本发明涉及生物,特别是涉及一种胃癌的生物标志物、核酸产品和试剂盒。
背景技术:
1、胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,据统计,在全球范围内,2020年有超过一百万的人口被确诊为胃癌,同时有约77万人有胃癌而死亡,胃癌严重威胁着人类健康并给患者家庭造成巨大的医疗负担。
2、胃癌的疾病分期是重要的预后参考因素,早期胃癌患者的5年生存率高达95%,而晚期胃癌患者的5年生存率在20%左右,且患者的中位生存期仅约9~10个月。由于缺乏早期筛查方案,胃癌患者往往在晚期才被确诊,预后较差。因此,早期筛查和诊断对于胃癌的预防和治疗具有十分重要的意义。
3、目前常用的筛查方法包括影像学检查、电子纤维胃镜和血清学检查等,其中,纤维内镜检查与活体组织病理学检查联用是目前临床上用于诊断胃癌的标准方法。影像学筛查胃癌,例如计算机x射线断层造影(computer tomography,ct),通常用于检查胃癌的发展及转移情况,但是胃癌患者在早期往往没有明显的临床症状,因此仅用影像学检查难以对其进行准确诊断。电子纤维胃镜作为侵入性检查,严重依赖检验设备和内镜医师资源。随着胃癌早期表现的无特异性和多样化,以及各地医师经验技巧的不同,导致其漏诊率波动在8%~35%。对患者来说,胃镜检查过程痛苦,接受度低。而血清学检查癌胚抗原(cea)、糖类抗原(ca19-9、ca72-4)、胃蛋白酶原等肿瘤标志物的方法,检测灵敏度低,因而其临床应用价值有限。
技术实现思路
1、基于此,有必要针对血清学筛查中肿瘤标志物的灵敏度低的问题,提供一种胃癌的生物标志物,通过检测该生物标志物的甲基化水平来诊断胃癌,可以改善传统生物标志物对胃癌检测灵敏度低的问题。
2、此外,还提供一种上述生物标志物在制备用于诊断胃癌的试剂或试剂盒中的应用、诊断胃癌的核酸产品和试剂盒。
3、一种胃癌的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物为gngt1基因,通过检测所述生物标志物的甲基化水平诊断胃癌。
4、经本研究发现,以gngt1基因作为胃癌的生物标志物,通过检测gngt1基因的甲基化水平来诊断或辅助诊断胃癌,具有较高的灵敏度和特异性,可以有效地提高早期胃癌的检出率。
5、用于检测如上述的生物标志物的甲基化水平的试剂在制备用于诊断胃癌的产品中的应用。
6、一种核酸产品,包括用于检测gngt1基因甲基化水平的检测引物对。
7、在其中一个实施例中,以grch38.p13为参考,所述核酸产品包括用于检测chr7:93890055~93890872区域的甲基化水平的检测引物对。
8、在其中一个实施例中,所述核酸产品包括用于检测chr7:93890055~93890731区域的甲基化水平的检测引物对。
9、在其中一个实施例中,所述核酸产品还包括与所述检测引物对对应的检测探针,所述检测探针上连接有荧光基团。
10、在其中一个实施例中,所述检测引物对包括以下引物对中的至少一组:
11、用于检测chr7:93890057~93890181区域内的正链的甲基化水平的第一引物对、用于检测chr7:93890190~93890344区域内的正链的甲基化水平的第二引物对、用于检测chr7:93890354~93890523区域内的正链的甲基化水平的第三引物对、用于检测chr7:93890536~93890731区域内的正链的甲基化水平的第四引物对、用于检测chr7:93890734~93890871区域内的正链的甲基化水平的第五引物对、用于检测chr7:93890860~93890751区域内的负链的甲基化水平的第六引物对、用于检测chr7:93890744~93890658区域内的负链的甲基化水平的第七引物对、用于检测chr7:93890653~93890493区域内的负链的甲基化水平的第八引物对、用于检测chr7:93890468~93890300区域内的负链的甲基化水平的第九引物对和用于检测chr7:93890288~93890055区域内的负链的甲基化水平的第十引物对。
12、在其中一个实施例中,所述第一引物对的核苷酸序列如seq id no:1~seq idno:2所示;和/或,所述第二引物对的核苷酸序列如seq id no:3~seq id no:4所示;和/或,所述第三引物对的核苷酸序列如seq id no:5~seq id no:6所示;和/或,所述第四引物对的核苷酸序列如seq id no:7~seq id no:8所示;和/或,所述第五引物对的核苷酸序列如seq id no:9~seq id no:10所示;和/或,所述第六引物对的核苷酸序列如seq idno:11~seq id no:12所示;和/或,所述第七引物对的核苷酸序列如seq id no:13~seqid no:14所示;和/或,所述第八引物对的核苷酸序列如seq id no:15~seq id no:16所示;和/或,所述第九引物对的核苷酸序列如seq id no:17~seq id no:18所示;和/或,所述第十引物对的核苷酸序列如seq id no:19~seq id no:20所示。
13、在其中一个实施例中,与所述第一引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq idno:21所示;和/或,与所述第二引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:22所示;和/或,与所述第三引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:23所示;和/或,与所述第四引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:24所示;和/或,与所述第五引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:25所示;和/或,与所述第六引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:26所示;和/或,与所述第七引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:27所示;和/或,与所述第八引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:28所示;和/或,与所述第九引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:29所示;和/或,与所述第十引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:30所示。
14、一种诊断胃癌的试剂盒,包括上述的核酸产品。
15、在其中一个实施例中,所述试剂盒还包括核酸提取试剂、甲基化转化试剂、质控品、pcr反应试剂和测序试剂中的至少一种。
1.一种胃癌的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物为gngt1基因,通过检测所述生物标志物的甲基化水平诊断胃癌。
2.用于检测如权利要求1所述的生物标志物的甲基化水平的试剂在制备用于诊断胃癌的产品中的应用。
3.一种核酸产品,其特征在于,包括用于检测gngt1基因甲基化水平的检测引物对。
4.根据权利要求3所述的核酸产品,其特征在于,以grch38.p13为参考,所述核酸产品包括用于检测chr7:93890055~93890872区域的甲基化水平的检测引物对。
5.根据权利要求4所述的核酸产品,其特征在于,所述核酸产品包括用于检测chr7:93890055~93890731区域的甲基化水平的检测引物对。
6.根据权利要求3~5任一项所述的核酸产品,其特征在于,所述核酸产品还包括与所述检测引物对对应的检测探针,所述检测探针上连接有荧光基团。
7.根据权利要求6所述的核酸产品,其特征在于,所述检测引物对包括以下引物对中的至少一组:
8.根据权利要求7所述的核酸产品,其特征在于,所述第一引物对的核苷酸序列如seqid no:1~seq id no:2所示;和/或,所述第二引物对的核苷酸序列如seq id no:3~seqid no:4所示;和/或,所述第三引物对的核苷酸序列如seq id no:5~seq id no:6所示;和/或,所述第四引物对的核苷酸序列如seq id no:7~seq id no:8所示;和/或,所述第五引物对的核苷酸序列如seq id no:9~seq id no:10所示;和/或,所述第六引物对的核苷酸序列如seq id no:11~seq id no:12所示;和/或,所述第七引物对的核苷酸序列如seqid no:13~seq id no:14所示;和/或,所述第八引物对的核苷酸序列如seq id no:15~seq id no:16所示;和/或,所述第九引物对的核苷酸序列如seq id no:17~seq id no:18所示;和/或,所述第十引物对的核苷酸序列如seq id no:19~seq id no:20所示。
9.根据权利要求8所述的核酸产品,其特征在于,与所述第一引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:21所示;和/或,与所述第二引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:22所示;和/或,与所述第三引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq idno:23所示;和/或,与所述第四引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:24所示;和/或,与所述第五引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:25所示;和/或,与所述第六引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:26所示;和/或,与所述第七引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:27所示;和/或,与所述第八引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:28所示;和/或,与所述第九引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:29所示;和/或,与所述第十引物对对应的检测探针的核苷酸序列如seq id no:30所示。
10.一种诊断胃癌的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3~9任一项所述的核酸产品。
11.根据权利要求10所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括核酸提取试剂、甲基化转化试剂、质控品、pcr反应试剂和测序试剂中的至少一种。