一组颅内肿瘤标志物及应用

本发明属生物和医学检验领域，涉及一组用于颅内肿瘤鉴别的标志物及应用；所涉及的基因包括：abcc4、ac006538.4、ac009065.4、ac053503.11、ac062021.1、ac068535.2、ac092675.3、ap000280.66、bmpr1aps2、cnga3、eef1a1p12、eif5ap4、fbn2、foxd3-as1、foxm1、gbx2、gpc2、gsx1、hapln1、hmgn1p37、hspb1p1、igfbpl1、lhx5-as1、linc00237、linc00519、linc00928、linc01235、lpar4、mir325hg、mstn、nfia-as2、pcdhb9、prlhr、rgs18、rp11-220c2.1、rp11-231c18.1、rp11-47i22.1、rp11-698n11.2、rp5-1056h1.2、rp5-1177m21.1、rpe65、rpl37p6、six1、sox11、tgif2-c20orf24、tmsb15a、ube2sp2、vax2、wdfy4、wdr49、znf660等51个基因。所述基因产物(蛋白、rna)表达量改变可作为颅内肿瘤鉴别的标志物，从而有利于建立颅内肿瘤鉴别的高通量、客观的分子检测方法。

背景技术：

1、颅内肿瘤包括原发性肿瘤(如神经胶质瘤等)和转移性肿瘤(如白血病脑转移、乳腺癌脑转移等)对人类健康和生命威胁极大。对于颅内原发性肿瘤还是转移性肿瘤，临床上采用的手术方案存在着巨大差异。因此，如果能快速鉴别颅内是否存在着肿瘤，是原发性肿瘤还是转移性肿瘤，具有重要的价值。病理诊断是颅内肿瘤鉴别的金标准，但病理诊断具有诊断耗时长、具有主观性、难以实现高通量等劣势。如果能建立颅内肿瘤的快速检测方法，可以辅助病理诊断，更好地服务于临床。

2、分子生物学技术具有快速、微量、高通量、客观等巨大优势。因而，用分子生物学方法对颅内肿瘤进行快速鉴别是未来的发展方向。但用于颅内肿瘤鉴别的有效标志物还有待进一步发掘。

3、生物信息学的目的是通过开放数据库，加快人类对肿瘤的认识，早日攻克肿瘤，造福于人类。在本发明中，我们利用“the cancer genome atlas(tcga)数据库研究”和gtexdata两个生物信息数据库；通过大规模筛查，我们找到一组颅内肿瘤特异性标志物，包括abcc4、ac006538.4、ac009065.4、ac053503.11、ac062021.1、ac068535.2、ac092675.3、ap000280.66、bmpr1aps2、cnga3、eef1a1p12、eif5ap4、fbn2、foxd3-as1、foxm1、gbx2、gpc2、gsx1、hapln1、hmgn1p37、hspb1p1、igfbpl1、lhx5-as1、linc00237、linc00519、linc00928、linc01235、lpar4、mir325hg、mstn、nfia-as2、pcdhb9、prlhr、rgs18、rp11-220c2.1、rp11-231c18.1、rp11-47i22.1、rp11-698n11.2、rp5-1056h1.2、rp5-1177m21.1、rpe65、rpl37p6、six1、sox11、tgif2-c20orf24、tmsb15a、ube2sp2、vax2、wdfy4、wdr49、znf660等51个基因。与正常脑组织相比，所述基因表达产物(rna，蛋白)在颅内一些肿瘤组织中表达增高；可用于颅内肿瘤与正常脑组织相鉴别。

4、基于现有技术的研究基础与现状，本技术的发明人拟提供一组用于颅内肿瘤鉴别的肿瘤标志物。本发明涉及通过所述基因组(单个或二种及以上任意组合)在颅内肿瘤组织中的表达量增高，来辅助颅内肿瘤鉴别。尤其是通过多种肿瘤标志物联合形成阵列，再与提取、检测颅内肿瘤组织中蛋白质(如免疫比浊、胶体金、免疫化学发光等)或rna(如rt-pcr、荧光定量pcr、rna array、rna sequencing等)相结合，可以为颅内肿瘤鉴别提供一种高通量、快速、有效、客观的方法。

技术实现思路

1、本发明的目的在于为“颅内肿瘤的快速鉴别”提供一组标志物。

2、本发明基于大规模颅内肿瘤基因表达谱的分析，筛查出一组颅内肿瘤特异性的肿瘤标志物，包括：abcc4、ac006538.4、ac009065.4、ac053503.11、ac062021.1、ac068535.2、ac092675.3、ap000280.66、bmpr1aps2、cnga3、eef1a1p12、eif5ap4、fbn2、foxd3-as1、foxm1、gbx2、gpc2、gsx1、hapln1、hmgn1p37、hspb1p1、igfbpl1、lhx5-as1、linc00237、linc00519、linc00928、linc01235、lpar4、mir325hg、mstn、nfia-as2、pcdhb9、prlhr、rgs18、rp11-220c2.1、rp11-231c18.1、rp11-47i22.1、rp11-698n11.2、rp5-1056h1.2、rp5-1177m21.1、rpe65、rpl37p6、six1、sox11、tgif2-c20orf24、tmsb15a、ube2sp2、vax2、wdfy4、wdr49、znf660等51个基因。所述基因组(mrna、蛋白质)的高表达与颅内肿瘤的出现期密切相关，可用于鉴别颅内肿瘤以及鉴别是否为神经胶质瘤。

3、s1.单独利用所述基因表达量改变来鉴别颅内肿瘤的存在以及鉴别是否为神经胶质瘤。

4、s2.联合所述基因(两个及两个以上的任意组合)的表达量改变来鉴别颅内肿瘤的存在以及鉴别是否为神经胶质瘤。

5、s3.所述基因(单个或任意组合)与其它指标相结合后，来鉴别颅内肿瘤的存在以及鉴别是否为神经胶质瘤。

6、本发明中研究显示：与其对应的正常组织相比，所述基因的表达量在颅内肿瘤组织中增高；而且一些基因在神经胶质瘤中特异性增高，可以将神经胶质瘤和转移性肿瘤区分开。

7、本发明涉及到检测所述基因表达产物包括：蛋白质和rna；既包括肿瘤细胞中的，也包括各种原因进入体液中的rna、蛋白质以及外泌体中的rna、蛋白，包括完整和片段(蛋白质、rna)。

8、本发明所涉及的用于分析的生物样品包括颅内肿瘤组织、体液(包括脑脊液等)等。

9、本发明所涉及的所述基因蛋白检测包括直接提取脑病变组织或脑脊液蛋白经化学或免疫学方法进行检测和免疫组化分析。本发明涉及的基因产物的检测方法涉及：免疫组化、免疫荧光、western blot、elisa、流式细胞术检测、rt-pcr、胶体金、免疫学检测、化学法检测、荧光定量pcr、巢式pcr、多重pcr、数字pcr、rna sequencing、rna array等检测技术，但不仅限于这些技术)、基因甲基化检测(包括各种检测基因甲基化的方法)等。

10、本发明的有益效果是：

11、病理形态学是诊断颅内肿瘤的金标准，然而病理形态学诊断具有耗时长、主观性强、难以自动化等劣势。在本发明中，我们提供了一组用于颅内肿瘤鉴别的分子生物学标志物。该标志物在颅内肿瘤中高表达，在正常脑组织中表达较低，对颅内肿瘤存在的鉴别具有特异性。该标志物(单独或任意组合)可直接用于颅内肿瘤的鉴别。另一方面，通过多种肿瘤标志物联合形成阵列，再与提取、检测颅内肿瘤组织中蛋白质(如免疫比浊、胶体金、免疫化学发光等)或rna(如rt-pcr、荧光定量pcr、rna array、rna sequencing等)等相结合，可以为颅内肿瘤的鉴别提供一种快速、高通量、有效、客观的方法。