或WRI4转录因子，其特征在于在植物的茎和/或根中而不是在发育的种子中的优先表达(Toetal.，2012)。尽管它们重新分类，但是在本文中它们包括在“WRI1”的定义中。优选的WRI1样转录因子是可以补充植物中wri1突变的功能的那些WRI1样转录因子，特别是植物发育的种子如拟南芥wri1突变体中的功能。WRI1样多肽的功能还可以如本文所述在本氏烟草瞬时测定中测定。如本文所用，“LEAFYCOTYLEDON”或“LEC”多肽表示转录因子，其是LEC1、LEC1样、LEC2、ABI3或FUS3转录因子，表现出对种子成熟和脂肪酸合成的广泛控制。LEC2、FUS3和ABI3是相关的多肽，各自包含仅在植物蛋白中发现的120个氨基酸的B3DNA-结合结构域(Yamasakietal.，2004)。它们可以通过系统发育分析来区分，以便确定氨基酸序列中与具有如下登录号的拟南芥多肽成员的相关性：LEC2，登录号AAL12004.1；FUS3(也称作FUSCA3)，登录号AAC35247。LEC1属于不同类别的多肽，并且与CBF结合因子类别的HAP3多肽同源(Leeetal.，2003)。在早期胚胎发生中需要LEC1、LEC2和FUS3基因以维持胚胎细胞命运和指定子叶身份，并且后来在胚胎成熟的启动和维持中需要LEC1、LEC2和FUS3基因(Santos-Mendozaetal.，2008)。它们还通过结合至启动子中存在的RY基序来诱导编码种子贮藏蛋白的基因的表达，以及诱导油质蛋白基因的表达。它们还可以通过它们在种子发育中的表达模式或者通过它们补充拟南芥中的相应突变的能力来区分。如本文所用，术语“LeafyCotyledon1”或“LEC1”是指NF-YB型转录因子，其参与合子发育和体细胞胚胎发生。内源基因特异性地在种子中于胚和胚乳中表达。LEC1激活编码WRI1的基因以及一大类脂肪酸合成基因。LEC2的异位表达还引起生长素应答基因的快速激活，并且可以引起体细胞配体的形成。LEC1多肽的实例包括来自拟南芥(AAC39488，SEQIDNO：149)、蒺藜苜蓿(AFK49653，SEQIDNO：154)和欧洲油菜(ADF81045，SEQIDNO：151)、琴叶拟南芥(A.lyrata)(XP_002862657，SEQIDNO：150)、蓖麻(R.communis)(XP_002522740，SEQIDNO：152)、栽培大豆(XP_006582823，SEQIDNO：153)、花生(A.hypogaea)(ADC33213，SEQIDNO：156)、玉米(AAK95562，SEQIDNO：155)的蛋白。LEC1样(L1L)与LEC1密切相关，但是具有不同模式的基因表达，在胚胎发生期间较早表达(Kwongetal.，2003)。LEC1样多肽的实例包括来自拟南芥(AAN15924，SEQIDNO：157)、欧洲油菜(AHI94922，SEQIDNO：158)和荷包豆LEC1样(AAN01148，SEQIDNO：159)的蛋白。如本文所用，术语“LeafyCotyledon2”或“LEC2”是指B3结构域转录因子，其参与合子发育和体细胞胚胎发生，并且其激活编码WRI1的基因的表达。其异位表达有助于从营养性植物组织的胚胎发生(Alemannoetal.，2008)。LEC2多肽的实例包括来自拟南芥(登录号NP_564304.1，SEQIDNO：142)、蒺藜苜蓿(登录号CAA42938.1，SEQIDNO：143)和欧洲油菜(登录号ADO16343.1，SEQIDNO：144)的蛋白。在一实施方案中，编码LEC2的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：142-144中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：142-144中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。如本文所用，术语“FUS3”是指B3结构域转录因子，其参与合子发育和体细胞胚胎发生，并且主要在胚胎的原表皮组织中检测到(Gazzarrinietal.，2004)。FUS3多肽的实例包括来自拟南芥(AAC35247，SEQIDNO：160)、欧洲油菜(XP_006293066.1，SEQIDNO：161)和蒺藜苜蓿(XP_003624470，SEQIDNO：162)的蛋白。来自外源多核苷酸的任何LEC1、L1L、LEC2、FUS3和ABI的过量表达优选由发育调节启动子控制，如衰老特异性启动子，诱导型启动子，或者已工程化用于提供相对于天然启动子降低水平的表达的启动子，特别是在除拟南芥和欧洲油菜品种Westar以外的植物中，以便避免通常与这些转录因子的过量表达相关的植物发育中的发育异常(Muetal.，2008)。如本文所用，术语“BABYBOOM”或“BBM”是指AP2/ERF转录因子，其在通常不支持野生型植物中的再生的培养条件下诱导再生。欧洲油菜和拟南芥中欧洲油菜BBM(BnBBM)基因的异位表达诱导从不含激素的基础培养基上生长的幼苗的自发体细胞胚胎发生和器官发生(Boutilieretal.，2002)。在烟草中，异位BBM表达足以在基础培养基上诱导不定新梢和根再生，但是体细胞胚胎(SE)形成需要外源细胞分裂素(Srinivasanetal.，2007)。BBM多肽的实例包括来自拟南芥(登录号NP_197245.2，SEQIDNO：145)、玉米(US7579529)、两色高粱(登录号XP_002458927)和蒺藜苜蓿(登录号AAW82334.1，SEQIDNO：146)的蛋白。在一实施方案中，除非另有说明，编码BBM的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：145或146之一所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：145或146中的一个或两个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。ABI3多肽(拟南芥登录号NP_189108)与玉米VP1蛋白相关，在营养组织中以低水平表达，并且影响质体发育。ABI4多肽(拟南芥登录NP_181551)属于包含植物特异性AP2结构域的转录因子家族(Finkelsteinetal.，1998)，并且在ABI3的下游发挥作用。ABI5(拟南芥登录号NP_565840)是bZIP家族的转录因子，其影响ABA敏感性并控制种子中一些LEA基因的表达。其结合至ABA-反应元件。在它们在植物中的胚胎发生中发挥功能的基础上选择以下转录因子中的每一个。登录号在表10中提供。每个的同系物可以在许多其他植物物种中容易地鉴定，并且如实施例10所述进行测试。MYB73是已在大豆中鉴定的转录因子，参与应激应答。bZIP53是拟南芥中鉴定的bZIP蛋白家族中的转录因子。AGL15(Agamous样15)是在胚胎发生中天然表达的MADS盒转录因子。AGL15还在叶原基、茎顶端分生组织和年轻的花芽中表达，表明AGL15还可以在发芽后发育中具有功能。AGL15在胚胎发生和赤霉酸分解代谢中具有作用。其靶向是胚胎发生的关键调节物的B3结构域转录因子。MYB115和MYB118是参与胚胎发生的来自拟南芥的MYB家族中的转录因子。也称作EMB2757的TANMEI编码拟南芥中胚胎发育需要的WD重复蛋白。也称作Wuschel的WUS是控制胚胎中的干细胞池的同源盒基因。其在分生组织的干细胞组织中心中表达，并且是将干细胞保持在未分化状态所需要的。该转录因子结合至TAAT元件核心基序。GFR2a1和GFR2a2是至少来自大豆的转录因子。脂肪酰基酰基转移酶如本文所用，术语“脂肪酰基酰基转移酶”是指能够将酰基从酰基-CoA、PC或-ACP(优选酰基-CoA或PC)转移至底物以形成TAG、DAG或MAG的蛋白。这些酰基转移酶包括DGAT、PDAT、MGAT、GPAT和LPAAT。如本文所用，术语“二酰甘油酰基转移酶”(DGAT)是指将脂肪酰基从酰基-CoA转移至DAG底物以产生TAG的蛋白。因此，术语“二酰甘油酰基转移酶活性”是指将酰基从酰基-CoA转移至DAG以产生TAG。DGAT还可以具有MGAT功能，但是主要用作DGAT，即，当将酶活性以nmol产物/min/mg蛋白为单位表示时，它作为DGAT的催化活性高于作为MGAT的催化活性(参见例如Yenetal.，2005)。DGAT的活性在种子中的TAG合成中可以是限速的(Ichiharaetal.，1988)。DGAT使用酰基-CoA底物作为酰基供体，并且将其转移至DAG的sn-3位置以形成TAG。该酶在细胞的内质网(ER)中以其天然状态发挥功能。有三种已知类别的DGAT，分别称作DGAT1、DGAT2和DGAT3。DGAT1多肽是通常具有10个跨膜结构域的膜蛋白，DGAT2多肽也是膜蛋白，但是通常具有2个跨膜结构域，而DGAT3多肽通常不含跨膜结构域并被认为可溶于细胞质，而不整合入膜。植物DGAT1多肽通常具有约510-550个氨基酸残基，而DGAT2多肽通常具有约310-330个残基。DGAT1是大多数发育的植物种子中负责从DAG产生TAG的主要酶，而来自产生大量的罕见脂肪酸的植物物种如油桐树(油桐)和蓖麻子(蓖麻)的DGAT2看来在TAG中的罕见脂肪酸积累中起重要作用。烟草叶中AtDGAT1的过量表达导致增加6-7倍的TAG含量(Bouvier-Naveetal.，2000)。DGAT1多肽的实例包括来自烟曲霉(XP_755172.1；SEQIDNO：80)、拟南芥(CAB44774.1；SEQIDNO：1)、蓖麻(AAR11479.1；SEQIDNO：81)、油桐(ABC94472.1；SEQIDNO：82)、斑鸠菊(ABV21945.1和ABV21946.1；分别为SEQIDNO：83和SEQIDNO：84)、卫矛(AAV31083.1；SEQIDNO：85)、秀丽隐杆线虫(AAF82410.1；SEQIDNO：86)、褐鼠(NP_445889.1；SEQIDNO：87)、智人(NP_036211.2；SEQIDNO：88)的DGAT1蛋白，以及它们的变体和/或突变体。DGAT2多肽的实例包括由来自拟南芥(NP_566952.1；SEQIDNO：2)、蓖麻(AAY16324.1；SEQIDNO：3)、油桐(ABC94474.1；SEQIDNO：4)、拉曼被孢霉(AAK84179.1；SEQIDNO：5)、智人(Q96PD7.2；SEQIDNO：6)(Q58HT5.1；SEQIDNO：7)、家牛(Q70VZ8.1；SEQIDNO：8)、小家鼠(AAK84175.1；SEQIDNO：9)的DGAT2基因编码的蛋白，以及它们的变体和/或突变体。DGAT1和DGAT2氨基酸序列表现出很少的同源性。在增加油含量(TAG)中，在叶中表达外源DGAT2的效率是DGAT1的两倍。此外，与DGAT1相比，相对于油酰基-CoA，拟南芥DGAT2对亚油酰基-CoA和亚麻酰基-CoA作为酰基供体具有更大偏好。除了它们的氨基酸序列，这种底物偏好可以用来区分这两种DGAT类别。DGAT3多肽的实例包括由来自花生(Arachishypogaea，Saha，etal.，2006)的DGAT3基因编码的蛋白，以及它们的变体和/或突变体。DGAT几乎没有可检测的MGAT活性，例如低于300pmol/min/mg蛋白，优选低于200pmol/min/mg蛋白，更优选低于100pmol/min/mg蛋白。在一实施方案中，编码DGAT1的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：1或80-88中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：1或80-88中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。在一实施方案中，编码DGAT2的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：2-9中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：2-9中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。如本文所用，术语“磷脂：二酰甘油酰基转移酶”(PDAT；EC2.3.1.158)或其同义词“磷脂：1，2-二酰基-sn-甘油O-酰基转移酶”表示将酰基从磷脂(通常为PC)转移至DAG的sn-3位置以形成TAG的酰基转移酶。此反应与DGAT无关并且使用磷脂作为酰基-供体。在植物细胞中有几种形式的PDAT，包括PDAT1、PDAT2或PDAT3(Ghosaletal.，2007)。如本文所用，术语“单酰甘油酰基转移酶”或″MGAT″是指将脂肪酰基从酰基-CoA转移至MAG底物如sn-2MAG以产生DAG的蛋白。因此，术语“单酰甘油酰基转移酶活性”至少是指将酰基从酰基-CoA转移至MAG以产生DAG。如本文所用的术语″MGAT″包括作用于sn-1/3MAG和/或sn-2MAG底物以分别形成sn-1，3DAG和/或sn-1，2/2，3-DAG的酶。在一优选实施方案中，相对于sn-1MAG，MGAT对sn-2MAG底物具有偏好，或者基本上仅使用sn-2MAG作为底物。如本文所用，MGAT不包括相对于MAG将酰基优先转移至LysoPA的酶，此类酶称作LPAAT。也就是说，MGAT优先地使用非磷酰化单酰基底物，即使它们还可能对LysoPA的催化活性较低。优选的MGAT不具有可检测的酰化LysoPA的活性。MGAT还可以具有DGAT功能，但主要用作MGAT，即，当将酶活性以nmol产物/min/mg蛋白为单位表示时，它作为MGAT的催化活性高于作为DGAT的催化活性(还参见Yenetal.，2002)。有三种已知类别的MGAT，分别称作MGAT1、MGAT2和MGAT3。MGAT1、MGAT2和MGAT3多肽的实例描述于WO2013/096993中。如本文所用，“MGAT途径”是指形成TAG的不同于Kennedy途径的合成代谢途径，其中DAG通过MGAT催化的sn-1MAG或优选sn-2MAG的酰化而形成。DAG随后可以用来形成TAG或其他脂质。WO2012/000026首先证实植物叶组织可以从G-3-P合成MAG，从而MAG是叶组织中表达的外源MGAT可使用的，第二，来自各种来源的MGAT可以在植物组织中发挥功能，需要与参与脂质合成的其他植物因子成功相互作用，第三，外源MGAT活性产生的DAG是植物DGAT或外源DGAT可使用的，以便产生TAG。MGAT和DGAT活性可以通过将编码酶(或候选酶)的构建体引入酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)菌株H1246并证明TAG积累来测定。已表明在某些DGAT2中对催化活性具有重要意义的某些基序在MGAT酰基转移酶中也是保守的。特别感兴趣的是具有共有序列FLXLXXXN(SEQIDNO：14)(其中每个X独立地为非脯氨酸的任何氨基酸，并且N为任何非极性氨基酸，该序列位于N端跨膜区内)的推定中性脂质结合结构域，接着为推定甘油/磷脂酰基转移酶结构域。FLXLXXXN基序(SEQIDNO：14)存在于小鼠DGAT2(氨基酸81-88)和MGAT1/2中但不存在于酵母或植物DGAT2中。它对小鼠DGAT2的活性具有重要意义。其他DGAT2和/或MGAT1/2序列基序包括：1.存在于大多数DGAT2多肽中也存在于MGAT1和MGAT2中的高度保守的YFP三肽(SEQIDNO：10)，例如作为小鼠DGAT2中的氨基酸139-141而存在。通过非保守取代使酵母DGAT2内的这个基序发生突变将使酶丧失功能。2.在MGAT中以及在来自动物和真菌的DGAT2序列中高度保守的HPHG四肽(SEQIDNO：11)，例如作为小鼠DGAT2中的氨基酸161-164而存在，并至少在酵母和小鼠DGAT2中对催化活性具有重要意义。植物DGAT2酰基转移酶相反具有EPHS(SEQIDNO：12)保守序列，因此可以接受对第一和第四氨基酸的保守变化。3.作为推定甘油磷脂结构域一部分的较长保守基序。这个基序的实例为RXGFX(K/R)XAXXXGXXX(L/V)VPXXXFG(E/Q)(SEQIDNO：13)，其作为小鼠DGAT2中的氨基酸304-327而存在。这个基序在氨基酸序列中不如其他的保守，如可以通过其长度所预料，但是通过基序搜素可以识别同系物。在更保守的氨基酸之间，间距可以变化，即，与上面的序列相比，在基序内可以存在额外的X氨基酸或者更少的X氨基酸。从脂肪酸酯化为ACP或CoA的甘油脂合成中的一个重要组分是酶sn-甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)，其是参与非极性脂质的生物合成的另一种多肽。这种酶参与不同的代谢途径和生理功能。其催化以下反应：G3P+脂肪酰基-ACP或-CoA→LPA+游离-ACP或-CoA。GPAT催化的反应发生在3种不同的植物亚细胞区室中：质体、内质网(ER)和线粒体。这些反应是通过3种不同类型的GPAT酶催化的，使用酰基-ACP作为其天然酰基底物的位于质体基质中的可溶形式(图1中的PGPAT)，以及分别使用酰基-CoA和酰基-ACP作为天然酰基供体的位于ER和线粒体中的2种膜结合形式(Chenetal.，2011)。如本文所用，术语“甘油-3-磷酸酰基转移酶”(GPAT；EC2.3.1.15)及其同义词“甘油-3-磷酸O-酰基转移酶”是指使甘油-3-磷酸(G-3-P)酰化形成LysoPA和/或MAG的蛋白，如果GPAT还具有对LysoPA的磷酸酶活性则形成后一产物。如果GPAT是ER类型GPAT(也称作“微粒体GPAT”的“酰基-CoA：sn-甘油-3-磷酸1-O-酰基转移酶”)，则转移的酰基来自酰基-CoA，或者如果GPAT是质体类型GPAT(PGPAT)，则转移的酰基来自酰基-ACP。因此，术语“甘油-3-磷酸酰基转移酶活性”是指G-3-P酰化形成LysoPA和/或MAG。术语“GPAT”涵盖使G-3-P酰化形成sn-1LPA和/或sn-2LPA优选sn-2LPA的酶。优选地，可以在推修饰中过量表达的GPAT是在细胞的ER中发挥功能的膜结合的GPAT，更优选GPAT9，而在原核途径中下调的质体GPAT是可溶性GPAT(“质体GPAT”)。在一优选实施方案中，GPAT具有磷酸酶活性。在一最优选的实施方案中，GPAT是具有产生sn-2MAG的磷酸酶活性的sn-2GPAT。如本文所用，术语“sn-1甘油-3-磷酸酰基转移酶”(sn-1GPAT)是指使sn-甘油-3-磷酸(G-3-P)酰化优先地形成1-酰基-sn-甘油-3-磷酸(sn-1LPA)的蛋白。因此，术语“sn-1甘油-3-磷酸酰基转移酶活性”是指使sn-甘油-3-磷酸酰化形成1-酰基-sn-甘油-3-磷酸(sn-1LPA)。如本文所用，术语“sn-2甘油-3-磷酸酰基转移酶”(sn-2GPAT)是指使sn-甘油-3-磷酸(G-3-P)酰化优先地形成2-酰基-sn-甘油-3-磷酸(sn-2LPA)的蛋白。因此，术语“sn-2甘油-3-磷酸酰基转移酶活性”是指使sn-甘油-3-磷酸酰化形成2-酰基-sn-甘油-3-磷酸(sn-2LPA)。GPAT家族是一个庞大的家族，并且所有已知的成员均包含两个保守结构域：plsC酰基转移酶结构域(PF01553；SEQIDNO：15)和HAD样水解酶(PF12710；SEQIDNO：16)超家族结构域及其变体。除此之外，至少在拟南芥中，亚类GPAT4-GPAT8中的GPAT均包含与磷酸丝氨酸磷酸酶结构域(PF00702；SEQIDNO：17)同源的N端区域，并且产生MAG作为产物的GPAT可以通过这样的同源区的存在来鉴定。在叶组织中内源表达的一些GPAT包含保守氨基酸序列GDLVICPEGTTCREP(SEQIDNO：18)。GPAT4和GPAT6均包含已知对磷酸酶活性至关重要的保守残基，具体地讲，位于N端的基序I(DXDX[T/V][L/V]；SEQIDNO：19)和基序III(K-[G/S][D/S]XXX[D/N]；SEQIDNO：20)中的保守氨基酸(Yangetal.，2010)。拟南芥GPAT4(登录号NP_171667.1)和GPAT6(NP_181346.1)的同源物包括AAF02784.1(拟南芥)、AAL32544.1(拟南芥)、AAP03413.1(水稻)、ABK25381.1(北美云杉(Piceasitchensis))、ACN34546.1(玉米)、BAF00762.1(拟南芥)、BAH00933.1(水稻)、EAY84189.1(水稻)、EAY98245.1(水稻)、EAZ21484.1(水稻)、EEC71826.1(水稻)、EEC76137.1(水稻)、EEE59882.1(水稻)、EFJ08963.1(江南卷柏(Selaginellamoellendorffii))、EFJ11200.1(江南卷柏)、NP_001044839.1(水稻)、NP_001045668.1(水稻)、NP_001147442.1(玉米)、NP_001149307.1(玉米)、NP_001168351.1(玉米)、AFH02724.1(欧洲油菜)NP_191950.2(拟南芥)、XP_001765001.1(小立碗藓)、XP_001769671.1(小立碗藓)、(葡萄)、XP_002275348.1(葡萄)、XP_002276032.1(葡萄)、XP_002279091.1(葡萄)、XP_002309124.1(毛果杨)、XP_002309276.1(毛果杨)、XP_002322752.1(毛果杨)、XP_002323563.1(毛果杨)、XP_002439887.1(两色高粱)、XP_002458786.1(两色高粱)、XP_002463916.1(两色高粱)、XP_002464630.1(两色高粱)、XP_002511873.1(蓖麻)、XP_002517438.1(蓖麻)、XP_002520171.1(蓖麻)、ACT32032.1(油桐)、NP_001051189.1(水稻)、AFH02725.1(欧洲油菜)、XP_002320138.1(毛果杨)、XP_002451377.1(两色高粱)、XP_002531350.1(蓖麻)以及XP_002889361.1(琴叶拟南芥)。可溶性质体GPAT(PGPAT，在拟南芥中也称作ATS1)已被纯化，并且编码它们的基因克隆自几种植物物种如豌豆(Pisumsativum，登录号：P30706.1)、菠菜(Spinaciaoleracea，登录号：Q43869.1)、squash(Cucurbitamoschate，登录号：P10349.1)、黄瓜(Cucumissativus，登录号：Q39639.1)和拟南芥(登录号：Q43307.2)。可溶性质体GPAT是已知为甘油脂合成的原核途径的第一个保证步骤，并且仅在质体中可操作(图1)。所谓的原核途径仅位于植物质体中，并且组装DAG用于包含在甘油骨架的sn-2位置酯化的C16：3脂肪酸的半乳糖脂(MGDG和DGMG)的合成。保守基序和/或残基可以用作基于序列的诊断法，用于GPAT酶。或者，可以利用更严格的基于功能的测定。这样的测定包括例如向细胞或微粒体供给加标记的甘油-3-磷酸，然后通过薄层层析或类似技术定量标记产物的水平。GPAT活性导致产生标记的LPA，而GPAT/磷酸酶活性则导致产生标记的MAG。如本文所用，术语“溶血磷脂酸酰基转移酶”(LPAAT；EC2.3.1.51)及其同义词“1-酰基-甘油-3-磷酸酰基转移酶”、“酰基-CoA：1-酰基-sn-甘油-3-磷酸2-O-酰基转移酶”和“1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶”是指使溶血磷脂酸(LPA)酰化形成磷脂酸(PA)的蛋白。如果LPAAT是ER类型LPAAT，则转移的酰基来自酰基-CoA，或者如果LPAAT是质体类型LPAAT(PLPAAT)，则转移的酰基来自酰基-ACP。因此，术语“溶血磷脂酸酰基转移酶活性”是指LPA酰化形成PA。油体包衣多肽植物种子和花粉在一般直径为0.5-2.5μm的称作油体的亚细胞结构中积累TAG。如本文所用，也称作“油体”的“脂滴”是用于储存或交换天然脂质(主要包括TAG)的富含脂质的细胞器。脂滴大小可以大大不同，从约20nm至100μm。这些细胞器具有磷脂单层所包围的TAG核，所述磷脂单层包含参与脂质代谢和储存以及脂质运输至其他膜的几种嵌入的蛋白，如果油体来自植物种子或花组织则包括油质蛋白(Jolivetetal.，2004)。它们一般由0.5-3.5％蛋白组成，而剩余的是脂质。它们是大多数细胞中密度最小的细胞器，并且因此可以通过浮选离心容易地分离。油质蛋白代表来自种子的油体膜中最丰富(至少80％)的蛋白。如本文所用，术语“油质蛋白”是指存在于种子的贮藏组织中的油体膜中的两亲蛋白(参见，例如，Huang，1996；Linetal.，2005；Capuanoetal.，2007；Luietal.，2009；ShimadaandHara-Nishimura，2010)和人工产生的变体(参见例如WO2011/053169和WO2011/127118)。油质蛋白具有低Mr(15-26,000)，对应约140-230个氨基酸，这允许它们紧紧包裹在油体表面上。在每个种子物种内，通常有两种或更多种不同Mr的油质蛋白。每个油质蛋白分子含有相对亲水的可变N-端结构域(例如，约48个氨基酸残基)，中间的完全疏水结构域(例如，约70-80个氨基酸残基的)，其特别富含脂肪族氨基酸如丙氨酸、甘氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸，以及位于或邻近C-末端的约30-40个氨基酸残基的两亲性α-螺旋结构域。中间的疏水结构域通常包含在其中心的约12个残基的脯氨酸节基序。一般来说，将疏水残基的中心段插入脂质核心，并且两亲性N-端和/或两亲性C-端位于油体的表面，带正电荷的残基包埋在磷脂单层中，而带负电荷的残基暴露于外部。如本文所用，术语“油质蛋白”涵盖聚油质蛋白，其具有以头尾方式融合在一起成为单个多肽的多个油质蛋白多肽(WO2007/045019)，例如2x、4x或6x油质蛋白肽；以及涵盖油体钙蛋白，其结合钙并且是包被种子中的油体的蛋白的最小蛋白组分(Froissardetal.，2009)；以及涵盖油体固醇蛋白，其结合固醇(WO2011/053169)。然而，一般油体的油质蛋白的大部分(至少80％)都不会是油体钙蛋白和/或油体固醇蛋白。术语“油质蛋白”还涵盖已人工修饰的油质蛋白多肽，用半胱氨酸残基人工置换天然油质蛋白的一个或多个氨基酸的这类油质蛋白，如WO2011/053169所述。通常，人工取代4-8个残基，优选6个残基，但是可以取代多达2-14个残基。优选地，两亲性N-端和两亲性C-端结构域包含半胱氨酸取代。该修饰增加油质蛋白的交联能力，并且增加热稳定性和/或蛋白抗蛋白酶降解的稳定性。从许多不同的植物物种已知大量的油质蛋白序列和编码它们的核苷酸序列。实例包括但不限于来自拟南芥、油菜、玉米、稻、花生、蓖麻，大豆、亚麻、葡萄、甘蓝、棉花、向日葵、高粱和大麦的油质蛋白。油体蛋白(与它们的登录号)的实例包括欧洲油菜油质蛋白(CAA57545.1；SEQIDNO：95)、欧洲油菜油质蛋白S1-1(ACG69504.1；SEQIDNO：96)、欧洲油菜油质蛋白S2-1(ACG69503.1；SEQIDNO：97)、欧洲油菜油质蛋白S3-1(ACG69513.1；SEQIDNO：98)、欧洲油菜油质蛋白S4-1(ACG69507.1；SEQIDNO：99)、欧洲油菜油质蛋白S5-1(ACG69511.1；SEQIDNO：100)、花生油质蛋白1(AAZ20276.1；SEQIDNO：101)、花生油质蛋白2(AAU21500.1；SEQIDNO：102)、花生油质蛋白3(AAU21501.1；SEQIDNO：103)、花生油质蛋白5(ABC96763.1；SEQIDNO：104)、蓖麻油质蛋白1(EEF40948.1；SEQIDNO：105)、蓖麻油质蛋白2(EEF51616.1；SEQIDNO：106)、大豆油质蛋白同种型a(P29530.2；SEQIDNO：107)、大豆油质蛋白同种型b(P29531.1；SEQIDNO：108)、亚麻油质蛋白低分子量同种型(ABB01622.1；SEQIDNO：109)、亚麻油质蛋白高分子量同种型(ABB01624.1；SEQIDNO：110)、向日葵油质蛋白(CAA44224.1；SEQIDNO：111)、玉米油质蛋白(NP_001105338.1；SEQIDNO：112)、欧洲油菜油体固醇蛋白(ABM30178.1；SEQIDNO：113)、欧洲油菜油体固醇蛋白SLO1-1(ACG69522.1；SEQIDNO：114)、欧洲油菜油体固醇蛋白SLO2-1(ACG69525.1；SEQIDNO：115)、芝麻油体固醇蛋白(AAL13315.1；SEQIDNO：116)、玉米油体固醇蛋白(NP001152614.1；SEQIDNO：117)、欧洲油菜油体钙蛋白CLO-1(ACG69529.1；SEQIDNO：118)、欧洲油菜油体钙蛋白CLO-3(ACG69527.1；SEQIDNO：119)、芝麻油体钙蛋白(AAF13743.1；SEQIDNO：120)、玉米油体钙蛋白(NP_001151906.1；SEQIDNO：121)、大豆油体钙蛋白(AAB71227)。功能等同的其他脂质包裹多肽是plastoglobulin和MLDP多肽(WO2011/127118)。在一实施方案中，除非另有说明，编码油质蛋白的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：95-112中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：95-112中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。在一实施方案中，除非另有说明，编码油体固醇蛋白的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：113-117中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：113-117中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。如本文所用，“脂滴相关蛋白”或“LDAP”表示除种子、花药和花粉以外的组织或器官(如包括果皮和中果皮的果实组织)中的与植物中的脂滴相关的多肽。LDAP可以与种子、花药或花粉以及除种子、花药或花粉以外的组织或器官中的油体相关。它们不同于油质蛋白，油质蛋白是与种子组织、花药和花粉中的脂滴表面相关的多肽。如本文所用的LDAP包括植物组织中天然产生的LDAP多肽以及人工产生的氨基酸序列变体。这类变体的功能可以如实施例15中示例的进行测试。Horn等人(2013)鉴定了在鳄梨果皮中表达的2个LDAP基因。所编码的鳄梨LDAP1和LDAP2多肽在氨基酸中62％相同，并且与拟南芥At3g05500编码的多肽和橡胶树SRPP样蛋白具有同源性。Gidda等人(2013)鉴定了在油棕(Elaeisguineensis)中果皮中但不在果仁中表达的3个LDAP基因，并且得出结论，LDAP基因是植物特异性的，并且在所有植物物种中是保守的。LDAP多肽可以包含额外的结构域(Giddaetal.，(2013)。编码LDAP的基因一般在具有丰富脂质的非种子组织中上调，并且从而可以鉴定但不认为在产生油(包括用于短暂储存)的所有非种子细胞中表达。Horn等人(2013)示出了植物中的SRPP样蛋白的系统树。示例性LDAP多肽描述于本文的实施例15中。其他植物物种中的LDAP的同系物可以由本领域技术人员容易地鉴定。在一实施方案中，除非另有说明，编码LDAP的本发明的外源多核苷酸包含以下一个或多个：i)核苷酸，其编码包含序列如SEQIDNO：237、239或241中任一个所示的氨基酸的多肽或其生物活性片段，或者氨基酸序列与SEQIDNO：237、239或241中的任何一个或多个至少30％相同的多肽，ii)序列与i)至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。如本文所用，术语“参与淀粉生物合成的多肽”是指任何多肽，其在细胞中下调至低于正常(野生型)水平导致淀粉合成水平的降低以及淀粉水平的降低。这样的多肽的实例是AGPase。如本文所用，术语“ADP-葡糖糖磷酸化酶”或“AGPase”是指调节淀粉生物合成的酶，催化葡萄糖-1-磷酸和ATP至ADP-葡糖糖(其用作淀粉多聚物的构件)的转化。AGPase酶的活性形式由2个大亚基和2个小亚基组成。植物中的ADPase酶主要作为四聚体存在，其由2个大亚基和2个小亚基组成。虽然这些亚基根据物种在它们的催化和调节作用上有所不同(Kuhnetal.，2009)，但是在植物中小亚基一般表现出催化活性。小亚基的分子量为约50-55kDa。大亚基的分子量为约55-60kDa。该植物酶由3-磷酸甘油酸盐(PGA)强烈激活，其为二氧化碳固定的产物；在缺乏PGA时，该酶仅表现出大约其3％的活性。植物AGPase还被无机磷酸盐(Pi)强烈抑制。相反，细菌和藻类AGPase以50kDa的同源四聚体存在。藻类酶(与其植物对应物类似)被PGA激活且被Pi抑制，而细菌酶则被果糖-1，6-二磷酸盐(FBP)激活且被AMP和Pi抑制。TAG脂肪酶和β-氧化如本文所用，术语“参与脂质降解和/或减少脂质含量的多肽”是指使脂质发生分解代谢的任何多肽，其在细胞中下调至低于正常(野生型)水平会导致该细胞(优选植物的营养性部分、块茎、根或种子的细胞)中油(如脂肪酸和/或TAG)水平的提高。这类多肽的实例包括但不限于，脂肪酶类(lipases)，或者脂肪酶如CGi58(比较基因标识符-58样)多肽、SUGAR-DEPENDENT1(SDP1)三酰基甘油脂肪酶(参见，例如，Kellyetal.，2011)以及WO2009/027335中描述的脂肪酶。如本文所用，术语“TAG脂肪酶”(EC.3.1.1.3)是指将TAG水解为一种或多种脂肪酸以及DAG、MAG或甘油中的任一种的蛋白。因此，术语“TAG脂肪酶活性”是指TAG至甘油和脂肪酸的水解。如本文所用，术语“CGi58”是指拟南芥中的At4g24160基因编码的可溶性酰基-CoA依赖性溶血磷脂酸酰基转移酶及其在其他植物中的同系物以及酵母中的“Ict1p”及其同系物。植物基因如来自拟南芥基因基因座At4g24160的植物基因表达为两个可选择的转录物：较长的全长同种型(At4g24160.1)和较短的缺少3′末端的同种型(At4g24160.2)(参见Jamesetal.，2010；Ghoshetal.，2009；US201000221400)。两种mRNA均编码蛋白，所述蛋白与人CGI58蛋白和这个α/β水解酶家族(ABHD)的其他直系进化同源成员同源。在一实施方案中，CGI58(At4g24160)蛋白含有三个在植物物种间保守的基序：GXSXG脂肪酶基序(SEQIDNO：127)、HX(4)D酰基转移酶基序(SEQIDNO：128)、和可能的脂质结合基序VX(3)HGF(SEQIDNO：129)。人CGI-58蛋白具有溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT)活性但不具有脂肪酶活性。相反，植物和酵母蛋白具有标准的脂肪酶序列基序GXSXG(SEQIDNO：127)，其在脊椎动物(人、小树和斑马鱼)蛋白中缺失，并且具有脂肪酶和磷脂酶活性(Ghoshetal.，2009)。虽然植物和酵母CGI58蛋白看来在LPAAT活性之外还具有可检测量的TAG脂肪酶和磷脂酶A活性，但人类蛋白却并不如此。拟南芥中同源CGI-58基因的破坏导致天然脂滴在成熟叶中的累积。来自cgi-58功能缺失突变体的分离的脂滴的质谱显示出它们包含具有常规叶特异性脂肪酸的三酰甘油。成熟cgi-58植物的叶表现出绝对三酰甘油水平的显著提高，比野生植物中高超过10倍。cgi-58功能缺失植物的储油种子中的脂质水平没有变化，并且与β-氧化中的突变不同，该cgi-58种子正常萌发和生长，不需要用蔗糖拯救(Jamesetal.，2010)。编码CGi58多肽的核苷酸的实例包括来自以下的核苷酸：拟南芥(编码NP_194147.2的NM_118548.1；SEQIDNO：130)、二穗短柄草(XP_003578450.1；SEQIDNO：131)、大豆(编码XP_003523638.1的XM_003523590.1；SEQIDNO：132)、玉米(编码NP_001149013.1的NM_001155541.1；SEQIDNO：133)、两色高粱(编码XP_002460538.1的XM_002460493.1；SEQIDNO：134)、蓖麻(编码XP_002510485.1的XM_002510439.1；SEQIDNO：135)、蒺藜苜蓿(编码XP_003603733.1的XM_003603685.1；SEQIDNO：136)以及水稻(编码EAZ09782.1)。在一实施方案中，本发明的遗传修饰下调CGi58的内源生成，其中CGi58由以下一个或多个编码：i)包含如SEQIDNO：130-136中任一个所示的序列的核苷酸，ii)包含与SEQIDNO：130-136中任一个或更多个至少30％相同的序列的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的多核苷酸。对TAG具有脂肪酶活性的其他脂肪酶包括SUGAR-DEPENDENT1三酰甘油脂肪酶(SDP1，参见例如Eastmondetal.，2006；Kellyetal.，2011)和在植物物种以及酵母(TGL4多肽)和动物细胞中发现的SDP1样多肽，其参与储存TAG的分解。SDP1和SDP1样多肽看来负责在萌发之后于种子中开始TAG分解(Eastmondetal.，2006)。在外源WRI1和DGAT1不存在的情况下，SDP1突变的植物表现出它们的TAG中升高水平的PUFA。如本文所用，“SDP1多肽”包括SDP1多肽、SDP1样多肽和它们在植物物种中的同系物。植物中的SDP1和SDP1样多肽的长度为800-910个氨基酸残基，具有可以与油体表面相关的patatin样酰基水解酶结构域，并且优先将TAG水解为DAG或MAG。据认为SDP1对水解TAG的sn-2位置的酰基具有偏好。拟南芥包含至少3个编码SDP1脂肪酶的基因，即SDP1(登录号NP_196024，核苷酸序列SEQIDNO：163和其他物种中的同系物)、SDP1L(登录号NM_202720和其他物种中的同系物，Kellyetal.，2011)和ATGLL(At1g33270)(Eastmondetal，2006)。对减少基因活性特别关注的是在植物中的营养组织如叶、茎和根中表达的SDP1基因。因此可以通过减少植物部分中的SDP1多肽的活性来提高营养性植物部分中非极性脂质的水平，例如通过编码SDP1多肽的内源基因的突变或者引入编码减少内源SDP1基因表达的沉默RNA分子的外源基因。这样的减少在块茎作物如甜菜和马铃薯中以及在“高蔗糖”植物如甘蔗和甜菜中特别有益。选择的编码植物物种中的SDP1同源物(包括SDP1样同源物)的基因可以通过与已知SDP1基因序列的同源性容易地鉴定。已知的SDP1核苷酸或氨基酸序列包括登录号：欧洲油菜中，GN078290(SEQIDNO：164)、GN078281、GN078283；荠菜(Capsellarubella)，XP_006287072；可可(Theobromacacao)，XP_007028574.1；毛果杨，XP_002308909(SEQIDNO：166)；桃树(Prunuspersica)，XP_007203312；梅花(Prunusmume)，XP_008240737；苹果(Malusdomestica)，XP_008373034；蓖麻，XP_002530081；蒺藜苜蓿，XP_003591425(SEQIDNO：167)；番茄(Solanumlycopersicum)，XP_004249208；菜豆，XP_007162133；大豆，XP_003554141(SEQIDNO：168)；马铃薯，XP_006351284；大豆，XP_003521151；鹰嘴豆(Cicerarietinum)，XP_004493431；黄瓜，XP_004142709；甜瓜，XP_008457586；麻风树，KDP26217；葡萄，CBI3074；水稻，粳稻组BAB61223；水稻，籼稻组EAY75912；水稻，粳稻组NP_001044325；两色高粱，XP_002458531(SEQIDNO：169)；二穗短柄草，XP_003567139(SEQIDNO：165)；玉米，AFW85009；大麦，BAK03290(SEQIDNO：172)；节节麦(Aegilopstauschii)，EMT32802；两色高粱，XP_002463665；玉米，NP_001168677(SEQIDNO：170)；大麦，BAK01155；节节麦，EMT02623；乌拉尔图小麦(Triticumurartu)，EMS67257；小立碗藓，XP_001758169(SEQIDNO：171)。用于抑制内源基因表达的遗传构建体中使用的优选SDP1序列来自对应于在细胞、营养性植物部分或种子(无论哪个待修饰)中最高表达的基因的cDNA。如果期望减少该物种中的基因家族所有成员的活性，则优选在对应于植物物种中的所有SDP1基因的cDNA之间高度保守的核苷酸序列。在一实施方案中，本发明的遗传修饰下调SDP1的内源生成，其中SDP1由以下一个或多个编码：i)序列如SEQIDNO：163-174中任一个所示的核苷酸，ii)序列与如SEQIDNO：163-174所示的任何一个或多个序列至少30％相同的核苷酸，以及iii)在严格条件下杂交至i)或ii)中的一种或两者的核苷酸序列。如实施例所示，植物叶中SDP1TAG脂肪酶的表达和/或活性的减少大大增加TAG含量，在植物发育期间积累的TAG量和积累的较早时间方面，在共表达转录因子WRI1和脂肪酰基酰基转移酶的背景下。特别地，在开花之前于植物中观察到增加，并且在衰老发生时在重量基础(％干重)上高达约70％。增加是相对于用编码WRI1和脂肪酰基酰基转移酶的外源多核苷酸转化但缺少减少SDP1表达和/或活性的修饰的相应植物叶中观察到的TAG水平。减少植物部分中其他TAG分解代谢基因的表达也可以增加TAG含量，如编码酰基CoA氧化酶的ACX基因如Acx1(At4g16760和其他植物物种中的同系物)或Acx2(At5g65110和其他植物物种中的同系物)基因。参与脂质分解代谢的另一多肽是PXA1，其是β-氧化的脂肪酸输入所需要的过氧化物酶体ATP-结合盒转运蛋白(Zolmanetal.2001)。从质体输出脂肪酸如本文所用，术语“增加脂肪酸输出细胞质体的多肽”是指辅助将脂肪酸从质体内(具有质体的细胞中，如营养性部分、块茎、根或植物种子的细胞)转移至质体外(其可以是细胞的任何其他部分，例如内质网(ER))的任何多肽。这类多肽的实例包括但不限于C16或C18脂肪酸硫酯酶如FATA多肽或FATB多肽，C8-C14脂肪酸硫酯酶(其也是FATB多肽)，脂肪酸转运蛋白如ABCA9多肽或长链酰基-CoA合成酶(LACS)。如本文所用，术语“脂肪酸硫酯酶”或“FAT”是指催化酰基-ACP中酰基部分和酰基载体蛋白(ACP)之间的硫酯键的水解以及游离脂肪酸的释放的酶。这类酶通常在从头合成脂肪酸的生物体的质体中发挥功能。如本文所用，术语“C16或C18脂肪酸硫酯酶”是指在质体中催化酰基-ACP中C16和/或C18酰基部分和ACP之间的硫酯键的水解以及游离C16或C18脂肪酸的释放的酶。然后在其转运出质体时，游离脂肪酸在质体被膜中重新酯化为CoA。质体中的脂肪酸硫酯酶(FAT)酶的底物特异性参与决定从质体输出的脂肪酸的链长度和饱和程度谱。基于它们的底物特异性和核苷酸序列，可以将FAT酶分为两类，FATA和FATB(EC3.1.2.14)(Jonesetal.，1995)。FATA多肽优选油酰基-ACP作为底物，而FATB多肽对不同链长度的饱和酰基-ACP表现出更高活性，如作用于棕榈酰-ACP产生游离棕榈酸。可用于本发明的FATA多肽的实例包括但不限于来自拟南芥(NP_189147)、花生(GU324446)、向日葵(AAL79361)、红花(AAA33020)、Morusnotabilis(XP_010104178.1)、欧洲油菜(CDX77369.1)、蓖麻(XP_002532744.1)和亚麻荠(AFQ60946.1)的那些FATA多肽。可用于本发明的FATB多肽的实例包括但不限于来自玉米(AIL28766)、欧洲油菜(ABH11710)、向日葵(AAX19387)、拟南芥(AEE28300)、加州月桂(AAC49001)、花生(AFR54500)、蓖麻(EEF47013)和小颖短柄草(ABL85052.1)的那些FATB多肽。FATB多肽的一个亚类是对通过硫酯键连接至ACP的C8-C14饱和酰基部分具有水解活性的脂肪酸硫酯酶。这类酶也称作中链脂肪酸(MCFA)硫酯酶或MC-FAT酶。这类酶还可以对C16-ACP具有硫酯酶活性，实际上它们可以对C16酰基-ACP底物具有比对MCFA-ACP底物更大的硫酯酶活性，尽管如果当在植物细胞中外源表达时它们产生总脂肪酸含量中的至少0.5％MCFA，则在本文中认为它们是MCFA硫酯酶。MCFA硫酯酶的实例在本文实施例9中给出。如本文所用，术语“脂肪酸转运蛋白”涉及质体膜中存在的多肽，其参与将脂肪酸从质体主动转移至质体外。可用于本发明的ABCA9(ABC转运蛋白A家族成员9)多肽的实例包括但不限于来自拟南芥(Q9FLT5)、荠菜(XP_006279962.1)、Arabisalpine(KFK27923.1)、亚麻荠(XP_010457652.1)、欧洲油菜(CDY23040.1)和芜菁(Brassicarapa)(XP_009136512.1)的那些ABCA9多肽。如本文所用，术语“酰基-CoA合成酶”或“ACS”(EC6.2.1.3)表示是连接酶家族成员的多肽，其催化通过腺苷酸化中间体进行的两步方法形成脂肪酰基-CoA，利用非酯化的脂肪酸、CoA和ATP作为底物产生酰基CoA酯、AMP和焦磷酸盐作为产物。如本文所用，术语“长链酰基-CoA合成酶”(LACS)是对至少C18游离脂肪酸底物具有活性的ACS，虽然其可以对任何C14-C20游离脂肪酸具有更广泛的活性。内源质体LACS酶位于质体的外膜中，并且与脂肪酸硫酯酶一起发挥功能用于从质体输出脂肪酸(Schnurretal.，2002)。在拟南芥中，有至少9种鉴定的LACS基因(Shockeyetal.，2002)。优选的LACS多肽是LACS9亚类的，其在拟南芥中是主要的质体LACS。可用于本发明的LACS多肽的实例包括但不限于来自拟南芥(Q9CAP8)、亚麻荠(XP_010416710.1)、荠菜(XP_006301059.1)、欧洲油菜(CDX79212.1)、芜菁(XP_009104618.1)、雷蒙德氏棉(Gossypiumraimondii)(XP_012450538.1)和葡萄(XP_002285853.1)的那些LACS多肽。上文提到的多肽在其他物种中的同系物可以由本领域技术人员容易地鉴定。参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽还可以通过减少参与植物部分中的质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽的活性来提高例如营养性植物部分中的非极性脂质的水平，例如通过编码这样的多肽的内源基因的突变或者引入编码减少参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的靶基因表达的沉默RNA分子的外源基因。如本文所用，术语“参与质体中的二酰甘油(DAG)生成的多肽”是指直接参与二酰甘油合成的质体中的任何多肽(在具有质体的细胞中，如营养性部分、块茎、根或植物种子的细胞)。这类多肽的实例包括但不限于质体GPAT、质体LPAAT或质体PAP。GPAT在本文件中的其他地方描述。可以靶向用于本发明中的下调的质体GPAT多肽的实例包括但不限于来自拟南芥(BAA00575)、荠菜(XP_006306544.1)、亚麻荠(010499766.1)、欧洲油菜(CDY43010.1)、芜菁(XP_009145198.1)、向日葵(ADV16382.1)和蜜柑(Citrusunshiu)(BAB79529.1)的那些质体GPAT多肽。其他物种中的同系物可以由本领域技术人员容易地鉴定。LPAAT在本文件中的其他地方描述。技术人员会理解，靶向用于下调以减少质体中的DAG合成的质体LPAAT不是在质体外发挥功能的内源LPAAT，如ER中的那些，例如如本文所述可用于产生包含中链长度脂肪酸的TAG。可以靶向用于本发明中的下调的质体LPAAT多肽的实例包括但不限于来自欧洲油菜(ABQ42862)、芜菁(XP_009137939.1)、拟南芥(NP_194787.2)、亚麻荠(XP_010432969.1)、大豆(XP_006592638.1)和马铃薯(XP_006343651.1)的那些质体LPAAT多肽。上文提到的多肽在其他物种中的同系物可以由本领域技术人员容易地鉴定。如本文所用，术语“磷脂酸磷酸酶”(PAP)(EC3.1.3.4)是指水解3-sn-磷脂酸盐上的磷酸基团产生1，2-二酰基-sn-甘油(DAG)和磷酸盐的蛋白。可以靶向用于本发明中的下调的质体PAP多肽的实例包括但不限于来自拟南芥(Q6NLA5)、荠菜(XP_006288605.1)、亚麻荠(XP_010452170.1)、欧洲油菜(CDY10405.1)、芜菁(XP_009122733.1)、大豆(XP_003542504.1)和马铃薯(XP_006361792.1)的那些质体PAP多肽。上文提到的多肽在其他物种中的同系物可以由本领域技术人员容易地鉴定。脂肪酸输入质体还可以通过减少植物部分中的TGD多肽的活性来提高营养性植物部分中的非极性脂质的水平，例如通过编码TGD多肽的内源基因的突变或者引入编码减少内源TGD基因表达的沉默RNA分子的外源基因。如本文所用，“三半乳糖基二酰甘油(TGD)多肽”是参与ER至叶绿体的脂质运输(Xuetal.，2010)以及参与形成对脂质具有通透酶功能的蛋白复合物的多肽。已知4种这样的多肽形成或与TGD通透酶相关，即TGD-1(登录号At1g19800和其他物种中的同系物)、TGD-2(登录号At2g20320和其他物种中的同系物)、TGD-3(登录号NM-105215和其他物种中的同系物)和TGD-4(At3g06960和其他物种中的同系物)(US20120237949)。据认为TGD-1、-2和-3多肽是与叶绿体的内被膜相关的ATP-结合盒(ABC)转运蛋白的组分。TGD-2和TGD-4多肽结合至磷脂酸，而TGD-3多肽的功能为叶绿体基质中的ATPase。如本文所用，“内源TGD基因”是编码植物中的TGD多肽的基因。拟南芥中TGD-1基因的突变引起三酰甘油、寡半乳糖脂和磷脂酸(PA)的积累(Xuetal.，2005)。TGD基因或SDP1基因中的突变，或者实际上植物中的任何期望基因中的突变，可以通过如本领域已知的人工锌指核酸酶(ZFN)、TAL效应子(TALEN)或CRISPR技术(使用Cas9型核酸酶)以位点特异性方式引入。优选的编码沉默RNA的外源基因是编码双链RNA分子如发夹RNA或人工微RNA前体的那些外源基因。脂肪酸修饰酶如本文所用，术语“FAD2”是指膜结合的Δ-12脂肪酸去饱和酶，其将油酸(C18：1Δ9)去饱和以产生亚油酸(C18：2Δ9，12)。如本文所用，术语“环氧化酶”或”脂肪酸环氧化酶”是指将环氧基引入脂肪酸的酶，其导致产生环氧基脂肪酸。在优选的实施方案中，在脂肪酸链上的第12个碳上引入环氧基，在此情形中该环氧化酶是Δ12-环氧化酶，特别是C16或C18脂肪酸链。所述环氧化酶可以是Δ9-环氧化酶、Δ15环氧化酶、或者如本领域已知的那样作用于酰基链中的不同位置。所述环氧化酶可以是P450类的。优选的环氧化酶是如WO98/46762中所述的单氧化酶类的。许多环氧化酶或推定的环氧化酶已被克隆并且是本领域已知的。环氧化酶的其他实例包括含有WO2009/129582的SEQIDNO：21中提供的氨基酸序列的蛋白，由来自还阳参(Crepispaleastina)(CAA76156，Leeetal.，1998)、琉璃菊(Stokesialaevis)(AAR23815)(单氧化酶类型)、大戟(Euphorbialagascae)(AAL62063)(P450类型)，人CYP2J2(花生四烯酸环氧化酶，U37143)的基因编码的多肽；人CYP1A1(花生四烯酸环氧化酶，K03191)、以及它们的变体和/或突变体。如本文所用，术语″羟化酶”或”脂肪酸羟化酶”是指将羟基引入脂肪酸内的酶，其导致产生羟基化的脂肪酸。在一优选实施方案中，羟基被引入C18脂肪酸链的第2、第12和/或第17个碳。优选地，羟基被引入第12个碳，在此情形中该羟化酶是Δ12-羟化酶。在另一优选实施方案中，羟基被引入C16脂肪酸链的第15个碳。羟化酶还可以具有作为脂肪酸去饱和酶的酶活性。编码Δ12-羟化酶的基因的实例包括来自以下的那些：蓖麻(AAC9010，vandeLoo1995)；Physarialindheimeri(ABQ01458，Dauketal.，2007)；Lesquerellafendleri(AAC32755，Brounetal.，1998)；野胡萝卜(Daucuscarota)(AAK30206)；将脂肪酸的末端羟基化的脂肪酸羟化酶，例如：拟南芥CYP86A1(P48422，脂肪酸ω-羟化酶)；救荒野豌豆(Viciasativa)CYP94A1(P98188，脂肪酸ω-羟化酶)；小鼠CYP2E1(X62595，月桂酸ω-1羟化酶)；大鼠CYP4A1(M57718，脂肪酸ω-羟化酶)，以及它们的变体和/或突变体。如本文所用，术语“轭合酶(conjugase)”或”脂肪酸轭合酶”是指能够在脂肪酸的酰基链中形成共轭键的酶。轭合酶的实例包括由来自以下的基因所编码的那些：金盏花(Calendulaofficinalis)(AF343064，Qiuetal.，2001)；油桐(AAN87574，Dyeretal.，2002)；石榴(Punicagranatum)(AY178446，Iwabuchietal.，2003)和栝楼(Trichosantheskirilowii)(AY178444，Iwabuchietal.，2003)；以及它们的变体和/或突变体。如本文所用，术语“乙炔酶(acetylenase)”或”脂肪酸乙炔酶”是指将三键引入脂肪酸的酶，其导致产生乙炔(acetylenic)脂肪酸。在一优选实施方案中，三键被引入至C18脂肪酸链的第2、第6、第12和/或第17个碳。乙炔酶的实例包括来自向日葵(AA038032、ABC59684)的那些，以及它们的变体和/或突变体。此类脂肪酸修饰基因的实例包括通过推定功能分组的根据以下登录号的蛋白、以及来自其他物种的同源物：Δ12-乙炔酶ABC00769、CAA76158、AAO38036、AAO38032；Δ12轭合酶AAG42259、AAG42260、AAN87574；Δ12去饱和酶P46313、ABS18716，AAS57577、AAL61825、AAF04093、AAF04094；Δ12环氧化酶XP_001840127、CAA76156、AAR23815；Δ12羟化酶ACF37070、AAC32755、ABQ01458、AAC49010；以及Δ12P450酶如AF406732。沉默抑制子在一实施方案中，本发明的重组/转基因细胞可以包含沉默抑制子。如本文所用，“沉默抑制子”增强本发明的细胞中的转基因表达。例如，沉默抑制子的存在导致当与缺少沉默抑制子的相应细胞相比时，本发明的细胞中的外源多核苷酸产生更高水平的多肽。在一实施方案中，相对于不同长度的dsRNA分子，沉默抑制子优先结合长度为21个碱基对的dsRNA。这是至少p19类型的沉默抑制子的特性，即p19及其功能直系同源物。在另一实施方案中，相对于具有平端的相应的双链RNA分子，沉默抑制子优先结合至具有突出的5’末端的双链RNA分子。这是V2类型的沉默抑制子的特性，即p19及其功能直系同源物。在一实施方案中，dsRNA分子或其加工的RNA产物包含至少19个连续的核苷酸，优选其长度为19-24个核苷酸，在双链发夹RNA分子或加工的RNA产物的情况下具有19-24个连续的碱基对，更优选长度上由20、21、22、23或24个核苷酸组成，并且优选包含甲基化的核苷酸，其与靶RNA的区域的补体至少95％相同，并且其中靶RNA的区域是i)在靶RNA的5’非翻译区内，ii)在靶RNA的5’一半内，iii)在靶RNA的编码蛋白的开放阅读框内，iv)在靶RNA的3’一半内，或者v)在靶RNA的3’非翻译区内。关于沉默抑制子的更多细节是本领域公知的，并且描述于WO2013/096992和WO2013/096993中。多核苷酸术语“多核苷酸”和“核酸”可交换使用。它们是指任何长度的聚合物形式的核苷酸，即脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或者它们的类似物。本发明的多核苷酸可以具有基因组、cDNA、半合成或合成起源，可为双链或单链的，并且归因于其起源或操纵：(1)与其在自然界中相关的多核苷酸的全部或一部分无关，(2)连接到其在自然界中所连接的之外的多核苷酸，或者(3)不存在于自然界中。以下是多核苷酸的非限制性实例：基因或基因片段的编码或非编码区、外显子、内含子、信使RNA(mRNA)、转移RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、核糖酶、cDNA、重组多核苷酸、质粒、载体、任何序列的分离DNA、任何序列的分离RNA、任何序列的嵌合DNA、核酸探针和引物。为了体外使用，多核苷酸可以包含修饰的核苷酸，如通过与标记组分缀合。如本文所用，“分离的多核苷酸”是指已从其天然状态下与之相关或连接的多核苷酸序列中分离的多核苷酸，或者非天然存在的多核苷酸。如本文所用，术语“基因”将采取其最广泛的含义，并且包括以下脱氧核糖核苷酸序列，其包含结构基因的转录区以及发生翻译时的蛋白编码区并包括位于5′和3′两个末端上的编码区附近的序列，它们在任一末端上距离末端的距离为至少约2kb并参与基因的表达。就这一点而言，基因包含与给定基因天然相关的控制信号如启动子、增强子、终止和/或多腺苷酸化信号，或者包含异源控制信号，在此情况下，基因称作“嵌合基因”。位于蛋白编码区的5′并存在于mRNA上的序列称作5′非翻译序列。位于蛋白编码区的3′或并存在于mRNA上的序列称作3′非翻译序列。术语“基因”涵盖基因的cDNA和基因组两种形式。基因的基因组形式或克隆包含可通过称为“内含子”、“间插区”或“间插序列”的非编码序列中断的编码区。内含子是转录为核RNA(nRNA)的基因片段。内含子可以包含调控元件如增强子。内含子从核或初级转录物中移除或“剪除”；因此内含子不存在于mRNA转录物中。包含至少一个内含子的基因可以进行可变剪接，导致来自单一转录基因的可选mRNA，因此导致多肽变体。天然状态的基因或嵌合基因可以缺少内含子。mRNA在翻译过程中起到指定新生多肽中的氨基酸序列或顺序的作用。术语“基因”包括编码本文所述的本发明蛋白的全部或一部分的合成或融合分子以及与上文任何一种序列互补的核苷酸序列。如本文所用，“嵌合DNA”是指不是天然存在于自然界中的任何DNA分子；在本文中也称作“DNA构建体”或“遗传构建体”。通常，嵌合DNA包含不是一起天然存在于自然界中的调控和转录或蛋白编码序列。因此，嵌合DNA可以包含衍生自不同来源的调控序列和编码序列，或者衍生自相同来源的调控序列和编码序列但以不同于自然界中所存在的方式排列。开放阅读框可以或可以不连接至其天然上游和下游调控元件。开放阅读框可以整合至例如植物基因组中、处于非天然位置或者处于复制子或载体中，在其中它在天然状态下不存在，如细菌质粒或病毒载体。术语“嵌合DNA”不限于能在宿主中复制的DNA分子，而是包括能够通过例如特定的衔接子序列连接至复制子中的DNA。“转基因”是已通过转化程序引入基因组中的基因。该术语包括子代细胞、植物、种子、非人生物体或其部分中的被引入其祖细胞的基因组内的基因。这类子代细胞等可以至少是所述经首次转化的祖细胞的第三代或第四代子代，或者是祖代转基因植物(在本文中称作T0植物)的第三代或第四代子代。子代可以通过性繁殖或者营养性地产生，例如，从马铃薯中的块茎或甘蔗中的的截根苗(ratoon)产生。术语“遗传修饰的”、“遗传修饰”及其变化是范围更宽的术语，其包括通过转化或转导将基因引入细胞，使细胞中的基因突变以及从遗传学上改变或调节细胞中的基因调控，或如上所述进行修饰的任何细胞的子代。如本文所用的“基因组区域”是指基因组内的位置，在该位置处已将转基因或转基因群组(在本文中也称作基因簇)插入细胞或其前体细胞。这类区域仅包含已通过人工干预如通过本文所述的方法整合的核苷酸。本发明的“重组多核苷酸”是指已通过人工重组方法构建或修饰的核酸分子。重组多核苷酸与其天然状态相比可以改变的量存在于细胞中或以改变的速率表达(例如，就mRNA而言)。在一实施方案中，将多核苷酸引入天然不含该多核苷酸的细胞。通常，将外源DNA用作mRNA转录的模板，然后在转化的细胞内翻译为编码本发明的多肽的氨基酸残基的连续序列。在另一实施方案中，多核苷酸是细胞的内源多核苷酸，并且其表达通过重组手段改变，例如，将外源控制序列引入所关注的内源基因的上游，以使得转化的细胞能表达由所述基因编码的多肽，或者通过ZFN、Talen或CRISPR方法在所关注的基因中产生缺失。本发明的重组多核苷酸包括尚未与其所存在的基于细胞或无细胞的表达系统的其他组分分离的多核苷酸，以及在所述基于细胞或无细胞的系统中产生、随后从至少某些其他组分中纯化的多核苷酸。多核苷酸可以是核苷酸的连续延伸(contiguousstretch)，或者包含来自不同来源(天然存在的和/或合成的)的接合形成单个多核苷酸的核苷酸的两个或更多个连续延伸。通常，这类嵌合多核苷酸包含至少一个编码本发明的多肽的开放阅读框，其可操纵地连接至适合驱动该开放阅读框在所关注的细胞中转录的启动子。关于所定义的多核苷酸，应当理解高于上文所提供的那些值的％相同性数字会涵盖优选的实施方案。因此，当适用时，根据最小％相同性数字，优选多核苷酸包含与相关指定的SEQIDNO至少60％，更优选至少65％，更优选至少70％，更优选至少75％，更优选至少80％，更优选至少85％，更优选至少90％，更优选至少91％，更优选至少92％，更优选至少93％，更优选至少94％，更优选至少95％，更优选至少96％，更优选至少97％，更优选至少98％，更优选至少99％，更优选至少99.1％，更优选至少99.2％，更优选至少99.3％，更优选至少99.4％，更优选至少99.5％，更优选至少99.6％，更优选至少99.7％，更优选至少99.8％，以及甚至更优选99.9％相同的多核苷酸。本发明的多核苷酸或可用于本发明的多核苷酸可以在严格条件下选择性地杂交至本文所定义的多核苷酸。如本文所用，严格条件是以下那些：(1)在42℃下在杂交期间采用诸如甲酰胺的变性剂，例如50％(v/v)甲酰胺与0.1％(w/v)牛血清白蛋白、0.1％Ficoll、0.1％聚乙烯吡咯烷酮、含750mMNaCl、75mM柠檬酸钠的50mM磷酸钠缓冲液(pH6.5)；或者(2)在42℃下在0.2xSSC和0.1％SDS中采用50％甲酰胺、5xSSC(0.75MNaCl、0.075M柠檬酸钠)、50mM磷酸钠(pH6.8)、0.1％焦磷酸钠、5xDenhardt溶液、超声处理的鲑精DNA(50g/ml)、0.1％SDS和10％硫酸葡聚糖；和/或(3)在50℃下采用低离子强度和高温进行洗涤，例如0.015MNaCl/0.0015M柠檬酸钠/0.1％SDS。本发明的多核苷酸当与天然存在的分子相比时可以具有一个或多个突变，它们为核苷酸残基的缺失、插入或取代。相对于参考序列，具有突变的多核苷酸可以是天然存在的(也就是说，从天然来源中分离)或合成的(例如，通过对如上所述的核酸进行位点定向诱变或DNA改组)。减少基因表达的多核苷酸RNA干扰RNA干扰(RNAi)对于特异性地减少基因表达特别有用，如果所述基因编码蛋白，这导致特定蛋白的产生减少。虽然不希望用理论来进行局限，Waterhouse等(1998)已经提供了dsRNA(二倍体RNA)可用于减少蛋白产生的机制的模型。这个技术依赖于包含与所关注的基因的mRNA或其部分基本上相同的序列的dsRNA分子的存在。方便地，所述dsRNA可以从重组载体或宿主细胞中的单个启动子产生，其中正义和反义序列旁侧有不相关的序列使得所述正义和反义序列能够杂交以形成dsRNA分子，其中不相关的序列形成结构。合适的dsRNA分子的设计和产生是本领域技术人员能力范围之内的，特别是参考Waterhouseetal.(1998)，Smithetal.(2000)、WO99/32619、WO99/53050、WO99/49029和WO01/34815。在一实例中，引入DNA指导至少部分双链RNA产物(与待失活的靶基因有同源性)的合成，例如SDP1、TGD、质体GPAT、质体LPAAT、质体PAP、AGPase基因。因此该DNA包含正义和反义序列，这二者在转录为RNA时，可以杂交以形成双链RNA区。在本发明的一实施方案中，正义和反义序列被间隔区分开，所述间隔区包含内含子，该内含子在转录为RNA时被剪切掉。此安排已经显示出导致更高效率的基因沉默(Smithetal.，2000)。双链区可以包含一个或两个RNA分子，其转录自一个DNA区或两个。据认为双链分子的存在引发内源系统的应答，破坏双链RNA以及来自靶基因的同源RNA转录物，有效降低或消除靶基因的活性。杂交的正义和反义序列的长度每个均应为至少19个连续的核苷酸，优选至少50个连续的核苷酸，更优选至少100个或至少200个连续的核苷酸。一般来说，使用对应于靶基因mRNA区域的100-1000个核苷酸的序列。可以使用对应于整个基因转录物的全长序列。正义序列与靶转录物的相同性程度(因此还有反义序列与靶转录物的补体的相同性)应为至少85％、至少90％或至少95-100％。所述RNA分子当然可以包含不相关的序列，其可发挥作用以稳定该分子。所述RNA分子可以在RNA聚合酶II或RNA聚合酶III启动子的控制下表达。后者的实例包括tRNA或snRNA启动子。优选的小干扰RNA(″siRNA″)分子包含与靶mRNA的大约19-21个连续核苷酸相同的核苷酸序列。优选地，所述siRNA序列以双核苷酸AA起始，包含约30-70％的GC含量(优选30-60％，更优选40-60％以及更优选约45％-55％)，并且与所要引入的生物体基因组中除靶标之外的任何核苷酸序列不具有高百分比相同性，例如，通过标准的BLAST搜索确定。微RNA微RNA(缩写为miRNA)一般是19-25个核苷酸(在植物中通常为约20-24个核苷酸)的非编码RNA分子，其衍生自更大的前体(形成不完美的茎-环结构)。miRNA结合至靶信使RNA转录物(mRNA)上的互补序列，通常导致翻译阻抑或者靶标降解和基因沉默。如本领域公知的，可以基于天然miRNA设计人工miRNA(amiRNA)用于减少所关注的任何基因的表达。在植物细胞中，据认为miRNA前体分子在细胞核中进行大规模加工。pri-miRNA(包含一个或多个局部双链或“发夹”区以及mRNA通常的5′″帽″和多腺苷酸化尾巴)被加工为较短的miRNA前体分子(也包括茎-环或反折叠(fold-back)结构且被命名为″pre-miRNA″)。在植物中，pre-miRNA由独特的DICER样(DCL)酶切割，产生miRNA：miRNA*二倍体。在转移出细胞核之前，这些二倍体被甲基化。在细胞质中，来自所述miRNA：miRNA二倍体的miRNA链被选择性地加入到有活性的RNA-诱导沉默复合物(RISC)中用于靶标识别。该RISC-复合物包含特定子集的Argonaute蛋白，其发挥序列特异性基因压制作用(参见，例如，MillarandWaterhouse，2005；Pasquinelli等，2005；AlmeidaandAllshire，2005)。共抑制基因可以阻抑相关内源基因和/或已存在于基因组中的转基因的表达，称作同源性依赖性基因沉默的现象。同源性依赖性基因沉默的大部分的情况分为两类——在转基因的转录水平发挥作用的那些，以及在转录后运作的那些。转录后同源性依赖性基因沉默(即，共抑制)描述的是转基因植物中转基因和相关的内源或病毒基因表达的丧失。共抑制通常(但并不总是)在转基因转录物丰富的时候发生，并且通常认为其在mRNA加工、定位和/或降解的水平触发。已存在若干模型以解释共抑制如何发挥作用(参见Taylor，1997)。共抑制包括将额外拷贝的基因或其片段以针对用于其表达的启动子而言有义的方向引入植物中。本领域技术人员可以确定正义片段的大小，其与靶基因区的对应性、以及其与靶基因的序列相同性程度。在某些情况下，基因序列的额外拷贝干扰靶植物基因的表达。对于共抑制方法的实施，参考WO97/20936和EP0465572。反义多核苷酸术语“反义多核苷酸″应当理解为表示DNA或RNA分子，其至少与编码内源多肽的特定mRNA分子的一部分互补，并且能够干扰转录后的事件如mRNA的翻译。反义方法的使用是本领域公知的(参见例如，G.HartmannandS.Endres，ManualofAntisenseMethodology，Kluwer(1999))。反义技术在植物中的使用已经由Bourque(1995)和Senior(1998)进行了综述。Bourque(1995)列举了如何在植物体系中使用反义序列作为失活方法的大量实例。Bourque还提到了，可能并不必需要达成任何酶活性的100％抑制，因为部分抑制已经可以导致体系中可测量的变化。Senior(1998)提到了，反义方法现在是用于操控基因表达的很成熟的技术。在一实施方案中，反义多核苷酸在生理条件下杂交，即，反义多核苷酸(其为全部或部分单链)至少能够在细胞中的正常条件下与编码多肽的mRNA(例如，SDP1、TGD、质体GPAT、质体LPAAT、质体PAP或AGPasemRNA)形成双链多核苷酸。反义分子可以包括对应于结构基因的序列或者用于实现针对基因表达或沉默事件的控制的序列。例如，反义序列可以对应于内源基因的靶向编码区、或者5′-非翻译区(UTR)或3′-UTR或者这些的组合。其可以与内含子序列(可以在转录期间或转录后被剪掉)部分互补，优选仅与靶基因的外显子序列互补。考虑到一般非常多样的UTR，靶向这些区域提供了基因抑制的更高特异性。反义序列的长度应当为至少19个连续核苷酸，优选至少50个核苷酸，并且更优选至少100、200、500或1000个核苷酸。可以使用与整个基因转录物互补的全长序列。长度最优选为100-2000个核苷酸。反义序列与靶标转录物的相同性程度应当为至少90％，并且更优选95-100％。反义RNA分子当然可以包含不相关的序列，其可发挥作用以稳定该分子。重组载体本发明的一实施方案包括重组载体，其包含本文所定义的至少一种多核苷酸并能够将该多核苷酸递送入宿主细胞。重组载体包括表达载体。重组载体包含异源多核苷酸序列，即，天然不与本文所定义的多核苷酸相邻的多核苷酸序列，优选地，源自不同的物种。载体可以是RNA或DNA，并且通常为病毒载体、衍生自病毒、或为质粒。质粒载体通常包含附加的核酸序列，以便于在原核细胞中表达盒的选择、扩增和转化，例如，pUC衍生的载体、pGEM衍生的载体或者包含一个或多个T-DNA区域的二元载体。附加的核酸序列包括复制起点(提供载体的自主复制)，优选编码抗生素或除草剂抗性的选择标记基因，提供多个位点以插入核酸构建体中编码的核酸序列或基因的独特的多克隆位点，以及增强原核和真核(特别是植物)细胞转化的序列。如本文所用的“可操纵地连接”是指两个或更多个核酸(例如，DNA)片段之间的功能关系。通常，是指转录序列的转录调控元件(启动子)的功能关系。例如，将启动子可操纵地连接至本文所定义的多核苷酸的编码序列，如果它在合适的细胞中刺激或调节该编码序列的转录。一般来说，可操作地连接至转录序列的启动子转录调控元件与转录序列在物理上是连续的，即它们是顺式作用的。但是，一些转录调控元件如增强子不必与其增强转录的编码序列在物理上连续或靠近编码序列。当存在多个启动子时，每个启动子可以独立地为相同的或不同的。重组载体还可以包含一个或多个信号肽序列以使得本文所定义的表达多肽保持在细胞中的内质网(ER)中，或者转移至质粒中和/或包含融合序列，其导致核酸分子作为融合蛋白表达。合适的信号片段的实例包括能够引导本文所定义的多肽分泌或定位的任何信号片段。为了有利于鉴定转化体，重组载体有利地包含选择或筛选标记基因。“标记基因”表示使表达该标记基因的细胞具有不同的表型并因此允许将此类转化细胞与没有该标记的细胞进行区分的基因。选择标记基因赋予一种性状，可以根据对选择剂(如，除草剂、抗生素)的抗性对其加以“选择”。筛选标记基因(或报告基因)赋予可以通过观察或测试，即，通过“筛选”进行鉴定的性状(例如，不存在于未转化的细胞中的β-葡糖醛酸酶、荧光素酶、GFP或其他酶活性)。选择植物转化体的示例性选择标记包括但不限于：编码潮霉素B抗性的hyg基因；赋予卡那霉素、巴龙霉素抗性的新霉素磷酸转移酶(nptII)基因；赋予谷胱甘肽源除草剂抗性的来自大鼠肝脏的谷胱甘肽-S-转移酶基因，例如，EP256223中所述；过量表达时赋予谷氨酰胺合成酶抑制剂(诸如草胺膦)抗性的谷氨酰胺合成酶基因，例如，WO87/05327中所述；赋予选择剂草胺膦抗性的来自绿色产色链霉菌(Streptomycesviridochromogenes)的乙酰基转移酶基因，例如，EP275957中所述；编码赋予草双甘膦耐性的5-烯醇式丙酮酸莽草酸-3-磷酸合成酶(EPSPS)的基因，例如，Hincheeetal.(1988)所述；赋予双丙氨磷抗性的bar基因，例如，WO91/02071中所述；赋予溴苯腈抗性的来自臭鼻克雷伯氏菌(Klebsiellaozaenae)的腈水解酶基因，如bxn(Stalkeretal.，1988)；赋予甲氨蝶呤抗性的二氢叶酸还原酶(DHFR)基因(Thilletetal.，1988)；赋予咪唑啉酮类、磺酰脲类或其他ALS抑制性化学剂的突变乙酰乳酸合酶基因(ALS)(EP154,204)；赋予5-甲基色氨酸抗性的突变邻氨基苯甲酸合成酶基因；或者赋予除草剂抗性的茅草枯脱卤素酶基因。优选地，重组载体稳定地整合至细胞如植物细胞的基因组中。因此，重组载体可以包含允许载体整合至细胞的基因组或染色体中的合适元件。表达载体如本文所用，“表达载体”是能够转化宿主细胞并实现一种或多种指定多核苷酸表达的DNA载体。本发明的表达载体包含调控序列如转录控制序列、翻译控制序列、复制起点以及与宿主细胞相容并控制本发明的多核苷酸表达的其他调控序列。具体地讲，本发明的表达载体包括转录控制序列。转录控制序列是控制转录的起始、延伸和终止的序列。特别重要的转录控制序列是控制起始的那些转录控制序列，例如启动子、增强子、操纵子和阻遏子序列。所用调控序列的选择取决于所关注的目标生物如植物和/或目标器官或组织。这类调控序列可以获得自任何真核生物如植物或植物病毒，或者可以化学合成。许多适合植物细胞稳定转染或适合建立转基因植物的载体已在例如Pouwelsetal.，CloningVectors：ALaboratoryManual，1985，supp.1987，WeissbachandWeissbach，MethodsforPlantMolecularBiology，AcademicPress，1989，和Gelvinetal.，PlantMolecularBiologyManual，KluwerAcademicPublishers，1990中有所描述。通常，植物表达载体包含例如受5′和3′调控序列的转录控制的一个或多个克隆植物基因以及显性选择标记。这类植物表达载体还可以包含启动子调控区域(例如，控制诱导或组成型、受环境或发育调控的、或者细胞或组织特异性表达的调控区域)、转录起始位点、核糖体结合位点、转录终止位点和/或多腺苷酸化信号。许多在植物细胞中具有活性的组成型启动子已得到了描述。在植物中组成型表达的合适启动子包括但不限于：花椰菜花叶病毒(CaMV)35S启动子、玄参花叶病毒(FMV)35S、来自核酮糖-1，5-双-磷酸羧化酶小亚基(SSU)的光诱导型启动子、水稻细胞溶质丙糖磷酸异构酶启动子、拟南芥腺嘌呤磷酸核糖转移酶启动子、水稻肌动蛋白1基因启动子、甘露氨酸合酶和章鱼碱合酶启动子、Adh启动子、蔗糖合酶启动子、R基因复合启动子以及叶绿素α/β结合蛋白基因启动子。这些启动子已用于构建已在植物中表达的DNA载体，参见例如WO84/02913。所有这些启动子已用于构建各种类型的植物表达性重组DNA载体。为了在植物的源组织如叶、根或茎中表达，优选的是，用于本发明的启动子在这些特定组织中具有相对高的表达。为此，可以针对具有组织或细胞特异性表达或增强表达的基因选择多种启动子。在文献中报导的这类启动子的实例包括：来自豌豆的叶绿体谷氨酰胺合成酶GS2启动子、来自小麦的叶绿体果糖-1，6-二磷酸酶启动子、来自马铃薯的核光合作用ST-LSl启动子、来自拟南芥的丝氨酸/苏氨酸激酶启动子和葡萄糖淀粉酶(CHS)启动子。还报导在光合有效组织中具有活性的是来自北美落叶松(Larixlaricina)的核酮糖-1，5-二磷酸羧化酶启动子，来自松树的Cab基因Cab6的启动子，来自小麦的Cab-1基因的启动子，来自菠菜的Cab-1基因的启动子，来自水稻的Cab1R基因的启动子，来自玉米的丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)启动子，烟草Lhcb1*2基因的启动子；拟南芥Suc2蔗糖-H30同向转运启动子，以及来自菠菜的类囊体膜蛋白基因的启动子(Psad、PsaF、PsaE、PC、FNR、AtpC、AtpD、Cab、RbcS)。叶绿素α/β-结合蛋白的其他启动子也可以用于本发明，如来自白芥(Sinapisalba)的LhcB基因和PsbP基因的启动子。响应环境、激素、化学和/或发育信号而调控的多种植物基因启动子也可以用于在植物细胞中表达RNA结合蛋白基因，包括受以下因素调控的启动子：(1)热；(2)光(例如，豌豆RbcS-3A启动子、玉米RbcS启动子)；(3)激素，如脱落酸；(4)创伤(例如，WunI)；或者(5)化学剂，如茉莉酸甲酯、水杨酸、甾类激素、醇、安全剂(WO97/06269)，或者也可以有利地采用(6)器官特异性启动子。如本文所用，术语“植物贮藏器官特异性启动子”是指当与其他植物组织相比时优先指导植物贮藏器官中的基因转录的启动子。为了在植物的库组织中表达，如马铃薯植物的块茎、番茄的果实或者大豆、油菜、棉花、玉米、小麦、水稻和大麦的种子，优选的是，用于本发明的启动子在这些特定组织中具有相对高的表达。可以使用β-伴球蛋白的启动子或其他种子特异性启动子，如欧洲油菜蛋白(napin)、玉米蛋白、核丝(1inin)和菜豆蛋白启动子。还可以使用根特异性启动子。这样的启动子的实例为酸性几丁质酶基因的启动子。根组织中的表达还可以通过利用已得到鉴定的CaMV35S启动子的根特异性亚结构域来实现。在一特别优选的实施方案中，启动子指导其中发生脂质生物合成的组织和器官中的表达。这类启动子可以在合适的时间作用于种子发育以改变种子中的脂质组成。种子特异性表达的优选启动子包括：1)来自编码参与种子中的脂质生物合成和积聚的酶(如去饱和酶和延长酶)的基因的启动子；2)来自编码种子贮藏蛋白的基因的启动子；以及3)来自编码参与种子中的碳水化合物生物合成和积聚的酶的基因的启动子。合适的种子特异性启动子为：油料种子油菜napin基因启动子(US5,608,152)、蚕豆(Viciafaba)USP启动子(Baumleinetal.，1991)、拟南芥油质蛋白启动子(WO98/45461)、菜豆蛋白启动子(US5,504,200)、芸苔Bce4启动子(WO91/13980)或豆球蛋白B4启动子(Baumlein等，1992)以及导致单子叶植物如玉米、大麦、小麦、裸麦、水稻等种子特异性表达的启动子。值得注意的合适启动子为大麦1pt2或1pt1基因启动子(WO95/15389和WO95/23230)或者WO99/16890中所述的启动子(来自大麦醇溶蛋白基因、水稻谷蛋白基因、水稻素(oryzin)基因、水稻醇溶蛋白基因、小麦醇溶蛋白基因、小麦谷蛋白基因、玉米醇溶蛋白基因、燕麦谷蛋白基因、高粱醇溶蛋白基因、黑麦醇溶蛋白基因的启动子)。其他启动子包括Brounetal.(1998)、Potenzaetal.(2004)、US20070192902和US20030159173所述的那些。在一实施方案中，种子特异性启动子优先在种子的限定部分如子叶或胚乳中表达。子叶特异性启动子的实例包括但不限于：FP1启动子(Ellerstrometal.，1996)、豌豆豆球蛋白启动子(Perrinetal.，2000)和菜豆植物凝集素启动子(Perrinetal.，2000)。胚乳特异性启动子的实例包括但不限于：玉米醇溶蛋白-1启动子(Chikwambaetal.，2003)、水稻谷蛋白-1启动子(Yangetal.，2003)、大麦D-醇溶蛋白启动子(Horvathetal.，2000)和小麦HMW谷蛋白启动子(Alvarezetal.，2000)。在进一步的实施方案中，种子特异性启动子在胚芽中和/或种子发芽后不表达或仅以低水平表达。在另一实施方案中，植物贮藏器官特异性启动子为果实特异性启动子。实例包括但不限于番茄聚半乳糖醛酸酶、E8和Pds启动子以及苹果ACC氧化酶启动子(有关综述，参见Potenzaetal.，2004)。在一优选实施方案中，相对于果皮或果实内的种子，启动子优先指导果实可食用部分(例如果髓)中的表达。在一实施方案中，可诱导启动子是构巢曲霉(Aspergillusnidulans)alc体系。可用于替代构巢曲霉alc体系的可诱导表达体系的实例在Padidam(2003)和CorradoandKarali(2009)的综述中有描述。在另一实施方案中，可诱导启动子是安全剂(safener)可诱导启动子，例如，玉米ln2-1或ln2-2启动子(HersheyandStoner，1991)，安全剂可诱导启动子是玉米GST-27启动子(Jepsonetal.，1994)，或大豆GH2/4启动子(Ulmasovetal.，1995)。在另一实施方案中，可诱导启动子是衰老诱导启动子，例如，来自拟南芥的衰老诱导启动子SAG(衰老相关基因)12和SAG13(Gan，1995；GanandArnasino，1995)和来自欧洲油菜的LSC54(Buchanan-Wollaston，1994)。这类启动子在植物组织(特别是叶)的衰老发生时表现出增加的表达。对于在营养性组织中的表达，可以使用叶特异性启动子，如核酮糖二磷酸羧化酶(RBCS)启动子。例如，番茄RBCS1、RBCS2和RBCS3A基因在叶和光生长的幼苗中表达(Meieretal.，1997)。可以使用几乎仅在叶片和叶稍中的叶肉细胞内高水平表达的核酮糖二磷酸羧化酶启动子，如Matsuokaetal.(1994)所述。另一种叶特异性启动子是光收获叶绿素a/b结合蛋白基因启动子(参见，Shiinaetal.，1997)。Lietal.(1996)所描述的拟南芥myb相关基因启动子(Atmyb5)是叶特异性的。所述Atmyb5启动子在发育中的叶表皮毛、托叶、以及幼年莲座叶和茎生叶的边缘上的表皮细胞、以及未成熟的种子中表达。还可以使用由Busketal.(1997)在玉米中鉴别的叶启动子。在某些情况下，例如当重组表达LEC2或BBM时，可能会期望转基因不以高水平表达。可以用于这类情况的启动子的实例是截短的芸苔素A启动子，其保留了种子特异性表达模式但却处于降低的表达水平(Tanetal.，2011)。5′非翻译前导序列可以衍生自所选的启动子以表达本发明的多核苷酸的异源基因序列，或者可以相对于待产生的酶的编码区是异源的，并且可以根据需要进行特定修饰以便增强mRNA的翻译。有关优化转基因表达的综述，参见Kozieletal.(1996)。5′非翻译区还可以获得自植物病毒RNA(烟草花叶病毒、烟草蚀纹病毒、玉米矮小花叶病毒、苜蓿花叶病毒等)，来自合适的真核基因、植物基因(小麦和玉米叶绿素a/b结合蛋白基因前导序列)或来自合成的基因序列。本发明不限于其中非翻译区衍生自伴随启动子序列的5′非翻译序列的构建体。前导序列还可以衍生自无关启动子或编码序列。可用于本发明背景的前导序列包含玉米Hsp70前导序列(US5,362,865和US5,859,347)以及TMVω元件。转录的终止通过在表达载体中可操纵地连接至所关注的多核苷酸的3′非翻译DNA序列而完成。重组DNA分子的3′非翻译区包含在植物中作用以使腺苷酸核苷酸加成至RNA的3′端的多腺苷酸化信号。3′非翻译区可以获得自在植物细胞中表达的多种基因。胭脂碱合酶3′非翻译区、来自豌豆小亚基Rubisco基因的3′非翻译区、来自大豆7S种子贮藏蛋白基因的3′非翻译区常用于此能力。包含农杆菌属(Agrobacterium)肿瘤诱导(Ti)质粒基因的多腺苷酸化信号的3′转录非翻译区也是合适的。重组DNA技术可以用来通过操纵例如通过根据宿主细胞物种密码子优化来翻译所得转录物的效率、或者使转录物不稳定的序列的缺失以及翻译后修饰的效率来提高转化的多核苷酸的表达。转移核酸转移核酸可以用于将外源多核苷酸递送到细胞，并且包含一个、优选两个边界序列以及一个或多个所关注的多核苷酸。转移核酸可以或可以不编码选择标记。优选地，转移核酸在细菌中形成二元载体的一部分，其中该二元载体进一步包含这样的元件，它们允许载体在细菌中复制、选择或维持包含该二元载体的细菌细胞。转移至真核细胞后，二元载体的转移核酸组分能够整合至真核细胞的基因组中，或者对于瞬时表达实验，仅能够在细胞中表达。如本文所用，术语“染色体外转移核酸”是指能够从细菌如农杆菌属(Agrobacteriumsp.)转移至真核细胞如植物叶细胞的核酸分子。染色体外转移核酸是一种遗传元件，它作为能够转移随后将其边界内所含的核苷酸序列整合至受体细胞基因组中的元件而广为人知。在这方面，转移核酸的侧翼通常为两个“边界”序列，但在某些情况下，可以使用一个末端的单个边界，而转移核酸的第二末端则在转移过程中随机生成。所关注的多核苷酸通常位于转移核酸的左边界样序列与右边界样序列之间。转移核酸内所含的多核苷酸可以可操作地连接至多种不同的有利于其表达(即，多核苷酸的转录和/或翻译)的启动子和终止子调控元件。来自农杆菌属如根癌农杆菌或发根农杆菌(Agrobacteriumrhizogenes)的转移DNA(T-DNA)及其人造变体/突变体可能是转移核酸中研究最为透彻的实例。另一实例是来自植物的包含T-DNA边界样序列的P-DNA(“植物DNA”)。如本文所用，″T-DNA″是指根癌农杆菌Ti质粒或发根农杆菌Ri质粒的T-DNA，或者其功能为将DNA转移至植物细胞中的变体。T-DNA可以包括同时包含左右边界序列的整个T-DNA，但只需要包含转移所需的顺式最小序列，即右侧T-DNA边界序列。本发明的T-DNA已插入它们之间，位于左右侧边界序列(如果存在)之间的任何位置，所关注的多核苷酸。编码将T-DNA转移至植物细胞中所需的因子的反式序列如vir基因可以插入T-DNA，或者可以存在于与T-DNA相同的复制子上，或优选地以反式存在于农杆菌宿主的相容复制子上。这类“二元载体系统”是本领域公知的。如本文所用，″P-DNA″是指从植物基因组分离的转移核酸或其人造变体/突变体，并在每个末端或只在一个末端包含T-DNA边界样序列。如本文所用，转移核酸的“边界”序列可以从所选的生物如植物或细菌中分离，或者可以为其人造变体/突变体。边界序列促进并有利于其所连接的多核苷酸的转移，并且可以有利于其在受体细胞基因组中的整合。在一实施方案中，边界序列的长度为10-80bp。来自农杆菌属的T-DNA的边界序列在本领域中是公知的，并且包括Lacroixetal.(2008)中描述的那些。虽然在传统上仅使用农杆菌属将基因转移到植物细胞，但是现今已鉴定/开发了大量的系统可按类似于农杆菌属的方式发挥作用。最近已对几种非农杆菌属物种遗传修饰，从而能够用于基因转移(Chungetal.，2006；Broothaertsetal.，2005)。它们包括根瘤菌属(Rhizobiumsp.)NGR234、苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobiummeliloti)和百脉根中慢生根瘤菌(Mezorhizobiumloti)。在几十年前，通过哺乳动物细胞与携带质粒的大肠杆菌(Escherichiacoli)的原生质体的融合，首次实现了真核表达质粒从细菌到真核宿主的直接转移(Schaffner，1980)。从那时起，能够将基因递送入哺乳动物细胞的细菌数量稳定增长(Weiss，2003)，由四个小组独立地发现(Sizemoreetal.1995；Courvalinetal.，1995；Powelletal.，1996；Darjietal.，1997)。如本文所用，术语“转染”、“转化”及其变化通常可互换使用。“转染的”或“转化的”细胞可以经过操纵引入所关注的多核苷酸，或者可以是由其衍生的子代细胞。重组细胞本发明还提供重组细胞，例如，重组植物细胞或真菌细胞，其为通过本文所定义的一种或多种多核苷酸或载体或者它们的组合转化的宿主细胞。本发明的合适细胞包括可以通过编码本文所述的RNA、多肽或酶的本发明多核苷酸或重组载体转化的任何细胞。所述细胞是因此能够用于生产脂质的细胞。重组细胞可以是培养中的细胞、体外或生物体(例如植物)中或器官(例如种子或叶)中的细胞。优选地，细胞在植物中，更优选在植物的种子中。在一实施方案中，所述重组细胞是非人细胞。向其中引入多核苷酸的宿主细胞可以是非转化细胞或已通过至少一种核酸转化的细胞。这类核酸可以与脂质合成相关或不相关。本发明的宿主细胞可以内源性地(即，天然地)能够产生本文所定义的多肽，在此情况下，由其衍生的重组细胞具有增强的产生所述多肽的能力，或者可以仅在用本发明的至少一种多核苷酸转化后才能产生所述多肽。在一实施方案中，本发明的重组细胞具有增强的产生非极性脂质如TAG的能力。本发明的宿主细胞可以是能够产生至少一种本文所述的蛋白的任何细胞，并且包括真菌(包括酵母)、动物如节肢动物和植物细胞如藻类细胞。在一优选实施方案中，植物细胞为种子细胞，具体地讲，为种子子叶或胚乳中的细胞。宿主细胞可以是适合发酵过程的生物体的细胞，例如，解脂耶氏酵母(Yarrowialipolytica)和其他酵母。在一实施方案中，细胞为动物细胞。动物细胞可以为任何类型的动物细胞，例如非人动物细胞、非人脊椎动物细胞、非人哺乳动物细胞或水生动物细胞，如鱼或甲壳纲动物、无脊椎动物、昆虫等。可用作本发明宿主细胞的藻类细胞的实例包括例如衣藻属(Chlamydomonassp.)(例如莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii))、杜氏藻属(Dunaliellasp.)、红球藻属(Haematococcussp.)、小球藻属(Chlorellasp.)、破囊壶菌属(Thraustochytriumsp.)、裂殖壶菌属(Schizochytriumsp.)和团藻属(Volvoxsp.)。转基因植物本发明还提供包含本发明的一种或多种外源多核苷酸或多肽以及一种或多种遗传修饰、本发明的细胞、本发明的载体或者它们的组合的植物。当用作名词时，术语“植物”是指整个植株，而术语“其部分”是指植物器官(例如，叶、茎干、根部、花朵、果实)、单个细胞(例如，花粉)、种子、种子部分(如胚芽、胚乳、盾片或种皮)、植物组织(如脉管组织)、植物细胞及其子代。如本文所用，植物部分包括植物细胞。如本文所用，术语“在植物中”和“在所述植物中”在对植物的修饰的上下文中表示修饰已发生在至少一部分的植物中，包括修饰已发生在整个植物中，并且不排除修饰仅发生在植物的一部分或多个部分但不是全部部分中。例如，据说组织特异性启动子“在植物中”表达，即使其可能仅在植物的某些部分中表达。类似地，“增加植物中的一种或多种糖酵解和/或脂肪酸生物合成基因表达的转录因子多肽”表示增加的表达发生在至少一部分植物中。如本文所用，术语“植物”以其最广泛的含义使用，包括植物界中的任何生物。其还包括红藻和褐藻以及绿藻。其包括但不限于开花植物、草、农作物或谷类(如油料种子、玉米、大豆)、秣料或草料、水果或蔬菜植物、草药植物、木本植物或树的任何物种。这不表示将植物限制到任何特定的结构。它还指单细胞植物(例如，微藻)。关于植物的术语“其部分”是指植物细胞及其子代，多个植物细胞、在植物发育的任何阶段存在的结构、或者植物组织。这类结构包括但不限于叶、茎、花朵、果实、坚果、根部、种子、种皮、胚芽。术语“植物组织”包括植物的分化和未分化组织，包括存在于叶、茎、花朵、果实、坚果、根部、种子中的那些，例如胚芽组织、胚乳、皮组织(例如，表皮、周皮)、脉管组织(例如，木质部、韧皮部)或基本组织(包括薄壁组织、厚角组织和/或厚壁组织细胞)以及培养中的细胞(例如，单细胞、原生质体、愈伤组织、胚芽等)。植物组织可以在原位，在器官培养、组织培养或细胞培养中。如本文所用，术语“营养组织”或“营养性植物部分”是除植物的有性生殖器官以外的任何植物组织、器官或部分。植物的有性生殖器官具体是包含种子的器官、花朵、花粉、果实和种子。营养组织和部分包括至少植物叶、茎(包括蓊(bolt)和蘖(tiller)但不包括穗(head))、块茎和根部，但是不包括花、花粉、种子(包括种皮、胚芽和胚乳)、果实(包括中果皮)、携有种子的荚(pod)和携有种子的穗。在一实施方案中，植物的营养性部分是地表植物部分。在另一或进一步的实施方案中，营养性植物部分是绿色部分如叶或茎。“转基因植物”或其变化是指包含不存在于相同物种、品种或品系的野生型植物中的转基因的植物。在本发明背景下定义的转基因植物包括使用重组技术进行遗传修饰以导致在所需的植物或其部分中产生本文所定义的至少一种多肽的植物及其子代。转基因植物部分具有相应的含义。术语“种子”和“谷粒”在本文中可互换使用。“谷粒”是指成熟的谷粒，如收获的谷粒或仍在植物上但已准备收获的谷粒，但根据上下文还可以指吸胀或发芽后的谷粒。成熟的谷粒通常具有低于约18％的水分含量。在一优选实施方案中，谷粒的水分含量处于一般认为是对储藏安全的水平，优选5％-15％、6％-8％、8％-10％、或10％-15％。如本文所用的“发育中的种子”是指成熟前的种子，通常存在于受精或开花后的植物生殖结构中，但也可以指从植物中分离的成熟前的此类种子。成熟的种子通常具有低于约12％的水分含量。如本文所用，术语“植物贮藏器官”是指特化以贮藏例如蛋白质、碳水化合物、脂质形式的能量的植物部分。植物贮藏器官的实例为种子、果实、块状根和块茎。本发明的优选植物贮藏器官为种子。如本文所用，术语“表型正常的”是指遗传修饰的植物或其部分，例如转基因植物，或者贮藏器官如本发明的种子、块茎或果实，它们与未修饰的植物或其部分相比时生长和繁殖能力无明显降低。优选地，当在相同条件下生长时，产生的生物质、生长速度、发芽率、贮藏器官大小、种子大小和/或活种子的数量不少于缺少所述遗传修饰或外源多核苷酸的植物的90％。这个术语不涵盖可能不同于野生型植物但不影响植物对商业目的的有用性的植物特性，例如，幼苗叶的芭蕾表型(ballerinaphenotype)。在一实施方案中，表型正常的遗传修饰的植物或其部分包含编码可操作地连接至植物贮藏器官特异性启动子的沉默抑制子的重组多核苷酸，并且具有基本上与不含所述多核苷酸的相应植物或其部分相同的生长或繁殖能力。如本文所用，关于植物的术语“开始开花”或“起始开花”是指植物上的第一朵花打开的时间，或者开花发生的时间。如本文所用，关于包含种子的植物的术语“结籽”是指植物的第一个种子达到成熟的时间。本领域公知的，这通常可通过种子的颜色或其水分含量观察。如本文所用，关于整个植物的术语“衰老”是指生长完成之后的植物发育的最后阶段，通常在植物达到最大地表生物质或高度之后。当植物地表生物质达到其最大值并且量开始下降时衰老开始，并且一般以大部分植物组织的死亡结束。在这个阶段期间，植物将生长期间积累的来自叶和其他部分的细胞组分调动和回收至其他部分以完成其生殖发育。衰老是一个复杂的调节过程，其包括一些基因的新的或增加的基因表达。通常，一些植物部分衰老，同时相同植物的其他部分继续生长。因此，关于植物叶或其他绿色器官，如本文所用的术语“衰老”是指叶或器官中的叶绿素量开始减少的时间。衰老通常与叶或器官的干燥相关，主要在衰老的最后阶段。衰老通常可通过叶的颜色从绿色向黄色并且在完全干燥时最终至褐色的变化观察。据信细胞衰老是植物和器官衰老的基础。本发明提供的或设想用于实践本发明的植物既包括单子叶植物也包括双子叶植物。在优选的实施方案中，本发明的植物为农作物(例如，谷类和豆类、玉米、小麦、马铃薯、水稻、高粱、小米、木薯、大麦)或豆科植物如大豆、菜豆或豌豆。植物可以生长产生可食用的根部、块茎、叶、茎、花或果实。植物可以是其营养性部分用作食物的蔬菜植物。本发明的植物可以为：刺干椰、拟南芥、花生、木鲁星果棕(murumuru)、星实棕榈(tucuma)、Attaleageraensis(Indaia-rateiro)、Attaleahumilis(美洲油棕)、Attaleaoleifera(andaia)、Attaleaphalerata(uricuri)、Attaleaspeciosa(babassu)、燕麦、甜菜、芸苔属如Brassicacarinata、芥菜、Brassicanapobrassica、欧洲油菜(油菜)、亚麻荠、大麻、红花、Caryocarbrasiliense(pequi)、椰子、海甘蓝、甜瓜、油棕(非洲棕榈)、大豆、陆地棉(棉花)、向日葵属如向日葵、大麦、麻风树、Joannesiaprinceps(araranut-tree)、浮萍属(duckweed)如青萍、Lemnadisperma、Lemnaecuadoriensis、膨胀浮萍、日本浮萍、浮萍、单脉萍、Lemnaobscura、稀脉萍、稀脉浮萍、Lemnatenera、吕藻、鳞根萍、Lemnavaldiviana、Lemnayungensis、奥蒂树(oiticica)、亚麻、羽扇豆、曲叶矛榈(曲叶矛榈)、摩帝椰子(inajapalm)、芒属如异源三倍体芒草奇岗和中国芒、烟草属(烟草)如红花烟草或本氏烟草、巴卡巴酒实棕(bacaba-do-azeite)、巴套阿酒实棕(pataua)、Oenocarpusdistichus(bacaba-de-leque)、稻属如水稻和光稃稻、柳枝稷、Paraqueibaparaensis(mari)、鳄梨、水黄皮(印度山毛榉)、毛果杨、蓖麻、甘蔗、芝麻、马铃薯、高粱属如两色高粱、高粱、大花可可、三叶草属、巴西针棕(巴西针棕)、小麦属(小麦)如小麦、玉米、紫花苜蓿(Medicagosativa)、黑麦(Secalecerale)、甜土豆(Lopmoeabatatus)、木薯(Manihotesculenta)、咖啡(Cofeaspp.)、凤梨(Ananacomosus)、合欢树(Citrusspp.)、可可(Theobromacacao)、茶(Camelliasenensis)、香蕉(Musaspp.)、鳄梨(Perseaamericana)、无花果(Ficuscasica)、番石榴(Psidiumguajava)、芒果(Mangiferindica)、橄榄(Oleaeuropaea)、番木瓜(Caricapapaya)、腰果(Anacardiumoccidentale)、夏威夷果(Macadamiaintergrifolia)和杏仁(Prunusamygdalus)。除了上文提到的那些，其他优选的植物包括C4草类植物如大须芒草(Andropogongerardi)、垂穗草(Boutelouacurtipendula)、细格兰马草(B.gracilis)、野牛草(Buchloedactyloides)、裂稃草(Schizachyriumscoparium)、印度草(Sorghastrumnutans)、曲折鼠尾粟(Sporoboluscryptandrus)；C3草类植物如加拿大披碱草(Elymuscanadensis)、豆科植物头状胡枝子(Lespedezacapitata)和Petalostemumvillosum、非禾本草本植物Asterazureus；以及木本植物如Quercusellipsoidalis和大果栎(Q.macrocarpa)。其它优选的植物包括C3草类植物。在一优选实施方案中，所述植物为被子植物。在一实施方案中，植物为油料种子(oilseed)植物，优选为油料种子作物植物。如本文所用，“油料种子植物”是用于从植物种子商业生产脂质的植物物种。油料种子植物可以是例如油菜籽(如油菜)、玉米、向日葵、红花、大豆、高粱、亚麻(亚麻籽)或甜菜。此外，油料种子植物可以是其他芸苔属植物、棉花、花生、罂粟、芜菁甘蓝、芥菜、蓖麻、芝麻、红花、麻风树或产坚果植物。植物可以在其果实中产生高水平的脂质，如橄榄、油棕或椰子。可以应用本发明的园艺植物为莴苣、菊苣或蔬菜类芸苔属植物，包括卷心菜、西兰花或花椰菜。本发明可应用于烟草、葫芦科植物、胡萝卜、草莓、番茄或胡椒。在一优选实施方案中，转基因植物对于已引入的每一个基因(转基因)为纯合的，使得其子代不发生所需表型的分离。转基因植物也可对于引入的转基因为杂合的，优选对于转基因为均匀杂合的，例如在通过杂交种子生长成的F1子代中。这类植物可以提供本领域熟知的多种优点如杂种优势。植物的转化转基因植物可以使用本领域已知的技术而产生，如通常在Slateretal.，PlantBiotechnology-TheGeneticManipulationofPlants，OxfordUniversityPress(2003)和ChristouandKlee，HandbookofPlantBiotechnology，JohnWileyandSons(2004)中所述的那些技术。如本文所用，术语“稳定转化”、“稳定转化的”及其变化是指多核苷酸整合到细胞基因组中使得它们在细胞分裂过程中转移到后代细胞而无需对它们的存在进行阳性选择。稳定的转化体或其子代可以通过本领域已知的任何方法进行选择，如对染色体DNA的Southern印迹或基因组DNA的原位杂交。农杆菌介导的转移是将基因引入植物细胞的广泛使用的系统，因为可以将DNA引入整个植物组织、植物器官或植物培养中的外植体中的细胞，从而瞬时表达或将DNA稳定整合到植物细胞基因组中。例如，可以使用花序浸渍法(植物中)。使用农杆菌介导的植物整合载体将DNA引入植物细胞在本领域是熟知的。待转移的DNA区域通过边界序列限定，并且通常将间插DNA(T-DNA)插入植物基因组中。这是首选的方法，原因在于基因转移的容易性和确定性。可用的加速方法包括例如微弹轰击法(microproiectilebombardment)等。将转化核酸分子递送至植物细胞的方法的一个实例为微弹轰击法。这种方法在Yangetal.，ParticleBombardmentTechnologyforGeneTransfer，OxfordPress，Oxford，England(1994)中进行了综述。非生物性粒子(微弹)可用核酸包被并通过推进力递送入细胞，例如未成熟胚的细胞。示例性粒子包括由钨、金、铂等构成的那些。在其他方法中，质粒可以稳定转化。针对在高等植物中进行质粒转化所公开的方法包括含有选择标记并通过同源重组将DNA靶向质粒基因组的DNA的粒子枪递送(US5,451,513、US5,545,818、US5,877,402、US5,932479和WO99/05265)。其他细胞转化方法也可以使用，并且包括但不限于通过将DNA直接转移入花粉、通过将DNA直接注射入植物的生殖器官或通过将DNA直接注射入未成熟胚的细胞然后通过干燥胚的再水合来将DNA引入植物。通过单个植物原生质体转化株或通过各种转化的外植体实现植物的再生、发育和培养在本领域是熟知的(Weissbachetal.，In：MethodsforPlantMolecularBiology，AcademicPress，SanDiego，Calif.，(1988))。这种再生和生长过程通常包括选择转化细胞、通过胚发育的通常阶段培养那些个体化细胞、通过生根苗阶段的步骤。使转基因胚和种子相似地再生。之后，将所得的转基因生根芽植入合适的生长培养基中，如土壤。包含异体外源基因的植物的发育或再生在本领域是熟知的。优选地，使再生的植物自花受粉以提供纯合的转基因植物。或者，将得自再生植物的花粉异花授粉到在农学上重要谱系的由种子长成的植物。反之，将得自这些重要谱系的植物的花粉用于对再生植物授粉。将本发明的包含所需多核苷酸的转基因植物用本领域技术人员熟知的方法进行培养。为了确认转基因在转基因细胞和植物中的存在，可使用本领域技术人员已知的方法进行聚合酶链反应(PCR)扩增或Southern印迹分析。可以根据产物性质按多种方式的任何一种检测转基因的表达产物，并且包括Northern印迹杂交、Western印迹和酶测定法。一旦得到转基因植物后，可以让它们生长以产生具有所需表型的植物组织或部分。可以收获植物组织或植物部分，和/或收集种子。种子可以用作长成其组织或部分具有所需特性的另外植物的来源。优选地，在非极性脂质的产量处于其最高时收获营养性植物部分。在一实施方案中，在大约开花的时间或开花已开始之后收获营养性植物部分。优选地，在大约衰老开始的时间收获植物部分，通常通过叶的变黄和干燥指示。使用农杆菌或其他转化方法形成的转基因植物通常在一条染色体上包含单个遗传基因座。这类转基因植物对于添加的基因可称为半合子的。更优选的是对于添加的基因为纯合的转基因植物，即包含两个添加的基因的转基因植物，一个基因位于染色体对的每条染色体上的相同基因座。纯合的转基因植物可以通过使半合子转基因植物自株传粉、使产生的其中一些种子发芽以及分析所得植物的所关注基因而获得。还应当了解，包含两个独立分离的外源基因或基因座的两种不同的转基因植物也可以异花授粉(配育)以产生包含两组基因或基因座的后代。合适的F1子代的自花受精可以产生对于两种外源基因或转座子为纯合的植物。还可以考虑亲本植株的回交以及与非转基因植物的异交，如营养繁殖。相似地，转基因植物可以与包含遗传修饰如突变基因的第二植物杂交，并且鉴定包含转基因和遗传修饰的子代。常用于不同性状和农作物的其他育种方法的描述可见于Fehr，In：BreedingMethodsforCultivarDevelopment，WilcoxJ.ed.，AmericanSocietyofAgronomy，MadisonWis.(1987)。TILLING在一实施方案中，TILLING(定向诱导基因组局部突变技术)可用于产生其中内源基因包含突变的植物，例如，编码SDP1或TGD多肽、质体GPAT、质体LPAAT、磷脂酸磷酸酶(PAP)或者它们中两种或更多种的组合的基因。在第一步中，通过以下方法在一组植物中诱导引入的突变如新的单一碱基对变化：用化学诱变剂处理种子(或花粉)，然后使植物生长到突变会稳定遗传的世代。提取DNA，并且从种群的所有成员保存种子，以形成可随时间反复获取的资源。对于TILLING测定，使用特异性内切核酸酶的异源双链方法可以用来检测单核苷酸多态性(SNP)。或者，来自诱变的植物池的DNA的下一代测序可以用来鉴定选择的基因中的突变体。通常，实现诱变的群体中1个突变体/1000株植物的突变频率。利用这种方法，可以筛选数千种植物以鉴定在基因组的任何基因或特定区域中具有单碱基变化以及小插入或缺失(1-30bp)的任何个体。TILLING进一步描述见SladeandKnauf(2005)和Henikoffetal.(2004)。除了实现突变的高效检测之外，高通量TILLING技术是检测自然多态性的理想选择。因此，通过与已知序列构建异源双链来探查未知的同源DNA可揭露多态位点的数量和位置。核苷酸变化以及小插入和缺失均进行鉴定，包括至少一些重复数多态性。这称为Ecotilling(Comaietal.，2004)。利用位点特异性核酸酶的基因组编辑基因组编辑使用工程化的核酸酶如RNA指导的DNA内切核酸酶或者由融合至非特异性DNA切割模块的序列特异性DNA结合结构域组成的核酸酶。这些工程化的核酸酶使得能够通过诱导靶向DNA双链断裂来进行高效和精确的遗传修饰，所述DNA双链断裂刺激细胞的内源细胞DNA修复机制以修复诱导的断裂。这类机制包括例如错误倾向的非同源末端连接(NHEJ)和同源性指导的修复(HDR)。在具有延长的同源臂的供体质粒的存在下，HDR可以导致引入单个或多个转基因以纠正或替换现有基因。在不存在供体质粒的情况下，NHEJ介导的修复获得引起基因破坏的靶标的小插入或缺失突变。可用于本发明的方法的工程化的核酸酶包括锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样(TAL)效应子核酸酶(TALEN)和CRISPR/Cas9型核酸酶。通常通过质粒DNA、病毒载体或体外转录的mRNA将编码核酸酶的基因递送至细胞中。锌指核酸酶(ZFN)包含DNA-结合结构域和DNA-切割结构域，其中DNA结合结构域包含在至少一个锌指中，并且可操作地连接至DNA-切割结构域。锌指DNA-结合结构域在蛋白的N-端，而DNA-切割结构域位于所述蛋白的C-端。ZFN必须具有至少一个锌指。在一优选实施方案中，ZFN会具有至少3个锌指以具有足够的特异性用于宿主细胞或生物体中的靶向遗传重组。通常，具有3个以上锌指的ZFN用每个额外的锌指会具有越来越大的特异性。锌指结构域可以衍生自任何类别或类型的锌指。在一特定实施方案中，锌指结构域包含例如锌指转录因子TFIIIA或Sp1非常普遍代表的Cis2His2类型的锌指。在一优选实施方案中，锌指结构域包含3个Cis2His2类型锌指。可以改变ZFN的DNA识别和/或结合特异性以在细胞DNA中的任何所选位点完成靶向遗传重组。可以利用已知的分子细胞学和/或化学合成技术完成这样的修饰。(参见，例如，Bibikovaetal.，2002)。ZFNDNA-切割结构域衍生自一类非特异性DNA切割结构域，例如II型限制性酶如FokI的DNA-切割结构域(Kimetal.，1996)。其他可用的内切核酸酶可以包括例如HhaI、HindIII、Nod、BbvCI、EcoRI、BglI和AlwI。转录激活因子样(TAL)效应子核酸酶(TALEN)包含TAL效应子DNA结合结构域和内切核酸酶结构域。TAL效应子是病原体注射入植物细胞的植物病原细菌蛋白，在植物细胞中它们行进至核，并且具有转录因子的功能以打开特异性植物基因。TAL效应子的一级氨基酸序列决定其结合的核苷酸序列。因此，可以对TAL效应子预测靶位点，并且为了结合至特定核苷酸序列的目的可以工程化和产生TAL效应子。融合至编码TAL效应子的核酸序列是编码核酸酶或一部分核酸酶的序列，通常是来自II型限制性内切核酸酶如FokI的非特异性切割结构域(Kimetal.，l996)。其他可用的内切核酸酶可以包括例如HhaI、HindIII、Nod、BbvCI、EcoRI、BglI和AlwI。可以利用一些内切核酸酶(例如，FokI)仅作为二聚体发挥功能的事实以增强TAL效应子的靶标特异性。例如，在某些情况下，可以将每个FokI单体融合至识别不同DNA靶序列的TAL效应子序列，并且仅在两个识别位点接近时，失活的单体在一起产生具有功能的酶。通过需要DNA结合以激活核酸酶，可以产生高度位点特异性的限制性酶。序列特异性TALEN可以识别细胞中存在的预先选择的靶核苷酸序列内的特定序列。因此，在一些实施方案中，可以扫描靶核苷酸序列的核酸酶识别位点，并且可以基于靶序列选择特定核酸酶。在其他情况下，可以将TALEN工程化以靶向特定细胞序列。利用可编程的RNA指导的DNA内切核酸酶的基因组编辑不同于上文所述的位点特异性核酸酶，成簇的规律间隔的短回文重复(CRISPR)/Cas系统提供ZFN和TALEN的另一种选择用于通过RNA指导的DNA切割诱导靶向遗传改变。CRISPR系统依赖于CRISPRRNA(crRNA)和反式激活嵌合RNA(tracrRNA)用于DNA的序列特异性切割。存在3种类型的CRISPR/Cas系统：在II型系统中，Cas9用作在crRNA-tracrRNA靶标识别时切割DNA的RNA指导的DNA内切核酸酶。CRISPRRNA与tracrRNA碱基配对形成2-RNA结构，所述2-RNA结构将Cas9内切核酸酶引导至切割的互补DNA位点。通过共递送表达Cas内切核酸酶的质粒和必需的crRNA组分，CRISPR系统对于植物细胞是可携带的。可以将Cas内切核酸酶转换为切口酶以提供对DNA修复机制的额外控制(Congetal.，2013)。CRISPR通常是包含多达11bp的内部和末端反向重复的24-40bp的短部分回文序列。虽然已检测分离的元件，但是它们一般是成簇(多达约20个或更多个每基因组)排列的独特间插20-58bp序列间隔的重复单元。CRISPR一般在给定基因组内是均质的，它们的大部分相同。但是，例如在古细菌中有异质性的实例(Mojicaetal.，2000)。植物生物质植物生物质的总脂质含量的提高等价于更高的能量含量，使得其作为饲料或牧草或者在生产生物燃料中的用途更加经济。天然存在的植物生物质的主要成分为碳水化合物(约75％，干重)和木质素(约25％)，其可随着植物类型而变化。碳水化合物主要为纤维素或半纤维素纤维，其赋予植物结构的强度，以及木质素，其将纤维收拢在一起。植物生物质通常具有低能量密度，这是其物理形式和水分含量的结果。这还使得其在没有经过某种预加工的情况下储存和运输不方便且低效。有许多方法可用于将其转化为更方便的形式，包括：1)物理预加工(例如，磨碎)，或者2)用热方法(例如，燃烧、气化、热解)或化学方法(例如，厌氧消化、发酵、堆肥、酯交换)来转化。以此方式，将生物质转化为所描述的生物质燃料。燃烧燃烧是允许可燃物质在空气或氧气的存在下烧着的过程，其中有热的释放。基本过程为氧化。燃烧是生物质可被用为能量的最简便的方法，并被用于提供热。这种热本身即能够以许多方式使用：1)空间加热，2)水(或其它液体)加热以用于中央或区域加热或生产用热，3)产生蒸汽以用于发电或动力。当可燃燃料物质是生物质的形式时，则主要是纤维素、半纤维素、木质素、和其他存在的分子中的碳(C)和氢(H)的氧化以形成二氧化碳(CO2)和水(H2O)。本发明的植物通过增加的脂质含量提供改进的燃料用于燃烧。气化气化是部分氧化的过程，其中碳源如植物生物质，被分解为一氧化碳(CO)和氢气(H2)，外加二氧化碳(CO2)和可能的烃分子如甲烷(CH4)。如果气化在相对低的温度下发生，如700℃-1000℃，则产物气体将会具有相对高水平的烃(与高温度气化比较)。结果其可以直接使用，以燃烧用于加热或经蒸汽机发电，或者经适宜的气体净化，可用于运转内部燃烧的发动机用于发电。简单锅炉的燃烧室可以与气化器紧密连接，或者产物气体可以被清洁掉长链烃(焦油)、运输、储存、以及在别处燃烧。气化体系可以与组合的循环蒸汽机紧密整合以用于发电(IGCC-整合的气化组合循环)。更高温度气化(1200℃-1600℃)导致产物气体中很少的烃，以及更高比例的CO和H2。这已知为合成气体(合成气或生物合成气)，因为其可以用于合成较长链的烃(使用技术如Fischer-Tropsch(FT)合成)。如果H2与CO的比例正确(2∶1)，FT合成可以用于将合成气转化为高质量的与传统化石柴油和柴油机兼容的合成柴油生物燃料。热解如本文所用，术语“热解＂是指在缺乏氧气的情况下使用缓慢加热以从生物质产生气态的、油和碳(char)产品的过程。热解是基于脂质的物质(特别是基于甘油三酯的物质)的热或热-化学转化。热解的产物包括气体、液体和固体碳，其各自的比例取决于过程的参数。较低温度(400℃左右)倾向于产生更多的固体碳(缓慢热解)，而更高一些的温度(500℃左右)产生比例高得多的液体(生物油)，前提是蒸汽余留时间保持低至1s左右或更短。约275℃-约375℃的温度可以用来产生具有更高比例的较长链烃的液体生物油。热解包括脂质的直接热裂解或者热和催化裂解的组合。在约400-500℃的温度，裂解发生，产生短链烃如烷烃、烯烃、二烯烃、芳烃、石蜡和羧酸、以及一氧化碳和二氧化碳。可以使用四类主要的催化剂类型，包括过渡金属催化剂、分子筛型催化剂、激活的铝土(alumina)和碳酸钠(Maheretal.，2007)。实例在US4102938中给出。酸激活的铝土(Al2O3)是有效的催化剂(US5233109)。分子筛催化剂是表现出大小选择性的多孔、高度晶体结构，因此仅有特定大小的分子能够穿过。这些包括沸石催化剂如ZSM-5或HZSM-5，其是包含AlO4和SiO4及其他硅胶-铝土催化剂的晶体材料。这些催化剂的活性和选择性取决于酸度、孔径和孔形，并且通常在300-500℃运作。过渡金属催化剂例如在US4992605中有描述。碳酸钠催化剂已用于油的热解(DandikandAksoy，1998)。如本文所用，也称作“热解聚”的“水热处理”、“HTP”是热解的一种形式，其使植物衍生的物质，特别是植物衍生的物质中的含碳材料与氢反应以产生生物油产品，其主要包含石蜡烃与其他气体和固体。HTP的显著优势是营养性植物材料在形成用于转化反应的组合物之前不需要干燥，虽然营养性植物材料可以预先干燥以辅助生物质的运输或储存。生物质可以如从田间收获的直接使用。反应器是可以耐受使用的高温和高压并且抗腐蚀的任何容器。HTP中使用的溶剂包括水或完全是水，或者可以包括一些油形式的烃化合物。一般来说，HTP中的溶剂缺少添加的醇。转化反应可以在氧化、还原或惰性环境中进行。如本文所用的“氧化”表示在空气的存在下；“还原”表示在还原剂的存在下，通常为氢气或甲烷，例如10-15％H2，剩余气体为N2；而“惰性”表示在惰性气体如氮气或氩气的存在下。转化反应优选在还原条件下进行。转化的含碳材料包括纤维素、半纤维素、木质素和蛋白质以及脂质。所述方法使用270℃-400℃的转化温度和70-350巴的压力，通常300℃-350℃和100-170巴的压力。作为所述方法的结果，产生有机蒸汽、热解气体和炭。使有机蒸汽冷凝以产生生物油。生物油的回收可以通过冷却反应器并将压力降低至大气压来完成，这允许生物油(有机)和水相发展并从反应器移出生物油。回收的生物油的收率在干重基础上计算为输入生物质的干重的百分比。其根据下式计算：生物油的重量x100/营养性植物部分的干重。生物油的重量不包括生物油混合物中可能存在的任何水或固体(其通过过滤或其他已知方法容易地去除)的重量。然后可以通过分馏将生物油分为级分，有或无额外的精炼过程。通常，在这些温度下冷凝的级分命名为：约370℃，燃油；约300℃，柴油；约200℃，煤油；约150℃，汽油(petrol)。较重的级分可以裂解为较轻的更可取的级分，这是本领域公知的。柴油燃料通常包含C13-C22烃化合物。如本文所用，“石化柴油”(petrodiesel)表示由化石燃料制成的柴油燃料，并且其符合美国的ASTMD975和欧洲的EN590列出的规格。如本文所用的术语“可再生柴油”表示衍生自最近活的生物质(不是化石燃料)的满足ASTMD975的标准且不是单烷基酯的柴油燃料。可再生柴油的典型特征为：75-90个的十六烷数量，约44MJ/kg的能力密度，约0.78g/ml的密度，约123KBTU/gal的能力含量，少于10ppm的硫水平，低于0℃的浊点。酯交换如本文所用，＂酯交换＂是在催化剂如碱或酸的存在下，通过与短链醇如甲醇或乙醇反应将脂质(原则上是三酰甘油)转化为脂肪酸甲基酯或乙基酯。甲醇更加常用，因为其低成本和可用性，但是还可以使用乙醇、丙醇或丁醇或者醇的混合物。所述催化剂可以是同质催化剂、异质催化剂或酶催化剂。同质催化剂包括硫酸铁随后是KOH。异质催化剂包括CaO、K3PO4和WO3/ZrO2。酶催化剂包括从南极假丝酵母(Candidaantarctica)产生的Novozyme435。酯交换可以在提取的油上进行，或者优选在营养性植物材料中原位进行。可以在用来制备用于转化反应的组合物之前将营养性植物部分干燥和研磨，但不是必须如此。直接转化为脂肪酸酯(优选FAME)的优点是转化可以使用较低的温度和压力，并且仍然提供良好收率的产物，例如，包含至少50重量％FAME。如HTP方法计算通过酯交换回收的生物油的收率。非极性脂质的产生在本领域经常用于实践的技术可以用于提取、加工、纯化和分析本发明细胞、生物体或其部分产生的脂质如TAG。这类技术在诸如以下文献资源中有所描述和解释：FereidoonShahidi，CurrentProtocolsinFoodAnalyticalChemistry，JohnWiley&Sons，Inc.(2001)D1.1.1-D1.1.11，和Perez-Vichetal.(1998)。从营养性植物部分或种子产生油通常，将植物种子煮熟、压榨和/或提取以产生粗制种子油，然后脱胶、精炼、脱色和除臭。一般来讲，破碎种子的技术是本领域已知的。例如，可以通过向油料种子喷水以将含水量提高至例如8.5％来使油料种子缓和，然后使用间隙设为0.23-0.27mm的平滑辊压成薄片。根据种子的类型，在破碎前可以不加水。施热使酶失活有利于进一步破碎细胞、合并脂滴和聚集蛋白颗粒，所有这些都有利于提取过程。在一实施方案中，大部分种子油在通过螺旋榨油机后释放出来。螺旋榨油机排出的油饼然后使用伴热柱通过溶剂提取，例如通过己烷提取。可选择地，可以使通过压榨作业产生的粗制种子油通过具有槽线排放盖的沉降槽，以除去在压榨作业期间与种子油榨出的固体。可以使澄清的种子油通过板框压滤机以除去任何剩余的细固体颗粒。如果需要，可以将通过提取过程回收的种子油与澄清的种子油合并以产生混合的粗制种子油。一旦将溶剂从粗制种子油除去后，将压榨和提取的部分合并，然后接受正常的脂质加工工序(即，脱胶、碱炼、脱色和除臭)。从本发明的营养性植物部分提取脂质使用与本领域已知用于种子油提取的那些类似的方法。一种方式是物理提取，其通常不使用溶剂提取。榨油机压榨提取是一种常见类型，如螺旋压榨和冲击压榨提取方法。机械提取通常比溶剂提取效率低，在溶剂提取中，将有机溶剂(例如，己烷)至少与植物生物质混合，优选在生物质干燥和研磨之后。溶剂溶解生物质中的脂质，然后通过机械作用(例如，用上述压榨过程)将该溶液与生物质分离。这个分离步骤还可以通过过滤(例如，用压滤机或相似装置)或离心等进行。然后可以分离有机溶剂与非极性脂质(例如，通过蒸馏)。这个第二分离步骤从植物获得非极性脂质，并且如果采用常规蒸汽回收，可以获得可重复使用的溶剂。在一实施方案中，在提取之前通过如Hometal.(2007)所述的近红外反射光谱分析植物部分或种子的油和/或蛋白含量。如果营养性植物部分不立即用来提取脂质，优选将其加工以确保将脂质含量尽可能地最小化(参见，例如，Christie，1993)，如通过干燥营养性植物部分。脱胶脱胶是精炼油的早期步骤并且其主要目的是从油中去除大部分的磷脂，其可占总的提取脂质的约1-2％。在70-80℃下将～2％的水(通常包含磷酸)添加至粗制油中，导致大部分磷脂(伴有微量的金属和色素)的分离。去除的不溶性物质主要是磷脂和三酰甘油的混合物并且也已知为卵磷脂(lecithin)。脱胶可通过以下方法进行：将浓磷酸加入粗制种子油以将不可水化的磷脂转化为可水化的形式，以及螯合存在的微量金属。通过离心将胶从种子油中分离。种子油可通过加入足量的氢氧化钠溶液以滴定所有脂肪酸并除去因此形成的皂而精炼。碱精炼碱精炼是一种处理粗制油的精炼过程，有时也称作中和。其通常在脱胶之后，并且在漂白之前。在脱胶后，可以通过加入足够量的碱溶液来处理种子油，以滴定所有的脂肪酸和磷酸，并且去除因此形成的皂。合适的碱物质包括氢氧化钠、氢氧化钾、碳酸钠、氢氧化锂、氢氧化钙、碳酸钙和氢氧化铵。这个过程通常在室温下进行并去除游离的脂肪酸部分。通过离心或通过萃取至皂的溶剂而将皂去除，并用水洗涤中和的油。如果需要，可以用合适的酸如盐酸或硫酸中和油中任何过量的碱。漂白漂白是精炼过程，其中在漂白粉(0.2-2.0％)的存在下将油在90-120℃下加热10-30分钟，并且其中通过用氮气或蒸汽或在真空中操作而缺乏氧气。油加工中的这个步骤设计为去除不期望的色素(类胡萝卜素、叶绿素、棉酚等)，并且该过程还去除氧化产物、微量金属、硫化合物和微量的皂。除臭除臭是在高温(200-260℃)和低压(0.1-1mmHg)下处理油和脂肪。这通常是通过以约0.1ml/分钟/100ml种子油的速率将蒸汽引入种子油来实现。除臭可以通过在真空下将种子油加热到260℃并以约0.1ml/分钟/100ml种子油的速率将蒸汽缓慢引入种子油来进行。鼓泡约30分钟后，使种子油在真空下冷却。通常将种子油转移到玻璃容器中，用氩气吹扫，然后冷藏。如果种子油的量有限，可以将种子油放在真空下，例如在Parr反应器中，然后加热到260℃持续与除臭会采用的相同时长。这个处理改善种子油的色泽，并且除去大部分挥发性物质或有气味的化合物，包括任何残余的游离脂肪酸、单酰甘油和氧化产物。冷滤(Winterisation)冷滤是有时用于油的商业生产的过程，用于在低室温下通过结晶将油和脂肪分离为固体(硬脂)和液体(软脂)部分。其最初应用于棉花种子油以产生无固体的产品。其通常用于降低油中的饱和脂肪酸含量。用于产生脂质的藻类藻类一年可以产生陆生植物10至100倍的物质，并且可以在开放池塘(如滚道式池塘和湖)或光生物反应器中的培养。最常见的产油藻类一般可包括硅藻(硅藻类)、绿藻(绿藻类)、蓝绿藻(蓝藻类)和金褐藻(金藻类)。此外，可以使用已知为定鞭藻类的第五组。组包括褐藻类和异鞭毛藻。具体的非限制性实例藻类包括以下类别：绿藻纲(Chlorophyceae)、大眼藻纲(Eustigmatophyceae)、土栖藻纲(Prymnesiophyceae)、硅藻纲(Bacillariophyceae)。能够产油的硅藻包括以下属：双肋藻属(Amphipleura)、双眉藻属(Amphora)、角毛藻属(Chaetoceros)、小环藻属(Cyclotella)、桥弯藻属(Cymbella)、脆杆藻属(Fragilaria)、菱板藻属(Hantzschia)、舟形藻属(Navicula)、菱形藻属(Nitzschia)、褐指藻属(Phaeodactylum)和海链藻属(Thalassiosira)。能够产油的绿藻的具体非限制性实例包括纤维藻属(Ankistrodesmus)、葡萄藻属(Botryococcus)、小球藻属(Chlorella)、绿球藻属(Chlorococcum)、杜氏藻属(Dunaliella)、单针藻属(Monoraphidium)、卵胞藻属(Oocystis)、栅藻属(Scenedesmus)和四爿藻属(Tetraselmis)。在一方面，绿藻可以是小球藻属或杜氏藻属。能够产油的蓝藻的具体非限制性实例包括颤藻属(Oscillatoria)和聚球藻属(Synechococcus)。能够产油的金藻类的具体实例包括黄金色藻(Boekelovia)。定鞭藻类的具体非限制性实例包括等鞭金藻属(Isochysis)和颗石藻(Pleurochysis)。可用于本发明的具体藻类包括，例如，衣藻属(Chlamydomonassp.)如莱茵衣藻，杜氏藻属(Dunaliellasp.)如盐生杜氏藻(Dunaliellasalina)、Dunaliellatertiolecta、嗜酸杜氏藻(D.acidophila)、D.lateralis、D.maritima、巴夫杜氏藻(D.parva)、多型杜氏藻(D.polmorpha)、D.primolecta、D.pseudosalina、D.quartolecta、绿色杜氏藻(D.viridis)，红球藻属(Haematococcussp.)，小球藻属(Chlorellasp.)如绿球藻(Chlorellavulgaris)、Chlorellasorokiniana或原壳小球藻(Chlorellaprotothecoides)，破囊壶菌属(Thraustochytriumsp.)，裂殖壶菌属(Schizochytriumsp.)，团藻属(Volvoxsp.)，微拟球藻属(Nannochloropsissp.)，可以包含超过60wt％脂质的布朗葡萄藻(Botryococcusbraunii)，三角褐指藻(Phaeodactylumtricornutum)，伪矮海链藻(Thalassiosirapseudonana)，等鞭金藻属(Isochrysissp.)，巴夫藻属(Pavlovasp.)，绿球藻属(Chlorococcumsp.)，后棘藻属(Ellipsoidionsp.)，新绿藻(Neochlorissp.)，栅藻属(Scenedesmussp.)。本发明的藻类可以使用微孔筛网、通过离心、通过絮凝(使用例如壳聚糖、矾和氯化铁)以及通过泡沫浮选来收获。中断二氧化碳供应可以使藻类自身絮凝，这称为“自絮凝”。在泡沫浮选中，养殖机向水通气形成泡沫，然后从水面撇去藻类。超声和其他收获方法目前正在开发中。脂质可以通过机械破碎从藻类提取。当干燥藻类块时，藻类块保持其脂质含量，然后可以通过榨油机“榨出”。渗透压休克也可以用来从藻类释放细胞组分如脂质，并且超声提取可以加速提取过程。化学溶剂(例如，已烷、苯、石油醚)常用于从藻类中提取脂质。利用酶降解细胞壁的酶法提取也可以用于从藻类中提取脂质。超临界CO2也可以用作溶剂。在这种方法中，将CO2在压力下液化并加热至变为超临界状态(同时具有液体和气体的性质)的点，允许其作为溶剂。如本文所用，“含油生物体”是积累其干重的至少20％为三酰甘油的生物体。如本文所用，“酵母”包括酵母属、酿酒酵母、卡尔酵母(Saccharomycescarlbergensis)、假丝酵母属(Candidaspp.)、克鲁维酵母属(Kluveromycesspp.)、毕赤酵母属(Pichiaspp.)、汉逊酵母属(Hansenulaspp.)、木霉属(Trichodermaspp.)、斯达氏油脂酵母(Lipomycesstarkey)和解脂耶氏酵母。优选的酵母包括解脂耶氏酵母或其他含油酵母和酵母属菌株。植物脂质的用途通过所述方法产生的脂质具有多种用途。在一些实施方案中，将脂质用作食用油。在其他实施方案中，将脂质精炼并用作润滑剂或用于其他工业用途如塑料合成。在一些优选实施方案中，将脂质精炼以生产生物柴油。生物柴油可以制备自衍生自本发明的植物、藻类和真菌的油。植物三酰甘油在生产生物燃料中的用途在Durrettetal.(2008)中进行了综述。所得的燃料通常称作生物柴油，并且具有1.9-6.0mm2s-1的动态粘度(ASTMD6751)。生物醇可以产生自除脂质提取之后残余的脂质以外的糖或生物质的发酵。生产生物燃料的一般方法可以在例如MaherandBressler(2007)，Greenwelletal.(2010)，Karmakaretal.(2010)，Alonsoetal.(2010)，Liuetal.(2010a).GongandJiang(2011)，Endalewetal.(2011)和Semwaletal.(2011)中找到。本发明提供增加营养组织中的油含量的方法。本发明的植物具有增加的叶和/或茎的能量含量，从而可以收获整个地上植物部分并用来生产生物燃料。此外，油酸水平显著升高，而多不饱和脂肪酸α亚麻酸(ALA)减少。因此本发明的植物、藻类和真菌减少生物燃料的生产成本。生物柴油生物柴油或烷基酯的生产是公知的。有三种通过脂质产生酯的基本路线：1)通过醇进行脂质的碱催化酯交换反应；2)通过甲醇进行脂质的直接酸催化酯化反应；以及3)将脂质转化成脂肪酸，然后通过酸催化形成烷基酯。可以使用用于制备脂肪酸烷基酯和甘油醚(其中甘油上的一个、两个或三个羟基被醚化)的任何方法。例如，可以分别通过用酸或碱催化剂水解或皂化TAG来制备脂肪酸，或者可以使用酶如脂肪酶或酯酶。可以通过使脂肪酸与醇在酸催化剂的存在下反应来制备脂肪酸烷基酯。还可以通过使TAG与醇在酸或碱催化剂的存在下反应制备脂肪酸烷基酯。可以例如通过使甘油与卤代烷在碱的存在下反应来制备甘油醚，或者使甘油与石蜡或醇在酸催化剂的存在下反应来制备甘油醚。所述烷基酯可以直接与柴油燃料搀和(blended)，或者用水或其他水性溶液洗涤以在搀和前去除各种杂质(包括催化剂)。航空燃料对于改善的生物燃料性能，已开发热和催化的化学键断裂(开裂)技术，其使得能够将生物油转化为石油衍生的柴油燃料和其他燃料如飞机燃油的生物基替代品。通过本发明的重组真核细胞、本发明的转基因非人生物体或其部分、本发明的转基因植物或其部分、本发明的种子、或者本发明的转基因细胞或者转基因植物或其部分这样产生的中链脂肪酸来源排除需要高能脂肪酸链开裂以获得飞机燃料和其他燃料需要的具有低温流动性要求的较短分子。这种方法包括从甘油酯切割一个或多个中链脂肪酸基团以形成甘油以及一个或多个游离脂肪酸。此外，所述方法包括分离所述一个或多个中链脂肪酸与甘油，并且脱去所述一个或多个中链脂肪酸的羧基以形成一个或多个烃用于生产飞机燃料。饲料本发明包括可以用作饲料的组合物。为了本发明的目的，“饲料”包括供人或动物消耗的任何食物或制品，并且其用来滋养或建立组织或者供应能量，和/或维持、恢复或支持足够的营养状况或代谢功能。本发明的饲料包括针对婴儿和/或幼儿的营养组合物。本发明的饲料包含例如本发明的细胞、本发明的植物、本发明的植物部分、本发明的种子、本发明的提取物、本发明方法的产物或与合适载体一起的组合物。术语“载体”以其最广泛的含义使用以涵盖可以或可以不具有营养价值的任何组分。如本领域技术人员将会知道，载体必须适用于(或以足够低的浓度用于)饲料，从而其对消耗饲料的生物没有有害作用。本发明的饲料包含通过使用本文所公开的方法、细胞或生物直接或间接产生的脂质。组合物可以为固体或液体形式。此外，组合物可以包括特定用途所需量的可食用大量营养素、维生素和/或矿物质。这些成分的量会随组合物是旨在用于正常个体还是用于具有特殊需求的个体如患有代谢病症等的个体而变化。具有营养价值的合适载体的实例包括但不限于大量营养素如食用脂肪、碳水化合物和蛋白质。这类食用脂肪的实例包括但不限于椰子油、琉璃苣油、真菌油、黑醋栗油、大豆油以及单-和二-甘油酯。这类碳水化合物的实例包括但不限于葡萄糖、食用乳糖和水解淀粉。此外，可以用于本发明的营养组合物的蛋白质的实例包括但不限于大豆蛋白、电渗析乳清、电渗析脱脂乳、乳清或这些蛋白质的水解产物。关于维生素和矿物质，可以将以下成分添加至本发明的饲料组合物中：钙、磷、钾、钠、氯化物、镁、锰、铁、铜、锌、硒、碘以及维生素A、E、D、C和B族。还可以添加其他此类维生素和矿物质。本发明的饲料组合物还可以添加到食物中，甚至在不需要膳食补充时。例如，可以将该组合物添加至任何类型的食物中，包括但不限于人造黄油、黄油、奶酪、牛奶、酸奶、巧克力、糖果、小吃、色拉油、烹调用油、烹调用脂肪、肉类、鱼肉和饮料。此外，根据本发明产生的脂质或经转化以包含和表达主题基因的宿主细胞也可用作动物食物补充剂以改变动物组织或牛奶脂肪酸组成以更适合人或动物消耗。这类动物的实例包括羊、牛、马等。此外，本发明的饲料可以用于水产养殖以提高鱼中的脂肪酸水平供人或动物消耗。本发明的优选饲料是可以直接用作人或其他动物的食物或饲料的植物、种子和其他植物部分如叶、果实和茎。例如，动物可以直接吃田野中生长的这类植物或以控制摄食的方式喂养更加定量的量。本发明包括将这类植物和植物部分用作饲料，以提高人和其他动物中的多不饱和脂肪酸水平。为了非人动物消耗，所述饲料可以是任何合适的形式，例如但不限于田野中生长的青贮饲料、草料或牧草。在一实施方案中，用于非人消耗的饲料是豆科植物或其部分，其是豆科(或leguminosae)的成员，如苜蓿、三叶草、豌豆、紫花苜蓿、菜豆、小扁豆、羽扇豆、牧豆树、角豆树、大豆和花生。组合物本发明还涵盖包含使用本发明的方法产生的一种或多种脂质的组合物，尤其是药物组合物。药物组合物可以包含一种或多种脂质，与标准、公知、无毒的药学上可接受的载体、佐剂或媒介物如磷酸盐缓冲盐水、水、乙醇、多元醇、植物油、润湿剂或乳剂如水/油乳剂相结合。组合物可以为液体或固体形式。例如，组合物可以为片剂、胶囊、可摄取液体、散剂、外用膏剂或霜剂的形式。适当的流动性可以例如通过在分散剂的情况下维持所需的粒度以及通过使用表面活性剂来维持。包含等渗剂，例如糖、氯化钠等也可以是可取的。除了这类惰性稀释剂外，组合物还可以包含佐剂如润湿剂、乳化及助悬剂、甜味剂、矫味剂和芳香剂。特定脂肪酸的典型剂量为0.1mg-20g，每天使用一至五次(每天最多100g)，并且优选在每天约10mg至约1、2、5或10g的范围内(以一个或多个剂量使用)。如本领域已知的，最低约300mg/天的脂肪酸，特别是多不饱和脂肪酸是可取的。然而，应当理解任何量的脂肪酸将有益于受试者。本发明的药物组合物的可能给药途径包括例如肠道和肠胃外。例如，可以口服给药液体制品。此外，均质混合物可以完全分散于水中，在无菌条件下与生理上可接受的稀释剂、防腐剂、缓冲剂或抛射剂混合以形成喷雾剂或吸入剂。向受试者给药的组合物的剂量可以由本领域的普通技术人员决定，并且取决于多种因素如受试者的体重、年龄、总体健康状况、既往史、免疫状态等。此外，本发明的组合物可以用于美容目的。可以将所述组合物添加至现有美容组合物中使得形成混合物，或者可以将根据本发明产生的脂肪酸用作美容组合物中唯一的“活性”成分。多肽术语“多肽”和“蛋白”在本文中一般可互换使用。一种多肽或一类多肽可以通过其氨基酸序列与参考氨基酸序列的相同性程度(％相同性)或者通过与一个参考氨基酸序列比与另一个参考氨基酸序列具有更高的％相同性而限定。多肽与参考氨基酸序列的％相同性通常通过GAP分析(NeedlemanandWunsch，1970；GCG程序)以空位形成罚分＝5和空位延伸罚分＝0.3的参数来确定。查询序列的长度为至少100个氨基酸，并且GAP分析在至少100个氨基酸的区域中比对两个序列。甚至更优选地，查询序列长度为至少250个氨基酸，并且GAP分析在至少250个氨基酸的区域中比对两个序列。甚至更优选地，GAP分析在它们的整个长度比对两个序列。所述一种多肽或一类多肽可以具有与参考多肽相同的酶促活性、或不同的活性或无活性。优选地，多肽的酶活性为参考多肽的活性的至少10％。如本文所用，“生物活性片段”是本发明的多肽的一部分，其保持全长参考多肽的限定活性，例如MGAT活性。如本文所用的生物活性片段不包括全长多肽。生物活性片段可以是任何大小的部分，只要它们保持限定的活性。优选地，生物活性片段保持全长多肽活性的至少10％。至于限定的多肽或酶，应当理解高于本文所提供的那些数值的％相同性数值将涵盖优选的实施方案。因此，当适用时，根据最小％相同性数字，优选多肽/酶包含与相关指定的SEQIDNO至少60％，更优选至少65％，更优选至少70％，更优选至少75％，更优选至少80％，更优选至少85％，更优选至少90％，更优选至少91％，更优选至少92％，更优选至少93％，更优选至少94％，更优选至少95％，更优选至少96％，更优选至少97％，更优选至少98％，更优选至少99％，更优选至少99.1％，更优选至少99.2％，更优选至少99.3％，更优选至少99.4％，更优选至少99.5％，更优选至少99.6％，更优选至少99.7％，更优选至少99.8％，以及甚至更优选99.9％相同的氨基酸序列。本文所限定的多肽的氨基酸序列突变体可以通过将合适的核苷酸变化引入本文所限定的核酸或者通过体外合成所需的多肽来制备。这类突变体包括例如氨基酸序列内残基的缺失、插入或取代。可以使缺失、插入和取代的组合到达最终构建体，只要最终多肽产物具有期望的特征。突变(改变)的多肽可以使用本领域已知的任何技术例如使用定向进化或合理设计策略(见下文)来制备。衍生自突变/改变的DNA的产物可以使用本文所述的技术容易地筛选，以确定它们是否具有转录因子、脂肪酸酰基转移酶或OBC活性。在设计氨基酸序列突变体中，突变位点的位置和突变的性质会取决于待改变的特征。突变位点可以单独或系列改变，例如通过(1)首先用保守的氨基酸选择取代，然后根据所得的结果用更激进的选择，(2)缺失靶残基，或者(3)相邻所处位点插入其他残基。氨基酸序列缺失一般范围为约1-15个残基，更优选约1-10个残基，并且通常约1-5个相邻残基。取代突变体具有至少一个在多肽中移除的氨基酸残基以及在其位置插入的不同残基。取代诱变灭活酶的最关注的位点包括鉴定为活性位点的位点。所关注的其他位点是其中获得自不同菌株或物种的特定残基相同的位点。这些位置对于生物活性可能很重要。优选以相对保守的方式取代这些位点，特别是落在至少其他三个相同的保守位点的序列内的位点。这类保守取代在表1中以“示例性取代”的标题示出。表1.示例性取代.原始残基示例性取代Ala(A)val；leu；ile；glyArg(R)lysAsn(N)gln；hisAsp(D)gluCys(C)serGln(Q)asn；hisGlu(E)aspGly(G)pro，alaHis(H)asn；glnIle(I)leu；val；alaLeu(L)ile；val；met；ala；pheLys(K)argMet(M)leu；phePhe(F)leu；val；alaPro(P)glySer(S)thrThr(T)serTrp(W)tyrTyr(Y)trp；pheVal(V)ile；leu；met；phe，ala在一优选实施方案中，当与天然存在的多肽相比时，突变体/变体多肽仅具有或不超过一个或两个或三个或四个保守氨基酸改变。保守氨基酸改变的细节在表1中提供。本领域技术人员会知道，可以合理地预测当在重组细胞中表达时，这类微小改变不会改变多肽的活性。可以利用本领域的标准程序如通过对所关注的已知基因进行随机诱变、靶向诱变或饱和诱变，或者通过对不同基因进行DNA改组将具有期望活性的突变体工程化。实施例实施例1.一般材料和方法以瞬时表达系统在植物细胞中表达基因使用基本上如Voinnetetal.(2003)和Woodetal.(2009)所述的瞬时表达系统在植物细胞中表达基因。将二元载体引入根癌农杆菌菌株AGL1，所述二元载体包含通过强组成型e35S启动子表达的编码区，该启动子包含重复的增强子区域。将用于表达p19病毒沉默抑制子的嵌合二元载体35S：p19单独地引入AGL1，如WO2010/057246中所述。将用于表达V2病毒沉默抑制子的嵌合二元载体35S：V2单独地引入AGL1。使重组细胞在补充了50mg/L卡那霉素和50mg/L利福平的LB肉汤中在28℃下生长至静止期。然后使细菌在室温下以5000g离心沉淀5分钟，之后在包含10mMMESpH5.7、10mMMgCl2和100μM乙酰丁香酮的渗透缓冲液中重悬至OD600＝1.0。然后，将细胞在28℃下振荡温育3小时，之后测量OD600，将达到OD600＝0.125的最终浓度所需体积的各培养物(包括病毒抑制子构建体35S：p19或35S：V2)添加至新的管中。。最终体积用上述缓冲液补足。然后将叶用培养混合物渗透，而植株通常在渗透后再生长三到五天，之后回收叶圆片用于纯化的细胞裂解物制备或总脂质分离。欧洲油菜转化如Keresztetal.(2007)所述利用氯气将欧洲油菜种子灭菌并在组织培养基上萌发。如Belideetal.(2013)所述分离具有2-4mm柄的子叶叶柄并用作外植体。如Belideetal.(2013)所述制备包含二元载体的根癌农杆菌AGL1(Lazoetal.，1991)培养物并用所述培养物接种子叶叶柄。将感染的子叶叶柄在补充了1mg/LTDZ+0.1mg/LNAA+3mg/LAgNO3+250mg/L头孢噻肟，50mg/L特美汀和25mg/L卡那霉素的MS培养基中培养，并且在24℃下培养4周，具有16hr/8hr光暗周期，在相同培养基上每两周亚培养。将具有绿色愈伤组织的外植体转移至新枝起始培养基(MS+1mg/L激动素+3mg/LAgNO3+250mg/L头孢噻肟+50mg/L特美汀+25mg/L卡那霉素)并另外培养2-3周。从抗性愈伤组织分离小的新枝(～1cm)并转移至新枝伸长培养基(具有0.1mg/L赤霉酸+3mg/LAgNO3+250mg/L头孢噻肟+25mg/L卡那霉素的MS培养基)，并且另外培养2周。选择具有一片或两片叶的健康新枝并转移至生根培养基(具有1mg/LNAA+20mg/LADS+3mg/LAgNO3+250mg/L头孢噻肟的1/2MS)，并且培养2-3周。如制造商的方案所述利用植物DNA分离试剂盒(Bioline，Alexandria，NSW，Australia)从抗性新枝的小叶片分离DNA。通过对基因组DNA进行PCR扩增测试T-DNA序列的存在。将具有根的阳性转基因新枝转移至包含育苗混合物的盆中，并且使其在温室中于24℃白天/16℃夜晚(标准条件)下生长。纯化的叶裂解物-酶测定将之前如上所述渗透的本氏烟草叶组织在包含0.1M磷酸钾缓冲液(pH7.2)和0.33M蔗糖的溶液中用玻璃匀浆器研磨。将叶匀浆物在4℃下以20,000g离心45分钟，之后收集各上清液。根据Bradford(1976)使用Wallac1420多标记计数仪和Bio-Rad蛋白测定染料试剂(Bio-RadLaboratories，Hercules，CAUSA)测量各上清液中的蛋白含量。酰基转移酶测定根据作了一些修改的Caoetal.(2007)方法使用100μg蛋白。反应培养基包含100mMTris-HCl(pH7.0)、5mMMgCl2、1mg/mLBSA(无脂肪酸)、200mM蔗糖、40mM冷油酰基-CoA、16.4μMsn-2单油酰基甘油[14C](55mCi/mmol，AmericanRadiochemicals，SaintLouis，MOUSA)或6.0μM[14C]甘油-3-磷酸(G-3-P)二钠盐(150mCi/mmol，AmericanRadiochemicals)。测定进行7.5、15或30分钟。脂质分析拟南芥种子中油含量的分析当要在小种子如拟南芥种子中确定种子油含量或总脂肪酸组成时，将种子中的脂肪酸直接甲基化而不破碎种子。将种子在干燥器中干燥24小时，并且将约4mg的种子转移至含有Teflon衬里螺旋盖的2ml玻璃小瓶中。将溶于0.1毫升甲苯的0.05毫克甘油三十七烷酸酯(triheptadecanoin)(具有3个C17：0脂肪酸的TAG)添加至小瓶中作为内部标准。通过将0.7ml的1N甲醇HCl(Supelco)添加至包含种子材料的小瓶中将种子脂肪酸甲基化。种子的破碎对于小种子如拟南芥种子的完全甲基化不是必需的。将混合物简短涡旋并在80℃下温育2小时。将混合物冷却至室温之后，将0.3ml的0.9％NaCl(w/v)和0.1ml的己烷添加至小瓶中并在HeidolphVibramax110中好好混合10分钟。将FAME收集至0.3ml的玻璃衬管中并如下文所述用火焰离子化检测器(FID)的通过GC分析。首先在市售标准GLC-411(NU-CHEKPREP，INC.，USA)中存在的已知量的相同FAME的峰面积响应的基础上将单个FAME的峰面积进行了修正。GLC-411包含等量的31种脂肪酸(重量％)，范围从C8：0至C22：6。对于不存在于该标准中的脂肪酸的情况，采用最相似的FAME的峰面积响应。例如，16：1d9的FAME峰面积响应用于16：1d7，而C22：6的FAME响应用于C22：5。通过与内部标准量比较，经修正的面积用来计算样品中每种FAME的量。油主要以TAG的形式储存并且其重量基于FAME的重量计算。通过计算每种FAME的摩尔数并将FAME的总摩尔数除以三来确定甘油的总摩尔数。使用如下方程将TAG计算为甘油与脂肪酰基部分的和：油的重量％＝100x((41x总的FAMEmol/3)+(总的FAMEg-(15x总的FAMEmol)))/g种子，其中41和15分别是甘油部分和甲基的分子量。亚麻荠种子和油菜种子中脂肪酸含量的分析为了确定较大的单个种子如油菜和亚麻荠种子中的脂肪酸组成，如拟南芥种子进行种子中脂肪酸的直接甲基化，除了破碎种皮。这种方法从种子提取足够的油以允许脂肪酸组成分析。为了确定来自种子的总提取脂质的脂肪酸组成，将种子破碎并用CHCl3/MeOH提取脂质。将提取脂质的等分试样甲基化并通过GC分析。通过破碎之后利用CHCl3/MeOH从已知重量的干燥种子两次提取脂质，然后甲基化脂质的等分试样连同作为内部标准的17：0脂肪酸来确定油菜的汇集的种子-总脂质含量(种子油含量)。在亚麻荠的情况下，如拟南芥油分析将来自已知量的种子的脂质连同已知量的17：0脂肪酸甲基化，并且通过GC分析FAME。对于TAG定量，利用TLC将TAG从提取的脂质分级分离并在硅中直接甲基化，利用17：0TAG作为内部标准。这些方法更详细地描述如下。在植物成熟时收获之后，通过在室温下将种子储存在含有硅胶作为干燥剂的干燥器中24小时来将亚麻荠或油菜种子干燥。种子的水分含量通常为6-8％。通过使用氯仿和甲醇的混合物(2/1v/v)在Eppendorf管中用Reicht组织裂解器(tissueiyser)(22频次/秒进行3分钟)和金属球破碎种子，以从已知重量的干燥种子中提取总脂质。加入1体积的0.1MKC1并将混合物摇晃10分钟。在将该混合物以3000rpm离心5分钟后收集下方的非极性相。用2体积的氯仿通过混合10分钟来洗涤余下的上方(水)相。第二非极性相也被收集并与第一个汇集。在氮气流下将溶剂从提取物的脂质蒸发，并将总干燥脂质溶于已知体积的氯仿中。为了测量所提取的材料中脂质的量，加入已知量的17：0-TAG作为内部标准并将来自已知量种子的脂质在1N的甲醇-HCl(Supelco)中于80℃下温育2小时。将如此制备的FAME在己烷中提取并通过GC分析。基于17：0TAG-FAME的量将单个FAME定量。在从FAME减去酯化甲基的重量之后，通过除以单个FAME的分子量将单个FAME的重量转化为摩尔数。所有FAME的总摩尔数除以3以计算TAG(以及继而的甘油)的摩尔数。然后，将TAG的摩尔数转化为TAG的重量。最后，使用种子重量计算基于种子重量的百分比油含量，其中为了计算油含量的目的假设所有提取的脂质为TAG或等价于TAG。这种方法是基于Lietal.，(2006)。亚麻荠或油菜种子以外的具有类似大小的种子也可以通过此方法来分析。还可以通过核磁共振技术测量油菜和其它种子油含量(RossellandPritchard，1991)，如实施例14所述通过脉冲波NMS100Minispec(BrukerPtyLtdScientificInstruments，Germany)。NMR方法同时测量水分含量。种子油含量还可以通过近红外反射(NIR)光谱进行测量，如利用NIRSystemsModel5000单色仪。还可以根据Lietal，(2006)，在来自一个批次种子的样品上通过在约100℃下干燥样品中的种子18小时来测量水分含量。来自叶裂解物测定的脂质的分析将来自裂解物测定的脂质用氯仿∶甲醇∶0.1MKCl(2∶1∶1)提取并回收。将样品中不同的脂质类别在用10％硼酸浸渍过的硅胶60薄层层析(TLC)板(MERCK，Dermstadt，Germany)上分离。用于从脂质提取物分馏TAG的溶剂体系为氯仿/丙酮(90/10v/v)。各脂质类别通过将平板暴露于碘蒸气而显色，并通过在相同的TLC平板上运行平行可信标准品而鉴定。将平板过夜暴露于磷成像屏，通过FujifilmFLA-5000磷屏成像仪进行分析，之后液闪计数以进行DPM定量。来自营养组织的脂质的总脂质分离和分馏通过直接甲基化冻干样品中的脂肪酸来确定叶和其他营养组织样品中总脂质的脂肪酸组成。对于总脂质定量，将已知重量的冻干样品中具有17：0FFA的脂肪酸直接甲基化。为了确定叶样品中的总TAG水平，通过TLC从提取的总脂质分馏TAG，并且在17：0TAG内部标准的存在下将其甲基化，因为叶中存在大量的极性脂质。这如下进行。如BlighandDyer(1959)所述将包括叶样品的组织冷冻干燥、称重(干重)并提取总脂质，或者通过使用氯仿∶甲醇∶0.1MKC1(CMK；2∶1∶1)作为溶剂。在冻干后，通过在每1cm直径叶样本加入900μL的氯仿/甲醇(2/1v/v)混合物来从本氏烟草叶样品提取总脂质。在要进行TLC-FID分析时，每0.5mg干叶重量加入0.8μg的DAGE作为内部标准。使用IKAultra-turrax组织分解器将样品匀浆，之后加入500μL的0.1MKC1。将样品涡旋，离心5min并收集下方的相。通过加入600μL的氯仿、涡旋并离心5min来将余下的上方的相进行第二次提取。回收下方的相并将其与前次的收集物汇集。在氮气流下将脂质干燥并在每mg叶干重2μL的氯仿中重悬。如上所述(有一些修改)提取红花烟草叶或叶样品的总脂质。如果组合了4个或6个叶片(每个约1cm2表面积)，使用1.6ml的CMK溶剂，而如果组合了3个或更少的叶片，则使用1.2ml的CMK。在含有金属球的Eppendorf管中用Reicht组织分解器(Qiagen)将冻干的叶组织匀浆3分钟(20频次/sec)。经TLC和转甲基化分离中性脂质将已知体积的总叶提取物(例如，30μL)，载入至TLC硅胶60平板上(1x20cm)(MerckKGaA，Qermany)。将中性脂质分馏为不同类型，并且在经平衡的含有己烷/DEE/乙酸(70/30/1v/v/v/)溶剂体系的进展槽(developmenttank)中通过TLC分离中性脂质与极性脂质。通过樱草灵喷洒来将TAG条带显色，在UV下标记，将其从TLC平板中刮下，转移至2mL的GC小管并用N2干燥。将750μL的1N甲醇-HCl(Supelcoanalytical，USA)与作为内部标准的已知量的C17：0TAG一起加入至每个小管，取决于每个样品中TAG的量。通常，对于低TAG样品，添加30μg的内部标准，而在高TAG样品的情况下，使用多达200μg的内部标准。通过将混合物在80℃下于甲醇-HCl的存在下温育2小时来将用于通过GC分析脂肪酸组成的脂质样品转甲基化。在将样品冷却至室温之后，通过加入350μL的H2O来使反应终止。通过加入350μL己烷、涡旋并以1700rpm离心5min来从混合物提取脂肪酰甲基酯(FAME)。收集上部的己烷相并转移至具有300μl圆锥形插入管(conicalinsert)的GC小瓶中。蒸发之后，将样品在30μL的己烷中重悬。将1μL注射入GC。通过GC对脂质部分中存在的个别和总的脂肪酸(TFA)的量进行定量，这是通过确定每个峰下的面积并通过与已知量的内部标准的峰面积比较来计算的。使用如下方程将叶中的TAG含量计算为甘油与脂肪酰基部分的和：重量％TAG＝1OOx((41x总FAME的mol/3)+(总FAME的g-(15x总FAME的mol)))/叶干重的g，其中41和15分别是甘油部分和甲基的分子量。毛细管气-液色谱(GC)使用AgilentTechnologies7890AGC(PaloAlto，California，USA)来分析FAME，其装配有SGEBPX70(70％氰丙基聚硅亚苯基硅氧烷)柱(30mx0.25mmi.d.，0.25μm膜厚度)、FID、分流/无分流注射器和AgilentTechnologies7693系列的自动取样器和注射器。氦被用作载体气体。以分流模式(50∶1比率)在150℃的烘箱温度下注射样品。注射后，将烘箱温度保持在150℃1min，然后以30℃·min-1升至210℃以及最终以50℃·min-1升至240℃。使用AgilentTechnologiesChemStation软件(RevB.04.03(16)，PaloAlto，California，USA)来对峰定量，其中是基于已知量的外部标准GLC-411(Nucheck)和C17：0-Me内部标准的反应。通过Iatroscan对TAG定量将1μL的脂质提取物装载至用于TLC-FIDIatroscanTM(MitsubishiChemicalMedienceCorporation-Japan)的一个Chromarod-SII上。继而将色谱棒架(Chromarodrack)转移至经平衡的进展槽中，所述进展槽含有70mL的己烷/CHCl3/2-丙醇/甲酸(85/10.716/0.567/0.0567v/v/v/v)的溶剂体系。温育30min之后，将色谱棒架在100℃下干燥3min并立即于IatroscanMK-6sTLC-FID分析仪(MitsubishiChemicalMedienceCorporation-Japan)上扫描。使用SIC-480II整合软件(版本：7.0-E，SICSysteminstrumentsCo.，LTD-Japan)整合DAGE内部标准和TAG的峰面积。以两个步骤进行TAG定量。首先，在所有样品中扫描DAGE以纠正提取产率，之后选择经浓缩的样品并稀释。接下来，在稀释的样品中以第二次扫描来对TAG进行定量，其中所述扫描是依照使用三硝酸甘油(Sigma-Aldrich)作为外部标准的外部校准。通过GC对叶样品中的TAG定量首先在市售标准GLC-411(NU-CHEKPREP，Inc.，USA)中存在的已知量的相同FAME的峰面积响应的基础上将单个FAME的峰面积进行了修正。通过与内部标准比较，经修正的面积用来计算样品中每种FAME的量。由于油主要以TAG的形式储存，基于每个样品中FAME的量来计算油的量。通过计算FAME的摩尔数并将FAME的总摩尔数除以3来确定甘油的总摩尔数。使用如下方程将TAG的量计算为甘油与脂肪酰基部分的和：油的重量％＝100x((41x总FAME的mol/3)+(总FAME的g-(15x总FAME的mol)))/叶干重的g，其中41和15分别是甘油部分和甲基的分子量。实施例2.增加本氏烟草营养性部分中的脂质含量遗传构建体pJP3502用来通过如WO2013/096993中对红花烟草所述的农杆菌介导的转化方案产生本氏烟草的稳定转化的植物。用卡那霉素抗性选择转基因植物，并且使其在温室中生长至成熟。在结籽时收获叶样品并将其冻干。确定从样品BlighandDyer(1959)提取总脂质之后的总脂肪酸(TFA)含量(％干物质)以及三酰甘油(TAG)级分含量和组成。数据在表2和表3中示出。最高叶油样品来自转基因植物#16，其具有33重量％的TFA含量。这个样品包含22.5重量％TAG(干重)。观察到脂肪酸组成的改变与TFA或TAG含量之间的强烈相关性。油酸(C18：1n-9)随着增加TFA和TAG含量而增加，因此其是具有高TAG含量的叶中的优势脂肪酸，例如在具有最高TAG含量的叶中包含TFA的66.8％和TAG脂肪酸的66.9％。对其他脂肪酸观察到相似的相关性，例如在具有最高TAG含量的叶中ALA水平降低至TFA的4.9％和TAG的3.9％。还观察到C16：3水平与TFA和TAG含量之间的强烈相关性，C16：3在高TFA和TAG样品中大幅度减少。当叶开始变黄时，在叶衰老期中还分析了两个高油植物#14和#16(表4和表5)。虽然最高样品的总脂肪酸含量没有什么变化(32.9％vs33％)，但是TAG的量增加至32.6％。在这些样品中，TAG包含几乎所有的叶脂质。实施例3.增加营养性红花烟草植物部分中的脂质含量构建体pJP3502以前已用来转化红花烟草(WO2013/096993)。收获获得自用来自pJP3502的T-DNA转化且具有高TFA和TAG含量的纯合T1植物的种子并将其播种以建立新一代的T2子代植物，对于转基因是均匀纯合的。将盆排列在温室中，从而成熟的植物叶如在田野中生长时会出现的以典型的冠层形成重叠(“冠层”)，或者最大暴露于直接的阳光(“非冠层”)。在结实阶段，当完全生长时从每个植物采集叶样品并冻干。从样品BlighandDyer(1959)提取总脂质之后对TAG级分确定脂肪酸含量(表6)。来自非冠层植物的成熟叶组织中的TAG水平通常高于冠层植物，观察到的最高叶TAG含量是叶干重的20.6％。表6.与野生型(wt)相比，用pJP3502的T-DNA转化的T2转基因子代植物(系49)的成熟叶组织中的TAG含量(％干重)。实施例4.增加单子叶植物的营养性部分中的油含量设计嵌合DNA构建体以通过在转基因植物中表达编码WRI1、玉米LEC1(登录号AAK95562；SEQIDNO：155)、DGAT和油质蛋白的组合来增加单子叶植物如C4植物两色高粱(高粱)中的油含量。如下，设计用于基因枪共转化的几对构建体，并且通过限制性酶-连接克隆产生。遗传构建体pOIL136是包含3个单子叶植物表达盒的二元载体，即用于植物选择的编码草胺膦乙酰基转移酶(PAT)的选择标记基因，用于表达DGAT的第二个盒以及用于表达油质蛋白的第三个。首先产生pJP136，通过扩增来自水稻的肌动蛋白基因启动子(McElroyetal.，1990)并将其作为平端-ClaI片段插入pORE04(Coutuetal.，2007)产生pOIL094。然后通过在KpnI位点将已为单子叶植物表达而密码子优化的芝麻油质蛋白基因的一个版本插入pOIL094产生pOIL095。通过将拉曼伞形霉(Umbelopsisramanniana)DGAT2a基因(Lardizabaletal.，2008)的一个单子叶植物密码子优化版本作为SmaI-KpnI片段插入包含玉米泛素基因启动子的载体产生pOIL093。然后通过将来自pOIL093的NotIDGAT2a表达盒在NotI位点克隆入pOIL095产生pOIL134。通过将编码PAT的选择标记基因作为BamHI-SacI片段插入包含玉米泛素启动子的载体产生pOIL141。最后，通过将玉米泛素：：PAT表达盒作为平端-AscI片段克隆入pOIL096的ZraI-AscI产生pOIL136。遗传构建体pOIL136因此包含以下表达盒：启动子水稻(O.sativa)肌动蛋白：：芝麻(S.indicum)油质蛋白、启动子玉米泛素：：拉曼伞形霉(U.ramanniana)DGAT2a和启动子玉米泛素：：PAT。通过将来自pUKN的玉米泛素：：NPTII盒作为HindIII-SmaI片段亚克隆入pJP3343的AscI(平端)和HindIII位点构建包含NPTII代替PAT的相似载体pOIL197。然后用HindIII(平端)和AgeI消化所得的载体pOIL196。将所得的3358bp片段克隆入pOIL134的ZraI-AgeI位点，获得pOIL197。设计并制备包含在不同启动子控制下的编码玉米WRI1(ZmWRI)或LEC1(ZmLEC1)转录因子的基因的一套构建体用于与pOIL136组合基因枪共转化，以便测试在C4植物如高粱的营养组织中表达时启动子强度和细胞特异性对WRI1或LEC1或者两者(如果组合)的功能的影响。这套单独的构建体不含选择标记基因，除了pOIL333，其包含NPTII作为选择标记。测试的不同启动子如下。玉米泛素基因启动子(pZmUbi)是强组成型单子叶植物启动子，而据报道具有重复增强子区的增强的CaMV35S启动子(e35S)导致较低的转基因表达水平(在GirijashankarandSwathisree，2009中综述)。虽然玉米磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(pZmPEPC)基因启动子在叶肉细胞中活化(MatsuokaandMinami，1989)，C4植物物种中光合作用的部位，但是玉米Rubisco小亚基(pZmSSU)基因启动子是维管束鞘细胞层特异性的(Nomuraetal.，2000；Lebrunetal.，1987)，C4植物中发生碳固定的细胞。据鉴定在植物发育期间编码SEE1半胱氨酸蛋白酶的玉米基因(登录号AJ494982)的表达与拟南芥SAG12衰老特异性启动子相似。因此还选择来自SEE1基因的1970bp启动子(SEQIDNO：216)驱动编码玉米WRI1和LEC1转录因子的基因的表达。此外，还选择来自编码马伴草(Aeluropuslittoralis)锌指蛋白AlSAP的基因的启动子(BenSaadetal.，2011；登录号DQ885219；SEQIDNO：217)和来自发根农杆菌的蔗糖反应性ArRolC基因的启动子(Yokoyamaetal.，1994；登录号DQ160187；SEQIDNO：218)用于在茎组织中表达ZmWRI1。因此，如下将这些启动子中的每个单独连接在ZmWRI1或ZmLEC1编码区的上游。首先通过将侧翼为AscI-NcoI位点的玉米WRI1编码序列和转录终止子/多腺苷酸化区克隆入二元载体pJP3343中的相同位点产生中间载体pOIL100。用于WRI1表达的不同版本的构建体是基于这个载体并通过将各种启动子克隆入pOIL100产生。通过将包含具有重复增强子区的e35S启动子的XhoI-SalI片段克隆入pOIL100的XhoI位点产生pOIL101。通过将包含玉米泛素基因启动子的HindIII-AvrII片段克隆入pOIL100的HindIII-XbaI位点产生pOIL102。通过将包含玉米PEPC基因启动子的HindIII-Nco片段克隆入pOIL100的HindIII-NcoI位点产生pOIL103。通过将包含玉米SSU基因启动子的HindIII-AvrII片段克隆入pOIL100的HindIII-AvrII位点产生pOIL104。合成包含侧翼为HindIII-XhoI独特位点的玉米SEE1启动子区的合成片段。利用pOIL100中的HindIII-XhoI位点将这个片段克隆在玉米WRI1蛋白编码区的上游。将所得的载体命名为pOIL329。合成包含侧翼为XhoI-XbaI独特位点的马伴草AlSAP启动子区的合成片段。利用pOIL100中的XbaI-XhoI位点将这个片段克隆在玉米WRI1编码区的上游。将所得的载体命名为pOIL330。合成包含侧翼为PspOMI-XhoI独特位点的发根农杆菌ArRolC启动子区的合成片段。利用pOIL100中的PspOMI-XhoI位点将这个片段克隆在玉米WRI1编码区的上游。将所得的载体命名为pOIL335。最后，在三个步骤中获得包含玉米SEE1：：ZmLEC1表达盒的二元载体(pOIL333)。首先，通过用包含AvrII和KpnI位点的侧翼引物扩增GUS编码区来构建35S：：GUS表达载体。随后将所得的片段克隆入pJP3343的SpeI-KpnI位点。将所得的载体命名为pTV111。然后，用玉米SEE1启动子取代pTV111的35S启动子区。为此，利用包含HindIII和XhoI独特位点的侧翼引物扩增玉米SEE1序列。用各自的限制性酶切割所得的片段并亚克隆入pTV111的SalI-HindIII位点。将所得的载体命名为pOIL332。然后，利用包含NotI和EcoRV位点的侧翼引物扩增ZmLEC1编码序列。将这个所得的片段亚克隆入pOIL332的各位点，获得pOIL333。通过限制性酶从pOIL101、pOIL102、pOIL103、pOIL104、pOIL197、pOIL329、pOIL330、pOIL333和pOIL335切除载体骨架然后凝胶分离来制备DNA用于基因枪转化。然后将pOIL197DNA与pOIL101、pOIL102、pOIL103、pOIL104、pOIL329、pOIL330、pOIL333或pOIL335DNA混合并通过基因枪介导的转化来转化入两色高粱外植体。或者，通过农杆菌介导的转化来单独转化或共转化用于表达基因的相同组合的构建体(Gureletal.，2009；Wuetal.，2014)。将转基因植物再生并通过抗生素抗性进行选择。当两个构建体在相同事件中共转化时，在转基因植物的非种子组织中观察到油含量增加。如Gouldetal.，(1991)所述将用于农杆菌介导的转化的嵌合DNA构建体用来转化玉米。简单地说，将茎尖外植体与转基因农杆菌共培养2天，然后转移至包含卡那霉素和羧苄西林的MS盐培养基上。几轮亚培养之后，转化的新枝和根自发形成并移植至土壤。所述构建体相似地用来利用对这些物种已知的转化方法转化大麦和燕麦。简单地说，对于大麦，农杆菌培养物用来根据公开的方法(Tingayetal.，1997；Bartlettetal.，2008)转化大麦(cv.GoldenPromise)的未成熟胚中的细胞，所述方法有一些修改，其中从未成熟的颖果分离长度为1.5-2.5mm的胚胎并去除胚轴。将所得的外植体与转基因农杆菌共培养2-3天，然后在包含特美汀和潮霉素的培养基上于黑暗中培养4-6周以产生胚性愈伤组织，然后移至过渡培养基在弱光中2周。然后将愈伤组织转移至再生培养基以允许新枝和根的再生，之后将再生的植株转移至土壤。获得转化的植物并使其在温室中生长至成熟。实施例5.增加双子叶植物中的油含量通过在营养性部分中表达WRI1、DGAT和油质蛋白基因的组合增加双子叶植物物种白三叶草(Trifoliumrepens)(三叶草)(常用作牧草物种的豆科植物)中的油含量。构建体pJP3502用来通过农杆菌介导的转化来转化白三叶草(T.repens)(Larkinetal.，1996)。简单地说，通过标准电穿孔程序将遗传构建体pJP3502引入根癌农杆菌。二元载体还包含T-DNA内的35S：NptII选择标记。使转化的农杆菌细胞在补充了卡那霉素(50mg/L)和利福平(25mg/L)的固体LB培养基上生长并在28℃下温育2天。将单一集落用来开始新鲜培养。48小时旺盛培养之后，将农杆菌细胞用来处理如Larkinetal.(1996)所述从吸涨的种子解剖的白三叶草(cv.Haifa)子叶。共培养3天之后，将外植体暴露于25mg/L卡那霉素以选择转化的新枝，然后转移至生根培养基以形成根，之后转移至土壤。获得包含来自pJP3502的T-DNA的6株转化的植物并转移至温室中的土壤。在一些植物的非种子组织中观察到油含量增加，一株植物表现出叶中的TAG水平增加大于4-倍。这类植物可用作动物饲料，例如通过使植物在牧场中生长，提供具有增加的能量含量/单位重量(能量密度)的饲料并导致动物的生长速度增加。构建体pJP3502还用来通过Wrightetal.(2006)的方法转化其他豆科植物如紫花苜蓿和蒺藜苜蓿以获得在营养性部分中具有增加的TAG含量的转基因植物。获得3种推定的蒺藜苜蓿(M.truncatula)植物。转基因植物可用作牧草物种或者用作草料或青贮饲料作为动物的饲料来源，例如，牛、羊和马，提供饲料中增加的能量密度。为了增加豆科植物种子中的油含量，合成DNA片段，其包含两个嵌合基因的组合，即(a)编码表达自菜豆β-类型菜豆蛋白贮藏蛋白启动子的拟南芥WRI1和5′UTR的第一嵌合基因加上(b)编码表达自豌豆的豌豆球蛋白启动子的拟南芥DGAT1和5′UTR的第二嵌合基因。将DNA片段插入包含编码油质蛋白的嵌合基因的二元载体pORE04以产生包含3个嵌合基因和选择标记的T-DNA构建体(图2)，将其用来转化另一种豆科植物羽扇豆，通过如Pigeaireetal.(1997)所述的方法。简单地说，将羽扇豆(L.angustifolius)的茎尖外植体与转基因农杆菌共培养，然后用卡那霉素溶液(20mg/ml)完全浸湿并转移至不含卡那霉素的再生培养基。将发育自茎尖的多个腋生枝切除至包含50mg/L卡那霉素的培养基上，并且将存活的新枝转移至包含50mg/L卡那霉素的新鲜培养基上。然后将健康的新枝转移至土壤。T-DNA上的基因在转化植物的细胞中表达，增加营养组织和种子中的油含量。驱动WRI1基因的种子特异性启动子还用来增加转基因羽扇豆种子中的油含量。该构建体还用来如Zhangetal.(1999)所述转化大豆以获得在种子中具有增加的TAG含量的转基因大豆植物。如通过对获得自植物样品的DNA进行PCR证实的，获得了转基因植物。使植物生长至成熟并由其收获种子。如通过非破坏性NMR证实的，预期种子的油含量增加。通过合成包含3个基因表达盒的DNA插入物，即具有表达拉曼伞形霉DGAT2A的大豆β-伴球蛋白启动子的第一基因表达盒，具有表达拟南芥WRI1的大豆KTi3启动子的第二基因表达盒以及具有表达小家鼠MGAT2的大豆β-伴球蛋白启动子的第三基因表达盒，构建用于增加羽扇豆和大豆中的种子油含量的第二遗传构建体。将这个插入物的SBfI-PstI片段在PstI位点克隆入二元载体pORE04以获得pJP3569。通过将较小的SbfI-SwaI片段在EcoRV-PstI位点克隆入pORE04来制备没有MGAT2基因的一个版本，获得pJP3570。相似地产生仅含WRI1基因和仅含DGAT2A基因的版本。将这些二元载体用来转化大豆以产生转基因种子。通过非破坏性NMR分析来自原代转化体的种子中的油含量，然后播种以产生T2种子。通过PCR扩增适应NotI限制性位点的单扩增子中的WRI1和DGAT2A表达盒来制备适合羽扇豆转化的一个版本的pJP3569。将NotI片段在PspOMI位点克隆入pJP3416以获得包含PAT选择标记基因的二元载体pJP3678。实施例6.增加油菜的营养性部分中的油含量的实验将二元表达载体用来转化欧洲油菜(cv.Oscar)以研究对种子和/或营养组织中的TAG积累的影响。首先，通过将密码子优化的拟南芥WRI1蛋白编码序列插入包含空35S表达盒的二元载体35S-pORE04来构建质粒pJP3414。pJP3414的T-DNA因此包含在组成型35S启动子控制下的密码子优化版本的拟南芥WRI1转录因子。如实施例1所述用pJP3414转化，来自11株独立转化的欧洲油菜T0幼苗的叶组织各自包含与空载体(pORE04)转化的植物相比升高的TAG水平。但是，TAG的水平均不超过1％。在系31中检测到最高水平，在干重基础上其包含多达0.58％TAG。与野生型(Oscar)和空载体对照种子相比，T1转基因种子中的油含量未显著升高。使在叶组织中表现出最高TAG水平的3个系的T1种子在包含3％蔗糖的MS培养基上萌发。当与未转化的对照(Oscar)相比时，5天和8天之后未观察到萌发的差异。为了进一步提高欧洲油菜营养组织中的TAG水平，将第二载体pJP3502(Vanherckeetal.，2014)用来转化欧洲油菜(cv.Oscar)。在开花之前采样的转基因叶中定量TAG水平。但是，在这个生长阶段TAG含量未进一步增加，并且脂肪酸组成没有不同于未转化的对照植物。这个实施例中描述的对欧洲油菜的观察(在叶中提供少于1％的TAG含量)与实施例2和3中对烟草属(Nicotiana)物种报道的那些(提供约20-30％TAG)形成鲜明对比。发明人仔细考虑这些观察，寻求对物种之间差异的解释。在物种之间鉴定了几个差异。发明人设想提供本质差异的一个差异是欧洲油菜是所谓的16：3物种，而烟草属物种是所谓的18：3物种。这涉及所谓的原核和真核途径对质体脂质合成的相对贡献(图1)，因此，发明人认为，对可用于TAG合成的DAG的量的相对贡献。这导致发明人设想这样的模型，例如通过减少16：3相对于18：3的积累，修改通过真核途径相对于原核途径合成脂肪酸的比例会改变植物细胞或光合、微生物细胞中积累的TAG水平。他们希望使平衡倾斜至有利于真核途径的这种修改会有益于TAG积累水平，特别是在所谓的16：3植物中。简单地说，将“16：3”细胞转化为更像“18：3”细胞。发明人假设由于在质体中通过原核途径合成和保留脂肪酸，质体中通过反馈抑制来抑制ACCase的C18：1-ACP的存在在16：3植物中可以更强。相反，他们假设由于为了提供入真核途径增加的质体C18：1输出，C18：3植物能够在营养组织中积累更高的TAG水平。如本文实施例2-4所示，相对于在质体脂质中具有低水平的C18：3的物种如欧洲油菜，在具有更高的C18：3/C16：3质体脂质比例的物种如红花烟草和本氏烟草中观察到这个。发明人假设，这个模型会解释为什么将来自载体pJP3502的WRI+DGAT+油质蛋白表达基因稳定转化入红花烟草和本氏烟草导致高水平的TAG积累和脂肪酸组成的广泛变化。相反，将相同载体转化入欧洲油菜仅导致TAG积累的轻微增加和脂肪酸组成的小变化。如下文所述检测这个模型。实施例7.质体GPAT表达的修改植物细胞中质体GPAT的过量表达进行许多实验以测试这样的假设，植物中高度活跃的16：3原核途径的存在(即所谓的16：3植物)在引入pJP3502上的基因组合时会在营养组织中提供相对于18：3植物低很多的TAG水平。这些实验在以下实施例中描述。最初，发明人测试是否可以通过质体GPAT的过量表达，增加原核途径中的通量来破坏转基因本氏烟草中观察到的高水平TAG积累。通过RT-PCR从拟南芥总RNA扩增用于表达拟南芥质体GPAT，ATS1的编码区(Nishidaetal.，1993)，并且作为EcoRI-PstI片段克隆入35S启动子控制下的二元表达载体pJP3343以产生组成型表达载体pOIL098。通过将嵌合载体pOIL098渗透入高油叶组织来确定在高油叶背景中过量表达质体GPAT的效果。通过WRI1和DGAT二元表达载体的共渗透(实施例1)或者通过将pOIL098渗透入用来自pJP3502的T-DNA或另一高油载体稳定转化的烟草属植物的叶产生高油叶组织。预期在共表达ATS1-编码基因的渗透叶斑中油含量减少。这通过分析TFA和TAG作为样品干质量的比例确定。这还通过观察标记的乙酸盐掺入制备自渗透叶斑的微粒体或叶裂解物的脂肪酸来确定。拟南芥的质体GPAT突变体中的油积累拟南芥的ats1突变体在编码质体GPAT的基因中具有破坏性突变，其将质体GPAT活性降低至仅野生型的3.8％的水平(Kunstetal.，1988)。测试并比较亲本和ats1突变体拟南芥中的非种子TAG积累水平(至少叶、茎和根中)。通过转化将用于过量表达编码WRI1、DGAT和油质蛋白的基因组合的pJP3502构建体的T-DNA引入两种基因型的植物。在两种植物背景下pJP3502的T-DNA中的基因组合均增加脂肪酸合成。但是，由于质体GPAT活性减少以及因此减少的脂肪酸进入质体原核途径的通量，预期ats1突变体中TAG的积累平均显著高于源自野生型(亲本)基因型的转基因植物。在转化和未转化的ats1突变体的叶中脂肪酸C16：3比C18：3的比例均显著减少。沉默植物细胞中编码质体GPAT的基因除了通过在编码质体GPAT的基因中引入突变来遗传修饰植物，通过沉默质体GPAT可以减少脂肪酸通过原核16：3途径的通量，从而增加营养性部分中的油含量。这通过产生具有表达RNA发夹(对应于编码来自所选物种的质体GPAT的基因区)的组成型或叶特异性启动子的转基因盒来确定。作为实例，利用拟南芥质体GPATcDNA序列(NM_179407，SEQIDNO：177)的581bpSalI-EcoRV片段产生RNAi发夹表达盒。与NM_179407的核苷酸序列具有高度序列相同性的编码质体GPAT的任何基因区也可以用来构建用于表达发夹RNA的基因用于沉默内源质体GPAT基因。设计包含侧翼为SmaI和KasI独特位点的本氏烟草质体GPAT的732bp片段(SEQIDNO：219)的hpRNAi构建体用于稳定转化入红花烟草。将合成的本氏烟草质体GPAT片段亚克隆入pJP3303的SmaI-KasI位点，导致pOIL113。预期减少质体脂肪酸保留会导致TAG积累增加，特别是在与“推”组分如过量表达转录因子如WRI1，或者通过“拉”组分如DGAT或PDAT，和/或减少的SDP1或TGD活性组合时。利用CRISPR/Cas9方法可以实现编码质体GPAT的基因或实际上任何基因的失活。例如，可以通过CRISPR/Cas9/sgRNA介导的基因破坏和随后通过非同源末端连接(NHEJ)DNA修复诱变进行编码拟南芥质体GPAT的基因(登录号NM_179407)的失活。靶向DNA切割之前，Cas9刺激DNA链分离并允许sgRNA与靶向基因中的特异性20nt序列杂交。这将靶DNA以相对于PAM(串联鸟苷核苷酸)结合位点正确的方向定位入Cas9的活性位点。这个定位允许Cas9的不同核酸酶结构域独立地在PAM位点上游3-nt的点切割靶DNA序列的每条链。然后双链断裂进行错误倾向的NHEJDNA修复，期间一些核苷酸的缺失或插入发生并导致质体GPAT基因的失活。通过使用CRISPRP网络工具(Xieetal.，2014)鉴定并选择靶向拟南芥GPAT基因的SgRNA序列。20nt靶序列可以是靶基因内的任何20nt序列，包括基因的非编码区如启动子或内含子内，只要其是基因组内的特异性序列。可以将该序列插入包含CRISPR/Cas9/sgRNA表达盒和卡那霉素植物选择标记的二元载体(Jiangetal.，2013)并通过农杆菌介导的转化来转化入植物细胞。可以通过PCR扩增和DNA测序筛选转基因T1植物的质体GPAT基因中的突变。实施例8.增加植物细胞中硫酯酶的表达从头脂肪酸合成发生在真核细胞的质体中，在这里合成脂肪酸同时结合至酰基载体蛋白如酰基-ACP缀合物。链延长至C16：0和C18：0酰基然后去饱和为C18：1同时连接至ACP之后，通过硫酯酶从ACP切割脂肪酸，并且脂肪酸通过从质体输出并转运至ER来进入真核途径，在ER中它们参与膜和储存脂质生物发生。在叶绿体中，输出过程具有两个步骤：首先，通过酰基-ACP硫酯酶(脂肪酰基硫酯酶；FAT)的酶促活性，酰基链释放为游离脂肪酸，第二通过与CoA反应形成酰基-CoA酯，所述反应通过长链酰基-CoA合成酶(LACS)催化。拟南芥包含3种脂肪酰基硫酯酶，可以基于它们的酰基链特异性区分。FATA1和FATA2优先水解不饱和的酰基-ACP，而饱和的酰基-ACP链通常由FATB切割。为了研究共表达硫酯酶和编码WRI1和/或DGAT多肽的基因对脂肪酸含量、TAG含量和脂肪酸组成的影响，通过将编码区插入pJP3343二元表达载体对3种拟南芥硫酯酶的每种制备嵌合基因用于在本氏烟草叶细胞中从35S启动子瞬时表达。利用包含EcoRI和PstI位点的引物从长角果cDNA扩增拟南芥FATA1(登录号NP_189147.1，SEQIDNO：202)和FATA2(登录号NP_193041.1，SEQIDNO：203)硫酯酶的编码区，随后利用相同的限制性位点克隆入pJP3343。将所得的表达载体分别命名为pOIL079和pOIL080。利用包含NotI和SacI侧翼位点的引物扩增拟南芥FATB基因(登录号NP_172327.1，SEQIDNO：204)的编码区并克隆入pJP3343的相应限制性位点，导致pOIL081。将构建体pOIL079、pOIL080和pOIL081渗透入本氏烟草叶组织，单独或者与包含拟南芥WRI1转录因子(AtWRI1)(pJP3414)和/或DGAT1酰基转移酶(AtDGAT1)(pJP3352)基因的构建体组合。为了比较，将编码椰子FatB1(CnFATB1)(pJP3630)、椰子(C.nucifera)FatB2(CnFATB2)(pJP3629)的嵌合基因与拟南芥硫酯酶平行引入本氏烟草叶组织，以便比较具有MCFA特异性的FatB多肽与没有MCFA特异性的拟南芥硫酯酶的效果。所有渗透均包括如实施例1所述的用于表达p19沉默抑制子的嵌合基因。阴性对照仅渗透p19T-DNA。在硫酯酶表达与WRI1和/或DGAT过量表达之间观察到对本氏烟草叶中的TAG水平的协同效应。表达硫酯酶基因而没有WRI1或DGAT基因在阴性对照(单独的p19)中的低水平之上显著提高TAG水平。例如，表达椰子FATB2硫酯酶导致与阴性对照相比叶中的TAG水平提高8.2-倍。与AtWRI1对照相比，拟南芥WRI1转录因子与每种硫酯酶的共表达进一步提高TAG水平。椰子硫酯酶CnFATB1和CnFATB2中每种与WRI1的共表达导致比具有WRI1的3种拟南芥硫酯酶中的每种高的TAG水平。有趣的是，当拟南芥DGAT1酰基转移酶与硫酯酶和WRI1组合共表达时观察到相反的情况。这表明拟南芥硫酯酶和拟南芥DGAT1酰基转移酶的酰基-链特异性的较好匹配，导致从酰基-ACP进入TAG的较大通量的酰基-链。非MCFA硫酯酶在提高叶中的总脂肪酸含量中的油酸百分比中也更有效。AtWRI1、AtDGAT1和AtFATA2的共表达导致叶中最高水平的TAG，提供比共表达AtWRI1和AtDGAT1而没有硫酯酶时高1.6-倍的水平。这些实验证实当WRI1和DGAT共表达时油合成和积累的协同增加，以及表明通过将硫酯酶加入组合获得进一步的协同增加。构建3种不同的二元表达载体以测试共表达编码WRI1、DGAT1和FATA的基因对稳定转化的红花烟草叶中的TAG水平和脂肪酸组成的影响。载体pOIL121包含用于从SSU启动子表达AtWRI1的SSU：：AtWRI1基因，用于从35S启动子表达AtDGAT的35S：：AtDGAT1基因，以及用于从组成型启动子enTCUP2启动子表达AtFATA2的enTCUP2：：AtFATA2基因。通过首先用NotI消化DNA以去除编码芝麻油质蛋白的基因来从pOIL38衍生这些遗传构建体。利用pOIL80DNA作为模板扩增拟南芥FATA2基因的蛋白编码区，侧翼为NotI位点。然后将这个片段插入pOIL38的NotI位点。然后将pOIL121用作pOIL122的亲本载体，pOIL122包含额外的enTCUP2：：SDP1发夹RNA盒用于转基因植物中内源SDP1基因的RNAi介导的沉默。为此，从pOIL51(实施例11)分离整个本氏烟草SDP1发夹盒为SfoI-SmaI片段，并且克隆入pOIL121的SfoI位点，产生pOIL122(图3)。以相似方式通过将作为SfoI-SmaI片段的enTCUP2：：SDP1发夹RNA盒克隆入pOIL36的SfoI位点获得包含SSU：：WRI1和35S：：DGAT1基因以及enTCUP2：：SDP1发夹RNA基因的第三载体pOIL123。总的来说，载体包含以下基因组合：pOIL121：SSU：：AtWRI1，35S：：AtDGAT1，enTCUP2：：AtFATA2。pOIL122：SSU：：AtWRI1，35S：：AtDGAT1，enTCUP2：：AtFATA2，enTCUP2：：SDP1发夹。pOIL123：SSU：：AtWRI1，35S：：AtDGAT1，enTCUP2：：SDP1发夹。将3个构建体每个用来通过农杆菌介导的转化产生转化的红花烟草植物(栽培种Wi38)。共表达拟南芥FATA2硫酯酶或沉默内源SDP1TAG脂肪酶与AtWRI1和AtDGAT1表达组合各自导致与在硫酯酶基因或SDP1-沉默基因不存在的情况下表达AtWRI1和AtDGAT1相比进一步升高的TAG水平。利用pOIL122通过所有4个嵌合基因的共同作用获得最大的TAG收率。注意本氏烟草是18：3植物。将相同的构建体pOIL079、pOIL080和pOIL081用来转化16：3植物拟南芥。发明人设想这样的模型，如通过增加的脂肪酰基硫酯酶活性增加质体脂肪酸输出会减少质体中的酰基-ACP积累，从而因为减少的对乙酰基-CoA羧化酶(ACCase)的反馈抑制增加脂肪酸生物合成(Andreetal.，2012；Moreno-Perezetal.，2012)。硫酯酶过量表达增加酰基链从质体输出进入ER，从而提供所谓的“推”和“拉”代谢工程化策略之间的有效连接。实施例9.营养性植物细胞中的中链脂肪酸产生Ecclestonetal.(1996)研究了用组成型表达的编码加州湾月桂12：0-ACP硫酯酶(加州月桂)的基因转化的转基因欧洲油菜植物的种子和叶中C12：0和C14：0脂肪酸的积累。该研究报道了成熟欧洲油菜种子中积累的高水平的C12：0，但是在叶组织中仅观察到非常低水平的C12：0，尽管有高水平的12：0-ACP硫酯酶表达。当将基因转化入拟南芥时获得了相同结果(Voelkeretal.，1992)。通过共表达椰子LPAAT和加州月桂硫酯酶扩展该研究，这导致欧洲油菜种子中增加的总C12：0积累以及增加的三月桂酸甘油酯部分(Knutzonetal.，1999)。因此现有技术表明营养性植物细胞中的中链脂肪酸(MCFA)合成是有问题的。为了测试引入对MCFA具有特异性的硫酯酶与本文所述其他基因组合的效果，合成用于表达几种不同硫酯酶的嵌合DNA并将其单独或组合引入植物细胞。合成来自已知产生MCFA的生物的硫酯酶的编码区(Jingetal.，2011)，并且将其作为EcoRI片段插入包含35S-启动子表达盒的二元载体pJP3343(Vanherckeetal.，2013)。硫酯酶为：樟树14：0-ACP硫酯酶(称作Cinca-TE)(Yuanetal.，1995；登录号Q39473.1；SEQIDNO：193)、椰子酰基-ACP硫酯酶FatB1(Cocnu-TE1；登录号AEM72519.1SEQIDNO：194)、椰子酰基-ACP硫酯酶FatB2(Cocnu-TE2；登录号AEM72520.1；SEQIDNO：195)、椰子酰基-ACP硫酯酶FatB3(Cocnu-TE3；登录号AEM72521.1；SEQIDNO：196)、披针叶萼距花酰基-(ACP)硫酯酶B型(Cupla-TE)(Topferetal.，1995；登录号CAB60830.1；SEQIDNO：197)、粘毛萼距花FatB1(Cupvi-TE；登录号AEM72522.1；SEQIDNO：198)和加州月桂12：0-ACP硫酯酶(Umbca-TE)(Voelkeretal.，1992；登录号Q41635.1；SEQIDNO：199)。这些硫酯酶全部在FATB类别中，并且对MCFA具有特异性。还克隆椰子LPAAT(Cocnu-LPAAT，MCFA型)(Knutzonetal.，1995；登录号Q42670.1；SEQIDNO：200)和拟南芥质体LPAAT1(Arath-PLPAAT；登录号AEE85783.1；SEQIDNO：201)的编码区。以前已显示Cocnu-LPAAT增加种子中TAG的sn-2位置上的MCFA掺入(Knutzonetal.，1995)，而拟南芥质体LPAAT(Arath-PLPAAT)(Kimetal.，2004)用作对照LPAAT以确定Cocnu-LPAAT可能具有的任何MCFA特异性的影响。前者LPAAT使用酰基-CoA作为一种底物并在其天然背景中在ER中操作，而后者PLPAAT使用酰基-ACP作为底物并在质体中工作。如实施例1所述通过农杆菌介导的渗透将硫酯酶基因与用于共表达p19沉默抑制子以及Cocnu-LPAAT或Arath-PLPAAT的基因一起引入本氏烟草叶，以便确定本氏烟草叶组织中是否可以产生MCFA。用农杆菌混合物渗透后5天收获渗透的叶区并将其冷冻干燥，之后如实施例1所述通过GC确定总脂肪酸含量和组成(表7)。对于表7中示出的数据，误差是一式三份渗透的标准差。渗透的对照叶区仅包含痕量(＜0.1％)或零水平的脂肪酸C12：0和C14：0，而C16：0以总叶脂质中TFA的14.9％±0.6存在。C12：0水平仅通过表达Cocnu-TE3(1.2％±0.1)和Umbca-TE(1.6％±0.1)而显著提高。每个受试硫酯酶的表达导致本氏烟草叶中的C14：0积累，Cinca-TE给出11.3％±1.0的最高水平。相似地，除了Umbca-TE，每个硫酯酶的表达导致升高的C16：0水平。用Cocnu-TE1的表达观察到最高水平的C16：0积累(35.4％±4.7)。当单独表达FATB基因时，在叶中观察到渗透区的大量坏死，这看来与MCFA生成的水平相关。发明人考虑坏死可能是由于游离脂肪酸(FFA)的水平大于最佳，并且还由于磷脂脂质池而不是TAG中MCFA的广泛积累。表7.用各种硫酯酶(TE)和LPAAT渗透的本氏烟草叶中所选脂肪酸的总叶脂肪酸组成(％总叶脂肪酸)。通过共渗透的基因(单个基因(除了所有样品中存在的p19)，Arath-LPAAT+各种TE，Cocnu-LPAAT+各种TE)将结果分组。“对照”表示未渗透的本氏烟草叶，而“仅p19”单独包含沉默抑制子。16：3为16：3Δ7，10，13；18：3为18：3Δ9，12，15。基因身份在文中定义。用于表达Arath-PLPAAT的嵌合基因与硫酯酶的共渗透倾向于与不存在LPAAT相比减少C12：0和C14：0的积累，同时略微增加C16：0的积累。相反，用于表达Cocnu-LPAAT或Umbca-TE的基因的共渗透使C12：0的积累增加至3.3％±0.5，同时发现C14：0在Cinca-TE+Cocnu-LPAAT样品中积累至14.9％±1.6。共表达Cocnu-TE1和Cocnu-LPAAT之后观察到最高的C16：0水平(40.2％±2.8)。向每个接种区添加LPAAT降低叶组织的坏死程度。令人惊讶的是，在瞬时表达研究中，在植物细胞中还产生C8：0和C10：0脂肪酸。当单独表达硫酯酶时，未观察到C8：0和C10：0的积累。但是，当硫酯酶表达与CuphoFatB与CnLPAAT和AtWRI1的共表达组合时，发现C8：0以植物细胞中总脂肪酸含量的0.27±0.09％的浓度存在。相似地，当CuplaFatB与CnLPAAT和AtWRI1共表达时，发现C10：0以总脂肪酸含量的0.54±0.16％存在。这些结果表明以前报道的从种子表达观察的硫酯酶的酰基特异性在本氏烟草叶中基本上保留，并且这个表达系统是测试酰基特异性的有效系统。添加质体拟南芥PLPAAT不增加MCFA的积累，虽然其的确导致拟南芥细胞中C16：0的积累略微增加。相反，椰子LPAAT增加本氏烟草叶中的C12：0、C14：0和C16：0积累，所述脂肪酸在椰子油中找到(Laurelesetal.，2002)。这表明天然本氏烟草LPAAT在叶组织中不高表达，或者对C12：0、C14：0和C16：0底物没有高活性。积累高水平TAG的营养性植物细胞中的中链氨基酸生成发明人以前通过编码拟南芥WRI1、拟南芥DGAT1和芝麻油质蛋白的嵌合基因的协调表达获得了红花烟草叶中15％TAG的生成(Vanherckeetal.，2014)。为了测试硫酯酶与LPAAT组合表达之后观察到的MCFA积累在产生高水平TAG的植物细胞中是否还会发生或增加(Vanherckeetal.，2013)，将这些基因共表达。将最佳表现的C12：0、C14：0和C16：0硫酯酶/LPAAT组合(Cocnu-LPAAT分别加上Umbca-TE、Cinca-TE和Cocnu-TE2硫酯酶)渗透，有或无以前描述的Arath-WRI1+DGAT组合(Vanherckeetal.，2013)。结果在图4中示出。相关MCFA(Umbca-TE的C12：0、Cinca-TE的C14：0和Cocnu-TE2的C16：0)的积累一致，并且通过向组合添加Arath-WRI1而最大幅度增加：C12：0包含Umbca-TE+Cocnu-LPAAT+Arath-WRI1样品中9.5％±0.9的总叶脂肪酸，C14：0水平在Cinca-TE+Cocnu-LPAAT+Arath-WRI1样品中为18.5％±2.6，而C16：0水平在Cocnu-TE2+Cocnu-LPAAT+Arath-WRI1样品中为38.3％±3.0。相对于在不存在WRI1下用硫酯酶加上Cocnu-LPAAT渗透，据发现硫酯酶加上Arath-WRI1渗透在Umbca-TE的存在下对C12：0、在Cinca-TE的存在下对C14：0以及在Cocnu-TE2的存在下对C16：0具有显著较大的影响(图5)。向硫酯酶加上Arath-WRI1混合物添加Cocnu-LPAAT对脂肪酸组成没有影响，在Umbca-TE和Cinca-TE组中观察到C12：0和C14：0的相对较小的增加以及Cocnu-TE2组中C16：0的小减少。观察到的最大水平是：在Umbca-TE+Arath-WRI1+Cocnu-LPAAT样品中观察到的总叶脂肪酸中8.8％±1.1的C12：0，Cinca-TE+Arath-WRI1+Cocnu-LPAAT样品中14.1％±3.5的C14：0以及Cocnu-TE2+Arath-WRI1样品中48.6％±3.7的C16：0。有趣的是，其中Arath-WRI1不同样增加MCFA积累的唯一硫酯酶是Cocnu-TE2，虽然其仍显著增加。单独添加这个基因导致C16：0的积累从16.0％±0.4增加至37.3％±0.6，而仅进一步添加Arath-WRI1将这个增加至48.6％±1.7。这可能是由于C12：0和C14：0中间体在质体脂肪酸合成期间与C16：0相比相对短暂。注意到的其他影响包括在Arath-WRI1的存在下C16：0和C18：1Δ9的增加以及C18：3Δ9，12，15水平的降低。进一步添加Cinca-TE和Cocnu-TE2仍进一步降低C18：3Δ9，12，15水平。相反，向Umbca-TE添加Arath-WRI1之后产生的额外C12：0看来以C16：0为代价而不是额外的C18：3Δ9，12，15(图5)。还通过LC-MS分析样品的子集以获得MCFA积累的更好理解。相对于p19对照渗透，质体半乳糖脂单半乳糖基二酰甘油(MGDG)和二半乳糖基二酰甘油(DGDG)仅包含低水平的C12：0和C14：0以及降低水平的C16：0。Umbca-TE样品中主要的包含C12：0的MGDG种类为30：3，表明一个C18：3和一个C12：0共定位在单半乳糖基骨架上。其他主要的包含C12：0的MGDG种类为28：0，表明第二脂肪酸为C16：0。Cinca-TE样品中主要的包含C14：0的MGDG种类为28：0和30：0，表明MGDG中显著比例的C14：0为二-C14：0或具有C16：0。在p19对照样品中未检测到包含C12：0和包含C14：0的MGDG种类。相反，包含C16：0的MGDG种类在Cocnu-TE2样品中倾向于减少。野生型样品中的主要MGDG种类(包含C16：3的34：6、包含C18：3的34：6和包含C18：3的36：6)全部倾向于通过表达转基因减少。这种减少在WRI+DGAT组合的存在下最大。在Umbca-TE样品中仅观察到痕量水平的包含C12：0的DGDG种类。在Cinca-TE样品中观察到的主要的包含C14：0的种类是28：0和30：0，两者在对照中均不存在。还观察到这些种类在Cocnu-TE2样品中处于升高的水平，但是在Umbca-TE样品中仅处于痕量水平。野生型样品中的主要DGDG种类(包含C16：0的34：3、包含C18：3的34：3和包含C18：3的36：6)全部倾向于通过表达转基因减少。这种减少在WRI的存在下最大。相似地，如以前所述，TAG种类一般在所有包含WRI+DGAT的样品中大幅度增加(Vanherckeetal.，2013)。据发现C12：0种类在高TAGUmbca-TE样品中是优势的，C14：0在高TAGCinca-TE样品中，并且C16：0在高TAGCocnu-TE2样品中。TAG级分的LC-MS分析显示在所有包含WRI转录因子的Umbca-TE样品中发现包含C12：0的36：0是优势TAG种类，是包含C18：3的TAG种类水平的两倍。相似地，包含C14：0的42：0是用LPAAT、DGAT、WRI或WRI+DGAT共转化的Cinca-TE样品中的优势TAG种类，虽然在样品包含WRI情况下反应显著更高。几种包含C16：0的TAG种类在高TAGCinca-TE(例如44：0和50：3)和Cocnu-TE2(例如46：0、48：0、50：2和50：3)样品中显著升高。同样地，在WRI的存在下观察到最大的C16：0增加。用于在营养组织中产生MCFA的稳定转化在二元载体中制备一系列遗传构建体以用基因的组合稳定转化植物如烟草用于在营养组织中产生MCFA，以便鉴定基因的最佳组合。这些构建体包括用于在SSU启动子(参见实施例8，pOIL121)或衰老特异性SAG12启动子的控制下表达WRI1的基因，编码油棕DGAT的基因(下文)，编码enTCUP启动子控制下的椰子LPAAT的基因(CocnuLPAAT，见上文)以及表达各种脂肪酰基硫酯酶(FATB)(表达自35S启动子或SAG12启动子)的几个基因。这些描述如下。编码油棕DGAT的基因的克隆为了首先测试不同的DGAT酶，包括代表性DGAT1、DGAT2和DGAT3酶，从公开的转录物组(Dussertetal.，2013)鉴定候选油棕DGAT序列并密码子优化用于在红花烟草中表达。然后将蛋白编码区各自单独克隆入35S启动子控制下的二元表达载体，用于如实施例1所述在瞬时本氏烟草叶测定中测试。测试的基因组合如下：1P19(阴性对照)2P19+CnLPAAT+WRI13P19+CnLPAAT+AtWRI1+AtDGAT14P19+CnLPAAT+AtWRI1+EgDGAT15P19+CnLPAAT+AtWRI1+EgDGAT26P19+CnLPAAT+AtWRI1+EgDGAT37P19+CincaFatB8P19+CincaFatB+CnLPAAT+WRI19P19+CincaFatB+CnLPAAT+AtWRI1+AtDGAT110P19+CincaFatB+CnLPAAT+AtWRI1+EgDGAT111P19+CincaFatB+CnLPAAT+AtWRI1+EgDGAT212P19+CincaFatB+CnLPAAT+AtWRI1+EgDGAT3TFA和TAG水平以及TFA或TAG含量中的总MCFA水平的结果在图6中示出。与AtDGAT1相比，EgDGAT1的表达导致总脂肪酸的更大积累和升高的TAG水平。相对于AtDGAT1，总脂肪酸含量中的总MCFA含量随着EgDGAT1的表达减少，但是TAG中存在的MCFA水平保持不变(图6)。遗传构建体的制备通过使用相容性限制性酶位点顺序插入基因盒来组装用于稳定转化的遗传构建体(表8)。除了编码FATB酶的一系列基因之一，4基因构建体(表8)各自包含编码表达自35S启动子的油棕DGAT1(EgDGAT1)的基因，编码表达自组成型enTCUP2启动子的椰子LPAAT(CnLPAAT)的基因，以及编码表达自SSU启动子或SAG12启动子的AtWRI1的基因。5基因构建体还包含用于表达发夹RNA的基因，所述发夹RNA用于减少编码酰基激活酶(AAE)的内源基因的表达。基于与从琴叶拟南芥(EFH44575.1)和本氏烟草基因组鉴定的AAE15的序列相似性构建发夹。已显示AAE参与MCFA的重新激活，因此进一步延长。考虑AAE的沉默可能增加MCFA积累。在载体pKANNIBAL中构建发夹盒，然后亚克隆入表达载体pWBVec2(Wangetal.，2004)，发夹的表达由35S启动子驱动。表8.组装的遗传构建体的总结。这些遗传构建体用来产生栽培种Wisconsin38的转化的烟草植物以及用来自pJP3502的T-DNA转化的高油品系。观察到用表达自35S启动子的单基因FATB构建体转化的植物比用表达自SAG12启动子或4基因构建体的相应FATB构建体转化的那些植物显著较小。认为较小的植物尺寸是由未有效掺入TAG的MCFA的累积引起的。过论本研究发现单独表达Umbca-TE之后叶细胞中的C12：0生成仅为总脂肪酸含量的约1.6％(表7)。添加用于表达Arath-WRI的基因比添加椰子LPAAT对叶组织中的C12：0和C14：0积累具有强很多的影响(图4和5)。这表明WRI1与硫酯酶组合大大增加叶细胞中的MCFA积累，协同作用。重要的是，发现许多C12：0、C14：0和C16：0在叶中积累在TAG中，该脂质在野生型叶中不积累在实质水平。这些实验表明可以将植物的营养性部分中的细胞修饰以产生MCFA，特别是TAG中高水平的C12：0和C14：0。C16：0水平也大幅度升高。实施例10.不同转录因子多肽对TAG积累的影响以前报道的关于WRI1和DGAT的实验(Vanherckeetal.，2013)使用编码拟南芥AtWRI1的合成基因(登录号AAP80382.1)和编码AtDGAT1的合成基因，也来自拟南芥(登录号AAF19262；SEQIDNO：1)。为了比较其他WRI多肽与AtWRI1的稳定性以与DGAT组合增加油含量，鉴定其他WRI编码序列并用来产生用于在本氏烟草叶中表达的构建体。合成编码拟南芥WRI3(登录号AAM91814.1，SEQIDNO：205)和WRI4(登录号NP_178088.2，SEQIDNO：206)转录因子(Toetal.，2012)的核苷酸序列并作为EcoRI片段插入35S启动子控制下的pJP3343。将所得的二元表达载体分别命名为pOIL027和pOIL028。利用包含额外的EcoRI位点侧翼引物从StenStymne教授(瑞典农业科学大学)提供的载体PCR扩增燕麦WRI1(AsWRI1，SEQIDNO：207)的编码序列。将扩增的片段插入pJP3343，导致pOIL055。在NCBI服务器上利用玉米WRI1氨基酸序列(登录号NP_001137064.1，SEQIDNO：209)作为询问通过BLASTp搜索鉴定来自两色高粱的WRI1候选序列(登录号XP_002450194.1，SEQIDNO：208)。合成两色高粱WRI1基因(SbWRI1)的蛋白编码区并作为EcoRI片段插入pJP3343，获得pOIL056。从乌桕(乌臼；TsWRI1，SEQIDNO：210)转录物组(Uday等提交)鉴定了编码WRI1的基因候选物。合成蛋白编码区并作为EcoRI片段插入pJP3343，导致pOIL070。包含用于表达拟南芥WRI1和DGAT1多肽的编码序列的pJP3414和pJP3352二元载体如Vanherckeetal.(2013)所述。如实施例1所述将包含各种WRI编码序列的治疗引入本氏烟草叶组织用于瞬时表达，在所有接种中使用编码p19病毒抑制子蛋白的基因。编码WRI多肽的基因单独测试或DGAT1酰基转移酶基因组合测试，后者提供更大的TAG生物合成和积累。这个实验中的阳性对照是编码拟南芥WRI1转录因子和AtDGAT1的基因的组合。如实施例1所述利用3株不同植物一式三份进行所有渗透并分析TAG水平。在不存在外源添加的DGAT1下大多数单独WRI多肽的表达导致渗透的叶斑中与仅具有p19构建体的对照相比增加但仍然低的TAG水平(在干重基础上＜0.23％)。TsWRI1是例外，其本身看来不显著提高TAG水平。此外，通过表达不同WRI转录因子产生的TAG水平的差异本身并不大。AsWRI1和SbWRI1获得与AtWRI1本身相似的TAG水平。TAG脂肪酸组成的分析显示在渗透的叶组织中仅有细微改变，除了从AtWRI3表达升高的C18：1Δ9水平(表9)。相反，来自不同WRI多肽表达的TAG收率的差异在与AtDGAT1酰基转移酶共表达时更明显。这再次证实如Vanherckeetal.(2013)报道的，在渗透的本氏烟草叶组织中WRI1和DGAT共表达对TAG生物合成的协同效应。当共表达DGAT1与AtWRI3、AtWRI4和TsWRI1表达载体时观察到中间TAG水平，而用AsWRI1和AtWRI1获得的水平显著较低。在不能事先预测的结果中，用DGAT与SbWRI1共表达获得了最高TAG收率，即使测定在双子叶植物细胞中进行。TAG脂肪酸组成分析显示在SbWRI1、AsWRI1和AtWRI1阳性对照的情况下升高水平的C18：1Δ9和降低水平的C18：3Δ9，12，15(ALA)(表9)。但是，不像AtWRI1，AsWRI1和SbWRI1的表达均表现出与p19阴性对照相比升高的C16：0水平。有趣的是，AtWRI3渗透的叶样品表现出不同的TAG谱，其中C18：1Δ9富集而C16：0和ALA仅略微受到影响。这个实验表明当与DGAT共表达以提高营养性植物部分中的TAG水平时，两色高粱WRI1转录因子SbWRI1优于AtWRI1。发明人还得出结论，来自单子叶植物的转录因子如WRI1可以在双子叶植物细胞中正常工作，实际上可能甚至具有与来自双子叶植物的相应转录因子相比更好的活性。同样地，来自双子叶植物的转录因子可以在单子叶植物细胞中正常工作。其他转录因子的使用制备遗传构建体用于在植物细胞中表达14个不同转录因子中的每个，以便测试它们与参与TAG生物合成和积累的其他基因组合为提高TAG水平发挥作用的能力。这些转录因子是作为WRI1的替换物的候选物，或者用于添加至包括WRI1、LEC1和LEC2转录因子中的一种或多种的组合用于植物细胞，特别是营养性植物部分。它们的选择主要是基于报道它们参与胚胎发生(在BaudandLepiniec(2010)和Ikedaetal.(2006)中进行了综述)，与LEC2相似。因此进行实验以测定它们的功能，使用本氏烟草表达系统(实施例1)，如下。将以下转录因子的蛋白编码区的核苷酸序列密码子优化用于在本氏烟草和红花烟草中表达，合成并作为NotI-SacI片段克隆入pJP3343的各位点：拟南芥FUS3(pOIL164)(Luerssenetal.，1998；登录号AAC35247；SEQIDNO：160)、拟南芥LEC1L(pOIL165)(Kwongetal.2003；登录号AAN15924；SEQIDNO：157)、拟南芥LEC1(pOIL166)(Lotanetal.，1998；登录号AAC39488；SEQIDNO：149)、栽培大豆MYB73(pOIL167)(Liuetal.，2014；登录号ABH02868；SEQIDNO：221)、拟南芥bZIP53(pOIL168)(Alonsoetal.，2009；登录号AAM14360；SEQIDNO：222)、拟南芥AGL15(pOIL169)(Zhengetal.，2009；登录号NP_196883；SEQIDNO：223)、拟南芥MYB118(登录号AAS58517；pOIL170；SEQIDNO：224)、MYB115(Wangetal.，2002；登录号AAS10103；pOIL171；SEQIDNO：225)、拟南芥TANMEI(pOIL172)(Yamagishietal.，2005；登录号BAE44475；SEQIDNO：226)、拟南芥WUS(pOIL173)(Lauxetal.，1996；登录号NP_565429；SEQIDNO：227)、拟南芥BBM(pOIL174)(Boutilieretal.，2002；登录号AAM33893，SEQIDNO：145)、欧洲油菜GFR2a1(登录号AFB74090；pOIL177；SEQIDNO：228)和GFR2a2(登录号AFB74089；pOIL178；SEQIDNO：229)(Liuetal.(2012c))。此外，将参与适应高光磷饥饿条件的拟南芥PHR1转录因子的密码子优化版本相似地亚克隆入pJP3343(pOIL189)(Nilssonetal(2012)；登录号AAN72198；SEQIDNO：230)。这些转录因子在表10中总结。作为确定这些转录因子的功能的筛选测定，如实施例1所述将遗传构建体引入本氏烟草叶细胞，有或无编码DGAT1的基因，或者其他基因组合如编码WRI1、LEC2、hpSDP1或FATA硫酯酶，并且测量叶细胞的总脂质含量和脂肪酸组成。鉴定并选择显著增加总脂质含量的转录因子。为了使用编码可选转录因子的基因稳定转化植物，制备以下二元构建体。用于表达转录因子的基因使用SSU启动子或SAG12启动子。已显示胚性转录因子如LEC1和LEC2的过量表达诱导在当前上下文中不可取的各种多效性作用，包括体细胞胚胎发生(Feeneyetal.(2012)；Santos-Mendozaetal.(2005)；Stoneetal.(2008)；Stoneetal.(2001)；Shenetal.(2010))。为了最小化可能的对植物发育和生物质收率的负面影响，与组成型启动子相比优先使用组织或发育阶段特异性启动子以驱动胚胎发生的主要调节子的异位表达。表10.额外的转录因子和用于它们表达的遗传构建体实施例11.沉默植物中的TAG脂肪酶在叶组织中积累高水平的TAG已证实糖依赖性1(SDP1)TAG脂肪酶在拟南芥的非种子组织中以及种子萌发期间的TAG转换中起作用(Eastmondetal.，2006；Kellyetal.，2011；Kellyetal.，2013)。SDP1在发育的种子中表达，并且SDP1多肽还存在于成熟种子中与油体相关(但不是包衣)。沉默编码SDP1的基因导致拟南芥根和茎组织中TAG水平的小但是显著的增加(在干重基础上＜0.4％)，同时在叶组织中观察到甚至更小的增加(Kellyetal.，2013)。为了确定TAG水平是否可以在叶和茎组织中相对于AtWRI1和AtDGAT1的共表达进一步升高，设计实验以沉默红花烟草植物(对于具有用于WRI、DGAT1和油质蛋白多肽的转基因表达的基因的T-DNA是纯合的)中的内源SDP1基因(Vanherckeetal.，2014)。使用AtSDP1核苷酸序列作为询问的本氏烟草转录物组(Naimetal.，2012)的BLAST搜索鉴定了与拟南芥SDP1基因具有同源性的转录物(Nbv5tr6385200，SEQIDNO：173)。选择713bp区域(SEQIDNO：174)用于发夹介导的基因沉默。基于pHELLSGATE12载体设计3.903kb合成片段，其顺序包含enTCUP2组成型启动子、正义方向的侧翼为attB1和attB2位点的713bp本氏烟草SDP1片段、Pdk内含子、反方向的cat内含子序列、反(反义)方向的侧翼为attB1和attB2位点的第二713bp本氏烟草SDP1片段、以及OCS3’区终止子/多腺苷酸化位点(图8)。利用SmaI和KasI限制性位点将插入物亚克隆入pJP3303，并且将所得的表达载体命名为pOIL051。这个嵌合DNA包含潮霉素抗性选自标记基因。将pOIL051用来通过农杆菌介导的转化产生转化的红花烟草植物。起始植物细胞来自对于pJP3502的T-DNA是纯化的转基因植物(Vanherckeetal.，2014)。通过潮霉素抗性选择包含来自pOIL051的T-DNA的转基因植物，并且将其转移至温室中的土壤或受控环境柜中用于继续生长。在开花之前、开花时和植物发育的结实阶段从证实的双转化体(T0植物)收获叶样品，并且确定每个中的TAG水平。通过从叶样品提取脂质并通过斑点TLC分析鉴定仅包含低水平的叶TAG或与对照相同水平的TAG的转基因植物并丢弃。如实施例1所述通过GC定量转化体的剩余群体中的TAG水平。开花之前，这些植物中的大多数在它们的叶组织中表现出大大升高的TAG水平(叶干重的＞5％)，同时4株植物包含10％以上的TAG水平(表11)。开花之前，在这些植物的叶中观察到的最高TAG水平在植物51-13中是11.3％。作为比较，表达AtWRI1、AtDGAT1和油质蛋白的亲本红花烟草品系的转基因植物表现出在开花之前约2％和在开花期间约6％的TAG水平(Vanherckeetal.，2014)。因此向AtWRI1加上AtDGAT1组合添加SDP1抑制构建体对于提高这些植物中的TAG水平是协同性的。令人惊讶的是，收获自开花阶段的双转化植物的叶中的TAG含量大大增加，观察到在干重基础上30.5％(表12)，代表相对于未对SDP1沉默的植物增加5-倍。令发明人大为吃惊的是，在结实阶段的衰老叶(绿色和黄色)的样品中TAG水平达到惊人的70.7％(干重的％)(表13)。当NMR用来测量来自结实阶段的烟草植物的整个叶的油含量时，已开始衰老的一些绿叶中的TAG含量为约43％，并且在一些褐色、干燥的叶中为42％。当将这类叶压在两张褐色滤纸之间时，渗出的油浸透纸并使其半透明，而对照烟草叶不这样，为检测具有高油含量的植物提供了简单的筛选方法。利用潮霉素基因特异性引物对通过数字PCR(ddPCR)分析包含来自pJP3502和pOIL51的T-DNA中的每个并表现出高TAG水平的两个主要转化体(#61，#69)以确定pOIL51T-DNA插入的数量。命名为#61的植物包含一个来自pOIL51的T-DNA插入，而植物#69包含3个来自pOIL51的T-DNA插入。通过ddPCR再次筛选两个品系的T1子代植物以鉴定纯合、杂合和空植物。选择不含来自pOIL51的插入(空；总计7个)或包含2个T-DNA插入(即对于该T-DNA是纯合的；总计12个)的植物#61的子代植物用于进一步分析。相似地，维持包含0个来自pOIL51的T-DNA插入(空；总计2个)或2个这样的插入(总计15个)或者4或5个插入(总计5个)的子代植物用于进一步分析。所选T1植物在与对照植物相同的时间和相同的条件下于温室中生长。将来自开花之前的T1植物的绿叶组织样品干燥并通过GC分析确定总脂肪酸(TFA)和TAG含量。包含两种T-DNA的植物的TFA含量在干重基础上范围为4.6％-16.1％，相同叶中包括在干重基础上1.2％-11.8％的TAG水平(图9)。这与仅包含来自pJP3502的T-DNA并在相同条件下于旁边生长且在生长的相同阶段分析的植物相比大很多，再次表明减少TAG脂肪酶与WRI1加上DGAT组合之间的协同作用。仅包含pJP3502T-DNA的植物包含4.2％-6.8％TFA，包括在干重基础上1.4％-4.1％的TAG水平(图9)。野生型植物平均包含约0.8％TFA，包括在干重基础上少于0.5％TAG。来自品系#61和#69中每个的叶的总脂肪酸含量和TAG含量中的脂肪酸组成与仅包含来自pJP3502的T-DNA的叶(亲本)中的组成相似。与野生型对照叶相比，包含来自pOIL51和pJP3502的T-DNA的植物表现出升高水平的C16：0、C18：1和C18：2脂肪酸。脂肪酸组成的这种显著升高主要来自C18：3的消耗，其从约50-55％减少至约20-30％(作为总脂肪酸含量的百分比)。仅包含pJP3502T-DNA的植物与包含来自pOIL51和pJP3502的T-DNA的植物之间TFA水平(包括TAG水平)的大幅度提高在整个植物发育中保持。仅包含来自pJP3502的T-DNA的对照植物在开花期间包含7.7％-17.5％TAG，而TAG水平在结实期间范围为在干重基础上14.1％-20.7％。来自包含pJP3502和pOIL51T-DNA的植物的叶中的TAG含量在开花期间为6.3％-23.3％，并且在结实期间为12.6％-33.6％。如较早对营养生长阶段描述的，检测到在两个阶段TAG级分的脂肪酸组成的相似变化。在转基因植物的其他营养组织如根和茎中也发现TAG水平进一步升高。在干重基础上，用pOIL051的T-DNA转化的转基因红花烟草植物的一些根组织包含4.4％TAG，并且一些茎组织7.4％TAG(图10)。野生型植物和仅包含来自pJP3502的T-DNA的红花烟草在两个组织中表现出低很多的TAG水平。对于增加茎和根中的TAG含量，添加发夹SDP1构建体以减少内源TAG脂肪酶的表达显然与编码TAG的转录因子和生物合成的基因(WRI1和DGAT)协同作用。值得注意的是，在相同植物内根中的TAG水平与茎组织相比较低，但是在野生型植物和仅包含来自pJP3502的T-DNA的红花烟草中观察到相反趋势。根和茎组织的TAG组成表现出与以前在转基因叶组织中观察到的相似的C18：1和C18：3脂肪酸变化。当与野生型对照相比时，TAG中的C18：2水平在转基因茎组织中降低，而C16脂肪酸通常在转基因根组织中降低。因此，发明人得出结论，向WRI1和DGAT的组合添加用于沉默内源SDP1基因的外源基因在植物生长的所有阶段增加总脂肪酸含量，包括TAG含量，并且与WRI1和DGAT协同作用，特别是在茎和根中。将来自转基因植物的T1种子在室温下体外平板接种于组织培养基中以测试萌发的程度和时间。与来自用来自pJP3502的T-DNA转化的转基因植物的种子相比，来自3个独立转化的品系的T1种子的萌发相同。此外，早期幼苗活力看来不受影响。鉴于SDP1在拟南芥种子萌发中的作用以及在SDP1突变体萌发中观察到的缺陷，这是令人惊讶的(Eastmondetal.，2006)。为了克服任何萌发缺陷(如果发生这种情况)，设计第二构建体，其中SDP1抑制RNA表达自在种子中基本上不表达或以低水平表达的启动子，例如来自光合基因如SSU的启动子。发明人考虑减少对种子萌发或早期幼苗活力的有害影响的风险是有益的，避免组成型启动子，或者至少避免在种子中表达的启动子驱动SDP1抑制RNA的表达。注意到具有最高TAG水平的T0植物在高光条件下于受控环境室中(500微摩尔光强，16hr光照/26℃-8hr黑暗/18℃每天循环)生长，并且看来比野生型对照植物小(相对于用来自pJP3502的T-DNA转化的植物高度为约70％)。发明人得出结论，用于“推”、“拉”、“保护”和“包装”方法的转基因和/或遗传修饰的组合特别有利于在营养性植物部分中获得高水平的TAG。在这个实施例中，WRI1提供“推”，DGAT提供“拉”，SDP1的沉默提供“保护”，而油质蛋白提供TAG的“包装”。实施例12.转录因子的衰老特异性表达已报道胚胎和种子发育的主要调节子如LEC2的异位表达提高非种子组织中的TAG水平(Santos-Mendozaetal.，2005；Slocombeetal.，2009；Andrianovetal.，2010)。但是，用35S-LEC2基因转化的植物中LEC2的组成型过量表达导致不需要的对植物发育和形态学的多效性作用，包括体细胞胚胎发生和异常的叶结构(Stoneetal.，2001；Santos-Mendozaetal.，2005)。为了测试对植物发育的叶衰老阶段(即植物已完全长大并达到它们的完全生物质之后)限制LEC2表达是否会最小化不可取的表型效应但仍提高叶脂质水平，设计并制备嵌合DNA用于在来自SAG12基因的拟南芥衰老特异性启动子的控制下表达LEC2(U37336；GanandAmasino，1995)。为了制备遗传构建体，制备3.635kb合成DNA片段，其顺序包含拟南芥SAG12衰老特异性启动子、LEC2蛋白编码序列和大豆凝集素基因终止子/多腺苷酸化区。将这个片段插入pJP3303的SacI和NotI限制性位点之间。将这个构建体命名为pOIL049，并且在用编码WRI1、DGAT1和油质蛋白多肽的基因稳定转化的包含来自pJP3502的T-DNA的红花烟草植物的叶中测试。利用农杆菌介导的转化方法，将pOIL049构建体用来转化对于pJP3502的T-DNA是纯合的红花烟草植物细胞(实施例3)。通过潮霉素抗性选择包含来自pOIL049的基因的转基因植物并使其在温室中生长至成熟。在生长的不同阶段(包括在叶衰老时)从转基因叶组织采集样品，所述样品与红花烟草pJP3502亲本系相比包含提高的TAG水平。获得总计149株独立的T0植物(即原代转化体)。在植物发育的结实阶段将所有植物的上部绿叶和所选事件的下部褐色、完全衰老的叶采样并通过TLC-GC定量TAG含量。利用潮霉素基因特异性引物对通过ddPCR确定所选植物中pOIL49T-DNA插入的数量。在结实阶段收获的绿叶组织中观察到在干重基础上30.2％的TAG水平。在大多数采样的植物中，褐色叶中的TAG水平较低。但是，3株植物(#32b、#8b和#23c)在褐色衰老叶中表现出比绿色展开叶中大的TAG水平。这些植物包含来自pOIL49的1、2或3个T-DNA插入。通过ddPCR筛选植物#23c和#32b的T1子代以鉴定来自pOIL049的T-DNA的空、杂合和纯合植物。选择包含0个来自pOIL049的T-DNA插入(空；总计7个)或2个来自pOIL049的T-DNA的T-DNA插入(纯合；总计4个)的植物#23c的子代植物用于进一步分析。相似地，维持包含0个插入(空；总计6个)或2个插入(纯合；总计9个)的植物#32b的子代植物用于进一步分析。在开花之前采样绿叶组织并通过GC确定TFA和TAG含量。野生型植物和用来自pJP3502的T-DNA转化的植物与之前相同(实施例11)，并且使其在相同温室中一起生长。在开花之前包含来自pOIL049的T-DNA的转化体叶中的TFA水平范围为在干重基础上5.2％-19.5％(图12)。相同组织中的TAG水平范围为在干重基础上0.8％-15.4％。这比仅包含来自pJP3502的T-DNA的植物中大很多。包含来自pJP3502和pOIL049的T-DNA的植物中的TAG水平在开花和结实期间分别提高至38.5％和34.9％。当分析对于来自pOIL049的T-DNA纯合的叶的总脂肪酸含量的脂肪酸组成时，观察到升高水平的C18：2和降低水平的C18：3(图12)，同时C16：0和C18：1的百分比相对于仅用来自pJP3502的T-DNA转化的叶保持不变。这些数据证实添加非组成型启动子控制下的第二转录因子基因以提供发育调节的表达能够进一步提高植物的营养组织中的TAG水平。数据还表明衰老特异性启动子SAG12在叶衰老之前在绿色组织中有一些表达。当与野生型红花烟草植物和单独包含来自pJP3502的T-DNA的转基因植物相比时，茎组织中的TAG水平升高很多。在干重基础上，用来自pOIL049的T-DNA转化的转基因红花烟草植物的一些茎组织包含4.9％TAG(图11)。在另一方面，根组织中的TAG水平在3个pOIL049植物之间表现出大变化，一些根组织包含3.4％TAG。值得注意的是，在相同植物内根中的TAG水平与茎组织相比较低，但是在野生型植物和仅包含来自pJP3502的T-DNA的红花烟草中观察到相反趋势。根和茎组织的TAG组成表现出与以前在转基因叶组织中观察到的相似的C18：1和C18：3脂肪酸变化。当与野生型对照相比时，TAG中的C18：2水平在转基因茎组织中降低，而C16脂肪酸通常在转基因根组织中降低。制备相应的遗传构建体，其编码SAG12启动子控制下的其他转录因子，即LEC1、LEC1样、FUS3、ABI3、ABI4和ABI5等(实施例10)。例如，制备额外的构建体用于在拟南芥SAG12启动子的单子叶植物驱动的同系物如玉米SEE1启动子(Robsonetal.，2004)的控制下表达单子叶植物转录因子玉米LEC1(Shenetal.，2010)或两色高粱LEC1(Genbank登录号XM_002452582.1)。制备其他构建体用于在发育控制的启动子下表达转录因子，例如在开花时优先表达的启动子(例如日长敏感启动子)，光敏色素启动子，隐花色素启动子，或者在二次生长期间在植物茎中如来自CesA基因的启动子。将这些构建体用来转化植物，并且选择在营养性部分中产生至少8％TAG的植物。淀粉和糖水平在从野生型以及包含来自pJP3502的T-DNA，或者来自pJP3502和pOIL51或者pJP3502和pOIL049的T-DNA的转基因植物采样的叶组织中测量淀粉和可溶性糖水平。一般来说，在具有两种T-DNA的叶中在干重基础上在叶组织中的TAG和淀粉水平之间发现负相关(图13)。相反，相对于野生型，叶可溶性糖水平在转基因植物中几乎相同，表明从糖转化至TAG没有显著瓶颈。在野生型植物中观察到植物中叶位置的影响，其中淀粉水平倾向于从较低的叶向更高的叶位置升高。在转基因植物中未检测到这样的影响。实施例13.编码转录因子的基因的茎特异性表达表达编码WRI1、DGAT和油质蛋白的转基因的红花烟草植物的叶在发育的结实阶段包含约16％TAG。但是，TAG水平在植物的茎(1％)和根(1.4％)中低很多(Vanherckeetal.，2014)。发明人考虑茎和根中较低的TAG水平是否是由于用来在转基因植物中表达编码WRI1的基因的RubiscoSSU启动子的低启动子活性。pJP350的T-DNA中的DGAT转基因通过在茎和根中更强表达的CaMV35S启动子表达，因此不太可能是茎和根中TAG积累的限制因素。为了增加茎组织中的TAG生物合成，设计构建体，其中将编码WRI1的基因置于拟南芥SDP1启动子的控制下。合成3.156kb合成DNA片段，其包含1.5kb的拟南芥SDP1启动子(SEQIDNO：175)(Kellyetal.，2013)，然后是拟南芥WRI1多肽的编码区和栽培大豆凝集素终止子/多腺苷酸化区。将这个片段插入pJP3303的SacI和NotI位点之间。将所得的载体命名为pOIL050，然后将其用来通过农杆菌介导的转化，转化来自对于来自pJP3502的T-DNA是纯合的红花烟草植物的细胞。用潮霉素抗性选择植物，并且使总计86株独立的转基因植物在温室中生长至成熟。在结实阶段用转基因叶和茎组织采集样品，所述样品与用pJP3502转化的红花烟草亲本植物相比包含升高的TAG水平。实施例14.增加种子中的油含量几个组已报道在过量表达编码WRI1和DGAT1的单独基因时玉米、油菜或拟南芥的种子组织中升高的TAG水平(Shenetal.，2010；Liuetal.，2010；Weselakeetal.，2008；Jakoetal.，2001；在Liuetal.，2012进行了综述)。最近，vanErpetal.(2014)研究了WRI1和DGAT1共表达对拟南芥中种子油含量的影响。据对TAG水平从野生型和空载体对照中的38％提高至转基因系中的44％。SDP1TAG脂肪酶的沉默与WRI1和DGAT1过量表达组合将TAG水平进一步提高至高达45％。值得注意的是，虽然发现平均种子重量增加，但是每个植物的种子数量与对照植物相比较低。合成长度为约14.3kb且包含在来自编码FAE1、Conlinin1和Conlinin2的基因的种子特异性启动子控制下的编码小家鼠(M.musculus)MGAT2、拟南芥DGAT1、拟南芥WRI1和拟南芥GPAT4多肽的开发阅读框的合成DNA片段，并且将其作为NotI-PstI片段插入pJP3416。将所得的载体命名为pTV55(图14)。通过顺序去除单独的表达盒从pTV55构建一系列衍生载体，每个步骤使用限制性酶消化然后自我连接。通过PacI消化缺失GPAT4盒，导致pTV56。随后用SrfI消化去除MGAT2表达盒，获得pTV57。利用侧翼SbfI限制性位点缺失WRI1盒，导致pTV58。最后，通过用SrfI和PacI消化，然后T4DNA聚合酶处理和连接，将pTV58中的DGAT1盒交换为WRI1盒。利用SbfI从pTV57切除WRI1盒并用T4聚合酶处理。将平端WRI盒连接入SrfI-PacI消化的pTV58骨架，获得pTV59。每个载体包含e35S(包含双增强子区)：：PAT基因作为选择标记基因，提供对BASTA的抗性。总的来说，构建体包含基因的以下组合：pTV55：ProCnl1：：MGAT2+ProCnl2：：DGAT1+ProCnl1：：GPAT4+ProFAE1：：WRI1；pTV56：ProCnl1：：MGAT2+ProCnl2：：DGAT1+ProFAE1：：WRI1；pTV57：ProCnl2：：DGAT1+ProFAE1：：WRI1；pTV58；ProCnl2：：DGAT1；pTV59：ProFAE1：：WRI1。将构建体pTV55-pTV59分别引入根癌农杆菌菌株AGL1并用来通过改编自Liuetal(2012)的花序浸渍法转化亚麻荠(cv.Celine)。简单地说，将新鲜开放的花蕾浸在根癌农杆菌溶液中15see，包裹在塑料膜中并在24℃下于黑暗中放置过夜，之后移除塑料。基于可用的花的质量进行总计3-4次花序浸渍。使植物生长至成熟并收获T1种子。T1种子在土壤中萌发之后，用0.1％BASTA除草剂((250g/L草铵膦；BayerCropSciencePtyLtd，VICAustralia)喷洒建立的T1幼苗(7-10天)以选测表达PAT选择表达标记的植物。将存活的幼苗分离并转移至新鲜的土盆，并且在温室中于22±1℃(白天)和18±1℃(黑夜)下生长直至成熟。.收获T2种子并通过NMR(MQC，OxfordInstruments)测量每个品系的3个独立批次的50mg种子的油含量(其为至少95％TAG)。用干燥的包含已知量的亚麻荠种子油的Kimwipes纸在10mm直径NMR测试管中制备校准样品，以便产生基于油和纸重量的一定范围的油含量。将校准样品用封口膜密封并维持在40℃加热块中最少1小时，然后用来允许油均匀分布在组织中。用以23.4MHz的质子共振频率操作16秒的0.55Tesla磁铁和10mm直径探针测量校准样品3次。将磁铁温度保持在40℃。首先将种子样品在105℃烤箱中干燥过夜以确保水分含量少于5％。随后将样品称重，转移至10mm直径玻璃管并在40℃下温育1hr，然后进行NMR分析。通过NMR针对校准一式三份测量油含量，基于质量重量。通过数字PCR(dPCR)确定每个转化系中插入的T-DNA的拷贝数。在多个插入的情况下，首先用EcoRI和BamHI消化基因组DNA以确保T-DNA的物理分离。在dPCR多重反应中选择亚麻荠LEAFY基因(lfy)作为参考基因，并且选择标记作为靶基因。用HEX(参考基因)或FAM(靶基因)标记探针。扩增反应条件如下：95℃10min(2.5℃/s的渐变)，39个循环的94℃30s(渐变2.5℃/s)和61℃1min(渐变2.5℃/s)，98℃10min。PCR扩增之后，在QX100液滴读数器(BioRad)中测量单个液滴的荧光，并且利用QuantaSoft软件(版本1.3.2.0，BioRad)计算拷贝数。亚麻荠的转化获得与未转化的野生型对照相比在分离T2种子中表现出升高的TAG水平的多个转基因事件(图15)。有趣的是，用包含编码WRI1和DGAT1的基因的pTV57获得了最高TAG水平。MGAT2(pTV56)和MGAT2+GPAT4(pTV55)的额外插入导致与pTV55相比略低的TAG水平。拷贝数确定显示pTV57系的1个或2个T-DNA插入，其分别表现出第二高和最高的种子油含量(表14)。还将用来自pTV057的T-DNA转化的纯合T2植物与用表达种子中DHA的合成和积累需要的脂肪酸去饱和酶和延长酶的基因(WO2013/185184)转化的亚麻荠植物杂交。如通过NMR测量的，F1种子表现出与用DHA构建体转化且没有pTV57的T-DNA的亚麻荠种子相比增加的油含量。通过测量与亚麻荠DHA亲本植物相比TAG级分中的DHA水平来确定种子中的DHA含量。包含两种T-DNA的种子的总DHA含量(mgDHA/g种子)相对于仅包含DHA构建体的种子的总DHA含量增加。表14.T2种子中的油含量(％)和亚麻荠pTV57转基因事件的拷贝数(通过数字PCR)。实施例15.油体蛋白表达对TAG积累和转换的影响用pJP3502的T-DNA转化并表达编码拟南芥WRI1、DGAT1和芝麻油质蛋白的转基因的红花烟草植物在营养组织中具有升高的TAG水平。如上文实施例11所示，当编码SDP1TAG脂肪酶的内源基因在那些植物中沉默时，叶TAG水平进一步升高，这对发明人表明在保留SDP1活性的植物中发生大量TAG转换。因此，确定植物中转基因的表达水平。虽然Northern杂交印迹证实强WRI1和DGAT1表达以及一些油质蛋白mRNA表达，但是通过数字PCR和qRT-PCR的表达分析仅检测到非常低水平的油质蛋白转录物。表达分析显示与WRI1和DGAT1转基因相比，编码油质蛋白的基因表达很差。从这些实验发明人得出结论，因为由pJP3502中的T-DNA编码时油质蛋白的生成不足，叶组织中的油体未受到完全保护免于TAG分解。为了改善整个植物发育中TAG的稳定积累，设计几个pJP3502修饰，其中将油质蛋白基因取代。这些修饰的构建体如下。1.pJP3502包含编码表达很差的芝麻油质蛋白基因(SEQIDNO：176提供其补体的序列)。该基因具有可能降低表达水平的内部UBQ10内含子。为了测试这个，合成包含芝麻油质蛋白基因且缺少内部UBQ10内含子的502bp合成DNA片段并将其作为NotI片段插入pJP3502，以便取代pJP3502中包含内含子的油质蛋白基因。将所得的质粒命名为pOIL040。2.用组成型enTCUP2启动子取代驱动pJP3502中的油质蛋白基因表达的Rubisco小亚基(SSU)启动子。为此，合成包含enTCUP2启动子、油质蛋白编码区、栽培大豆凝集素终止子/多腺苷酸化区和驱动wri1表达的下游SSU启动子的前643bp的2321bp片段并将其亚克隆入pJP3502的AscI和SpeI位点，导致pOIL038。3.按照相似的策略表达工程化版本的芝麻油质蛋白基因，其包含6个引入的半胱氨酸残基(o3-3)，在enTCUP2启动子的控制下(Winichayakuletal.，2013)。合成包含enTCUP2启动子、油质蛋白o3-3蛋白编码区、栽培大豆凝集素终止子/多腺苷酸化区和驱动wri1表达的下游SSU启动子的前643bp的2298bp片段并将其亚克隆入pJP3502的AscI和SpeI位点，导致pOIL037。4.将pJP3502中芝麻油质蛋白基因侧翼的NotI位点用来交换编码花生油质蛋白3的蛋白编码区(登录号AAU21501.1)(Parthibaneetal.，2012a；Parthibaneetal.，2012b)。合成侧翼为NotI位点的包含油质蛋白3基因的528bp片段并将其亚克隆入pJP3502的各位点。将所得的载体命名为pOIL041。5.相似地，合成包含编码拟南芥油体固醇蛋白(Arab-1)(登录号AAM10215.1)(Jolivetetal.，2014)的基因的1077bpNotI侧翼片段并将其亚克隆入pJP3502的NotI位点，导致pOIL043。6.将Nannochloropsisoceanic脂滴表面蛋白(LDSP)(登录号AFB75402.1)(Vieleretal.，2012)合成为504bpNotI侧翼片段并亚克隆入pJP3502的NotI位点，获得pOIL044。7.最后，将拟南芥油体钙蛋白(CLO3)(登录号O22788.1)(Shimadaetal.，2014)合成为612bpNotI侧翼片段并亚克隆入pJP3502，导致pOIL042。如实施例1所述将这些构建体中的每个引入本氏烟草叶细胞。本氏烟草叶组织中pJP3502和pOIL040的瞬时表达导致升高TAG水平和TAG脂肪酸谱的相似变化，但是pOIL040提高TAG水平更多(与0.9％相比1.3％)。将构建体pOIL037、pOIL038、pOIL041、pOIL042和pOIL043中的每个用来通过农杆菌介导的方法稳定转化红花烟草植物(栽培种W38)。在卡那霉素抗性的基础上选择转基因植物，并且使其在温室中生长至成熟。在植物发育期间的不同阶段从转基因叶组织采集样品，所述样品包含与野生型红花烟草和用pJP3502转化的红花烟草植物相比提高的TAG水平。来自乌桕(Sapiumsebifera)的LDAP多肽的克隆和表征油质蛋白在非种子油积累植物组织如橄榄、油棕和鳄梨的中果皮不高表达(Murphy，2012)。反而，在这些组织中已鉴定脂滴相关蛋白(LDAP)可能起到与种子组织中的油质蛋白相似的作用(Hornetal.，2013)。因此发明人考虑可能油质蛋白不是最佳包装蛋白以保护植物的营养组织中来自TAG脂肪酶或其他胞质酶活性的积累的油。因此鉴定LDAP多肽并对TAG积累的增强进行评价，如下。大戟科的成员乌桕树，Sapiumsebifera的果实令发明人特别感兴趣，因为其包含种子外的富含油的组织。最近的研究(Divietal，提交发表)表明称作脂层的这种油质组织可能源自其果实的中果皮。因此，发明人查询了S.sebifera的转录物组的LDAP序列。果皮和种子组织中表达的基因的比较分析显示一组3种以前未鉴定的在脂层中高表达的LDAP基因。通过利用源自脂质组织的RNA使用3对引物RT-PCR获得编码3种LDAP的核苷酸序列。引物序列是基于3个基因中每个的整个编码区侧翼的DNA序列。引物序列为：LDAP1，5’-TTTTAACGATATCCGCTAAAGG-3’(SEQIDNO：245)和5’-AATGAATGAACAAGAATTAAGTC-3’(SEQIDNO：246)AT-3’；LDAP2，5’-CTTTTCTCACACCGTATCTCCG-3’(SEQIDNO：247)和5’-AGCATGATATACTTGTCGAGAAAGC-3’(SEQIDNO：248)；LDAP3，5’-GCGACAGTGTAGCGTTTT-3’(SEQIDNO：249)和5’-ATACATAAAATGAAAACTATTGTGC-3’(SEQIDNO：250)。S.sebifera转录物组的分析显示LDAP基因中每个的多个直系同源物，包括8个LDAP1、6个LDAP2和6个LDAP3基因，在每个基因家族内具有少于10％序列分化。将推定的肽序列比对并利用Genious软件构建系统树(图16)，连同来自其他植物物种的LDAP同系物，包括来自鳄梨的2个(Pam)、来自油棕的1个、来自银胶菊(Partheniumargentatum)的1个(Par)，来自拟南芥的2个(Ath)、来自短角蒲公英(Taraxacumbrevicorniculatum)的5个(Tbr)、来自橡胶树(Heveabrasiliensis)的3个(Hbr)，如图16所示。系统树显示SsLDAP3与来自鳄梨的LDAP1和LDAP2多肽和来自油棕的LDAP享有更大的氨基酸序列相同性，而SsLDAP1和SsLDAP2多肽更加不同。用于过量表达LDAP的遗传构建体为了测试来自S.sebifera的LDAP的功能，制备表达载体以在叶细胞中在35S启动子的控制下表达这些多肽中的每个。通过重组反应将全长SsLDAPcDNA序列插入pDONR207目的载体，用SsLDAPcDNA片段代替目的载体的CcdB和Cm(R)区。通过限制性消化分析和DNA测序证实之后，将构建体引入根癌农杆菌菌株AGL1并用于在本氏烟草叶细胞中瞬时表达和红花烟草的稳定转化。在本氏烟草叶中在35S启动子的转录控制下3个SsLDAP基因中每个的表达与35S：：AtDGAT1和35S：：AtWRI1的表达组合获得相对于用35S：：AtDGAT1和35S：：AtWRI1基因浸润的没有LDAP构建体的细胞基本上更高水平的TAG积累。TAG水平在对照细胞中的TAG水平上升高约2-倍。相对于对照细胞，在接受基因组合的细胞中观察到α-亚麻酸(ALA)水平的显著升高和降低水平的饱和脂肪酸。叶细胞中YFP融合的LDAP多肽与脂滴的共定位为了体内表征SsLDAP并观察它们的动态行为，制备表达构建体用于表达由融合至黄色荧光蛋白(YFP)的LDAP多肽组成的融合多肽。对于每个融合多肽，将YFP框内融合至SsLDAP的C-末端。将在其3’端没有终止密码子的3个LDAP基因中每个的完整开发阅读课融合至YFP序列，并且将嵌合基因插入pDONR207。通过限制性消化和DNA测序证实之后，将构建体引入根癌农杆菌菌株AGL1并用于在本氏烟草叶细胞中瞬时表达和红花烟草的稳定转化。用LDAP-YFP构建体浸润叶吸管之后3天，将来自浸润区的叶片用阳性染色脂滴的尼罗红染色，并且在共聚焦显微镜下观察以检测红色染色(脂滴)和来自YFP多肽的荧光。观察到LDAP-YFP与脂滴的共定位，表明在叶细胞中LDAP与脂滴相关。实施例16.积累高水平TAG的叶中的不同脂质池中的脂肪酸修饰发明人已描述通过共表达编码拟南芥WRI1、拟南芥DGAT1和芝麻油质蛋白的转基因产生红花烟草叶中升高水平的TAG(Vanherckeetal.，2014)。为了研究用WRI1和DGAT1基因的共表达，叶中存在的不同脂质池中的脂肪酸修饰是否可能，进行瞬时表达实验以观察酰基-CoA和酰基-PC池中的脂肪酸是否可以出现。在一实验中，将编码拟南芥脂肪酸延长酶(AtFae1)(其将C18：1-CoA延长为C20：1-CoA)的转基因的表达与编码WRI1和DGAT的基因组合以测试酰基-CoA池中的修饰。在第二个实验中，将编码拟南芥脂肪酸去饱和酶2(AtFAD2)(其将C18：1-PC去饱和为C18：2-PC)的转基因与WRI1和DGAT基因组合以测试PC池中的修饰。设计这些实验以测试植物细胞的ER中的酰基底物的可用性。如实施例1所述，编码AtFAE1的基因在本氏烟草叶中单独或与WRI1和DGAT1组合表达自CaMV35S启动子，一式三份。用包含不同基因组合的农杆菌细胞浸润之后5天收获叶样品。从叶样品提取总脂质，并且通过TLC从每个分离TAG级分。用GC利用已知量的C17：0-TAG作为内部标准确定并定量每个TAG级分的脂肪酸组成。如表15所示，当表达AtAFE1时，TAG中的C20：1比例显著提高。与对照相比，WRI1和DGAT1与AtFAE1的共表达也提高C20：1产物的水平，而总TAG量从0.8增加至14.9μg/mg叶。与没有WRI1和DGAT1组合的0.04μg/mg相比，TAG中的C20：1产物积累至高达0.96μg/mg。表15.本氏烟草叶中修饰酶的转基因表达之后修饰的脂肪酸水平。相似地，AtFAD2在本氏烟草叶中单独或者与WRI1和DGAT1组合共表达自CaMV35S启动子。如上确定并定量TAG级分的脂肪酸组成。当AtFAD2与WRI1和DGAT1共表达时，TAG中的C18：2脂肪酸的水平显著提高，从10.7％至37.9％，并且C18：1的水平从19.5％降低至7.6％。此外，当WRI+DGAT1+AtFAD2在叶中共表达时，观察到高水平的TAG(13.4μg/mg叶)。这些结果清楚证实可以通过添加脂肪酸修饰酶与至少WRI1和DGAT组合来修改脂肪酸组成和量，因此可以用于酰基-CoA和PC池中任一个或两者中产生的修饰脂肪酸产物的增加的积累，并且最终储存在营养性植物部分中的TAG中。实施例17.植物中TGD基因的沉默Li-Beissonetal.(2013)估计在拟南芥叶(16：3植物)中，叶绿体中合成的约40％的脂肪酸进入原核途径，而60％输出进入真核途径。它们在ER中去饱和之后，大约一半的这些输出的脂肪酸返回质体以支持类囊体膜的半乳糖脂合成。脂肪酸作为DAG或磷脂输出(输入)质体包括叶绿体内被膜的通透酶样蛋白TGD1。包含TGD1、2和3蛋白的拟南芥ABC脂质转运蛋白由Benningetal.(2008and2009)和最近由Rostonetal.(2012)鉴定。这种蛋白复合物定位在叶绿体内被膜中，并且提出其介导磷脂酸盐转移通过这个膜。TGD2多肽是磷脂酸结合蛋白，而TGD3是ATPase。通过遗传方法鉴定了一种新的拟南芥蛋白TGD4(Xuetal.，2008)，并且TGD4基因的失活还阻断脂质从ER转移至质体。最近的生物化学数据表明TGD4是位于叶绿体外被膜中的磷脂酸结合蛋白(WangandBenning，2012)。Xuetal.(2005)描述了拟南芥中渗漏的tgd1等位基因导致减少的植物生长和胚胎败育的高发生率。拟南芥tgd1突变体的叶组织包含升高的TAG水平，如胞质油滴。此外，在tgd1突变体的根中也发现了升高的TAG水平。未检测到种子油含量的差异。对拟南芥tgd2(Awaietal.，2006)、tgd3(Luetal.，2007)和tgd4突变体(Xuetal.，2008)已报道叶组织中相似的TAG积累。所有tgd突变体均足够渗漏或在植物发育中严重受损。TGD1沉默基于在本氏烟草转录物组中鉴定的全长mRNA转录物产生针对TGD1质体输入蛋白(importer)的沉默构建体。从本氏烟草叶cDNA扩增685bp片段，同时在5’端并入PmlI位点。将TGD1片段首先克隆入pENTR/D-TOPO(Invitrogen)，随后通过LR克隆(Gateway)插入pHELLSGATE12目的载体。将所得的表达载体命名为pOIL025，并且在本氏烟草中瞬时表达以评价TGD1基因沉默对叶TAG水平的影响。通过作为PmlI-EcoRV片段亚克隆入pOIL020的NheI(klenow)-SfoI位点将TGD1发夹构建体置于黑曲霉(A.niger)诱导型alcA启动子的控制下。将命名为pOIL026的所得载体超级转化入纯合的红花烟草pJP3502系以进一步提高叶油水平。制备其他构建体用于表达减少TGD-2、-3和-4基因表达的发夹RNA。利用这些构建体产生转化的植物，并且确定转化体中的油含量。将转化的植物与用pJP3502或如上文所述的基因的其他组成产生的转化体杂交。实施例18.在马铃薯块茎中表达基因组合pJP3506的构建制备包含用于在马铃薯块茎中表达的3个基因的遗传构建体并用于马铃薯转化。将这个构建体命名为pJP3506，并且是基于现有载体pJP3502(W02013/096993)，置换启动子以提供块茎特异性表达。pJP3506包含(i)有具有重复增强子区的35S启动子(e35S)驱动的NPTII卡那霉素抗性基因作为选择标记基因，以及3个基因表达盒，其为(ii)编码拟南芥DGAT1的35S：：AtDGAT1，(iii)编码拟南芥WRI1的B33：：AtWRI1，和(iv)编码来自芝麻的油质蛋白的B33：：芝麻油质蛋白。编码这些多肽的核苷酸序列如pJP3502中。patatinB33启动子(B33)是源自马铃薯的块茎特异性启动子，其由DrAlisdairFernie，MaxPlanckInstituteofMolecularPlantPhysiology，Potsdam，Germany提供。pJP3506的环状质粒图在图17中示出。pJP3506构建体中使用的马铃薯PatatinB33启动子序列是截短的版本，相对于GenBank登录号X14483，其从5’端缺失183个核苷酸且从3’端缺失261个核苷酸。如pJP3506中使用的patatinB33启动子的核苷酸序列给出为SEQIDNO：211。马铃薯的转化在组织培养中无菌生长的栽培种Atlantic的马铃薯幼苗(Solanumtuberosum)购自ToolangiElite，VictorianCertifiedSeedPotatoAuthority(ViCSPA)，Victoria，Australia。在包含pJP3506的根癌农杆菌菌株LBA4404的悬浮液下将茎节间切为长度约1cm的段。农杆菌细胞已生长至0.2的OD，并且用等体积的MS培养基稀释。通过在无菌滤纸上短暂印迹茎段来去除过滤的农杆菌悬浮液，然后将其置于MS培养基上并维持在24℃下2天(共培养)。然后将节间转移至补充了200μg/LNAA、2mg/LBAP和250mg/L头孢噻肟的新鲜MS培养基上。10天后当将节间转移至补充了2mg/LBAP、5mg/LGA3、50mg/L卡那霉素和250mg/L头孢噻肟的新鲜MS培养基时开始转基因愈伤组织的选择。将再生自愈伤组织的新枝切除并置于简单MS培养基上用于根诱导，然后移植入包含盆栽混合土的15cm直径盆中并在温室中生长直至植物成熟(包括块茎生长)。DNA提取和通过PCR分子鉴定转基因植物从来自温室中的植物的马铃薯叶获得直径约1cm的圆盘。将这些置于深孔微量滴定板中并冷冻干燥48hr。然后通过向每个孔添加钢球轴承并将板在Reicht组织分解器(Qiagen)中以28/sec的最大频率振荡(微量滴定板的每侧2min)，将冷冻干燥的叶样品研磨为粉末。将375μL的包含0.1MTris-HC1pH8.0、0.05MEDTA和1.25％SDS的提取缓冲液添加至包含粉状叶组织的每个孔中。65℃下温育1hr后，将187μL的6M乙酸铵添加至每个孔中，并且将混合物在4℃下储存30min，然后将板以3000rpm离心30min。将来自每个孔的340μL上清液转移至包含220μL异丙醇的新深孔微量滴定板中，并且在室温下保持5min，然后以3000rpm离心30min。将沉淀的DNA颗粒用70％乙醇洗涤，空气干燥并重悬于225μLH2O/样品中。将来自每个叶样品DNA制品的2μL添加至使用HotStarPCR系统(Qiagen)的20μLPCR反应混合物中。在PCR反应中使用基于来自对马铃薯密码子优化的拟南芥WRI1基因的5’和3’序列的一对寡核苷酸引物。它们的序列为：Nt-Wri-P3：5’-CACTCGTGCTTTCCATCATC-3’(SEQIDNO：212)和Nt-Wri-P1：5’-GAAGGCTGAGCAACAAGAGG-3’(SEQIDNO：213)。在对每个DNA样品的单独PCR反应中还使用基于对马铃薯密码子优化的拟南芥DGAT1基因的一对寡核苷酸引物。它们的序列为：Nt-DGAT-P2：5’-GGCGATTTTGGATTCTGC-3’(SEQIDNO：214)和Nt-DGAT-P3：5’-CCCAACCCTTCCGTATACAT-3’(SEQIDNO：215)。扩增进行如下：在95℃15min的初始循环，然后95℃30sec、57℃30sec和72℃60sec的40个循环。将PCR产物在1％琼脂糖凝胶上电泳以检测特异性扩增产物。马铃薯块茎的脂质分析将证实的转基因植物和未转化的对照的收获自再生马铃薯植物的块茎的薄片冷冻干燥72hr，并且分析脂质含量和组成。如下利用氯仿∶甲醇∶0.1MKC1(2∶1∶1v/v/v)从干燥的块茎组织提取总脂质。将冷冻干燥的块茎组织首先在氯仿∶甲醇(2∶1，v/v)中在包含金属球的eppendorf管中利用Reicht组织分解器(Qiagen)以29/sec的频率匀浆3min。将每个匀浆物与Vibramax10(Heidolph)以2,000rpm混合15min之后，将1/3体积的0.1MKCl溶液添加至每个样品中并进一步混合。以10,000g离心5min之后，收集包含来自每个样品的脂质的下方的相并利用N2流完全蒸发。将每个脂质制品溶于3μL的CHCl3/毫克块茎干重中。将脂质制品的等分试样装载在薄层色谱(TLC)板(20cmx20cm，Silicagel60，Merck)上，并且在己烷∶二乙醚∶乙酸(70∶30∶1，v/v/v)中显影。将TLC板用樱草灵喷洒并在UV下可视化以显示脂质斑。通过刮适当条带的二氧化硅回收TAG和PL，并且通过将材料在80℃下于1N甲醇-HCl(Supelco，Bellefonte，PA)中温育2hr来将其转化为脂肪酸甲基酯(FAME)，连同已知量的甘油三十七烷酸酯(Nu-ChekPREP’Inc.USA)作为内部标准用于脂质定量。如以前所述通过装有30mBPX70柱(0.25mm内径，0.25mm膜厚度，SGE，Austin，USA)的GC-FID(7890AGC，AgilentTechnologies，PaloAlto，CA)分析FAME(Petrieetal.，2012)。用AgilentTechnologiesChemStation软件(RevB.04.03)整合峰。在再生的约100个单独转基因系中，源自直径约2cm的年轻马铃薯块茎的脂质分析显示在来自许多转基因植物的块茎中总脂质、TAG和磷脂级分的水平升高，观察到的范围在无升高至大幅度升高之间。马铃薯块茎脂质的第一分析显示处于其发育早期的典型的野生型马铃薯块茎(直径约2cm)包含在干重基础上约0.03％的TAG。在代表16个独立转化的品系的21个单独转基因植物的块茎中，总脂质含量增加至0.5-4.7重量％(干重)(表16)。品系#69的块茎表现出最高的TAG积累，在干重基础上平均3.3％。相对于在相同发育阶段的野生型块茎，这是约100-倍增加。相同转基因系的块茎还积累最高的观察水平的磷脂，在年轻块茎中在干重基础上1.0重量％(表18)。增强的脂质积累还伴随有转基因块茎中改变的脂肪酸组成。转基因块茎始终在总脂肪酸含量和总脂肪酸含量的TAG级分中积累更高百分比的饱和和单不饱和脂肪酸(MUFA)以及较低水平的多不饱和脂肪酸(PUFA)(表17)，特别是降低水平的18：3(ALA)，其从野生型中的约17％降低至转基因块茎中的少于10％。总脂肪酸含量中的油酸(18：1)水平从野生型中的约1％升高至许多品系中的超过5％和一些块茎中的超过15％。虽然棕榈酸水平升高，但是硬脂酸(18：0)水平在最佳转基因系中降低(表16和17)。将转基因马铃薯植物保持在温室中以允许块茎继续生长。品系#69的较大块茎包含比直径约2cm的块茎更高水平的TFA和TAG。通过添加编码下调内源SDP1基因表达的沉默RNA的嵌合基因，与WRI1和DGAT基因组合，在马铃薯块茎中获得了水平进一步升高的TFA和TAG。用于转化马铃薯的其他基因组合通过TRIzol方法(Invitrogen)从新鲜发育的马铃薯(马铃薯L.cv.Atlantic)块茎提取总RNA。利用以下引物通过RT-PCR获得编码马铃薯AGPase小亚基和SDP1的cDNA的所选区域：st-AGPs1：5’-ACAGACATGTCTAGACCCAGATG-3’(SEQIDNO：251)，st-AGPa1：5’-CACTCTCATCCCAAGTGAAGTTGC-3’(SEQIDNO：252)；st-SDP1-s1：5’-CTGAGATGGAAGTGAAGCACAGATG-3’(SEQIDNO：253)，和st-SDP1-al：5’-CCATTGTTAGTCCTTTCAGTC-3’(SEQIDNO：254)。然后纯化PCR产物并将其连接至pGEMTEasv。通过DNA测序验证之后，将克隆的PCR产物直接用作靶基因序列制备发夹RNAi构建体，或者通过重叠PCR融合。随后将3个PCR片段(SDP1，AGPase，SDP+AGP)克隆入pKannibal载体，所述pKannibal载体包含特异性限制性位点以克隆正义和反义方向的期望基因。用于以正义方向克隆片段的所选限制性位点为BamHI和HindIII，而用于以反义方向插入片段的所选限制性位点为KpnI和XhoI。通过添加指导片段进入pKannibal的克隆位点的限制性位点来改变用于扩增3个靶基因片段的引物组。用Not1释放pKannibal中35S启动子和OCS终止子之间的包含靶DNA片段的表达盒，并且将其克隆入具有潮霉素作为植物选择标记的二元载体pWBVec2。如上文所述将这类二元载体引入根癌农杆菌AGL1菌株并用于马铃薯转化。实施例19.增加单子叶植物中的油含量胚乳中的表达通过利用胚乳特异性启动子在谷粒发育期间在胚乳中表达编码WRI1、DGAT和油质蛋白的基因组合来增加单子叶植物物种小麦胚乳中的油含量，并且因此增加植物谷粒中的油含量。构建体(命名为pOIL-Endo2)包含嵌合基因：(a)二穗短柄草的Glu1基因的启动子：：编码ZmWRI1多肽(SEQIDNO：35)的玉米基因的蛋白编码区：：来自大豆凝集素的终止子/多腺苷酸化区，(b)小麦的Bx17谷蛋白基因的启动子：：编码AtDGAT1多肽(SEQIDNO：1)的拟南芥基因的蛋白编码区：：来自根癌农杆菌Nos基因的终止子/多腺苷酸化区，(c)水稻的GluB4基因的启动子：：编码油质蛋白多肽的芝麻基因的蛋白编码区：：来自大豆凝集素基因的终止子/多腺苷酸化以及(d)作为选择标记基因的35S启动子：：潮霉素抗性编码区。通过农杆菌介导的转化，将构建体用来转化小麦(cv.Fielder)的未成熟胚。将接种的未成熟胚暴露于潮霉素以选择转化的新枝，然后转移至生根培养基以形成根，之后转移至土壤。获得30株转化的植物，其结出T1种子且包含来自pOIL-Endo2的T-DNA。从全部30株植物收获成熟种子，并且将每个家族的6个种子切成两半。将包含胚胎的一半储存用于以后萌发；将主要包含胚乳的另一半提取并测试油含量。插入小麦基因组的T-DNA在来自这些植物的T1种子中仍是分离的，因此T1种子是对于T-DNA纯合转化、杂合转化和空的混合物。在一些谷粒的胚乳中观察到增加的油含量，一些谷粒表现出TAG水平升高大于5-倍。与一些谷粒中2.5％的TAG含量相比，6个野生型谷粒(cv.Fielder)的胚乳一半具有约0.47重量％(范围0.37％-0.60％)的TAG含量。一些家族的全部6个谷粒具有超过1.7％的TAG；其他显然是分离的，具有野生型和升高含量的TAG。在具有升高的TAG含量的胚乳中，脂肪酸组成也改变，表现出油酸和棕榈酸百分比的增加，以及亚油酸百分比的减少(表19)。T1谷粒以与相应野生型谷粒相同的速度萌发没有困难，并且使来自14个T0家族的代表高油和低油个体的植物生长至成熟。这些植物是完全雄性和雌性可育的。所述谷粒可用于制备食品用于人消耗或作为动物饲料，提供具有增加的能量含量/单位重量(能力密度)的谷粒，并且导致动物如家禽、猪、牛、羊和马中增加的生长速度。表19.转基因小麦胚乳中TAG含量和总TAG含量(一半胚乳的重量％油)的脂肪酸组成(总脂肪酸的％)样品C14：0C16：0C16：1C16：3C18：0C18：1C18：1d11对照10.316.90.10.01.615.60.6对照20.316.00.10.11.615.10.6F5.30.120.10.10.12.623.50.6F16.30.119.10.10.12.824.20.6样品C18：2C18：3n3C20：0C20：1C22：0C24：0重量％油对照160.44.00.10.40.00.00.5对照261.34.30.10.30.00.00.49F5.348.52.40.80.70.30.42.5F16.348.12.90.70.50.30.41.8构建体pOIL-Endo2还用来转化玉米和水稻以获得在胚乳中并且因此在谷粒中具有增加的TAG含量的转基因植物。叶和茎中的表达设计一系列二元表达载体用于高粱(两色高粱)和小麦的农杆菌介导的转化以增加营养组织中的油含量。构建的起始载体是pOIL093-095、pOIL134和pOIL100-104(见实施例4)。首先，利用pOIL104作为模板和包含KpnI限制性位点的引物通过PCR扩增编码玉米WRI1多肽的DNA片段。利用KpnI位点，将这个片段亚克隆至pOIL095的组成型水稻Actin1启动子下游。将所得的载体命名为pOIL154。将玉米泛素启动子(pZmUbi)控制下的编码拉曼伞形霉DGAT2a的DNA片段作为NotI片段从pOIL134分离并插入pOIL154的NotI位点，导致pOIL155。通过利用pJP3416作为模板扩增PAT编码区构建由pZmUbi启动子控制下的PAT编码区组成且3’端侧翼为根癌农杆菌NOS终止子/多腺苷酸化区的表达盒。设计引物以在5’和3’端分别并入BamHI和SacI限制性位点。BamHI+SacI双消化之后，将PAT片段克隆入pZLUbilcasNK的各位点。将所得的中间体命名为pOIL141。然后，将PAT选择标记盒引入pOIL155骨架。为此，首先将pOIL141用NotI切割，用DNA聚合物I的Klenow片段使其变平，随后用AscI消化。然后将这个2622bp片段亚克隆入pOIL155的ZraI-AscI位点，导致pOIL156。最后，将pOIL156中驱动WRI1表达的Actin1启动子交换为玉米Rubisco小亚基启动子(pZmSSU)，导致pOIL157。通过利用pOIL104作为模板以及包含AsiSI和PmlI限制性位点的侧翼引物PCR扩增玉米SSU启动子获得这个载体。然后将所得扩增子用SpeI+MluI切割并亚克隆入pOIL156的各位点。因此这些载体包含以下表达盒：pOIL156：水稻Actin1启动子：：玉米WRI1，玉米泛素启动子：：U.rammanianaDGAT2a和玉米泛素启动子：：PATpOIL157：玉米SSU启动子：：玉米WRI1，玉米泛素启动子：：U.rammanianaDGAT2a和玉米泛素：：PAT。包含玉米SEE1衰老启动子(Robsonetal.，2004，见实施例4)、玉米LEC1转录因子(Shenetal.，2010)和两色高粱SDP1hpRNAi片段的第二系列的二元表达载体构建如下。首先，通过pDCOT的AatII+SnaBI消化和亚克隆入pORE04的AatII+EcoRV位点，将基质结合区(MAR)引入pORE04。将所得的中间载体命名为pOIL158。然后，将玉米泛素启动子控制下的PAT选择标记基因亚克隆入pOIL158。为此，首先将pOIL141用NotI消化，用DNA聚合物I的Klenow片段处理，最后用AscI消化。将所得片段插入pOIL158的AscI+ZraI位点，导致pOIL159。通过pJP3416的SwaI+SpeI限制性消化，然后亚克隆入pOIL159的SwaI+AvrII位点，将pOIL159中的原始RK2oriV复制起点交换为RiA4起点。将所得的载体命名为pOIL160。合成包含以下表达盒的10.019kb“单子叶植物衰老部分1”片段：水稻Actin1：：拟南芥DGAT1，为玉米表达密码子优化的，玉米SEE1：：玉米WRI1，玉米SEE1：：玉米LEC1。将这个片段作为SpeI-EcoRV片段亚克隆入pOIL160的SpeI-StuI位点，导致pOIL161。合成第二7.967kb“单子叶植物衰老部分2”片段并包含以下元件：MAR，玉米泛素：：靶向两色高粱/小麦SDP1的hpRNAi片段，在水稻Actin1启动子控制下的空盒。通过用拟南芥SDP1序列(登录号NM_120486)进行BLAST搜索获得2种两色高粱SDP1TAG脂肪酶的序列(登录号XM_002463620；SEQIDNO.242和XM_002458486；SEQIDNO：169)和一种小麦SDPI序列(登录号AK334547)(SEQIDNO：243)。设计合成发夹构建体(SEQIDNO：244)，其包括与小麦SDP1序列表现出最高程度相同性的两色高粱XM_002458486序列的4个片段(67bp，90bp，50bp，59bp)。此外，包括源自两色高粱XM_002463620SDP1脂肪酶的278bp片段以增加对两色高粱SDP1序列的沉默效率。将“单子叶植物衰老部分2”片段作为BsiWI-EcoRV片段亚克隆入pOIL161的BsiWI-FspI位点。将所得的载体命名为pOIL162。利用农杆菌介导的转化，将遗传构建体pOIL156pOIL157、pOIL162和pOIL163用于转化两色高粱和小麦。用潮霉素抗性选择转基因植物，并且与未转化的对照植物相比，转基因植物在营养组织中包含升高水平的TAG和TFA。这类植物可用于为动物提供饲料作为草料或青贮饲料，以及产生谷粒，或者可以用来提取油。实施例20.油的提取和生物柴油的生产从叶提取脂质从夏季的几个月中在温室中生长的植物收获用来自pJP3502的T-DNA转化的转基因烟草叶。将叶干燥，然后在提取之前研磨为1-3mm大小的片。使研磨的材料用所选溶剂进行soxhlet(回流)提取24小时，如下文所述。在每个提取实验中使用5g干燥的烟草叶材料和250ml溶剂。己烷溶剂提取己烷常用作溶剂，商业上用于从压榨油种子如油菜提取油，提取中性(非极性)脂质，因此首先尝试。来自5g叶材料的提取的脂质质量为1.47g，29重量％的脂质回收率。进行DMSO中的己烷提取的脂质的1HNMR分析。分析显示长链甘油三酯脂肪酸的典型信号，不存在芳香产物。然后使脂质进行GCMS用于鉴定主要组分。己烷提取的脂质的直接GCMS分析证明是困难的，因为沸点太高，并且材料在GCMS分解。在这样的情况下，常用的分析技术是首先制备脂肪酸的甲基酯，其进行如下：将18mg脂质提取物溶于1mL甲苯中，添加3mL的干3N甲醇HCL并在60℃下搅拌过夜。将5mL的5％NaCl和5mL的己烷添加至冷却的小瓶并振荡。去除有机层并用另一5mL的己烷重复提取。将合并的有机级分用8mL的2％KHCO3中和，分离并用Na2SO4干燥。将溶剂在N2流下蒸发，然后补足至在己烷中1mg/mL的浓度用于GCMS分析。存在的主要脂肪酸是16：0(棕榈酸，38.9％)和18：1(油酸，31.3％)。FA16：016：118：018：118：220：022：0％wt38.94.66.431.32.51.50.6丙酮溶剂提取将丙酮用作提取溶剂，因为其溶剂特性应当从叶提取几乎所有脂质，即非极性和极性脂质。丙酮提取的油看来与己烷提取的脂质相似。来自5g烟草叶的提取的脂质质量为1.59g，即31.8重量％。进行DMSO中的脂质的1HNMR分析。观察到长链甘油三酯脂肪酸的典型信号，没有芳香产物的信号。热水溶剂提取尝试将热水作为提取溶剂以观察其是否适合从烟草叶获得油。水提取的材料外观是凝胶样的，并且在冷却时胶凝。提取的质量为1.9g，或者38重量％。这种材料像厚凝胶，并且可能包括来自叶的极性化合物如糖和其他碳水化合物。进行DMSO中的材料的1HNMR分析。分析显示长链甘油三酯脂肪酸的典型信号，没有提取的芳香产物。将剩余的固体材料用己烷提取，获得20重量％的脂质，表明水提取未高效提取非极性脂质。乙醇溶剂提取将乙醇用作提取溶剂以观察其是否适合从烟草叶获得油。乙醇提取的脂质在外观上与水和己烷提取的脂质相似，颜色为黄色-红色，具有凝胶样外观，并且在冷却时胶凝。来自5g烟草的提取的脂质质量为1.88g，或者37.6重量％。乙醇溶剂还会提取烟草叶中的一些极性化合物。醚溶剂提取尝试将二乙醚作为提取溶剂，因为认为其可能提取比其他溶剂少的杂质。提取获得1.4g，或者28重量％。醚提取的脂质在外观上与己烷提取的材料相似，颜色为淡黄色，并且其的确看来比己烷提取物干净一些。虽然二乙醚提取看来给出最干净的油，但是NMR分析显示更多有机化合物的混合物。从烟草植物生产生物柴油使一批转基因烟草植物在冬季(不是其正常生长季节)生长以评价在具有较少自然光的较冷季节期间叶中的油生成。来自成熟植物的叶在干重基础上具有约10％油；比在夏季生长的植物低很多。然而，如下提取脂质并将其转化为生物柴油。方法中的阶段为：(a)粗脂质的提取，(b)从脂质纯化TAG，以及(c)将纯化的TAG转化为生物柴油。将己烷(石油醚40-60C)用作提取溶剂用于获得主要包含非极性脂质的油。将500g烟草叶材料干燥，称重然后浸泡在己烷中搅拌过夜。将混合物过滤，然后将己烷提取物用硫酸镁干燥并用活性炭处理以将油脱色。将溶液过滤，并且将所得液体在旋转式蒸发器中蒸发，导致约42克的粗油。这个颜色为黄色/绿色，并且在冷却时具有粘性一致性。将一些这种油用于尝试直接制备生物柴油，但是杂质的数量和大量的游离脂肪酸产生大量肥皂生成，其阻碍甲基化反应和产物分离。因此，在酯交换反应制备生物柴油之前将这种油进一步纯化以富集TAG级分是必需的。冬季生长的样品的一个问题是在提取的材料中存在相对高水平的游离脂肪酸(FFA)，导致产生过量的肥皂，其阻碍甲基酯和甘油产物的分离。为了纯化油中的TAG，研究了几种溶剂系统并选择80∶20的己烷/乙酸乙酯混合物适合柱色谱。利用己烷∶乙酸乙酯(80∶20)在硅胶柱上进行分离。更疏水的TAG首先从柱洗脱为橙色/黄色油。然后洗脱的是深绿色条带，包含烟草叶中的己烷可溶性组分的混合物，包括与一些TAG和FFA混合的叶绿素。用纯乙酸乙酯从柱洗涤出最终产物，主要是FFA。远离FFA和磷酸盐和其他杂质富集的纯化的TAG现在可以制备为生物柴油。这通过使TAG与甲醇在碱催化剂的存在下反应以产生甲基酯(生物柴油)和甘油作为副产物来进行。一种可选方法，酸催化的酯化可以用来使脂肪酸与醇反应以在FFA的存在下产生生物柴油，需要并不那么纯的TAG。其他方法如固定床反应器、超临界反应器和超声反应器放弃或减少化学催化剂的使用，并且也可以用于从脂质生产生物柴油。但是，碱催化的方法对于转化纯化的TAG是最经济的，仅需要低温和低压，并且产生超过98％转化收率，只要起始油的水分和游离脂肪酸低。将纯化的TAG在60℃的油温下用甲氧基金属溶液(混合直至完全溶解的NaOH和甲醇)处理。在酯交换反应发生时将混合物维持在60℃下并搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温并且两相分离，其为上部的生物柴油层和下部的甘油层。然后利用分液漏斗将相分离并回收生物柴油。高油营养组织的水热处理将营养性植物部分转化为工业产品如液体燃料的另一更直接的方法通过水热处理(HTP)。这用来将包含约30重量％TFA的转基因烟草叶材料转化为可再生的生物油，可以将所述可再生的生物油添加至常规石油精炼厂原料以产生可再生的柴油(石蜡基柴油)。石化柴油是许多碳氢化合物的混合物，主要是烷，并且定义为来自精炼厂的200-300℃的级分，通常主要包含C13-C22烃类。在通过HTP的转基因烟草叶的典型转化中，将固体转基因烟草营养性植物材料与水混合以产生16-50％的固体浓度。然后使这个浆处于270-400℃的温度和70-350巴压力下。反应时间为1-60分钟，并且进行实验，有或无NaOH和KOH作为催化剂。一旦HTP处理完成且反应冷却，将其分为3个不同产物流，即气体、固体和液体生物油。相对于原料量，生物油收率在干重基础上为25-40％。图18显示相对于相应的野生型烟草叶材料，对转基因烟草叶材料获得了大很多的生物油收率。在营养性植物部分中将脂质直接原位转化为生物油在另一系列的实验中，将HTP反应中的水组分用溶剂甲醇代替。有许多原因尝试使用甲醇，一个是尝试在一步中直接(原位)转化叶中的TAG油，在植物脂质中产生脂肪酸的甲基酯(FAME)并直接产生生物柴油。使用与以前HTP实验相同的反应条件和设备，将水用甲醇代替，反应温度为335℃，在240巴的压力下，用NaOH作为催化剂。相对于输入重量，转基因烟草营养性植物部分产生47重量％生物油，而野生型烟草产生35重量％生物油。两种所得生物油的H1NMR仅显示少量的FAME，而转基因烟草生物油的NMR显示大量的生物柴油FAME。本领域技术人员会理解，如具体实施方案所示，可以对本发明进行许多变化和/或修改而不背离广泛描述的本发明的精神或范围。因此在各方面均认为目前的实施方案是说明性而不是限制性的。本文讨论和/或引用的所有出版物均整体加入本文。本说明书中已包括的文件、条例、材料、装置、文章等的任何讨论仅为了提供本发明的上下文的目的。不应视作承认任何或所有这些事项因为其在本申请各权利要求项的优先权日之前已存在而构成了现有技术基础的一部分或是本领域中与本发明相关的常见性一般知识。参考文献Alemannoetal.(2008)Planta227：853-866.AlmeidaandAllshire(2005)TRENDSCellBiol.15：251-258.Alonsoetal.(2009)PlantCell21：1747-1761.Alonsoetal.(2010)GreenChem.12：1493-1513.Alvarezetal.(2000)Theor.Appl.Genet.100：319-327.Andreatal(2012)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.109：10107-10112.Andrianovetal.(2010)PlantBiotech.J.8：277-287.Awaietal(2006)Biochem.Soc.Trans.34：395-398.Bartlettetal.(2008)PlantMethods4：22.Baudetal.(2007)PlantJ.50：825-838.BaudandLepiniec(2010)Progr.LipidRes.49：235-249.Baumleinetal.(1991)Mol.Gen.Genet.225：459-467.Baumleinetal.(1992)PlantJ.2：233-239.Belideetal.(2013)PlantCellTiss.Org.Cult.DOI10.1007/s11240-013-0295-1.BenSaadetal.(2011)TransgenicRes20：1003-1018.Benningetal(2008)Prog.LipidRes.47：381-389.Benningetal(2009)J.Biol.Chem284：17420-17427.Bibikovaetal.(2002)Genetics161：1169-1175.BlighandDyer(1959)CanadianJournalofBiochemistryandPhysiology37：911-917.Bourque(1995)PlantSci.105：125-149.Boutilieretal.(2002)PlantCell14：1737-1749.Bouvier-Naveetal.(2000)EuropeanJournalofBiochemistry/FEBS267：85-96.Bradford(1976)Anal.Biochem.72：248-254.Broothaertsetal.(2005)Nature433：629-633.Brounetal.(1998)PlantJ.13：201-210.Browseetal.(1986)BiochemJ235：25-31.Buchanan-Wollaston(1994)PlantPhysiol.105：839-846.Busketal.(1997)PlantJ.11：1285-1295.Caoetal.(2007)J.LipidRes.48：583-591.Capuanoetal.(2007)Biotechnol.Adv.25：203-206.Chenetal(2011)PlantPhysiol.155：851-865.Chikwambaetal.(2003)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.100：11127-11132.Christie(1993)AdvancesinLipidMethodology-Two，OilyPress，Dundee，pp195-213.Chungetal.(2006)BMCGenomics7：120.Comaietal.(2004)PlantJ37：778-786.Congetal.(2013)Science339：819-823.CorradoandKarali(2009)Biotechnol.Adv.27：733-743.Courvalinetal.(1995)LifeSci.318：1207-1212.Coutuetal.(2007)TransgenicRes.16：771-781.DandikandAksoy(1998)FuelProcessTechnol.57：81-92.Darjietal.(1997)Cell91：765-775.Dauketal(2007)PlantSci.173：43-49.DulermoandNicaud(2011)Metab.Eng.13：482-491.Durrettetal.(2008)PlantJ.54：593-607.Dussertetal.(2013)PlantPhysiol.162：1337-1358.Dyeretal.(2002)PlantPhysiol.130：2027-2038.Eastmondetal.(2006)PlantCell18：665-675.Ecclestonetal(1996)Planta198：46-53.Ellerstrometal.(1996)PlantMol.Biol.32：1019-1027.Endalewetal.(2011)BiomassandBioenergy35：3787-3809.Feeneyetal.(2012)PlantPhysiol162：1881-1896.Finkelsteinetal.(1998)PlantCell10：1043-1054.Froissardetal.(2009)FEMSYeastRes9：428-438.Gan(1995)Molecularcharacterizationandgeneticmanipulationofplantsenescence.PhDthesis.UniversityofWisconsin，Madison.GanandAmasino(1995)Science270：1986-1988.Gazzarrinietal.(2004)Dev.Cell7：373-385.Ghosaletal.(2007)BiochimicaetBiophysicaActa1771：1457-1463.Ghoshetal.(2009)PlantPhysiol.151：869-881.Giddaetal(2013)PlantSignalingBehav.8：e27141.GirijashankarandSwathisree，(2009)Physiol.Mol.Biol.Plants15：287-302.GongandJiang(2011)Biotechnol.Lett.33：1269-1284.Gouldetal.(1991)PlantPhysiol.95：426-434.Greenwelletal.(2010)J.R.Soc.Interface7：703-726.Gureletal.(2009)PlantCellRep.28：429-444.HersheyandStoner(1991)PlantMol.Biol.17：679-690.Hincheeetal.(1988)Biotechnology6：915-922.Hometal.(2007)Euphytica153：27-34.Hornetal.(2013).PlantPhysiol162：1926-1936.Horvathetal.(2000)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.97：1914-1919.Huang(1996)PlantPhysiol.110：1055-1061.Ichiharaetal(1988)Biochim.Biophys.Acta958：125-129.Ikedaetal.(2006)P1BiotechJ.23：153-161.Iwabuchietal.(2003)J.Biol.Chem.278：4603-4610.Jakoetal(2001)PlantPhysiol.126：861-874.Jamesetal.(2010)Proc.Natl.Acad.Sci.USA107：17833-17838.Jepsonetal.(1994)PlantMol.Biol.26：1855-1866.Jiang，etal.(2013)NucleicAcidsResearch41(20)el88.Jingetal.(2011)BMCBiochemistry12：44.Jolivetetal.(2014)PlantPhysiol.Biochem.42：501-509.Jonesetal.(1995)PlantCell7：359-371.Karmakaretal.(2010)BioresourceTechnology101：7201-7210.Kellyetal.(2011)PlantPhysiol.157：866-875.Kellyetal(2013a)PlantBiotech.J.11：355-361.Kellyetal.(2013b)PlantPhysiol.162：1282-1289.Keresztetal.(2007)NatureProtocols2：948-952.Kimetal.(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.USA93：1156-1160.Kimetal.(2004)PlantPhysiol.134：1206-1216.Knutzonetal.(1995)PlantPhysiol.109：999-1006.Kozieletal.(1996)PlantMol.Biol.32：393-405.Kuhnetal.(2009)J.Biol.Chem.284：34092-102.Kunstetal.(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85：4143-4147.Kwongetal.(2003)PlantCell15：5-18.Lacroixetal.(2008)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.105：15429-15434.Lardizabaletal.(2008)PlantPhysiol.148：89-96.Larkinetal.(1996)TransgenicRes.5：325-335.Laurelesetal.(2002)J.ofAgric.andFoodChem.50：1581-1586.Lebrunetal.(1987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tal.(2009)PlPhysiol21：2563-2577.Zolmanetal(2001)PlantPhysiol.127：1266-1274.序列表<110>联邦科学技术研究组织<120>从植物脂质生产工业产品的方法<130>517481<150>AU2014902617<151>2014-07-07<150>AU2015900084<151>2015-01-13<150>AU2015900284<151>2015-01-30<160>254<170>PatentInversion3.5<210>1<211>520<212>PRT<213>Arabidopsisthaliana<400>1MetAlaIleLeuAspSerAlaGlyValThrThrValThrGluAsnGly151015GlyGlyGluPheValAspLeuAspArgLeuArgArgArgLysSerArg202530SerAspSerSerAsnGlyLeuLeuLeuSerGlySerAspAsnAsnSer354045ProSerAspAspValGlyAlaProAlaAspValArgAspArgIleAsp505560SerValValAsnAspAspAlaGlnGlyThrAlaAsnLeuAlaGlyAsp65707580AsnAsnGlyGlyGlyAspAsnAsnGlyGlyGlyArgGlyGlyGlyGlu859095GlyArgGlyAsnAlaAspAlaThrPheThrTyrArgProSerValPro100105110AlaHisArgArgAlaArgGluSerProLeuSerSerAspAlaIlePhe115120125LysGlnSerHisAlaGlyLeuPheAsnLeuCysValValValLeuIle130135140AlaValAsnSerArgLeuIleIleGluAsnLeuMetLysTyrGlyTrp145150155160LeuIleArgThrAspPheTrpPheSerSerArgSerLeuArgAspTrp165170175ProLeuPheMetCysCysIleSerLeuSerIlePheProLeuAlaAla180185190PheThrValGluLysLeuValLeuGlnLysTyrIleSerGluProVal195200205ValIlePheLeuHisIleIleIleThrMetThrGluValLeuTyrPro210215220ValTyrValThrLeuArgCysAspSerAlaPheLeuSerGlyValThr225230235240LeuMetLeuLeuThrCysIleValTrpLeuLysLeuValSerTyrAla245250255HisThrSerTyrAspIleArgSerLeuAlaAsnAlaAlaAspLysAla260265270AsnProGluValSerTyrTyrValSerLeuLysSerLeuAlaTyrPhe275280285MetValAlaProThrLeuCysTyrGlnProSerTyrProArgSerAla290295300CysIleArgLysGlyTrpValAlaArgGlnPheAlaLysLeuValIle305310315320PheThrGlyPheMetGlyPheIleIleGluGlnTyrIleAsnProIle325330335ValArgAsnSerLysHisProLeuLysGlyAspLeuLeuTyrAlaIle340345350GluArgValLeuLysLeuSerValProAsnLeuTyrValTrpLeuCys355360365MetPheTyrCysPhePheHisLeuTrpLeuAsnIleLeuAlaGluLeu370375380LeuCysPheGlyAspArgGluPheTyrLysAspTrpTrpAsnAlaLys385390395400SerValGlyAspTyrTrpArgMetTrpAsnMetProValHisLysTrp405410415MetValArgHisIleTyrPheProCysLeuArgSerLysIleProLys420425430ThrLeuAlaIleIleIleAlaPheLeuValSerAlaValPheHisGlu435440445LeuCysIleAlaValProCysArgLeuPheLysLeuTrpAlaPheLeu450455460GlyIleMetPheGlnValProLeuValPheIleThrAsnTyrLeuGln465470475480GluArgPheGlySerThrValGlyAsnMetIlePheTrpPheIlePhe485490495CysIlePheGlyGlnProMetCysValLeuLeuTyrTyrHisAspLeu500505510MetAsnArgLysGlySerMetSer515520<210>2<211>314<212>PRT<213>Arabidopsisthaliana<400>2MetGlyGlySerArgGluPheArgAlaGluGluHisSerAsnGlnPhe151015HisSerIleIleAlaMetAlaIleTrpLeuGlyAlaIleHisPheAsn202530ValAlaLeuValLeuCysSerLeuIlePheLeuProProSerLeuSer354045LeuMetValLeuGlyLeuLeuSerLeuPheIlePheIleProIleAsp505560HisArgSerLysTyrGlyArgLysLeuAlaArgTyrIleCysLysHis65707580AlaCysAsnTyrPheProValSerLeuTyrValGluAspTyrGluAla859095PheGlnProAsnArgAlaTyrValPheGlyTyrGluProHisSerVal100105110LeuProIleGlyValValAlaLeuCysAspLeuThrGlyPheMetPro115120125IleProAsnIleLysValLeuAlaSerSerAlaIlePheTyrThrPro130135140PheLeuArgHisIleTrpThrTrpLeuGlyLeuThrAlaAlaSerArg145150155160LysAsnPheThrSerLeuLeuAspSerGlyTyrSerCysValLeuVal165170175ProGlyGlyValGlnGluThrPheHisMetGlnHisAspAlaGluAsn180185190ValPheLeuSerArgArgArgGlyPheValArgIleAlaMetGluGln195200205GlySerProLeuValProValPheCysPheGlyGlnAlaArgValTyr210215220LysTrpTrpLysProAspCysAspLeuTyrLeuLysLeuSerArgAla225230235240IleArgPheThrProIleCysPheTrpGlyValPheGlySerProLeu245250255ProCysArgGlnProMetHisValValValGlyLysProIleGluVal260265270ThrLysThrLeuLysProThrAspGluGluIleAlaLysPheHisGly275280285GlnTyrValGluAlaLeuArgAspLeuPheGluArgHisLysSerArg290295300ValGlyTyrAspLeuGluLeuLysIleLeu305310<210>3<211>340<212>PRT<213>Ricinuscommunis<400>3MetGlyGluGluAlaAsnHisAsnAsnAsnAsnAsnAsnIleAsnSer151015AsnAspGluLysAsnGluGluLysSerAsnTyrThrValValAsnSer202530ArgGluLeuTyrProThrAsnIlePheHisAlaLeuLeuAlaLeuSer354045IleTrpIleGlySerIleHisPheAsnLeuPheLeuLeuPheIleSer505560TyrLeuPheLeuSerPheProThrPheLeuLeuIleValGlyPhePhe65707580ValValLeuMetPheIleProIleAspGluHisSerLysLeuGlyArg859095ArgLeuCysArgTyrValCysArgHisAlaCysSerHisPheProVal100105110ThrLeuHisValGluAspMetAsnAlaPheHisSerAspArgAlaTyr115120125ValPheGlyTyrGluProHisSerValPheProLeuGlyValSerVal130135140LeuSerAspHisPheAlaValLeuProLeuProLysMetLysValLeu145150155160AlaSerAsnAlaValPheArgThrProValLeuArgHisIleTrpThr165170175TrpCysGlyLeuThrSerAlaThrLysLysAsnPheThrAlaLeuLeu180185190AlaSerGlyTyrSerCysIleValIleProGlyGlyValGlnGluThr195200205PheTyrMetLysHisGlySerGluIleAlaPheLeuLysAlaArgArg210215220GlyPheValArgValAlaMetGluMetGlyLysProLeuValProVal225230235240PheCysPheGlyGlnSerAsnValTyrLysTrpTrpLysProAspGly245250255GluLeuPheMetLysIleAlaArgAlaIleLysPheSerProIleVal260265270PheTrpGlyValLeuGlySerHisLeuProLeuGlnArgProMetHis275280285ValValValGlyLysProIleGluValLysGlnAsnProGlnProThr290295300ValGluGluValSerGluValGlnGlyGlnPheValAlaAlaLeuLys305310315320AspLeuPheGluArgHisLysAlaArgValGlyTyrAlaAspLeuThr325330335LeuGluIleLeu340<210>4<211>322<212>PRT<213>Verniciafordii<400>4MetGlyMetValGluValLysAsnGluGluGluValThrIlePheLys151015SerGlyGluIleTyrProThrAsnIlePheGlnSerValLeuAlaLeu202530AlaIleTrpLeuGlySerPheHisPheIleLeuPheLeuValSerSer354045SerIlePheLeuProPheSerLysPheLeuLeuValIleGlyLeuLeu505560LeuPhePheMetValIleProIleAsnAspArgSerLysLeuGlyGln65707580CysLeuPheSerTyrIleSerArgHisValCysSerTyrPheProIle859095ThrLeuHisValGluAspIleAsnAlaPheArgSerAspArgAlaTyr100105110V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NucleotidesequenceofthecomplementofthepSSU-OleosingeneintheT-DNAofpJP3502.Inorder(complementarysequences):GlycinemaxLectinterminator348nt,3'exon255nt,UBQ10intron304nt,5'exon213nt,SSUpromoter<400>176ggcccctagaatctaattattctattcagactaaattagtataagtatttttttaatcaa60taaataataattaataatttattagtaggagtgattgaatttataatatattttttttaa120tcatttaaagaatcttatatctttaaattgacaagagttttaaatggggagagtgttatc180atatcacaagtaggattaatgtgttatagtttcacatgcattacgataagttgtgaaaga240taacattattatatataacaatgacaatcactagcgatcgagtagtgagagtcgtcttat300tacactttcttccttcgatctgtcacatggcggcggcccgcggccgcttcattactcgag360ccaggaggatggatcgatgctggtctgagaccctgctaccggttgctgactgaactgctc420ggcacggtccttcatttcacgggccttgctcgccaactttgtcttggccgactccaactg480atccgctccgggtggatgtttccccgtcaggtaacggtagatccaggacagcacagacag540agcggcaacaccaaatcccccgcttgccagaaaacccgctcccaacaggaagatggtgat600gactgcagatcagaaaaactcagattaatcgacaaattcgatcgcacaaactagaaacta660acaccagatctagatagaaatcacaaatcgaagagtaattattcgacaaaactcaaatta720tttgaacaaatcggatgatatctatgaaaccctaatcgagaattaagatgatatctaacg780atcaaacccagaaaatcgtcttcgatctaagattaacagaatctaaaccaaagaacatat840acgaaattgggatcgaacgaaaacaaaatcgaagattttgagagaataaggaacacagaa900atttacctgcagggaccagtacaggcgagaagatcaccaggagaggtgtggcgattgtca960gcgcaatgaccgttccagccagggtcaacccggataacaccaacaggctacctccggcag1020taaccgcggtcgctgcctttacaacacgctgagcacgcggttgcagttgcaagtgggggg1080cacgtgtttgttgctgctgcccgtagtgctctgccatggttttttttaacggagcaagcg1140gccgctgttcttctttactctttgtgtgactgaggtttggtctagtgctttggtcatcta1200tatataatgataacaacaatgagaacaagctttggagtgatcggagggtctaggatacat1260gagattcaagtggactaggatctacaccgttggattttgagtgtggatatgtgtgaggtt1320aattttacttggtaacggccacaaaggcctaaggagaggtgttgagacccttatcggctt1380gaaccgctggaataatgccacgtggaagataattccatgaatcttatcgttatctatgag1440tgaaattgtgtgatggtggagtggtgcttgctcattttacttgcctggtggacttggccc1500tttccttatggggaatttatattttacttactatagagctttcataccttttttttacct1560tggatttagttaatatataatggtatgattcatgaataaaaatgggaaatttttgaattt1620gtactgctaaatgcataagattaggtgaaactgtggaatatatatttttttcatttaaaa1680gcaaaatttgccttttactagaattataaatatagaaaaatatataacattcaaataaaa1740atgaaaataagaactttcaaaaaacagaactatgtttaatgtgtaaagattagtcgcaca1800tcaagtcatctgttacaatatgttacaacaagtcataagcccaacaaagttagcacgtct1860aaataaactaaagagtccacgaaaatattacaaatcataagcccaacaaagttattgatc1920aaaaaaaaaaaacgcccaacaaagctaaacaaagtccaaaaaaaacttctcaagtctcca1980tcttcctttatgaacattgaaaactatacacaaaacaagtcagataaatctctttctggg2040cctgtcttcccaacctcctacatcacttccctatcggattgaatgttttacttgtacctt2100ttccgttgcaatgatattgatagtatgtttgtgaaaactaatagggttaacaatcgaagt2160catggaatatggatttggtccaagattttccgagagctttctagtagaaagcccatcacc2220agaaatttactagtaaaataaatcaccaattaggtttcttattatgtgccaaattcaata2280taattatagaggatatttcaaatgaaaacgtatgaatgttattagtaaatggtcaggtaa2340gacattaaaaaaatcctacgtcagatattcaactttaaaaattcgatcagtgtggaattg2400tacaaaaatttgggatctactatatatatataatgctttacaacacttggattttttttt2460ggaggctggaatttttaatctacatatttgttttggccatgcaccaactcattgtttagt2520gtaatactttgattttgtcaaatatatgtgttcgtgtatatttgtataagaatttctttg2580accatatacacacacacatatatatatatatatatatattatatatcatgcacttttaat2640tgaaaaaataatatatatatatatagtgcattttttctaacaaccatatatgttgcgatt2700gatctgcaaaaatactgctagagtaatgaaaaatataatctattgctgaaattatctcag2760atgttaagattttcttaaagtaaattctttcaaattttagctaaaagtcttgtaataact2820aaagaataatacacaatctcgaccacggaaaaaaaacacataataaatttg2871<210>177<211>1578<212>DNA<213>Arabidopsisthaliana<400>177gtcacacacacataaacactccacacgctctgcttcgtccaatcaccaaacacgctttaa60tgactctcacgttttcctcctccgccgcaaccgttgccgttgctgctgcaaccgtaacct120cctccgctagggttccggtttatccactcgcttcgtcgactcttcgtggattagtatctt180tcagattaaccgcgaagaagctgtttctgccgcctcttcgttctcgcggcggcgttagtg240tgagagccatgtctgagcttgttcaggataaagaatcgtccgtcgcggcgagcattgctt300tcaatgaagccgccggtgagacgccgagtgagcttagtcattcccgtactttcttggatg360cgcgaagtgaacaagatcttttatctggtatcaagaaggaagctgaagctggaaggttgc420cagcaaatgttgcagcaggaatggaagaattgtattggaactacaaaaatgcagttttaa480gtagtggagcttccagggcagatgaaactgttgtatcaaacatgtctgttgcttttgatc540gcatgcttcttggtgtggaggatccttatacttttaatccatatcataaagcagtcagag600aaccatttgactactacatgtttgtccatacatacatccgtcctcttattgatttcaaaa660attcgtacgttggaaatgcttctatattctctgagctggaagacaagattcgacagggac720acaatatcgtgttgatatcaaaccatcaaagtgaagctgatccggctgtcatttctctat780tgcttgaagcacaatctcctttcataggagagaacattaaatgtgtggctggtgatcgag840tcatcactgatcctctttgtaagccgttcagtatgggaaggaacctcatatgtgtttact900cgaaaaagcacatgaatgatgatcctgagcttgttgacatgaaaagaaaagcaaacacac960gaagcttaaaggagatggctacaatgctaaggtctggcggtcaacttatatggattgcac1020caagcggtggaagggaccgcccgaatccttctactggggaatggtttcctgcaccctttg1080atgcttcttcggtagacaacatgagaagactggttgaacattctggcgctcctggacata1140tatatccaatgtctttgctttgctatgacatcatgccccctccaccccaggttgagaaag1200aaatcggagagaaaagattagttgggtttcacggtactggactatcaattgctcctgaaa1260tcaacttctcagacgtcacagcagactgcgagagccctaatgaggcgaaagaagcataca1320gccaagctttgtacaagtcggtgaatgaacaatacgagatcttaaactctgcgattaaac1380acagaagaggagtagaagcatcaacttcaagggtctctttgtcacaaccttggaattagt1440ctctcgttttagggtaacactttcaaaactcataaatcttctgtctcagaagttttgttg1500caactgtatatatattgagagagagagcattgttctttcatttgcaggatacacaaacac1560aatcaatggaaaatactc1578<210>178<211>459<212>PRT<213>A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