一种固相合成DNA的氨解预处理液及氨解方法与流程

文档序号:27312310发布日期:2021-11-09 22:50阅读:1191来源:国知局
一种固相合成dna的氨解预处理液及氨解方法
技术领域
1.本发明为固相dna合成领域,具体涉及一种固相合成dna的氨解预处理液及氨解方法。


背景技术:

2.固相亚磷酰胺三酯法为现在合成dna的常用方法,其反应的基本原理是溶液中的亚磷酰胺单体通过缩合反应形成3
’‑5’
磷酸二酯键,连接到固相载体上,并依次延伸,直到序列的最后一个5’碱基连接上合成结束。整个合成过程仪器自动完成,每个循环按脱保护、活化、偶合、盖帽及氧化五个步骤依次完成。
3.在dna合成仪完成了对dna的合成步骤后,其产物会连接在固相载体上。接下来会用氨解将产物从固相载体上进行脱离,纯化后得到产物。在现有的氨解方法中,有采用直接进行氨水氨解的,有采用氨气加水蒸气混合氨解的,但是其氨解的效率均不高,导致后续的dna合成产率受到影响。


技术实现要素:

4.为解决上述技术问题,本发明提供一种固相合成dna的氨解预处理液及氨解方法。
5.具体技术方案为:
6.一种dna氨解预处理液,其不同之处在于,所述dna氨解预处理液由水与有机溶剂构成;其中,所述有机溶剂的体积百分比为70%~80%,所述有机溶剂选自乙腈、乙醇或甲醇中的一种或多种。
7.进一步,所述有机溶剂为乙腈。
8.一种固相合成dna的氨解方法,其不同之处在于,包括如下步骤:
9.步骤s1:向用于装有合成dna片段的固相载体的合成柱内加入上述的dna氨解预处理液进行润湿;
10.步骤s2:采用氨气与水蒸气的混合气体进行氨解,然后采用洗脱液进行脱附,得到dna产物。
11.进一步,所述步骤s2中,氨解时间为90min,氨解温度为90℃。
12.进一步,所述步骤s2中,经过氨解处理后,再用洗涤液洗去无机盐,再用洗脱液进行脱附,所述洗脱液为水。
13.进一步,所述洗涤液为乙腈。
14.进一步,所述步骤s1中,加入所述氨解预处理液的体积大于所述合成柱的体积。
15.与现有技术相比,本发明的有益效果在于:
16.(1)本发明提供了用于氨解的预处理液,通过配制水与有机溶剂的合理比例配制的dna氨解预处理液,在保证可以提高氨解效率的同时又能进一步提高产率。
17.(2)选取乙腈作为有机溶剂,乙腈无毒,极性大,性质稳定,不与粗产品中的不稳定的试剂发生反应,相较于其余有机溶剂,选其作为氨解预处理液的组分,有利于进一步提高
氨解效率与产物产率,且价格低廉,有利于进一步的降低成本。
18.(3)与现有技术相比,本发明的氨解方法采用dna氨解预处理液先进行润湿,然后再进行气相氨解,提高了氨解效率,提高了dna产物的收率。
19.(4)本发明氨解方法加入氨解柱时,不需要严格控制氨解预处理液的加入含量,操作简便。
具体实施方式
20.下面结合具体实施例对本发明作进一步的详细说明,以使本领域的技术人员更加清楚地理解本发明。
21.以下各实施例,仅用于说明本发明,但不止用来限制本发明的范围。基于本发明中的具体实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动的情况下,所获得的其他所有实施例,都属于本发明的保护范围。
22.在本发明实施例中,若无特殊说明,所有原料组分均为本领域技术人员熟知的市售产品;在本发明实施例中,若未具体指明,所用的技术手段均为本领域技术人员所熟知的常规手段。
23.本发明实施例涉及原料说明如下:
24.固相合成dna的粗品由mermade192e dna合成仪进行合成:选择t10mers(tttt tttt tt(5
’‑3’
))做为寡核苷酸的序列,合成柱为50nmol通用合成柱(参数:合成柱载量78nmol;cv值:9.1%;气阻值18~22mmhg;cpg frits体积:50.20ul,品牌:深逗点生物技术有限公司)。
25.实施例1
26.本实施例提供一种固相合成dna的氨解预处理液,具体成分如下:
27.水:30%(v/v);乙腈:70%(v/v)。
28.本实施例还提供一种利用上述dna氨解预处理液进行氨解的方法,具体操作如下:
29.(1)将氨解预处理液加入合成柱中,加入体积大于合成柱的体积即可;并对合成柱进行抽真空处理,直至氨解预处理液在合成柱中充分扩散润湿。
30.(2)放入气相氨解仪里,加入400pa的氨气与水蒸气,密封,反应时间90min,反应温度90℃。
31.(3)将氨解完成的合成柱,用无水乙腈洗去无机盐成分的杂质,用200ul体积的灭菌后的高纯水两次洗脱并回收寡核苷酸。
32.实施例2
33.本实施例提供一种固相合成dna的氨解预处理液,具体成分如下:
34.水:20%(v/v);乙腈:80%(v/v)。
35.本实施例还提供一种利用上述dna氨解预处理液进行氨解的方法,具体操作如下:
36.(1)将氨解预处理液加入合成柱中,加入体积大于合成柱的体积即可;并对合成柱进行抽真空处理,直至氨解预处理液在合成柱中充分扩散润湿。
37.(2)放入气相氨解仪里,加入400pa的氨气与水蒸气,密封,反应时间90min,反应温度90℃。
38.(3)将氨解完成的合成柱,用无水乙腈洗去无机盐成分的杂质,用200ul体积的灭
菌后的高纯水两次洗脱并回收寡核苷酸。
39.对比例1
40.本对比例提供一种固相合成dna的氨解预处理液,具体成分如下:
41.水:90%(v/v);乙腈:10%(v/v)。
42.本对比例还提供一种利用上述dna氨解预处理液进行氨解的方法,具体操作如下:
43.(1)将氨解预处理液加入合成柱中,加入体积与实施例3加入的体积相同;并对合成柱进行抽真空处理,直至氨解预处理液在合成柱中充分扩散润湿。
44.(2)放入气相氨解仪里,加入400pa的氨气与水蒸气,密封,反应时间90min,反应温度90℃。
45.(3)将氨解完成的合成柱,用无水乙腈洗去无机盐成分的杂质,用200ul体积的灭菌后的高纯水两次洗脱并回收寡核苷酸。
46.对比例2
47.本对比例提供一种固相合成dna的氨解预处理液,具体成分如下:
48.水:50%(v/v);乙腈:50%(v/v)。
49.本实施例还提供一种利用上述dna氨解预处理液进行氨解的方法,具体操作如下:
50.(1)将氨解预处理液加入合成柱中,加入体积大于合成柱的体积即可;并对合成柱进行抽真空处理,直至氨解预处理液在合成柱中充分扩散润湿。
51.(2)放入气相氨解仪里,加入400pa的氨气与水蒸气,密封,反应时间90min,反应温度90℃。
52.(3)将氨解完成的合成柱,用无水乙腈洗去无机盐成分的杂质,用200ul体积的灭菌后的高纯水两次洗脱并回收寡核苷酸。
53.对比例3
54.本对比例提供一种固相合成dna的氨解预处理液,具体成分如下:
55.水:100%(v/v)。
56.本对比例还提供一种利用上述dna氨解预处理液进行氨解的方法,具体操作如下:
57.(1)将氨解预处理液加入合成柱中,加入体积与实施例3加入的体积相同;并对合成柱进行抽真空处理,直至氨解预处理液在合成柱中充分扩散润湿。
58.(2)放入气相氨解仪里,加入400pa的氨气与水蒸气,密封,反应时间90min,反应温度90℃。
59.(3)将氨解完成的合成柱,用无水乙腈洗去无机盐成分的杂质,用200ul体积的灭菌后的高纯水两次洗脱并回收寡核苷酸。
60.对比例4
61.本对比例提供一种dna氨解方法,具体操作方法与实施例2大体相同,不同的是,无步骤(1)中的氨解预处理液润湿处理。
62.采用分光光度计来检测将实施例1~实施例2以及对比例1~4的寡核苷酸含量进行检测,加测结果如表1所示。
63.表1实施例1~2及对比例1~4的寡核苷酸含量测试结果
64.氨解方法寡核苷酸含量(a260)实施例116.795
实施例217.899对比例14.337对比例210.906对比例34.538对比例415.429
65.表1中,a260表示寡核苷酸在260nm紫外光的吸收值。
66.从表1看出,实施例1~2与对比例1~对比例2相比,有机溶剂的体积百分比为70%~80%,其寡核苷酸含量为在16以上;
67.实施例1~2与对比例3相比,加入了有机溶剂,相较于纯水进行润湿,其产量大幅提高。
68.实施例1~2与对比例4相比,在氨解前采用了氨解预处理液进行了润湿处理,其产量提高。
69.在此有必要指出的是,以上实施例仅限于对本发明的技术方案做进一步的阐述和说明,并不是对本发明的技术方案的进一步的限制,本发明的方法仅为较佳的实施方案,并非用于限定本发明的保护范围。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
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