一种用于检测与营养素代谢、吸收、偏好相关的snp位点的成套引物的制作方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种用于检测与营养素代谢、吸收、偏好相关的SNP位点的成套引物。
【背景技术】
[0002] 某些营养素通过基因调节在慢性病发作、罹患率、加深程度等方面起关键作用。营 养素对不同个体的健康与疾病影响程度的差异与个体基因型差异相关，可以基于营养需 求、营养状况和基因型的差异通过营养物质介导来预防、减轻或治疗慢性病。因此，开展营 养基因检测，对监测人群中营养相关基因的差异，以达到营养相关疾病的早期预防、早期诊 断和早期治疗是非常必要的。
[0003] 基因芯片是指固定在玻璃片等介质材料上的基因探针的微阵列（micro-arrays)， 通过一次实验可以检测所有希望得到的基因位点结果，适合对已知的基因序列进行检测、 分析。制作基因芯片时，把要检测的众多基因位点集成在一张芯片上，一次实验操作便能得 到所有检测结果，实验平台自动化程度高，整个实验过程规模化；所检测的指标越多，相对 成本就越低，在多基因、多位点检测时，其成本要比测序方法低。
【发明内容】
[0004] 本发明的目的是提供一种用于检测与营养素代谢、吸收、偏好相关的SNP位点的 成套引物。
[0005] 本发明提供了一种用于检测与待测者营养素摄入能力相关的SNP位点的成套引 物，包括如下38个引物组：
[0006] 用于检测编号为rsl0741657的SNP位点的引物组1;所述引物组1由引物对1和 单碱基延伸引物1组成；所述引物对1由序列表的序列1所示的单链DNA分子和序列表的 序列2所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物1如序列表的序列3所示；
[0007] 用于检测编号为rs757343的SNP位点的引物组2;所述引物组2由引物对2和单 碱基延伸引物2组成；所述引物对2由序列表的序列4所示的单链DNA分子和序列表的序 列5所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物2如序列表的序列6所示；
[0008] 用于检测编号为rs4588的SNP位点的引物组3 ;所述引物组3由引物对3和单碱 基延伸引物3组成；所述引物对3由序列表的序列7所示的单链DNA分子和序列表的序列 8所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物3如序列表的序列9所示；
[0009] 用于检测编号为rs2472299的SNP位点的引物组4;所述引物组4由引物对4和 单碱基延伸引物4组成；所述引物对4由序列表的序列10所示的单链DNA分子和序列表的 序列11所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物4如序列表的序列12所示；
[0010] 用于检测编号为rs41281112的SNP位点的引物组5 ;所述引物组5由引物对5和 单碱基延伸引物5组成；所述引物对5由序列表的序列13所示的单链DNA分子和序列表的 序列14所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物5如序列表的序列15所示；
[0011] 用于检测编号为rsl801133的SNP位点的引物组6 ;所述引物组6由引物对6和 单碱基延伸引物6组成；所述引物对6由序列表的序列16所示的单链DNA分子和序列表的 序列17所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物6如序列表的序列18所示；
[0012] 用于检测编号为rsl2794714的SNP位点的引物组7 ;所述引物组7由引物对7和 单碱基延伸引物7组成；所述引物对7由序列表的序列19所示的单链DNA分子和序列表的 序列20所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物7如序列表的序列21所示；
[0013] 用于检测编号为rs3758674的SNP位点的引物组8 ;所述引物组8由引物对8和 单碱基延伸引物8组成；所述引物对8由序列表的序列22所示的单链DNA分子和序列表的 序列23所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物8如序列表的序列24所示；
[0014] 用于检测编号为rs731236的SNP位点的引物组9 ;所述引物组9由引物对9和单 碱基延伸引物9组成；所述引物对9由序列表的序列25所示的单链DNA分子和序列表的序 列26所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物9如序列表的序列27所示；
[0015] 用于检测编号为rsl993116的SNP位点的引物组10 ;所述引物组10由引物对10 和单碱基延伸引物10组成；所述引物对10由序列表的序列28所示的单链DNA分子和序列 表的序列29所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物10如序列表的序列30所示；
[0016] 用于检测编号为rs2241766的SNP位点的引物组11 ;所述引物组11由引物对11 和单碱基延伸引物11组成；所述引物对11由序列表的序列31所示的单链DNA分子和序列 表的序列32所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物11如序列表的序列33所示；
[0017] 用于检测编号为rsl049353的SNP位点的引物组12 ;所述引物组12由引物对12 和单碱基延伸引物12组成；所述引物对12由序列表的序列34所示的单链DNA分子和序列 表的序列35所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物12如序列表的序列36所示；
[0018] 用于检测编号为rsll568820的SNP位点的引物组13 ;所述引物组13由引物对13 和单碱基延伸引物13组成；所述引物对13由序列表的序列37所示的单链DNA分子和序列 表的序列38所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物13如序列表的序列39所示；
[0019] 用于检测编号为rs2472297的SNP位点的引物组14 ;所述引物组14由引物对14 和单碱基延伸引物14组成；所述引物对14由序列表的序列40所示的单链DNA分子和序列 表的序列41所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物14如序列表的序列42所示；
[0020] 用于检测编号为rsl799883的SNP位点的引物组15 ;所述引物组15由引物对15 和单碱基延伸引物15组成；所述引物对15由序列表的序列43所示的单链DNA分子和序列 表的序列44所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物15如序列表的序列45所示；
[0021] 用于检测编号为rs4988321的SNP位点的引物组16 ;所述引物组16由引物对16 和单碱基延伸引物16组成；所述引物对16由序列表的序列46所示的单链DNA分子和序列 表的序列47所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物16如序列表的序列48所示；
[0022] 用于检测编号为rs2242480的SNP位点的引物组17 ;所述引物组17由引物对17 和单碱基延伸引物17组成；所述引物对17由序列表的序列49所示的单链DNA分子和序列 表的序列50所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物17如序列表的序列51所示；
[0023] 用于检测编号为rsl047781的SNP位点的引物组18 ;所述引物组18由引物对18 和单碱基延伸引物18组成；所述引物对18由序列表的序列52所示的单链DNA分子和序列 表的序列53所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物18如序列表的序列54所示；
[0024] 用于检测编号为rs4988235的SNP位点的引物组19 ;所述引物组19由引物对19 和单碱基延伸引物19组成；所述引物对19由序列表的序列55所示的单链DNA分子和序列 表的序列56所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物19如序列表的序列57所示；
[0025] 用于检测编号为rs838145的SNP位点的引物组20 ;所述引物组20由引物对20和 单碱基延伸引物20组成；所述引物对20由序列表的序列58所示的单链DNA分子和序列表 的序列59所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物20如序列表的序列60所示；
[0026] 用于检测编号为rsl0766197的SNP位点的引物组21 ;所述引物组21由引物对21 和单碱基延伸引物21组成；所述引物对21由序列表的序列61所示的单链DNA分子和序列 表的序列62所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物21如序列表的序列63所示；
[0027] 用于检测编号为rsl378942的SNP位点的引物组22 ;所述引物组22由引物对22 和单碱基延伸引物22组成；所述引物对22由序列表的序列64所示的单链DNA分子和序列 表的序列65所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物22如序列表的序列66所示；
[0028] 用于检测编号为rs3760776的SNP位点的引物组23 ;所述引物组23由引物对23 和单碱基延伸引物23组成；所述引物对23由序列表的序列67所示的单链DNA分子和序列 表的序列68所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物23如序列表的序列69所示；
[0029] 用于检测编号为rsl801131的SNP位点的引物组24 ;所述引物组24由引物对24 和单碱基延伸引物24组成；所述引物对24由序列表的序列70所示的单链DNA分子和序列 表的序列71所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物24如序列表的序列72所示；
[0030] 用于检测编号为rsl2221497的SNP位点的引物组25 ;所述引物组25由引物对25 和单碱基延伸引物25组成；所述引物对25由序列表的序列73所示的单链DNA分子和序列 表的序列74所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物25如序列表的序列75所示；
[0031] 用于检测编号为rsl801394的SNP位点的引物组26 ;所述引物组26由引物对26 和单碱基延伸引物26组成；所述引物对26由序列表的序列76所示的单链DNA分子和序列 表的序列77所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物26如序列表的序列78所示；
[0032] 用于检测编号为rsll33323的SNP位点的引物组27 ;所述引物组27由引物对27 和单碱基延伸引物27组成；所述引物对27由序列表的序列79所示的单链DNA分子和序列 表的序列80所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物27如序列表的序列81所示；
[0033] 用于检测编号为rsl0515552的SNP位点的引物组28 ;所述引物组28由引物对28 和单碱基延伸引物28组成；所述引物对28由序列表的序列82所示的单链DNA分子和序列 表的序列83所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物28如序列表的序列84所示；
[0034] 用于检测编号为rs7041的SNP位点的引物组29 ;所述引物组29由引物对29和 单碱基延伸引物29组成；所述引物对29由序列表的序列85所示的单链DNA分子和序列表 的序列86所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物29如序列表的序列87所示；
[0035] 用于检测编号为rsl544410的SNP位点的引物组30 ;所述引物组30由引物对30 和单碱基延伸引物30组成；所述引物对30由序列表的序列88所示的单链DNA分子和序列 表的序列89所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物30如序列表的序列90所示；
[0036] 用于检测编号为rs2298585的SNP位点的引物组31 ;所述引物组31由引物对31 和单碱基延伸引物31组成；所述引物对31由序列表的序列91所示的单链DNA分子和序列 表的序列92所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物31如序列表的序列93所示；
[0037] 用于检测编号为rs2229616的SNP位点的引物组32;所述引物组32由引物对32 和单碱基延伸引物32组成；所述引物对32由序列表的序列94所示的单链DNA分子和序列 表的序列95所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物32如序列表的序列96所示；
[0038] 用于检测编号为rsl6846876的SNP位点的引物组33;所述引物组33由引物对33 和单碱基延伸引物33组成；所述引物对33由序列表的序列97所示的单链DNA分子和序列 表的序列98所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物33如序列表的序列99所示；
[0039] 用于检测编号为rs2228570的SNP位点的引物组34;所述引物组34由引物对34 和单碱基延伸引物34组成；所述引物对34由序列表的序列100所示的单链DNA分子和序 列表的序列101所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物34如序列表的序列102所 示；
[0040] 用于检测编号为rs4654748的SNP位点的引物组35;所述引物组35由引物对35 和单碱基延伸引物35组成；所述引物对35由序列表的序列103所示的单链DNA分子和序 列表的序列104所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物35如序列表的序列105所 示；
[0041] 用于检测编号为rs842999的SNP位点的引物组36;所述引物组36由引物对36 和单碱基延伸引物36组成；所述引物对36由序列表的序列106所示的单链DNA分子和序 列表的序列107所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物36如序列表的序列108所 示；
[0042] 用于检测编号为rs4410790的SNP位点的引物组37;所述引物组37由引物对37 和单碱基延伸引物37组成；所述引物对37由序列表的序列109所示的单链DNA分子和序 列表的序列110所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物37如序列表的序列111所 示；
[0043] 用于检测编号为rsl2785878的SNP位点的引物组38;所述引物组38由引物对38 和单碱基延伸引物38组成；所述引物对38由序列表的序列112所示的单链DNA分子和序 列表的序列113所示的单链DNA分子组成；所述单碱基延伸引物38如序列表的序列114所 不。
[0044] 所述成套引物在制备试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围；所述试剂盒的功 能为评价待测者营养素摄入能力。
[0045] 本发明还保护含有所述成套引物的试剂盒；所述试剂盒的功能为评价待测者营养 素摄入能力。
[0046] 本发明还保护所述试剂盒的制备方法，包括将各条引物进行独立包装的步骤。
[0047] 本发明还保护用于检测如下38个SNP位点的物质在制备评价或辅助评价待测者 营养素摄入能力的产品中的应用：编号为rsl0741657的SNP位点、编号为rs757343的SNP 位点、编号为rs4588的SNP位点、编号为rs2472299的SNP位点、编号为rs41281112的SNP 位点、编号为rsl801133的SNP位点、编号为rsl2794714的SNP位点、编号为rs3758674的 SNP位点、编号为rs731236的SNP位点、编号为rsl993116的SNP位点、编号为rs2241766 的SNP位点、编号为rsl049353的SNP位点、编号为rsll568820的SNP位点、编号为 rs2472297的SNP位点、编号为rsl79