本发明涉及分子生物学检测,具体涉及一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒。
背景技术:
1、从非洲猪瘟到新型冠状病毒,前者是动物烈性传染病,给养猪业造成了巨大的经济损失;后者是新发人类传染病,对人类健康和生命构成了巨大威胁,导致社会经济损失惨重。因此快速、准确的病原诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。随着检测技术的发展,病原核酸检测由于其高敏感和高特异的检测性能,已成为主流的检测手段。
2、核酸提取是病原核酸检测的第一步,目前最常用的核酸提取方法是磁珠吸附法和硅胶膜吸附柱法。硅胶膜吸附柱法快速简便,获得的核酸纯度高,但是对小片段dna或rna提取效率不高,而且不适用于自动化提取流程。磁珠法以超顺磁纳米微球为载体,能吸附核酸,快速分离纯化dna或rna,提取过程无需离心或过滤,也可以使用自动化工作平台的形式完成,提取通量高、自动化程度好。
3、蛋白酶k,是一种切割活性较广的丝氨酸蛋白酶,它能够切割脂族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽键。由于蛋白酶k在尿素和sds中稳定,还具有降解天然蛋白质的能力,因而在病毒核酸提取中可裂解病毒外壳蛋白,暴露核酸;可降解与核酸紧密结合的组蛋白,使核酸游离到提取液中,有利于进一步纯化;同时蛋白酶k还能够降解rna酶,防止病毒rna降解,有利于核酸检测。但在核酸提取过程中,增加蛋白酶k,增加了操作步骤、提取时间以及试剂成本,对于样本量较大的核酸提取来说,耗时耗力。除此之外,蛋白酶k在提取过程中清洗不彻底,会对下游pcr产生抑制作用。
4、目前磁珠法提取仍存在提取时间长的问题,整个提取过程通常需要30分钟左右,在应对紧急事件时,不能满足大量样本下更简单、更快速的核酸提取需求。因此,亟需改进磁珠发核酸提取体系,开发出一套更简单、更快速、适用于自动化工作平台的核酸提取纯化试剂,为病原核酸检测提供高质量核酸模板,提高检测效率和检测准确度。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,解决现有技术中提取时间长,蛋白酶k清洗不彻底对下游pcr反应有抑制的技术问题。
2、本发明公开了一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,包括裂解液,所述裂解液包括1.0mol/l~5.0mol/l的异硫氰酸胍,10mmol/l~50mmol/l的乙酸钠,10mmol/l~30mmol/l的edta,0.5mol/l~5.0mol/l的nacl,质量百分含量为0.1%~3%的尿素、体积比为10%~70%的异丙醇,ctab和n-月桂酰肌氨酸钠,所述ctab和n-月桂酰肌氨酸钠物质的量浓度比为10~50。
3、进一步的,所述ctab的浓度为10mmol/l~30mmol/l,n-月桂酰肌氨酸钠的浓度为0.5mmol/l~2mmol/l;
4、优选地,对于新冠拭子样本,ctab与n-月桂酰肌氨酸钠的浓度分别为20mm和1.5mm;对于口鼻拭子样本,ctab与n-月桂酰肌氨酸钠的浓度分别为15mm和1.0mm。
5、优选地,对于新冠拭子样本,所述裂解液包括3mol/l的异硫氰酸胍、30mmol/l的乙酸钠、10mmol/l的edta、3mol/l的nacl、质量百分含量为2%的尿素和体积比为20%的异丙醇;对于非洲猪瘟样本,所述裂解液包括3.5mol/l的异硫氰酸胍、30mmol/l的乙酸钠、10mmol/l的edta、3mol/l的nacl、质量百分含量为2%的尿素和体积比为20%的异丙醇;
6、进一步的,所述试剂盒还包括洗涤液1,洗涤液1包括10mmol/l~50mmol/l的乙酸钠、5mmol/l~30mmol/l的edta、0.5mol/l~3.0mol/l nacl、30%~70%体积比的异丙醇或无水乙醇;
7、优选地,所述洗涤液1包括15mmol/l的乙酸钠,20mmol/l的edta,0.8mol/l的nacl和体积比为50%的异丙醇;
8、进一步的,所述试剂盒还包括洗涤液2,洗涤液2包含0.5mmol/l~3mmol/l的柠檬酸钠、1mmol/l~10mmol/l的edta、40%~90%体积比的异丙醇或无水乙醇;洗涤液中的柠檬酸三钠可以控制反应体系的离子强度,同时还有一定的缓冲作用,有利于核酸的稳定,减少对核酸的破坏。
9、优选地,所述洗涤液2包括2.0mmol/l的柠檬酸钠,1.0mmol/l的edta,体积比为60%的无水乙醇;
10、进一步的,所述试剂盒还包括洗脱液,所述洗脱液包括0.1mmol/l~10mmol/l的tris;
11、优选地,所述洗脱液中tris浓度为0.1mmol/l;
12、进一步的,所述试剂盒还包括磁珠混合液,所述磁珠混合液包括磁珠和磁珠稀释液,所述磁珠所带官能团包括但不限于带氨基、羟基、羧基或硅羟基,所述磁珠在磁珠混合液中的浓度为15mg/ml;
13、进一步的,所述磁珠稀释液包括0.1mol/l~2mol/l的氯化钠、0.1mmol/l~5mmol/l的edta和30%~90%体积比的异丙醇。
14、优选地,磁珠混合液中所带官能团为硅羟基。
15、与现有技术相比,本发明具有的有益效果是:
16、1.本发明的核酸提取或纯化试剂盒,通过对裂解液的组分及浓度进行适当调整,得到的裂解体系裂解能力强,裂解效率高,在不含蛋白酶k的情况下,提取效率与含有蛋白酶k的试剂盒提取效率相当;
17、2.本发明的核酸提取或纯化试剂盒,简化了核酸提取纯化的过程,减少了一个检测样本所需要的时间,有利于大量样本的临床检测;
18、3.本发明的核酸提取或纯化试剂盒,提取体系不包含蛋白酶k,因此解决了因蛋白酶k清洗不彻底导致的下游pcr反应的影响,且提高了提取效率。
1.一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:包括裂解液,所述裂解液包括1.0mol/l~5.0mol/l的异硫氰酸胍,10mmol/l~50mmol/l的乙酸钠,10mmol/l~30mmol/l的edta,0.5mol/l~5.0mol/l的nacl,质量百分含量为0.1%~3%的尿素、体积比为10%~70%的异丙醇,ctab和n-月桂酰肌氨酸钠,所述ctab和n-月桂酰肌氨酸钠物质的量浓度比为10~50。
2.根据权利要求1所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述ctab的浓度为10mmol/l~30mmol/l,n-月桂酰肌氨酸钠的浓度为0.5mmol/l~2mmol/l。
3.根据权利要求2所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:对于新冠拭子样本,ctab与n-月桂酰肌氨酸钠的浓度分别为20mm和1.5mm;对于口鼻拭子样本,ctab与n-月桂酰肌氨酸钠的浓度分别为15mm和1.0mm。
4.根据权利要求1所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:对于新冠拭子样本,所述裂解液包括3mol/l的异硫氰酸胍、30mmol/l的乙酸钠、10mmol/l的edta、3mol/l的nacl、质量百分含量为2%的尿素和体积比为20%的异丙醇;对于非洲猪瘟样本,所述裂解液包括3.5mol/l的异硫氰酸胍、30mmol/l的乙酸钠、10mmol/l的edta、3mol/l的nacl、质量百分含量为2%的尿素和体积比为20%的异丙醇。
5.根据权利要求1所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括洗涤液1,洗涤液1包括10mmol/l~50mmol/l的乙酸钠、5mmol/l~30mmol/l的edta、0.5mol/l~3.0mol/l nacl、30%~70%体积比的异丙醇或无水乙醇。
6.根据权利要求5所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述洗涤液1包括15mmol/l的乙酸钠,20mmol/l的edta,0.8mol/l的nacl和体积比为50%的异丙醇。
7.根据权利要求1所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括洗涤液2,洗涤液2包含0.5mmol/l~3mmol/l的柠檬酸钠、1mmol/l~10mmol/l的edta、40%~90%体积比的异丙醇或无水乙醇。
8.根据权利要求7所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述洗涤液2包括2.0mmol/l的柠檬酸钠,1.0mmol/l的edta,体积比为60%的无水乙醇。
9.根据权利要求1所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括洗脱液,所述洗脱液包括0.1mmol/l~10mmol/l的tris。
10.根据权利要求1所述的一种无需蛋白酶k核酸提取或纯化试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括磁珠混合液,所述磁珠混合液包括磁珠和磁珠稀释液,所述磁珠所带官能团包括但不限于带氨基、羟基、羧基或硅羟基,所述磁珠在磁珠混合液中的浓度为15mg/ml。