一种液体活检样本的处理方法及其应用与流程

文档序号:34691148发布日期:2023-07-06 00:52阅读:38来源:国知局
一种液体活检样本的处理方法及其应用与流程

本发明涉及液体活检样本的处理方法,具体而言涉及不同分子量的疾病检测用液体活检样本的处理方法。


背景技术:

1、随着体外诊断技术(intro diagnostic)技术应用的普及,用于体外诊断的生物样本的预处理工艺也越来越受到关注。以往,在液体活检样本中存在大量的盐类及基因碎片,对仪器检测产生严重的干扰。因此,降低生物样本中的干扰,提高检测精度,在当前生物检测领域备受瞩目。而且,当前使用的疾病筛查手段中使用的样本处理,往往精度比较低,漏检率较高,这也让很多患者失去早期治疗的机会,从而降低了患者的生存率。例如血液代表了一种方便的临床分析诊断样本。血清代谢物和肽有可能作为从正常状态到疾病状态进展的可靠指标。然而,血清中盐、脂质和高浓度蛋白质的存在会对仪器分析产生不利影响,因为所有这些部分都会干扰仪器对生物诊断标志物的检测。

2、本发明在实验过程中,已评估、优化和标准化许多处理步骤,通过对少量血清等液体活检样本进行特定的前处理,便会得到消除干扰物质,富集和纯化多肽、代谢产物等目标物质的目的,更加适用于高通量和临床环境,从而更适用于精确的疾病筛查。

3、现有技术文献

4、非专利文献

5、machine learning of serum metabolic patterns encodes early-stage lungadenocarcinoma,lin huang et.,nature communications(2020)11:3556


技术实现思路

1、发明要解决的技术问题

2、在液体活检样本中存在大量的盐类及基因碎片,对仪器检测产生严重的干扰。本方法通过使用填料为色谱吸附剂的过滤装置,对样本中的干扰物质进行过滤,对待检测物质进行富集再分离,后续通过检测仪器对洗脱液进行检测,可以筛查出包括肿瘤、冠心病、高血压等慢性疾病。

3、解决问题的手段

4、为了解决上述问题,本发明提供一种光谱法、质谱法测定液体活检样本中蛋白、多肽以及代谢产物的前处理方法,建立一种准确性良好的、样品消耗量低的、高通量检测的一种的非侵袭性诊断疾病的方法,大大降低了样本中干扰物质的浓度,提高了诊断的准确率。

5、具体而言,本发明包含以下实施方式。

6、1、一种样本处理方法,其包括下述步骤:

7、步骤一:将样本与酸化试剂混合,进行酸化;

8、步骤二:使过滤装置的过滤头润湿;

9、步骤三:使步骤二的过滤装置的过滤头吸附步骤一的酸化样本;

10、步骤四:使用冲洗液冲洗步骤三的过滤装置的过滤头;

11、步骤五:使用步骤四的过滤装置的过滤头吸取洗脱液;

12、步骤六:收集洗脱液。

13、2、根据1所述的样本处理方法,其特征在于,所述过滤装置选自固相萃取柱无筛板固相萃取柱、层析柱、微量层析柱、针头过滤器。

14、3、根据2所述的样本处理方法,其特征在于,所述过滤装置中的填料选自c18十八烷基硅胶、c8辛烷基硅烷键合硅胶、c4硅胶键合丁基、c6h5苯基硅烷键合硅胶、cn硅胶键合氰基、nh2硅胶键合氨基以及oh硅胶键合二醇基中的一种。

15、4、根据1~3中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤一中的样本选自血清、尿液、组织液中的任意一种。

16、5、根据1~4中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤一中的酸化试剂选自卤代有机酸溶液。

17、6、根据5所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤一中的酸化试剂为体积浓度0.05%~2%的卤代有机酸的水溶液。

18、7、根据6所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤一中的酸化试剂为体积浓度0.1%的卤代有机酸的水溶液。

19、8、根据1~7中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤一中的酸化试剂选自三氟乙酸、三氟丙酸中的一种以上的酸的溶液。

20、9、根据1~8任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤一中的酸化试剂为三氟乙酸的水溶液。

21、10、根据1~9中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用乙腈水溶液润湿1、2或3次。

22、11、根据10所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中,再使用三氟乙酸水溶液别润湿1、2或3次。

23、12、根据10或11所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用体积浓度30-70%乙腈水溶液。

24、13、根据10~12中任一项~所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用体积浓度40-60%乙腈水溶液。

25、14、根据10~13中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用体积浓度50%乙腈水溶液。

26、15、根据11所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用体积浓度0.05%~0.2%的三氟乙酸溶液。

27、16、根据11或15所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用体积浓度0.08%~0.15%的三氟乙酸溶液。

28、17、根据10、15或16中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤二中使用体积浓度0.1%三氟乙酸溶液。

29、18、根据1~17中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤四中的冲洗液包含水、三氟乙酸以及体积浓度为3%~8%的选自乙腈、丙酮、乙醇、异丙醇、甲酸和甲醇中的一种以上的溶剂,其中,三氟乙酸的体积浓度为0.05%~2%。

30、19、根据18所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤四中的冲洗液包含水、三氟乙酸和乙腈。

31、20、根据19所述的样本处理方法,其特征在于,三氟乙酸:乙腈以体积比计为1∶100~1∶20。

32、21、根据19或20所述的样本处理方法,其特征在于,三氟乙酸:乙腈以体积比计为1∶50。

33、22、根据19~21中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,相对于冲洗液的总量,三氟乙酸的体积浓度为0.1%。

34、23、根据19~21中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,相对于冲洗液的总量,乙腈的体积浓度为5%。

35、24、根据1~23中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五中的洗脱液包含水、三氟乙酸和体积浓度为10%~95%的选自乙腈、丙酮、乙醇、异丙醇、甲酸和甲醇中的一种以上的溶剂。

36、25、根据1~24中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五中的洗脱液包含水、三氟乙酸和乙腈。

37、26、根据25所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五的洗脱液中,三氟乙酸:乙腈以体积比计为1∶2000~1∶500。

38、27、根据25或26所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五的洗脱液中,三氟乙酸:乙腈以体积比计为1∶1000~1∶900。

39、28、根据25~27中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五中,相对于洗脱液的总量,三氟乙酸的体积浓度为0.05%~0.2%。

40、29、根据25~28中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五中,相对于洗脱液的总量,三氟乙酸的体积浓度为0.1%。

41、30、根据25~29中任一项所述的样本处理方法,其特征在于,所述步骤五中,相对于洗脱液的总量,乙腈的体积浓度为95%。

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