1.引物组合,包括
用于扩增sol_kasp01位点的引物组1、
用于扩增sol_kasp02位点的引物组2、
用于扩增sol_kasp03位点的引物组3、
用于扩增sol_kasp04位点的引物组4、
用于扩增sol_kasp05位点的引物组5、
用于扩增sol_kasp06位点的引物组6、
用于扩增sol_kasp07位点的引物组7、
用于扩增sol_kasp08位点的引物组8、
用于扩增sol_kasp09位点的引物组9、
用于扩增sol_kasp10位点的引物组10、
用于扩增sol_kasp11位点的引物组11、
用于扩增sol_kasp12位点的引物组12、
用于扩增sol_kasp13位点的引物组13、
用于扩增sol_kasp14位点的引物组14、
用于扩增sol_kasp15位点的引物组15、
用于扩增sol_kasp16位点的引物组16、
用于扩增sol_kasp17位点的引物组17和
用于扩增sol_kasp18位点的引物组18;
sol_kasp01位点—sol_kasp18位点为莴苣基因组的18个snp位点;
sol_kasp01位点为1号染色体上的第126697665位核苷酸;
sol_kasp02位点为1号染色体上的第147985160位核苷酸;
sol_kasp03位点为2号染色体上的第122143189位核苷酸;
sol_kasp04位点为2号染色体上的第210259848位核苷酸;
sol_kasp05位点为3号染色体上的第27187844位核苷酸;
sol_kasp06位点为3号染色体上的第212222861位核苷酸;
sol_kasp07位点为3号染色体上的第247666277位核苷酸;
sol_kasp08位点为4号染色体上的第215625068位核苷酸;
sol_kasp09位点为4号染色体上的第340636295位核苷酸;
sol_kasp10位点为5号染色体上的第313574466位核苷酸;
sol_kasp11位点为6号染色体上的第88254911位核苷酸;
sol_kasp12位点为7号染色体上的第210730056位核苷酸;
sol_kasp13位点为7号染色体上的第89707923位核苷酸;
sol_kasp14位点为7号染色体上的第103614221位核苷酸;
sol_kasp15位点为8号染色体上的第215217745位核苷酸;
sol_kasp16位点为8号染色体上的第240162601位核苷酸;
sol_kasp17位点为9号染色体上的第84172204位核苷酸;
sol_kasp18位点为9号染色体上的第173010178位核苷酸。
2.如权利要求1所述的引物组合,其特征在于:
所述引物组1由seqidno:1所示的正向引物01f1、seqidno:2所示的正向引物01f2和seqidno:3所示的反向引物01r组成;
所述引物组2由seqidno:4所示的正向引物02f1、seqidno:5所示的正向引物02f2和seqidno:6所示的反向引物02r组成;
所述引物组3由seqidno:7所示的正向引物03f1、seqidno:8所示的正向引物03f2和seqidno:9所示的反向引物03r组成;
所述引物组4由seqidno:10所示的正向引物04f1、seqidno:11所示的正向引物04f2和seqidno:12所示的反向引物04r组成;
所述引物组5由seqidno:13所示的正向引物05f1、seqidno:14所示的正向引物05f2和seqidno:15所示的反向引物05r组成;
所述引物组6由seqidno:16所示的正向引物06f1、seqidno:17所示的正向引物06f2和seqidno:18所示的反向引物06r组成;
所述引物组7由seqidno:19所示的正向引物07f1、seqidno:20所示的正向引物07f2和seqidno:21所示的反向引物07r组成;
所述引物组8由seqidno:22所示的正向引物08f1、seqidno:23所示的正向引物08f2和seqidno:24所示的反向引物08r组成;
所述引物组9由seqidno:25所示的正向引物09f1、seqidno:26所示的正向引物09f2和seqidno:27所示的反向引物09r组成;
所述引物组10由seqidno:28所示的正向引物10f1、seqidno:29所示的正向引物10f2和seqidno:30所示的反向引物10r组成;
所述引物组11由seqidno:31所示的正向引物11f1、seqidno:32所示的正向引物11f2和seqidno:33所示的反向引物11r组成;
所述引物组12由seqidno:34所示的正向引物12f1、seqidno:35所示的正向引物12f2和seqidno:36所示的反向引物12r组成;
所述引物组13由seqidno:37所示的正向引物13f1、seqidno:38所示的正向引物13f2和seqidno:39所示的反向引物13r组成;
所述引物组14由seqidno:40所示的正向引物14f1、seqidno:41所示的正向引物14f2和seqidno:42所示的反向引物14r组成;
所述引物组15由seqidno:43所示的正向引物15f1、seqidno:44所示的正向引物15f2和seqidno:45所示的反向引物15r组成;
所述引物组16由seqidno:46所示的正向引物16f1、seqidno:47所示的正向引物16f2和seqidno:32所示的反向引物16r组成;
所述引物组17由seqidno:49所示的正向引物17f1、seqidno:50所示的正向引物17f2和seqidno:51所示的反向引物17r组成;
所述引物组18由seqidno:52所示的正向引物18f1、seqidno:53所示的正向引物18f2和seqidno:54所示的反向引物18r组成。
3.如权利要求1所述的引物组合,其特征在于:
所述引物组1由seqidno:1自5’末端起第22至45位所示的正向引物01f1、seqidno:2自5’末端起第22至45位所示的正向引物01f2和seqidno:3所示的反向引物01r组成;
所述引物组2由seqidno:4自5’末端起第22至45位所示的正向引物02f1、seqidno:5自5’末端起第22至44位所示的正向引物02f2和seqidno:6所示的反向引物02r组成;
所述引物组3由seqidno:7自5’末端起第22至46位所示的正向引物03f1、seqidno:8自5’末端起第22至47位所示的正向引物03f2和seqidno:9所示的反向引物03r组成;
所述引物组4由seqidno:10自5’末端起第22至48位所示的正向引物04f1、seqidno:11自5’末端起第22至48位所示的正向引物04f2和seqidno:12所示的反向引物04r组成;
所述引物组5由seqidno:13自5’末端起第22至43位所示的正向引物05f1、seqidno:14自5’末端起第22至44位所示的正向引物05f2和seqidno:15所示的反向引物05r组成;
所述引物组6由seqidno:16自5’末端起第22至48位所示的正向引物06f1、seqidno:17自5’末端起第22至48位所示的正向引物06f2和seqidno:18所示的反向引物06r组成;
所述引物组7由seqidno:19自5’末端起第22至47位所示的正向引物07f1、seqidno:20自5’末端起第22至47位所示的正向引物07f2和seqidno:21所示的反向引物07r组成;
所述引物组8由seqidno:22自5’末端起第22至44位所示的正向引物08f1、seqidno:23自5’末端起第22至46位所示的正向引物08f2和seqidno:24所示的反向引物08r组成;
所述引物组9由seqidno:25自5’末端起第22至43位所示的正向引物09f1、seqidno:26自5’末端起第22至44位所示的正向引物09f2和seqidno:27所示的反向引物09r组成;
所述引物组10由seqidno:28自5’末端起第22至46位所示的正向引物10f1、seqidno:29自5’末端起第22至46位所示的正向引物10f2和seqidno:30所示的反向引物10r组成;
所述引物组11由seqidno:31自5’末端起第22至45位所示的正向引物11f1、seqidno:32自5’末端起第22至45位所示的正向引物11f2和seqidno:33所示的反向引物11r组成;
所述引物组12由seqidno:34自5’末端起第22至44位所示的正向引物12f1、seqidno:35自5’末端起第22至44位所示的正向引物12f2和seqidno:36所示的反向引物12r组成;
所述引物组13由seqidno:37自5’末端起第22至41位所示的正向引物13f1、seqidno:38自5’末端起第22至41位所示的正向引物13f2和seqidno:39所示的反向引物13r组成;
所述引物组14由seqidno:40自5’末端起第22至41位所示的正向引物14f1、seqidno:41自5’末端起第22至41位所示的正向引物14f2和seqidno:42所示的反向引物14r组成;
所述引物组15由seqidno:43自5’末端起第22至42位所示的正向引物15f1、seqidno:44自5’末端起第22至42位所示的正向引物15f2和seqidno:45所示的反向引物15r组成;
所述引物组16由seqidno:46自5’末端起第22至46位所示的正向引物16f1、seqidno:47自5’末端起第22至46位所示的正向引物16f2和seqidno:32所示的反向引物16r组成;
所述引物组17由seqidno:49自5’末端起第22至47位所示的正向引物17f1、seqidno:50自5’末端起第22至47位所示的正向引物17f2和seqidno:51所示的反向引物17r组成;
所述引物组18由seqidno:52自5’末端起第22至45位所示的正向引物18f1、seqidno:53自5’末端起第22至45位所示的正向引物18f2和seqidno:54所示的反向引物18r组成。
4.权利要求1至3任一所述引物组合的应用,为x1)至x8)中的任一种:
x1)制备用于鉴定41个莴苣品种的试剂盒;
x2)制备用于鉴别41个莴苣品种真伪性的试剂盒;
x3)鉴定41个莴苣品种;
x4)鉴别41个莴苣品种真伪性;
x5)制备用于鉴定32个莴苣杂交种的试剂盒;
x6)制备用于鉴别32个莴苣杂交种真伪性的试剂盒;
x7)鉴定32个莴苣杂交种;
x8)鉴别32个莴苣杂交种真伪性;
所述41个莴苣品种为c385、b117、b90、c345、r776、n1195、、l1056、m560、m546、m1070、l452、n1190、l1018、l467、m587、m1062、m1060、m1110、m1097、m540、s1253、、、r811、l399、l1015、l521、n703、n742、b902、c371、m1090、m1106、n1151、c306、sy-18、m586、l471、sy-19、n644、n1159、、n1144和n1158;
所述32个莴苣杂交种为n742×b902、l1056×s1253、l1056×m560、m546×m1070、m1090×m1106、m1070×m546、m1060×m1110、m1110×m1060、l452×n1190、m540×m1097、m1062×m587、l1018×l467、r811×l399、n1190×l452、n1190×l1015、l467×l1018、m1097×m540、m587×m1062、、l521×n1195、c345×r776、、n703×c371、n703×b90、n1151×n1159、n1151×n158、c385×b117、n1151×n1144、、n703×b117、c385×b90、、n1151×l471、sy-19×n644、sy-18×m586和n1151×c306。
5.一种鉴定待测莴苣属于权利要求4中所述41个莴苣品种和所述32个莴苣杂交种中哪个品种的方法,包括如下步骤:分别检测待测莴苣、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种基于权利要求1所述18个snp位点的基因型,然后进行如下判断:如果待测莴苣基于所述18个snp位点的基因型和41个莴苣品种或32个莴苣杂交种中某品种基于所述18个snp位点的基因型完全一致,则待测莴苣与该莴苣品种属于同一个品种;如果待测莴苣基于所述18个snp位点的基因型和41个莴苣品种或32个莴苣杂交种中各个品种基于所述18个snp位点的基因型均不一致,则待测莴苣与41个莴苣品种的品种均不相同。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于:所述“检测待测莴苣、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种基于所述18个snp位点的基因型”的步骤如下:
(1)分别以待测莴苣的基因组dna、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种的基因组dna为模板,采用权利要求2所述引物组合中引物组的进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;
(2)完成步骤(1)后,采用仪器检测pcr扩增产物的荧光信号,根据荧光信号的颜色获得待测莴苣、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种基于所述18个snp位点的基因型。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于:所述“检测待测莴苣、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种基于所述18个snp位点的基因型”的步骤如下:
(1)分别以待测莴苣的基因组dna、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种的基因组dna为模板,采用权利要求3所述引物组合中引物组的进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;
(2)取步骤(1)得到的pcr扩增产物,测序;
(3)根据步骤(2)得到的测序结果,获得待测莴苣、41个莴苣品种和32个莴苣杂交种基于所述18个snp位点的基因型。
8.一种鉴定待测莴苣属于权利要求4中所述41个莴苣品种和所述32个莴苣杂交种中哪个品种的方法,包括如下步骤:
(1)以待测莴苣的基因组dna为模板,采用权利要求2所述引物组合中引物组的进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;以标准莴苣品种群中的各个莴苣品种的基因组dna为模板,采用权利要求2所述引物组合中引物组的进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;所述标准莴苣品种群由41个莴苣品种组成;以标准莴苣杂交种群中的各个莴苣品种的基因组dna为模板,采用权利要求2所述引物组合中引物组的进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;所述标准莴苣杂交种群由32个莴苣杂交种组成;
(2)将待测莴苣得到的各个pcr扩增产物与每个标准莴苣品种或每个标准莴苣杂交种对应的pcr扩增产物进行聚类分析,聚类分析中待测莴苣与哪个标准莴苣品种或哪个标准莴苣杂交种为同一类,该待测莴苣与该标准莴苣品种或该标准莴苣杂交种即属于同一个品种。
9.含有权利要求1至3任一所述引物组合的试剂盒。
10.权利要求9所述试剂盒的应用,为x3)、x4)、x7)或x8):
x3)鉴定权利要求4中所述41个莴苣品种;
x4)鉴别权利要求4中所述41个莴苣品种真伪性;
x7)鉴定权利要求4中所述32个莴苣杂交种;
x8)鉴别权利要求4中所述32个莴苣杂交种真伪性。