一种评估HR缺陷模型及应用的制作方法

文档序号:19422545发布日期:2019-12-14 01:43阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种评估hr缺陷模型,其特征在于所述模型为:

其中,t为hr缺陷模型统计值,n为分子标志物个数,m0为基础值,设为0;mn为第n个分子标志物的基因突变值,若分子标志物存在功能缺失性突变则mn值设为1,未突变的mn值为0。

2.如权利要求1所述评估hr缺陷模型,其特征在于所述n为15。

3.如权利要求2所述评估hr缺陷模型,其特征在于所述m1……mn分别为分子标志物brca1、brca2、rad51b、rad50、fanca、fancb、fancg、blm、atm、atr、chek2、brip1、cdk12、fam175a、palb2的基因突变值。

4.一种权利要求1所述评估hr缺陷模型在定性判断肿瘤细胞是否存在同源重组缺陷中的应用。

5.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述肿瘤细胞为胆囊癌细胞。

6.如权利要求5所述的应用,其特征在于所述胆囊癌细胞gbc-sd或胆囊癌细胞sgc-996。

7.如权利要求5所述的应用,其特征在于所述的应用方法为:提取待测肿瘤样本进行分子标志物外显子测序,若分子标志物序列中检测到功能缺失性突变,则其相应m值设为1,未检测到突变,则m值为0,利用所述评估hr缺陷模型,若t>0,则hr缺陷;若t≤0,则hr正常。


技术总结
本发明公开了一种评估HR缺陷模型及应用,本发明基于肿瘤个体化化疗策略,利用已有的HR相关指标评估胆囊癌细胞内HR是否存在缺陷,依据HR正常或HR缺陷分别以抑制自噬和抑制PARP处理,提高化疗方案FAM的抗肿瘤疗效,避免了患者多轮高毒性用药后才发现存在抗性的情况的发生。本发明用于检测胆囊癌细胞的多分子标志物仅包含15个基因,易于临床试验检测及减少检测费用;且该多分子标志物不会受到实验的批次效应或检测平台差异的影响;该多分子标志物在使用前不需要进行多样本间的数据标准化处理,使用方便。

技术研发人员:汤佳城;梁霄;卫赛赛;张占丰
受保护的技术使用者:浙江大学
技术研发日:2019.07.19
技术公布日:2019.12.13
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