本发明涉及一种dna分子鉴定方法,特别涉及中药绿丝郁金pcr鉴定试剂盒、特异性引物、模板及鉴定方法。
(二)
背景技术:
绿丝郁金为蓬莪术(curcumaphaeocaulisval.)的干燥块茎,地道产地为四川的崇州。郁金的其他品种还包括温郁金、黄丝郁金、桂郁金。郁金是一种传统中药,具有活血祛瘀的功效,用于治疗经闭痛经、胸腹胀痛、黄胆尿赤、癫痫发狂等疾病。近代研究表明郁金可以调节免疫功能、抗炎、抑制中枢神经、改善血液流动性等作用,亦可用于治疗癌症、胃炎、心脑血管疾病。不同的郁金品种,其有效成分和药效差别较大。由于郁金品种较多,来源多样,外观形态类似,单靠外形和传统中药检测方法较难区别,急需建立一种新型的鉴定方法。
本发明提供的pcr检测法是一种绿丝郁金的dna分子鉴定方法,能够准确鉴定绿丝郁金。利用pcr检测法对绿丝郁金进行鉴定尚未见报道。该方法的建立对实现中药现代化,规范管理郁金的种植,采摘和销售,具有重要意义。
(三)
技术实现要素:
本发明目的是提供一种能够准确鉴定中药绿丝郁金的pcr鉴定试剂盒和检测方法,包括pcr检测法关键试剂pcr引物、模板和pcr检测法的检测步骤。
本发明采用的技术方案是:
本发明提供一种绿丝郁金pcr鉴定试剂盒,所述试剂盒中的特异性引物为lsy1和lsy2:
lsy1:5’-cctgagtgaggacttgtacg-3’
lsy2:5’-cgatgctaagggcacagcta-3’。
进一步,所述的绿丝郁金pcr鉴定试剂盒的组成为:
本发明还涉及一种利用所述绿丝郁金pcr鉴定试剂盒对绿丝郁金进行鉴定的方法,所述方法为:
(1)模板dna的提取和质量鉴定:采用常规提取法提取供试品dna作为pcr的模板;以电泳法检测模板dna的质量(检测方法同步骤(3)),条带清晰无弥散的,即为符合pcr反应的模板dna;
(2)pcr鉴定:利用绿丝郁金pcr鉴定试剂盒中的特异性引物lsy1和lsy2,进行pcr扩增:
pcr反应溶液:
将pcr反应溶液放入pcr自动扩增仪器中进行pcr扩增反应,反应程序设置为:94℃预变性5min,94℃变性45s,58~64℃复性45s,72℃延伸1min,32个循环,最后72℃延伸10min;
(3)pcr产物进行电泳检测:取出pcr扩增产物(即扩增反应后的反应液)5μl与加样缓冲液1μl混合,用1.2%琼脂糖凝胶电泳(含0.5%溴化乙锭)检测扩增结果,在869bp处出现扩增条带的为绿丝郁金,在869bp处不出现扩增条带的不是绿丝郁金。
与现有技术相比,本发明的有益效果主要体现在:(1)本发明根据凝胶电泳在869bp处有无扩增条带作为鉴定绿丝郁金的依据,可以检测单个或者混合绿丝郁金dna样品,检测准确、灵敏度高、操作简单、耗时短、重复性好;(2)利用绿丝郁金pcr鉴定试剂盒中引物lsy1和lsy2以及pcr反应溶液配方可以制造绿丝郁金鉴定试剂盒;(3)本发明提供了一种快速、准确鉴定绿丝郁金的方法,可以广泛应用于绿丝郁金中药选种育种、种植、采收储存、销售、临床应用各环节的品种鉴定,在鉴别中药真伪,打击伪品,加强中药质量监管,促进中药现代化发展方面具有重大意义。
(四)附图说明
图1为11种供试品经pcr检测法鉴定后的电泳图,泳道1~11分别为温郁金(浙江瑞安)、温郁金(浙江永嘉)、黄丝郁金(四川崇州)、黄丝郁金(四川双流)、绿丝郁金、桂郁金、生姜、海南三七、草果、浙白芍、安白术,泳道m为marker。
图2为不同浓度的绿丝郁金经pcr检测法鉴定后的电泳图,泳道m为marker,泳道1的绿丝郁金浓度为2ng/μl,泳道2的绿丝郁金浓度为4ng/μl,泳道3的绿丝郁金浓度为8ng/μl,泳道4的绿丝郁金浓度为20ng/μl。
(五)具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:
本发明实施例所用温郁金(浙江瑞安)、温郁金(浙江永嘉)、黄丝郁金(四川崇州)、黄丝郁金(四川双流)、绿丝郁金、桂郁金、生姜、海南三七、草果、浙白芍、安白术均按照《中国药典》2010版采集制备。
实施例1
1、绿丝郁金pcr检测法关键试剂pcr引物的获得
应用植物dna快速提取试剂盒方法从温郁金、黄丝郁金、绿丝郁金和桂郁金中分别提取基因组dna。使用rapd扩增法对四种郁金进行rapd分析,筛选获得一条绿丝郁金特异性扩增条带,这条特异性扩增条带只出现在绿丝郁金品种中,在其他郁金品种中没有,此条带中的dna分子即是绿丝郁金特异性dna分子标记。将绿丝郁金特异性dna分子标记从琼脂糖凝胶中回收、克隆、测序,测序结果见seqidno.1所示,命名为lsy888。
根据lsy888序列,设计一对特异性引物lsy1和lsy2,引物序列为
lsy1:5’-cctgagtgaggacttgtacg-3’
lsy2:5’-cgatgctaagggcacagcta-3’
上下游引物选取的位点分别对应于lsy888序列位点上的9-28bp和858-877bp处。
seqidno.1为:
5’-atggtggacctgagtgaggacttgtacgaatcctatatcaaggtatgtcgctttgcattggggggtatttctacaattctgtaagttaactgaatttcatgtctcgtagatcggtatagaacagaaagccttgcaccgtcaagtggttaggtcggagaaacacatagcccggatggacaacgagataacttatttgcgagcggagctggctgaccgacttcccatgcctcaaggtttgtctgaagctttgagggatgtggacttagctcgggccgaggtgatggtggctcaaagtgctcagtcaaaagcagtggaggaggttgaaaattggaaggcgaaagttcaggaattgtataacactgagagactacatcgagactcctacttgcaagcggagcgtttgtcagctcaacgggagaccgagatagttgaagttagggatcaggttcaacggttgaaggctgactttgataaggaacgtgaacattgggctcaacagttatcagaagcccgtgctaaagaagaacaactcatctctgagctcaatgcggctcaagtggagatggaggatatgtagacgagggaggaggctcggtttgcggaacgccactagaccttcctttcttcacccgatttttaccacttggttgccctaagtgcaggtaaaatgatggaatatgattttgatgatgccattctccaattcatgaggtcgggcttgatcgctcgagatgccgacctcaagttttttgatttaaaggtcgcctggaatgctctacctgaggccgttcgacaagattttcctatctccgaagagattgcttaacctgaggctttggttgctgcagttagccagttagctgtgcccttagcatcggcccgatctcc-3’
2、绿丝郁金的pcr检测法
(1)采用常规提取法提取供试品dna作为pcr的模板;以电泳法(同步骤(3))检测模板dna的质量,条带清晰无弥散的,即为符合pcr反应的模板dna;
(2)按照lsy1和lsy2的序列用体外合成仪合成引物lsy1和lsy2。以lsy1和lsy2为引物进行pcr扩增。
按照下述配方配置pcr反应溶液:
将pcr反应溶液放入pcr自动扩增仪器中进行pcr扩增反应,反应程序设置为:
94℃预变性5min,94℃变性45s,58~64℃复性45s,72℃延伸1min,32个循环,最后72℃延伸10min;
(3)pcr产物进行电泳检测:取出pcr扩增后的反应液5μl与加样缓冲液1μl混合,用1.2%琼脂糖凝胶电泳(含0.5%溴化乙锭)检测扩增结果,在869bp处出现扩增条带的样品为绿丝郁金,在869bp处不出现条带的样品不是绿丝郁金。
实施例2:
1、绿丝郁金pcr检测法的准确性研究
从温郁金(浙江瑞安)、温郁金(浙江永嘉)、黄丝郁金(四川崇州)、黄丝郁金(四川双流)、绿丝郁金、桂郁金、生姜、海南三七、草果、浙白芍、安白术植物中提取基因组dna。以上述11份材料基因组dna为模板,利用特异性引物“lsy1/lsy2”进行pcr扩增,pcr反应液、扩增程序、检测方法同实施例1,只是更换dna模板,以验证绿丝郁金pcr检测法的准确性和可靠性,结果见图1所示,泳道1~11分别分别为温郁金(浙江瑞安)、温郁金(浙江永嘉)、黄丝郁金(四川崇州)、黄丝郁金(四川双流)、绿丝郁金、桂郁金、生姜、海南三七、草果、浙白芍、安白术,泳道m为marker。
图1表明,绿丝郁金在869bp处具有特异性的扩增条带,而其他品种没有。本发明的绿丝郁金pcr检测法经实验证明可以用于绿丝郁金的鉴定,方法准确性高,简单、效率高、重复性好。
2、绿丝郁金pcr检测法的灵敏度研究
将绿丝郁金模板dna浓度(40ng/μl)经四个梯度进行稀释,配置四份不同浓度的绿丝郁金基因组dna溶液:一份浓度为稀释一倍,即20ng/μl;一份浓度稀释为原始浓度的五分之一,即8ng/μl;一份浓度稀释为原始浓度的十分之一,即4ng/μl;一份浓度稀释为原始浓度的二十分之一,即2ng/μl。
分别以这四种不同浓度的绿丝郁金基因组dna作为模板(1.0μl),以“lsy1/lsy2”为引物进行pcr扩增,pcr反应液、扩增程序、检测方法同实施例1,以验证绿丝郁金pcr检测法的灵敏度,结果见图2所示,泳道m为marker,泳道1为2ng/μl,泳道2为4ng/μl,泳道3为8ng/μl,泳道4为20ng/μl。
结果显示当绿丝郁金模板基因组dna浓度仅为8ng/μl时,在869bp处依然出现绿丝郁金的特异性条带,经过多次重复验证,结果保持稳定,证明本发明提供的绿丝郁金pcr检测法灵敏度很高,含量较微弱的绿丝郁金也能够鉴定出来。
序列表
<110>浙江工业大学
<120>绿丝郁金pcr鉴定试剂盒及鉴定方法
<160>3
<170>siposequencelisting1.0
<210>1
<211>887
<212>dna
<213>蓬莪术(curcumaphaeocaulisval.)
<400>1
atggtggacctgagtgaggacttgtacgaatcctatatcaaggtatgtcgctttgcattg60
gggggtatttctacaattctgtaagttaactgaatttcatgtctcgtagatcggtataga120
acagaaagccttgcaccgtcaagtggttaggtcggagaaacacatagcccggatggacaa180
cgagataacttatttgcgagcggagctggctgaccgacttcccatgcctcaaggtttgtc240
tgaagctttgagggatgtggacttagctcgggccgaggtgatggtggctcaaagtgctca300
gtcaaaagcagtggaggaggttgaaaattggaaggcgaaagttcaggaattgtataacac360
tgagagactacatcgagactcctacttgcaagcggagcgtttgtcagctcaacgggagac420
cgagatagttgaagttagggatcaggttcaacggttgaaggctgactttgataaggaacg480
tgaacattgggctcaacagttatcagaagcccgtgctaaagaagaacaactcatctctga540
gctcaatgcggctcaagtggagatggaggatatgtagacgagggaggaggctcggtttgc600
ggaacgccactagaccttcctttcttcacccgatttttaccacttggttgccctaagtgc660
aggtaaaatgatggaatatgattttgatgatgccattctccaattcatgaggtcgggctt720
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gaggccgttcgacaagattttcctatctccgaagagattgcttaacctgaggctttggtt840
gctgcagttagccagttagctgtgcccttagcatcggcccgatctcc887
<210>2
<211>20
<212>dna
<213>未知(unknown)
<400>2
cctgagtgaggacttgtacg20
<210>3
<211>20
<212>dna
<213>未知(unknown)
<400>3
cgatgctaagggcacagcta20