一种贴壁细胞计数方法与流程

本发明涉及医疗视觉，特别是涉及一种贴壁细胞计数方法。

背景技术：

1、目前现有的粘连贴壁细胞的计数技术主要是分为三个方向。传统的采用手工对细胞进行计数速度又慢，效果又差，准确性也不好。目前也有一部分技术采用深度学习模型预测的mask直接对细胞进行计数，但是该计数不容易对粘连到一起的细胞进行计数，从而导致计数的结果不准确，数量偏低等情况。还有一部分是采用模型后处理的方式对粘连细胞先去除粘连后进行计数的方式，比如单纯采用分水岭算法来进行性去除粘连粘连并计数，但是该种计数存在两个问题，一个是针对细胞粘连不严重的细胞图片没办法做到每张图片的效果都一致从而导致计数不准确，另外一个问题就是针对细胞在图片上占比较大的去除粘连效果特别差，导致计数不准。

技术实现思路

1、为了克服现有技术的不足，本发明的目的是提供一种贴壁细胞计数方法。

2、为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

3、一种贴壁细胞计数方法，包括：

4、采集待计数区域的细胞图片；

5、根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；

6、判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；

7、根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或

8、根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。

9、优选地，根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：

10、采集所述低汇合度图片中的所有的细胞轮廓，并计算所述细胞轮廓面积；

11、根据第二预设阈值与所述细胞轮廓面积将所述低汇合度图片划分为小面积细胞区域和大面积细胞区域；

12、根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得到第一数量；

13、计算所述小面积细胞区域的细胞图上非零像素点到最近的零像素点之间的距离，并生成距离图；

14、将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图对细胞进行计数，得到第二数量；

15、将所述第一数量和所述第二数量进行相加，得到所述计算结果。

16、优选地，根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得到第一数量，包括：

17、将所有的大面积细胞区域的面积进行相加，得到大面积细胞区域的面积之和；

18、将大面积细胞区域的面积之和除以单个细胞的面积，得到所述第一数量。

19、优选地，所述单个细胞的面积是基于大量细胞面积统计得到的数据。

20、优选地，将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图对细胞进行计数，得到第二数量，包括：

21、根据每张所述距离图上的最大距离的0.1倍到1这十个数值来选取最合适分割阈值，遍历这十个数值，根据这十个数值对应得到的二值图中轮廓数来选取具体的阈值，选取轮廓数最大所对应的阈值；

22、使用轮廓数最大所对应的阈值对所述距离图进行二值化处理，得到一张二值图，此二值图是前景区域也就是确定的细胞区域，然后将原始图与二值化之后的图进行相减得到可能存在细胞粘连的部分，并将所述可能存在细胞粘连的部分定义为未知区域；

23、将所述未知区域打标签，以得到标签图；不同的细胞被打上了不同的标签；打标签的过程中无细胞区域的标签被标记为0，将标签图统一加上1，这样无细胞的区域就被标记为1；

24、根据所述未知区域将标签图中同样位置的标签置为0；

25、根据标签图找到原图上的极小值点，并在原图上的极小值点周围4邻域或者8邻域范围内寻找领域中像素的最小值，当邻域中找到一个最小值接着在当前领域的下一个领域找最小值，依次迭代下去，在每个被打标签的极小值区域周围均得到一个包含最小值的队列，并且对每个队列进行区分，将每个队列的交集的位置的像素值置为-1，将数组中为-1的地方对应到原图上，并将原图为-1的位置置为0，最后将原图进行腐蚀，以将粘连细胞分开；

26、对分开的细胞进行计数，得到所述第二数量。

27、优选地，根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：

28、将所有细胞区域面积相加得到细胞面积总和，然后将细胞面积总和除于单个细胞面积，得到大面积细胞团中的细胞数量，并作为所述计算结果。

29、根据本发明提供的具体实施例，本发明公开了以下技术效果：

30、本发明提供了一种贴壁细胞计数方法，包括：采集待计数区域的细胞图片；根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。本发明能够提高细胞计数的准确性。

技术特征：

1.一种贴壁细胞计数方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：

3.根据权利要求2所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得到第一数量，包括：

4.根据权利要求3所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，所述单个细胞的面积是基于大量细胞面积统计得到的数据。

5.根据权利要求2所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图对细胞进行计数，得到第二数量，包括：

6.根据权利要求1所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：

技术总结
本发明提供了一种贴壁细胞计数方法，涉及医疗视觉技术领域，包括：采集待计数区域的细胞图片；根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。本发明能够提高细胞计数的准确性。

技术研发人员：史相杰,刘家宏,刘河山,杨程
受保护的技术使用者：南京九川科学技术有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/1/14