用于将细胞编程为造血谱系的系统及其方法与流程

文档序号:43755234发布日期:2025-11-14 22:55阅读:20来源:国知局


背景技术:

1、异源蛋白质和/或核酸分子可以用于在细胞中引起所希望的应答。异源蛋白质和/或核酸分子可以调控感兴趣的基因(例如,转基因和/或内源基因)以对细胞进行编程(例如,分化、去分化)。在一些情况下,已经采取基于核酸内切酶的技术(例如,成簇的规律间隔短回文重复序列(crispr)相关联蛋白质或“crispr/cas”)用于操纵多核苷酸序列、其表观遗传修饰和/或其表达水平。例如,crispr/cas技术可以以其多功能性和易得的可编程性为特征,并且可以用于促进跨不同物种的基因组编辑。


技术实现思路

1、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的方法,所述方法包括:在培养基中离体培养所述第一多个细胞,所述培养基基本上不含选自血小板生成素(tpo)、外源flt-3配体(flt3l)和白介素(il)的一种或多种外源因子,其中,在所述培养之后约14天内,从所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的转变率为至少约5%,其中所述第二多个细胞为cd45+。

2、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的方法,所述方法包括:使所述第一多个细胞与包含多个门单元的异源基因回路接触,其中,在所述异源基因回路激活后,所述多个门单元协同操作来以顺序方式调节多个不同靶基因的表达水平,其中所述多个门单元包括:第一门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,调节靶基因的表达;以及第二门单元,其在所述第一门单元的所述激活后可激活,以调节与所述靶基因不同的另外的靶基因的表达,使得在对所述靶基因的所述表达的调节之后,诱导对所述另外的靶基因的所述表达的调节,其中所述靶基因包括选自tbxt、tbx6、mixl1及其组合的一个或多个成员;并且所述另外的靶基因包括选自ets1、etv2、gata2、scl、lmo2及其组合的一个或多个成员,并且其中,在所述接触后,所述多个门单元协同操作,以实现所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的所述转变。

3、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的方法,所述方法包括:使所述第一多个细胞与包含多个门单元的异源基因回路接触,其中,在所述异源基因回路激活后,所述多个门单元协同操作来以顺序方式调节多个不同靶基因的表达水平,其中所述多个门单元包括:第一门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,调节靶基因的表达;以及第二门单元,其在所述第一门单元的所述激活后可激活,以调节与所述靶基因不同的另外的靶基因的表达,使得在对所述靶基因的所述表达的调节之后,诱导对所述另外的靶基因的所述表达的调节,其中所述异源基因回路被编程为使得:(x)所述靶基因包括选自tbxt、tbx6、mixl1及其组合的一个或多个成员;并且所述另外的靶基因包括选自hoxa5、hoxa9、erg、lcor、runx1及其组合的一个或多个成员;和/或(y)所述靶基因包括选自ets1、etv2、gata2、scl、lmo2及其组合的一个或多个成员;并且所述另外的靶基因包括选自hoxa5、hoxa9、erg、lcor、runx1及其组合的一个或多个成员,其中,在所述接触后,所述多个门单元协同操作,以实现所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的所述转变。

4、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的方法,所述方法包括:使所述第一多个细胞中的靶基因与异源基因调控部分接触,以调节所述靶基因的表达和/或活性水平,其中所述靶基因编码成红细胞转化特异性(ets)转录因子,其中所述接触实现所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的转变。

5、本公开提供了用于引导多个干细胞的分化的方法,所述方法包括:使所述多个干细胞与包含多个门单元的异源基因回路接触,其中,在所述异源基因回路激活后,所述多个门单元协同操作来以顺序方式诱导对所述多个干细胞中靶基因的多个不同调节,所述多个不同调节中的每一个是实现对所述多个干细胞的分化的所述引导所必需的,但单独地却不足以实现所述引导,其中所述多个门单元包括:(i)第一门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,以诱导所述多个不同调节中的第一不同调节;以及(ii)第二门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,以诱导所述多个不同调节中的第二不同调节,其中所述第二不同调节在所述第一不同调节之后诱导,使得所述第一不同调节和所述第二不同调节均提高或均降低所述细胞中所述靶基因的表达和/或活性水平,其中所述靶基因编码成红细胞转化特异性(ets)转录因子,并且其中,在所述接触后,所述多个门单元协同操作,以实现对所述多个干细胞的分化的所述引导。

6、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的系统,所述系统包括:用于离体培养所述第一多个细胞的培养基,其中所述培养基基本上不含选自血小板生成素(tpo)、外源flt-3配体(flt3l)和白介素(il)的一种或多种外源因子,其中,在所述培养基中离体培养所述第一多个细胞之后约14天内,从所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的转变率为至少约5%,其中所述第二多个细胞为cd45+。

7、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的系统,所述系统包括:异源基因回路,其包含多个门单元,其中,在所述异源基因回路激活后,所述多个门单元被配置为协同操作来以顺序方式调节多个不同靶基因的表达水平,其中所述多个门单元包括:第一门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,调节靶基因的表达;以及第二门单元,其在所述第一门单元的所述激活后可激活,以调节与所述靶基因不同的另外的靶基因的表达,使得在对所述靶基因的所述表达的调节之后,诱导对所述另外的靶基因的所述表达的调节,其中所述靶基因包括选自tbxt、tbx6、mixl1及其组合的一个或多个成员;并且所述另外的靶基因包括选自ets1、etv2、gata2、scl、lmo2及其组合的一个或多个成员,并且其中,在使所述第一多个细胞与所述异源基因回路接触后,所述多个门单元协同操作,以实现所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的所述转变。

8、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的系统,所述系统包括:异源基因回路,其包含多个门单元,其中,在所述异源基因回路激活后,所述多个门单元被配置为协同操作来以顺序方式调节多个不同靶基因的表达水平,其中所述多个门单元包括:第一门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,调节靶基因的表达;以及第二门单元,其在所述第一门单元的所述激活后可激活,以调节与所述靶基因不同的另外的靶基因的表达,使得在对所述靶基因的所述表达的调节之后,诱导对所述另外的靶基因的所述表达的调节,其中所述异源基因回路被编程为使得:(x)所述靶基因包括选自tbxt、tbx6、mixl1及其组合的一个或多个成员;并且所述另外的靶基因包括选自hoxa5、hoxa9、erg、lcor、runx1及其组合的一个或多个成员;和/或(y)所述靶基因包括选自ets1、etv2、gata2、scl、lmo2及其组合的一个或多个成员;并且所述另外的靶基因包括选自hoxa5、hoxa9、erg、lcor、runx1及其组合的一个或多个成员,其中,在使所述第一多个细胞与所述异源基因回路接触后,所述多个门单元协同操作,以实现所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的所述转变。

9、本公开提供了用于将多个干细胞(第一多个细胞)转变成多个造血谱系细胞(第二多个细胞)的系统,所述系统包括:异源基因调控部分,其表现出与所述第一多个细胞中的靶基因的特异性结合,以调节所述靶基因的表达和/或活性水平,其中所述靶基因编码成红细胞转化特异性(ets)转录因子,其中所述靶基因与所述异源基因调控部分的接触实现所述第一多个细胞到所述第二多个细胞的转变。

10、本公开提供了用于引导多个干细胞的分化的系统,所述系统包括:异源基因回路,其包含多个门单元,其中,在所述异源基因回路激活后,所述多个门单元协同操作来以顺序方式诱导对所述多个干细胞中靶基因的多个不同调节,所述多个不同调节中的每一个是实现对所述多个干细胞的分化的所述引导所必需的,但单独地却不足以实现所述引导,其中所述多个门单元包括:(i)第一门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,以诱导所述多个不同调节中的第一不同调节;以及(ii)第二门单元,其在所述异源基因回路的所述激活后可激活,以诱导所述多个不同调节中的第二不同调节,其中所述第二不同调节在所述第一不同调节之后诱导,使得所述第一不同调节和所述第二不同调节均提高或均降低所述细胞中所述靶基因的表达和/或活性水平,其中所述靶基因编码成红细胞转化特异性(ets)转录因子,并且其中,在使所述多个干细胞与所述异源基因回路接触后,所述多个门单元协同操作,以实现对所述多个干细胞的分化的所述引导。

11、本公开提供了工程化细胞,其包含本文公开的任一种系统。本公开提供了组合物,其包含本文公开的任一种系统和/或任一种工程化细胞。

12、援引并入

13、本说明书中提及的所有出版物、专利和专利申请均通过引用而并入本文,其程度如同具体地并单独地指出通过引用而并入每个单独的出版物、专利或专利申请。在通过引用而并入的出版物和专利或专利申请与本说明书中含有的公开内容矛盾的范围内,本说明书旨在取代和/或优先于任何此类矛盾的材料。

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