小麦穗长主效qtl的紧密连锁标记及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术领域，涉及一种小麦穗长主效QTL的紧密连锁标记及其应 用。
【背景技术】
[0002] 小麦是世界上的重要粮食作物之一，养活了世界上35%的人口。世界范围内小麦 的育种目标是不断提高小麦产量。小麦单产取决于三个产量因素，即单位面积成穗数、穗粒 数和籽粒重量。这三个产量因素是提高小麦产量的重要组成成分。
[0003] 小麦的籽粒生长于穗部，因此穗部性状与三个产量因素密切相关。除此之外，穗部 参与抽穗后的光合作用，对于籽粒灌浆起重要作用，尤其是干旱环境中。穗部形态结构主要 包括穗长、小穗密度和可育小花数且这些性状都属于数量性状。
[0004] 前人对于穗部性状尤其是易于考查的穗长性状展开了诸多研究。例如，有研究表 明穗长性状与小穗密度也有很尚的相关性。另外，穗长（SPL)与根部生物量、猜杆生物量、 收获指数以及籽粒产量成正相关。虽然穗越长，密实度越小，但可以降低赤霉病的感病率， 从而减少由于病害引起的产量损失和品质下降。
[0005] 目前，小麦产量及相关性状的QTL定位和克隆研究是小麦数量性状研究的热点。
【发明内容】
[0006] 本发明的第一个目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定小麦穗长性状的引物对。
[0007] 本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定小麦穗长性状的引物对，为能够扩增得到如 下DNA片段的引物对：所述DNA片段是以小麦基因组DNA为模板，采用序列表中序列1和序 列2所示引物对进行PCR扩增所得的DNA片段。
[0008] 具体的，所述引物对由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成。
[0009] 所述引物对的制备方法也属于本发明的保护范围。
[0010] 所述引物对的制备方法，包括将所述两条单链DNA分别单独包装的步骤。
[0011] 本发明的第二个目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定小麦穗长性状的试剂盒。
[0012] 本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定小麦穗长性状的试剂盒，含有所述引物对和 如下中的至少一种：dNTP、DNA聚合酶和PCR扩增缓冲液。
[0013] 所述试剂盒的制备方法也属于本发明的保护范围。
[0014] 所述试剂盒的制备方法，包括将引物对和如下中的至少一种分别单独包装的步 骤：dNTP、DNA聚合酶和PCR扩增缓冲液。
[0015] 本发明的第三个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定小麦杂交后代的穗长性状的方 法。
[0016] 本发明所提供的鉴定或辅助鉴定小麦杂交后代的穗长性状的方法，具体可包括如 下步骤：
[0017] (al)分别以小麦A、小麦B以及由所述小麦A和所述小麦B杂交而来的小麦杂交 后代群体中的每个个体的基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)分别进行 PCR扩增，得到所述小麦A的PCR产物、所述小麦B的PCR产物以及所述小麦杂交后代群体 中的每个个体的PCR产物；
[0018] 所述小麦A的穗长大于所述小麦B的穗长；
[0019] (a2)将所述小麦A的PCR产物、所述小麦B的PCR产物以及所述小麦杂交后代群 体中的每个个体的PCR产物分别进行电泳，根据电泳结果按照如下确定所述小麦杂交后代 的穗长性状：与所述小麦A的PCR产物的电泳条带的带型相同的所述小麦杂交后代的穗长 大于或候选大于与所述小麦B的PCR产物的电泳条带的带型相同的所述小麦杂交后代。
[0020] 本发明的第四个目的是提供一种从小麦杂交后代群体中获得穗长相对较长的个 体的方法。
[0021] 本发明所提供的从小麦杂交后代群体中获得穗长相对较长的个体的方法，具体可 包括如下步骤：
[0022] (bl)分别以小麦A、小麦B以及由所述小麦A和所述小麦B杂交而来的小麦杂交 后代群体中的每个个体的基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)分别进行 PCR扩增，得到所述小麦A的PCR产物、所述小麦B的PCR产物以及所述小麦杂交后代群体 中的每个个体的PCR产物；
[0023] 所述小麦A的穗长大于所述小麦B的穗长；
[0024] (b2)将所述小麦A的PCR产物、所述小麦B的PCR产物以及所述小麦杂交后代群 体中的每个个体的PCR产物分别进行电泳，选取所述小麦杂交后代群体中与所述小麦A的 PCR产物的电泳条带的带型相同的个体，即为或候选为所述小麦杂交后代群体中所述穗长 相对较长的个体。
[0025] 对于上述两种方法，在本发明中，所述小麦A具体为小麦品种农大3338 ;所述小麦 B具体为小麦品种京冬6号。相应的，所述小麦杂交后代群体具体为由小麦品种农大3338 和小麦品种京冬6号杂交而来的小麦杂交后代群体。
[0026] 当然，所述小麦A也可为除小麦品种农大3338外符合条件A的任一品种的小麦； 所述条件A为：以基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)进行PCR扩增，将 所得PCR产物进行电泳，电泳条带的带型与参照带型A相同；所述参照带型A为以小麦品种 农大3338的基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)进行PCR扩增，将所得 PCR产物进行电泳所得的带型。
[0027] 相应的，所述小麦B也可为除小麦品种京冬6号外符合条件B的任一品种的小麦； 所述条件B为：以基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)进行PCR扩增，将 所得PCR产物进行电泳，电泳条带的带型与参照带型B相同；所述参照带型B为以小麦品种 京冬6号的基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)进行PCR扩增，将所得 PCR产物进行电泳所得的带型。
[0028] 所述小麦A和所述小麦B中，任一为母本，另一为父本。
[0029] 在上述两种方法中，所述小麦杂交后代具体可为小麦杂交后代的DH群体。
[0030] 本发明的第五个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测小麦的基因组中是否含有 小麦穗长主效QTL QS1-5A. 1的方法。
[0031] 本发明所提供的鉴定或辅助鉴定待测小麦的基因组中是否存在小麦穗长主效QTL QS1-5A. 1的方法，具体可包括如下步骤：
[0032] (cl)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)进行 PCR扩增，得到PCR产物；
[0033] (c2)将所述PCR产物进行电泳，根据电泳结果按照如下确定所述待测小麦的基 因组中是否存在所述小麦穗长主效QTL QS1-5A. 1 :若所述PCR产物的电泳条带的带型与 参照带型A相同，或同时含有所述参照带型A和参照带型B，则所述待测小麦的基因组中 存在或候选存在所述小麦穗长主效QTL QS1-5A. 1 ;若所述PCR产物的电泳条带的带型与 参照带型B相同，则所述待测小麦的基因组中不存在或候选不存在所述小麦穗长主效QTL QS1-5A. 1 ；
[0034] 所述参照带型A为以小麦品种农大3338的基因组DNA为模板，采用所述引物对 (序列1和序列2)进行PCR扩增，将所得PCR产物进行电泳所得的带型；
[0035] 所述参照带型B为以小麦品种京冬6号的基因组DNA为模板，采用所述引物对（序 列1和序列2)进行PCR扩增，将所得PCR产物进行电泳所得的带型。
[0036] 其中，所述小麦穗长主效QTL QS1-5A. 1位于小麦5A染色体上，定位于SNP标记 Kukri_r^_c72329_163和SSR标记AL-127之间；所述SSR标记AL-127是以小麦的基因组 DNA为模板，用所述引物对（序列1和序列2)进行PCR扩增得到的DNA片段；所述SNP标 记Kukri_rep_c72329_163的检测探针序列为序列表中序列3。
[0037] 本发明的第六个目的是提供一种培育穗长增加的小麦品种的方法。
[0038] 本发明所提供的培育穗长增加的小麦品种的方法，是选取符合如下条件的小麦作 为亲本进行育种：以基因组DNA为模板，采用所述引物对（序列1和序列2)进行PCR扩增， 将所得PCR产物进行电泳，电泳条带的带型与参照带型A相同；
[0039] 所述参照带型A为以小麦品种农大3338的基因组DNA为模板，采用所述引物对 (序列1和