生物催化制备(S)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的方法与流程

文档序号:18786748发布日期:2019-09-29 17:57阅读:491来源:国知局
生物催化制备(S)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的方法与流程

本发明涉及一种医药中间体制备方法,尤其涉及一种生物酶催化制备(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的方法。



背景技术:

larotrectinib是由loxooncology公司和拜耳公司研发的一款广谱肿瘤药,用于所有表达有原肌球蛋白受体激酶(tropomyosinreceptorkinase,trk)的肿瘤患者,该药是一款针对特定基因突变,而不针对特定癌症种类的抗癌新药。其所能治疗的ntrk基因融合实体瘤包括乳腺癌、结直肠癌、肺癌、甲状腺癌等癌症类型。因此,larotrectinib(loxo-101)在美国获批被认为是癌症疗法从“基于癌症在体内的起源”转向“基于肿瘤的遗传特征”这一演变过程中的重要里程碑。

larotrectinib通用名为拉罗替尼,商品名为vitrakvi,结构式如式i。该药物在2016年7月13日被fda授予突破性药物资格,用于trk融合基因突变阳性的成人及儿童的不可手术切除或转移性实体瘤,2018年11月26日,被fda批准在美国上市。根据国家药监局药品审评中心(cde)网站公开信息可知,该药品以“硫酸larotrectinib胶囊”为名称的ind申请由拜耳公司申报,且已经于2019年1月14日获受理,该药在中国申报临床并获得受理,是该药在全球进行注册的又一大进展。

随着对拉罗替尼药理学研究的进一步推进,拉罗替尼的光学异构体也具备一定的市场需求。在工业化生产过程中,拉罗替尼光学异构体作为标准对照品将具备广泛的应用市场。目前拉罗替尼光学异构体并无专门的生产路线,而是作为拉罗替尼的拆分纯化副产品制备。但随着手性合成技术研究的不断伸入,作为副产物的拉罗替尼光学异构体产出逐步降低,难以满足市场需求。根据中国专利cn107987082(a)公开的一种合成拉罗替尼的工艺路线scheme1分析可知,(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷将成为制备拉罗替尼光学异构体的关键中间体。

同时,(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷也可以应用于其他化合物的合成过程中。

整合应激反应指细胞在氧化应激、氨基酸剥夺和内质网应激等情况下,通过真核细胞起始因子2(eif2α)/活化转录因子4(atf4)所介导的细胞适应反应。主要由内质网应激反应的perk途径介导,并通过整合调控蛋白质合成、折叠、细胞自噬与凋亡。可能会引起脑白质营养不良,癌症,炎性疾病,肌肉骨骼疾病,代谢疾病,或与eif2b功能受损或isr途径中的组分相关的疾病或病症。

专利wo2019090088(a1)报道一种化合物通式能够用在治疗此类疾病中,其中包含了结构式ii的化合物,含有片段(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷。此化合物目前仍然处于临床实验过程中。

综上所述,(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷不仅应用于拉罗替尼药物研究及生产领域,也会被用于一些新药研究中,因此未来将具有广泛的市场需求。

目前,仅专利cn108101820(a)报道一种制备(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的化学合成法,路线如scheme2所示。

此路线以2,5-二氟溴苯和n-甲氧基-n-甲基-4-氯丁酰胺为原料,经四步反应得到(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷,需要用到格氏试剂参与反应,且需要柱层析纯化,收率较低,不适合工业化生产。



技术实现要素:

本发明的目的在于针对现有技术的不足,运用亚胺还原酶催化5-(2,5-二氟苯基)-3,4-二氢-2h-吡咯为(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷,提高收率。

本发明采用的技术方案如scheme3所示:

进一步,生物催化制备(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的方法,其特征在于:将5-(2,5-二氟苯基)-3,4-二氢-2h-吡咯、亚胺还原酶酶粉或含有亚胺还原酶的细胞、辅酶、缓冲溶液配制成混合溶液,反应得到产物。

进一步,所述的亚胺还原酶的氨基酸序列如seqidno.1所示。

进一步,所述的亚胺还原酶的基因核苷酸序列如seqidno.2所示。

进一步,所述反应的反应时间为12~36h,优选为24h。

进一步,所述5-(2,5-二氟苯基)-3,4-二氢-2h-吡咯浓度为1~400g/l;亚胺还原酶酶粉浓度为1~10g/l,或含有亚胺还原酶的细胞的浓度为10~100g/l。

进一步,反应体系中可以加入辅酶促进反应,当采用含亚胺还原酶的细胞时,细胞内部含有少量辅酶,此时也可以不加入辅酶;某些情况下制备的亚胺还原酶酶粉中亦含有少量辅酶,此时也可以不加入辅酶。但反应体系中也可以加入辅酶进一步促进反应进行,当反应体系中加入辅酶促进反应时,所述辅酶选自nad+、nadh、nadp+、nadph或它们的组合物,优选nadp+

更进一步,添加辅酶的浓度为0.02~0.4g/l,优选为0.05~0.10g/l。

更进一步,本技术方案中所采用的辅酶,均选自尚科生物医药(上海)有限公司对外销售的辅酶产品。

进一步,所述缓冲液为磷酸钾缓冲液。

进一步,本技术方案中,所述亚胺还原酶为来源于streptomycessp.gf3587的野生型亚胺还原酶。

进一步,所述含有亚胺还原酶的细胞由基因工程菌发酵得到,所述基因工程菌为基因工程改造的大肠杆菌或酵母菌。

附图说明

图1为底物标品的常规hplc分析谱图

图2为产物标品的常规hplc分析谱图

图3为实施例3的反应液常规hplc分析谱图

图4为消旋产物标品的手性hplc分析谱图

图5为r型产物标品的手性hplc分析谱图

图6为实施例3的反应液手性hplc分析谱图

具体实施方式

下面结合具体实施例对本发明的技术内容作进一步的阐述,其目的是为了更好的理解本发明的内容,但本发明的保护范围不限于此。

实施例1亚胺还原酶的筛选

使用本公司的亚胺还原酶(ired)酶库对底物进行反应筛选,反应体系组分如下:0.1mph7.0磷酸钾缓冲液,底物1g/l,dmso10%,nadp0.2g/l,葡萄糖10g/l,gdh(葡萄糖脱氢酶)5g/l,ired酶粉10g/l。于30℃反应24h,进行hplc检测。结果显示,筛到的效果最好的酶为来自于streptomycessp.gf3587的亚胺还原酶,转化率为98.2%,手性hplc检测显示产物手性纯度为96.6%,s构型为优势构型。

实施例2亚胺还原酶细胞的制备

将含有亚胺还原酶的编码基因(seqidno.2)的基因工程菌(载体pet24a,宿主细胞e.colibl21(de3))接种至5ml含卡那霉素的lb试管培养基中活化培养(37℃培养12h),按1%接种量转接活化培养物至380ml含卡那霉素的lb液体培养基中,37℃培养od至0.6-0.8,加入iptg(终浓度0.1mm)于25℃诱导培养16h。离心收集菌体得到亚胺还原酶细胞。

实施例3使用亚胺还原酶酶粉制备(2s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷

向100ml反应体系中加入0.1mph7.0磷酸钾缓冲液,底物10g/l,dmso10%,nadp0.2g/l,葡萄糖10g/l,gdh5g/l,亚胺还原酶细胞50g/l。于30℃反应24h,进行hplc检测。底物标品的常规hplc图谱如图1所示;产物标品的常规hplc图谱如图2所示;反应液的常规hplc图谱如附图3;消旋产物的手性hplc图谱如附图4所示;r型产物标品的手性hplc图谱如附图5所示;反应液的手性hplc图谱如图6所示。底物转化率为90.6%,s型产物手性纯度为96.6%。

序列表

<110>尚科生物医药(上海)有限公司

<120>生物催化制备(s)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的方法

<160>2

<170>siposequencelisting1.0

<210>1

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<213>streptomycessp.gf3587

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