本发明属于微生物分子诊断领域,具体涉及一种氧化石墨烯-多重qpcr检测新型冠状病毒的试剂盒和方法。
背景技术:
1、新型冠状病毒主要通过呼吸道传播,在人群中极易传播,容易造成聚集性感染,因此检测新冠病毒尤为重要。目前,反转录定量聚合酶链反应(rt-qpcr)被认为是新型冠状病毒检测的金标准。然而,传统的rt-qpcr不能充分满足筛查新型冠状病毒感染的临床需求,并增加了新型冠状病毒二次传播的潜在风险。多重qpcr可同时检测不同的目标基因,但由于系统的复杂性和不同扩增反应之间可能存在的干扰,其在临床诊断中的应用较少。因此,需要一种新型的或改进的、高灵敏度的多重qpcr系统来提高新型冠状病毒检测的准确性。
2、go是石墨烯的氧化衍生物,具有六角形蜂窝结构的sp2区域和与含氧官能团相连的sp3碳基区。sp2区域使go对芳香族具有亲和力,并具有荧光淬灭能力。此外,连接到sp3区域的亲水基团使go在水溶液中稳定。go通过π-π堆叠和氢键来吸附ssdna。基于这一特性,有研究表明go-qpcr在疾病诊断中具有良好的检测性能;另外,目前也有利用go提高多重pcr反应灵敏度和特异性的报道,例如公开号为cn105603055a的中国专利申请,在多重pcr反应体系中直接添加go,提高了目标产物的特异性和产量,有助于抑制非特异性扩增,但其所用的go的自身性能特点未知。
3、然而,对于多重qpcr检测而言,体系组成比多重pcr更为复杂,影响因素众多,特别是go自身的性能、制备工艺及其在反应体系中的用量等参数会对多重qpcr检测效果带来何种影响难以预料,如何更显著地提升多重qpcr检测的灵敏度和特异性,提高对新型冠状病毒检测的准确性,仍需要进一步探索。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种灵敏度很高的氧化石墨烯-多重qpcr检测新型冠状病毒的试剂盒和方法。
2、本发明提供了一种氧化石墨烯,所述氧化石墨烯中sp2杂化的碳原子与sp3杂化的碳原子的数量比为1:(0.5~1.5)。
3、进一步地,上述氧化石墨烯中sp2杂化的碳原子与sp3杂化的碳原子的数量比为1:1。
4、进一步地,上述氧化石墨烯是嵌锰石墨溶液与双氧水反应制备而成,所述嵌锰石墨溶液和双氧水的体积比为5:(1~5),优选为5:2.5;
5、所述嵌锰石墨溶液按照如下方法制备而成:
6、(1)石墨粉、硝酸钾加入浓硫酸混匀得到体系a;高锰酸钾、硝酸钾和浓硫酸混匀得到体系b;
7、(2)将体系b分次加入体系a中,混匀后密封,自然沉降20~40天后再搅拌均匀。
8、本发明还提供了一种氧化石墨烯-引物复合体,它是上述的氧化石墨烯与基因引物复合而成,所述基因引物是新型冠状病毒特异性靶基因的引物。
9、进一步地,上述基因引物是新型冠状病毒rdrp基因和/或e基因的正向引物;优选地,所述rdrp基因正向引物序列如seq id no.1所示;所述e基因正向引物序列如seq idno.4所示。
10、进一步地,上述复合体是氧化石墨烯溶液与基因引物混合后50℃孵育25~35分钟,再超声25~35分钟制备而成;所述氧化石墨烯溶液浓度为5.21~23.46μg/ml,优选为10.11~13.44μg/ml,更优选为13.44μg/ml。
11、本发明还提供了一种检测新型冠状病毒的试剂盒,包括上述的氧化石墨烯-引物复合体。
12、进一步地,上述氧化石墨烯-引物复合体是氧化石墨烯分别与新型冠状病毒rdrp基因和e基因的正向引物复合而成的复合体;所述试剂盒还包括新型冠状病毒rdrp基因和e基因的反向引物;所述rdrp基因反向引物序列如seq id no.2所示;所述e基因反向引物序列如seq id no.5所示;
13、优选的,所述试剂盒还包括新型冠状病毒rdrp基因和e基因的检测探针,所述rdrp基因的检测探针序列如seq id no.3所示,所述e基因的检测探针序列如seq id no.6所示;所述检测探针修饰有荧光报告基团和荧光淬灭基团;
14、更优选地,所述试剂盒还包括内参基因的正向引物、反向引物和检测探针;所述检测探针修饰有荧光报告基团和荧光淬灭基团。所述内参基因优选为rnase p基因,所述rnase p基因的正向引物序列如seq id no.7所示,反向引物序列如seq id no.8所示,探针序列如seq id no.9所示。
15、进一步地,上述试剂盒还包括探针预混液、无酶水。
16、本发明还提供一种检测新型冠状病毒的方法,包括如下步骤:
17、(1)上述试剂盒的组分与待测样本混匀,孵育;
18、(2)检测扩增产物;所述检测是琼脂糖凝胶电泳、荧光检测或胶体金试纸条检测;
19、优选地,所述试剂盒包括型冠状病毒rdrp基因、e基因和rnase p基因的检测探针;所述检测扩增产物是荧光检测,更优选为实时荧光pcr检测。
20、本发明的有益效果:本发明采用改良的hummers方法调节go氧化程度制备得到具有适当的sp2和sp3比例的go,用其吸附目标基因的正向引物构建go-正向引物复合体,应用于多重qpcr检测新型冠状病毒的反应体系中,与其他sp2和sp3比例的go-正向引物复合体建立的多重qpcr检测新型冠状病毒的反应体系相比,检测灵敏度显著提升;同时,还兼具优异的特异性,可以实现对新型冠状病毒的快速、灵敏、准确检测,具有推广应用价值。
21、本发明术语“浓硫酸”是指浓度大于或等于70%的硫酸溶液,最常用浓硫酸的浓度为98%。
22、“新型冠状病毒”指sars-cov-2。
23、本发明“rdrp基因”是:the rna-dependent rna polymerase(rdrp)gene;基因id:30897989。
24、“e基因”是envelope(e)coding gene;基因id:43740570。
25、“rnase p基因”是:the human ribonuclease p gene;基因id:10556。
26、显然,根据本发明的上述内容,按照本领域的普通技术知识和惯用手段,在不脱离本发明上述基本技术思想前提下,还可以做出其它多种形式的修改、替换或变更。
27、以下通过实施例形式的具体实施方式,对本发明的上述内容再作进一步的详细说明。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实例。凡基于本发明上述内容所实现的技术均属于本发明的范围。
1.一种氧化石墨烯,其特征在于,所述氧化石墨烯中sp2杂化的碳原子与sp3杂化的碳原子的数量比为1:(0.5~1.5)。
2.如权利要求1所述的氧化石墨烯,其特征在于,所述氧化石墨烯中sp2杂化的碳原子与sp3杂化的碳原子的数量比为1:1。
3.如权利要求1或2所述的氧化石墨烯,其特征在于,所述氧化石墨烯是嵌锰石墨溶液与双氧水反应制备而成,所述嵌锰石墨溶液和双氧水的体积比为5:(1~5),优选为5:2.5;
4.一种氧化石墨烯-引物复合体,其特征在于,它是权利要求1~3任一项所述的氧化石墨烯与基因引物复合而成,所述基因引物是新型冠状病毒特异性靶基因的引物。
5.如权利要求4所述的复合体,其特征在于,所述基因引物是新型冠状病毒rdrp基因和/或e基因的正向引物;优选地,所述rdrp基因正向引物序列如seq id no.1所示;所述e基因正向引物序列如seq id no.4所示。
6.如权利要求4所述复合体,其特征在于,它是氧化石墨烯溶液与基因引物混合后50℃孵育25~35分钟,再超声25~35分钟制备而成;所述氧化石墨烯溶液浓度为5.21~23.46μg/ml,优选为10.11~13.44μg/ml,更优选为13.44μg/ml。
7.一种检测新型冠状病毒的试剂盒,其特征在于,包括权利要求4~6任一项所述的氧化石墨烯-引物复合体。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述氧化石墨烯-引物复合体是氧化石墨烯分别与新型冠状病毒rdrp基因和e基因的正向引物复合而成的复合体;所述试剂盒还包括新型冠状病毒rdrp基因和e基因的反向引物;所述rdrp基因反向引物序列如seq id no.2所示;所述e基因反向引物序列如seq id no.5所示;
9.如权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括探针预混液、无酶水。
10.一种检测新型冠状病毒的方法,其特征在于,包括如下步骤: