本发明属于生物检测,尤其涉及一种快速检测人腺病毒14型的引物、探针及试剂盒。
背景技术:
1、人腺病毒(hadv)是双链无包膜dna病毒,具有高度传染性,可在人群中引起广泛的疾病,如急性呼吸道感染、急性胃肠炎、流行性角膜结肠炎和泌尿生殖系统疾病等。hadv分为7个亚组(hadv-a至hadv-g),包括100多种血清型,不同的hadv血清型会引起不同的临床综合征,在这些血清型中,hadv-b种病毒(hadv-3、-7、-11、-14、-55)和hadv-e(hadv-4)是导致呼吸道感染的主要病原体,开发快速、灵敏、特异的hadv-14诊断方法及时诊断hadv-14,对于控制hadv-14感染至关重要。
2、目前针对hadv的检测方法主要包括病毒分离培养法、血清学检测和分子生物学检测。病毒分离法是通过观察特征性细胞致病作用(cpe)来检测腺病毒,被认为是诊断腺病毒的“金标准”,但其培养细胞耗时较长,对技术水平要求较高,不能满足临床快速诊断的需求,也不适用于现场的疾病快速诊断;血清学检测对设备等要求条件较低,可以快速检测出病毒,但该方法依赖于特异性抗体,稳定性差且灵敏度低;随着分子诊断技术的发展,以聚合酶链反应(pcr)为基础的变温扩增技术(如pcr、实时荧光定量pcr、巢式pcr等)已经成为检测腺病毒感染的常用工具,这些方法具有灵敏度高、特异强等优点,即便核酸含量较少也能检测,但其操作过程繁琐,它们需要热循环仪和训练有素的操作人员,难以在缺乏精密仪器设备、医疗资源相对有限的地区和医院实现;与以聚合酶链反应(pcr)为基础的变温扩增技术相比,核酸等温扩增方法简单、快速且具有成本效益,重组酶介导等温扩增技术(recombinase aided amplification,raa)是一种新型的等温核酸扩增技术,包含三种重要的蛋白质:重组酶、单链dna结合蛋白和dna聚合酶,在raa过程中,反应体系中的重组酶与引物结合形成复合物,在dna模板中寻找同源序列,一旦同源序列定位,发生链交换反应,ssb与单链dna结合稳定dna单链,dna聚合酶启动dna扩增,raa可在恒定温度下,5-30分钟完成基因扩增,与pcr相比,该过程不需要高温变性或低温退火,反应简单、快速、高效。
3、申请号为201910029711.4的中国专利公开了一种基于raa荧光法快速检测呼吸道腺病毒的引物、探针及检测试剂盒,能够准确地检测出呼吸道腺病毒,操作方便,检测时间短。但是该方法只能检测出呼吸道腺病毒,却不能对呼吸道腺病毒进行分型,无法确定患者感染的是哪种亚型腺病毒。
4、鉴于现存的hadv-14病毒检测方法的不足以满足hadv-14病毒快速现场检测的需求,因此研究一种能在基层应用、可在常温下快速检测hadv-14病毒的扩增方法非常有必要。
技术实现思路
1、本发明实施例的目的在于提供一种快速检测人腺病毒14型的引物,旨在解决上述背景技术中提出的问题。
2、本发明实施例是这样实现的,一种快速检测人腺病毒14型的引物,所述引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物的核苷酸序列为gcgaacagatagttacaaggagattcagtt(如seq id no.1所示);所述下游引物的核苷酸序列为gagatacagagccacattggaataaaggaa(如seq id no.2所示)。
3、本发明实施例的另一目的在于提供一种快速检测人腺病毒14型的探针,所述探针的核苷酸序列为gagaccaagcttggaaagatgtaaatccaaa[fam-dt][thf]g[bhq1-dt]atcagtgaacttgttaag[c3spacer](如seq id no.3所示)。
4、本发明实施例的另一目的在于提供一种快速检测人腺病毒14型的试剂盒,所述试剂盒包括上述引物和如上述探针。
5、优选地,所述试剂盒还包括缓冲液。
6、本发明实施例的另一目的在于提供一种上述试剂盒在基于raa荧光法快速检测人腺病毒14型中的应用。
7、本发明实施例针对hadv-14的hexon基因设计特异性引物和探针,具有较好的灵敏性和特异性,其能够配合raa技术对待测样品中是否含有14型腺病毒进行快速、准确的检测,实现了对14型腺病毒进行准确、快速、灵敏、方便、高通量的快速检测,可在40℃条件下30分钟内完成实验,可检出低至101copies/μl的hadv-14,为hadv-14的临床诊断或现场评估提供了新的方法,弥补了现有传统检测技术的不足,非常适用于现场快速检测,与传统pcr法相比raa法是在恒温下反应,操作简单,摆脱了复杂仪器的束缚,大大缩短了反应时间,非常适用于资源有限地区的现场检测。
1.一种快速检测人腺病毒14型的引物,所述引物包括上游引物和下游引物,其特征在于,所述上游引物的核苷酸序列为gcgaacagatagttacaaggagattcagtt;所述下游引物的核苷酸序列为gagatacagagccacattggaataaaggaa。
2.一种快速检测人腺病毒14型的探针,其特征在于,所述探针的核苷酸序列为gagaccaagcttggaaagatgtaaatccaaa[fam-dt][thf]g[bhq1-dt]atcagtgaacttgttaag[c3spacer]。
3.一种快速检测人腺病毒14型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1所述的引物和如权利要求2所述的探针。
4.根据权利要求3所述的快速检测人腺病毒14型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括缓冲液。
5.一种如权利要求3或4所述的试剂盒在基于raa荧光法快速检测人腺病毒14型中的应用。