本发明涉及一种用于检测某种病毒的检测试剂盒,确切讲本发明是一种用于检测g3型猪博卡病毒的试剂盒。
背景技术:
1、博卡病毒( bocavirus)属于细小病毒科( parvoviridae)细小病毒亚科( parvovirinae)博卡病毒属( bocavirus),分为两个亚种:牛细小病毒( bovine parvovirus)与犬微小病毒( canine minutevirus)。2009年,瑞典科学家首次运用随机多重置换扩增方法在pmws(断奶仔猪多系统衰竭综合征)的患病猪淋巴结中扩增出了一段长为1879bp的基因序列,并经过高通量测序技术发现其完整的np1基因及部分vp基因并将其命名为猪博卡病毒(blomstrom al, et al.2009)。猪博卡病毒是单链线性无囊膜dna病毒,基因组大小为4786~5905bp。基因组编码3个开放阅读( orf ),orf1阅读框在5’末端,编码非结构蛋白ns1,该蛋白在病毒基因组的复制过程中起到重要作用(乔涵等,2015)。orf2阅读框位于3’末端编码2个衣壳蛋白vp1和vp2,他们是病毒主要的抗原蛋白(lupescu a,etal.2006)。orf3阅读框位于病毒基因组的中间,编码磷酸化的非结构蛋白np1(sun y,etal.2009)。
2、2012年,yang等将所发现的pbov毒株划分为了3个基因群pbovg1、pbovg2和pbovg3,该方法弥补了之前分型方法的不足,可将所有的pbov毒株划分在内,且同种群毒株之间相似度高。2013 年国际病毒分类委员会(ictv)将猪博卡病毒分为pbov2、pbov3、pbov4、pbov5,共4个种群。2015年,国内学者陈如敬等基于vp1基因将猪博卡病毒分为g1、g2、g3,3个基因群。目前将猪博卡病毒划分为 3个大的种群(g1、g2、g3)的分型研究被国内外学者所接受,应用较为广泛的。
3、根据相关研究报道,pbov感染猪后可引起仔猪发生腹泻,同时也会引起其发生呼吸道系统疾病,并具有高发病率和死亡率。其发病特点与感染猪的年龄密切相关,日龄较小的猪群更容易感染。研究表明,目前我国流行的猪博卡病毒基因型主要为pbov g3。
4、猪博卡病毒在全基因扩增、流行病学等方面已经取得了较大进展,但是在病毒分离、致病性等方面的研究还比较薄弱。针对猪博卡病毒的病原学检测方法主要有常规pcr、nanopcr、实时荧光定量pcr(sybrgreenⅰ和
5、 taq
6、man探针)和lamp等。中国专利申请cn105219887a、cn105803114a 、cn105755176a分别公开了猪博卡病毒检测技术。但是它们都是针对g3基因型几条毒株的基因序列,不具有检测g3基因型毒株的广谱性。因此有必要开发出一种具有广谱性检测猪博卡病毒g3基因型毒株的实时荧光定量pcr快速检测试剂盒,在准确检测和疾病防控等方面具有重要的应用前景。
技术实现思路
1、本发明提供一种操作简单快速、特异性强、敏感性高的检测猪博卡病毒g3基因群的检测试剂盒。
2、本发明的一种检测g3型猪博卡病毒的检测试剂盒是一种taqman荧光定量pcr检测试剂盒,试剂盒内至少有序列为seq id no.1、seq id no.2的引物对和序列为seq id no.3的探针。
3、本发明检测试剂盒具有使用简便快捷、检测特异性强、敏感性高、结果判断容易,可以用于猪博卡病毒的诊断、流行病学和分子生物学研究等多个领域的优点。
1.一种检测g3型猪博卡病毒taqman荧光定量pcr检测试剂盒,其特征在于试剂盒内至少有序列为seq id no.1、seq id no.2的引物对和序列为seq id no.3的探针。
2.根据权利要求1所述的检测g3型猪博卡病毒taqman荧光定量pcr检测试剂盒,其特征在于试剂盒内还有pcr缓冲液、dntp、taq酶和双蒸水。