鸭λ干扰素突变体及其制备方法和应用与流程

文档序号：18733681发布日期：2019-09-21 00:53阅读：382来源：国知局

本发明涉及家禽干扰素及其突变体，尤其涉及鸭λ干扰素及其突变体，本发明还涉及利用家蚕杆状病毒表达系统制备所述鸭λ干扰素突变体的方法以及应用所述鸭λ干扰素突变体预防或治疗鸭病毒性疾病，属于鸭λ干扰素突变体的制备及应用领域。

背景技术：

干扰素是一种具有广谱抗病毒、抗寄生于细胞内细菌、抗肿瘤、调节免疫功能等广泛生物活性的细胞因子。IFN蛋白家族根据其编码基因的序列、染色体定位和受体特异性分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型干扰素。Ⅰ型干扰素包括IFN-α、IFN-β、IFN-ω、IFN-δ、IFN-ε、IFN-ζ、IFN-τ等，哺乳动物中主要是IFN-α和IFN-β。其中IFN-α有23种以上亚型，各个亚型具有相似的结构特点，分子量在19-26KDa之间，含有两个二硫键，与IFNAR1和IFNAR2受体系统结合。Ⅰ型干扰素具有较强的抗病毒活性，主要通过干扰病毒的复制抑制其增殖，还具有抗肿瘤和免疫调节的功能。Ⅱ型干扰素只有IFN-γ一个成员，又称为免疫干扰素，分子量在20-25KDa之间，没有二硫键，单体时没有活性，活化形式为二聚体或四聚体，其受体为IFNGR1和IFNGR2。主要作用是激活巨噬细胞杀灭微生物。Ⅲ型干扰素是新发现的细胞因子，包括λ1(IL-29)、λ2(IL-28a)、λ3(IL-28b)和λ4，特异性结合受体为IFNLR，包括两个亚基IFNLR1(IL28RA)和IL10RB，其中IL10RB是普遍表达的，而IFNLR1主要在上皮细胞、肝细胞和某些免疫细胞中表达，所以这些细胞可以对Ⅲ型干扰素作出反应。Ⅲ型干扰素与Ⅰ型干扰素关系密切，但有特殊的生理学功能，如刺激主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex，MHC)分子的活化和表达，调节先天免疫和获得性免疫等。由于干扰素具有广谱抗病毒、抗肿瘤的活性以及强大的免疫调节作用，现已成为病毒学、细胞学、分子生物学、临床医学、免疫学、肿瘤学等相关领域的研究热点之一。

干扰素首先在禽类中发现，但与人及其他哺乳动物相比，鸭干扰素分子水平的研究起步较晚，与鸡相比，鸭干扰素方面的研究也相对较少。近年来，家禽病毒感染引起的流感、新城疫、传染性支气管炎、传染性喉气管炎、传染性法氏囊病、鸭瘟、鸭肝炎和马立克等传染性疾病愈演愈烈，每年都会给养禽业带来巨大的经济损失，严重制约了养禽业的健康发展，而如何有效的预防和治疗家禽的病毒性传染病一直是禽病防治和治疗研究中的重点。鸭干扰素对鸭养殖业中具有重大威胁的病毒性传染病具有防御和抑制作用，为病毒性疾病的防治带来了新的希望，为养鸭业提供了有利的安全保障条件，其应用研究，则为开发鸭干扰素拓展了更加广阔的空间。鸭干扰素具有光谱抗病毒作用，主要通过直接激活免疫细胞核间接抑制病毒复制而达到抗病毒作用；同时，它还具有抗细胞内寄生的细菌、立克次氏体、衣原体、原虫作用。主要通过下调转铁蛋白受体，直接抑制细胞内细菌等；免疫增强功能，通过刺激NK细胞、活化巨噬细胞增强其杀伤功能，并直接促进T、B细胞分化和CTL成熟，刺激B细胞分泌抗体，从而增强机体免疫功能。

鸭的α干扰素基因最早是由德国研究人员Schultz等于1995年利用已报道的ChIFN-α基因作为探针经过克隆筛选得到。国内研究人员夏春2000年报道了北京鸭的α干扰素基因，其他研究人员后续报道了番鸭、绍兴鸭、麻鸭等各品种鸭的α干扰素基因，此外研究人员相继报道了重组鸭α干扰素对各种病毒的抵抗作用，Schultz等证实了重组干扰素有抵抗水泡型口炎病毒、A型流感病毒、鸭肝炎病毒和新城疫病毒的作用；周雪等2007年采用带有鸭α干扰素基因的质粒注射樱桃谷鸭后表现出一定的抗鸭瘟强毒感染的能力；Pei Gao等2018年用重组鸭α干扰素治疗2日龄鸭来研究其对高致病性禽流感病毒H5N1的抵抗作用，结果显示与病毒对照组相比试验组的鸭死亡率从60％下降到10％，说明重组鸭α干扰素对2日龄鸭感染禽流感病毒H5N1具有抵抗作用。Yao等人2014年克隆并在293T细胞中表达出北京鸭Ⅲ型干扰素IFN-λ，其研究表明重组鸭λ干扰素可以上调原代鸭肝细胞内OASL和Mx-1的mRNA水平，与抗病毒防御和炎症反应密切相关，但未对鸭Ⅲ型干扰素IFN-λ的活性进行报道。

技术实现要素：

本发明所要解决的第一个技术问题是提供一种鸭λ干扰素及鸭λ干扰素的突变体，所述鸭λ干扰素突变体具有高抗病毒活性；

本发明所要解决的第二个技术问题是提供一种利用家蚕杆状病毒表达系统制备所述鸭λ干扰素或鸭λ干扰素突变体的方法；

本发明所要解决的第三个技术问题是提供所述鸭λ干扰素或鸭λ干扰素突变体应用于预防或治疗鸭病毒性疾病。

为解决上述技术问题，本发明所采取的技术方案是：

本发明分析了NCBI上所有鸭λ干扰素氨基酸序列，最终确定以SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列为鸭λ干扰素原始氨基酸序列(即DuIFN-λ)，其编码基因的多核苷酸序列为(a)或(b)或(c)所示：

(a)SEQ ID No.2所示的多核苷酸序列；或(b)与SEQ ID No.2的互补序列在严谨杂交条件能够进行杂交的多核苷酸序列，该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；或(c)与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有80％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；优选的，与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有85％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；更优选的，与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有90％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性。

本发明进一步通过对鸭λ干扰素所有氨基酸序列进行比对得到鸭λ干扰素的保守序列，该保守序列的氨基酸序列为SEQ ID No.3所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID No.4所示。

本发明在鸭λ干扰素保守氨基酸序列(即SEQ ID NO.3所示)的基础上，根据家蚕密码子偏好性对该基因序列进行优化，对影响基因转录效率、翻译效率和蛋白折叠的GC含量、CpG二核苷酸含量、密码子偏好性、mRNA的二级结构、mRNA自由能稳定性、RNA不稳定性基因序列、重复序列等多种相关参数进行优化设计，并保持最终翻译成的蛋白序列不变；为了提高在家蚕杆状病毒真核表达体系中的翻译起始效率，在基因ATG前面加了Kozak序列ACGAAC。此外，还去除了基因序列内部的BamHI、EcoRI、SmaI等限制性酶切位点，在基因上游加上了BamHI，在基因下游加上了EcoRI限制性酶切位点，在保持其氨基酸序列(即SEQ ID NO.3所示)不变的前提下，得到优化后的基因(即：DuIFN-λ-C-O)，其核苷酸序列为SEQ ID NO.5所示。抗病毒活性结果显示，在家蚕幼虫体内表达的DuIFN-λ效价为1.56×10⁶U/mL，优化后基因(DuIFN-λ-C-O)效价为2.58×10⁶U/mL。

本发明进一步以DuIFN-λ-C-O的基因序列为模板设计多对引物，利用融合PCR法进行氨基酸单位点突变和氨基酸多位点突变，获得了多个鸭λ干扰素突变体；在DuIFN-λ-C-O的基础上，分别进行S30T、N56S、I95V、Q136K或V166L这5个位点单位点突变后，所表达的鸭λ干扰素效价高于DuIFN-λ-C-O表达测得的效价，抗病毒效价达到8.58×10⁴U/mL～3.65×10⁶U/mL，而其余位点突变后效价不变甚至降低，说明这5个位点的突变是有效突变可以达到提高抗病毒活性的目的；其中，进行I95V单位点突变获得的DuIFN-λ-C-O-I95V突变体具有最强抗病毒作用。

本发明所述氨基酸单位点突变“S30T”表示将氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示的鸭λ干扰素突变体的第30位氨基酸由丝氨酸(S)突变成苏氨酸(T)；“N56S”表示将第56位氨基酸由天冬酰胺(N)突变成丝氨酸(S)；其余的单位点突变的表述依此类推。

本发明进一步将抗病毒活性提高的单突变位点S30T、N56S、I95V、Q136K或V166L进行组合，将DuIFN-λ-C-O进行多位点突变；具体的，将氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示的鸭λ干扰素突变体进行S30T-N56S、S30T-I95V、S30T-Q136K、S30T-V166L、N56S-I95V、N56S-Q136K、N56S-V166L、I95V-Q136K、I95V-V166L、Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V、S30T-N56S-Q136K、S30T-N56S-V166L、S30T-I95V-Q136K、S30T-I95V-V166L、S30T-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K、N56S-I95V-V166L、N56S-Q136K-V166L、I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K、S30T-N56S-I95V-V166L、S30T-N56S-Q136K-V166L、S30T-I95V-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K-V166L中任何一种氨基酸多位点突变获得的突变体；抗病毒活性的检测结果表明，N56S-I95V、I95V-Q136K、N56S-I95V-Q136K以及N56S-I95V-Q136K-V166L几组多突变后，表达的鸭λ干扰素效价高于保守序列、单突变序列表达测得的效价，抗病毒效价达到8.16×10⁴U/mL～5.01×10⁶U/mL，而其余几组位点突变后效价不变甚至降低，说明这4个组合位点的突变是有效突变，可以达到提高抗病毒活性的目的；其中，进行N56S-I95V-Q136K-V166L多位点突变所获得的DuIFN-λ-S-C-N56S-I95V-Q136K-V166L突变体具有最强抗病毒作用，其氨基酸序列为SEQ ID NO.6所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.7所示。

本发明所述氨基酸多位点突变“N56S-I95V”表示将氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示的鸭λ干扰素突变体的第56位氨基酸由天冬酰胺(N)突变成丝氨酸(S)并且将第95位氨基酸由异亮氨酸(I)突变成缬氨酸(V)；氨基酸多位点突变“I95V-Q136K”表示将第95位氨基酸由异亮氨酸(I)突变成缬氨酸(V)并且将第136位氨基酸由谷氨酰胺(Q)突变成赖氨酸(K)；其余的多位点突变的表述依此类推。

本发明还公开了含有所述鸭λ干扰素或者鸭λ干扰素突变体的编码基因的重组载体或重组宿主细胞；其中，所述重组载体为重组表达载体或重组克隆载体。

本发明所构建的转移载体包括：

(1)含有鸭λ干扰素(DuIFN-λ)基因的载体pVL-DuIFN-λ；

(2)含有鸭λ干扰素保守氨基酸序列基因DuIFN-λ-C进行优化后的基因序列的载体pVL-DuIFN-λ-C-O；

(3)含有DuIFN-λ-C-O进行氨基酸单位点突变后的突变体(DuIFN-λ-C-O-M1突变体)基因序列的载体pVL-DuIFN-λ-C-O-M1；

(4)含有DuIFN-λ-C-O进行氨基酸多位点突变后的突变体(DuIFN-λ-C-O-M2突变体)基因序列的载体pVL-DuIFN-λ-C-O-M2。

本发明所获得的重组杆状病毒包括：重组家蚕核型多角体病毒rBmBacmid(DuIFN-λ)、rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O、DuIFN-λ-C-O-M1、DuIFN-λ-C-O-M2)。

本发明还公开了所述的鸭λ干扰素或者鸭λ干扰素突变体在制备预防或治疗鸭病毒性疾病的药物或试剂中的用途。

其中，所述鸭病毒性疾病包括：雏鸭病毒性肝炎、鸭瘟(鸭病毒性肠炎)、小鹅瘟、番鸭细小病毒病、雏番鸭小鹅瘟、鸭流行性出血症(黑羽病)、鸭花肝病、鸭病毒性脑炎、鸭呼肠孤病毒感染、鸭腺病毒感染、鸭的传染性囊病、鸭副黏病毒病(鸭新城疫)、鸭冠状病毒感染、鸭流感中的一种或多种。

本发明更进一步公开了一种制备所述鸭λ干扰素或者鸭λ干扰素突变体的方法，包括以下步骤：(1)分别将所述鸭λ干扰素或者所述鸭λ干扰素突变体的编码基因克隆到杆状病毒转移载体中构建得到重组转移载体；(2)将重组转移载体与杆状病毒DNA共转染昆虫细胞，获得重组杆状病毒；(3)将重组杆状病毒感染昆虫细胞或昆虫宿主，培养被感染的昆虫细胞或昆虫宿主表达相应的蛋白，纯化，即得。

其中，所述杆状病毒转移载体优选自AcRP23-lacZ、AcRP6-SC、AcUWl-lacZ、BacPAK6、Bac to Pac、Bacmid、BlucBacII(pETL)、p2Bac、p2Blue、p89B310、pAc360、pAc373、pAcAB3、pAcAB 4、PAcAS3、pAcC129、pAcC4、DZI、pAcGP67、pAcIEl、pAcJPl、pAcMLF2、pAcMLF 7、pAcMLF 8、pAcMPl、pAcMP2、pAcRP23、pAcRP 25、pAcRW4、pAcsMAG、pAcUWl、pAcUW21、pAcUW2A、pAcUW2B、pAcUW3、pAcUW31、pAcUW41、pAcUW42、pAcUW43、pAcUW51、pAcVC2、pAcVC 3、pAcYMl、pAcJcC5、pBacl、pBac2、pBlueBacIII、pBlueBaSWis、pEV55、mXIV、pIEINeo、pJVETL、pJVNhel、pJVP10、pJVrsMAG、pMBac、pP10、pPAKl、pPBac、pSHONEX1.1、pSYN XIV VI+、pSYNVI+wp、pSYNXIV VI-、pVL1391、pVL 1392、pVL 1393、pVL941、pVL 945、pVL 985、pVTBac、pBM030或pUAC-5；

优选的，所述杆状病毒选自家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid、BmNPV、AcMNPV、ApNPV、HaNPV、HzNPV、LdMNPV、MbMNPV、OpMNPV、SlMNPV、SeMNPV或SpltNPV；

优选的，所述昆虫宿主选自家蚕(Bombyx mori)、野蚕(Bombyx mandarina)、蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricim)、樟蚕(Dictyoploca japanica)、樗蚕(Philosamia cynthia pryeri)、柞蚕(Antheraea pernyi)、日本柞蚕(Antheraea yamamai)、野天蚕(Antheraea polyphymus)、苜蓿尺蠖(Atographa califorica)、茶尺蠖(Ectropis obliqua)、甘兰夜蛾(Mamestra brassicae)、斜纹夜蛾(Spodoptera littoralis)、秋粘虫(Spodoptera frugiperda)、粉纹夜蛾(TriSWoplusia ni)、行军虫(Thaumetopoea wilkinsoni)、棉铃虫(Heliothis armigera)、美国棉铃虫(Heliothis zea)、烟青虫(Heliothis assulta)、烟草夜蛾(Heliothis virescens)、东方粘虫(Pseudaletia separata)或舞毒蛾(Lymantria dispar)；

最优选的，所述杆状病毒转移载体为pVL1393；所述杆状病毒为家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid；所述昆虫宿主为家蚕(Bombyx mori)。

所述感染是指重组杆状病毒通过吞食或透过表皮来感染1-5龄的昆虫幼虫或蛹体；优选为，将重组家蚕杆状病毒感染家蚕细胞或穿刺接种1-5龄的家蚕幼虫或蛹，在感染3-6天后收集含各种鸭λ干扰素基因的家蚕幼虫或蛹的体液或组织匀浆；其中，所述的蛹优选为1-2天的早期嫩蛹。

本发明技术方案与现有技术相比，具有以下有益效果：

本发明通过分析NCBI上所有鸭λ干扰素氨基酸序列，进行序列比对及信号肽分析，生成保守序列，并对保守序列进行密码子优化，以密码子优化后的序列为模板设计多对引物用融合PCR法进行氨基酸单位点突变、氨基酸多位点突变，获得了多个鸭λ干扰素突变体。本发明利用家蚕杆状病毒表达系统在家蚕生物反应器中表达所述鸭λ干扰素突变体，采用家蚕杆状病毒表达系统在家蚕虫(蛹)体内对鸭Ⅲ型干扰素IFN-λ进行表达，以获得大量优质廉价的鸭Ⅲ型干扰素蛋白，本发明方法工艺简单，可快速获得大量安全可靠的鸭λ干扰素；所表达的鸭λ干扰素突变体的抗病毒活性大幅度提高，具有较为明显的抗病毒活性；本发明所述的鸭λ干扰素突变体能够用于制备预防或治疗鸭病毒性疾病的药物或试剂，对鸭养殖业的发展具有重大意义。

本发明所涉及到的术语定义

除非另外定义，否则本文所用的所有技术及科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所了解相同的含义。

术语“多核苷酸”或“核苷酸”意指单股或双股形式的脱氧核糖核苷酸、脱氧核糖核苷、核糖核苷或核糖核苷酸及其聚合物。除非特定限制，否则所述术语涵盖含有天然核苷酸的已知类似物的核酸，所述类似物具有类似于参考核酸的结合特性并以类似于天然产生的核苷酸的方式进行代谢。除非另外特定限制，否则所述术语也意指寡核苷酸类似物，其包括PNA(肽核酸)、在反义技术中所用的DNA类似物(硫代磷酸酯、磷酰胺酸酯等等)。除非另外指定，否则特定核酸序列也隐含地涵盖其保守修饰的变异体(包括(但不限于)简并密码子取代)和互补序列以及明确指定的序列。特定而言，可通过产生其中一个或一个以上所选(或所有)密码子的第3位经混合碱基和/或脱氧肌苷残基取代的序列来实现简并密码子取代(Batzer等人，Nucleic Acid Res.19:5081(1991)；Ohtsuka等人，J.Biol.Chem.260:2605-2608(1985)；和Cassol等人，(1992)；Rossolini等人，MolCell.Probes8:91-98(1994))。

术语“同源性”，指与天然核酸序列的序列相似性。“同源性”包括与本发明的调控片段的核苷酸序列具有优选地85％或更高，更优选地90％或更高，以及最优选地95％或更高同一性的核苷酸序列。同源性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件，两个或多个序列之间的同源性可以用百分比(％)表示，其可以用来评价相关序列之间的同源性。

术语“互补的”在此指的是两种包括反向平行核苷酸序列的核苷酸序列，反向平行核苷酸序列能在反向平行核苷酸序列的互补碱基残基之间形成氢键后彼此相互配对。本领域已知的是，当都从5’到3’的方向看序列时，两种互补链的核苷酸序列是彼此反向互补的。本领域也已知的是，两种在给定的条件组下能彼此杂交的序列不必必须是100％完全互补的。

术语“严谨杂交条件”意指在所属领域中已知的低离子强度和高温的条件。通常，在严谨条件下，探针与其靶序列杂交的可检测程度比与其它序列杂交的可检测程度更高(例如超过本底至少2倍)。严谨杂交条件是序列依赖性的，在不同的环境条件下将会不同，较长的序列在较高温度下特异性杂交。通过控制杂交的严谨性或洗涤条件可鉴定与探针100％互补的靶序列。对于核酸杂交的详尽指导可参考有关文献(Tijssen,Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hybridization with Nucleic Probes,"Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acid assays.1993)。更具体的，所述严谨条件通常被选择为低于特异序列在规定离子强度pH下的热熔点(Tm)约5-10℃。Tm为在平衡状态下50％与目标互补的探针杂交到目标序列时所处的温度(在指定离子强度、pH和核酸浓度下)(因为目标序列过量存在，所以在Tm下在平衡状态下50％的探针被占据)。严谨条件可为以下条件：其中在pH 7.0到8.3下盐浓度低于约1.0M钠离子浓度，通常为约0.01到1.0M钠离子浓度(或其它盐)，并且温度对于短探针(包括(但不限于)10到50个核苷酸)而言为至少约30℃，而对于长探针(包括(但不限于)大于50个核苷酸)而言为至少约60℃。严谨条件也可通过加入诸如甲酰胺的去稳定剂来实现。对于选择性或特异性杂交而言，正信号可为至少两倍的背景杂交，视情况为10倍背景杂交。例示性严谨杂交条件可如下：50％甲酰胺，5×SSC和1％SDS，在42℃下培养；或5×SSC，1％SDS，在65℃下培养，在0.2×SSC中洗涤和在65℃下于0.1％SDS中洗涤。所述洗涤可进行5、15、30、60、120分钟或更长时间。

术语“突变”和“突变体”在此具有它们的常用含义，指的是在核酸或多肽序列中的遗传的、天然存在的或引入的变化，它们的意义与本领域人员通常所知的意义相同。

术语“宿主细胞”或“重组宿主细胞”意指包含本发明多核苷酸的细胞，而不管使用何种方法进行插入以产生重组宿主细胞，例如直接摄取、转导、f配对或所属领域中已知的其它方法。外源性多核苷酸可保持为例如质粒的非整合载体或者可整合入宿主基因组中。

术语“转染”指真核细胞由于外源DNA掺入而获得新的遗传标志的过程。

附图说明

图1为细胞病变比例对应的荧光图；其中，A，“-”：无细胞病变；B，“±”：几个细胞病变；C，“+”：5％～15％细胞病变；D，“++”：20％～30％细胞病变。

图2为重组质粒pVL-DuIFN-λ的双酶切鉴定；其中，M：DNA分子质量标准；1：为阴性对照；2：重组质粒pVL-DuIFN-λ双酶切产物。

图3为细胞出现荧光的各种比例的情况；其中，A：细胞中的VSV病毒复制被干扰素抑制未显示荧光；B：细胞中的VSV病毒未能被低剂量干扰素抑制所显示的荧光；C：大部分细胞未能被干扰素抑制VSV病毒复制后所显示的荧光。

具体实施方式

下面结合具体实施例来进一步描述本发明，本发明的优点和特点将会随着描述而更为清楚。但是应理解所述实施例仅是范例性的，不对本发明的范围构成任何限制。本领域技术人员应该理解的是，在不偏离本发明的精神和范围下可以对本发明技术方案的细节和形式进行修改或替换，但这些修改或替换均落入本发明的保护范围。

1、试验材料与试剂

转移载体pVL1393，E.coli菌株TOP10，BmN细胞，VSV-GFP病毒，均由中国农业科学院生物技术研究所保存和提供；试验家蚕品种秋丰×白玉为江苏科技大学蚕业研究所提供，亲本病毒BmBacmid DNA按照文献(专利号：ZL 201110142492.4，授权日期：2013.01.23)中所公开的方法构建。SPF鸭胚购自北京梅里亚维通实验动物技术有限公司，限制性内切酶、T4DNA连接酶购自Promega公司，PCR反应所用的LA Taq DNA聚合酶及其它相关试剂均购自TakaRa公司，脂质体购自Invitrogen公司，DMEM细胞培养基、胎牛血清为GIBCO公司产品。有关溶液和培养基的配置方法参照相关工具书(Joseph et al.，分子克隆实验指南第三版，2002；奥斯伯，等人，精编分子生物学指南，1998；David L.Spector，细胞实验指南，2001)；除非另外说明，否则百分比和份数按重量计算。

2、通用实验方法

实验方法中用于定点突变的融合PCR方法，参照邝翡婷等人(一种载体构建的新方法：重组融合PCR法，基因组学与应用生物学，2012年，第31卷，第6期，第634-639页)所描述的方法进行。

实验方法中计算干扰素的效价，利用DEF/VSV*GFP系统，使用Reed-Muench方法，具体操作参照刘兴健，等(猫ω-like干扰素在家蚕中的表达和生物活性检测，生物技术进展，2015，5(6)：441-445)以及Summers MD等(A manual of methods for baculovirus vectors and insect cell culture procedures[R].Texas Agricultural Experiment Station，1987)所描述的方法进行，其中判断细胞病变的标准参照图1。

每一个实施案例中的最佳改良方案均作为下一实施案例改良方案的比较标准。

实施例1鸭λ干扰素基因在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1目的基因的合成和重组质粒的构建

本发明分析了NCBI上所有的鸭λ干扰素氨基酸序列，进行序列比对及信号肽分析，最终确定以登录号为NP_001297721.1所示的氨基酸序列做为鸭λ干扰素原始氨基酸序列，其氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示。

用DNAman软件分析限制性酶切位点，根据酶切位点分析结果及转移载体pVL1393和pUC57上的多克隆位点，在目的基因两端加入目的基因序列中不存在的限制性酶切位点。根据分析结果在其5’端加入BamHI酶切位点和Kozak序列，3’端加入EcoRI酶切位点，将确定好的基因序列交由南京金斯瑞生物科技有限公司合成，并插入pUC57载体，形成质粒pUC57-DuIFN-λ。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用BamHI、EcoRI对合成的pUC57-DuIFN-λ进行双酶切处理，玻璃奶法回收目的片段，酶切回收的DuIFN-λ目的片段与经BamHI、EcoRI双酶切处理后的转移载体pVL1393连接。用T4DNA连接酶，16℃，连接过夜。将连接产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-DuIFN-λ。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

根据已有文献报道的方法进行BmN细胞的复苏、传代以及重组病毒的筛选。当BmN细胞培养至细胞单层达80％左右时，倒掉旧培养基，用无血清TC-100培养基洗三次，加1.5mL无FBS培养基。向一灭菌管中依次加入1μg家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid DNA，2μg重组转移质粒和5μL脂质体，用无菌双蒸水补足体积到60μL，轻轻混匀，静置15min后，逐滴加入到培养瓶中进行共转染。27℃培养4h后补加1.5mL无血清培养基和300μL FBS。27℃恒温培养4～5天，至细胞脱落浮起，收集细胞培养液，获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ)。

重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法如下：接种适量细胞(约70～80％)于35mm小平皿中，细胞贴壁后，吸去培养基，将收集的细胞培养液进行不同浓度稀释，取1mL加到贴壁细胞中，分布均匀。27℃感染1h后，吸去感染液，将2％低融点琼脂糖凝胶于60℃水浴中融化，冷至40℃与40℃预热的2×TC-100培养基(含20％FBS)混合均匀，每个平皿加4mL胶，待凝固后用Parafilm封口，27℃倒置培养3～5d，显微镜观察。把不含有多角体的空斑挑选出来，重复以上步骤，经过2～3轮的纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ)。

1.4鸭λ干扰素在家蚕体内表达

将重组病毒培养液按10⁵PFU/头的剂量注射5龄起蚕，在27℃、70％～80％湿度的条件下培养，家蚕幼虫生长晚期，DuIFN-λ在多角体基因启动子的作用下得到高效表达。接种感染3.5d～4d左右，可以观察到家蚕幼虫体节肿胀、行为异常、食欲下降等症状，当观察到幼虫体积明显缩小，停止进食时，收集血淋巴，-20℃保存备用。

1.5鸭胚成纤维细胞(DEF)的制备及鸭λ干扰素抗病毒活性检测

取10～12日龄鸭胚，超净台中消毒蛋壳以后，从气室敲碎蛋壳，取出胚体，剪去头和四肢，HBSS冲洗3次，将胚体放入灭菌的三角瓶中并剪成小米粒大小，再用HBSS冲洗3次，加胰酶在37℃消化40min，弃去胰酶并用HBSS冲洗3次，以除去残留胰酶，加入30mL完全培养基，吹打并晃动三角瓶使细胞分散，用8层灭菌纱布过滤，得到细胞悬液，进行细胞计数并将细胞稀释至10⁶个/mL。

采用微量细胞病变抑制法在DEF/VSV*GFP系统上检测蚕血淋巴中表达的鸭λ干扰素的抗病毒活性。将制备好的DEF细胞以3.0×10⁵个/mL的密度接种于96孔培养板中。将已超声破碎并过滤除菌的蚕血淋巴用含50mL/L胎牛血清的M199培养液配制成不同稀释度的溶液，将稀释好的样品按100μL/孔接种于已经铺满DEF细胞的培养孔内，每个稀释度和对照蚕血至少设12个复孔，同时设不加蚕血淋巴及VSV*GFP的细胞对照组和添加VSV*GFP的病毒对照组，于37℃、5％CO2条件下培养18～24h。将稀释至100TCID50的VSV*GFP病毒，按100μL/孔加入已经吸弃上清液的培养孔内，置于37℃、5％CO2条件下培养。在倒置荧光显微镜下观察，当病毒对照组各孔中大量细胞出现荧光，而细胞对照组中的细胞仍完全生长良好，无荧光出现时，则表明对照系统完全合格，即可作全面观察。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-DuIFN-λ经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段在500bp-750bp之间，与目的基因片段558bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明鸭λ干扰素基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2鸭λ干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

表1重组鸭λ干扰素抗病毒活性的检测结果

实施例2 DuIFN-λ氨基酸保守序列的获得及其进行优化后的序列在家蚕生物反应器中的表达与检测1.1鸭λ干扰素氨基酸保守序列的获得及其密码子优化突变体基因的构建

对鸭λ干扰素的所有氨基酸序列进行分析，生成其保守序列，其氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示，核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示。

本发明利用OptimumGene^TM技术对上述鸭λ干扰素保守序列基因(SEQ ID NO.4)进行优化，根据生物反应器家蚕的密码子偏好性对基因序列进行改造，对影响基因转录效率、翻译效率和蛋白折叠的GC含量、CpG二核苷酸含量、密码子偏好性、mRNA的二级结构、mRNA自由能稳定性、RNA不稳定性基序、重复序列等多种相关参数进行优化设计，有利于提高所优化基因在家蚕中的转录效率与翻译效率，并保持最终翻译成的蛋白序列不变。

为了提高在家蚕杆状病毒真核表达体系中的翻译起始效率，在基因ATG前面加了Kozak序列ACGAAC。此外，还去除了基因序列内部的BamHI、EcoRI、SmaI等限制性酶切位点，在基因上游加上了BamHI，在基因下游加上了EcoRI限制性酶切位点，以便后续克隆到真核转移载体pVL1393中。

所设计的鸭λ干扰素基因进行优化后的序列由生物科技公司人工合成，命名为DuIFN-λ-C-O突变体，其核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，合成的基因片段插入pUC57载体，形成质粒pUC57-DuIFN，命名为pUC57-DuIFN-λ-C-O。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

具体操作参照实施例1，将测序正确的质粒命名为pVL-DuIFN-λ-C-O。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

BmN细胞的复苏、传代参照实施例1，通过共转染获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O)。重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法参照实施例1，通过纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O)。

1.4鸭λ干扰素突变体在家蚕体内表达

同实施例1。

1.5鸭胚成纤维细胞(DEF)的制备及鸭λ干扰素抗病毒活性检测

同实施例1。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-DuIFN-λ-C-O经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段在500bp-750bp之间，与目的基因片段558bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明鸭λ干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2鸭λ干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在DEF/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的鸭λ干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组鸭λ干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据鸭λ干扰素对DEF细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素的效价。检测结果列于表2，抗病毒活性测定结果表明在蚕幼虫体内表达的DuIFN-λ-C-O有较为显著的抗病毒活性，效价达2.58×10⁶U/mL，达到了预期的效果，说明在鸭λ干扰素基因上优化的方法来提高DuIFN-λ抗病毒活性是可行和有效的。

表2鸭λ干扰素突变体优化后抗病毒活性的检测结果

实施例3 DuIFN-λ-C-O进行氨基酸单位点突变后在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1鸭λ干扰素突变体基因的构建

本发明以DuIFN-λ-C-O的基因序列为模板，设计多对引物对序列进行定点突变，定点突变是利用融合PCR的方法进行，突变体的转移载体的构建采用同源重组法进行，具体方法参照马凯，等(双酶切和同源重组方法构建pMIR-reporter载体的比较[J].中国病原生物学杂志,2015(6):495-499.)进行并测序验证。

突变位点分别为A19V、S30T、Y41S、L48Q、K51R、N56S、P62S、T74K、L84I、I95V、D104H、F117L、G126D、Q136K、H143Y、S158G、V166L、H173N；所得的鸭λ干扰素突变体命名为DuIFN-λ-C-O-M1(A19V、S30T、Y41S、L48Q、K51R、N56S、P62S、T74K、L84I、I95V、D104H、F117L、G126D、Q136K、H143Y、S158G、V166L、H173N)突变体。

DuIFN-λ-C-O核苷酸序列进行氨基酸单位点及多位点突变所需引物：

(1)两侧上下游引物：

F:TCATACCGTCCCACCATCGGGCCGGGATCCACGAACATGCTGTGCCCTGTG

R:GATCTGCAGCGGCCGCTCCGGAATTCTTAGGTGCAACGCTCAG

(2)中间上下游引物

1.A19V GCT-GTT

F1:TGGGTCTGGGACCACTGCTGGTTGGAGCCTTCCCACAGGCTG

R1:CAGCCTGTGGGAAGGCTCCAACCAGCAGTGGTCCCAGACCCA

2.S30T TCC-ACC

F2:CACAGGCTGCCCTGAAGAAGACCTGCCGCCTGAGCCAGTACG

R2:CGTACTGGCTCAGGCGGCTGGACTTCTTCAGGGCAGCCTGTG

3.Y41S TAC-TCC

F3:GCCAGTACGGATCTCCAGCTTCCTCAGAGCTGGCCGAAGTGCTG

R3:GCACTTCGGCCAGCTCTGAGGAAGCTGGAGATCCGTACTGGCTC

4.L48Q CTG-CAG

F4：TCAGAGCTGGCCGAAGTGCAGAAGTTCAAGAAGTACTACGA

R4：TCGTAGTACTTCTTGAACTTCTGCACTTCGGCCAGCTCTGA

5.K51R AAG-AGG

F5：GGCCGAAGTGCTGAAGTTCAGGAAGTACTACGAAAACATCAC

R5：GTGATGTTTTCGTAGTACTTCCTGAACTTCAGCACTTCGGCC

6.N56S AAC-AGC

F6:GTTCAAGAAGTACTACGAAAGCATCACCTCCAAGGACCCTAAG

R6:CTTAGGGTCCTTGGAGGTGATGCTTTCGTAGTACTTCTTGAAC

7.P62S CCT-TCT

F7:GAAAACATCACCTCCAAGGACTCTAAGTGCAGCACTCGCCTG

R7:CAGGCGAGTGCTGCACTTAGAGTCCTTGGAGGTGATGTTTTC

8.T74K ACC-AAG

F8:GCCTGTTCAACCGTAAGTGGAAGCCAAACGAGCTGTCCGTG

R8:CACGGACAGCTCGTTTGGCTTCCACTTACGGTTGAACAGGC

9.L84I CTG-ATC

F9:GCTGTCCGTGCCTGACCGTATCCTGCTGGTCGAGGCTGAAC

R9:GTTCAGCCTCGACCAGCAGGATACGGTCAGGCACGGACAGC

10.I95V ATC-GTC

F10:GGCTGAACTGGACCTGACTGTCGCTGTGCTGGCCCACCCTAC

R10:GTAGGGTGGGCCAGCACAGCGACAGTCAGGTCCAGTTCAGCC

11.D104H GAC-CAC

F11:GCTGGCCCACCCTACCGTGCACAAGCTGGCCGAAAAGTCTC

R11:GAGACTTTTCGGCCAGCTTGTGCACGGTAGGGTGGGCCAGC

12.F117L TTC-TTG

F12:CTCAGCAGCCCCTGGCTTTCTTGACTCAGGCCAGGGAAGACC

R12:GGTCTTCCCTGGCCTGAGTCAAGAAAGCCAGGGGCTGCTGAG

13.G126D GGA-GAC

F13:GGCCAGGGAAGACCTGAGAGACTGCGTGGCTGCCGAGGCTCC

R13:GGAGCCTCGGCAGCCACGCAGTCTCTCAGGTCTTCCCTGGCC

14.Q136K CAG-AAG

F14:GCCGAGGCTCCATCTCACAAGCCATCTGGCAAGCTGAGGCAC

R14:GCCTCAGCTTGCCAGATGGCTTGTGAGATGGAGCCTCGGCAGC

15.H143Y CAC-TAC

F15:CCATCTGGCAAGCTGAGGTACTGGCTGCAAAAGCTGGAGAC

R15:GTCTCCAGCTTTTGCAGCCAGTACCTCAGCTTGCCAGATGG

16.S158G TCT-GGT

F16:GCTAAGAAGACCGAAACTGCCGGTTGCCTGGAGTACTCAACCATC

R16:GATGGTTGAGTACTCCAGGCAACCGGCAGTTTCGGTCTTCTTAGC

17.V166L GTG-TTG

F17:CCTGGAGTACTCAACCATCTTGCACCTGTTCCAGGTCCTGC

R17:GCAGGACCTGGAACAGGTGCAAGATGGTTGAGTACTCCAGG

18.H173N CAC-AAC

F18:CACCTGTTCCAGGTCCTGAACGACCTGGGTTGCGTCGCC

R18:GGCGACGCAACCCAGGTCGTTCAGGACCTGGAACAGGTG

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用重组酶(pEASY-Uni Seamless Cloning and Assenbly Kit)将玻璃奶法回收的上述目的片段与经过BamHI和EcoRI双酶切的灭活杆状病毒转移载体pVL1393同源重组，重组产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒测序，测序正确的质粒命名为pVL-DuIFN-λ-C-O-M1(A19V、S30T、Y41S、L48Q、K51R、N56S、P62S、T74K、L84I、I95V、D104H、F117L、G126D、Q136K、H143Y、S158G、V166L、H173N)。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

同实施例1。

通过共转染获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M1)。

通过纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M1)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M1)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M1)。

1.4鸭λ干扰素突变体在家蚕体内表达

同实施例1。

1.5鸭胚成纤维细胞(DEF)的制备及鸭λ干扰素抗病毒活性检测

同实施例1。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-DuIFN-λ-C-O-M1经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位在500bp-750bp之间，与目的基因片段558bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明鸭λ干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2鸭λ干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在DEF/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的鸭λ干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组鸭λ干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据鸭λ干扰素对DEF细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素效价，检测结果列于表3，所有鸭λ干扰素突变体测得效价在8.58×10⁴U/mL～3.65×10⁶U/mL，其中S30T、N56S、I95V、Q136K或V166L这5个位点突变后，表达的鸭λ干扰素效价略高于保守序列表达测得的效价，而其余位点突变后效价不变甚至降低，说明这5个位点的突变是有效突变，可以达到提高DuIFN-λ抗病毒活性的目的。其中，DuIFN-λ-C-O-I95V突变体具有最强抗病毒作用。

表3重组鸭λ干扰素单位点突变抗病毒活性的检测结果

实施例4DuIFN-λ-C-O-M1突变体进行氨基酸多位点突变后在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1鸭λ干扰素突变体基因的构建

鉴于实施例3的结果所确定部分位点的突变是有效突变可达到提高DuIFN-λ-C-O突变体的抗病毒活性目的。考虑到氨基酸的排列顺序是蛋白质的一级结构，并决定着蛋白质的高级结构，且实施例3中进行的氨基酸单位点突变有部分突变位点的位置可能是相互关联的，故尝试进行氨基酸多位点突变。本发明将抗病毒活性提高的单突变位点S30T、N56S、I95V、Q136K和V166L互相组合，进行多位点突变，多位点突变是在实施例3获得的单位点突变序列的基础之上，以其(DuIFN-λ-C-O-M1)作为模板，利用相应的引物(详见实施例3)，通过多轮融合PCR的方法进行的定点突变，从而获得多位点突变的目的片段，突变体的转移载体的构建采用同源重组法进行，具体方法参照马凯,等(双酶切和同源重组方法构建pMIR-reporter载体的比较[J].中国病原生物学杂志,2015(6):495-499.)进行，并测序验证。

多突变位点为S30T-N56S、S30T-I95V、S30T-Q136K、S30T-V166L、N56S-I95V、N56S-Q136K、N56S-V166L、I95V-Q136K、I95V-V166L、Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V、S30T-N56S-Q136K、S30T-N56S-V166L、S30T-I95V-Q136K、S30T-I95V-V166L、S30T-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K、N56S-I95V-V166L、N56S-Q136K-V166L、I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K、S30T-N56S-I95V-V166L、S30T-N56S-Q136K-V166L、S30T-I95V-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K-V166L共26种组合，所获得的鸭λ干扰素突变体命名为DuIFN-λ-C-O-M2(S30T-N56S、S30T-I95V、S30T-Q136K、S30T-V166L、N56S-I95V、N56S-Q136K、N56S-V166L、I95V-Q136K、I95V-V166L、Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V、S30T-N56S-Q136K、S30T-N56S-V166L、S30T-I95V-Q136K、S30T-I95V-V166L、S30T-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K、N56S-I95V-V166L、N56S-Q136K-V166L、I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K、S30T-N56S-I95V-V166L、S30T-N56S-Q136K-V166L、S30T-I95V-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K-V166L)突变体。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

方法同实施例3。测序正确的质粒命名为pVL-DuIFN-λ-C-O-M2(S30T-N56S、S30T-I95V、S30T-Q136K、S30T-V166L、N56S-I95V、N56S-Q136K、N56S-V166L、I95V-Q136K、I95V-V166L、Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V、S30T-N56S-Q136K、S30T-N56S-V166L、S30T-I95V-Q136K、S30T-I95V-V166L、S30T-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K、N56S-I95V-V166L、N56S-Q136K-V166L、I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K、S30T-N56S-I95V-V166L、S30T-N56S-Q136K-V166L、S30T-I95V-Q136K-V166L、N56S-I95V-Q136K-V166L、S30T-N56S-I95V-Q136K-V166L)。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

同实施例1。

通过共转染获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M2)。

通过纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M2)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M2)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(DuIFN-λ-C-O-M2)。

1.4鸭λ干扰素突变体在家蚕体内表达

同实施例1。

1.5鸭胚成纤维细胞(DEF)的制备及鸭λ干扰素抗病毒活性检测

同实施例1。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-DuIFN-λ-C-O-M2经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位于500bp-750bp之间，与目的基因片段558bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明鸭λ干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2鸭λ干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在DEF/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的鸭λ干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组鸭λ干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据鸭λ干扰素对DEF细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素效价，检测结果列于表4，所有鸭λ干扰素突变体测得效价在8.16×10⁴U/mL～5.01×10⁶U/mL，其中N56S-I95V、I95V-Q136K、N56S-I95V-Q136K、N56S-I95V-Q136K-V166L四组多突变后，表达的鸭λ干扰素效价略高于保守序列以及单突变序列表达测得的效价，而其余几组位点突变后效价不变甚至降低，说明这4个组合位点的突变是有效突变，可以达到提高DuIFN-λ-C-O-M1突变体抗病毒活性的目的。其中，DuIFN-λ-C-O-N56S-I95V-Q136K-V166L突变体具有最强抗病毒作用，其氨基酸序列为SEQ ID NO.6所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.7所示。

表4重组鸭λ干扰素多位点突变抗病毒活性的检测结果

SEQUENCE LISTING

<110> 中国农业科学院生物技术研究所

<120> 鸭λ干扰素突变体及其制备方法和应用

<130> BJ-2002-190529A

<160> 7

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 185

<212> PRT

<213> Duck

<400> 1

Met Leu Cys Pro Val Phe Ala Ala Val Leu Val Val Gly Leu Gly Pro

1 5 10 15

Leu Leu Ala Gly Ala Phe Pro Gln Ala Ala Leu Lys Lys Ser Cys Arg

20 25 30

Leu Ser Gln Tyr Gly Ser Pro Ala Tyr Ser Glu Leu Ala Glu Val Leu

35 40 45

Lys Phe Lys Lys Tyr Tyr Glu Asn Ile Thr Ser Lys Asp Pro Lys Cys

50 55 60

Ser Thr Arg Leu Phe Asn Arg Lys Trp Thr Pro Asn Glu Leu Ser Val

65 70 75 80

Pro Asp Arg Leu Leu Leu Val Glu Ala Glu Leu Asp Leu Thr Ile Ala

85 90 95

Val Leu Ala His Pro Thr Val Asp Lys Leu Ala Glu Lys Ser Gln Gln

100 105 110

Pro Leu Ala Phe Phe Thr Gln Ala Arg Glu Asp Leu Arg Gly Cys Val

115 120 125

Ala Ala Glu Ala Pro Ser His Gln Pro Ser Gly Lys Leu Arg His Trp

130 135 140

Leu Gln Lys Leu Glu Thr Ala Lys Lys Thr Glu Thr Ala Ser Cys Leu

145 150 155 160

Glu Tyr Ser Thr Ile Val His Leu Phe Gln Val Leu His Asp Leu Gly

165 170 175

Cys Val Ala Ile Pro Glu Arg Cys Thr

180 185

<210> 2

<211> 558

<212> DNA

<213> Duck

<400> 2

atgctgtgcc ccgtattcgc cgcggtgctg gtggtgggcc tggggcccct gctggcgggc 60

gccttccccc aggctgccct gaagaagagc tgccgcctct cccagtacgg atccccggcg 120

tattccgagc tggcggaggt gctgaagttt aagaagtact atgagaacat cacgtcgaag 180

gaccccaaat gcagcaccag gctcttcaat cggaagtgga cacccaacga gctgtcggtg 240

cctgaccgac tcctcctggt ggaagccgag ctggacctca ccatcgccgt gctggcacac 300

cccacagtcg acaagctggc cgagaagagc cagcagcccc tggccttctt cacccaagcc 360

cgggaggacc tgcgaggctg cgtggccgct gaggctcctt cgcatcagcc ctctgggaag 420

ctgaggcact ggctgcagaa gctggagacg gccaagaaga cggagaccgc cagctgcctg 480

gagtactcca ccatcgtcca cctcttccaa gtgctgcacg acctggggtg cgtggccatt 540

ccggagcggt gcacgtag 558

<210> 3

<211> 185

<212> PRT

<213> Duck

<400> 3

Met Leu Cys Pro Val Phe Ala Ala Val Leu Val Val Gly Leu Gly Pro

1 5 10 15

Leu Leu Ala Gly Ala Phe Pro Gln Ala Ala Leu Lys Lys Ser Cys Arg

20 25 30

Leu Ser Gln Tyr Gly Ser Pro Ala Tyr Ser Glu Leu Ala Glu Val Leu

35 40 45

Lys Phe Lys Lys Tyr Tyr Glu Asn Ile Thr Ser Lys Asp Pro Lys Cys

50 55 60

Ser Thr Arg Leu Phe Asn Arg Lys Trp Thr Pro Asn Glu Leu Ser Val

65 70 75 80

Pro Asp Arg Leu Leu Leu Val Glu Ala Glu Leu Asp Leu Thr Ile Ala

85 90 95

Val Leu Ala His Pro Thr Val Asp Lys Leu Ala Glu Lys Ser Gln Gln

100 105 110

Pro Leu Ala Phe Phe Thr Gln Ala Arg Glu Asp Leu Arg Gly Cys Val

115 120 125

Ala Ala Glu Ala Pro Ser His Gln Pro Ser Gly Lys Leu Arg His Trp

130 135 140

Leu Gln Lys Leu Glu Thr Ala Lys Lys Thr Glu Thr Ala Ser Cys Leu

145 150 155 160

Glu Tyr Ser Thr Ile Val His Leu Phe Gln Val Leu His Asp Leu Gly

165 170 175

Cys Val Ala Ile Pro Glu Arg Cys Thr

180 185

<210> 4

<211> 558

<212> DNA

<213> Duck

<400> 4