IRF2BP2基因在绵羊育种中的应用

本发明属于遗传育种，涉及irf2bp2基因在绵羊育种中的应用。

背景技术：

1、绵羊(ovis aries)经过长期的人工驯化和自然选择，形成了多种为人类生活提供奶、肉、皮、毛等物资的经济品种。绵羊被毛类型主要分为双层被毛(异质被毛)和单层被毛(同质被毛)，细毛羊、半细毛羊等品种主要由无髓毛组成单层被毛，地方粗毛绵羊品种主要由无髓毛及有髓毛组成双层被毛，有些品种(如和田羊)还包括了较多兼具有髓毛和无髓毛特性的两型毛。

2、基因突变是指基因组dna分子发生的突然的、可遗传的变异现象。基因突变包括插入突变、缺失突变、碱基置换突变、移码突变等多种类型。基因突变为遗传学研究提供突变型，为育种工作提供素材，具有广泛的科学研究和实际生产意义。

3、随着基因组时代的到来，明确绵羊的基因型对绵羊外在性状的影响，并寻找控制这些性状的关键基因，进而开发出相应的分子标记，是目前绵羊育种工作的一项重要内容。分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性dna片段。分子标记辅助育种是利用dna分子与生物性状密切相关的特点，通过对基因分型的检测，达到选择目标性状的目的。这种方法具有快速、准确、可重复性好等优点，已经广泛用于各个领域的育种工作。利用分子标记对筛选出具有优良性状的绵羊，促进新品种选育具有指导意义。

4、基于基因突变的可遗传性，研究影响绵羊被毛类型、绒毛含量等性状的相关基因，探究这些基因变异与羊毛生长情况的关系，将有助于加快绵羊育种进程，对提升经济效益具有实际意义。

技术实现思路

1、更高的绒毛含量、更多的绒毛支数织造的毛纺产品品质更好，因此选育出具有这些优良性状的绵羊将更有利于提升整体经济效益。

2、基于此，本发明提供irf2bp2基因在绵羊育种中的应用，所述irf2bp2基因位于绵羊基因组oar3.1版25号染色体；所述irf2bp2基因的突变影响绵羊毛的生长情况；所述irf2bp2基因突变包括：aseif2s2片段插入突变和chr25：t7068586c位点单碱基突变；所述irf2bp2基因的核苷酸序列如seq id no:1所示；所述aseif2s2片段的核苷酸序列如seq idno:2所示；所述chr25：t7068586c位点的核苷酸序列如seq id no:3所示。

3、进一步地，所述aseif2s2片段插入突变与绵羊被毛类型相关，所述被毛类型包括：单层被毛和双层被毛；所述chr25：t7068586c位点单碱基突变与绒毛含量相关。

4、进一步地，所述aseif2s2片段插入突变纯合bb型为单层被毛类型，缺失突变纯合bb型为双层被毛类型，所述aseif2s2片段的插入位点位于irf2bp2基因7452236～7450860处；所述chr25：t7068586c位点三种基因型的绒毛含量为：cc＞ct＞tt。

5、本发明还提供一种绵羊毛生长情况的鉴定方法，包括：

6、提取绵羊基因组dna；根据所述绵羊基因组dna，检测irf2bp2基因中aseif2s2片段和/或chr25：t7068586c位点的突变情况。

7、所述aseif2s2片段插入突变纯合bb型为单层被毛类型，缺失突变纯合bb型为双层被毛类型，所述aseif2s2片段的插入位点位于irf2bp2基因7452236～7450860处。所述chr25：t7068586c位点单碱基突变与绒毛含量相关，chr25：t7068586c位点三种基因型绒毛含量为：cc＞ct＞tt。

8、所述irf2bp2基因的核苷酸序列如seq id no:1所示；所述aseif2s2片段的核苷酸序列如seq id no:2所示；所述chr25：t7068586c位点的核苷酸序列如seq id no:3所示。

9、进一步地，在上述鉴定方法中，用于检测aseif2s2片段的插入突变情况的上游引物如seq id no:4所示，下游引物如seq id no:5所示。用于检测chr25：t7068586c位点单碱基突变情况的上游引物如seq id no:6所示，下游引物如seq id no:7所示。

10、另外，本发明还请求保护一种探针、芯片或试剂盒，所述探针、芯片或试剂盒用于检测上述irf2bp2基因的突变情况，进行基因分型。所述irf2bp2基因突变包括aseif2s2片段插入突变和chr25：t7068586c位点单碱基突变。

11、所述aseif2s2片段插入突变与绵羊被毛类型相关，插入突变纯合bb型为单层被毛类型，缺失突变纯合bb型为双层被毛类型。所述chr25：t7068586c位点单碱基突变与绒毛含量相关，chr25：t7068586c位点三种基因型绒毛含量为：cc＞ct＞tt。

12、所述irf2bp2基因的核苷酸序列如seq id no:1所示；所述aseif2s2片段的核苷酸序列如seq id no:2所示；所述chr25：t7068586c位点的核苷酸序列如seq id no:3所示。

13、与现有技术相比，本发明“irf2bp2基因在绵羊育种中的应用”具有以下有益效果：

14、基于绵羊品种选育时，单层被毛和更高的绒毛含量更有利于提升经济效益，本发明提供了irf2bp2基因在绵羊育种中的应用，所述irf2bp2基因位于绵羊基因组oar3.1版25号染色体，所述irf2bp2基因突变包括：aseif2s2片段插入突变和chr25：t7068586c位点单碱基突变。其中，aseif2s2片段插入突变与绵羊被毛类型相关，所述aseif2s2片段插入突变纯合bb型为单层被毛类型，缺失突变纯合bb型为双层被毛类型。所述chr25：t7068586c位点单碱基突变与绒毛含量相关，该位点三种基因型绒毛含量为：cc＞ct＞tt。

15、上述两个突变位点均影响羊毛品质，表现出突变等位基因均增加绒毛含量的趋势。本发明分析了irf2bp2基因两个位点的突变与绵羊不同被毛类型、绒毛含量之间的关系，为了解该基因对羊毛性状影响及其在育种中应用提供参考。

16、本发明可通过检测绵羊基因型可准确判断绵羊的被毛类型和绒毛含量，缩短育种时间，适用于绵羊的遗传鉴定与育种工作。

技术特征：

1.irf2bp2基因在绵羊育种中的应用，其特征在于，所述irf2bp2基因位于绵羊基因组oar3.1版25号染色体；

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述aseif2s2片段插入突变与绵羊被毛类型相关，所述被毛类型包括：单层被毛和双层被毛；

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述aseif2s2片段插入突变纯合bb型为单层被毛类型，缺失突变纯合bb型为双层被毛类型，所述aseif2s2片段的插入位点位于irf2bp2基因7452236～7450860处；

4.一种绵羊毛生长情况的鉴定方法，其特征在于，包括：

5.根据权利要求4所述的鉴定方法，其特征在于，用于检测aseif2s2片段的插入突变情况的上游引物如seq id no:4所示，下游引物如seq id no:5所示；用于检测chr25：t7068586c位点单碱基突变情况的上游引物如seq id no:6所示，下游引物如seq id no:7所示。

6.一种探针、芯片或试剂盒，其特征在于，所述探针、芯片或试剂盒用于检测ir f2bp2基因的突变情况，进行基因分型；

技术总结
本发明属于遗传育种技术领域，公开了IRF2BP2基因在绵羊育种中的应用。所述IRF2BP2基因位于绵羊基因组oar3.1版25号染色体，所述IRF2BP2基因的突变影响绵羊毛的生长情况，包括asEIF2S2片段插入突变和chr25：t7068586c位点单碱基突变。其中，所述asEIF2S2片段插入突变纯合BB型为单层被毛类型，缺失突变纯合bb型为双层被毛类型。所述chr25：t7068586c位点单碱基突变与绒毛含量相关，该位点三种基因型绒毛含量为：CC＞CT＞TT。本发明将IRF2BP2基因的两个突变位点用于绵羊的基因鉴定和遗传育种工作，进而加快育种进程，提升经济效益。

技术研发人员：于丽娟,狄江,李文蓉,李忠慧,谢梦婉,张艳花,田月珍,唐丽苹,郑培宇,张彦威,阿米妮古丽·阿不来孜,宋楠楠
受保护的技术使用者：新疆畜牧科学院畜牧研究所
技术研发日：
技术公布日：2024/5/10