生物标志标识方法及用于其的装置和试剂盒与流程

文档序号:13109715
本申请要求于2014年2月6日提交的标题为“Biomarkersignaturemethod,andapparatusandkitstherefor”的编号为2014900363的澳大利亚临时申请的优先权,该申请的全部内容通过引用并入本文。发明背景本发明涉及用于导出用于在诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在或程度或者在预后生物受试者中至少一种状况中使用的指示物的方法、试剂盒和装置以及与其相关的试剂和组合物,涉及用于在诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在或程度或者在预后生物受试者中至少一种状况中使用的生物标志标识,并涉及用于鉴定用于在生物标志标识中使用的生物标志的方法、试剂盒和装置以及与其相关的试剂和组合物。现有技术描述在本说明书中对任何现有出版物(或来源于其的信息)或对是已知的任何事物的引用,不是,并且不应该被视为该现有出版物(或来源于其的信息)或已知事物构成本说明书努力涉及的领域的公知常识的一部分的承认或认可或任何形式的暗示。用于诊断目的的基因表达产物的分析是已知的。这样的分析要求鉴定一种或更多种可用来生成用于区分不同状况的标识(signature)的基因。然而,这样的鉴定可要求分析许多基因表达产物,其可以是数学上复杂的,计算上昂贵的,并因此很难。许多生物标志发现过程致力于鉴定可具有相关输入的数据的子集,使用这些值的组合从该子集导出标识以产生用于诊断或预后用途的模型。WO2004\/044236描述了确定受试者的状态的方法。具体地,这通过获得受试者数据(包括许多参数的每个的各自值)来实现,该参数值指示受试者的当前生物学状态。将受试者数据与预定数据进行比较,该预定数据包括对于至少一些参数和状况的指示的值。受试者的状态且特别是一种或更多种状况的存在和\/或不存在可然后根据比较的结果来确定。US2010\/0028876描述了用于通过区分细胞类型(包括癌细胞类型)基于来自细胞或组织样品诸如癌细胞或癌组织样品的基因表达数据的比率来诊断生物状态或状况的方法。该发明提供了在正常肺细胞及组织中和癌症肺细胞及组织中差异表达的、能够区分这些细胞和组织的基因的集合。这样的细胞区分在诊断癌症及癌症类型中是重要的。基因的集合通过上调或下调的程度(倍数变化)来鉴定。这些基因的集合可被用来区分正常细胞或组织与恶性细胞或组织,并区分恶性细胞或组织的种类。因此,还提供了用于肿瘤分类、肿瘤结果预测、选择和监测治疗方案及监测肿瘤进展\/消退的诊断测定。然而,用于生物标志鉴定的传统方法和标志的传统组合使用相对大数目的生物标志,这继而使测试进行起来很昂贵,限制其在实践中的使用。另外,现有技术未描述免疫系统生物标志比率的用途,或鉴定在确定免疫系统介导的医学状况(medicalconditions)的存在、不存在、程度或预后中有用的免疫系统生物标志比率的最小集合的方法。发明概述以一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)确定一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一个对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度;b)使用该对生物标志值确定导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示该对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及,c)使用所述导出的生物标志值确定所述指示物。通常,该方法包括:a)使用第一对生物标志值确定第一导出的生物标志值,所述第一导出的生物标志值指示第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的浓度的比率;b)使用第二对生物标志值确定第二导出的生物标志值,所述第二导出的生物标志值指示第三免疫系统生物标志和第四免疫系统生物标志的浓度的比率;以及,c)通过将所述第一导出的生物标志值与所述第二导出的生物标志值组合来确定所述指示物。通常,该方法包括使用组合函数组合所述导出的生物标志值,所述组合函数是以下的至少一种:a)加性模型(additivemodel);b)线性模型;c)支持向量机(supportvectormachine);d)神经网络模型;e)随机森林模型;f)回归模型;g)遗传算法;h)退火算法;i)加权和;j)最邻近模型(nearestneighbormodel);以及,k)概率模型。通常该方法至少部分地使用电子处理装置来进行。通常,该方法包括,在至少一个电子处理装置中:a)获得至少两对测量的生物标志值,每个测量的生物标志值是生物受试者的对应的免疫系统生物标志的测量的值;b)确定指示第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的浓度的比率的第一导出的生物标志值;c)确定指示第三免疫系统生物标志和第四免疫系统生物标志的比率的第二导出的生物标志值;以及,d)通过将所述第一导出的生物标志值与所述第二导出的生物标志值组合来确定所述指示物。通常,该方法包括,在至少一种处理装置中,生成指示物的表示(representation)。通常,该表示包括:a)所述指示物的字母数字指示;b)所述指示物与一种或更多种指示物参考的比较的图形指示;c)受试者具有至少一种医学状况的可能性的字母数字指示。通常,该方法包括:a)将所述指示物与指示物参考进行比较;以及,b)根据比较的结果确定可能性。通常,指示物参考是基于以下的至少一个:a)指示物阈值范围;b)指示物阈值;以及,c)指示物分布。通常,指示物参考从对参考群体中许多个体确定的指示物导出。通常,指示物参考基于对一组参考群体确定的指示物的分布,该组由被诊断为具有医学状况或缺乏医学状况的个体组成。通常,参考群体包括:a)多个不同性别的个体;b)多个不同种族的个体;c)多个健康的个体;d)多个患有至少一种已诊断的医学状况的个体;e)多个缺乏至少一种该已诊断的医学状况的个体;f)多个显示至少一种医学状况的临床体征的个体;g)第一组个体和第二组个体,每个组的个体患有各自的已诊断的医学状况;以及,h)第一组个体和第二组个体,第一组个体患有已诊断的医学状况,且第二组缺乏该已诊断的医学状况。通常,指示物用于确定生物受试者具有至少一种医学状况的可能性,且其中参考群体包括:a)表现该至少一种医学状况的临床体征的个体;b)被诊断为具有该至少一种医学状况的个体;c)被诊断为缺乏该至少一种医学状况的个体;以及,d)健康的个体。通常,指示物参考从数据库检索。通常,可能性基于使用比较的结果生成的概率。通常,指示物用于确定受试者具有第一状况或第二状况的可能性,且其中所述方法包括:a)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考指示第一状况和第二状况;以及,b)根据比较的结果确定可能性。通常,该方法包括:a)使用比较的结果确定第一指示物概率和第二指示物概率;以及,b)将所述第一指示物概率和所述第二指示物概率组合,以确定指示可能性的状况概率。通常,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组分别由被诊断为具有第一状况的个体和第二状况的个体组成。通常,该方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;以及,b)定量在所述样品内的所述多核苷酸表达产物的至少一些,以确定一对生物标志值。通常,该方法包括,至少部分地使用所述多核苷酸表达产物的浓度的比率确定指示物。通常,该方法包括:a)通过以下定量多核苷酸表达产物:b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;以及,c)确定扩增量,扩增量代表获得定义水平的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度;以及,d)通过确定所述扩增量之间的差异来确定所述指示物。通常,所述扩增量是以下的至少一个:a)循环时间;b)循环的数目;c)循环阈值;d)扩增时间;以及,e)相对于另一种扩增的产物的扩增量的。通常,该方法包括:a)通过确定第一对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第一导出的生物标志值;b)通过确定第二对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第二导出的生物标志值;c)通过将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加确定所述指示物。通常,免疫系统生物标志是生物受试者的免疫系统的生物标志,该生物受试者的免疫系统的生物标志作为对损伤或病原性损害(pathogenicinsult)的炎性反应的一部分被改变,或该生物受试者的免疫系统的生物标志的表达水平作为对损伤或病原性损害的炎性反应的一部分被改变。通常:a)至少两个免疫系统生物标志具有位于互相关性(mutualcorrelation)范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,b)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差(explainedvariance)。通常,该互相关性范围是以下的至少一个:a)±0.8;b)±0.7;c)±0.6;d)±0.5;e)±0.4;f)±0.3;g)±0.2;以及,h)±0.1。通常,每一种免疫系统生物标志具有在状况相关性范围之外的与至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性(conditioncorrelation),所述状况相关性范围在±0.3之间。通常,该状况相关性范围是以下的至少一个:a)±0.9;b)±0.8;c)±0.7;d)±0.6;e)±0.5;以及,f)±0.4。通常,性能阈值指示以下的至少一个的解释方差:a)0.4;b)0.5;c)0.6;d)0.7;e)0.8;以及,f)0.9。通常,免疫系统生物标志值指示选自核酸分子和蛋白性分子中的一种或更多种的分子的水平或丰度。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性,且其中所述方法包括:a)确定指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度的第一对生物标志值;b)确定指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度的第二对生物标志值;以及,c)使用所述第一对生物标志值和所述第二对生物标志值确定所述指示物。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有inSIRS或健康状况的可能性,且其中从第一炎症反应综合征(IRS)免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:NUMB、RAB27A、USP3\/\/LOC100130855、HIF1A、LBXCOR1\/\/PIAS1\/\/CALML4、SQRDL、C20orf74、IL10RB、PARP4、DNTTIP1、MTMR6\/\/LOC646482、LAMP2、MAPK1、SERINC3\/\/TTPAL、IGSF6\/\/METTL9、RP2、C18orf32、LOC284757、MTMR10\/\/MTMR15、SLC12A6、LCP1、CHP、PRR13、C20orf177、ZFP106、DICER1、PHF12、IFNAR1、BNIP2、UBE2A、NIN、MBD2\/\/SNORA37、TM9SF2、RAB8B、CLIP1、WAS、DNAJC3、CDADC1、KIAA0317、MED13L、INTS6、PDK3、MYO5A、NUPL1、VEZF1、CUL4B、USP9X\/\/USP9Y、RPS6KA3、IL17RA\/\/CECR7、ELF1、TMX4、TAOK1、ELMO2、STAT5B\/\/STAT5A、PAN3\/\/EEF1A1\/\/CHCHD2、SIPA1L1\/\/SNORD56B\/\/LOC145474\/\/LOC283567、OSBPL1A、SYNJ1、U2AF1、NPEPPS\/\/TBC1D3F\/\/LOC440434、AP1G1、SNTB2、ZNF230\/\/ZNF222、LYRM1、ME2、GALNT1、DYRK1A、ZMYM2、ARID4A、TOB1、DOCK11、ACTR10、ZMYM5\/\/ZMYM2、FNDC3A、NUFIP2、STRADA、SPG11\/\/ISLR、SPATA13\/\/C1QTNF9、BRWD3、BACH1、CLTC、LIG4、C21orf41\/\/BACH1、KPNB1、DHRS7、USP8、LACTB、SYNE2、ZDHHC20\/\/LOC728099、EAPP、MED13\/\/LOC100129112、TAOK3、NLGN3、CIT、RIPK3、CP110、ABHD2、GNA13、GGNBP2、PXN和PTPN1(以下在本文中可互换地称为“A组IRS免疫系统生物标志基因”或“A组IRS生物标志基因”);并且b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:AGFG1、BMX\/\/HNRPDL、MCM5、TRIM28、GRWD1、ZNF574、ARRDC2、PELP1、SHPK、GPS1、FAM38A、FBXO31、C16orf58\/\/LOC100128371、NLRC3、JMJD8、CDK10、TRAPPC2L、PRMT7、BRF1、MTA1\/\/LOC647310\/\/LOC100128343、PLD4、DDX54\/\/CCDC42B、PLBD1、IRAK3、FGD4、ARG1、RANGAP1、UNC84B、SAMSN1\/\/LOC388813、PFKL、S100A12、KIF22、LRRN1、CCDC134、LZTR1、GZMM、ICAM2、TMC8、LAT\/\/SPNS1\/\/NPIPL2\/\/LOC728741\/\/LOC730153\/\/NPIPL3\/\/SPIN1\/\/LOC728888\/\/LOC100289169\/\/LOC728734\/\/LOC729602\/\/LOC100288442\/\/LOC100288332、CLEC4D、CDK5RAP1、PPP1R16B、DAZAP1、LMF1、EDC4、IL21R\/\/LOC283888、JMJD7-PLA2G4B\/\/JMJD7\/\/PLA2G4B、TMEM120B\/\/RHOF、ENTPD1\/\/C10orf131、ACSL1、ZC3H7B、CHERP\/\/C19orf44\/\/CALR3、U2AF2、PYGL、SOS2、ANKRD22、MEGF9、MGAM\/\/LOC100124692、IL1R2、IL2RB、FCAR、IL27RA、DHX37、PATZ1、PRDM15、NOSIP、RPTOR、SPG7、DNAJA3、VNN1、SEPT9、THAP11、LPCAT2、MAN2C1、PITPNM2、NOC2L\/\/SAMD11\/\/LOC401010、ZMYM3、FTSJ1、KCNE1、ACTR5、FAM110A、FAM134C、LLGL2、INF2、KDM2B、ACSL4、B4GALT5、CD79B、BCL11B、ERLIN1、TLR4、EVL、SRGN、SLC37A3、GPR141、MSL3、MMP9\/\/LOC100128028、MAP2K6、PHTF1、KLHL36、POLR3E、PCNX、PNKP、TMEM104、TRPV2、SEPT1、APH1B、POLE、MED24、MPI、C12orf49、PES1、ERCC1\/\/CD3EAP、CD177、CPD、MEF2A\/\/LYSMD4、C14orf43、RPLP0、CDC25B、SYMPK、ARHGEF18\/\/LOC100128573、PSTPIP2、HERC2\/\/HERC2P2\/\/HERC2P3\/\/LOC440248、MAPK14、F5、PLCG1、ZNF416、AARS、KLHL2、APOBEC3A\/\/APOBEC3B、CMTM1\/\/CKLF、USP11、MAP3K14\/\/LOC100133991、GOLGA3、TMEM204、S100A8、IL1R1、DHPS、PPP2R1A、UBTF、DRG2、DNMT1、USP36、ZBTB4、TSC2、KIAA0195、KIAA0182、ALOX5AP、TGIF2、ST20\/\/C15orf37、FN3KRP、ABCD4、ZFP64、NEO1、PPIL2\/\/YPEL1、RNPS1、NF2、SERPINB1、DDX51、PRPF6、TIMM22、SYS1\/\/SYS1-DBNDD2\/\/DBNDD2、RAB31、KRI1、SMARCA4、CLUAP1、C16orf67、C20orf4、CHTF8\/\/HAS3、NPTN、CSRP2BP、AES、ODZ1、MTMR15\/\/MTMR10、SIRPD、EEF2\/\/SNORD37、DKC1\/\/SNORA36A\/\/SNORA56、CEACAM4、C12orf43、RANBP3、EEF2K、LOC338799、PLP2、AKAP8、ELAC2、AKAP1、TBC1D4、ALOX5、WSB1、BAZ1A、ETS2、GGA2、CSTF2\/\/RAD21、METTL9、GYG1、CRAMP1L\/\/HN1L、EVI2B、PPP1R13B、POP5、C20orf3、WDR59、KCNJ15、PGLYRP1、ELAVL1、SLC25A1、PSMD3、CDC42EP3、FTSJ3、C2CD2、RBM19、CDH26、TRMT2B、GTF2F1\/\/LOC100130856、SNRPN\/\/SNURF\/\/IPW\/\/SNORD116-16\/\/SNORD116-18\/\/SNORD116-21\/\/SNORD116-22\/\/SNORD116-17\/\/SNORD116-19\/\/PAR5\/\/PAR-SN\/\/SNORD116-2\/\/SNORD116-25\/\/SNORD116-26\/\/SNORD107\/\/SNORD115-12\/\/SNORD115-5\/\/SNORD115-6\/\/SNORD115-9\/\/SNORD116-11\/\/SNORD116-12\/\/SNORD116-13\/\/SNORD116-28\/\/SNORD116-4\/\/SNORD64\/\/PAR1\/\/SNORD109A\/\/SNORD109B\/\/SNORD116-6\/\/SNORD116-3\/\/SNORD116-9\/\/SNORD115-13\/\/SNORD115-1\/\/SNORD115-14\/\/SNORD115-15\/\/SNORD115-21\/\/SNORD115-10\/\/SNORD115-7\/\/SNORD115-16\/\/SNORD115-40\/\/SNORD115-42\/\/SNORD115-11\/\/SNORD115-29\/\/SNORD115-34\/\/SNORD115-36\/\/SNORD115-4\/\/SNORD115-43\/\/HBII-52-24\/\/SNORD116-5\/\/SNORD116-7\/\/SNORD115-26\/\/SNORD115-30\/\/SNORD116-15\/\/SNORD116-8\/\/SNORD115-2\/\/SNORD115-39\/\/SNORD116-14\/\/SNORD116-20\/\/SNORD115-8\/\/SNORD115-3\/\/SNORD115-38\/\/SNORD115-41\/\/SNORD115-22\/\/SNORD115-44\/\/SNORD116-1\/\/SNORD115-17\/\/SNORD115-18\/\/SNORD115-19\/\/SNORD115-20\/\/SNORD116@、SLC9A8、RPA1、ADARB1、AFG3L2、MCTP2、DACH1、SEH1L、RRP1B、ZNF335、WDR73、TAF15、MOSPD2、WIPI1\/\/ARSG、ARRB2、PLIN5\/\/LRG1、SNRPD3\/\/C22orf13、CTNNBL1、ZNF175、NCF4、DDX27、FBXO21、TDP1、ATXN2L、ILF3、VAPA、DDX19B\/\/DDX19A、NCOR2、KL、MTHFS、TOM1L2\/\/LOC246315、APOBEC3D、EXD2、CDR2\/\/RRN3\/\/LOC100131998\/\/LOC653390、ADCY4、DHX33、CKLF、GTF3C1、PRKCSH、DHX35、HSPH1、CCDC92、BCOR、CCPG1\/\/PIGB\/\/DYX1C1、MCM3AP、FPR1、ZNF460、AKAP8L、DCAF7、RNF24、NSMCE1、PDHA1、SAFB2\/\/SAFB、ITM2B、ZNF236、PI4KA\/\/PI4KAP1\/\/PI4KAP2\/\/LOC100293141、CSTB、C14orf138、ITGAL、ARID3A、COG7、TYROBP、HP\/\/HPR、SRCAP\/\/SNORA30、COG1、GK\/\/GK3P\/\/FTL\/\/LOC652904、C15orf63\/\/SERF2、SERPINA6、SMG6\/\/C17orf6、INO80、C16orf62、RAB35、PEF1、C14orf101、TMEM185A、LIMK2、CTCF、DIABLO\/\/B3GNT4、VPS33A、UNQ1887、TBCB\/\/POLR2I、ABHD13、SLC24A6、EDNRB、CA12、ANAPC5、TMC3、TRIAP1、ABHD12B、TDRD9、EIF2B1、CXorf59、LRRC37A3\/\/LRRC37A2\/\/LRRC37A\/\/ARL17P1\/\/LRRC37A4\/\/LOC100294335\/\/LOC644397、SDS、SYCP2、TBC1D8B、TMEM31、GUCY1B2、PFN1、SLC24A3、ABCC11\/\/LONP2和ZNF257\/\/ZNF492\/\/ZNF99\/\/ZNF98\/\/LOC646864(以下在本文中可互换地称为“B组IRS免疫系统生物标志基因”或“B组IRS生物标志基因”)。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有ipSIRS或健康状况的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:LTBP3、LPHN1、NR1D1\/\/THRA、METTL9、PLD4、MAPK14、FAM102A、MYBBP1A\/\/SPNS2、FLJ10232、SEMA4C、LMF1、PLBD1、MAN1C1、B4GALT5、ENGASE、NDRG2、TLR5、WDR4、PATZ1、CD177、LILRA5、SIRPD、ADAMTS10、TCF7、GGT7、GYG1、CDAN1、BRF1、GPR84、TMC6\/\/LOC100131096、PGAP3、GRAP\/\/SNORD3B-1\/\/SNORD3B-2\/\/LOC400581、SHPK、NOG、PVRIG\/\/PILRB\/\/STAG3、TDRD9、TMC8、C14orf21、NLRC4、APBA2、TBL3、LDOC1L、C16orf58\/\/LOC100128371、KLHL3、IRAK3、JMJD7-PLA2G4B\/\/JMJD7\/\/PLA2G4B、RAB31、IL10RB、NFATC1\/\/LOC100127994、S100A12、SLC2A3\/\/SLC2A14、GPA33、PLXDC1、BCL6\/\/LOC100131635、GTPBP3、SQRDL、CD7、TMEM177\/\/LOC100125918、FBXO31、CACNA1E、LILRA4、FAM38A、UBE2J1、SBF1\/\/SBF1P1、TMEM204、FCAR、CDK4\/MARCH9\/C3HC4、ZBTB4、PIWIL4、RNASE2\/\/LOC643332、PRMT7、AGFG1、CMTM1\/\/CKLF、MCTP1、ARL11、FMNL3\/\/PRPF40B、FAM151B、BAHD1、OSBPL7、ZAP70、TUBGCP6、MAP2K6、NPTN、C3AR1、CD247、S100A8、TBCD、LMNB1\/\/PCIF1、PFKL、GRWD1、PYGL、UPP1、OMG、SAMSN1\/\/LOC388813、BLCAP、PTPRS、FAM20A、CARD6、SPPL2B、IL2RB、SORT1、BST1、TAF1C\/\/ADAD2、SEMA4F、NCAPH2、MCTP2、ZAK、CCR7、MAN2C1、NEURL4\/\/GPS2\/\/D4S234E、BMX\/\/HNRPDL、TRAPPC6A、LPCAT2、C19orf60、SLC4A10、C14orf101、TP53I3、IL1RN、AIM2、UBE2R2、PNKP、ZNF70、SEPT1、NEO1、MPRIP、DPH1\/\/OVCA2、C16orf67、CD58、RAB27A、EEF2K、CLIC1、MBLAC2、IFNGR2、CRTC1\/\/MAML2、CACNB1、GALNT3、C19orf6、C20orf74、RALB、GPRASP1、CA4、ETS2、RP2、MARS2、RAB32、FAIM3、C20orf24\/\/SLA2、ZNF549、PIGL、PHTF1、IL18R1、IPO4、ZFP106、SLC12A4、DNTTIP1、S100A11、ZNF544、ATXN1、GNLY、MID2、BACH2、INF2、ARFGAP1、MSL3、SOS2、ARL8A、PTPRJ\/\/OR4B1、NAT9、RHOT2\/\/FBXL16、PNPLA1、DNAJC13、GNG5、FAM129C、PXK、C10orf119、BATF、LMO7、KLF2、NRD1、CLCN7、GLA、CFLAR、SYCP2、IMAGE5303689、LPGAT1、PTGDR、LAMP2、ZNF607、INSL3\/\/JAK3、DUSP3、PCNX、CD79B、IRAK1、ZNF550\/\/ZNF549、LOC100130950、SPTLC2、CTSA、RAP2C、ADCY9、MED12L、MTHFD2、CAP1、TOR1AIP2\/\/TOR1AIP1\/\/IFRG15、CHP、TSEN2、LYRM1、UBE2A、NUPL1、YIPF1、FRMD3、KAL1、CLTC、FLVCR2\/\/RPS24、WSB2、KIAA0040、JAG1、GPR183、N6AMT1、ZNF563、AP3B2、SERPINB2\/\/SERPINB10、CDH2、ITFG1、EDEM2、RNF135、HPSE、DSC1、FOXN2、RASSF2、ZNF420、ZFP28、UBE2G2\/\/SUMO3、PTTG1IP、PRKCB、KIT、PLEK、MAP4K4、GBA\/\/GBAP、CLIP1、EDEM3、SERINC3\/\/TTPAL、TPST2、HNRPLL、TP53BP2、KCND1、GCLM、RIT1、OSCAR、DDX59、EDNRB、ELMO2、RRAGC、AFTPH、DCUN1D3\/\/LYRM1、RSBN1、IFI30、SNX1、PTPN1、SEP15、ARMCX5、ALAS1、NFKBIA、STXBP2\/\/LOC554363\/\/LOC100131801、C15orf24、SRI、ASGR2、NSF\/\/LOC728806、TRIM69、SEC23A、PLAUR、RAB3GAP2\/\/AURKAPS1\/\/AURKA\/\/SNORA36B、MAOB\/\/NAT13、DEDD、SEC23B、COPA、EGF、STRADA、SIAE、C5、SLC30A1、ANXA4、NKG7、ABHD12B、TESK2、LONRF3、PIKFYVE、SH3BGRL3、ARMCX3、NEU1、SPAST、STX6\/\/KIAA1614、TADA3L、LIN37\/\/PSENEN、UBR3、WDR90、RTN2和TMUB2(以下在本文中可互换地称为“C组IRS免疫系统生物标志基因”或“C组IRS生物标志基因”);并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:CNNM3、SLC25A45、UNC84B、ARHGEF18\/\/LOC100128573、PIK3IP1、EPHX2、SEPT9、ITPKB、TSPYL2\/\/GPR173、GALT、USP11、CBX7\/\/LOC100128400、MAP3K14\/\/LOC100133991、CDK5RAP1、KLHL36、SPG7、ZNF574、RASA3、KLHL22\/\/KRT18、PYGO2、USP36、LCK、SKI、C5orf45\/\/SQSTM1、PIK3C2B\/\/LOC100130573、ANGEL1、ZCCHC14、CIRBP、ZMIZ2、TMEM120B\/\/RHOF、NOC2L\/\/SAMD11\/\/LOC401010、PPP1R13B、ZNF416、PBXIP1、SMYD5\/\/NOTO、ZNF529、EDC4、LENG8、TBC1D22A\/\/LOC100289878、CORO7、COG8\/\/PDF、CUL9、RASGRF2、CHERP\/\/C19orf44\/\/CALR3、POLR3E、CNNM4、TSC2、XYLT2\/\/LOC100130580、TP53、LMBR1L、AKT1、SLC7A6\/\/SLC7A6OS、LDLRAP1、SGSM2、ZNF764\/\/ZNF747、AKAP1、RNPS1、ICAM2、KIF3A、TGIF2、VAC14\/\/LOC100130894、CXXC5、DCAF15、TARBP1、RCAN3、IMP4、LUC7L、SIN3B、TRMT2B、POFUT2、AXIN1、PPIL2\/\/YPEL1、NLRP1\/\/LOC728392、TMEM63A、TMEM208、ZNF362、GNG7、CASS4、ZNF287、DGKE、CEP68、ASXL1、CLUAP1、WDR89、CD40LG、MGC57346\/\/C17orf69、PPIE\/\/CCDC25、FCHO1、TNPO2\/\/SNORD41、CSNK1E\/\/LOC400927、CLYBL、XAB2、METT10D\/\/LOC284009、PRPF6、AKAP8、SH3BP1\/\/PDXP、TOM1L2\/\/LOC246315、ZNF329、ZNF274、FAM119A、SMYD3、UNC84A\/\/C7orf20、ZNF256、PSD4、CCDC130、LIMD2\/\/MAP3K3、ELP2、ZNF8、AFG3L2、TXK、DDX27、FBXL12、TNRC6C、TADA1L、KIAA0355\/\/FLJ21369、ZNF211、ZNF808\/\/ZNF578\/\/ZNF611、SRCAP\/\/SNORA30、BANP\/\/RUNDC2C、ADARB1、CCDC71、KTI12、TCF25、XYLT1\/\/LYRM2\/\/ZC3H11A、DET1、ABCF3、PRKCZ、KIAA0141、CHI3L1、RPGRIP1、TTC31、MTMR15\/\/MTMR10、MEF2D、TMEM50B、GLOD4、PRPF8、C14orf43、P2RX5、MSH2、PCCA、DENND4B、SLC43A2、MAPK8IP3、TUBGCP5、C19orf2、SEH1L、CCDC104、TRIM62、TDRKH、COG1、POLR1B、AFG3L1、TYK2、RBM3、UBTF、RP11-94I2.2\/\/NBPF16\/\/NBPF11\/\/NBPF15\/\/NBPF8\/\/NBPF20\/\/NBPF10\/\/NBPF14\/\/NBPF1\/\/LOC100288142\/\/NBPF12\/\/KIAA1245\/\/LOC100290137、ZNF41、ZNF461、PI4KA\/\/PI4KAP1\/\/PI4KAP2\/\/LOC100293141、THEM4、BCL11A、CC2D1B、WDR73、BBS2\/\/OGFOD1、RRN3\/\/LOC653390\/\/LOC730092\/\/LOC100131998、NOP58、NUCKS1、ZNHIT6、RXRB、AKT3、FANCM、ERN1、FAM117B、COX11\/\/TOM1L1、ACVR2A、RP3-402G11.5、AHCTF1、CLN8、NVL、SAPS2、DPEP3、PDE3B、DPEP2、GGA1、CCDC50、SNRPN\/\/SNURF\/\/IPW\/\/SNORD116-16\/\/SNORD116-18\/\/SNORD116-21\/\/SNORD116-22\/\/SNORD116-17\/\/SNORD116-19\/\/PAR5\/\/PAR-SN\/\/SNORD116-2\/\/SNORD116-25\/\/SNORD116-26\/\/SNORD107\/\/SNORD115-12\/\/SNORD115-5\/\/SNORD115-6\/\/SNORD115-9\/\/SNORD116-11\/\/SNORD116-12\/\/SNORD116-13\/\/SNORD116-28\/\/SNORD116-4\/\/SNORD64\/\/PAR1\/\/SNORD109A\/\/SNORD109B\/\/SNORD116-6\/\/SNORD116-3\/\/SNORD116-9\/\/SNORD115-13\/\/SNORD115-1\/\/SNORD115-14\/\/SNORD115-15\/\/SNORD115-21\/\/SNORD115-10\/\/SNORD115-7\/\/SNORD115-16\/\/SNORD115-40\/\/SNORD115-42\/\/SNORD115-11\/\/SNORD115-29\/\/SNORD115-34\/\/SNORD115-36\/\/SNORD115-4\/\/SNORD115-43\/\/HBII-52-24\/\/SNORD116-5\/\/SNORD116-7\/\/SNORD115-26\/\/SNORD115-30\/\/SNORD116-15\/\/SNORD116-8\/\/SNORD115-2\/\/SNORD115-39\/\/SNORD116-14\/\/SNORD116-20\/\/SNORD115-8\/\/SNORD115-3\/\/SNORD115-38\/\/SNORD115-41\/\/SNORD115-22\/\/SNORD115-44\/\/SNORD116-1\/\/SNORD115-17\/\/SNORD115-18\/\/SNORD115-19\/\/SNORD115-20\/\/SNORD116@、C17orf65\/\/ASB16、ZNF317、SNRNP200、CXorf26、MTBP、NOL11\/\/SNORA38B、CCNL2、ALDOC、PITPNC1、FASTKD2、ZZZ3、PIK3R5、WDR82、GLDN、CHML、C15orf40、DIDO1、CLCC1\/\/GPSM2\/\/C1orf62、SLC35D1、SCRN1、C15orf63\/\/SERF2、ZNF460、SAFB2\/\/SAFB、C16orf54、DDX18、CTPS2、ZNF382、ZNF101、LIPT1\/\/MRPL30、ITGA6、KIF21B、INPP5B、SF3A1\/\/CCDC157、ODF2L、NUAK2、CHCHD5、AHSA2\/\/USP34、YLPM1、TERF2、ZNF830、MAN2B1\/\/MORG1、GPATCH8、SHC1、SEPT4、SFRS2、TMC3、OTUD5、NARG1L、MKL1\/\/KIAA1659、YTHDF1、SLC14A2、GGA3和EXOC7(以下在本文中可互换称为“D组IRS免疫系统生物标志基因”或“D组IRS生物标志基因”)。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:ALKBH5\/\/FLJ13773、RPS19BP1、RFXANK\/\/MEF2B\/\/LOC729991、NA、CDC6、C19orf56、NA、ABCC2、THAP11、RTN2、MAZ、TAX1BP3、NUTF2、MPZL3、FBXW5、HIST1H2BM、CETP、PQLC1、H2AFX、KIAA0101\/\/CSNK1G1、STK17B、SMARCD3、LOC100134934\/\/CDK3、LPCAT4、LPP、MPZL2、ANKRD9、PRR13\/\/PCBP2、MDS2、RBM33、GATAD2B\/\/PLIN2、PPTC7、MYBL2、OIP5、PLA2G7、CRIPT、RNF186、CCDC125、TLE3、C3orf35、SAP130、MXD1、ZHX2、CDK5RAP3、ENTPD1\/\/C10orf131、NDUFB7、POGZ、DOK3、MCM7、IL17F、CLPS和DUSP11(以下在本文中可互换地称为“E组IRS免疫系统生物标志基因”或“E组IRS生物标志基因”);并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:PIWIL4、C11orf82、ACRC、CLPTM1L、MAGED2、PLAC8、ZDHHC4、OTX1、INSIG1、BATF、MFSD11、DNASE1L1\/\/RPL10、C15orf24、CDS2、KEAP1、ARD1A、POLR2G、AHCY、SLC39A9、CUGBP1、FAM96B、TM7SF3、CTSZ、CD63、SPPL2A、ST3GAL2、SEC13、TM9SF1、IRAK2、GOSR2、ADIPOR2、TG、GABRR2、TPST2、DERL2、CCDC101\/\/LOC388242、VWA5A\/\/OR10D1P、CD300A、MRPS34、PSMA7、MAPK6、JKAMP、TLR10、RAG1AP1、NEU1、SLC30A1、PDGFC、ATOX1、CYBASC3、TMEM205\/\/hCG_29977、FAM108B1、ACSS2、HIST1H4L、AGTRAP、RNF114、UBQLN2、EDF1、C20orf197、UBE2E1、RER1、ANKRD10、SEC22C、TM2D3、SLC15A2、TRIM28、COX15、CCDC109A、CSTF1、AIP、ACTR1A、HIST1H4I、YIF1B、TSPAN31、VPS26B、CNIH、TGFBR1、NIPA2\/\/CYFIP1、DDAH2、BID、CYB5R1、CEACAM4、KIT、GAB2、JAG1、RPGRIP1、VAT1、GNB5\/\/LOC100129973、SSR4\/\/IDH3G、LAMP1、MRPL41、RUNX2、ITFG1、DNASE1、ZNRD1\/\/NCRNA00171、NLRP1\/\/LOC728392、STT3A、MGAT4B\/\/SQSTM1、KIAA1257\/\/ACAD9\/\/LOC100132731、KLHL6、PTPN6、GALK2、DAD1\/\/OR6J1、PDLIM5、TMEM147、TRAM1\/\/LOC286190、LZTR1、TNPO1、ACSL5、C22orf37、PLK1、SYNE2、PSMD3、FLJ27255、PRKCD、RAB34、RPN2\/\/EEF1A2、SLC35B1、KCNIP3、PDE3B、PXMP2\/\/PGAM5、SDF2、HIST1H3I、LOC284757、TMEM33\/\/DCAF4L1、CSNK2A2、LSM10、PTTG1IP、ADRB3\/\/GOT1L1、PLXNA2、DIAPH2、BICD2、HAL、RPS6KC1、TMEM106C、CD1E、SLC35A5、C7orf26、IMP3、PICALM、ARF1、FHOD1\/\/SLC9A5、C19orf55、TOMM40L\/\/NR1I3、INSIG2、NEK9、HCG27、SDHB、CUBN、PRDX3、CEPT1\/\/DRAM2、ERGIC1、KPNA3、VAV1、ELMO1、CUGBP2、LASP1、COL9A2、MEGF9、ELF4、SUZ12P、SULT1A2\/\/SULT1A1、FAM123C、FAR2、IER2、RGS2、MYBPH、MFAP3、RCHY1、MGAT1、MFSD4、CDH2、TMEM184C、CTRB2\/\/CTRB1、MPP4、PHF12、SLBP、ADAM19、HTR1B、TRIM55、CRNN、KLHDC7A、YIPF5、SLC11A1、GABBR1、CAMKV、SLC35F5、CHRNG、CXCL14、METTL6、PHC2、GPR153、TNFRSF10D、BAT2L、GALNT2、DENND3\/\/C8orf60、CLDN3、F11、CCDC93、FLJ46365、CYP21A2、ETV5、TRPM2、IL20、NBL1\/\/C1orf151、NGEF、POU6F2、PTEN\/\/PTENP1、NPC1L1、CYP4B1、NFIC、PPARGC1A、PLIN3、THPO、TIMP4、CELSR2、DMBX1、CAMK2B、PPFIA1、HCLS1、SLC6A20、C17orf66\/\/RSL24D1、PIWIL2、DAZL\/\/DAZ4\/\/DAZ3\/\/DAZ2、GAL3ST2、TPD52L1、C19orf34、RASGEF1C、BAALC\/\/FLJ10489、NR4A2\/\/FLJ46875、HAPLN1、CLDN18、TAS1R1、TIMD4、SKI、CCDC48、MEGF10、OSBPL6、DNAH2、ARID1B、PGC、DCST1、SDK1、CHIA、REG4\/\/NBPF7、TMEM49\/\/CLTC\/\/MIR21、TMEM44、NDUFB6\/\/DFFB、COL25A1、EPHX4、NCRNA00085、NTRK3、PKHD1、SLC2A7、NTRK1、ABHD1\/\/PREB、SLC4A9、GPNMB、SLC5A1、SLC7A8、RTCD1、PROC、C17orf64、FLJ14100\/\/C1orf86、NUP50、UNKL、C10orf18、TMEM61、C9orf68、CYTSA、MORN3、RAB17、CNNM3、CCDC28B、SH2D6、BARHL2、T、SNRK、TCP11、KDR、ENAM、UNKL、SPRR2C、GPR17\/\/LOC100291428\/\/LIMS2、C1orf175\/\/TTC4、CACNA1D、C2orf62、LOC100132686、UNQ6126、TRIM15、GPR113\/\/SELI、IL22、SCN10A、FAAH、MBOAT7、C7orf51、KIAA1530、TRPM8、C1orf95、DDC\/\/LOC100129427、GABRA1、HCRTR1、DCST2、CHODL、PAN3\/\/EEF1A1\/\/CHCHD2、LYPD6B、UGT3A1和SERPINA6(以下在本文中可互换地为“F组IRS免疫系统生物标志基因”或“F组IRS生物标志基因”)。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组、第二IRS免疫系统生物标志组、第三IRS免疫系统生物标志组和第四IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:RPS19BP1、RFXANK\/\/MEF2B\/\/LOC729991、C19orf56、RTN2、HIST1H2BM、CETP、PQLC1、H2AFX、KIAA0101\/\/CSNK1G1、LOC100134934\/\/CDK3、LPCAT4、LPP、MPZL2、ANKRD9、RBM33、MYBL2、PLA2G7、OIP5、CRIPT、RNF186、C3orf35、ZHX2、NDUFB7和DUSP11(以下在本文中可互换地称为“G组IRS免疫系统生物标志基因”或“G组IRS生物标志基因”);b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:PIWIL4、C11orf82、ACRC、PLAC8、ZDHHC4、OTX1、INSIG1、BATF、MFSD11、C15orf24、CDS2、POLR2G、SLC39A9、FAM96B、TM7SF3、SPPL2A、ADIPOR2、GOSR2、DERL2、TPST2、VWA5A\/\/OR10D1P、CCDC101\/\/LOC388242、MAPK6、PSMA7、JKAMP、TLR10、RAG1AP1、SLC30A1、PDGFC、ATOX1、TMEM205\/\/hCG_29977、FAM108B1、UBQLN2、EDF1、C20orf197、RER1、UBE2E1、ANKRD10、SEC22C、TM2D3、SLC15A2、CCDC109A、HIST1H4I、TSPAN31、TGFBR1、CNIH、DDAH2、NIPA2\/\/CYFIP1、BID、CYB5R1、KIT、RPGRIP1、MRPL41、RUNX2、ITFG1、ZNRD1\/\/NCRNA00171、NLRP1\/\/LOC728392、KIAA1257\/\/ACAD9\/\/LOC100132731、KLHL6、GALK2、DAD1\/\/OR6J1、PDLIM5、TRAM1\/\/LOC286190、TNPO1、ACSL5、SYNE2、RPN2\/\/EEF1A2、SLC35B1、KCNIP3、TMEM33\/\/DCAF4L1、CSNK2A2、LSM10、PLXNA2、DIAPH2、HAL、RPS6KC1、SLC35A5、PICALM、C19orf55、INSIG2、SDHB、PRDX3、CEPT1\/\/DRAM2、KPNA3、SULT1A2\/\/SULT1A1、FAR2、MYBPH、MFAP3、RCHY1、CDH2、TMEM184C、CTRB2\/\/CTRB1、SLBP、CRNN、YIPF5、CHRNG、SLC35F5、METTL6、CLDN3、CCDC93、CYP21A2、NBL1\/\/C1orf151、NGEF、POU6F2、NPC1L1、PPARGC1A、THPO、CELSR2、DMBX1、SLC6A20、C17orf66\/\/RSL24D1、GAL3ST2、C19orf34、BAALC\/\/FLJ10489、CLDN18、TAS1R1、CCDC48、OSBPL6、SDK1、TMEM49\/\/CLTC\/\/MIR21、TMEM44、NDUFB6\/\/DFFB、NCRNA00085、NTRK3、NTRK1、SLC4A9、SLC5A1、RTCD1、FLJ14100\/\/C1orf86、PROC、C17orf64、UNKL、C9orf68、MORN3、RAB17、CNNM3、CCDC28B、BARHL2、UNKL、LOC100132686、UNQ6126、IL22、FAAH、C7orf51、DCST2、LYPD6B和SERPINA6(以下在本文中可互换称为“H组IRS免疫系统生物标志基因”或“H组IRS生物标志基因”);c)所述第三IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:ALKBH5\/\/FLJ13773、RNA243、ARD1A、CDC6、AHCY、MRPS34、CYBASC3、HIST1H4L、RNF114、TRIM28、CSTF1、CEACAM4、GAB2、GNB5\/\/LOC100129973、THAP11、SSR4\/\/IDH3G、STT3A、NUTF2、MPZL3、TMEM147、RAB34、PDE3B、PXMP2\/\/PGAM5、HIST1H3I、LOC284757、TMEM106C、STK17B、IMP3、HCG27、CUBN、ERGIC1、ELMO1、CUGBP2、COL9A2、MEGF9、SUZ12P、FAM123C、RGS2、PRR13\/\/PCBP2、PHF12、ADAM19、GATAD2B\/\/PLIN2、SLC11A1、PPTC7、PHC2、BAT2L、DENND3\/\/C8orf60、FLJ46365、ETV5、CCDC125、PTEN\/\/PTENP1、TLE3、NFIC、TIMP4、PPFIA1、HCLS1、SAP130、MXD1、NR4A2\/\/FLJ46875、SKI、ARID1B、ENTPD1\/\/C10orf131、POGZ、DOK3、REG4\/\/NBPF7、MCM7、SLC7A8、NUP50、C10orf18、TMEM61、SH2D6、SNRK、SPRR2C、CACNA1D、TRIM15、CLPS、MBOAT7、KIAA1530、C1orf95、GABRA1、HCRTR1、CHODL和PAN3\/\/EEF1A1\/\/CHCHD2(以下在本文中可互换称为“I组IRS免疫系统生物标志基因”或“I组IRS生物标志基因”);并且,d)所述第四IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:CLPTM1L、MAGED2、DNASE1L1\/\/RPL10、KEAP1、CUGBP1、CTSZ、CD63、ST3GAL2、SEC13、TM9SF1、IRAK2、GABRR2、TG、CD300A、NEU1、ACSS2、AGTRAP、UPF0627、COX15、ABCC2、ACTR1A、AIP、YIF1B、VPS26B、JAG1、VAT1、LAMP1、DNASE1、MAZ、TAX1BP3、MGAT4B\/\/SQSTM1、FBXW5、PTPN6、LZTR1、PLK1、C22orf37、PSMD3、FLJ27255、PRKCD、SDF2、PTTG1IP、ADRB3\/\/GOT1L1、BICD2、CD1E、C7orf26、ARF1、FHOD1\/\/SLC9A5、TOMM40L\/\/NR1I3、NEK9、VAV1、SMARCD3、LASP1、ELF4、IER2、MGAT1、MFSD4、MDS2、MPP4、HTR1B、TRIM55、KLHDC7A、GABBR1、CAMKV、CXCL14、GPR153、TNFRSF10D、GALNT2、F11、IL20、TRPM2、CYP4B1、PLIN3、CAMK2B、PIWIL2、DAZL\/\/DAZ4\/\/DAZ3\/\/DAZ2、TPD52L1、RASGEF1C、HAPLN1、TIMD4、CDK5RAP3、MEGF10、DNAH2、PGC、DCST1、CHIA、COL25A1、EPHX4、PKHD1、SLC2A7、ABHD1\/\/PREB、GPNMB、CYTSA、T、TCP11、ENAM、KDR、GPR17\/\/LOC100291428\/\/LIMS2、C1orf175\/\/TTC4、IL17F、C2orf62、GPR113\/\/SELI、SCN10A、TRPM8、DDC\/\/LOC100129427和UGT3A1(以下在本文中可互换称为“J组IRS免疫系统生物标志基因”或“J组IRS生物标志基因”)。在特定的实施方案中,所述第一IRS免疫系统生物标志是PLA2G7表达产物,所述第二IRS免疫系统生物标志是PLAC8表达产物,所述第三IRS免疫系统生物标志是CEACAM4表达产物,且所述第四IRS免疫系统生物标志是LAMP1表达产物。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有轻度脓毒症或严重脓毒症的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:N4BP2L2\/\/CG030、FAM96A、MINPP1、MORC3\/\/DOPEY2、LSM8、PLEKHA3、MITD1、ATF4、B2M、TMX3、ZNF273、PLEKHF2、UNQ2999、DPM1、OCLM、NADK、GPR65、SFRS3、ZNF28、PFDN4、COQ10B、SLC30A6\/\/DDX50、KPNA5、ATP6V1G1、HAUS2、hCG_2039148、RAB33B、BET1、UBE2V2、ATP6AP2、SUB1\/\/TMEM183A、TMEM188、ABHD3、LAPTM4A、RNF138、CCDC82、TMEM179B、PAPD4、VAMP2、CCDC126、ATG3、CHCHD5、RBM39\/\/LOC643167、NAT8B、HAT1、CNOT6L、ZBED5、GOLT1B、TTC33、ACTN1、ACTR6、GNB4、TMEM208、CCNH、C4orf34、HAUS6\/\/SCARNA8、TCTN1、SF3B14、TMEM138、TTC35、DLEU2\/\/DLEU2L、MFSD8、COX7A2L、UGGT2、CEPT1\/\/DRAM2、LEMD3、CREBZF、RPL21P44、ANGEL2、UFM1、XPO1、CALM2\/\/C2orf61、PLDN、CLK1\/\/PPIL3、C1orf84、PPA2、FPGT\/\/TNNI3K、ORC4L、SLC25A14、H3F3B\/\/H3F3C、FAM188A、MCM9、KLHL9、NACA、PAFAH1B2、CRLS1、TSSK4、LOC152217、ZNF568、ATP6V0D1\/\/LOC100132855、CDC37L1、FNTA、SHFM1、JKAMP、TMEM126B、MRPL47、DENND1B、ATP6V0E1\/\/SNORA74B、LIN7C、HAUS3\/\/POLN、SLC30A7、VAMP3、OBFC2A、MAGT1、STARD3NL、C5orf15、PSMD10、RERE、RNF139、SFT2D2、SKP1、RNPC3\/\/AMY2B、MYOM1、TIPRL、HPRT1、TRIM21、VRK2、CDKN1B、ANKRA2、RAP2B、FAM127B\/\/FAM127C\/\/FAM127A、FAM126A、TMEM161B、UNQ1887、FANCF、SELT、CYP20A1、RWDD1、ARPP19、SC5DL、TICAM2\/\/TMED7\/\/TMED7-TICAM2、STAM、LEPROTL1、RNF44、DCP1B、TNNT3、UCHL5、UPRT、SON、PIK3C3、SFRS1\/\/FLJ44342、FBXO22\/\/FBXO22OS、SCFD1、C11orf31、TMTC3、CCDC132、TMBIM4\/\/LOC100133322、ATAD1、APH1A、MYNN、HADHB、PIGN、RNA243、SLC38A9、C10orf84、CDKN1A、ATP7A、RPAP2、ZNF451、GSK3B\/\/LOC100129275、TMSB10、KCTD5\/\/PRO0461\/\/PDPK1、VPS29、WIPF3\/\/ZNRF2\/\/LOC441208、SFRS5和C11orf73(以下在本文中可互换地称为“K组IRS免疫系统生物标志基因”或“K组IRS生物标志基因”);并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:C13orf1、PRKCB、APOBEC3A\/\/APOBEC3B、SFRS9、NCAPD2\/\/SCARNA10\/\/FADS1、GATS、LOC284757、TSHZ2、JAK1、MAPK13、RPN1、GNAS、CYTSA、TRPM6、C22orf30、PCMTD1\/\/PXDNL、CCDC69、ARSD、MLL3\/\/BAGE2、NCOR1\/\/C20orf191\/\/LOC100131704、MRPS7、VEZF1、GSR、POU2F1、VPS4A、SMG7、PTP4A2、OSBP、GLCCI1\/\/tcag7.903、DOCK2、PCNX、GLTP、FBXO18、YY2、TCF20、NR2C2\/\/MRPS25、TEX2、BAMBI、WHSC1L1、UBTF、FAH、GEMIN4、DDEF1IT1、FAM50A、VPS13D、SATB1\/\/TBC1D5、PARP6、SETD5、PHF21A、IRF4、ZNF217、UBE4A、HIVEP1、HDLBP、GNAI2、MED13L、FOXP1、NSD1、DDOST、TMBIM6、ABLIM1、SYNRG\/\/LOC100131822、KDM3B、ASH1L、NCOA2、GPRIN3、NCOA1、KLF3、LOC100288114\/\/MGC9913、VPS26B、AHCYL1、CDC6、PLCG2、IL16、GIT2、TACC3、MAP4K4、NEK9、FAM149B1\/\/FAM149B2、VPS8、ATXN7、WDFY4、ZC3H11A\/\/RP11-74E24.2、THRAP3、ZNF346、AP3M2、CD14、CLASP1、ABCC2、ATXN7L1\/\/RINT1\/\/EFCAB10、INO80D、CTPS、LRRC37A3\/\/LRRC37A2\/\/LRRC37A\/\/ARL17P1\/\/LRRC37A4\/\/LOC100294335\/\/LOC644397、DNASE1、LRRN3、ZNF318、PRKAR2A、MRPS15、ANKHD1-EIF4EBP3\/\/ANKHD1\/\/EIF4EBP3、BTF3L4、DGKA、C10orf119、MBD5、C11orf30、CDC2L5、DPP4、DCTN4、TP53BP2、IMPDH2、GOT2、ELMO1和PARP1(以下在本文中可互换地称为“L组IRS免疫系统生物标志基因”或“L组IRS生物标志基因”)。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有轻度脓毒症或脓毒性休克的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:EEF1DP3、GIMAP7、ZNF839、PYGL、TNFAIP8L2、SFRS9、VIM、GLTP、WDFY4、APPL2、C4orf3、PLD1、LIN7A、ELP2、ZDHHC3、UBAP1\/\/KIF24、C20orf177、FAM149B1\/\/FAM149B2、E2F3、SPATA1、DACH1、FAM47E\/\/STBD1、SVIL\/\/hCG_1783494、METTL9、LRRC42、NUPL1、UPP1、AFF2、SLC16A4、SET、CA4、HCK、C16orf72、EXT1、NOP58、FRZB、C9orf6\/\/IKBKAP、VASP、ASB8\/\/PHB、GTDC1、SLC39A9、FBXO34\/\/KIAA0831、RABGEF1\/\/tcag7.967\/\/tcag7.951\/\/KCTD7\/\/LOC100293333、SLC28A3、WIPI1\/\/ARSG、NFE2、GOLGA1\/\/SCAI、C9orf84、RPS6KA2、PSMA7、C19orf59、ICA1、TOR1AIP2\/\/TOR1AIP1\/\/IFRG15、MSRA、FPR1、TP53I3、FOXL2、CD63、PIGC、CENPBD1、CYB5R1、GNB2、ZNF197、KLF7、NSFL1C、USF2、PARP6、MAP9、TSPO、CSTB、DDA1、SLC36A4、GFOD2、OCRL、ZNF232、APH1B、TALDO1\/\/INTS8、DENND2C\/\/BCAS2、RAB11FIP2、LARS、PLP2、EIF4E2、DNASE1L1\/\/RPL10、AFTPH、TMCO3、RPA2、UQCRC1、ZDHHC3和ACTR1A(以下在本文中可互换地称为“M组IRS免疫系统生物标志基因”或“M组IRS生物标志基因”);并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:CD6、ITPA、PVRIG\/\/PILRB\/\/STAG3、FLT3LG、IL12RB1、MAP3K14\/\/LOC100133991、FAM102A、TMC8、TMEM208、TMEM109、C1orf84、NADK、SEPT1、UBA7、CD5、C12orf62、C20orf112、FOXP4、EIF4A2\/\/SNORA4、ZNF487\/\/LOC439911、KCTD13、IL18BP\/\/NUMA1、KPNA5、EDC4、ZNF587\/\/ZNF417、NBR2、RPL28、ZNF738、SHFM1、CNO、C9orf82、RPL5\/\/SNORA66\/\/SNORD21\/\/FAM69A、VAMP2、SIT1、SFRS3、LCK、IRF9、MRPS21、NEFM\/\/LOC100129717、RCN2、BET1、C19orf6、SH2D1A、GLS、OR1C1、RBM14\/\/RBM4、CCDC97、TUT1、MRPL14、ENOPH1、NAGK、DPM1、MPV17、SH2D3C、TMEM204、C3orf42、ARSD、FAM96A、LSM8、ATP5G1、KTI12、ARL4C、C11orf31、C16orf58\/\/LOC100128371、CCDC109B\/\/HIGD1A\/\/CCDC13、NUDT21、ZFP106、ACTR6、LIX1L、MEF2D、ZNF407、TMEM18、NAT11、DNAJC24、PLEKHA3、GPN2、SMCR7、C7orf23\/\/DMTF1、PPM1G、CNOT6L、NACA、FNTA、GRIA2、N4BP2L2\/\/CG030、ENOSF1\/\/TYMS、THBS4、LUC7L2、MOCS2、ZNF383、AKNA、UBE2Z、FLJ34077、SH3KBP1、POLR2F\/\/LOC100131530、IL1A、UBE2V2、KIAA1919、PRKCB、SHOC2、RBM46、GRPEL2、KCNG3、PCDH10、XAB2、VPS52、MCCC2、NSMCE4A、PTP4A2、SNX2、COQ10A、C6orf182、RNF44、MOGS、DIRAS3、Mitochondrial、KIAA1826、SGK196、NSUN5\/\/NSUN5B\/\/NSUN5C、Mitochondrial、MORF4L2、MAK16\/\/C8orf41、PILRB\/\/PVRIG\/\/STAG3、SAAL1、TMX3、PTPRG、MAPK1、DNAJA3、LEAP2、LMOD3、ASB6、MTMR10\/\/MTMR15、HIBADH、MORC1、CORO1A\/\/LOC606724、SFXN2、HSN2、AAAS、INHBA、MRPS7、LRRFIP1、KCTD7\/\/RABGEF1、DCDC2\/\/KAAG1、SLCO3A1、DENND4B、CFTR、MOG、QRFPR、BAT2\/\/SNORA38、ITPR3、C3orf22、TNFRSF4、ZNF646\/\/ZNF668、GCM2、CDK4\/\/TSPAN31、FXC1、RNMT、CHST4、POLR3E、PDE8B、C6orf146、CHCHD5、TARBP1、TADA1L、PREX2、TRAP1\/\/DNASE1、ZNHIT6、RGP1\/\/GBA2、SMCP、ZC3H15、TRAPPC4、SARNP\/\/DNAJC14、GNAS、C14orf104、IL20RA、WAC、SLIT3、C4orf39、TSEN54、PPP1R13B、TRIM35、HGC6.3、YIPF3、HQ0644\/PRO0644、FAM13C\/\/PHYHIPL、BCCIP\/\/DHX32、ACADM、SUB1\/\/TMEM183A、KPNA1、SPAG17\/\/WDR3、KIAA1549、DIABLO\/\/B3GNT4、ZBTB44、EIF1AD、RUNX1T1、TRIL、PTPLB、DHDDS、UPK1A、OTUB1、C1orf182、HAPLN2、SOBP、RYR3、LRRC17、TKTL2、TMBIM6和GDNF(以下在本文中可互换地称为“N组IRS免疫系统生物标志基因”或“N组IRS生物标志基因”)。在一些实施方案中,指示物用于确定受试者具有严重脓毒症或脓毒性休克的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:SIRPG\/\/SIRPA、GATA3、FAM102A、UPF3A、ATP13A5、CACNA1I和RANBP17\/\/USP12(以下在本文中可互换地称为“O组IRS免疫系统生物标志基因”或“O组IRS生物标志基因”);并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自以下IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成:GABRA6、HAPLN1、YSK4、FOXL2、TLL1、MECOM、COL3A1、HRG、SLC22A3、C8orf45、SCN7A和SNTG1(以下在本文中可互换地称为“P组IRS免疫系统生物标志基因”或“P组IRS生物标志基因”)。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性中使用的指示物的设备,所述设备包括至少一个电子处理装置,所述电子处理装置:a)确定一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度;b)使用该对生物标志值确定导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示该对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及,c)使用所述导出的生物标志值确定所述指示物。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含第一对逆转录的mRNA和第二对逆转录的mRNA,其中所述第一对包含PLAC8逆转录的mRNA和PLA2G7逆转录的mRNA,并且其中所述第二对包含CEACAM4逆转录的mRNA和LAMP1逆转录的mRNA。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含来自选自A组IRS免疫系统生物标志基因的第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自选自B组IRS免疫系统生物标志基因的第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含来自选自C组IRS免疫系统生物标志基因的第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自选自D组IRS免疫系统生物标志基因的第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含来自选自E组IRS免疫系统生物标志基因的第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自选自F组IRS免疫系统生物标志基因的第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少两对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少两对逆转录的mRNA包含第一对逆转录的mRNA和第二对逆转录的mRNA,其中所述第一对包含来自第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA,且其中所述第二对包含来自第三IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自第四IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自G组IRS免疫系统生物标志基因,其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自H组IRS免疫系统生物标志基因,其中所述第三IRS免疫系统生物标志基因选自I组IRS免疫系统生物标志基因,并且其中所述第四IRS免疫系统生物标志基因选自J组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含来自选自K组IRS免疫系统生物标志基因的第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自选自L组IRS免疫系统生物标志基因的第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含来自选自M组IRS免疫系统生物标志基因的第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自选自N组IRS免疫系统生物标志基因的第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供组合物,所述组合物包含至少一对逆转录的mRNA和与所述逆转录的mRNA的单独的一个杂交的至少一种寡核苷酸引物或探针,所述至少一对逆转录的mRNA包含来自选自O组IRS免疫系统生物标志基因的第一IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA和来自选自P组IRS免疫系统生物标志基因的第二IRS免疫系统生物标志基因的逆转录的mRNA。至少一种寡核苷酸引物或探针可与逆转录的mRNA中的单独的一个杂交。逆转录的mRNA可来源于免疫系统的组分。逆转录的mRNA可来源于白细胞。逆转录的mRNA可来源于血细胞。逆转录的mRNA可来源于外周血细胞。组合物还可包含用于检测逆转录的mRNA的被标记的试剂。被标记的试剂可以是被标记的所述至少一种寡核苷酸或探针。被标记的试剂可以是被标记的所述逆转录的mRNA。被标记的试剂可以是用于标记所述逆转录的mRNA的被标记的寡核苷酸连接体或标签。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由inSIRS和ipSIRS组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包含至少一对试剂,所述至少一对试剂包含第一对试剂和第二对试剂,其中所述第一对试剂包含(i)允许定量PLA2G7基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量PLAC8基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第二对试剂包含:(iii)允许定量CEACAM4基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(iv)允许定量LAMP1基因的多核苷酸表达产物的试剂。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由inSIRS和健康状况组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少一对试剂,所述至少一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自A组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自B组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由ipSIRS和健康状况组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少一对试剂,所述至少一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自C组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自D组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由inSIRS和ipSIRS组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少一对试剂,所述至少一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自E组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自F组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由inSIRS和ipSIRS组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少两对试剂,所述至少两对试剂包含第一对试剂和第二对试剂,其中所述第一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,且其中所述第二对试剂包括(i)允许定量第三IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第四IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自G组IRS免疫系统生物标志基因,其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自H组IRS免疫系统生物标志基因,其中所述第三IRS免疫系统生物标志基因选自I组IRS免疫系统生物标志基因,并且其中所述第四IRS免疫系统生物标志基因选自J组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由轻度脓毒症和严重脓毒症组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少一对试剂,所述至少一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自K组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自L组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由轻度脓毒症和脓毒性休克组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少一对试剂,所述至少一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自M组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自N组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒用于确定指示选自由严重脓毒症和脓毒性休克组成的组的至少一种状况的存在或不存在的可能性的指示物,所述试剂盒包括至少一对试剂,所述至少一对试剂包含(i)允许定量第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂;以及(ii)允许定量第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的试剂,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自O组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自P组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中选自由inSIRS和ipSIRS组成的组的至少一种状况的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗至少一种状况的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中所述至少一种状况的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示所述至少一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中该对生物标志值包括以下的至少一个:a)第一对生物标志值,所述第一对生物标志值包括对应于第一生物标志和第二生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表PLA2G7基因的多核苷酸表达产物且其中所述第二免疫系统生物标志代表PLAC8基因的多核苷酸表达产物,以及,b)第二对生物标志值,第二对生物标志值包括分别对应于第三免疫系统生物标志和第四免疫系统生物标志的第三生物标志值和第四生物标志值,其中所述第三免疫系统生物标志代表CEACAM4基因的多核苷酸表达产物且其中所述第四免疫系统生物标志代表LAMP1基因的多核苷酸表达产物。通常,指示物确定方法包括:确定所述第一对生物标志值和所述第二对生物标志值,以及确定使用所述第一对生物标志值计算的第一导出的生物标志值和使用所述第二对生物标志值计算的第二导出的生物标志值;并基于所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值的组合确定所述指示物。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中inSIRS的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗inSIRS的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中inSIRS的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示该对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自A组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自B组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中ipSIRS的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗ipSIRS的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中ipSIRS的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示所述至少一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自C组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自D组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中选自由inSIRS和ipSIRS组成的组的至少一种状况的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗所述至少一种状况的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中所述至少一种状况的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示所述至少一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自E组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自F组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中选自由inSIRS和ipSIRS组成的组的至少一种状况的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗至少一种状况的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中所述至少一种状况的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少两对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少两对生物标志值确定至少两个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示每一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少两个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括第一对生物标志值和第二对生物标志值,所述第一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且所述第二对生物标志值包括分别对应于第三免疫系统生物标志和第四免疫系统生物标志的第三生物标志值和第四生物标志值,其中所述第三免疫系统生物标志代表第三IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第四免疫系统生物标志代表第四IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自G组IRS免疫系统生物标志基因,其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自H组IRS免疫系统生物标志基因,其中所述第三IRS免疫系统生物标志基因选自I组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第四IRS免疫系统生物标志基因选自J组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中选自由轻度脓毒症和严重脓毒症组成的组的至少一种状况的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗至少一种状况的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中所述至少一种状况的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示所述至少一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自K组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自L组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中选自由轻度脓毒症和脓毒性休克组成的组的至少一种状况的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗至少一种状况的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中所述至少一种状况的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示所述至少一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自M组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自N组IRS免疫系统生物标志基因。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于抑制受试者中选自由严重脓毒症和脓毒性休克组成的组的至少一种状况的发展或进展的方法,所述方法包括:基于从指示物确定方法获得的指示物将所述受试者暴露于用于治疗至少一种状况的治疗方案,其中所述指示物指示所述受试者中所述至少一种状况的存在,所述指示物确定方法包括:(a)确定至少一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度,(b)使用所述至少一对生物标志值确定至少一个导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示所述至少一对免疫系统生物标志的浓度的比率;以及(c)基于所述至少一个导出的生物标志值确定所述指示物,其中所述至少一对生物标志值包括分别对应于第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的第一生物标志值和第二生物标志值,其中所述第一免疫系统生物标志代表第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,且其中所述第二免疫系统生物标志代表第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自O组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自P组IRS免疫系统生物标志基因。在一些实施方案中,该方法包括从受试者采集样品并根据指示物确定方法获得指示物。在一些实施方案中,该方法包括:将从受试者采集的样品送至实验室,在该实验室指示物被确定。通常,样品包含从受试者获得的细胞或其核酸样品。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中inSIRS和ipSIRS的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值选自由以下组成的组:i)第一对生物标志值,所述第一对生物标志值指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度;ii)第二对生物标志值,所述第二对生物标志值指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示inSIRS和ipSIRS;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中inSIRS和健康状况的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自A组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自B组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示inSIRS和健康状况;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有inSIRS或所述健康状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中ipSIRS和健康状况的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自C组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自D组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示ipSIRS和健康状况;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有ipSIRS或所述健康状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中inSIRS和ipSIRS的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自E组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自F组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示inSIRS和ipSIRS;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中inSIRS和ipSIRS的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值选自由以下组成的组:i)第一对生物标志值,所述第一对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自G组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自H组IRS免疫系统生物标志基因;ii)第二对生物标志值,所述第二对生物标志值指示第三IRS免疫系统生物标志基因和第四IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第三IRS免疫系统生物标志基因选自I组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第四IRS免疫系统生物标志基因选自J组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示inSIRS和ipSIRS;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中轻度脓毒症和严重脓毒症的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自K组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自L组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示轻度脓毒症和严重脓毒症;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有轻度脓毒症或严重脓毒症的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中轻度脓毒症和脓毒性休克的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自M组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自N组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示轻度脓毒症和脓毒性休克;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有轻度脓毒症或脓毒性休克的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中严重脓毒症和脓毒性休克的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值指示第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物的浓度,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自O组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自P组IRS免疫系统生物标志基因;c)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;以及,d)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考分别指示严重脓毒症和脓毒性休克;以及,e)根据所述比较的结果确定所述受试者具有严重脓毒症或脓毒性休克的可能性。通常,所述方法包括:a)使用所述第一对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的第一导出的生物标志值;b)使用所述第一对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的第二导出的生物标志值;以及,c)通过将所述第一导出的生物标志值与所述第二导出的生物标志值组合来确定所述指示物。通常,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组分别由被诊断为具有inSIRS和ipSIRS的个体组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:i)PLA2G7基因和PLAC8基因的第一对多核苷酸表达产物;ii)CEACAM4基因和LAMP1基因的第二对多核苷酸表达产物;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自A组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自B组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自C组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自D组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自E组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自F组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:i)第一IRS免疫系统生物标志基因和第二IRS免疫系统生物标志基因的第一对多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自G组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自H组IRS免疫系统生物标志基因;ii)第三IRS免疫系统生物标志基因和第四IRS免疫系统生物标志基因的第二对多核苷酸表达产物,其中所述第三IRS免疫系统生物标志基因选自I组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第四IRS免疫系统生物标志基因选自J组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自K组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自L组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自M组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自N组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的选自由以下组成的组的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度:第一IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和第二IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物,其中所述第一IRS免疫系统生物标志基因选自O组IRS免疫系统生物标志基因,且其中所述第二IRS免疫系统生物标志基因选自P组IRS免疫系统生物标志基因;d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物;以及,e)使用所述指示物来评估生物受试者具有医学状况的可能性。通常,所述方法包括:a)通过确定第一对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第一导出的生物标志值;b)通过确定第二对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第二导出的生物标志值;c)通过将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加确定所述指示物。通常,所述方法包括:a)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,其中所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组中的一组由被诊断为具有所述医学状况的个体组成;以及,b)根据所述比较的结果确定所述受试者具有医学状况的可能性。通常,所述扩增量是以下的至少一个:a)循环时间;b)循环的数目;c)循环阈值;d)扩增时间;以及,e)相对于另一种扩增的产物的扩增量的。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于在评估生物受试者具有医学状况的可能性中使用的方法,所述方法包括,在一个或更多个处理装置中:a)确定一对生物标志值,该对生物标志值选自由以下组成的组:i)第一对生物标志值,所述第一对生物标志值指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度;ii)第二对生物标志值,所述第二对生物标志值指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度;b)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;c)从数据库检索先前被确定的第一指示物参考和第二指示物参考,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考基于由第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物来确定,所述组之一由被诊断为具有医学状况的个体组成;d)将所述指示物与所述第一指示物参考和所述第二指示物参考进行比较;e)使用所述比较的结果来确定指示所述受试者具有所述医学状况的概率;以及,f)生成所述概率的表示,所述表示被展示给用户,以允许所述用户评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性。通常,所述方法包括:a)使用所述第一对生物标志值确定第一导出的生物标志值,所述第一导出的生物标志值指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率;b)使用所述第一对生物标志值确定第二导出的生物标志值,所述第二导出的生物标志值指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率;以及,c)通过将所述第一导出的生物标志值与所述第二导出的生物标志值组合确定所述指示物。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在确定生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用的指示物的设备,所述设备包括:a)取样装置,所述取样装置获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)测量装置,所述测量装置定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值选自由以下组成的组:i)第一对生物标志值,所述第一对生物标志值指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度;ii)第二对生物标志值,所述第二对生物标志值指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度;c)至少一种处理装置,所述至少一种处理装置:i)接收来自所述测量装置的该对生物标志值的指示;ii)使用所述生物标志值、使用所述第一多核苷酸表达产物和所述第二多核苷酸表达产物的浓度的比率确定指示物;以及,iii)将所述指示物与至少一种指示物参考进行比较;以及,iv)使用所述比较的结果确定所述受试者具有所述至少一种医学状况的可能性;以及,v)生成用于展示给用户的指示物和可能性的表示。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于区分生物受试者中inSIRS和ipSIRS的方法,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)在测量装置中:i)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;ii)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的多核苷酸表达产物需要的扩增程度,包括:(1)对于PLA2G7基因和PLAC8基因的第一对多核苷酸表达产物的扩增量;(2)对于CEACAM4基因和LAMP1基因的第二对多核苷酸表达产物的扩增量;c)在处理系统中:i)检索所述扩增量;ii)通过以下确定指示物:(1)通过确定对于所述第一对的所述扩增量之间的差异确定指示所述第一对多核苷酸表达产物的浓度的比率的第一导出的生物标志值;(2)通过确定对于所述第二对的所述扩增量之间的差异确定指示所述第二对多核苷酸表达产物的浓度的比率的第二导出的生物标志值;(3)通过将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加确定所述指示物;iii)从数据库检索先前被确定的第一指示物参考和第二指示物参考,其中所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组由分别被诊断为具有inSIRS和ipSIRS的个体组成;iv)将所述指示物与所述第一指示物参考和所述第二指示物参考进行比较;v)使用所述比较的结果来确定所述受试者被分类在所述第一组或所述第二组内的可能性;vi)生成至少部分地指示所述指示物和所述概率的表示;以及,vii)向用户提供所述表示,以允许所述用户评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)确定多个生物标志值,每个生物标志值指示对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度;b)使用所述多个生物标志值的组合确定所述指示物,其中:i)至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。通常,所述方法包括:c)确定多个测量的生物标志值,每个测量的生物标志值是生物受试者的对应的生物标志的测量的值;以及,d)通过对至少一个所述测量的生物标志值应用函数确定至少一个导出的生物标志值来确定所述指示物,所述至少一个导出的生物标志值指示对应的导出的生物标志的值。通常,所述函数包括以下的至少一种:a)将两个生物标志值相乘;b)将两个生物标志值相除;c)将两个生物标志值相加;d)将两个生物标志值相减;e)两个生物标志值的比率;f)至少两个生物标志值的加权和;g)至少两个生物标志值的对数和;以及,h)至少两个生物标志值的S型函数(sigmoidalfunction)。通常,该方法包括确定对应于两个测量的生物标志值的比率的至少一个导出的生物标志值。通常,该方法包括将至少两个生物标志值组合以确定代表所述指示物的指示物值。通常,该方法包括使用组合函数组合至少两个生物标志值,所述组合函数是以下的至少一种:a)加性模型;b)线性模型;c)支持向量机;d)神经网络模型;e)随机森林模型;f)回归模型;g)遗传算法;h)退火算法;i)加权和;j)最邻近模型;以及,k)概率模型。通常,所述至少两个生物标志中的至少一个是导出的生物标志。通常,该方法包括:a)确定第一导出的生物标志值,所述第一导出的生物标志值指示第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的浓度的比率;b)确定第二导出的生物标志值,所述第二导出的生物标志值指示第三测量的免疫系统生物标志和第四测量的免疫系统生物标志的浓度的比率;以及,c)将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加,以生成指示物值。通常该方法至少部分地使用电子处理装置来进行。通常,该方法包括,在电子处理装置中:a)接收多个测量的生物标志值,每个测量的生物标志值是对应的免疫系统生物标志的测量的值;b)对至少一个测量的生物标志值应用函数确定至少一个导出的生物标志值,所述至少一个导出的生物标志值指示对应的导出的生物标志的值;以及,c)将至少一个导出的生物标志值和至少一个其他生物标志值组合,以确定所述指示物。通常,该互相关性范围是以下的至少一个:a)±0.8;b)±0.7;c)±0.6;d)±0.5;e)±0.4;f)±0.3;g)±0.2;以及,h)±0.1。通常,每一种生物标志具有在状况相关性范围之外的与至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性,所述状况相关性范围在±0.3之间。通常,该状况相关性范围是以下的至少一个:a)±0.9;b)±0.8;c)±0.7;d)±0.6;e)±0.5;以及,f)±0.4。通常,性能阈值指示以下的至少一个的解释方差:a)0.4;b)0.5;c)0.6;d)0.7;e)0.8;以及,f)0.9。通常,生物标志值指示选自核酸分子和蛋白性分子中的一种或更多种的分子的水平或丰度。通常,该方法包括,生成指示物的表示。通常,该表示包括:a)所述指示物的字母数字指示;b)所述指示物与一种或更多种指示物参考的比较的图形指示;c)受试者具有至少一种医学状况的可能性的字母数字指示。通常,该方法包括:a)将所述指示物与指示物参考进行比较;以及,b)根据比较的结果确定可能性。通常,指示物参考是基于以下的至少一个:a)指示物阈值范围;b)指示物阈值;以及,c)指示物分布。通常,指示物参考由对参考群体中许多个体确定的指示物导出。通常,指示物参考是基于对一组参考群体确定的指示物的分布,该组由被诊断为具有医学状况的个体组成。通常,参考群体包括:a)多个不同性别的个体;b)多个不同种族的个体;c)多个健康的个体;d)多个患有至少一种已诊断的医学状况的个体;e)多个显示至少一种医学状况的临床体征的个体;以及,f)第一组个体和第二组个体,每个个体组患有各自已诊断的医学状况。通常,指示物用于在确定生物受试者具有至少一种医学状况的可能性中使用,且其中参考群体包括:a)表现至少一种医学状况的临床体征的个体;b)被诊断为具有至少一种医学状况的个体;以及,c)健康的个体。通常,指示物参考从数据库检索。通常,可能性基于使用比较的结果生成的概率。通常,指示物用于确定受试者具有第一状况或第二状况的可能性,且其中所述方法包括:a)将所述指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考指示第一状况和第二状况;以及,b)根据比较的结果确定可能性。通常,该方法包括:a)使用比较的结果确定第一指示物概率和第二指示物概率;以及,b)将所述第一指示物概率和所述第二指示物概率组合,以确定指示可能性的状况概率。通常,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组分别由被诊断为具有第一状况或第二状况的个体组成。通常,该方法包括:a)获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)定量在所述样品内的所述多核苷酸表达产物的至少一些,以确定至少一对生物标志值;c)至少部分地使用该对生物标志值确定指示物。通常,该方法包括,至少部分地使用所述多核苷酸表达产物的浓度的比率确定指示物。通常,该方法包括:a)通过以下定量多核苷酸表达产物:b)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;以及,c)确定扩增量,所述扩增量代表获得定义水平的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度;以及,d)通过确定所述扩增量之间的差异确定所述指示物。通常,所述扩增量是以下的至少一个:a)循环时间;b)循环的数目;c)循环阈值;d)扩增时间;以及,e)相对于另一种扩增的产物的扩增量的。通常,该方法包括:a)通过确定第一对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第一导出的生物标志值;b)通过确定第二对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第二导出的生物标志值;c)通过将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加确定所述指示物。通常,免疫系统生物标志是生物受试者的免疫系统的生物标志,所述生物受试者的免疫系统的生物标志作为对损伤或病原性损害的炎症反应的一部分被改变,或所述生物受试者的免疫系统的生物标志的表达水平作为对损伤或病原性损害的炎症反应的一部分被改变。通常,指示物用于确定受试者具有inSIRS和ipSIRS的至少一种的可能性,且其中该方法包括:a)确定指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度的第一对生物标志值;b)确定指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度的第二对生物标志值;以及,c)使用所述第一对生物标志值和所述第二对生物标志值确定所述指示物。通常,指示物用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性,且其中该方法包括:a)确定指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度的第一对生物标志值;b)确定指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度的第二对生物标志值;以及,c)使用所述第一对生物标志值和所述第二对生物标志值确定所述指示物。通常,指示物用于确定受试者具有inSIRS或健康状况的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自A组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自B组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。通常,指示物用于确定受试者具有ipSIRS或健康状况的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自C组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自D组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。通常,指示物用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自E组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自F组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。通常,指示物用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组、第二IRS免疫系统生物标志组、第三IRS免疫系统生物标志组和第四IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自G组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自H组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;c)所述第三IRS免疫系统生物标志组由来自I组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且,d)所述第四IRS免疫系统生物标志组由来自J组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。通常,所述第一IRS免疫系统生物标志是PLA2G7表达产物,所述第二IRS免疫系统生物标志是PLAC8表达产物,所述第三IRS免疫系统生物标志是CEACAM4表达产物,且所述第四IRS免疫系统生物标志是LAMP1表达产物。通常,指示物用于确定受试者具有轻度脓毒症或严重脓毒症的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自K组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自L组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。通常,指示物用于确定受试者具有轻度脓毒症或脓毒性休克的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自M组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自N组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。通常,指示物用于确定受试者具有严重脓毒症或脓毒性休克的可能性,且其中从第一IRS免疫系统生物标志组和第二IRS免疫系统生物标志组的每一组中的至少一种IRS免疫系统生物标志确定生物标志值,其中:a)所述第一IRS免疫系统生物标志组由来自O组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成;并且,b)所述第二IRS免疫系统生物标志组由来自P组IRS免疫系统生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性中使用的指示物的设备,所述设备包括电子处理装置,所述电子处理装置:a)确定多个生物标志值,每个生物标志值指示对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度;b)使用所述多个生物标志值的组合确定所述指示物,其中:i)至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。以一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)确定多个生物标志值,每个生物标志值指示对所述生物受试者的至少一种对应的生物标志测量或导出的值;b)使用所述多个生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示所述至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:i)至少两种标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。通常,该方法包括:a)确定多个测量的生物标志值,每个测量的生物标志值是生物受试者的对应的生物标志的测量的值;以及,b)对至少一个测量的生物标志值应用函数确定至少一个导出的生物标志值,所述至少一个导出的生物标志值指示对应的导出的生物标志的值。通常,所述函数包括以下的至少一种:a)将两个生物标志值相乘;b)将两个生物标志值相除;c)将两个生物标志值相加;d)将两个生物标志值相减;e)至少两个生物标志值的加权和;f)至少两个生物标志值的对数和;以及,g)至少两个生物标志值的S型函数。通常,该方法包括确定对应于两个测量的生物标志值的比率的至少一个导出的生物标志值。通常,该方法包括将至少两个生物标志值组合以确定代表所述指示物的指示物值。通常,该方法包括使用组合函数组合至少两个生物标志值,所述组合函数是以下的至少一种:a)加性模型;b)线性模型;c)支持向量机;d)神经网络模型;e)随机森林模型;f)回归模型;g)遗传算法;h)退火算法;i)加权和;j)最邻近模型;以及,k)概率模型。通常,所述至少两个生物标志中的至少一个是导出的生物标志。通常,该方法包括:a)确定第一导出的生物标志值,所述第一导出的生物标志值是第一测量的生物标志值和第二测量的生物标志值的比率;b)确定第二导出的生物标志值,所述第二导出的生物标志值是第三测量的生物标志值和第四测量的生物标志值的比率;以及,c)将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加,以生成指示物值。通常,该方法包括:a)确定指示物值;b)将所述指示物值与至少一个指示物值范围进行比较;以及,c)使用所述比较的结果,以诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后。通常,该方法至少部分地使用电子处理装置来进行。通常,该方法包括,在电子处理装置中:a)接收多个测量的生物标志值,每个测量的生物标志值是生物受试者的对应的生物标志的测量的值;b)对至少一个测量的生物标志值应用函数确定至少一个导出的生物标志值,所述至少一个导出的生物标志值指示对应的导出的生物标志的值;以及,c)将至少一个导出的生物标志值和至少一个其他生物标志值组合,以确定指示物值。通常,该方法包括根据至少一个指示物值生成表示。通常,该方法包括:a)将所述指示物值与至少一个指示物值范围进行比较;以及,b)显示所述比较的结果。通常,该互相关性范围是以下的至少一个:a)±0.8;b)±0.7;c)±0.6;d)±0.5;e)±0.4;f)±0.3;g)±0.2;以及,h)±0.1。通常,每一种生物标志具有在状况相关性范围之外的与至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性,所述状况相关性范围在±0.3之间。通常,该状况相关性范围是以下的至少一个:a)±0.9;b)±0.8;c)±0.7;d)±0.6;e)±0.5;以及,f)±0.4。通常,性能阈值指示以下的至少一个的解释方差:a)0.4;b)0.5;c)0.6;d)0.7;e)0.8;以及,f)0.9。通常,生物标志值指示选自以下的一种或更多种的分子或实体的水平或丰度:a)核酸分子;b)蛋白性分子;c)氨基酸d)碳水化合物;e)脂质;f)类固醇;g)无机分子;h)离子;i)药物;j)化学品;k)代谢物;l)毒素;m)营养物;n)气体;o)细胞;p)致病性生物体;以及,q)非致病生物体。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于确定在诊断生物受试者中至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后中使用的指示物的设备,所述设备包括电子处理装置,所述电子处理装置:a)确定多个生物标志值,每个生物标志值指示对所述生物受试者的至少一种对应的生物标志测量或导出的值;b)使用所述多个生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示所述至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:i)至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的诊断标识,所述诊断标识定义对应于可对所述生物受试者测量或从所述生物受试者导出的生物标志的值的至少两个生物标志值的组合,其中:a)至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,b)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表所述至少两种生物标志的所述组合诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。通常,诊断标识定义被应用于至少一个测量的生物标志值以确定至少一个导出的生物标志值的函数,所述至少一个导出的生物标志值指示对应的导出的生物标志的值。通常,所述函数包括以下的至少一种:a)将两个生物标志值相乘;b)将两个生物标志值相除;c)将两个生物标志值相加;d)将两个生物标志值相减;e)至少两个生物标志值的加权和;f)至少两个生物标志值的对数和;以及,g)至少两个生物标志值的S型函数。通常,至少一个导出的生物标志值对应于两个测量的生物标志值的比率。通常,诊断标识定义至少两个生物标志值的组合,以用于确定代表所述指示物的指示物值。通常,诊断标识定义组合函数,以用于组合至少两个生物标志值,所述组合函数是以下的至少一种:a)加性模型;b)线性模型;c)支持向量机;d)神经网络模型;e)随机森林模型;f)回归模型;g)遗传算法;h)退火算法;以及,i)加权和。通常,所述至少两种生物标志中的至少一种是导出的生物标志。通常,诊断标识定义:a)第一导出的生物标志值,所述第一导出的生物标志值是第一测量的生物标志值和第二测量的生物标志值的比率;b)第二导出的生物标志值,所述第二导出的生物标志值是第三测量的生物标志值和第四测量的生物标志值的比率;以及,c)第一导出的生物标志值和第二导出的生物标志值的组合,以生成指示物值。通常,诊断标识定义至少一个指示物值范围,并且其中使用至少一个指示物值与至少一个指示物值范围的比较诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后。通常,该互相关性范围是以下的至少一个:a)±0.8;b)±0.7;c)±0.6;d)±0.5;e)±0.4;f)±0.3;g)±0.2;以及,h)±0.1。通常,每一种生物标志具有在状况相关性范围之外的与至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性,所述状况相关性范围在±0.3之间。通常,该状况相关性范围是以下的至少一个:a)±0.9;b)±0.8;c)±0.7;d)±0.6;e)±0.5;以及,f)±0.4。通常,性能阈值指示以下的至少一个的解释方差:a)0.4;b)0.5;c)0.6;d)0.7;e)0.8;以及,f)0.9。通常,生物标志值指示选自以下的一种或更多种的分子或实体的水平或丰度:a)核酸分子;b)蛋白性分子;c)氨基酸d)碳水化合物;e)脂质;f)类固醇;g)无机分子;h)离子;i)药物;j)化学品;k)代谢物;l)毒素;m)营养物;n)气体;o)细胞;p)致病性生物体;以及,q)非致病生物体。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供鉴定在诊断标识中使用的生物标志的方法,所述诊断标识被用于在诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后中使用,所述方法包括:a)对于许多候选生物标志,根据每种生物标志区分生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力将所述候选生物标志排序;b)根据所述排序选择至少两种候选生物标志,所述至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的对于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;c)确定所述至少两种候选生物标志的组合的性能值;以及,d)如果所述性能值大于或等于代表所述指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值,根据所述至少两种生物标志的所述组合定义诊断标识,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。通常,该方法包括使用组合函数确定至少两种候选生物标志的组合,所述组合函数是以下的至少一种:a)加性模型;b)线性模型;c)支持向量机;d)神经网络模型;e)随机森林模型;f)回归模型;g)遗传算法;h)退火算法;以及,i)加权和。通常,该方法包括:a)选择下一个组合函数;b)确定通过下一个组合函数确定的至少两种候选生物标志的组合的性能值是否大于或等于性能阈值;以及,c)如果该性能值不大于或等于性能阈值,对于连续的组合函数重复步骤a)和b),。通常,该方法包括:a)选择两种候选生物标志;b)确定两种候选生物标志的组合的性能值是否大于或等于性能阈值;以及,c)如果该性能值不大于或等于性能阈值,则:i)将选择的候选生物标志与至少一种另外的候选生物标志组合;以及,ii)用至少一种另外的候选生物标志重复步骤a)和b)。通常,该方法包括将许多候选生物标志组合直到极限。通常,该方法包括:a)选择排序最高的候选生物标志;b)选择次最高排序的候选生物标志;c)对于选择的候选标志,确定该候选生物标志的互相关性是否在互相关性范围内;以及,d)如果不,重复步骤b)和c),直到具有在互相关性范围内的互相关性的两种候选生物标志被选择。通常,该方法包括:a)定义至少两组候选生物标志,在不同组中的候选生物标志具有在互相关性范围内的互相关性;b)将每一组中的候选生物标志排序;以及,c)从不同组选择候选生物标志。通常,该方法包括:a)使用至少一个个体的参考数据定义指示至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的许多组;以及,b)使用至少一种分析技术鉴定对区分组潜在地有用的许多候选生物标志。通常,该方法包括使用对至少一个个体的参考生物标志测量的参考值来鉴定候选生物标志。通常,该方法包括使用参考值来过滤参照生物标志,以确定候选生物标志。通常,候选生物标志的至少一种是使用函数从至少一种参考生物标志导出的导出的生物标志。通常,该导出的生物标志从过滤的生物标志导出。通常,该方法包括:a)对至少一个参考值应用函数确定至少一个导出的参考生物标志值,该至少一个导出的参考生物标志值指示对应的导出的参考生物标志的值;以及,b)使用该至少一个导出的参考生物标志值确定至少一种候选生物标志。通常,该方法包括:a)使用至少一个个体的参考数据定义指示至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的许多组;以及,b)对于每一组,将至少两个参考生物标志值的范围组合,以确定对于该组的指示物值范围。通常,该互相关性范围是以下的至少一个:a)±0.8;b)±0.7;c)±0.6;d)±0.5;e)±0.4;f)±0.3;g)±0.2;以及,h)±0.1。通常,每一种生物标志具有位于状况相关性范围之外的关于至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性,所述状况相关性范围在±0.3之间。通常,该状况相关性范围是以下的至少一个:a)±0.9;b)±0.8;c)±0.7;d)±0.6;e)±0.5;以及,f)±0.4。通常,性能阈值指示以下的至少一个的解释方差:a)0.4;b)0.5;c)0.6;d)0.7;e)0.8;以及,f)0.9。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于鉴定在诊断标识中使用的标志的设备,所述诊断标识被用于诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后中使用,所述设备包括电子处理装置,所述电子处理装置:a)对于许多候选生物标志,根据每种生物标志区分生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力将所述候选生物标志排序;b)根据所述排序选择至少两种候选生物标志,所述至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的对于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;c)确定所述至少两种候选生物标志的组合的性能值;以及,d)如果所述性能值大于或等于代表所述指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值,根据所述至少两种生物标志的所述组合定义诊断标识,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中inSIRS或健康状况的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自inSIRS和健康状况的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自A组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自B组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中ipSIRS或健康状况的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一个指示物至少部分地指示选自ipSIRS和健康状况的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自C组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自D组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中inSIRS或ipSIRS的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自inSIRS和ipSIRS的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自E组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自F组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中inSIRS或ipSIRS的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自inSIRS和ipSIRS的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少四种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少四种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,其中所述至少四种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述至少四种IRS生物标志的至少另一种选自第三IRS生物标志组,且其中所述至少四种IRS生物标志的至少另一种选自第四IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由选自G组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,其中所述第二IRS生物标志组由选自H组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,其中所述第三IRS生物标志组由来自I组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第四IRS生物标志组由来自J组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,所述第一IRS生物标志是PLA2G7表达产物,所述第二IRS生物标志是PLAC8表达产物,所述第三IRS生物标志是CEACAM4表达产物,且所述第四IRS生物标志是LAMP1表达产物。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中轻度脓毒症或严重脓毒症的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自轻度脓毒症和严重脓毒症的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自K组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自L组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在另一个形式中,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中轻度脓毒症或脓毒性休克的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自轻度脓毒症和脓毒性休克的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一中选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自M组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自N组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种形式,本发明的目的是,提供用于诊断生物受试者中严重脓毒症或脓毒性休克的存在或不存在的方法,所述方法包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自严重脓毒症和脓毒性休克的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;并且,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自O组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自P组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供试剂盒,所述试剂盒包括:(i)允许第一IRS生物标志的定量的试剂;以及(ii)允许第二IRS生物标志的定量的试剂,其中所述第一IRS生物标志和所述第二IRS生物标志具有关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或选自轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克的ipSIRS的阶段的至少一种状况的互相关性,所述至少一种状况位于在±0.9之间的互相关性范围内,且其中对于对生物受试者测量的或由生物受试者导出的所述第一IRS生物标志和所述第二IRS生物标志的各自生物标志值的组合具有大于或等于代表所述第一IRS生物标志和所述第二IRS生物标志的组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在、或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值是至少0.3的解释方差。适当地,该试剂盒还包括:(iii)允许第三IRS生物标志的定量的试剂;以及(ii)允许第四IRS生物标志的定量的试剂,其中所述第三IRS生物标志和所述第四IRS生物标志具有位于在±0.9之间的互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,且其中对于对生物受试者测量的或由生物受试者导出的所述第三IRS生物标志和所述第四IRS生物标志的各自生物标志值的组合具有大于或等于代表所述第三IRS生物标志和所述第四IRS生物标志的组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在、或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值是至少0.3的解释方差。适当地,该试剂盒用于诊断inSIRS或健康状况的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,且其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自A组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自B组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,该试剂盒用于诊断ipSIRS或健康状况的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,且其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自C组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自D组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,该试剂盒用于诊断inSIRS或ipSIRS的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,且其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自E组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自F组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,该试剂盒用于诊断inSIRS或ipSIRS的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第三IRS生物标志选自第三IRS生物标志组,且其中所述第四IRS生物标志选自第四IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自G组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,其中所述第二IRS生物标志组由来自H组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,其中所述第三IRS生物标志组由来自I组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第四IRS生物标志组由来自J组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,所述第一IRS生物标志是PLA2G7表达产物,所述第二IRS生物标志是PLAC8表达产物,所述第三IRS生物标志是CEACAM4表达产物,且所述第四IRS生物标志是LAMP1表达产物。适当地,该试剂盒用于诊断轻度脓毒症或严重脓毒症的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,且其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自K组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自L组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,该试剂盒用于诊断轻度脓毒症或脓毒性休克的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,且其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自M组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自N组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。适当地,该试剂盒用于诊断严重脓毒症或脓毒性休克的存在或不存在,其中所述第一IRS生物标志选自第一IRS生物标志组,且其中所述第二IRS生物标志选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自O组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自P组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供用于治疗、预防或抑制受试者中选自inSIRS、ipSIRS或者ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症或脓毒性休克)的至少一种状况的发展的方法,所述方法包括(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定指示物,所述指示物至少部分地指示所述至少一种状况的存在、不存在或程度,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于在互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(c)基于所述指示物指示inSIRS的存在,向所述受试者施用有效量的治疗或改善inSIRS的症状或逆转或抑制inSIRS的发展的试剂,或者基于所述指示物指示ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的存在,向所述受试者施用有效量的治疗或改善ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的症状或逆转或抑制ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的发展的试剂。适当地,该方法还包括:(1)确定多个测量的IRS生物标志值,每个测量的IRS生物标志值是所述生物受试者的IRS生物标志的测量的值;以及(2)对所述测量的IRS生物标志值的至少一个应用函数以确定至少一个导出的IRS生物标志值,所述至少一个导出的IRS生物标志值指示对应的导出的IRS生物标志的值。通常,该函数包括以下的至少一种:(a)将两个IRS生物标志值相乘;(b)将两个IRS生物标志值相除;(c)将两个IRS生物标志值相加;(d)将两个IRS生物标志值相减;(e)至少两个IRS生物标志值的加权和;(f)至少两个IRS生物标志值的对数和;以及,(g)至少两个IRS生物标志值的S型函数。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供监测特定治疗方案在受试者朝向期望的健康状态中的效力的方法,所述方法包括:a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示在用治疗方案治疗之后对生物受试者的至少一个IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定指示物,所述指示物至少部分地指示所述选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的存在、不存在或程度,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(c)基于所述指示物指示健康状况的存在,或相对于在用所述治疗方案治疗之前所述受试者中状况的程度,较低程度的所述状况的存在,确定所述治疗方案对将所述受试者的所述健康状态改变为期望的健康状态有效。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供将生物标志标识与对选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的状况的有效治疗方案关联的方法,所述方法包括:(a)确定生物标志标识,所述生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个IRS生物标志值的组合,所述至少两个IRS生物标志的值可对具有所述状况且有效治疗已被鉴定的生物受试者测量或由具有所述状况且有效治疗已被鉴定的生物受试者导出并,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述状况的存在、不存在或程度或者提供所述状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(b)将如此确定的生物标志标识与对于所述状况的有效治疗方案关联。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供确定治疗方案对治疗具有选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的状况的受试者是否有效的方法,所述方法包括:(a)确定多个治疗后IRS生物标志值,每个治疗后IRS生物标志值指示在用所述治疗方案治疗之后对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个治疗后IRS生物标志值的组合确定治疗后指示物,所述治疗后指示物至少部分地指示选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的存在、不存在或程度,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)所述治疗后指示物具有大于或等于代表所述治疗后指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述治疗后指示物基于以下指示所述治疗方案对治疗所述受试者中的所述状况是否有效:所述治疗后指示物指示健康状况的存在,或相对于在用所述治疗方案治疗之前所述受试者中的状况的程度,较低程度的所述状况的存在。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供将生物标志标识与对治疗方案的正响应或负响应或副作用关联的方法,所述方法包括:(a)确定生物标志标识,所述生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个IRS生物标志值的组合,所述至少两种IRS生物标志的值可在开始所述治疗方案之后对生物受试者测量或由生物受试者导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(b)将如此确定的生物标志标识与对所述治疗方案是正响应或负响应关联。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供确定具有选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的状况的受试者对治疗方案的正响应或负响应和\/或对治疗方案的副作用的方法,所述方法包括:(a)将参考生物标志标识与对所述治疗方案的正响应或负响应或副作用关联,其中所述生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个IRS生物标志值的组合,所述至少两种IRS生物标志的值对对照生物受试者或对照组测量或由对照生物受试者或对照组导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;(b)确定样品生物标志标识,所述样品生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个IRS生物标志值的组合,所述至少两种IRS生物标志的值在开始所述治疗方案之后对生物受试者测量或由生物受试者导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;其中所述样品生物标志标识基于以下指示所述受试者是否正响应或负响应于所述治疗方案和\/或是否发展来自所述治疗方案的副作用:所述参考生物标志标识与对所述治疗方案的正响应或负响应的相关性。以另一种广泛的形式,本发明的目的是,提供确定生物受试者对治疗方案的正响应或负响应和\/或对治疗方案的副作用的方法,所述方法包括:(a)确定样品生物标志标识,所述样品生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个IRS生物标志值的组合,所述至少两个IRS生物标志的值在开始所述治疗方案之后对生物受试者测量或由生物受试者导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述样品生物标志标识与对所述治疗方案的正响应或负响应和\/或来自所述治疗方案的副作用相关;以及(b)基于所述样品生物标志标识确定所述受试者是否正响应或负响应于所述治疗方案和\/或发展来自所述治疗方案的副作用。附图简述本发明的实例现将参考附图来描述,其中:-图1A是用于导出用于在生物受试者中诊断至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供至少一种状况的预后中使用的指示物的方法的实例的流程图;图1B是用于鉴定用于在生物标志标识中使用的生物标志的方法的实例的流程图;图2是分布式计算机体系结构的实例的示意图;图3是图2的处理系统的实例的示意图;图4是图2的计算机系统的实例的示意图;图5是用于鉴定用于在生物标志标识中使用的生物标志的方法的具体实例的流程图;图6A是用于选择候选生物标志的方法的第一实例的流程图;图6B是用于选择候选生物标志的方法的第二实例的流程图;图7是用于在生物受试者中诊断至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供至少一种状况的预后中使用的方法的第二实例的流程图;图8A是941种mRNA生物标志针对用于区分健康状况和手术后炎症(PS)(本文还称为“感染阴性SIRS”(inSIRS))的AUC的图,单独生物标志具有大于0.7的AUC;图8B是显示用于分离健康状况和PS的最佳mRNA生物标志的箱须图(BoxandWhiskerplots);图8C是AUC对于1000种导出的生物标志在分离健康状况和PS中的诊断能力的图,所有导出的生物标志具有1.0的AUC;图8D是基于AUC,用于分离健康状况和PS的最佳表现的导出的生物标志的箱须图;图8E和8F是显示每个组中的生物标志彼此相关的两幅图;图8G和8H是显示每个组(第1组和第2组)中的生物标志的AUC的两幅图;图8I是显示当生物标志从第1组和第2组导出时获得较大整体AUC的箱须图;图9A是941种mRNA生物标志针对用于区分健康状况和脓毒症(本文还称为“感染阳性SIRS”(ipSIRS))的AUC的图,所有单独生物标志具有大于0.7的AUC;图9B是显示用于分离健康状况和脓毒症的最佳mRNA生物标志的箱须图;图9C是AUC对于1000种导出的生物标志在分离健康状况和脓毒症中的诊断能力的图,所有导出的生物标志具有1.0的AUC;图9D是基于AUC,用于分离健康状况和脓毒症的最佳表现的导出的生物标志的箱须图;图9E和9F示出了每个组彼此相关的生物标志组彼此的相关;图9G和9H是显示每个组(第1桶组(bucketgroups)和第2桶组)中的生物标志的AUC的两幅图;图9I是显示当生物标志从第1桶组和第2桶组导出时获得较大整体AUC的箱须图;图10A是359种mRNA生物标志针对用于区分PS和脓毒症的AUC的图,所有单独生物标志具有大于0.7的AUC;图10B是显示用于分离PS和脓毒症的最佳mRNA生物标志的箱须图;图10C是AUC对于1000种导出的生物标志在分离PS和脓毒症中的诊断能力的图,所有导出的生物标志具有0.9的AUC;图10D是用于分离PS和脓毒症的最佳导出的生物标志的箱须图;图10E是显示每个桶组中的生物标志与状况的相关性的图;图10F是显示当生物标志从第1桶组和第2桶组导出时获得较大整体AUC的箱须图;图10G是显示四个桶组的每个中的生物标志的AUC的图;图10H是显示当生物标志从四个桶组的每个导出时获得较大整体AUC的箱须图;图11A是66种mRNA生物标志针对用于区分轻度脓毒症和严重脓毒症的AUC的图,选择的所有单独生物标志具有大于0.7的AUC;图11B是显示用于分离轻度脓毒症和严重脓毒症的最佳mRNA生物标志的箱须图;图11C是AUC对于1000种导出的生物标志在分离轻度脓毒症和严重脓毒症中的诊断能力的图,所有导出的生物标志具有至少0.87的AUC;图11D是基于AUC,用于分离轻度脓毒症和严重脓毒症的最佳表现的导出的生物标志的箱须图;图11E和11F是显示每个组中的生物标志彼此的相关的图;图11G和11H是显示每个组中的生物标志的AUC的图;图11I是显示当生物标志从第1组和第2组导出时获得较大整体AUC的箱须图;图12A是48种mRNA生物标志针对用于区分轻度脓毒症和脓毒性休克(本文还称为“感染阳性SIRS-休克”(ipSIRS-休克))的AUC的图,所有单独生物标志具有大于0.7的AUC;图12B是显示用于分离轻度脓毒症和脓毒性休克的最佳mRNA生物标志的箱须图;图12C是AUC对于1000种导出的生物标志在分离轻度脓毒症和脓毒性休克中的诊断能力的图,所有导出的生物标志具有至少0.793的AUC;图12D是基于AUC,用于分离轻度脓毒症和脓毒性休克的最佳表现的导出的生物标志的箱须图;图12E和12F是显示每个组中的生物标志彼此相关的图;图12G和12H是显示每个组中的生物标志的AUC的图;图12I是显示当生物标志从第1组和第2组导出时获得较大整体AUC的箱须图;图13A是61种mRNA生物标志针对用于区分严重脓毒症和脓毒性休克的AUC的图,选择的所有单独生物标志具有大于0.7的AUC;图13B是显示用于分离严重脓毒症和脓毒性休克的最佳mRNA生物标志的箱须图;图13C是AUC对于1000种导出的生物标志在分离严重脓毒症和脓毒性休克中的诊断能力的图,所有导出的生物标志具有至少0.821的AUC;图13D是基于AUC,用于分离轻度脓毒症和脓毒性休克的最佳表现的导出的生物标志的箱须图;图13E和13F是显示每个组中的生物标志彼此的相关的图;图13G和13H是显示每个组中的生物标志的AUC的图;图13I是显示当生物标志从第1组和第2组导出时获得较大整体AUC的箱须图;图14是显示热循环仪方案的实例的用户界面;图15是报告的实例的图示;图16A至16L是用于区分健康状况和PS的前十二个生物标志组合的箱须图;图17A至17L是用于区分健康状况和脓毒症的前十二个生物标志组合的箱须图;图18A至18L是用于区分PS和脓毒症的前十二个生物标志组合的箱须图;图19A至19L是用于区分脓毒症和严重脓毒症的前十二个生物标志组合的箱须图;图20A至20L是用于区分严重脓毒症和脓毒性休克的前十二个生物标志组合的箱须图;图21A至21L是用于区分脓毒症和脓毒性休克的前十二个生物标志组合的箱须图;图22是将生物标志与生物标志标识相加对AUC的效应的图;图23是显示生物标志标识为两个患者群体区分PS和脓毒症的能力的实例的图;图24是用于确定指示物参考的方法的实例的流程图;图25A和25B是用于验证由生物标志测量值导出的指示物的方法的实例的流程图;图26是显示指示物值与指示物参考的比较的实例;以及,图27A和27B是指示物值的示例性表示。优选实施方案详述现将参考图1A描述,用于确定在诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在或程度或诊断生物受试者的至少一种状况的存在、不存在或程度,或者在监测受试者中至少一种状况的进展或监测受试者的至少一种状况的进展,或者在预后受试者中至少一种状况或预后受试者的至少一种状况中使用的指示物的方法的实例。出于解释的目的,将使用一些不同的术语。例如,术语“生物标志”指可被用作生物状态的指示物的可测量的参数,或参数的组合,并且包括,但不限于,蛋白、核酸、碳水化合物、脂质、代谢物、气体、类固醇、离子、营养物、毒素、细胞、致病性生物体、非致病性生物体、有机化合物以及无机化合物。生物标志还包括非血源性(non-blood-borne)因子、健康状态的非分析物生理学标志或者并非从样品(例如,生物样品诸如体液)测量的其他因子或生物标志,诸如“临床”参数或“表型”参数,包括,但不限于,年龄、种族、性别、物种、品种、遗传信息、白细胞计数、舒张压和收缩压、骨密度、身高、体重、腰围和臀围、身体质量指数、以及其他诸如I型或II型糖尿病或妊娠期糖尿病(本文统称为糖尿病)、静息心率(restingheartrate)、稳态模式评估(homeostaticmodelassessment)(HOMA)、HOMA胰岛素耐受性(HOMA-IR)、静脉葡萄糖耐受性(SI(IVGT))、静息心率(restingheartrate)、β细胞功能、大血管功能、微血管功能、致动脉粥样硬化指数、低密度脂蛋白\/高密度脂蛋白的比率、内膜中层厚度、体温、序贯性器官衰竭估计(SequentialOrganFailureAssessment)(SOFA)等。“生物标志”还可包括“免疫应答生物标志”,其将在下面更详细地描述。术语“生物标志值”指对生物受试者的至少一种对应的生物标志测量或导出的并通常至少部分地指示在从受试者采集的样品中的免疫系统生物标志的浓度的值。因此,生物标志值可以是测量的生物标志值,其是对受试者测量的生物标志的值,或者可选地可以是导出的生物标志值,其是已从一个或更多个测量的生物标志值导出的值,例如,通过对一个或更多个测量的生物标志值应用函数。生物标志值可依据该值被确定的方式呈任何适当的形式。例如,生物标志值可使用高通量技术,诸如质谱法、测序平台、阵列和杂交平台、免疫测定、流式细胞术、或此类技术的任何组合来确定,并在一个优选的实例中,生物标志值涉及使用技术诸如PCR、测序等来定量的表达产物或其他可测量分子的活性或丰度的水平。在这种情况下,生物标志值可呈扩增量或循环时间的形式,这是生物标志在样品内的浓度的对数表示,如本领域技术人员将理解的并如将在下面更详细描述的。术语“参考生物标志”用来指对具有一种或更多种状况、一种或更多种状况的阶段、一种或更多种状况的亚型或具有不同预后的一个或更多个个体的样品群体已定量其的活性的生物标志。术语“参考数据”指对样品群体中一个或更多个个体测量的数据,并且可包括对每个个体测量的生物标志的水平或活性的定量,关于个体的任何状况的信息,以及任选地感兴趣的任何其他信息。术语“候选生物标志”指参考生物标志的子集,其已被鉴定为潜在地可用于区分个体的不同组,诸如患有不同状况或具有不同阶段或预后的个体。候选生物标志的数目将不同,但通常是约200个。术语“标识生物标志”用来指已被鉴定用于在生物标志标识中使用的候选生物标志的子集,所述生物标志标识可用于进行临床评估,诸如划入(rulein)或排除特定状况、状况的不同阶段或严重程度、不同状况的亚型或不同预后。标识生物标志的数目将不同,但通常为10或更小的量级。术语“生物标志标识”意指对应于可对一个或更多个生物受试者测量或从一个或更多个生物受试者导出的生物标志的值的至少两个生物标志值的组合,该组合是独立的状况、状况的阶段、状况的亚型或对于独立的状况、状况的阶段、状况的亚型的预后特征性的。术语“生物受试者”、“受试者”、“个体”和“患者”在本文可互换使用,指动物受试者,特别是脊椎动物受试者,且甚至更特别是哺乳动物受试者。落入本发明的范围内的适合的脊椎动物包括,但不限于,脊索动物门(Chordata),脊椎动物亚门(vertebrata)的任何成员,包括灵长类动物,啮齿类动物(例如,小鼠、大鼠、豚鼠),兔类动物(例如,兔、野兔),牛科动物(例如,家牛),似绵羊的(ovines)(例如,绵羊),如山羊的(caprines)(例如,山羊),像猪的(porcines)(例如,猪),似马的(equines)(例如,马),犬科动物(例如,狗),猫科动物(例如,猫),鸟类(例如,鸡,火鸡、鸭、鹅、伴侣鸟类,诸如金丝雀、虎皮鹦鹉等),海洋哺乳动物(例如,海豚、鲸),爬行动物(蛇、青蛙、蜥蜴等)和鱼。优选的受试者是灵长类动物(例如,人、猿、猴子、黑猩猩)。如本文所用,术语SIRS(“全身炎症反应综合征”)指起因于具有以下可测量的临床特征中的两个或更多个的非特异性损伤的临床反应;体温大于38℃或低于36℃、心率大于每分钟90次心跳、呼吸率大于每分钟20、白血细胞计数(总白细胞)大于12,000\/mm3或小于4,000\/mm3、或带状核嗜中性粒细胞(bandneutrophil)百分比大于10%。从免疫学角度,它可被视为代表对损伤(例如,大手术)或全身性炎症的全身反应。如本文所用,“inSIRS”(这在其范围内包括“手术后”(PS)炎症)包括以上提及的临床反应,但缺乏全身感染过程。相比之下,“ipSIRS”(本文还称为“脓毒症”)包括以上提及的临床反应,但存在假定或证实的感染。感染的证实可使用微生物培养或感染因子的分离来确定。从免疫学角度,ipSIRS可视为对不论其是局部、外围或全身感染的微生物的全身反应。如本文所用,术语状况的“程度”指状况的严重性、严重程度、阶段或状态。例如,状况可被表征为轻度、中度或严重。本领域技术人员将能够确定或评估特定状况的程度。例如,状况的程度可通过将具有状况的受试者的存活的可能性或长度与在具有相同状况的其他受试者中的存活的可能性或长度进行比较来确定。在其他实施方案中,状况的程度可通过将具有状况的受试者的临床体征与在具有相同状况的其他受试者中的临床体征的程度进行比较来确定。应该理解,使用以上描述的术语和相关定义仅为了解释的目的并不意图限制。在该实例中,该方法包括在步骤100确定多个生物标志值,每个生物标志值指示对所述生物受试者的至少一种生物标志测量或导出的值。生物标志值和对应于该生物标志值的生物标志可呈任何适当的形式,并且特别地可涉及对其可定量值的受试者的任何属性。该技术特别适合于高通量技术,诸如质谱法、测序平台、阵列和杂交平台、或此类技术的任何组合,并在一个优选的实例中,生物标志值涉及表达产物或其他可测量分子的活性或丰度的水平。生物标志值可以是测量的生物标志值,其是对受试者测量的生物标志的值,或者可选地可以是导出的生物标志值,其是已从一个或更多个测量的生物标志值导出的值,例如,通过对一个或更多个测量的生物标志值应用函数。如本文所用,已将函数应用于其的生物标志被称为“导出的标志”。生物标志值可以以许多方式中的任一种来确定。在一个实例中,确定生物标志值的过程可包括,例如通过对生物受试者进行测试来测量生物标志值。然而,更通常地,确定生物标志值的步骤包括使电子处理装置接收或以其他方式获得先前已测量或导出的生物标志值。这可包括,例如,从数据存储诸如远程数据库检索生物标志值,获得已使用输入装置等手动输入的生物标志值。在步骤100,指示物使用多个生物标志值的组合来确定,所述指示物至少部分地指示所述至少一种状况的存在、不存在、程度或预后。生物标志值可以以许多方式中的任一种来组合,并且这可包括,例如,将生物标志值相加、相乘、相减或相除,以确定指示物值。该步骤被进行,使得多个生物标志值可被组合成单指示物值,提供更有用和直接的机制,用于允许解释指示物,并因此在诊断受试者中至少一种状况的存在、不存在或程度,或者在预后受试者中的至少一种状况中使用。假设该方法使用电子处理装置来进行,在步骤120,指示物的指示任选地展示或以其他方式提供至用户。在这方面,指示可以是指示物值的图形表示或字母数字表示。然而,可选地,指示可以是指示物值与预定义阈值或范围的比较的结果,或者可选地可以是使用指示物导出的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的指示。为了确保有效的诊断或预后可被确定,至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间。这种要求意味着,当在被诊断或预后的状况的背景中被考虑时,两种生物标志关于彼此不完全相关。换言之,组合中的生物标志的至少两种随着状况变化差异地应答,这显著增加它们当组合时区分至少两种状况,诊断至少一种状况的存在、不存在或程度,和\/或提供生物受试者中至少状况的预后或生物受试者的至少一种状况的预后的能力。如本文所用,“和\/或”指并包括相关的列出的项目的一个或更多个的任何和所有可能的组合,以及当以替代方案(或)解释时缺乏组合。通常,生物标志具有低互相关性的要求意味着,该生物标志可涉及不同的生物属性或结构域诸如但不限于不同的分子功能、不同的生物进程以及不同的细胞组分。分子功能的说明性实例包括将以下部分中的一个或更多个添加至蛋白、多肽、肽、核酸(例如,DNA、RNA)或从蛋白、多肽、肽、核酸(例如,DNA、RNA)去除以下部分中的一个或更多个:直链的、支链的、饱和的或不饱和的烃基(例如,C1-C24烃基);磷酸;泛素;酰基;脂肪酸,脂质,磷脂;核苷酸碱基;羟基等。分子功能还包括信号通路,包括但不限于,受体信号通路及核信号通路。分子功能的非限制性实例还包括在一个或更多个位点处的核酸、肽、多肽或蛋白的裂解;核酸、肽、多肽或蛋白的聚合;易位通过细胞膜(例如,外细胞膜;核膜);易位进入或离开细胞器(例如,高尔基体、溶酶体、内质网、核、线粒体);受体结合、受体信号传导、膜通道结合、膜通道流入或流出等。生物进程的说明性实例包括:细胞周期的阶段诸如减数分裂、有丝分裂、细胞分裂、前期、中期、后期、末期和间期、细胞分化的阶段;细胞凋亡;坏死;趋化作用;免疫应答包括适应性和先天性免疫应答、促炎免疫应答、自身免疫应答、致耐受性应答等。生物进程的其他说明性实例包括生成或分解腺苷三磷酸(ATP)、糖类、多糖、脂肪酸、脂质、磷脂、鞘脂、糖脂、胆固醇、核苷酸、核酸、膜(例如,细胞质膜、核膜)、氨基酸、肽、多肽、蛋白等。细胞组分的代表性实例包括如例如以上指出的细胞器、膜、及其他。应该理解,具有不同的生物属性或结构域的生物标志的使用相比于如果生物标志涉及相同或共同的生物属性或结构域提供更进一步的信息。在这方面,应该理解,如果至少两种生物标志彼此高度相关,相比于生物标志的单一一个的使用,两种生物标志的使用将几乎不增加诊断\/预后的改进。因此,该方法使用彼此不良好相关的生物标志,从而确保,该方法中的每种生物标志的包含显著增加指示物的区分能力。尽管这样,为了确保指示物可准确用于进行区分至少两种状况或诊断至少一种状况的存在、不存在或程度或者至少一种状况的预后,指示物具有大于或等于性能阈值的性能值。性能阈值可以是任何适合的形式,但通常将指示至少0.3的解释方差,或另一种性能量度的等效值。已发现,利用具有在±0.9之间的互相关性的生物标志的组合以及使用在提供至少0.3的解释方差的组合中的这些,这允许定义适合于确保准确区分的指示物,诊断或预后可被获得,同时将要求的生物标志的数目最小化。应该理解,在该上下文中,在以上描述的方法内使用的生物标志可定义用于至少一种状况的生物标志标识,这包括最小数目的生物标志,同时保持足够性能以允许生物标志标识被用于做出临床相关的诊断、预后或区分。使用的生物标志的数目最小化使与进行诊断或预后测试相关的成本最小化,并且在核酸表达产物的情况下,允许测试利用相对直接的技术诸如核酸阵列以及聚合酶链式反应(PCR)过程等进行,允许测试在临床环境中迅速进行。此外,产生单一指示物值允许测试的结果被临床医师或其他医学从业者容易地解释,使得测试可被用于在临床环境中可靠诊断。用于生成用于在图1A的方法中使用的适合的生物标志标识的过程的实例现将参考图1B来描述。特别地,通常,通过分析大量生物标志并然后选择满足以上描述的标准的生物标志的组合来生成生物标志标识。在该实例中,在步骤150,该过程包括将许多候选生物标志根据每种生物标志区分生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力排序。候选生物标志可以以任何适当的方式获得,但通常这将包括获得参考数据,所述参考数据包括与对具有感兴趣的一种或更多种状况的不同的存在、不存在、程度或预后的一个或更多个参考个体已测量或导出的许多参考生物标志相关的参考生物标志值。因此,应该理解,候选生物标志可包括测量的和\/或导出的生物标志,如将在下面更详细地描述的。参考数据通常包括多个参考生物标志的测量值,该测量值包括关于任何表达产物或可测量的分子的活性的信息,诸如水平、丰度或功能活性,如将在下面更详细地描述的。参考数据还可包括关于每个个体患有的一种或更多种状况的信息诸如临床数据。这可包括关于状况的存在、不存在、程度或进展的信息,表型信息,诸如表型性状的细节,遗传信息或遗传调节的信息,氨基酸或核苷酸相关的基因组学信息,其他测试包括成像、生物化学测定和血液学测定的结果,其他生理评分诸如SOFA(序惯性脏器衰竭估计)评分等,且这不意图限制,如从下面的描述将明显的。取决于优选的实施,候选生物标志可包括一些或所有的参考生物标志。因此,例如,参考生物标志值可被分析以确定该参考生物标志和至少一种状况之间的相关性,其中该参考生物标志被粗过滤以去除具有低相关性的那些,例如具有低于0.3的与状况的相关性的那些。在步骤160,至少两种候选生物标志基于排序和互相关性来选择。特别地,具有在±0.9的互相关性范围内的互相关性的至少两种候选生物标志被选择。因此,当在一种或更多种状况的上下文中考虑时,该过程排除了高度互相关性,并且其因此将不显著增加区分至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的任何生物标志。在步骤170,选择的候选生物标志的组合的性能值被确定。如以上提及的,组合可以是候选生物标志值的任何组合,诸如候选生物标志值的加法、减法、乘法或除法,且因此这将不再进行更进一步详细描述。在步骤180,确定组合的性能值是否超过性能阈值,该性能阈值等于至少0.3的解释方差。如果是这样,候选生物标志的组合可被用来定义生物标志标识。否则,前面的步骤可被重复,例如通过确定候选生物标志的可选择的组合,选择不同的候选生物标志,或增加另外的候选生物标志,如将在下面更详细地描述的。在这方面,应该理解,其他措施可被使用,并且对至少0.3的解释方差的提及意图是特定实例,用于说明性目的。因此,以上描述的方法可被用来选择候选生物标志的组合,所述候选生物标志适合于用作在生物标志标识中的标识生物标志,用于例如使用以上图1A的方法诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后。在一个实例中,这通过确保使用的生物标志的至少两种不高度互相关性来实现,从而确保这些生物标志的每种有助于所得标识的性能。现将描述许多更进一步的特征。在一个实例中,该方法包括确定多个测量的生物标志值,每个测量的生物标志值是生物受试者的对应的生物标志的测量的值,以及对测量的生物标志值的至少一个应用函数确定至少一个导出的生物标志值,所述至少一个导出的生物标志值指示对应的导出的生物标志的值。使用的函数将因此取决于优选的实施而变化。在一个实例中,函数包括以下的至少一个:将两个生物标志值相乘;将两个生物标志值相除;将两个生物标志值相加;将两个生物标志值相减;至少两个生物标志值的加权和;至少两个生物标志值的对数和;以及,至少两个生物标志值的S型函数。更具体地,函数是两个生物标志值的除法,使得导出的生物标志值对应于两个测量的生物标志值的比率。存在为什么该比可能是优选的许多原因。例如,比的使用是自归一化的(self-normalizing),意味着测量技术中的偏差将自动被调节。例如,如果样品的输入浓度加倍,生物标志的相对比例将保持不变。结果,函数的类型因此具有对一系列输入浓度稳定的分布曲线(profile),这是重要的,因为输入浓度是表达数据的已知变量。另外,许多生物标志是生物化学通路上的节点,所以生物标志的比率给出关于一个生物通路对另一个的相对活化的信息,这是系统内生物变化的自然表示。最后,比率通常容易被解释。该方法通常包括将至少两个生物标志值组合以确定代表指示物的指示物值。这通常通过使用组合函数组合至少两个生物标志值来实现,所述组合函数诸如:加性模型;线性模型;支持向量机;神经网络模型;随机森林模型;回归模型;遗传算法;退火算法;以及加权和。在一个实例中,至少两种生物标志中的至少一种是导出的生物标志,并且在一个优选的实例中,组合函数为是比率的导出的生物标志值的加法,在该情况下该方法包括从第一测量的生物标志值和第二测量的生物标志值和第三测量的生物标志值以及第四测量的生物标志值的比率确定第一导出的生物标志值和第二导出的生物标志值,并然后将该第一导出的生物标志值和第二导出的生物标志值相加以生成指示物值。在一个实例中,该方法包括确定指示物值,将该指示物值与至少一个指示物值范围进行比较,并在诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后中使用该比较的结果。以上描述的过程通常使用电子处理装置来进行,所述电子处理装置形成处理系统诸如计算机系统等的一部分。在这种情况下,该方法通常包括使电子处理装置接收多个测量的生物标志值,对该测量的生物标志值的至少一个应用函数,以确定至少一个导出的生物标志值,并将至少一个导出的生物标志值与至少一个其他生物标志值组合,以确定指示物值。电子处理装置然后可根据至少一个指示物值生成表示,例如通过展示指示物值的数字指示。然而,更通常地,电子处理装置将指示物值与至少一个指示物值范围进行比较,并展示该比较的结果。这可被用来将指示物与代表一种或更多种状况的特定阶段、进展或预后的定义的范围进行比较,允许指示待展示的各自阶段、进展或预后。该互相关性范围通常是以下的至少一个:±0.8;±0.7;±0.6;±0.5;±0.4;±0.3;±0.2;以及±0.1。在这方面,应该理解,使用的互相关性范围越小,生物标志将越不太相关,并因此这些在区分一种或更多种状况的特定阶段、进展或预后中将越有用。通常,还使用与状况具有至少最小相关性的生物标志。在一个实例中,每一种生物标志具有位于状况相关性范围之外的与至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性,所述状况相关性范围在±0.3之间。然而,应该理解,范围越大,生物标志和状况之间的相关性越大,并因此这将在进行诊断中越有用。因此,该状况相关性更通常是以下的一个:±0.9;±0.8;±0.7;±0.6;±0.5;以及±0.4。此外,应该理解,指示物的性能越大,指示物在进行诊断中用途将越大。因此,性能阈值通常指示以下的至少一个的解释方差:0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;以及0.9。如以上描述的,生物标志值可以是任何适合的形式。然而,该技术特别适合于指示选自以下的一种或更多种的分子的水平或丰度的生物标志值:核酸分子;蛋白性分子;氨基酸;碳水化合物;脂质;类固醇;无机分子;离子;药物;化学品;代谢物;毒素;营养物;气体;细胞;致病性生物体;以及非致病性生物体。当确定用于在生物标志标识中使用的生物标志时,该方法通常包括选择组合函数,确定通过该组合函数确定的至少两种候选生物标志的组合的性能值是否大于或等于性能阈值,以及如果性能值不大于或等于性能阈值,则对于连续的不同的组合函数重复这些步骤。因此,这允许许多不同的组合函数被连续尝试,允许最佳组合函数被鉴定。该方法通常还包括选择两种候选生物标志,确定该两种候选生物标志的组合的性能值是否大于或等于性能阈值,且如果不,在以至少一种另外的候选生物标志重复这些步骤之前,将选择的候选生物标志与至少一种另外的候选生物标志组合。这允许在两种生物标志是不足够的情形中使用大量生物标志,并且以组合使用的递增数目的候选生物标志,这可被重复,且与性能阈值进行比较,直到达到要求的性能,或直到达到候选生物标志的定义的数目极限。为了确保当选择候选生物标志时满足要求的互相关性,该方法通常包括选择最高和次最高排序的候选生物标志,对于选择的候选生物标志,确定该候选生物标志的互相关性是否在互相关性范围内,且如果不,重复这些步骤直到具有在互相关性范围内的互相关性的两种候选生物标志被选择。然而,可选地,这可通过定义至少两组的候选生物标志来实现,在不同组中的候选生物标志具有在互相关性范围内的互相关性,将每个组中的候选生物标志排序,并从不同的组选择候选生物标志。通常,候选生物标志通过以下来确定:使用至少一个个体的参考数据以定义指示至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的许多组,并然后使用至少一种分析技术鉴定对区分这些组潜在有用的许多候选生物标志。这些组还可被用来建立至少两个参考生物标志值的范围,以确定对于该组的指示物值范围。在一个实例中,对至少一个个体的参考生物标志测量的参考值然后可被用来鉴定候选生物标志,例如通过基于每种生物标志与状况的相关性过滤参考生物标志,以确定候选生物标志。在一个实例中,过程由操作作为分布式体系结构的一部分的一个或更多个处理系统来进行,其实例现将参考图2来描述。在该实例中,排列包括经由一个或更多个通信网络,诸如因特网202和\/或许多局域网(LAN)204相互连接的许多处理系统201和计算机系统203。应该理解,网络202、204的配置是仅出于示例的目的,且在实践中,处理系统和计算机系统201、203可经由任何适当的机制通信,诸如经由有线或无线连接,包括,但不限于移动网络,专用网络,诸如802.11网络、因特网、LAN、WAN等,以及经由直接或点对点的连接,诸如蓝牙等。单独的术语“处理系统”和“计算机系统”的使用是出于说明性目的,并使得能够区别不同的装置,任选地具有不同的功能的装置。例如,处理系统和计算机系统201、203可分别表示服务器和客户端,如将从以下描述中变得明显的。然而,这并不意图是限制性的,且在实践中可使用任何适合的计算机网络体系结构。适合的处理系统201的实例示于图3。在该实例中,处理系统201包括电子处理装置,诸如至少一个微处理器300,存储器301,任选的输入\/输出装置302,诸如键盘和\/或显示器,以及外部接口303,如所示的经由总线304相互连接。在该实例中,外部接口303可用于将处理系统201连接至外围装置,诸如通信网络202、204、数据库211、其他储存装置等。尽管单个外部接口303被示出,这是仅出于示例的目的,并且在实践中可提供使用多种方法(例如,以太网、串行、USB、无线等)的多个接口。在使用时,微处理器300执行以储存于存储器301中的应用软件的形式的指令,以进行要求的进程,诸如与其他处理系统或计算机系统201、203通信。因此,由处理系统201进行的动作由处理器300进行,该动作根据在存储器301中作为应用软件储存的指令和\/或经由I\/O装置302接收的输入命令,或从其他处理系统或计算机系统201、203接收的命令。应用软件可包括一个或更多个软件模块,并且可在适合的执行环境,诸如操作系统环境等中来执行。因此,应该理解,处理系统201可由任何适合的处理系统,诸如适当编程的计算机系统、PC、网页服务器、网络服务器等形成。在一个特定实例中,处理系统201是标准的处理系统,诸如基于32位或64位英特尔体系架构的处理系统,其执行储存在非易失性的(例如,硬盘)存储上的软件应用程序,尽管这不是必不可少的。然而,还应该理解,处理系统可以是或可包括任何电子处理装置,诸如微处理器,微芯片处理器,逻辑门配置,任选与执行逻辑诸如FPGA(现场可编程门阵列)相关的固件,或任何其他电子装置、系统或布置。如图4中所示,在一个实例中,计算机系统203包括电子处理装置,诸如至少一个微处理器400,存储器401,输入\/输出装置402,诸如键盘和\/或显示器,以及外部接口403,如所示的经由总线404相互连接。在该实例中,外部接口403可用于将计算机系统203连接至外围装置,诸如通信网络202、204、数据库、其他储存装置等。尽管单个外部接口403被示出,这是仅出于示例的目的,并且在实践中可提供使用多种方法(例如,以太网、串行、USB、无线等)的多个接口。在使用时,微处理器400执行以储存于存储器401中的应用软件的形式的指令,以进行要求的进程,例如,允许与其他处理系统或计算机系统201、203通信。因此,由处理系统203进行的动作由处理器400进行,该动作根据在存储器401中作为应用软件储存的指令和\/或经由I\/O装置402从用户接收的输入命令。应用软件可包括一个或更多个软件模块,并且可在适合的执行环境,诸如操作系统环境等中来执行。因此,应该理解,计算机系统203可由任何适合的处理系统,诸如适当编程的PC、因特网终端、膝上型电脑、手持式PC、智能电话、PDA、平板电脑等形成。因此,在一个实例中,处理系统300是标准的处理系统,诸如基于32位或64位英特尔体系架构的处理系统,其执行储存在非易失性的(例如,硬盘)存储上的软件应用程序,尽管这不是必不可少的。然而,还应该理解,处理系统203可以是任何电子处理装置,诸如微处理器,微芯片处理器,逻辑门配置,任选与执行逻辑诸如FPGA(现场可编程门阵列)相关的固件,或任何其他电子装置、系统或布置。还应该注意,尽管处理系统和计算机系统201、203示出为单一实体,应该理解这不是必不可少的,且而是,例如通过使用被提供作为基于云的环境的部分的处理系统,可将处理系统和\/或计算机系统201、203中的一个或更多个分布在地理上单独的位置上。以上描述的方法的实例现将更进一步详细描述。出于这些实例的目的,假定,过程由充当诊断服务器的处理系统201中的一个或更多个来进行。与用户的交互是经由用户计算机系统203,其被用来允许用户提交例如从对受试者的测量值获得的原始数据,用处理系统201生成指示物,允许这被展示在计算机系统203上。然而,应该理解,为了以下实例的目的假定的以上描述的配置不是必不可少的,且可使用许多其他配置。还应当理解,处理系统和计算机系统201、203之间的功能性的分配可取决于具体的实施而变化。用于鉴定用于使用生物标志标识的生物标志的具体方法的实例现将参考图5描述。在该实例中,在步骤500,从至少一个个体获得参考数据。参考数据通常呈为至少一个个体对于至少一种状况的不同阶段获得的测量的生物标志值的形式。参考数据可以以任何适当的方式来获得,但通常这包括从多个个体获得基因表达产物数据,该多个个体被选择以包括被诊断为具有感兴趣的一种或更多种状况的个体,以及健康个体。使用任何本文所述的方法检测任一类型的基因表达被本发明所涵盖。术语“表达”或“基因表达”指仅RNA产生或RNA产生及RNA翻译为蛋白或多肽。因此,术语“表达产物”包括(i)多核苷酸,其包括RNA转录物和对应的核酸(包含RNA转录物的互补cDNA拷贝),以及(ii)由RNA转录物编码的多肽。状况通常是医学、兽医或其他健康状态状况,并且可包括任何患病、疾病、疾病的阶段、疾病亚型、疾病的严重程度、不同预后的疾病等。术语“健康个体”、“健康受试者”等在本文用来指不具有已诊断的疾病、紊乱、虚弱或小病的受试者,特别是哺乳动物。此类个体或受试者的状况在本文称为“健康状况”,使得在一个实例中,状况可包括健康。在特定实施方案中,健康的受试者缺乏SIRS(例如,inSIRS或ipSIRS)。为了实现这,收集基因表达产物数据,例如通过获得生物样品,诸如外周血样品,并然后进行定量过程,诸如核酸扩增过程,包括PCR(聚合酶链式反应)等,以评估许多参考生物标志的活性,并特别是,许多参考生物标志的水平或丰度。指示相对活性的定量值然后被储存作为参考数据的一部分。示例性参考生物标志可包括表达产物诸如核酸或蛋白性分子,以及在进行临床评估中相关的其他分子。为用作参考生物标志测量的生物标志的数目将取决于优选的实施而变化,但通常包括大量诸如,1000个、5000个、10000个或以上,尽管这不意图限制。个体还通常经历允许临床鉴定任何状况的临床评估,以及任何评估或状况的指示形成参考数据的部分。尽管可评估任何状况,在一个实例中,将该过程特别应用于鉴定状况诸如SIRS(全身炎症反应综合征)(MSRangel-Frausto,DPittet,MCostigan,THwang,CSDavis,和RPWenzel,“TheNaturalHistoryoftheSystemicInflammatoryResponseSyndrome(SIRS).aProspectiveStudy.”,JAMA:theJournaloftheAmericanMedicalAssociation273,2号(January11,1995):117–123.)。(MSRangel-Frausto,DPittet,MCostigan,THwang,CSDavis,andRPWenzel,“TheNaturalHistoryoftheSystemicInflammatoryResponseSyndrome(SIRS).aProspectiveStudy.”,JAMA:theJournaloftheAmericanMedicalAssociation273,no.2(January11,1995):117–123.).SIRS是可具有传染性或非传染性病因的过度全身反应,而脓毒症是感染期间发生的SIRS。两者都通过许多非特异性宿主响应参数包括心脏和呼吸速率、体温和白细胞计数的改变来定义(MitchellMLevy等,“2001SCCM\/ESICM\/ACCP\/ATS\/SISInternationalSepsisDefinitionsConference,”CriticalCareMedicine31,4号(April2003):1250–1256,doi:10.1097\/01.CCM.0000050454.01978.3B.;KReinhart,MBauer,NCRiedemann,和CSHartog,“NewApproachestoSepsis:MolecularDiagnosticsandBiomarkers,”ClinicalMicrobiologyReviews25,4号(October3,2012):609–634,doi:10.1128\/CMR.00016-12.)。(MitchellMLevyetal.,“2001SCCM\/ESICM\/ACCP\/ATS\/SISInternationalSepsisDefinitionsConference”,CriticalCareMedicine31,no.4(April2003):1250–1256.;KReinhart,MBauer,NCRiedemann,andCSHartog,“NewApproachestoSepsis:MolecularDiagnosticsandBiomarkers”,ClinicalMicrobiologyReviews25,no.4(October3,2012):609–634)为了区分这些状况,它们在本文中被称为SIRS(全部两种状况),感染阴性SIRS(没有感染的SIRS,以下称为“inSIRS”)和感染阳性SIRS(脓毒症,具有已知或疑似感染的SIRS,以下称为“ipSIRS”)。SIRS的原因是多样和变化的,并且可包括,但不限于,创伤、烧伤、胰腺炎、内毒素血症、手术、药物不良反应和感染(局部和全身)。然而,从以下应当理解,可将这应用于一系列不同状况,且提及SIRS或脓血症不意图限制。另外,参考数据可包括另外的生物标志诸如个体和\/或其亲属的一个或更多个表型参数或临床参数。表型参数可包括信息诸如性别、种族、年龄、头发颜色、眼睛颜色、身高、体重、腰围及臀围等。另外,在将该技术应用于除了人以外的个体的情况下,这还可包括信息诸如物种、品种的名称等。临床性状可包括遗传信息、白细胞计数、舒张压和收缩压、骨密度、身体质量指数、糖尿病、静息心率、HOMA、HOMA-IR、IVGT、静息心率、β细胞功能、大血管功能、微血管功能、致动脉粥样硬化指数、低密度脂蛋白\/高密度脂蛋白的比率、内膜中层厚度、体温、SOFA等。因此,在一个实例中,对于每个参考个体,参考数据可包括与状况的至少一种相关及期望地与多个参考生物标志和状况的存在、不存在、程度或进展相关的信息。参考数据通常可从出现在医疗中心、具有与感兴趣的相关任何状况相关性的临床体征的个体来收集,并可包括后继咨询,以确认临床评估,以及鉴定生物标志和\/或临床体征和\/或临床体征的严重程度经一段时间的改变。在这后一种情况下,参考数据可包括指示状况的进展和\/或参考生物标志的活性的时间序列数据,使得个体的参考数据可用来确定个体的状况是否改进、恶化或静态。还应当理解,对于样品群体内的个体,参考生物标志优选地基本上相似,使得可在个体之间进行测量的活性的比较。该参考数据还可随时间(例如随着个体内的状况进展)从单个个体收集,尽管更通常它将从多个个体来获得,该多个个体的每个具有感兴趣的一种或更多种状况的不同阶段。应当理解,在收集后,参考数据可被储存在数据库211中,允许这随后被处理系统201检索用于随后的分析。处理系统201还通常储存各参考生物标志的身份的指示。在一个实例中,测量值被接收作为原始数据,其然后经历初步处理。此类原始数据对应于已来自来源未经修改的信息,诸如来自仪器诸如PCR仪、阵列(例如,微阵列)扫描仪、测序仪的输出,临床记录或任何其他生物化学数据,生物数据,观测的数据等。该步骤可被用来将原始数据转化成更适合分析的格式。在一个实例中,这被进行,以归一化原始数据,并从而辅助确保甚至当使用不同的技术、不同的装备等测量时生物标志值显示一致性。因此,归一化的目的是,去除不直接可归因于在考虑中的具体分析的样品内的变化。例如,去除由在不同场所样品处理中的差异引起的变化。归一化的经典实例包括用于通用数据的z-评分转换,或热门领域的特定归一化,诸如用于微阵列的RMA归一化。然而,应该理解,在一些应用中,诸如在单个数据采集机器上运行的单个样品实验,该步骤可以不是严格必不可少的,在该情况下函数可以是产生与输入相同的输出的Null函数。在一个实例中,优选的方法是相比于对数归一化数据的配对函数方法。对数归一化是对微阵列数据的标准的数据转换,因为当离开机器时,该数据遵循对数正态分布。应用对数转换将数据转变成过程友好的正常数据。在步骤505,使用参考数据来定义不同的组。在这发生之前,处理系统201任选地从参考数据去除个体的验证子组,以允许处理系统201使用无验证子组的参考数据确定候选生物标志,使得验证子组可随后用来验证候选生物标志或包括多个候选生物标志的标识。因此,来自验证子组的数据用来验证候选或标识生物标志在鉴定状况的任一种或更多种的存在、不存在、程度、阶段、严重程度、预后或进展中的效力,以确保潜在的或标识生物标志有效。在一个实例中,这通过使处理系统210标记验证子组内的个体或可选择地将这些储存在数据库211内的替代性位置或参考数据的替代性数据库中来实现。个体的验证子组通常随机选择并可任选地被选择以包括具有不同表型性状的个体。当个体的验证子组被去除时,为在整个剩余说明书中方便,剩余个体将简单地称为参考数据。参考数据(即,不包括验证子组)被分为组。组可以以任何适当的方式来定义,并且可基于以下来定义:状况的存在、不存在、程度、阶段、严重程度、预后或进展的指示的任一个或更多个,其他测试或测定,或者与个体相关的测量的生物标志。例如,组的首选可以是鉴定患有SIRS的个体的一个或更多个组,患有ipSIRS的个体的一个或更多个组,患有inSIRS的一个或更多个组,以及健康个体的一个或更多个组。对于患有其他状况的个体,还可定义另外的组。组可包括重叠的组,所以例如,可期望定义健康个体及具有SIRS个体的组,其中被进一步定义以区分inSIRS患者与ipSIRS患者,以及inSIRS或ipSIRS的不同程度,这些组共同具有SIRS,但各组患者在临床医师是否已确定感染的存在与否方面不同。另外,进一步细分可基于表型性状来进行,因此组可基于性别、种族等来定义,使得患有状况的个体的多个组被定义,其中每个组涉及不同的表型性状。然而,应该理解,不同组的鉴定可以以其他方式,例如基于参考个体的生物学样品内的生物标志的特定活性来进行,并因此,提及状况不意图限制并且可根据要求使用其他信息。进行分类为组的方式可取决于优选的实施而变化。在一个实例中,这可由处理系统201自动进行,例如,使用无监督方法诸如主成分分析(PCA),或监督的方法诸如k-均值或自组织映射(SOM)。可选择地,这可通过允许操作者检查图形用户界面(GUI)上呈现的参考数据并使用适当的输入命令定义各自组,由操作者手动地进行。在步骤510,生物标志基于它们区分组的能力来过滤。该过程通常检查组内和跨组的个体的参考生物标志的活性,以鉴定在其活性在组之间不同的参考生物标志并因此可区分组。可利用一系列不同的分析技术,包括,例如,回归或相关性分析技术。所用技术的实例可包括已建立的用于参数化建模的方法,诸如偏最小二乘、随机森林或支持向量机,所述方法通常与特征简化技术结合用于选择将在标识中使用的生物标志的特定子集。这样的技术是已知的,并且在许多出版物中被描述。例如,偏最小二乘的使用描述在来自BriefingsinBioinformatics2007卷8.1号,32-44页的Boulesteix、Anne-Laure和Strimmer、Korbinian的“Partialleastsquares:aversatiletoolfortheanalysisofhigh-dimensionalgenomicdata”中。支持向量机描述在来自ACMTransactionsonIntelligentSystemsandTechnology(TIST),2011卷2,3号,27页的Chang,C.C.和Lin,C.J.的“LIBSVM:alibraryforsupportvectormachines”中。以R语言的标准随机森林描述在Rnews2002,卷2,3号,18-22页的Liaw,A.和Wiener,M.的“ClassificationandRegressionbyrandomForest”中。。分析技术由处理系统201使用应用软件来实施,该应用软件允许处理系统201依次进行分析技术中的多个技术。这是有利的,由于不同的分析技术通常具有不同的偏差,并因此可用来鉴定可区分组的不同的潜在生物标志,从而减少临床相关的生物标志被忽略的风险。在一个实例中,过程包括过滤掉显示与组相关并因此与状况相关性,即低于一定相关阈值,诸如0.3的任何生物标志。在步骤515,导出的生物标志使用一个或更多个函数由过滤的参考生物标志来生成。导出的生物标志的性质和使用的函数将取决于优选的实施而变化。例如,函数可包括两种标志的除法、减法、乘法、加法,应用于两种标志的产物的S型函数,两种生物标志的除法的负对数,应用于标志的两个向量以产生函数(方程)输出的最小二乘回归,分类生物标志的两个向量的一致性相关系数等。通常,函数基于许多规则来选择。这些规则可包括:实用性,提供最佳结果的函数;解释性,可在生物功能方面被解释的函数;输出,产生提供信息的输出的函数;简单;性能评估;对于最佳性能的最少数目的生物标志;在统计过拟合阈值的生物标志的数目等。在一个实例中,优选的函数是除法,其中所得生物标志是不同的比率。应该理解,除法可以以多种不同的方式来进行,使得对于三种生物标志,可确定九种不同的导出的生物标志。在步骤520,性能量度对于候选生物标志的每个来确定,所述候选生物标志包括过滤的参考生物标志和任何导出的标志。性能量度可以是以任何适合的形式,并通常包括指示对应的生物标志的相关性和其区分组的能力的相关或性能解释量度。在一个实例中,用来确定性能量度的性能函数是对所有候选生物标志的标准单变量统计检验。然而其他实例包括t-检验,非参数等效(non-parametricequivalent)或接收机工作特征曲线下面积(areaunderreceiveroperatorcurve),卡方分布或回归分析或者可使用它们的等同物、扩展物或衍生物。对候选选择步骤中的每个应用性能函数的结果是生物标志的排序列表,其中前N个排序的生物标志继续至下一个阶段。降至低于该阈值的生物标志不再被考虑。应用的阈值可以是所有生物标志的绝对数目或比例,或通过性能,诸如p值≤0.05来确定。阈值应该被选择,以包含足够大量的生物标志,以偏向包括足够独立的生物标志(即,低的互相关性)。在步骤525,处理系统201基于性能量度和互相关性选择下两个候选生物标志。在这方面,根据状况的上下文彼此高度相关的两个标志将不一定比该标志中的单独一个更多改进区分状况的特定存在、不存在、程度或预后的能力。因此,通常,选择关于状况具有高性能量度但具有降至低于互相关性阈值的互相关性的生物标志。使用的互相关性阈值将取决于优选的实施而变化,并通常被选择为尽可能地低,如以上描述的。生物标志被选择的方式的实例将关于图6A和6B在下面更详细地描述。在步骤530,处理系统201确定下一个候选生物标志组合的性能。在这方面,处理系统201将使用组合函数诸如加法,将选择的候选生物标志的生物标志值组合,并使用此、基于生物标志值的组合确定指示物值。性能可以以任何适合的方式来确定,诸如使用统计测量值、相关性测量值、一致性测量值或聚集性能测量值诸如平均值。在一个特定实例中,性能量度是‘解释方差'(VE)。“1”的VE意指,使用生物标志,你们可完美分类\/预测疾病。“0.8”的VE意指,你的标志在实践中占结果的80%。因此,在步骤535,处理系统201将指示物的性能与性能阈值进行比较,并在步骤540确定这是否被超过。在阈值被超过的情形中,这指示,选择的标志的组合提供区分所需的程度,允许状况的存在、不存在、程度或预后被确定。在步骤540阈值不被超过的情形中,在步骤545确定所有组合是否已被考虑。在这方面,尝试两种选择的生物标志的多个不同的组合是可能的,因此,如果每个可能的组合尚未被考虑,处理系统201返回至步骤530,以确定下一候选生物标志组合的性能。在这方面,使用的组合将通常根据偏好来排序,使得优选的组合首先被尝试,较不优选的组合仅在优选的组合证明是不成功的情形中被尝试。在对于选择的两种候选生物标志,所有的候选生物标志组合都已被考虑后,并且如果性能阈值仍未被超过,过程移动至步骤550,以将被考虑的候选生物标志的当前数目与限值进行比较。在这方面,限值用来控制在生物标志标识中的生物标志的整体数目,从而使标识尺寸并因此使进行相关测量和诊断的成本最小化。如果限值尚未被超过,另外的生物标志基于在步骤560的相关性和性能来添加,其中过程移动至步骤530,以确定下一候选生物标志组合的性能。否则,如果限值已被达到,则可选的下两种候选生物标志在步骤525来选择。因此,该过程允许另外的候选生物标志被逐步包括,其中多种候选生物标志的组合被与性能阈值进行比较,以确定要求的性能是否被满足。如果,在候选生物标志的数目达到限值之前,这未被实现,过程使用两种不同的候选生物标志重新开始。在性能阈值在步骤540已被超过后,选择的候选生物标志可被定义为标识生物标志,以用于被包括在步骤565的用于一种或更多种状况的生物标志标识中。应该注意,在生物标志标识在步骤565被最后敲定之前,另外的检查可被进行,以确保,被包括在标识中的候选生物标志不应该出于任何原因被排除。例如,候选生物标志可能出于成本考虑被排除,因为候选生物标志的一些组合可比其他花费更多。例如,大数目生物标志可比小数目花费更多,且另外的成本不能通过性能中的小改进来调整。可选地,如果多个不同的测试被要求以测量要求的生物标志值,成本可能增加。生物标志还可能出于法律原因被排除使用,例如,如果它们的使用受到批准或知识产权原因限制。一些生物标志可能难以从技术的角度来测量,例如,在体内非常低的表达,这增加了可变性,并因此减少稳健性。每个生物标志组合组的性能还可包括一些可变性,通常表示为围绕报告的性能的置信区间。尽管,对于一组的点估计值可高于对于另一组的点估计值,如果提供可变性的差异不显著,组合可被认为是相等的。在标识生物标志的特定组合被定义后,在步骤570,处理系统201可确定与每个组相关的指示物值范围。特别地,对于在每个组内的标识生物标志的参考生物标志值的范围被用来计算对于每个组的指示物值范围。这些可然后与对具有至少一种状况的未知的存在、不存在、程度或进展的生物受试者计算的指示物值进行比较,并被用来鉴定受试者将属于的组并因此鉴定状况的存在、不存在、程度或进展。因此,以上描述的过程迭代地评估生物标志,最初选择两种生物标志,这些的多种组合被考虑,以确定这些是否具有要求的性能,以用于在诊断状况的存在、不存在、程度或进展中使用。在要求的性能不被提供的情形中,另外的生物标志可被添加并且进一步的组合被尝试。因此,过程可考虑三种生物标志、四种生物标志、五种生物标志、六种生物标志、七种生物标志、八种生物标志、九种生物标志或更多种。通常,这被进行至限值,所述限值可例如基于在给定的成本或过程参数内可事实上测量的生物标志的数目定义。在要求的性能未获得的情形中,过程移动至以选择可选的候选生物标志,以其重复。因此,应该理解,以上过程最初选择具有适合的性能并不高度相关的那些生物标志,基于这些提供最大性能。这些生物标志区分的能力然后被测试,并在这是不足够的情形中,另外的生物标志可被添加至限值。如果这仍不提供要求的区分性能,可选的生物标志可被选择。取决于优选的实施,在步骤525,选择两种候选生物标志的过程可以以许多方式来实现,且这的实例现将参考图6A和6B描述。在图6A的实例中,在步骤600,生物标志根据它们的互相似性分组。因此,高度相关的生物标志一起放置在共同组中。该组内的生物标志在步骤610基于它们根据它们与状况的相关性的性能量度排序,其中来自两个该组的最高排序的生物标志在步骤620被选择,以定义下两种候选生物标志。应该理解,如果另外的候选生物标志被要求,这些可从与最初两种候选生物标志不同的组来选择。可选的过程示出在图6B中。在该实例中,在步骤650,生物标志基于它们区分状况的性能排序。在步骤660,下一最高的生物标志被选择,其中剩余生物标志基于它们与选择的生物标志的相似性的组合重新排序,例如,使用互信息以及它们的性能。下一最高的生物标志然后在步骤680被选择,其中该过程根据需要被重复。因此,应该理解,以上描述的过程提供了用于选择生物标志且更通常地导出的生物标志(可被用来形成生物标志标识)的组合的机制,这反过来可在诊断至少一种状况的存在、不存在或程度或在提供至少一种状况的预后中被使用。在这方面,生物标志标识定义应该被测量的生物标志(即,标识生物标志),导出的生物标志值应该如何对于测量的生物标志值被确定,且然后生物标志值应该如何被随后组合以生成指示物值。生物标志标识还可指定指示一种或更多种状况的特定存在、不存在、程度或预后的定义的指示物值范围。使用以上描述的生物标志标识的方法的实例现将参考图7描述。在该实例中,在步骤700,对其的状况未知的生物受试者测量多个测量的生物标志值,这些通常被提供至处理系统201,例如通过从测量装备等下载。在任何要求的处理,诸如归一化等之后,在步骤710,处理系统201对测量的生物标志值应用一个或更多个函数,以确定任何要求的导出的生物标志值。将导出的生物标志值和另一个生物标志值(即,另一个导出的生物标志值或测量的生物标志值)组合,以生成指示物值,其然后可被展示或以其他方式在确定一种或更多种状况的存在、不存在、程度或预后中使用。因此,这可包括简单展示指示物值,允许医学从业者做出评估或可选地可包括进一步处理,诸如将指示物与指示一种或更多种状况的特定存在、不存在、程度或预后的定义的指示物值范围进行比较,比较的结果被展示。因此,在以上描述的方法中,生物标志标识定义需要被测量和\/或导出的生物标志值,允许处理系统201基于接收的测量的生物标志值自动生成指示物值。在这已被完成之后,处理系统201可将指示物值与指示物值范围进行比较,并展示该比较的结果或可选地解释该比较的结果,允许指示状况的存在、不存在、程度或预后的指示物被展示。这然后可被医学从业者在进行生物受试者的医学诊断中根据需要使用。使用以上描述的方法,已确定的是,当评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性时,“免疫系统生物标志”的比率的使用特别有益。如本文所用,术语“免疫系统生物标志”指宿主的免疫系统的、作为对损伤或病原性损害的炎性反应的一部分被改变,或作为对损伤或病原性损害的炎性反应的一部分被改变其表达水平的生物标志,所述病原性损害包括代谢、毒性、神经毒性、医源性、热或化学损害,其的说明性实例包括创伤、手术、药物包括化学治疗药物、辐射、疾病,包括致病性感染、代谢性疾病和缺血,以及外来的或植入的物质。如本文所用,术语“免疫系统”指提供针对损伤和损害和物质的防御的细胞、分子组分和机制,分别包括适应性免疫系统和先天免疫系统的抗原特异性和非特异性的类别,所述物质包括抗原分子,包括但不限于肿瘤、病原体和自身反应性细胞。术语“先天免疫系统”指宿主对损害的非特异性反应,包括在暴露于几乎任何损害或抗原之后立即或数小时内开始行动的抗原非特异性防御细胞、分子组分和机制。先天免疫的要素包括例如吞噬细胞(单核细胞、巨噬细胞、树突细胞、多形核白细胞诸如嗜中性粒细胞、网状内皮细胞诸如Küpffer细胞及小神经胶质细胞)、释放炎症介质的细胞(嗜碱性粒细胞、肥大细胞及嗜酸性粒细胞)、自然杀伤细胞(NK细胞),以及物理屏障和分子诸如角蛋白、粘液、分泌物、补体蛋白、免疫球蛋白M(IgM)、急性期蛋白、纤维蛋白原和凝血级联的分子以及细胞因子。先天免疫系统的效应物化合物包括化学品诸如溶酶、IgM、粘液以及化学引诱物(例如,细胞因子或组胺)、补体和凝血蛋白。术语“适应性免疫系统”指在数天内出现并与特定抗原反应且去除特定抗原的抗原特异性的细胞、分子组分和机制。适应性免疫系统在宿主的整个一生中发展。适应性免疫系统是基于白细胞,并且被分成两个主要部分:体液免疫系统和细胞介导的免疫系统,所述体液免疫系统主要经由由B细胞产生的免疫球蛋白起作用,所述细胞介导的免疫系统主要经由T细胞起作用。因此,在一个实例中,确定了与免疫系统生物标志的比率相关的指示物,这可在评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性中使用。在该实例中,该方法包括确定一对生物标志值,每个生物标志值是对所述生物受试者的至少一个对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度。生物标志值被用来使用该对生物标志值确定导出的生物标志值,所述导出的生物标志值指示该对免疫系统生物标志的浓度的比率。因此,如果生物标志值是生物标志的浓度,则导出的生物标志值将基于所述生物标志值的比率。然而,如果生物标志值与生物标志的浓度有关,例如,如果它们凭借基于PCR循环次数等的生物标志值对数地相关,则生物标志值可以以一些其他方式诸如通过减去循环次数进行组合,以确定指示浓度的比率的导出的生物标志值。然后,导出的生物标志被用来确定指示物,通过使用导出的生物标志值作为指示物值,或通过进行另外的处理,诸如将导出的生物标志值与参考进行比较等,如将在下面更详细地描述的。在任何情况下,将生物标志值组合,以确定免疫系统生物标志的浓度的比率,并然后使用这确定指示物,取决于选择的免疫系统生物标志,允许待确定的指示物用于在确定受试者患有一系列不同的状况的可能性中使用,如应该理解的,这可使用以上描述的过程来进行。现将描述许多更进一步的特征。在一个实例中,过程包括使用第一对生物标志值确定第一导出的生物标志值,所述第一导出的生物标志值指示第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的浓度的比率,使用第二对生物标志值确定第二导出的生物标志值,所述第二导出的生物标志值指示第三免疫系统生物标志和第四免疫系统生物标志的浓度的比率,并且通过将所述第一导出的生物标志值和第二导出的生物标志值组合确定指示物。因此,在该实例中,两对导出的生物标志值可被使用,这可帮助增加指示物可靠地确定受试者具有状况的可能性的能力。导出的生物标志值可使用组合函数来组合,所述组合函数诸如加性模型;线性模型;支持向量机;神经网络模型;随机森林模型;回归模型;遗传算法;退火算法;加权和;最邻近模型;以及概率模型。在一个实例中,将指示物与指示物参考进行比较,其中可能性根据该比较的结果来确定。指示物参考通常由对参考群体中的许多个体确定的指示物导出。参考群体通常包括具有不同特征的个体,诸如不同性别;和\/或种族的多个个体,其中不同的组基于不同的特征来定义,将受试者的指示物与由具有相似特征的个体导出的指示物参考进行比较。参考群体还可包括多个健康的个体、多个患有至少一种已诊断的医学状况的个体、多个显示至少一种医学状况的临床体征的个体和\/或第一组个体和第二组个体,每个个体组患有各自的诊断的医学状况。应该理解,选择的个体将取决于指示物的预期用途。特别地,当指示物用于在确定生物受试者具有特定医学状况的可能性中使用时,样品群体包括显示特定医学状况的临床体征的个体、被诊断为具有特定医学状况的个体以及健康的个体。这确保,指示物有效性的评估适用,不管或无论个体是否具有特定状况。还应该理解,样品群体还可包括多个不同的性别、种族、年龄等的个体,允许对照值范围跨群体是共同的。然而,这不是必不可少的,并且可选地,可建立特异于群体的特定子集的对照值阈值。在该情况下,确保使用的对照值阈值范围适合于所考虑的受试者将是有必要的。指示物还可用于确定受试者具有第一状况或第二状况的可能性,换言之区分状况。在该情况下,这将通常通过将指示物与第一指示物参考和第二指示物参考进行比较来实现,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考指示第一状况和第二状况,并根据比较的结果确定可能性。特别地,这可包括使用比较的结果确定第一指示物概率和第二指示物概率,并例如使用贝叶斯方法将所述第一指示物概率和所述第二指示物概率组合,以确定对应于受试者具有状况之一的可能性的状况概率。在该情况下,所述第一状况和所述第二状况可包括两种医学状况,或单医学状况和健康状况。在这种情况下,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组分别由诊断为具有第一状况或第二状况的个体组成。在这方面,这可通过确定第一组个体和第二组个体来实现,每个个体组具有已诊断的医学状况的存在或不存在,并分别对第一组和第二组确定第一指示物参考和第二指示物参考。这允许指示物被用来区分第一状况和第二状况,其可包括不同的医学状况、以及健康状况。还应该理解,尽管两个组被描述,这不是必不可少的,且三个组或更多个组还可被定义。过程通常使用至少一个电子处理装置,诸如适当编程的计算机系统等来进行。在这种情况下,电子处理装置通常通过从测量装置或其他定量装置接收这些,或通过从数据库等检索这些获得至少两对测量的生物标志值。处理装置然后确定指示第一免疫系统生物标志和第二免疫系统生物标志的浓度的比率的第一导出的生物标志值和指示第三免疫系统生物标志和第四免疫系统生物标志的比率的第二导出的生物标志值。处理装置然后通过将所述第一导出的生物标志值与所述第二导出的生物标志值组合确定所述指示物。处理装置然后可生成指示物的表示,例如通过生成指示物的字母数字指示、指示物与一个或更多个指示物参考的比较的图形指示或者受试者具有至少一种医学状况的可能性的字母数字指示。方法通常还将包括获得从生物受试者采集的样品,所述样品包括多核苷酸表达产物,并定量所述样品内的所述多核苷酸表达产物的至少一些,以确定该对生物标志值。这可使用任何适合的技术来实现,并将取决于免疫系统生物标志的性质。例如,如果指示物是基于多核苷酸表达产物的浓度的比率,该过程通常将包括通过扩增样品中的至少一些多核苷酸表达产物来定量多核苷酸表达产物,确定代表获得定义水平的一对多核苷酸表达产物的每一个需要的扩增程度的扩增量,以及通过确定扩增量之间的差异确定指示物。在该方面,扩增量通常为循环时间、循环的数目、循环阈值及扩增时间。在这方面,该方法包括通过确定第一对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第一导出的生物标志值,通过确定第二对多核苷酸表达产物的扩增量之间的差异确定第二导出的生物标志值,并且通过将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加确定指示物。如先前所论述的,至少两种免疫系统生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间,以及,指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。通常,该互相关性范围是以下的一个:±0.8;±0.7;±0.6;±0.5;±0.4;±0.3;±0.2;以及±0.1。通常,每一种免疫系统生物标志具有位于状况相关性范围之外的与至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的状况相关性,所述状况相关性范围在±0.3之间,且更通常为±0.9;±0.8;±0.7;±0.6;±0.5;以及,±0.4。通常,性能阈值指示以下的至少一个的解释方差:0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;以及0.9。以上描述的方法已被用来鉴定1650种炎症反应综合征的生物标志(在本文还可互换地称为“IRS生物标志”或“IRS免疫系统生物标志”),其对帮助区分以下有用:(1)区分感染SIRS的受试者(即,具有inSIRS或ipSIRS的受试者)和健康的受试者或未受SIRS感染的健康受试者;(2)区分有inSIRS的受试者和有ipSIRS的受试者;和\/或(3)区分具有ipSIRS的不同阶段(例如,脓毒症、严重脓毒症和脓毒症休克)的受试者。基于该鉴定,本发明人已开发了多种方法、组合物、装置及试剂盒,其利用这些生物标志来提供用于在诊断至少一种状况的存在、不存在或程度中使用或者用于预后至少一种状况的指示物,其中所述至少一种状况选自健康状况(例如,正常状况或其中inSIRS和inSIRS是不存在的状况)、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的阶段(例如,具有特定严重程度的ipSIRS的阶段,其的说明性实例包括轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒症休克)。在有利的实施方案中,方法和试剂盒包括监测免疫系统的细胞,包括血细胞(例如,免疫细胞诸如白细胞)中IRS生物标志基因的表达,该IRS生物标志基因的表达可反映在例如与活跃疾病的存在相关或应答疾病的RNA水平或蛋白产生的变化模式中。IRS生物标志是基因(在本文还可互换称为“IRS生物标志基因”或IRS免疫系统生物标志基因”)的表达产物,包括多核苷酸表达产物和多肽表达产物。如本文所用,IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物在本文中称为“IRS生物标志多核苷酸”。IRS生物标志基因的多肽表达产物在本文称为“IRS生物标志多肽”。如本文所用,术语“基因”指编码多肽或具有功能的RNA链的一段(stretch)核酸。尽管,基因的外显子区域被转录以形成RNA(例如,mRNA),术语“基因”还包括调控区域诸如支配外显子区域的表达的启动子和增强子。适当地,IRS生物标志基因选自由以下组成的组:PRKCZ、SKI、RER1、TAS1R1、VAMP3、AGTRAP、VPS13D、KLHDC7A、NBL1\/\/C1orf151、MDS2、RCAN3、LDLRAP1、MAN1C1、SH3BGRL3、DHDDS、HCRTR1、CCDC28B、LCK、ZNF362、THRAP3、PPIE\/\/CCDC25、CAP1、CTPS、C1orf84、FAAH、DMBX1、CYP4B1、BTF3L4、LRRC42、C1orf175\/\/TTC4、TMEM61、FPGT\/\/TNNI3K、ACADM、SPATA1、EPHX4、RPAP2、RPL5\/\/SNORA66\/\/SNORD21\/\/FAM69A、RTCD1、SLC30A7、RNPC3\/\/AMY2B、CELSR2、AHCYL1、CEPT1\/\/DRAM2、CHIA、LIX1L、UPF0627、MRPS21、TNFAIP8L2、SMCP、DCST1、RAG1AP1、C1orf182、HAPLN2、NTRK1、CD1E、TOMM40L\/\/NR1I3、POU2F1、TIPRL、SFT2D2、CACNA1E、SMG7、OCLM、RGS2、ZC3H11A\/\/RP11-74E24.2、MFSD4、IL20、RPS6KC1、C1orf95、ARF1、GALNT2、TNFRSF4、NADK、FLJ14100\/\/C1orf86、GPR153、RERE、SLC2A7、SDHB、RNF186、DDOST、GPN2、R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AD2、FBXO31、ZCCHC14、FAM38A、CENPBD1、TIMM22、RPA1、DPH1\/\/OVCA2、SGSM2、ARRB2、LOC100130950、DNAH2、PIGL、TRPV2、MPRIP、DRG2、ALKBH5\/\/FLJ13773、SMCR7、WSB1、TAOK1、CPD、SUZ12P、RNF135、ZNF830、TAF15、GGNBP2、LASP1、PSMD3、CDC6、NBR2、TMUB2、MGC57346\/\/C17orf69、NSF\/\/LOC728806、GOSR2、NPEPPS\/\/TBC1D3F\/\/LOC440434、KPNB1、CDK5RAP3、ATP5G1、UBE2Z、XYLT2\/\/LOC100130580、NOG、DGKE、AKAP1、TMEM49\/\/CLTC\/\/MIR21、CLTC、CA4、C17orf64、DCAF7、PITPNC1、NOL11\/\/SNORA38B、MAP2K6、COG1、CD300A、TMEM104、MRPS7、KIAA0195、TSEN54、LLGL2、LOC100134934\/\/CDK3、MFSD11、SEPT9、TNRC6C、TMC8、ENGASE、RPTOR、GPS1、FN3KRP、TBCD、GEMIN4、GLOD4、SLC43A2、PRPF8、SMG6\/\/C17orf6、METT10D\/\/LOC284009、SHPK、TAX1BP3、P2RX5、MYBBP1A\/\/SPNS2、PELP1、PFN1、ZNF232、DHX33、DERL2、NLRP1\/\/LOC728392、ASGR2、NEURL4\/\/GPS2\/\/D4S234E、ZBTB4、TP53、VAMP2、PIK3R5、ELAC2、NCOR1\/\/C20orf191\/\/LOC100131704、ZNF287、TOM1L2\/\/LOC246315、GRAP\/\/SNORD3B-1\/\/SNORD3B-2\/\/LOC400581、ALDOC、SDF2、RAB34、PHF12、NUFIP2、OMG、EVI2B、C17orf66\/\/RSL24D1、SYNRG\/\/LOC100131822、PLXDC1、CACNB1、PGAP3、MED24、NR1D1\/\/THRA、CCR7、STAT5B\/\/STAT5A、FAM134C、VAT1、DUSP3、C17orf65\/\/ASB16、UBTF、GPATCH8、MAP3K14\/\/LOC100133991、OSBPL7、SLC35B1、TOB1、COX11\/\/TOM1L1、VEZF1、SFRS1\/\/FLJ44342、SEPT4、MED13\/\/LOC100129112、LIMD2\/\/MAP3K3、STRADA、FTSJ3、CD79B、ICAM2、ERN1、TEX2、LRRC37A3\/\/LRRC37A2\/\/LRRC37A\/\/ARL17P1\/\/LRRC37A4\/\/LOC100294335\/\/LOC644397、GNA13、WIPI1\/\/ARSG、FAM20A、NAT9、GGA3、H3F3B\/\/H3F3C、EXOC7、SFRS2、TMC6\/\/LOC100131096、USP36、CD7、RAB31、VAPA、SEH1L、HQ0644\/PRO0644、RNMT、RNF138、GALNT1、ELP2、PIK3C3、SLC14A2、ME2、SERPINB2\/\/SERPINB10、ZNF407、ZNF236、NFATC1\/\/LOC100127994、ENOSF1\/\/TYMS、MYOM1、AFG3L2、ABHD3、OSBPL1A、CDH2、DSC1、PSTPIP2、C18orf32、MBD2\/\/SNORA37、PIGN、TMX3、PQLC1、GZMM、ARID3A、CIRBP、DAZAP1、SPPL2B、NFIC、VAV1、ARHGEF18\/\/LOC100128573、STXBP2\/\/LOC554363\/\/LOC100131801、C19orf59、ZNF317、ILF3、SMARCA4、PRKCSH、IER2、CCDC130、DCAF15、IL27RA、KLF2、SIN3B、DDA1、GTPBP3、FAM129C、FCHO1、ARRDC2、IFI30、C19orf60、CRTC1\/\/MAML2、RFXANK\/\/MEF2B\/\/LOC729991、ZNF101、ZNF738、ZNF257\/\/ZNF492\/\/ZNF99\/\/ZNF98\/\/LOC646864、C19orf2、KIAA0355\/\/FLJ21369、USF2、TMEM147、LIN37\/\/PSENEN、C19orf55、TBCB\/\/POLR2I、ZNF382、ZNF568、ZNF420、ZNF383、CCDC97、ZNF574、CD177、ZNF230\/\/ZNF222、VASP、GRWD1、FLT3LG、ZNF175、NCRNA00085、PPP2R1A、ZNF808\/\/ZNF578\/\/ZNF611、LENG8、FCAR、RPL28、U2AF2、LOC100288114\/\/MGC9913、ZFP28、ZNF460、ZNF549、ZNF211、ZNF587\/\/ZNF417、ZNF274、ZNF544、ZNF8、TRIM28、C19orf6、C19orf34、GNG7、AES、EEF2\/\/SNORD37、PLIN5\/\/LRG1、PLIN3、PTPRS、SAFB2\/\/SAFB、RANBP3、GTF2F1\/\/LOC100130856、XAB2、ELAVL1、ADAMTS10、FBXL12、DNMT1、TYK2、KEAP1、KRI1、TMEM205\/\/hCG_29977、ZNF563、MAN2B1\/\/MORG1、C19orf56、DHPS、TNPO2\/\/SNORD41、LPHN1、NDUFB7、AKAP8、AKAP8L、CHERP\/\/C19orf44\/\/CALR3、INSL3\/\/JAK3、IL12RB1、UPK1A、TYROBP、ZNF529、ZNF461、ZNF607、YIF1B、PRR13、CEACAM4、PLAUR、TRAPPC6A、ERCC1\/\/CD3EAP、RTN2、SYMPK、PGLYRP1、NOSIP、PNKP、NKG7、FPR1、ZNF28、OSCAR、MBOAT7、LILRA5、LILRA4、ZNF550\/\/ZNF549、ZNF416、ZNF256、ZNF329、FAM110A、ITPA、CDC25B、CDS2、CRLS1、CSRP2BP、SEC23B、SLC24A3、HCK、ASXL1、ACSS2、C20orf4、TGIF2、C20orf24\/\/SLA2、RPN2\/\/EEF1A2、CTNNBL1、ACTR5、PPP1R16B、DHX35、PLCG1、MYBL2、SYS1\/\/SYS1-DBNDD2\/\/DBNDD2、DNTTIP1、CTSA、MMP9\/\/LOC100128028、DDX27、SLC9A8、RNF114、PTPN1、TSHZ2、PFDN4、CSTF1、CASS4、GNAS、C20orf177、CDH26、C20orf197、LOC284757、ARFGAP1、PRPF6、NSFL1C、SIRPD、SIRPG\/\/SIRPA、RNF24、RASSF2、TMX4、JAG1、C20orf74、C20orf3、C20orf112、CDK5RAP1、AHCY、GGT7、EDEM2、RBM39\/\/LOC643167、BLCAP、SERINC3\/\/TTPAL、ZNF335、ELMO2、B4GALT5、DPM1、ZFP64、ZNF217、CTSZ、SYCP2、PSMA7、DIDO1、YTHDF1、CHODL、BACH1、C21orf41\/\/BACH1、IL10RB、IFNAR1、IFNGR2、SON、MORC3\/\/DOPEY2、DYRK1A、KCNJ15、ETS2、RRP1B、PFKL、TRPM2、ADARB1、SAMSN1\/\/LOC388813、N6AMT1、SYNJ1、TMEM50B、KCNE1、PRDM15、C2CD2、WDR4、U2AF1、CSTB、UBE2G2\/\/SUMO3、PTTG1IP、POFUT2、MCM3AP、IL17RA\/\/CECR7、C22orf37、LZTR1、PPIL2\/\/YPEL1、CYTSA、SNRPD3\/\/C22orf13、NF2、LIMK2、SLC5A1、MCM5、NCF4、GGA1、SH3BP1\/\/PDXP、POLR2F\/\/LOC100131530、APOBEC3A\/\/APOBEC3B、APOBEC3D、ATF4、CACNA1I、ZC3H7B、CCDC134、TSPO、NUP50、TBC1D22A\/\/LOC100289878、RP3-402G11.5、SAPS2、NCAPH2、BID、SLC25A1、KLHL22\/\/KRT18、PI4KA\/\/PI4KAP1\/\/PI4KAP2\/\/LOC100293141、MAPK1、ZNF70、TPST2、SF3A1\/\/CCDC157、PES1、PIK3IP1、PATZ1、C22orf30、IL2RB、CSNK1E\/\/LOC400927、UNC84B、CBX7\/\/LOC100128400、RPS19BP1、MKL1\/\/KIAA1659、RANGAP1、TCF20、LDOC1L、UNQ6126、TUBGCP6、SBF1\/\/SBF1P1、MSL3、MOSPD2、BMX\/\/HNRPDL、PDHA1、YY2、PDK3、GK\/\/GK3P\/\/FTL\/\/LOC652904、CXorf59、ATP6AP2、USP9X\/\/USP9Y、RP2、USP11、RBM3、FTSJ1、WAS、PLP2、TSPYL2\/\/GPR173、MAGED2、UBQLN2、NLGN3、ACRC、UPRT、CXorf26、ATP7A、DIAPH2、CSTF2\/\/RAD21、ARMCX3、ARMCX5、GPRASP1、TMEM31、TBC1D8B、MID2、DOCK11、LONRF3、UBE2A、SH2D1A、OCRL、SLC25A14、HPRT1、CD40LG、AFF2、SSR4\/\/IDH3G、FAM50A、DKC1\/\/SNORA36A\/\/SNORA56、ARSD、KAL1、CTPS2、RPS6KA3、BCOR、MAOB\/\/NAT13、ZNF41、OTUD5、KCND1、ZMYM3、MAGT1、BRWD3、TRMT2B、GLA、MORF4L2、PSMD10、ACSL4、LAMP2、CUL4B、ODZ1、ELF4、RAP2C、FAM127B\/\/FAM127C\/\/FAM127A、TMEM185A、ARD1A、IRAK1、DNASE1L1\/\/RPL10、SH3KBP1、Mitochondrial、Mitochondrial、CCNL2、INPP5B、TLR5、ADRB3\/\/GOT1L1、NOC2L\/\/SAMD11\/\/LOC401010和SHFM1(此后在本文可互换地称为“IRS免疫系统生物标志基因的完全列表”或“完全列表IRS生物标志基因”)。本发明的方法、组合物、装置及试剂盒利用本文以上以及别处广泛描述的IRS生物标志,提供用于在诊断至少一种状况的存在、不存在或程度中使用或者提供至少一种状况的预后的指示物,所述至少一种状况选自健康状况(例如,正常状况或其中inSIRS和inSIRS是不存在的状况)、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的阶段(例如,具有特定严重程度的ipSIRS的阶段,诸如轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒症休克),所述方法、组合物、装置及试剂盒可包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种(例如,1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用多个IRS生物标志值的组合(在本文中还称为“生物标志标识”)确定所述指示物,所述指示物至少部分地指示至少一个状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种(例如,2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及(ii)指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供对于至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。在有利的实施方案中,本发明的诊断或预后方法、组合物、装置及试剂盒包括:(1)确定多个测量的IRS生物标志值,每个测量的IRS生物标志值是所述生物受试者的IRS生物标志的测量的值;以及(2)对所述测量的IRS生物标志值的至少一个应用函数确定至少一个导出的IRS生物标志值,所述至少一个导出的IRS生物标志值指示对应的导出的IRS生物标志的值。该函数适当地包括以下的至少一种:(a)将两个IRS生物标志值相乘;(b)将两个IRS生物标志值相除;(c)将两个IRS生物标志值相加;(d)将两个IRS生物标志值相减;(e)至少两个IRS生物标志值的加权和;(f)至少两个IRS生物标志值的对数和;以及(g)至少两个IRS生物标志值的S型函数。在一些实施方案中,诊断或预后方法、组合物、装置及试剂盒包括:确定对应于两个测量的IRS生物标志值的比率的至少一个导出的IRS生物标志值。在这些实例中,诊断或预后方法、装置及试剂盒适当地包括,将至少两个IRS生物标志值组合,以确定代表所述指示物的指示物值,并在该类型的说明性实例中,至少两个IRS生物标志值使用组合函数(例如,以下的任一种或更多种:加性模型;线性模型;支持向量机;神经网络模型;随机森林模型;回归模型;遗传算法;退火算法;加权和;最邻近模型;以及概率模型)组合。适当地,诊断或预后方法、装置及试剂盒包括:(a)确定第一导出的IRS生物标志值,所述第一导出的IRS生物标志值指示第一测量的IRS生物标志值和第二测量的IRS生物标志值的比率;(b)确定第二导出的IRS生物标志值,所述第二导出的IRS生物标志值指示第三测量的IRS生物标志值和第四测量的IRS生物标志值的比率;以及(c)将第一导出的IRS生物标志值和第二导出的IRS生物标志值相加,以生成指示物值。在一些实施方案中,本发明的方法、组合物、试剂盒及装置对诊断inSIRS或健康状况存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、组合物、试剂盒及装置适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自inSIRS和健康状况的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的A组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的B组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在其他实施方案中,方法、装置及试剂盒对诊断ipSIRS或健康状况存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自ipSIRS和健康状况的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的C组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的D组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在仍其他实施方案中,方法、装置及试剂盒对诊断inSIRS或ipSIRS存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自inSIRS和ipSIRS的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的E组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的F组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在其他实施方案中,方法、装置及试剂盒对诊断inSIRS或ipSIRS存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自inSIRS和ipSIRS的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少四种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少四种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,其中所述至少四种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述至少四种IRS生物标志的至少另一种选自第三IRS生物标志组,且其中所述至少四种IRS生物标志的至少另一种选自第四IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的G组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的H组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,其中所述第三IRS生物标志组由来自如本文定义的I组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第四IRS生物标志组由来自如本文定义的J组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在仍其他实施方案中,方法、装置及试剂盒对诊断轻度脓毒症或严重脓毒症存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自轻度脓毒症和严重脓毒症的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的K组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的L组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在仍其他实施方案中,方法、装置及试剂盒对诊断轻度脓毒症或脓毒性休克存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自轻度脓毒症和脓毒性休克的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的M组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的N组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。在仍其他实施方案中,方法、装置及试剂盒对诊断严重脓毒症或脓毒性休克存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个IRS生物标志值的组合确定所述指示物,所述至少一种指示物至少部分地指示选自严重脓毒症和脓毒性休克的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后,其中:(i)至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在或程度、或者提供至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述至少两种IRS生物标志的至少一种选自第一IRS生物标志组,且其中所述至少两种IRS生物标志的至少另一种选自第二IRS生物标志组,其中所述第一IRS生物标志组由来自如本文定义的O组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成,且其中所述第二IRS生物标志组由来自如本文定义的P组IRS生物标志基因的多核苷酸表达产物和\/或多肽表达产物组成。如本文所用,术语“诊断(diagnosis)”、“诊断(diagnosing)”等在本文可互换地使用,包括确定受试者将发展状况的可能性,或者受试者中状况的存在或性质。这些术语还包括确定疾病的严重程度或疾病的发作,以及在合理疗法的情况下,其中诊断指导疗法,包括疗法的初始选择、疗法的修改(例如,剂量或给药方案的调整)等。“可能性”意指如下的量度:基于给定的数学模型,具有特定测量的或导出的生物标志值的生物受试者实际上是否具有状况(或不具有)。例如,增加的可能性可以是相对的或绝对的并且可定性地或定量地来表示。例如,基于先前的群体研究,增加的可能性可通过确定受试者的对至少两种IRS生物标志测量的或导出的生物标志值来简单地确定,并将受试者放置在“增加的可能性”分类中。术语“可能性”在本文还与术语“概率”可互换地使用。在一些实施方案中,生物标志,包括IRS生物标志从生物样品获得。如本文所用的术语“生物样品”指可从动物提取、未处理、处理、稀释或浓缩的样品。生物样品适当地是生物流体,诸如全血、血清、血浆、唾液、尿液、汗液、腹水、腹膜液、滑液、羊水、脑脊髓液、组织活检等。在某些实施方案中,生物样品包含血液,特别是外周血,或其级分或提取物。通常,生物样品包括血细胞诸如成熟的白细胞、未成熟的白细胞或发育中的白细胞,包括淋巴细胞、多形核白细胞、嗜中性粒细胞、单核细胞、网织红细胞、嗜碱细胞、体腔细胞、血细胞、嗜酸性粒细胞、巨核细胞、巨噬细胞、树突细胞自然杀伤细胞、或这样的细胞的级分(例如,核酸或蛋白质级分)。在具体实施方案中,生物样品包含白细胞,包括外周血单核细胞(PBMC)。“从...获得”意指开始拥有。如此获得的生物样品或参考样品包括,例如,从特定来源分离或衍生的核酸提取物或多肽提取物。例如,提取物可从受试者的生物流体或组织中直接分离。如本文所用的术语“核酸”或“多核苷酸”包括RNA、mRNA、miRNA、cRNA、cDNA、mtDNA或DNA。该术语通常指长度为至少10个碱基的核苷酸(核糖核苷酸或脱氧核苷酸)的聚合形式或任一类型核苷酸的修饰形式。该术语包括DNA或RNA的单链和双链形式。“蛋白”、“多肽”和“肽”在本文可互换地使用,指氨基酸残基的聚合物及氨基酸残基的聚合物的变体和合成的类似物。在一些实施方案中,生物标志标识通过对具有或不具有状况的一个或更多个对照受试者的IRS生物标志测量或导出的IRS生物标志值的分析来确定。这些生物标志在本文中称为“参考IRS生物标志”。在特定实施中,个体对照受试者选自“健康对照受试者”、“非健康对照受试者”、“SIRS对照受试者”、“inSIRS对照受试者”、“ipSIRS对照受试者”、“具有ipSIRS的特定阶段的对照受试者”,其的说明性实例包括“轻度脓毒症对照受试者”、“严重脓毒症对照受试者”和“脓毒性休克对照受试者”等等),其在本文中还称为对照组(例如,“健康对照组”、“非健康对照组”、“SIRS对照组”、“inSIRS对照组”、“ipSIRS对照组”、“ipSIRS阶段组”,其的说明性实例包括“轻度脓毒症对照组”、“严重脓毒症对照组”和“脓毒性休克对照组”等等)。适当地,个体的测量的或导出的IRS生物标志值对应于各自IRS生物标志的水平或量或者对应于对该水平或量应用的函数。如本文所用,术语“水平”和“量”在本文可互换地使用,指定量的量(例如,重量或摩尔)、半定量的量、相对量(例如,在分类内的重量%或摩尔%)、浓度等。因此,这些术语包括样品中IRS生物标志的绝对量或相对量或浓度。在一些实施方案中,生物受试者中的至少一种状况的存在、不存在、程度或预后通过确定多个IRS生物标志值来建立,其中每个IRS生物标志值指示对从该生物受试者获得的生物样品中的至少一种IRS生物标志测量或导出的值。这些生物标志在本文中称为“样品IRS生物标志”。根据本发明,样品IRS生物标志对应于参考IRS生物标志(在本文中还称为“对应的IRS生物标志”)。“对应的IRS生物标志”意指在结构上和\/或功能上与参考IRS生物标志相似的IRS生物标志。代表性的对应的IRS生物标志包括参考IRS生物标志基因的等位基因变体(相同基因座)、同源物(不同基因座)及直向同源物(不同生物体)的表达产物。参考IRS生物标志基因和编码的IRS生物标志多核苷酸表达产物的核酸变体可包含核苷酸取代、缺失、倒位和\/或插入。变异可发生在编码区和非编码区的任一个或两者中。变异可产生保守和非保守氨基酸取代两者(与编码产物相比)。对于核苷酸序列,保守变体包括由于遗传密码的简并性而编码参考IRS多肽的氨基酸序列的那些序列。通常,特定IRS生物标志基因或多核苷酸的变体将与该特定核苷酸序列具有至少约40%、45%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多的序列同一性,如使用缺省参数通过本领域已知的序列比对程序确定的。在一些实施方案中,IRS生物标志基因或多核苷酸显示与选自SEQIDNO:1-1650的任一个的核苷酸序列至少约40%、45%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多的序列同一性,如表1中总结的。对应的IRS生物标志还包括显示与参考IRS生物标志多肽的氨基酸序列的基本序列相似性或同一性的氨基酸序列。通常,对应于参考氨基酸序列的氨基酸序列将显示与选自SEQIDNO:1651-3284的任一个的参考氨基酸序列至少约50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、97%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或甚至多达100%的序列相似性或同一性,如表2中总结的。在一些实施方案中,序列之间的序列相似性或序列同一性的计算如下进行:为了确定两种氨基酸序列或两种核酸序列的同一性百分比,序列出于最佳比较目的来比对(例如,为最佳比对,空位可被引入第一和第二氨基酸或核酸序列中的一个或两者,并且出于比较目的非同源序列可被忽略)。在一些实施方案中,出于比较目的比对的参考序列的长度是参考序列的长度的至少30%,通常至少40%,更通常至少50%、60%,及甚至更通常至少70%、80%、90%、100%。在对应氨基酸位置或核苷酸位置上的氨基酸残基或核苷酸然后进行比较。当在第一序列中的位置在第二序列中被对应位置上的相同氨基酸残基或核苷酸占据时,则分子在该位置是相同的。对于氨基酸序列比较,当在第一序列中的位置在第二序列中被对应位置上的相同或相似氨基酸残基(即,保守取代)占据时,则分子在该位置是相同的。考虑到为两种序列的最佳比对需要被引入的空位的数目和每个空位的长度,两种序列之间的同一性百分比是被在单独位置上的序列共享的相同氨基酸残基的数目的函数。相比之下,考虑到为两种序列的最佳比对需要被引入的空位的数目和每个空位的长度,两种序列之间的相似性百分比是被在单独位置上的序列共享的相同和相似氨基酸残基的数目的函数。序列的比较和序列之间的同一性百分比或相似性百分比的确定可使用数学算法来完成。在某些实施方案中,氨基酸序列之间的同一性百分比或相似性百分比如下来确定:使用已被掺入GCG软件包中的GAP程序(在http:\/\/www.gcg.com可得)的Needleman和Wünsch(1970,J.Mol.Biol.48:444-453)算法,使用Blossum62矩阵或PAM250矩阵以及16、14、12、10、8、6或4的空位权重和1、2、3、4、5或6的长度权重。在具体实施方案中,核苷酸序列之间的同一性百分比如下来确定:使用GCG软件包中的GAP程序(在http:\/\/www.gcg.com可得),使用NWSgapdna.CMP矩阵以及40、50、60、70或80的空位权重和1、2、3、4、5或6的长度权重。非限制性的参数集(且除非另外指定应该使用该参数集)包括Blossum62评分矩阵与12的空位罚分、4的空位延伸罚分和5的移码空位罚分。在一些实施方案中,氨基酸序列或核苷酸序列之间的同一性百分比或相似性百分比可如下来确定:使用已被并入ALIGN程序(2.0版)的E.Meyers和W.Miller(1989,Cabios,4:11-17)的算法,使用PAM120权重残基表、12的空位长度罚分和4的空位罚分。本文描述的核酸序列和蛋白序列可用作“查询序列”以针对公共数据库进行搜索,例如,鉴定其他家族成员或相关的序列。此类搜索可使用Altschul等的NBLAST和XBLAST程序(2.0版)(1990,J.Mol.Biol.,215:403-10)来进行。BLAST核苷酸搜索可用NBLAST程序,评分=100,字长=12,来进行,以获得与本发明的53010核酸分子同源的核苷酸序列。BLAST蛋白搜索可用XBLAST程序,评分=50,字长=3,来进行,以获得与本发明的YYYYY蛋白分子同源的氨基酸序列。出于比较目的为获得带空位的比对,GappedBLAST可如Altschul等(1997,NucleicAcidsRes,25:3389-3402)所述被利用。当利用BLAST和GappedBLAST程序时,可使用各自程序(例如,XBLAST和NBLAST)的缺省参数。对应的IRS生物标志多核苷酸还包括在如下所述的严格条件下与参考IRS生物标志多核苷酸,或它们的互补物杂交的核酸序列。如本文所用,术语“在低严格、中等严格、高严格或非常高严格条件下杂交”描述了用于杂交和洗涤的条件。“杂交”在本文中用于表示互补核苷酸序列配对产生DNA-DNA杂合体或DNA-RNA杂合体。互补碱基序列是通过碱基配对规则相关的那些序列。在DNA中,A与T配对且C与G配对。在RNA中,U与A配对且C与G配对。在这方面,如本文所用的术语“匹配”和“错配”指配对的核苷酸在互补核酸链中的杂交潜力。匹配的核苷酸有效杂交,诸如以上提及的经典A-T和G-C碱基对。错配是不有效杂交的核苷酸的其他组合。用于进行杂交反应的指导可见于Ausubel等,(1998,同上),6.3.1-6.3.6节。水性方法和非水性方法在该参考文献中被描述,且任一个可被使用。本文提及低严格条件包括和涵盖从至少约1%v\/v至至少约15%v\/v甲酰胺和从至少约1M至至少约2M盐用于在42°℃杂交,以及至少约1M至至少约2M盐用于在42°℃洗涤。低严格条件还可包括1%牛血清白蛋白(BSA)、1mMEDTA、0.5MNaHPO4(pH7.2)、7%SDS用于在65°℃杂交,以及(i)2°×SSC、0.1%SDS;或(ii)0.5%BSA、1mMEDTA、40mMNaHPO4(pH7.2)、5%SDS用于在室温洗涤。低严格条件的一个实施方案包括在6°×氯化钠\/柠檬酸钠(SSC)中在约45°℃杂交,随后是在0.2×SSC、0.1%SDS中至少在50°℃的两次洗涤(洗涤温度可增加至55°℃用于低严格条件)。中度严格条件包括和涵盖从至少约16%v\/v至至少约30%v\/v甲酰胺和从至少约0.5M至至少约0.9M盐用于在42°℃杂交,以及至少约0.1M至至少约0.2M盐用于在55°℃洗涤。中度严格条件还可包括1%牛血清白蛋白(BSA)、1mMEDTA、0.5MNaHPO4(pH7.2)、7%SDS用于在65°℃杂交,以及(i)2°×SSC、0.1%SDS;或(ii)0.5%BSA、1mMEDTA、40mMNaHPO4(pH7.2)、5%SDS用于在60-65°℃洗涤。中度严格条件的一个实施方案包括在6°×SSC中在约45°℃杂交,随后是在0.2°×SSC、0.1%SDS中在60°℃一次或更多次洗涤。高严格条件包括和涵盖从至少约31%v\/v至至少约50%v\/v甲酰胺和从约0.01M至约0.15M盐用于在42°℃杂交,以及约0.01M至约0.02M盐用于在55°℃洗涤。高严格条件还可包括1%BSA、1mMEDTA、0.5MNaHPO4(pH7.2)、7%SDS用于在65°℃杂交,以及(i)0.2°×SSC、0.1%SDS;或(ii)0.5%BSA、1mMEDTA、40mMNaHPO4(pH7.2)、1%SDS用于在超过65°℃的温度洗涤。高严格条件的一个实施方案包括在6°×SSC中在约45°℃杂交,随后是在0.2°×SSC、0.1%SDS中在65°℃一次或更多次洗涤。在某些实施方案中,对应的IRS生物标志多核苷酸是在非常高严格条件下与公开的核苷酸序列杂交的多核苷酸。非常高严格条件的一个实施方案包括在0.5M磷酸钠、7%SDS在65°℃杂交,随后是在0.2°×SSC、1%SDS在65°℃一次或更多次洗涤。其他严格条件是本领域熟知的且熟练受送达人将认识到,多种因素可被操作,以优化杂交的特异性。最后洗涤的严格度的优化可用于确保杂交的程度高。对于详细的实例,参见Ausubel等,同上,在2.10.1至2.10.16页以及Sambrook等(1989,同上)在1.101至1.104节。本文公开的IRS生物标志各自具有对于诊断选自以下的至少状况的存在、不存在或程度的显著灵敏度和特异性:健康状况(例如,正常状况或其中inSIRS和inSIRS是不存在的状况)、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的阶段(例如,具有特定严重程度的ipSIRS的阶段,诸如轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒症休克)。因此,在不依赖于生物标志之间的低互相关性的使用的方法、装置及试剂盒中使用个体IRS生物标志诊断至少状况的存在、不存在或程度是可行的。在该类型的说明性实例中,本发明包括对诊断inSIRS或健康状况存在于或不存在于生物受试者中有用的方法、试剂盒及装置,所述方法、试剂盒及装置适当地包括:(1)将参考生物标志标识与选自inSIRS和健康状况的状况的存在或不存在相关,其中参考生物标志标识评价至少一种IRS生物标志;(2)获得来自受试者的样品的生物标志标识,其中样品生物标志标识评价参考生物标志标识中的个体IRS生物标志的对应的IRS生物标志;以及(3)基于样品生物标志标识和参考生物标志标识诊断受试者中状况的存在或不存在,其中个体IRS生物标志是选自由如本文定义的A组IRS生物标志基因和B组IRS生物标志基因的IRS生物标志基因的表达产物。在其他非限制性实例中,方法、装置及试剂盒对诊断ipSIRS或健康状况存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(1)将参考生物标志标识与选自ipSIRS和健康状况的状况的存在或不存在相关,其中参考生物标志标识评价至少一种IRS生物标志;(2)获得来自受试者的样品的生物标志标识,其中样品生物标志标识评价参考生物标志标识中的个体IRS生物标志的对应的IRS生物标志;以及(3)基于样品生物标志标识和参考生物标志标识诊断受试者中状况的存在或不存在,其中个体IRS生物标志是选自由如本文定义的C组IRS生物标志基因和D组IRS生物标志基因的IRS生物标志基因的表达产物。在仍其他非限制性实例中,方法、装置及试剂盒对诊断inSIRS或ipSIRS存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(1)将参考生物标志标识与选自inSIRS和ipSIRS的状况的存在或不存在相关,其中参考生物标志标识评价至少一种IRS生物标志;(2)获得来自受试者的样品的生物标志标识,其中样品生物标志标识评价参考生物标志标识中的个体IRS生物标志的对应的IRS生物标志;以及(3)基于样品生物标志标识和参考生物标志标识诊断受试者中状况的存在或不存在,其中个体IRS生物标志是选自由如本文定义的E组IRS生物标志基因和F组IRS生物标志基因的IRS生物标志基因的表达产物。在仍其他说明性实例中,方法、装置及试剂盒对诊断轻度脓毒症或严重脓毒症存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(1)将参考生物标志标识与选自轻度脓毒症和严重脓毒症的状况的存在或不存在相关,其中参考生物标志标识评价至少一种IRS生物标志;(2)获得来自受试者的样品的生物标志标识,其中样品生物标志标识评价参考生物标志标识中的个体IRS生物标志的对应的IRS生物标志;以及(3)基于样品生物标志标识和参考生物标志标识诊断受试者中状况的存在或不存在,其中个体IRS生物标志是选自由如本文定义的K组IRS生物标志基因和L组IRS生物标志基因的IRS生物标志基因的表达产物。在仍其他说明性实例中,方法、装置及试剂盒对诊断轻度脓毒症或脓毒性休克存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(1)将参考生物标志标识与选自轻度脓毒症和脓毒性休克的状况的存在或不存在相关,其中参考生物标志标识评价至少一种IRS生物标志;(2)获得来自受试者的样品的生物标志标识,其中样品生物标志标识评价参考生物标志标识中的个体IRS生物标志的对应的IRS生物标志;以及(3)基于样品生物标志标识和参考生物标志标识诊断受试者中状况的存在或不存在,其中个体IRS生物标志是选自由如本文定义的M组IRS生物标志基因和N组IRS生物标志基因的IRS生物标志基因的表达产物。在其他非限制性实例中,方法、装置及试剂盒对诊断严重脓毒症或脓毒性休克存在于或不存在于生物受试者中有用,所述方法、装置及试剂盒适当地包括:(1)将参考生物标志标识与选自严重脓毒症和脓毒性休克的状况的存在或不存在相关,其中参考生物标志标识评价至少一种IRS生物标志;(2)获得来自受试者的样品的生物标志标识,其中样品生物标志标识评价参考生物标志标识中的个体IRS生物标志的对应的IRS生物标志;以及(3)基于样品生物标志标识和参考生物标志标识诊断受试者中状况的存在或不存在,其中个体IRS生物标志是选自由如本文定义的O组IRS生物标志基因和P组IRS生物标志基因的IRS生物标志基因的表达产物。生物标志可使用任何适合的技术来定量或检测。在特定实施方案中,包括IRS生物标志的生物标志使用确定个体生物标志的水平或丰度的试剂来定量。该类型的非限制性试剂包括用于在基于核酸的测定和基于蛋白的测定中使用的试剂。在说明性基于核酸的测定中,核酸根据标准方法从包含在生物样品中的细胞来分离(Sambrook,等,1989,同上;以及Ausubel等,1994,同上)。核酸通常被分级分离(例如,聚A+RNA)或全细胞RNA。当RNA作为检测的对象(subject)时,可期望将RNA转换成互补的DNA。在一些实施方案中,核酸通过模板依赖性核酸扩增技术来扩增。许多模板依赖性过程可用于扩增存在于给定模板样品中的IRS生物标志序列。示例性核酸扩增技术是聚合酶链式反应(称为PCR),其被详细地描述于美国专利号4,683,195、4,683,202和4,800,159,Ausubel等(同上)和Innis等(“PCRProtocols”,AcademicPress,Inc.,SanDiegoCalif.,1990)中。简言之,在PCR中,与生物标志序列的相对互补链上的区域互补的两种引物序列被制备。将过量的脱氧核苷三磷酸连同DNA聚合酶,例如,Taq聚合酶添加至反应混合物。如果同源IRS生物标志序列存在于样品中,引物将与生物标志结合并且聚合酶将引起引物沿着生物标志序列通过加上核苷酸被延伸。通过升高和降低反应混合物的温度,延伸的引物将从生物标志分离,形成反应产物,过量的引物将与生物标志且与反应产物结合并重复该过程。逆转录酶PCR扩增程序可被进行以定量扩增的mRNA的量。将RNA逆转录为cDNA的方法是熟知的并描述于Sambrook等,1989,同上中。用于逆转录的替代性方法利用热稳定的RNA依赖性DNA聚合酶。这些方法描述于WO90\/07641中。聚合酶链式反应方法是本领域熟知的。在某些有利的实施方案中,模板依赖性扩增包括实时定量转录物。例如,RNA或DNA可使用实时PCR技术来定量(Higuchi,1992,等,Biotechnology10:413-417)。通过确定靶DNA在已完成相同数目的循环并且在其线性范围内的PCR反应中的扩增产物的浓度,确定特定靶序列在原始DNA混合物中的相对浓度是可能的。如果DNA混合物是从不同的组织或细胞分离的RNA合成的cDNA,对于各自组织或细胞,靶序列源自的特定mRNA的相对丰度可被确定。PCR产物的浓度和相对mRNA丰度之间的这种正比例仅在PCR反应的线性范围内如此。靶DNA在曲线的平台部分中的最终浓度通过反应混合物中试剂的可用性来确定,并独立于靶DNA的原始浓度。在具体实施方案中,多重串联PCR(MT-PCR)被采用,其使用两个步骤过程用于从少量RNA或DNA的基因表达谱分析,如例如在美国专利申请公布号20070190540中所述的。在第一个步骤中,RNA被转化成cDNA,并使用多重基因特异性引物来扩增。在第二个步骤中,每个单独的基因通过实时PCR来定量。在某些实施方案中,靶核酸使用本领域技术人员熟知的印迹技术来定量。DNA印迹包括使用DNA作为靶,而RNA印迹包括使用RNA作为靶。尽管cDNA印迹在印迹或RNA物类的多个方面是类似的,每种提供不同类型的信息。简言之,探针用于靶向已被固定化在适合的基质(经常是硝酸纤维素的过滤器)上的DNA或RNA物类。不同的物类应该在空间上分开,以促进分析。这通常通过核酸物类的凝胶电泳,随后是向过滤器的“印迹”来完成。随后,将印迹的靶与探针(通常标记的)在促进变性和再杂交的条件下孵育。因为探针被设计为与靶碱基配对,探针将在复性条件下结合靶序列的一部分。未结合的探针然后被去除,并且检测如以上描述来完成。在检测\/定量之后,人们可将给定受试者中所观察的结果与对照反应组或统计学上显著的参考组或如本文定义的对照受试者的群体比较。以这种方式,将检测的IRS生物标志核酸的量与疾病的进展或严重程度相关是可能的。如本文所用,术语“探针”指与特定的序列或亚序列或另一种分子的其他部分结合的分子。除非另有说明,术语“探针”通常指与另一种核酸(在本文中还称为“靶多核苷酸”)通过互补碱基配对结合的核酸探针。取决于杂交条件的严格性,探针可结合缺乏与探针的完全序列互补性的靶多核苷酸。探针可直接或间接标记,并在其范围内包括引物。“引物”意指当与DNA的链配对时,能够在适合的聚合剂的存在下启动引物延伸产物的合成的寡核苷酸。引物优选地是单链的,以用于在扩增中的最大效率,但可选地可以是双链的。引物必须足够长以在聚合剂的存在下引发延伸产物的合成。引物的长度取决于许多因素,包括应用、待采用的温度、模板反应条件、其他试剂以及引物的来源。例如,取决于靶序列的复杂性,引物可以是在引物的3'末端至少约5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、26个、27个、28个、29个、30个、35个、40个、50个、75个、100个、150个、200个、300个、400个、500个至长度比模板序列短一个碱基,以允许核酸链的延伸,尽管引物的5'末端可延伸超出模板序列的3'末端的长度。在某些实施方案中,引物可以是大的多核苷酸,诸如从约35个核苷酸至数千个碱基或更多。引物可被选择为与它被设计成与之杂交的模板上的序列“基本上互补”,并用作用于合成的起始的位点。“基本上互补”意指该引物是足够互补的,以与靶多核苷酸杂交。期望地,引物不包含与该引物被设计成与之杂交的模板的错配,但这不是必不可少的。例如,非互补核苷酸残基可被附连至引物的5'末端,引物序列的剩余部分与模板互补。可选地,非互补核苷酸残基或非互补核苷酸残基的一段可散布进引物中,条件是该引物序列具有与与其杂交的模板序列的足够的互补性,并从而形成用于合成引物的延伸产物的模板。还预期了基于生物芯片的技术诸如被Hacia等(1996,NatureGenetics14:441-447)和Shoemaker等(1996,NatureGenetics14:450-456)描述的那些。简言之,这些技术包括用于快速和准确分析大数目基因的定量方法。通过用寡核苷酸将基因加标签或使用固定的核酸探针阵列,人们可采用生物芯片技术隔离靶分子作为高密度阵列并基于杂交筛选这些分子。还参见Pease等(1994,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91:5022-5026);Fodor等(1991,Science251:767-773)。简言之,针对IRS生物标志多核苷酸的核酸探针被制备并附连至用于如本文概述的筛选和诊断方法的生物芯片。附连至生物芯片的核酸探针被设计为与特定表达的IRS生物标志核酸,即靶序列(样品的靶序列或其他探针序列,例如在夹心测定(sandwichassays)中的)基本上互补,使得靶序列和本发明的探针的杂交发生。这种互补性不一定是完美的;可存在任何数目的碱基对错配,其将干扰靶序列和本发明的核酸探针之间的杂交。然而,如果错配的数目是如此之大使得甚至在最少严格的杂交条件下没有杂交可发生,则该序列不是互补的靶序列。在某些实施方案中,每序列多于一个的探针被使用,使用重叠探针或针对靶的不同部分的探针。即,两个、三个、四个或更多个探针,三个是期望的,用于构建特定靶的冗余。探针可以是重叠的(即具有一些共同的序列),或单独的。在说明性生物芯片分析中,将生物芯片上的寡核苷酸探针在有利于特异性杂交的条件下暴露于或接触怀疑包含一种或更多种IRS生物标志多核苷酸的核酸样品。单链或双链的DNA或RNA的样品提取物,可从生物材料的流体悬液来制备,或通过研磨生物材料,或按照细胞裂解步骤,其包括但不限于,通过SDS(或其他去垢剂)、渗透压休克、异硫氰酸胍和溶菌酶处理实现的裂解。可在本发明的方法中使用的适合的DNA包括cDNA。这样的DNA可通过许多常用方案中的任一个,如例如描述于Ausubel,等,1994,同上以及Sambrook,等,1989同上中的来制备。可在本发明的方法中使用的适合的RNA包括信使RNA、从DNA转录的互补RNA(cRNA)或基因组RNA或亚基因组RNA。这样的RNA可使用如例如在Ausubel等1994,同上以及Sambrook,等1989,同上)的相关节段中描述的标准方案来制备。cDNA可被片段化,例如,通过超声处理或通过用限制性内切酶处理。适当地,cDNA被片段化,使得所得的DNA片段的长度大于固定化寡核苷酸探针的长度,但足够小,以允许在适合的杂交条件下对其的快速接近。可选地,cDNA的片段可被选择并使用如例如以上所述的适合的核苷酸扩增技术(包括适当的随机引物或特异性引物)来扩增。通常靶IRS生物标志多核苷酸被可检测地标记,使得其与单独的探针的杂交可被确定。靶多核苷酸通常用报道分子可检测地标记,报道分子的说明性实例包括色原、催化剂、酶、荧光染料、化学发光分子、生物发光分子、镧系离子(例如、Eu34)、放射性同位素和直接的视觉标记。在直接视觉标记的情况下,可利用胶体金属或非金属颗粒、染料颗粒、酶或底物、有机聚合物、胶乳颗粒、脂质体、或包含信号产生物质的其他囊泡等。该类型的说明性标记包括大胶体,例如,金属胶体诸如来自氧化金、氧化硒、氧化银、氧化锡和氧化钛的那些。在其中酶被用作直接视觉标记的一些实施方案中,将生物素化的碱基掺入靶多核苷酸。杂合体形成步骤可在适合将寡核苷酸探针杂交至测试核酸(包括DNA或RNA)的条件下进行。在这方面,可参考,例如,NUCLEICACIDHYBRIDIZATION,APRACTICALAPPROACH(Homes和Higgins,编著)(IRLpress,WashingtonD.C.,1985)。通常,杂交是否发生受以下的影响:寡核苷酸探针和待测的多核苷酸序列的长度、pH、温度、单价阳离子和二价阳离子的浓度、G和C核苷酸在杂合体形成区域的比例、介质的粘度和变性剂的可能存在。这样的变量还影响杂交所需的时间。因此,优选的条件将取决于特定的应用。然而,这样的经验性条件可常规地确定而无需过度的实验。在杂合体形成步骤之后,将探针用杂交缓冲液洗涤以去除任何未结合的核酸。该洗涤步骤仅保留结合的靶多核苷酸。探针然后被检查,以鉴定哪些探针已与靶多核苷酸杂交。杂交反应然后被检测,以确定哪个该探针已与相应靶序列杂交。取决于与靶多核苷酸缔合的报道分子的性质,信号可被用仪器如下来检测:通过用光照射荧光标记并以荧光计检测荧光;通过提供酶系统以产生可使用分光光度计检测的染料;或使用反射计检测染料颗粒或有色胶体金属或非金属颗粒;在使用放射性标记或化学发光分子的情况下采用辐射计数器或放射自显影。因此,检测装置可适于检测或扫描与标记缔合的光,该光可包括荧光、发光、聚焦光束或激光。在这样的情况下,电荷耦合器件(CCD)或光电管可用于扫描来自微阵列中每个位置的探针:靶多核苷酸杂合体的光线发射,并将数据直接记录在数字式计算机中。在一些情况下,信号的电子检测可能不是必要的。例如,用与核酸阵列格式缔合的酶促生成的色斑,阵列的目视检查将允许解析阵列上的模式。在核酸阵列的情况下,检测装置被适当与模式识别软件配合将来自阵列的信号的模式转换成普通语言遗传谱。在某些实施方案中,特异于不同的IRS生物标志多核苷酸的寡核苷酸探针呈核酸阵列的形式,并且由阵列上的报道分子生成的信号的检测使用‘芯片阅读器’来进行。可被‘芯片阅读器’使用的检测系统例如被Pirrung等(美国专利号5,143,854)描述。芯片阅读器通常将还掺入一些信号处理,以确定在特定阵列位置或特征的信号是否是真阳性或也许是杂散信号。示例性芯片阅读器例如被Fodor等(美国专利号5,925,525)描述。可选地,当阵列使用单独可寻址种类的标记的微珠的混合物制成时,该反应可使用流式细胞术来检测。在某些实施方案中,IRS生物标志是靶RNA(例如,mRNA)或靶RNA的DNA拷贝,其的水平使用在至少低、中度或高度严格条件下与靶RNA或与DNA拷贝杂交的至少一种核酸探针来测量,其中核酸探针包括IRS生物标志多核苷酸的至少15个(例如,15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、26个、27个、28个、29个、30个或更多个)连续的核苷酸。在一些实施方案中,靶RNA或其DNA拷贝的测量的水平或丰度被归一化为参考RNA或参考RNA的DNA拷贝的水平或丰度。适当地,核酸探针在固体支撑物或半固体支撑物上固定化。在该类型的说明性实例中,核酸探针形成核酸探针的空间阵列的一部分。在一些实施方案中,与靶RNA或与DNA拷贝结合的核酸探针的水平通过杂交(例如,使用核酸阵列)来测量。在其他实施方案中,与靶RNA或与DNA拷贝结合的核酸探针的水平通过核酸扩增(例如,使用聚合酶链式反应(PCR))来测量。在仍其他实施方案中,与靶RNA或与DNA拷贝结合的核酸探针的水平通过核酸酶保护测定来测量。在其他实施方案中,IRS生物标志蛋白水平使用本领域已知的基于蛋白的测定进行测定。例如,当IRS生物标志蛋白是酶时,蛋白可基于其催化活性或基于包含在样品中的蛋白的分子数目来定量。基于抗体的技术可被采用,包括,例如,免疫测定,诸如酶联免疫吸附测定(ELISA)和放射免疫测定(RIA)。在具体实施方案中,允许同时检测和\/或定量大量蛋白的蛋白捕获阵列被采用。例如,过滤膜上的低密度蛋白阵列,诸如通用蛋白阵列系统(Ge,2000NucleicAcidsRes.28(2):e3)允许使用标准ELISA技术和扫描电荷耦合器件(CCD)检测器成像排列的抗原。免疫传感器阵列也已被开发,其能够同时检测临床分析物。现在,使用蛋白阵列序型分析(profile)健康受试者或患病的受试者、以及药物处理前和药物处理后的受试者的体液中诸如血清中的蛋白表达是可能的。示例性蛋白捕获阵列包括包含空间寻址的抗原结合分子的阵列(通常被称为抗体阵列),其可促进定义蛋白质组或亚蛋白质组的许多蛋白的广泛平行分析。抗体阵列已被证明具有特异性和可接受的背景的所要求的特性,并且一些是商购可得的(例如,BDBiosciences、Clontech、BioRad和Sigma)。用于制备抗体阵列的多种方法已被报道(参见,例如,Lopez等,2003J.Chromatogram.B787:19-27;Cahill,2000TrendsinBiotechnology7:47-51;美国专利申请公布2002\/0055186;美国专利申请公布2003\/0003599;PCT公布WO03\/062444;PCT公布WO03\/077851;PCT公布WO02\/59601;PCT公布WO02\/39120;PCT公布WO01\/79849;PCT公布WO99\/39210)。此类阵列的抗原结合分子可识别由细胞或细胞群表达的蛋白的至少一个子集,其的说明性实例包括生长因子受体、激素受体、神经递质受体、儿茶酚胺受体、氨基酸衍生物受体、细胞因子受体、细胞外基质受体、抗体、凝集素、细胞因子、丝氨酸蛋白酶抑制剂、蛋白酶、激酶、磷酸酶、ras样GTP酶、水解酶、类固醇激素受体、转录因子、热休克转录因子、DNA结合蛋白、锌指蛋白、亮氨酸拉链蛋白质、同源结构域蛋白、细胞内信号转导调节因子和效应因子、凋亡相关因子、DNA合成因子、DNA修复因子、DNA重组因子和细胞表面抗原。单独空间上不同的蛋白捕获剂通常被附连至通常是平面或波形的支撑物表面。常见的物理支撑物包括载玻片、硅、微孔、硝酸纤维素或PVDF膜和磁珠以及其他微珠。悬液中的颗粒也可用作阵列的基础,只要它们被为鉴定编码;系统包括颜色编码微球(例如,可从Luminex、Bio-Rad和NanomicsBiosystems获得)和半导体纳米晶体(例如,可从QuantumDots获得的QDotsTM),以及条形码珠(可从Smartbeads获得的UltraPlexTM)和多金属微米棒(可从Surromed获得的NanobarcodesTM颗粒)。珠还可被组装成在半导体芯片上的平面阵列(例如,可从LEAPStechnologyandBioArraySolutions获得)。当使用颗粒时,单独的蛋白捕获剂通常被附连至单独的颗粒,以提供阵列的空间定义或间隔。颗粒然后可单独地但平行地以区室化的方式被测定,例如在微量滴定板的孔中或在单独的试管中。在操作中,将任选地片段化以形成肽片段的蛋白样品(参见,例如,美国专利申请公布2002\/0055186),在适合于蛋白或肽结合的条件下递送至蛋白捕获阵列,并且该阵列被洗涤以从该阵列去除样品的未结合的或非特异性结合的组分。接着,与阵列的每个特征结合的蛋白或肽的存在或量使用适合的检测系统来检测。与阵列的特征结合的蛋白的量可相对于与阵列的第二特征结合的第二蛋白的量来确定。在某些实施方案中,样品中第二蛋白的量已经是已知的或已知是不变的。在特定实施方案中,IRS生物标志是靶多肽,所述靶多肽的水平使用与该靶多肽免疫相互作用的至少一种抗原结合分子来测量。在这些实施方案中,靶多肽的测量的水平被归一化为参考多肽的水平。适当地,抗原结合分子在固体支撑物或半固体支撑物上固定化。在该类型的说明性实例中,抗原结合分子形成抗原结合分子的空间阵列的一部分。在一些实施方案中,与靶多肽结合的抗原结合分子的水平通过免疫测定(例如,使用ELISA)来测量。本文提及“免疫相互作用”包括提及任何相互作用、反应或分子之间的缔合的其他形式,并且特别地其中分子的一个是免疫系统的组分或模拟免疫系统的组分。检测和定量本发明的生物标志,包括IRS生物标志,所需的所有必要试剂可在试剂盒中组装在一起。在一些实施方案中,试剂盒包括:(i)允许第一生物标志的定量(例如,确定水平或丰度)的试剂;以及(ii)允许第二生物标志的定量(例如,确定水平或丰度)的试剂,其中所述第一生物标志和所述第二生物标志具有位于在±0.9之间的互相关性范围内的关于至少一种状况(例如,以下的至少一种:健康状况和一种或更多种疾病诸如但不限于inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的阶段(例如,具有特定严重程度的ipSIRS的阶段诸如轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克))的互相关性,且其中对于对生物受试者测量或由生物受试者导出的所述第一生物标志和所述第二生物标志的各自生物标志值的组合具有大于或等于代表所述第一生物标志和所述第二生物标志的组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在、或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值是至少0.3的解释方差。在一些实施方案中,试剂盒还包括(iii)允许第三生物标志的定量(例如,确定水平或丰度)的试剂;以及(ii)允许第四生物标志的定量(例如,确定水平或丰度)的试剂,其中所述第三生物标志和所述第四生物标志具有位于在±0.9之间的互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,且其中对于对生物受试者测量或由生物受试者导出的所述第三生物标志和所述第四生物标志的各自生物标志值的组合具有大于或等于代表所述第三生物标志和所述第四生物标志的组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在、或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值是至少0.3的解释方差。在有利的实施方案中,本发明的试剂盒对诊断至少一种状况的存在、不存在或程度,或者提供至少一种状况的预后有用,其中所述至少一种状况选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的阶段。在这些实施方案中,IRS生物标志适当地选自如本文以上及别处广泛描述的组。在本发明的上下文中,“试剂盒”被理解为意指包含进行本发明的方法所需的、被包装以允许它们的运输和储存的不同的试剂的产品。适合于包装试剂盒的组分的材料包括水晶、塑料(聚乙烯、聚丙烯、聚碳酸酯等)、瓶子、小瓶、纸、包装(envelopes)等。另外,本发明的试剂盒可包含用于同时、顺序或单独使用包含在试剂盒中的不同组分的说明书。说明书可呈印刷的材料的形式或呈能够储存说明书使得它们能够被受试者阅读的电子支撑物的形式,诸如电子存储介质(磁盘、磁带等)、光学介质(CD-ROM、DVD)等。可选地或另外,介质可包含提供说明书的因特网地址。“允许生物标志的定量的试剂”意指允许生物标志的定量的化合物或材料、或者化合物或材料的组。在特定实施方案中,化合物、材料或者化合物或材料的组允许确定基因(例如,IRS生物标志基因)的表达水平,包括不限于RNA材料的提取、对应RNA的水平的确定等等,用于对应cDNA的合成的引物、用于DNA的扩增的引物、和\/或能够与由基因编码的RNA(或对应cDNA)特异性杂交的探针、TaqMan探针等等。试剂盒还可任选地包括用于检测标记、阳性和阴性对照的适当的试剂、洗涤溶液、印迹膜、微量滴定板、稀释缓冲剂等。例如,基于核酸的检测试剂盒可包括(i)生物标志多核苷酸(例如,IRS生物标志多核苷酸)(其可用作阳性对照),(ii)引物或探针,其与生物标志多核苷酸(例如,IRS生物标志多核苷酸)特异性杂交。还可包括适合于扩增核酸的酶,包括多种聚合酶(逆转录酶、Taq酶、SequenaseTM、DNA连接酶等等,取决于采用的核酸扩增技术),脱氧核苷酸和缓冲液,以提供用于扩增的必要的反应混合物。此类试剂盒通常将还包括用于每种单独的试剂和酶以及每种引物或探针的在适当的装置中的不同的容器。可选地,基于蛋白的检测试剂盒可包括(i)生物标志多肽(例如,IRS生物标志多肽)(其可用作阳性对照),(ii)抗体,其与生物标志多肽(例如,IRS生物标志肽)特异性结合。试剂盒还可以以下为特征:用于进行本文描述的测定中的一个的多种装置(例如,一种或更多种)和试剂(例如,一个或更多个);和\/或使用试剂盒定量生物标志基因(例如,IRS生物标志基因)的表达的印刷的说明书。能够任选地与可检测的标记物缔合的本文描述的试剂,可以以以下的形式展示:为了与在实施例或下面描述的测定,例如,本文描述的RT-PCR或QPCR技术一起使用而调整的微流体卡、芯片或室、微阵列或试剂盒。术语“微阵列”指可杂交的阵列元件,例如,探针(包括引物)、配体、生物标志核酸序列或蛋白序列在基板上的排列。试剂还在用于检测和定量本发明的生物标志的组合物中具有实用性。例如,逆转录酶可用来逆转录核酸样品中的RNA转录物,包括mRNA,以产生逆转录的转录物,包括逆转录的mRNA(还称为“cDNA”)。核酸样品适当地来源于免疫系统的组分,其的代表性实例包括如例如以上广泛讨论的先天免疫系统和适应性免疫系统的组分。在特定实施方案中,逆转录的RNA是血细胞(例如,外周血细胞)来源的。适当的,逆转录的RNA是白细胞来源的。试剂适当地用来定量逆转录的转录物。例如与逆转录的转录物杂交的寡核苷酸引物可被用来经由适合的核酸扩增技术,例如,本文描述的RT-PCR或QPCR技术扩增逆转录的转录物的至少一部分。可选地,寡核苷酸探针可被用来使用如例如以上描述的核酸杂交分析技术(例如,微阵列分析)与逆转录的转录物杂交用于定量。因此,在一些实施方案中,各自的寡核苷酸引物或探针与在本发明的组合物中的逆转录的转录物的互补核酸序列杂交。组合物通常包括标记的试剂,用于检测和\/或定量逆转录的转录物。该类型的代表性试剂包括与RNA转录物或逆转录的RNA杂交的标记的寡核苷酸引物或探针、标记的RNA、标记的逆转录的RNA以及标记的寡核苷酸衔接物或标签(例如,标记的RNA或DNA衔接物或标签),用于标记(例如,末端标记诸如3'末端标记)RNA或逆转录的RNA。引物、探针、RNA或逆转录的RNA(即,cDNA)(无论标记或未标记的)可被固定化或在溶液中游离。该类型的代表性试剂包括与逆转录的转录物以及标记的逆转录的转录物杂交的标记的寡核苷酸引物或探针。标记物可以是如本领域已知的任何报道物分子,其的说明性实例在本文以上和别处被描述。本发明还包括未逆转录的RNA实施方案,在该实施方案中,cDNA未被制备,且RNA转录物直接是分析对象。因此,在其他实施方案中,试剂被适当地用来直接定量RNA转录物。例如,寡核苷酸探针可被用来使用如例如以上描述的核酸杂交分析技术(例如,微阵列分析)与转录物杂交用于定量本发明的免疫系统生物标志。因此,在一些实施方案中,各自的寡核苷酸探针与在本发明的组合物中的免疫系统生物标志转录物的互补核酸序列杂交。在该类型的说明性实例中,组合物可包括与转录物杂交的标记的试剂用于检测和\/或定量转录物。该类型的代表性试剂包括与转录物以及标记的转录物杂交的标记的寡核苷酸探针。引物或探针可被固定化或在溶液中游离。术语“固定化”意指,感兴趣的分子物类适当地通过共价连接被固定至固体支撑物。取决于分子物类的分子性质,该共价连接可通过不同的方法来实现。此外,分子物类还可通过静电力、疏水性或亲水性相互作用或范德瓦尔斯力固定在固体支撑物上。以上描述的物理化学相互作用通常发生在分子之间的相互作用中。在特定实施方案中,需要做的只是,分子(例如,核酸或蛋白)在于其中意图使用支撑物的条件下保持固定或附接至支撑物,例如在要求核酸扩增和\/或测序的应用或在抗体结合测定中。例如,寡核苷酸或引物被固定化使得3'末端可用于酶促延伸和\/或序列的至少一部分能够与互补序列杂交。在一些实施方案中,固定化可经由与表面附连的引物杂交发生,在该情况下,固定化引物或寡核苷酸可以3'-5'方向。在其他实施方案中,固定化可通过除了碱基配对杂交以外的方法,诸如共价附连而发生。如本文所用的术语“固体支撑物”指分子物类,诸如核酸和多肽可被固定化至其的固体惰性表面或主体。固体支撑物的非限制性实例包括玻璃表面、塑料表面、乳胶、葡聚糖、聚苯乙烯表面、聚丙烯表面、聚丙烯酰胺凝胶、金表面以及硅片。在一些实施方案中,固体支撑物呈膜、芯片或颗粒的形式。例如,固体支撑物可以是玻璃表面(例如,流动池通道的平坦表面)。在一些实施方案中,固体支撑物可包括已诸如通过应用包括允许与分子诸如多核苷酸共价附连的反应基团的中间材料的层或涂层被“官能化”的惰性基材或基质。通过非限制性实例的方式,此类支撑物可包括被支持在惰性基材诸如玻璃上的聚丙烯酰胺水凝胶。分子(例如,多核苷酸)可被直接地共价地附接至中间材料(例如,水凝胶),但是中间材料其自身可被非共价地附接至基材或基质(例如,玻璃基材)。支撑物可包括各自具有不同附连的分子物类的多个颗粒或珠。本发明还延伸至inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的管理,或inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的进一步进展的预防,或在inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)在受试者中的存在的阳性诊断之后评估疗法在受试者中的效力。inSIRS或ipSIRS状况的管理通常是高度密集的,并且可包括鉴定和改善根本原因以及侵入性使用治疗性化合物,诸如,血管活性化合物、抗生素、类固醇、针对内毒素的抗体、抗肿瘤坏死因子剂、重组蛋白C。另外,如例如在Cohen和Glauser(1991,Lancet338:736-739)中描述的旨在恢复和保护器官功能的姑息疗法可被使用,诸如静脉输液和输氧和严格的血糖控制。用于ipSIRS的疗法被综述于Healy(2002,Ann.Pharmacother.36(4):648-54)和Brindley(2005,CJEM.7(4):227)以及Jenkins(2006,JHospMed.1(5):285-295)中。通常,治疗剂将连同药学上可接受的载体以药物(或兽用药)组合物及以实现其预期目的的有效量来施用。施用至受试者的活性化合物的剂量应该足以实现随时间受试者中的有益响应,诸如减少、或缓解inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的症状。待施用的药物活性化合物的量可取决于被治疗的受试者,包括其年龄、性别、体重和一般健康状况。在这方面,用于施用的活性化合物的精确量将取决于从业者的判断。在确定待施用的活性化合物在治疗或预防inSIRS、ipSIRS或ipSIRS特定阶段中的有效量时,医学从业者或兽医师可评估与inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的存在相关的任何症状的严重程度,所述症状包括炎症、血压异常、心动过速、呼吸急促发热、寒颤、呕吐、腹泻、皮疹、头痛、神志不清、肌肉疼痛、痉挛。在任何情况下,本领域技术人员可容易地确定治疗剂的适合剂量和适合的治疗方案而无需过度实验。治疗剂可与辅助(姑息)疗法协同施用,以增加至主要器官的氧气供应,增加至主要器官的血流量和\/或减少炎症反应。这样的辅助疗法的说明性实例包括非甾体抗炎药(NSAID)、静脉内盐水和输氧。在本发明的特定实施方案中,设想了本文以上和别处描述的方法、装置及试剂盒在用于治疗、预防或抑制受试者中选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症或脓毒性休克)的至少一种状况的发展的方法中的用途。这些方法(在本文还称为“治疗方法”)通常包括:(a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示对生物受试者的至少一种(例如,1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用多个IRS生物标志值的组合确定指示物,所述指示物至少部分地指示至少一个状况的存在、不存在或程度,其中:(i)至少两种(例如,2种、3种4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志具有位于在互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(c)基于所述指示物指示inSIRS的存在,向所述受试者施用有效量的治疗或改善inSIRS的症状或逆转或抑制inSIRS的发展的试剂,或者基于所述指示物指示ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的存在,向所述受试者施用有效量的治疗或改善ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的症状或逆转或抑制ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的发展的试剂。在有利的实施方案中,治疗方法包括:(1)确定多个测量的IRS生物标志值,每个测量的IRS生物标志值是所述生物受试者的IRS生物标志的测量的值;以及(2)对所述测量的IRS生物标志值的至少一个应用函数确定至少一个导出的IRS生物标志值,所述至少一个导出的IRS生物标志值指示对应的导出的IRS生物标志的值。该函数适当地包括以下的至少一种:(a)将两个IRS生物标志值相乘;(b)将两个IRS生物标志值相除;(c)将两个IRS生物标志值相加;(d)将两个IRS生物标志值相减;(e)至少两个IRS生物标志值的加权和;(f)至少两个IRS生物标志值的对数和;以及(g)至少两个IRS生物标志值的S型函数。在一些实施方案中,本发明的方法、装置及试剂盒用于监测、治疗和管理可导致inSIRS或ipSIRS的状况,其的说明性实例包括胎盘滞留、脑膜炎、子宫内膜异位症、休克、中毒性休克(即,卫生棉条使用的后遗症)、肠胃炎、阑尾炎、溃疡性结肠炎、克罗恩病、炎性肠病、酸肠综合征、肝衰竭和肝硬化、新生儿初乳转移失败、缺血(在任何器官)、菌血症、在体腔诸如腹膜、心包、腱鞘、和胸膜腔内的感染、烧伤、严重创伤、过度运动或应力、血液透析、包括无法忍受的痛苦的状况(例如,胰腺炎、肾结石)、外科手术、以及不愈合损伤。在这些实施方案中,本发明的方法或试剂盒通常以有效监测inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的早期发展的频率来使用,从而使得能早期治疗干预和治疗该状况。在说明性实例中,诊断方法或试剂盒被如下使用:至少以1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小时间隔或至少1、2、3、4、5或6天间隔,或至少每周、双周或每月。本发明可在预测医学领域,为了诊断或监测受试者中选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的状况的存在或发展,和\/或监测对疗法效力的响应的目的来实践。本发明的生物标志标识和对应的指示物还使得能够确定药物共翻译研究(pharmacotranslationalstudies)中的端点。例如,临床试验可耗费数月或甚至数年以建立用于在治疗或预防inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)中被使用的药剂的药理学参数。然而,这些参数可以被与健康状态(例如,健康状况)的生物标志标识和对应的指示物相关。因此,临床试验可通过选择导致与期望的健康状态(例如,健康状况)相关的生物标志标识的治疗方案(例如,药剂和药物参数)来加速。这可例如通过以下来确定:a)确定多个IRS生物标志值,每个IRS生物标志值指示在用治疗方案治疗后对生物受试者的至少一种(例如,1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用多个IRS生物标志值的组合确定指示物,所述指示物至少部分地指示选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的存在、不存在或程度,其中:(i)至少两种(例如,2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(c)基于所述指示物指示健康状况的存在或相对于在所述受试者中在用所述治疗方案治疗之前的状况的程度的较低程度的所述状况的存在,确定所述治疗方案对将所述受试者的所述健康状态改变为所述期望的健康状态(例如,健康状况)有效。如本文所用,术语“程度”指状况的程度或阶段。因此,例如,轻度脓毒症是低于严重脓毒症的脓毒症的阶段或程度。相似地,严重脓毒症是低于脓毒性休克的脓毒症的阶段或程度。因此,本发明的该方面有利地提供了监测特定治疗方案在已被诊断为具有选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的状况的受试者中的效力的方法(例如,在临床试验的背景下)。这些方法利用了与治疗效力相关的测量的或导出的IRS生物标志值,例如,以确定经历治疗的受试者的测量的或导出的IRS生物标志值在疗法过程期间或疗法之后是否部分或完全恢复正常或以其他方式显示与对疗法的响应性相关的改变。如本文所用,术语“治疗方案”指预防性和\/或治疗性(即,在指定状况发作之后)治疗,除非上下文明确另外指明。术语“治疗方案”包括天然物质和药剂(即,“药物”)以及任何其他治疗方案,包括但不限于饮食治疗、物理疗法或运动方案、外科手术及其组合。因此,本发明提供了将生物标志标识与对选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的状况的有效治疗方案关联的方法,其中所述方法通常包括:(a)确定生物标志标识,所述生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个(例如,2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或更多个)IRS生物标志值的组合,所述至少两种IRS生物标志的值可对具有所述状况并已对其鉴定有效治疗的生物受试者测量或由具有所述状况并已对其鉴定有效治疗的生物受试者导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于所述状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述状况的存在、不存在或程度或者提供所述状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(b)将所述生物标志标识关联,以便确定对于所述状况的有效治疗方案。术语“关联”通常指确定一种类型的数据与另一种或与状态之间的关系。在特定的实施方案中,使用受试者工作特征(ROC)曲线,将指示物或生物标志标识与全局性概率或特定结果相关。本发明还提供了确定治疗方案是否对治疗具有选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段(例如,轻度脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克)的状况的受试者有效的方法。这些方法通常包括:(a)确定多个治疗后IRS生物标志值,每个治疗后IRS生物标志值指示在用所述治疗方案治疗之后对生物受试者的至少一种(例如,1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志测量或导出的值;(b)使用所述多个治疗后IRS生物标志值的组合确定治疗后指示物,所述治疗后指示物至少部分地指示选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的存在、不存在或程度,其中:(i)所述至少两种(例如,2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)所述治疗后指示物具有大于或等于代表所述治疗后指示物诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;其中所述治疗后指示物基于以下指示所述治疗方案对治疗所述受试者中的所述状况是否有效:所述治疗后指示物指示健康状况的存在或相对于在所述受试者中在用所述治疗方案治疗之前的状况的程度的较低程度的所述状况的存在。本发明还可被实践,以评估受试者是否响应(即,正响应)或不响应(即,负响应)于治疗方案或者具有对治疗方案的副作用。本发明的该方面提供了将生物标志标识与对治疗方案的正响应或负响应或副作用关联的方法,所述方法通常包括:(a)确定生物标志标识,所述生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个(例如,2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或更多个)IRS生物标志值的组合,所述至少两种IRS生物标志的值可在开始所述治疗方案之后对生物受试者测量或由生物受试者导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;以及(b)将所述生物标志标识关联,以便确定对所述治疗方案是正响应或负响应。如本文所用,术语“正响应”意指,治疗方案的结果包括一些临床显著益处,诸如状况的严重程度的预防或减轻、状况的症状的预防或减轻,或者状况的进展的减慢。相比之下,术语“负响应”意指,治疗方案不提供临床显著益处,诸如状况的严重程度的预防或减轻、状况的症状的预防或减轻,或者增加状况的进展的速率。本发明还包括确定由具有选自inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的状况的受试者对治疗方案的正响应或负响应和\/或对治疗方案的副作用的方法。这些方法通常包括:(a)将参考生物标志标识与对所述治疗方案的正响应或负响应或副作用关联,其中所述生物标志标识定义对应于对对照生物受试者或对照组测量或由对照生物受试者或对照组导出的至少两种IRS生物标志的值的至少两个(例如,2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或更多个)IRS生物标志值的组合,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;(b)确定样品生物标志标识,所述样品生物标志标识定义对应于在开始所述治疗方案之后对生物受试者测量或由生物受试者导出的至少两种IRS生物标志的值的至少两个(例如,2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或更多个)IRS生物标志值的组合,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差;其中所述样品生物标志标识基于以下指示所述受试者是否正响应或负响应于所述治疗方案和\/或发展来自所述治疗方案的副作用:所述参考生物标志标识与对所述治疗方案的正响应或负响应或副作用的相关性。在相关的实施方案中,本发明还设想确定由生物受试者对治疗方案的正响应或负响应和\/或对治疗方案的副作用的方法。这些方法通常包括:(a)确定样品生物标志标识,所述生物标志标识定义对应于至少两种IRS生物标志的值的至少两个(例如,2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或更多个)IRS生物标志值的组合,所述至少两种IRS生物标志的值在开始所述治疗方案之后对生物受试者测量或由生物受试者导出,其中:(i)所述至少两种IRS生物标志具有位于互相关性范围内的关于选自健康状况、inSIRS、ipSIRS或ipSIRS的特定阶段的至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;且(ii)至少两个生物标志值的所述组合具有大于或等于代表至少两个生物标志值的所述组合诊断所述至少一种状况的存在、不存在或程度或者提供所述至少一种状况的预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差,其中所述样品生物标志标识与对所述治疗方案的正响应或负响应和\/或来自所述治疗方案的副作用相关;以及(b)基于所述样品生物标志标识确定所述受试者是否正响应或负响应于所述治疗方案和\/或发展来自所述治疗方案的副作用。该以上方法可被实践以在治疗过程中相对早期,即,在效力的临床表现之前鉴定响应者或无响应者。以这种方式,治疗方案可任选地被终止,不同的治疗方案可被实施和\/或补充疗法可被施用。因此,在一些实施方案中,样品IRS生物标志标识在开始疗法的约2小时、4小时、6小时、12小时、1天、2天、3天、4天、5天、1周、2周、3周、4周、6周、8周、10周、12周、4个月、6个月或更长的时间内来获得。用于在诊断各自状况中使用的许多非限制性示例性标识现将被描述。出于说明的目的,以上描述的过程被用来选择提供选自包括测量的生物标志和\/或导出的生物标志的组合的理论上的最佳诊断生物标志的生物标志。在此之后,将其他测量的生物标志和\/或导出的生物标志基于它们与最佳诊断生物标志的相关性来分组,生物标志在这些组内充当诊断标识的能力然后被评估。在下面详细地列出的结果强调,只要以上描述的标准被满足,所得的标识提供用于在诊断生物受试者中至少一种状况的存在、不存在、程度或预后中使用所要求的区分能力。标识推导现将描述用于鉴定用于在诊断算法中使用的mRNA生物标志的说明性过程。概述外周血样品从健康对照和被一组医师回顾性诊断为具有inSIRS或ipSIRS的患者(血培养阳性)获得。ipSIRS患者基于临床参数被进一步回顾性分类为“轻度”、“严重”或“休克”。然后,来自患者样品的总RNA在基因表达分析和\/或定量PCR(qPCR))中被使用。基因表达数据使用多种统计方法来分析,以鉴定个体标志和导出的标志。导出的标志基于它们与表现最佳(top-performing)(基于AUC)比率的标志的每个如何相关被分成组。该比率方法提供了关于AUC用于分离以下的最佳诊断能力:健康状况和手术后(PS)(在本文还称为“inSIRS”)状况;健康和脓毒症(在本文还称为“ipSIRS”);inSIRS和ipSIRS;轻度ipSIRS和严重ipSIRS;轻度ipSIRS和脓毒性休克;以及严重ipSIRS和脓毒性休克。临床试验进行临床试验,以确定某些mRNA转录物是否能够区分健康对照和多个患者组,以及在患者组内进行区分。重症监护脓毒症患者、手术后患者和inSIRS患者以及健康对照被预期招募并参加单次就诊,其中血液被收集,用于使用Affymetrix外显子阵列和\/或定量实时PCR(qRT-PCR)的基因表达和mRNA分析。感染阳性SIRS(轻度、严重或休克)或inSIRS的明确诊断在患者被招募时不可能是已知的,且因此患者的诊断的证实和分配队列被回顾性进行。具有ipSIRS或inSIRS的临床体征和\/或症状的患者在他们已被鉴定之后尽快,在大部分情况下在入院24小时内同意并被招募进研究。参与者是否具有inSIRS、ipSIRS(轻度、严重或休克)的最终评估当临床信息和血液培养结果变得可用时回顾性进行。研究参与者均超过18岁,并且他们或他们的代理决策者在临床试验信息表和知情同意书标识并注明日期。所有对照参与者基于简单体检和他们在招募时的病史被认为健康良好。如果患者在进入ICU时(使用基于美国医师学院(AmericanCollegeofPhysicians)和危症监护医学学会标准定义(SocietyofCriticalCareMedicinestandarddefinitions)的标准)展示inSIRS或ipSIRS的体征和症状,患者或他们的代理决策者被提供参与该研究的机会。即,inSIRS和ipSIRS参与者需要在过去24小时内的包括以下的两个或更多个的临床状况的可变组合:体温>38℃或<36℃;心率>90次心跳\/min;呼吸率>20呼吸\/min或<4.3kPa(<32mmHg)的PaCO2;以及白血细胞计数<4,000个细胞\/mm3(<4x109个细胞\/L)或>12,000个细胞\/mm3(>12x109细胞\/L)或者>10%未成熟嗜中性粒细胞(带状形式)的证据。如果他们具有任何慢性全身性免疫炎性紊乱,包括SLE、克罗恩病、胰岛素依赖型糖尿病(IDDM);是移植受者或目前正在接受化疗治疗癌症,参与者被排除在外。大部分患者具有其他潜在的共病(co-morbidities)。所有研究参与者在18岁或以上,并具有小于40的体重指数。记录了人口统计学、生命体征测量值(血压、心率、呼吸率、氧饱和度、体温)、血液学(全血计数)、临床化学(尿液、电解质、肝功能酶、血糖)以及微生物状态。出于提取高质量RNA的目的,将血液收集进PAXgene管TM(PreAnalytixInc.,Valencia,CA,USA)。为细菌培养,将血液收集进BacTecPlusAerobic(10ml)管和BacTecPlusAnaerobic(10mL)管(BectonDickinson)管,分别用于检测需氧菌和厌氧菌生长。从QiagenInc.(Valencia,CA,USA)可得的PAXgene血液RNA试剂盒被用来从PAXgene管分离总RNA。分离开始于离心步骤,以将PAXgene血液RNA管中的核酸成团块。将团块洗涤并重悬,并与蛋白酶K一起在优化的缓冲液中孵育,以使蛋白消化。另外的离心被进行,以去除剩余细胞碎片,并将上清液转移至新鲜的微量离心管。添加乙醇,以调整结合条件,且将裂解物施加至PAXgeneRNA离心柱。在短暂离心期间,随着污染物穿过,RNA被选择性地结合至硅胶膜。剩余污染物在三个高效洗涤步骤中去除,且RNA然后在缓冲液BR5中洗脱。RNA数量和质量的确定使用Agilent生物分析仪来进行,且吸光度260\/280比使用分光光度计来进行。样品的处理组织样品中特定mRNA水平的测量可使用多种技术来实现。覆盖大部分已知的人mRNA的常见和容易可得的技术是使用Affymetrix技术的分析。关于该技术和方法的详细信息可在www.affymetrix.com发现。分析具有能够同时分析数千RNA转录物的优势。另一种常见的和容易可得的技术是qPCR(定量聚合酶链式反应),其具有能够实时分析和同时定量数百RNA转录物的优势。关于这些技术之一化学反应和方法的详细内容,可在LifeTechnologies网址被发现,包括题为“Protocol:IntroductiontoTaqManSYBRGreenChemistriesforReal-TimePCR”和“TaqManGeneExpressionAssaysProtocol”的公布方案。和qPCR两者在用于生物标志鉴定的发现和证明概念阶段被使用。使用qPCR专门用于生物标志可行性测试。生物标志和导出的生物标志的分析、数据解释及选择健康对照对inSIRS用于区分健康和inSIRS的两种状况、具有至少0.7的AUC的941种mRNA个体标志的列表被生成。图8A绘制了这些标志针对AUC的图,且图8B是用于分离两种状况的最佳mRNA生物标志(AGFG1–具有FG重复1的ArfGAP(ArfGAPwithFGrepeats1))的盒须图。当使用该单独的mRNA生物标志时,健康和inSIRS的状况被完全分离。从941种个体标志生成具有1.0的AUC的至少1000种导出的标志(比率)。用于分离健康和inSIRS的状况的这些导出的标志的AUC的图示出于图8C中,最佳表现的比率显示为图8D中的盒须图。用于AGFG1和PVRIG(包含脊髓灰质炎病毒受体相关免疫球蛋白结构域(poliovirusreceptorrelatedimmunoglobulindomaincontaining))的AUC具有1.0的比率。所有941种个体标志然后被分成两组-与AGFG1相关的那些以及与PVRIG相关的那些。图8E和8F显示了基于两个组与AGFG1或PVRIG的相似性,两个组之间的相关性。在这些图中,组被称为第1组(AGFG1)或第2组(PVRIG)。可见,每个“组”包含彼此最高度相关的那些标志。每个“组”中的标志还与被研究的状况(在这种情况下健康对inSIRS(PS))强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示),如在图8G和8H中所示。相比于当从组内选择标志时,通过从这两个组选择mRNA来创建导出的标志,用于分离健康和inSIRS的更好AUC被获得(p<2.558e-13),如图8I中证明的,图8I示出了相比于当使用来自单独的第1组或第2组的标志时获得的较大整体AUC。从第1组和第2组导出的标志的平均AUC高于0.97,而从单独的第1组或第2组导出的标志的平均AUC小于0.9。健康对照对ipSIRS用于分离健康和ipSIRS的两种状况、具有至少0.7的AUC的941种mRNA个体标志的列表被生成。图9A绘制了这些标志针对AUC的图,且图9B是用于分离两种状况的最佳mRNA生物标志(LTBP3–潜在转化生长因子β结合蛋白3)的盒须图。当使用该单独的mRNA生物标志时,健康和ipSIRS的状况被完全分离。从941种个体标志生成具有1.0的AUC的至少1000种导出的标志(比)。用于分离健康和inSIRS的状况的这些导出的标志的AUC的图示出于图9C中,最佳表现的比率显示为图9D中的盒须图。用于LTBP3和LPHN1(蛛毒素受体1(latrophilin1))的AUC作为比为1.0。所有941种个体标志然后被分成两组-与LTBP3相关的那些以及与LPHN1相关的那些。图9E和9F中的两个图显示了基于两个组与LTBP3或LPHN1的相似性,两个组之间的相关性。可见,每个“组”包含彼此最高度相关的那些标志。每个“组”中的标志还与被研究的状况(在这种情况下健康对ipSIRS(脓毒症))强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示),如在图9G和9H中所示。通过从这两个组选择mRNA来创建导出的标志,相比于当从组内选择标志时,用于分离健康和ipSIRS的较好AUC被获得(p<2.2e-16),如图9I中证明的,图9I示出了相比于使用来自单独的第1组或第2组的标志的改进的AUC。从第1组和第2组导出的标志的平均AUC高于0.97,而从单独的第1组或第2组导出的标志的平均AUC小于0.8。inSIRS对ipSIRS用于分离inSIRS和ipSIRS的两种状况、具有至少0.7的AUC的359种mRNA个体标志的列表被生成。图10A绘制了这些标志针对AUC的图,且图10B是用于分离这两种状况的最佳mRNA生物标志(PIWIL4–piwi-样RNA介导的基因沉默4)的盒须图。当使用该单独的mRNA生物标志时,inSIRS(PS)和ipSIRS(脓毒症)的状况被完全分离。从359种个体标志生成具有大于0.9的AUC的至少1000种导出的标志(比)。用于分离inSIRS和ipSIRS的状况的这些导出的标志的AUC的图被示于图10C中,PLA2G7(磷脂酶A2,VII组,(血小板活化因子乙酰水解酶,血浆))和PLAC8(胎盘特异8)的最佳表现的比率示出为图10D中的盒须图。所有359种个体标志然后被分成两组-与PLA2G7相关的那些以及与PLAC8相关的那些。图10E中的图示出了,每个“组”中的标志与被研究的状况(在这种情况下inSIRS(PS)对ipSIRS(脓毒症))强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示)。通过从这两个组选择mRNA来创建导出的标志,相比于当使用来自单独的第1组或第2组的标志时,当从组内选择标志时,用于分离inSIRS(PS)和ipSIRS(脓毒症)的较好AUC被获得(p<5.78e-5),如图10F中证明的。从第1组和第2组导出的标志的平均AUC高于0.80,而从单独的第1组或第2组导出的标志的平均AUC小于0.8。在替代性实施方案中,标志被分成四组-与CEACAM4相关的那些(桶3)、与LAMP1相关的那些(桶4)、与PLA2G7相关的那些(桶1)、和与PLAC8相关的那些(桶2)。图10G中的图示出了每个“组”中的标志与被研究的状况(即inSIRS(PS)对ipSIRS(脓毒症))强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示)。如以上讨论的两-桶(two-bucket)实施方案,从四个组选择mRNA来创建导出的标志,相比于当使用来自第1组至第4组的任一个的标志时,相比于当从组内选择标志时,导致分离inSIRS(PS)和ipSIRS(脓毒症)的整体较好AUC(p<0.2564,如在图10H中示出的。从第1组至第4组导出的标志的平均AUC高于0.8,而从单独的第1组至第4组的任一个导出的标志的平均AUC小于0.8。轻度ipSIRS对严重ipSIRS用于分离轻度ipSIRS和严重ipSIRS的两种状况、具有至少0.7的AUC的66种mRNA个体标志的列表被生成。图11A绘制了这些标志针对AUC的图,且图11B是用于分离两种状况的最佳mRNA生物标志(N4BP2L2–NEDD4结合蛋白2-样2(NEDD4bindingprotein2-like2))的盒须图。当使用该单独的mRNA生物标志时,轻度ipSIRS和严重ipSIRS的状况被良好分离。从66种个体标志生成具有0.87的AUC的至少1000种导出的标志(比)。用于分离轻度ipSIRS和严重ipSIRS的状况的这些导出的标志的AUC的图示出于图11C中,最佳表现的比率显示为图11D中的盒须图。用于N4BP2L2和ZC3H11A(包含11A的CCCH型锌指蛋白结构(zincfingerCCCH-typecontaining11A))的AUC作为比为0.983。所有66种个体标志然后被分成两组-与N4BP2L2相关的那些以及与ZC3H11A相关的那些。图11E和11F中的两个图显示了基于两个组与N4BP2L2或ZC3H11A的相似性,两个组之间的相关性。在这些图中,组被称为第1组(N4BP2L2)或第2组(ZC3H11A)。可见,每个“组”包含彼此最高度相关的那些标志。每个“组”中的标志还与被研究的状况(在这种情况下轻度ipSIRS对严重ipSIRS)强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示)。通过从这两个组选择mRNA来创建导出的标志,相比于当使用来自单独的第1组或第2组的标志时,相比于当从组内选择标志时,用于区分轻度ipSIRS和严重ipSIRS的较好AUC被获得(p<2.2e-16),如图11I中所示的。从第1组和第2组导出的标志的平均AUC高于0.89,而从单独的第1组或第2组导出的标志的平均AUC小于0.6。轻度ipSIRS对ipSIRS-休克用于分离轻度ipSIRS和ipSIRS-休克的两种状况、具有至少0.7的AUC的48种mRNA个体标志的列表被生成。图12A绘制了这些标志针对AUC的图,且图12B是用于分离两种状况的最佳mRNA生物标志(CD6–CD6分子)的盒须图。当使用该单独的mRNA生物标志时,轻度ipSIRS和ipSIRS休克的状况被良好分离。从48种个体标志生成具有至少0.793的AUC的至少1000种导出的标志(比)。用于分离轻度ipSIRS和ipSIRS休克的状况的这些导出的标志的AUC的图示出于图12C中,最佳表现的比率显示为图12D中的盒须图。用于VAMP2和UBAP1(泛素相关蛋白1)的AUC作为比为0.978。所有48种个体标志然后被分成两组-与VAMP2相关的那些以及与UBAP1相关的那些。图12E和12F中的两个图显示了基于两个组与VAMP2或UBAP1的相似性,两个组之间的相关性。在这些图中,组被称为第1组(VAMP2)或第2组(UBAP1)。可见,每个“组”包含彼此最高度相关的那些标志。每个“组”中的标志还与被研究的状况(在这种情况下轻度ipSIRS对ipSIRS-休克)强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示)。通过从这两个组选择mRNA来创建导出的标志,相比于当使用来自单独的第1组或第2组的标志时,相比于当从组内选择标志时,用于分离轻度ipSIRS和ipSIRS-休克的较好AUC被获得(p<2.2e-16),如图12I中所示的。从第1组和第2组导出的标志的平均AUC高于0.87,而从单独的第1组或第2组导出的标志的平均AUC小于0.65。严重ipSIRS对ipSIRS-休克用于区分严重ipSIRS和ipSIRS-休克的两种状况、具有至少0.7的AUC的61种mRNA个体标志的列表被生成。图13A绘制了这些标志针对AUC,且图13B是用于分离两种状况的最佳mRNA生物标志(SIRPG–信号调节蛋白γ)的盒须图。当使用该单独的mRNA生物标志时,严重ipSIRS和ipSIRS-休克的状况被良好分离。从61种个体标志生成具有至少0.821的AUC的至少1000种导出的标志(比)。用于分离严重ipSIRS和ipSIRS-休克的状况的这些导出的标志的AUC的图示出于图13C中,最佳表现的比率显示为图13D中的盒须图。用于GATA3(GATA结合蛋白3)和MECOM(MDS1和EVI1复杂基因座)的AUC作为比为0.936。所有61种个体标志然后被分成两组-与GATA3相关的那些以及与MECOM相关的那些。图13E和13F中的两个图显示了基于两个组与GATA3或MECOM的相似性,两个组之间的相关性。在这些图中,组被称为第1组(GATA3)或第2组(MECOM)。可见,每个“组”包含彼此最高度相关的那些标志。每个“组”中的标志还与被研究的状况(在这种情况下严重ipSIRS对ipSIRS-休克)强相关(如由对于所有标志大于0.7的AUC所示)。通过从这两个组选择mRNA来创建导出的标志,相比于当使用来自单独的第1组或第2组的标志时,相比于当从组内选择标志时,用于区分严重ipSIRS和ipSIRS-休克的较好AUC被获得(p<2.2e-16),如图13I中所示的。从第1组和第2组导出的标志的平均AUC高于0.82,而从单独的第1组或第2组导出的标志的平均AUC小于0.7。标识用法现将描述以上描述的标志和所得标识在患者群体中的使用以及关于区分inSIRS和ipSIRS的益处。能够区分具有inSIRS和ipSIRS的患者的测定可在包括以下的多个患者群体中被使用:1)重症监护病房(内科和外科ICU)2)手术后和内科病房3)急诊室4)医疗诊所。被许可进入重症监护(ICU)的患者通常具有ipSIRS,或在其ICU停留期间发展ipSIRS。重症监护的最终目的是确保患者存活并在最短时间内被转至普通病房。被诊断为ipSIRS的重症监护中的患者通常被施用许多治疗化合物-治疗化合物的许多对免疫系统具有相反作用,且治疗化合物的许多取决于ipSIRS的严重程度(轻度脓毒症、严重脓毒症、脓毒性休克)可能适得其反。用本发明的生物标志定期监测重症监护患者,将允许医学从业者区分inSIRS与ipSIRS并确定ipSIRS的阶段并因此当开始和停止疗法时选择疗法和患者管理程序,以及最终对疗法的响应。因此,这些生物标志提供的信息将允许医学重症监护定制和修改疗法,确保患者存活并在重症监护中花费更少的时间。在重症监护中的较少时间导致节约可观的医疗费用,包括通过较少的占用时间和药物治疗的合理使用以及时机。外科和普通内科患者通常或作为他们的状况或程序的结果发展手术后inSIRS,并具有发展ipSIRS的较高风险。因此,在此类患者中的术后和医疗护理包括监测inSIRS和ipSIRS的体征并区分这两种状况。在手术后和在普通病房的inSIRS和ipSIRS患者的治疗和管理是不同的,由于inSIRS患者可供应轻度抗炎药或解热药,且ipSIRS患者为最好的结果一定要尽早开始供应抗生素。用本发明的生物标志定期监测手术后和内科患者,将允许护理从业者和医学从业者,在早期阶段区分inSIRS和ipSIRS,并因此对选择疗法和患者管理程序,以及对疗法的最终响应做出明智的决定。因此,这些生物标志提供的信息将允许医学从业者定制和修改疗法,确保患者从手术或其他状况很快恢复,且不发展ipSIRS。较少的住院时间和较少的并发症导致节约可观的医疗费用,包括通过较少的占用时间和药物治疗的合理使用以及时机。此外,出现在急诊室的患者通常发热,其是inSIRS的临床体征(四个中的)之一。此类患者需要被评估以确定他们是否具有inSIRS或ipSIRS。如以上提及的,发热、inSIRS和脓毒症患者的治疗和管理是不同的。例如,具有发热而无其他inSIRS临床体征和无明显感染来源的患者可被送回家,或提供其他非住院服务,无需进一步住院治疗。然而,具有发热的患者可能具有早期ipSIRS且不允许此类患者住院可能将他们的生命置于危险中。由于这些生物标志能够区分inSIRS和ipSIRS,它们将允许医学从业者快速和有效地分诊急诊室患者。做出精确的分诊决策确保了,对需要住院治疗的患者给予住院治疗,且对不需要住院治疗的那些提供其他适当的服务。仍此外,出现在医疗诊所的患者通常具有inSIRS的四个临床体征(增加的心率、增加的呼吸率、异常白细胞计数、发热或体温过低)的任一个。许多不同的临床状况可伴随inSIRS的四个临床体征之一存在,且此类患者需要被评估以确定他们是否具有inSIRS或ipSIRS并排除其他鉴别诊断。例如,具有绞痛的患者还可伴随存在增加的心率的临床迹象。鉴别诊断,可以是(但不限于)阑尾炎、尿路结石、胆囊炎、胰腺炎、小肠结肠炎。在这些状况的每个中,确定是否存在全身炎症反应(inSIRS)或感染是否促成对状况的全身反应(ipSIRS)将是重要的。有和没有全身炎症和\/或感染的患者的治疗和管理是不同的。由于这些生物标志可区分具有对感染的全身炎症反应的患者与具有无感染的全身炎症反应的患者(inSIRS和ipSIRS),并确定全身参与程度,它们的使用将允许医学从业者确定下一个进行的医疗程序以令人满意地解决患者的问题。确定患病患者和具有inSIRS和ipSIRS的那些患者中全身炎症的程度如以上提及的,出现在医疗诊所的患者通常具有inSIRS的四个临床体征的任一个。然而,许多不同的临床状况可伴随inSIRS的四个临床体征之一存在,且此类患者需要被评估以确定他们是否具有inSIRS(且如果有,则inSIRS的程度)或ipSIRS(且如果有,则ipSIRS的程度),并排除其他鉴别诊断。例如,具有呼吸窘迫的患者可能伴随存在增加的呼吸率的临床体征。鉴别诊断,可以是(但不限于)哮喘、肺炎、充血性心脏衰竭、气道的物理堵塞、过敏反应、肺萎陷(collapsedlung)、气胸。在这些状况的每个中,确定是否存在全身炎症反应(inSIRS)或感染是否促成状况将是重要的。有和没有全身炎症和\/或感染的患者的治疗和管理是不同的。由于这些生物标志可区分具有对感染的全身炎症反应的患者与具有无感染的全身炎症反应的病患(inSIRS和ipSIRS),并确定全身参与程度,它们的使用将允许医学从业者确定下一个进行的医疗程序以令人满意地解决患者的问题。具有肺萎陷、气胸或物理堵塞的患者不太可能具有大的全身炎症反应,且具有充血性心脏衰竭、过敏反应或哮喘的患者不太可能具有由于感染的大的全身炎症反应。如由本专利中提出的生物标志指示的,inSIRS和ipSIRS两者的程度还给临床医师提供了关于下一治疗和管理步骤的信息。例如,具有呼吸窘迫和指示ipSIRS的强生物标志反应的患者可能立即住院,提供抗生素,并进行胸部X射线。具有呼吸窘迫和指示inSIRS而非ipSIRS的强生物标志反应的患者可能立即住院,并且胸部X射线连同其他研究诊断程序,诸如MRI、ECG及血管造影一起进行。具有呼吸窘迫与短病史而无inSIRS或ipSIRS的患者可能在当地诊所经历进一步检查,而不需要住院治疗。再一次,并如以上提及的,出现在急诊室的患者通常发热,其是inSIRS的临床体征(四个中的)之一。此类患者需要被评估以确定他们是否具有inSIRS或ipSIRS。此外,确定他们如何不适以能够做出是否允许患者住院的判断警告是重要的。做出精确的分诊决策确保了对需要住院治疗的患者给予住院治疗,且对不需要住院治疗的那些提供其他适当的服务。ICU中的患者通常具有inSIRS和ipSIRS,并且区分这两种状况是重要的,因为治疗方案不同。在具有inSIRS的患者中,确定炎症反应的程度是重要的,以便可适当实施适当的治疗和管理方案。例如,新确定为具有不是广泛的inSIRS的患者可能够被提供温和药物诸如非甾体抗炎药。新确定为具有广泛inSIRS(例如,创伤)的患者可能需要较强的抗炎药物诸如类固醇,以降低炎症的副作用(肿胀)的潜在影响。在具有ipSIRS的患者中,确定对感染的炎症反应的程度也是重要的,以便可适当实施或停止适当的治疗和管理方案。例如,对于具有持久性强ipSIRS反应的患者,临床医师可在传统细菌培养和灵敏度结果的不存在下考虑改变,或增加抗生素治疗方案。此外,已知已具有ipSIRS并一直进行抗微生物疗法持续延长的周期但已显示(通过使用生物标志测试)他们不再具有inSIRS或ipSIRS的患者因此可安全中断静脉注射抗生素。确定ipSIRS的严重程度被许可进入重症监护(ICU)的患者通常具有ipSIRS,或在ICU停留期间发展ipSIRS。已知,脓毒症的严重程度可被认为是连续的,从较不严重、或脓毒症至较严重或严重脓毒症,至最严重或脓毒性休克。相比于脓毒症,较严重脓毒症(ipSIRS)要求更迫切、立即、和定制的干预(尽管所有都是急性状况)。被诊断为ipSIRS的重症监护中的患者通常被施用许多治疗化合物-治疗化合物的许多对免疫系统具有相反作用,且治疗化合物的许多取决于ipSIRS的严重程度(脓毒症、严重脓毒症、脓毒性休克)可能适得其反。定期用本发明的生物标志监测重症监护患者,将允许医学从业者确定ipSIRS的严重程度(轻度、严重或休克)并因此选择疗法和患者管理程序,以及最终对疗法的响应。因此,本文公开的这些生物标志提供的信息将允许医学从业者定制、修改或停止疗法和\/或护理,确保患者存活并在重症监护中花费更少的时间。在重症监护中的较少时间导致节约大量的医疗费用,包括通过较少的占用时间和药物治疗的合理使用以及时机。第一示例性工作流程现将描述第一实例工作流程。取决于自动化平台的可用性,该工作流程包括多达七个步骤。基于qRT-PCR仪(例如AppliedBiosystems7500FastDx实时PCR仪,AppliedBiosystems,FosterCity,CA,目录号440685;K082562)上荧光的检测,测定使用定量、实时确定样品中每种转录物的量。转录物使用在FAM通道中可视化(通过实例)的探针在单独的反应孔中被各自扩增、检测和定量。报告的评分使用针对试剂盒单独提供但被设计成与RT-PCR机器集成的解释性软件来计算。工作流程在下面描述了手动处理和预制备试剂盒的使用。分析前血液收集总RNA分离分析逆转录(cDNA的生成)qPCR准备qPCR软件,结果的解释和质量控制输出。试剂盒内含物稀释液RT缓冲液RT酶混合物qPCR缓冲液引物\/探针混合物AmpliTaq(或相似的)高阳性对照低阳性对照阴性对照血液收集使用的样本是使用在PAXgene血液RNA(Qiagen,试剂盒目录号762164;BectonDickinson,收集管目录号762165;K042613)内的PAXgene收集管通过静脉穿刺收集的2.5mL血液样品。替代性收集管是(LifeTechnologies)。总RNA分离收集进PAXgeneRNA管的血液(2.5mL)根据制造商的说明书来处理。简言之,使用在PAXgeneTM血液RNA系统(Qiagen,试剂盒目录号762164;BectonDickinson,收集管目录号762165;K042613)内的PAXgeneTM收集管通过静脉穿刺收集2.5mL血液样品。总RNA分离使用在PAXgeneTM血液RNA试剂盒(PAXgeneTM血液RNA系统的组分)中指明的程序来进行。然后,测试提取的RNA的纯度和产量(例如,通过使用(ThermoScientific)运行A260\/280比),对于其最低质量必须是(比>1.6)。RNA应该被调整浓度,以允许逆转录反应的恒定输入体积(下面)。RNA应该被立即处理或者在或低于-70℃以单次使用体积储存用于以后处理。逆转录基于板图(platemap)和下面直接提供的信息,确定适当数目的待制备的反应当量(主混合物制剂)。每个临床样本以单例模式(singleton)运行。a)每个批次运行必须包括以下样本:b)各自以单例模式的高对照、低对照、阴性对照以及无模板对照(测试稀释液,而不是样品)如下面详述的编程ABI7500FastDx仪器。a)启动该软件。b)点击创建新文档c)在新建文档向导,选择以下选项:i)测定:标准曲线(绝对定量)ii)容器:透明的96孔iii)模板:空白文档(或选择实验室定义的模板)iv)运行模式:标准7500v)操作员:输入操作员的缩写vi)板名称:[缺省]f)点击完成g)选择在左上角的仪器选项卡h)在热循环仪方案区域、热谱选项卡、输入以下时间:i)25℃持续10分钟ii)45℃持续45分钟iii)93℃持续10分钟iv)在25℃保持60分钟在无模板区域,取出测试稀释液和RT-qPCR测试RT缓冲液至室温以解冻。将RT-qPCR测试RT酶混合物保留在冰箱中和\/或在冷冻模块上。在无模板区域,以下面列出的顺序组装主混合物。RT主混合物-计算:轻轻涡旋主混合物,然后脉冲离心。在室温,将适当体积(5μL)的RT主混合物添加进每个孔。取出临床样本和对照RNA以解冻。(如果样本常规需要较长时间解冻,该步骤可在验证方法中移到上游。)涡旋临床样本和对照RNA,然后脉冲离心将10μL对照RNA或RT-qPCR测试稀释液添加至每个各自对照孔或阴性孔。将10μL样品RNA添加至每个各自样品孔(对于RT,150ng总输入;OD260\/OD280比大于1.6)。将10μLRT-qPCR测试稀释液添加至各自NTC孔。注意:每孔最终反应体积是15μL。轻轻吹打混合。避免在孔中形成气泡。用封条盖上孔。离心板,以去除任何气泡(以400xg,1分钟)。迅速转移至如以上详述的预编程的ABI7500FastDx仪器。点击开始。点击保存并继续。在离开仪器之前,建议,通过在估计剩余时间下显示时间来验证运行被成功启动。qPCR主混合物可被制备,以大致与RT反应的结束一致。例如,此时之前约15分钟启动。参见下面。当RT完成时(即在25℃停留;在完成60分钟之前,在任何时间停止保持),离心板以收集凝结(以400xg,1分钟)。qPCR准备基于板图(platemap)和在以上RT制备中提供的信息,确定适当数目的待制备的反应当量(主混合物制剂)。编程具有以下设置的ABI7500FastDx。a)启动该软件。b)单击创建新文档c)在新建文档向导,选择以下选项:i)测定:标准曲线(绝对定量)ii)容器:透明的96孔iii)模板:空白文档(或选择实验室定义的模板)iv)运行模式:标准7500v)操作员:输入操作员的缩写vi)板名称:输入期望的文件名称d)点击下一步e)在选择检测物对话框:i)选择对于第一生物标志的检测物,并然后单击添加>>。ii)选择检测物第二生物标志,并然后单击添加>>,等等。iii)被动参考:ROXf)点击下一步g)根据板图将检测物分配至适当孔。i)突出在其中第一生物标志测定将被分配的孔ii)点击使用用于第一生物标志检测物iii)重复前两个步骤,以用于其他生物标志iv)点击完成h)确保设置和板选项卡被选择i)选择在左上角的仪器选项卡j)在热循环仪方案区域、热谱选项卡,进行以下操作,结果示于图14中:i)删除阶段1(除非这在实验室定义的模板中被完成)。ii)输入25μL体积样品。iii)95℃10分钟iv)95℃持续15秒、63℃持续1分钟的40个循环v)运行模式:标准7500vi)收集使用“阶段2、步骤2(63.0@1:00)”设置的数据k)使用该过程如下面标记孔:在板图上右击,然后选择孔检查物。随着孔检查物打开,选择一个孔或更多个孔。点击后退至孔检查物,并输入样品名称。当完成时关闭孔检查物。i)用于高对照的CONHii)用于低对照的CONLiii)用于阴性对照的CONNiv)用于无模板对照的NTCv)用于临床样本的[登陆ID]l)确保检测物和猝灭剂被选择,如下面列出的。i)用于CEACAM生物标志1的FAM;猝灭剂=无ii)用于LAMP1生物标志2的FAM;猝灭剂=无,等等。iii)用于PLA2G7的FAM;猝灭剂=无iv)用于PLAC8的FAM;猝灭剂=无v)对于被动参考选择“ROX”qPCR在无模板区域,取出测定qPCR缓冲液和对于每个靶的测定引物\/探针混合物至室温,以解冻。将测定AmpliTaqGold保留在冰箱中和\/或在冷冻模块上。仍在无模板区域,在室温,以列出的顺序制备对于每个靶的qPCR主混合物。qPCR主混合物-每样品计算通过弹或通过涡旋轻轻混合主混合物,并然后脉冲离心。在室温,将15μL的qPCR主混合物添加至每个孔。在模板区域,将130μLSeptiCyteLab测试稀释液添加至来自RT反应物的每种cDNA产物。紧紧地重新密封板,并离心板以彻底混合。根据板布局,将10μL稀释的cDNA产物添加至每个孔。轻轻吹打混合。避免在孔中形成气泡。用光学封条盖上孔。离心板,以去除任何气泡(以400xg,1分钟)。放置在用以上设置预编程的实时热循环仪上。点击开始。点击保存并继续。在离开仪器之前,建议,通过在估计剩余时间下显示时间来验证运行被成功启动。注意:在扩增已开始之后的任何点不要打开qPCR板。当扩增完成时,丢弃未开封的板。软件、结果的解释和质量控制将软件专门设计成与PCR机器的输出集成并基于多种生物标志的使用应用算法。软件考虑适当的对照和以期望的格式报告结果。当运行已在ABI7500快速Dx仪器上完成时,用21CFRPart11软件、ABI软件SDSv1.4在应用7500快速系统中完成下面步骤。点击左上角的结果选项卡。点击左上角的扩增曲线选项卡。在分析设置区域中,对所有靶选择自动基线和手动阈值。输入0.01作为阈值。点击分析设置区域中右侧的分析按钮。从左上方的菜单栏,选择文件,然后关闭。完成在请求变化的原因的对话框中的表格。点击OK。将数据文件(.sds)转移至运行特定测定RT-qPCR测试软件的单独的计算机。启动测定RT-qPCR测试软件。登入。从左上方的菜单栏,选择文件,然后打开。浏览转移的数据文件(.sds)的位置。点击OK。数据文件将然后使用用于结果的解释的测定的软件应用程序来分析。结果的解释和质量控制结果启动解释软件。软件应用指令被单独提供。在上传.sds文件后,软件将自动生成对于对照和临床样本的分类评分。对照软件将每个CON(对照)样本(CONH、CONL、CONN)与其期望的结果进行比较。对照以单例模式运行。如果CONH、CONL和\/或CONN失败,批次运行无效,且对于临床样本数据将不被报告。该确定由解释软件自动做出。批次运行应该被重复,以新的RNA制品开始或在RT反应步骤开始。如果NTC产生除了失败(对于所有靶,无Ct)以外的结果,批次运行无效,且对于临床样本,无数据可被报告。该确定由运行数据的视觉检查做出。批次运行应该被重复,以新的RNA制品开始或在RT反应步骤开始。如果第二批次运行失败,请联系技术服务。如果校准和所有对照两者有效,则批次运行有效,且样本结果将被报告。样本注意,有效批次运行可包含有效样本结果和无效样本结果两者。使每个样本资格为通过或失败(使用预定数据)的分析标准(例如,Ct值)被软件自动调用。报告-超出范围的评分。质量控制阴性对照、低阳性对照和高阳性对照的各自单例模式必须被包括在每个批次运行中。如果对于这些对照的任一个没有标记出现,该批次有效。无模板对照的单例模式被包括在每个批次运行中,且失败(对于所有靶,无Ct)是指示可扩增的材料在该孔中未被检测到的有效结果。阴性对照必须生成阴性结果。如果阴性对照被标记为无效,则整个批次运行无效。低阳性对照和高阳性对照必须落入指定的范围内。如果样性对照中的一个或两个被标记为无效,则整个批次运行无效。示例性输出来自软件的可能的示例性输出在下面被示于图15中。此类报告的格式取决于许多因素,包括;质量控制、监管当局(regulatoryauthorities)、截止值、使用的算法、实验室和临床医师要求、误释的可能性。在这种情况下,该测定被称为“SeptiCyte实验室测试”。结果被报告为数字(5.8)、调用(“脓毒症阳性”)、在0-12标度上的位置,且基于历史结果患者具有脓毒症的概率和预定截止的使用(使用来自临床试验的结果)。在测定内的对照的结果也被报告。可被报告的其他信息可包括:此类结果的先前结果和日期以及时间,严重脓毒症或脓毒性休克的概率,为历史测试结果提供分离健康、inSIRS和ipSIRS(轻度、严重和休克)的状况使得具有较高评分的那些患者被认为具有较严重的inSIRS或ipSIRS的截止值的标度。第二示例性工作流程现将描述第二实例工作流程。能够以即时检验(point-of-care)或接近即时检验处理患者样品的机器已被并正在开发。此类机器运行要求很少的分子生物学技能,并针对非技术用户。理念是,样品将被直接用移液器吸取进一次性盒中,该一次性盒然后被插入进机器。用户按压“开始”,并在2-3小时内生成结果。盒包含进行以上实例工作流程中的步骤2-5所需的所有试剂,且机器具有并入的适当软件,以允许步骤6和7被进行。新鲜、抗凝固的全血液可被用移液器吸取进Idylla盒(BiocartisNV)或相似物(Unyvero,CuretisAG;EnigmaML,EnigmaDiagnostics;DiagCore,STATDiagnostica;Savannah,QuidelCorp;ePlex,GenMarkDx),遵循对Idylla机器的屏幕上的说明,以测试用于区分inSIRS和ipSIRS(例如)。在Idylla机器内部,RNA首先从全血提取,并然后被转化为cDNA。cDNA然后被用于qRT-PCR反应。反应被实时追踪,且Ct值被计算。板载软件生成结果输出(参见图XX)。用于RNA质量、无模板对照、高模板对照和低模板对照和预计的Ct范围的适当的质量控制量度确保结果不被错误地报告。示例性生物标志比能够分离不同状况的示例性生物标志比(基于AUC的前12个)被示出在如下面列出的盒须图中,每个显示完美分离。·图16A至16L显示健康对inSIRS(手术后)·图17A至17L显示健康对ipSIRS(脓毒症)·图18A至18L显示inSIRS(手术后)对ipSIRS(脓毒症)·图19A至19L显示脓毒症对严重脓毒症·图20A至20L显示严重脓毒症对脓毒性休克·图21A至21L显示脓毒症对脓毒性休克组合生物标志比的示例性算法生物标志比(导出的标志)可以以组合被用来增加分离多种状况的诊断能力。使用哪些标志,以及多少标志用于分离多种状况的确定可通过计算曲线下面积(AUC)来实现。图22显示了将生物标志与诊断标志相加对AUC的效应(在这种情况下,分离inSIRS和ipSIRS)。相比于组合(在这种情况下,PLA2G7和PLAC8,0.96的AUC、95%CI0.91-1.0)中的两种最佳表现的标志的能力,单mRNA生物标志(在这种情况下,PLA2G7,0.88的AUC、95%CI0.79-0.97)之间的诊断能力显著增加(校正的p值=0.0175)。两种、三种、四种和五种生物标志的组合同样产生为inSIRS和ipSIRS的良好区分,而无显著差异。为了导出的标志的商业开发,其他因素开始发生作用,诸如成本效益、测定复杂性及qRT-PCR平台的容量。在该实例中,超过3种或4种的标志的添加不显著改进性能,且相反地,AUC的下降在≥5种基因的标识中被观察到,可能由于当统计模型被强制包括添加很少的另外信息的生物标志时,数据过度拟合且添加噪音发生。如此,且例如,4种基因标识(0.986,95%CI0.964-1.00)提供分离inSIRS和ipSIRS的简单性、实用性和商业风险之间的适当的平衡。此外,使用四种标志的方程同样地衡量每种生物标志,其在分析或临床可变性的情况下还提供了另外的稳健性。提供分离inSIRS和ipSIRS(以及其他)的良好诊断能力的一个示例性方程是:诊断评分=(PLA2G7–PLAC8)+(CEACAM4–LAMP1)用于每个生物标志的值是来自PCR的Ct值。当来自具有inSIRS和ipSIRS的患者的临床样品在PCR中使用这四种标志来测试时,用于每种标志的Ct值被发现落入在26和34之间。在该患者群体中,在每个括号对内的第一生物标志具有比在每个括号对内的第二生物标志高的值。因此,发现“诊断评分”具有在0和12之间的值。然而,在理论上,“诊断评分可潜在地是最高的Ct值+\/-最高的Ct值。在图23,显示了,对于两个患者群体,已计算了PCR和以上算法的使用的结果(对于“发现”N=63,且对于“可行性”N=70)每个患者被临床上和回顾性(注意,不是在采集样品时)确认为具有inSIRS(黑点)或ipSIRS(红点)。每个患者样品还具有计算的SeptiCyte评分(在左侧的Y轴)。在0-12的标度上,可见,相比于具有确认的inSIRS的那些,具有确认的ipSIRS(红点)的患者获得较高的诊断评分。此外,可见,取决于期望的假阴性或假阳性比,或多或少分离两种状况的任意截止线可被绘制(相比于使用临床数据的inSIRS或ipSIRS的回顾性诊断)。在这种情况下,线以4的“SeptiCyte评分”来绘制,使得发现数据集中假阴性ipSIRS调用的数目为0,且可行性数据集中假阴性ipSIRS调用的数目为2。相反地,发现数据集中假阳性ipSIRS调用的数目为4,且可行性数据集中假阳性ipSIRS调用的数目为9。清楚地,在这种情况下,患者样品是否是假阳性或假阴性取决于inSIRS或ipSIRS的回顾性临床调用的人工金标准。因此,在一个实例中,当用于确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性时,方法可包括确定指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度的第一对生物标志值,确定指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度的第二对生物标志值,并然后使用所述第一对生物标志值和所述第二对生物标志值确定指示物。如先前讨论的,指示物可然后与专门建立的指示物参考进行比较,以区分inSIRS和ipSIRS。用于建立指示物参考的过程的示例性过程现将参考图24更详细描述。在该实例中,在步骤2400,处理系统201确定以对于参考群体获得的测量的生物标志值的形式的参考数据。参考数据可以以任何适当的方式来获得,但通常这包括从多个个体获得基因表达产物。为了实现此,收集基因表达产物数据,例如通过获得生物样品,诸如外周血样品,并然后进行定量过程,诸如核酸扩增过程,包括PCR(聚合酶链式反应)等,以评估许多参考生物标志的活性,并特别是,许多参考生物标志的水平或丰度。指示相对活性的定量值然后被储存作为参考数据的一部分。在一个实例中,测量值被接收作为原始数据,其然后经历初步处理。此类原始数据对应于已来自来源未经修改的信息,诸如来自仪器诸如PCR仪、阵列(例如,微阵列)扫描仪、测序仪的输出,临床笔记或任何其他生物化学数据、生物数据、观测的数据等。该步骤可被用来将原始数据转化成更适合分析的格式。在一个实例中,这被进行,以归一化原始数据,并从而帮助确保甚至当使用不同的技术、不同的装备等测量时生物标志值显示一致性。因此,归一化的目的是,去除不可直接归因于在考虑中的具体分析的样品内的变化。例如,去除由在不同场所样品处理中的差异引起的变化。归一化的经典实例包括对通用数据的z-评分转换,或流行领域的特定归一化,诸如用于微阵列的RMA归一化。然而,应该理解,在一些应用中,诸如在单个数据采集机器上运行的单个样品实验,该步骤可以不是严格必不可少的,在该情况下函数可以是产生与输入相同的输出的Null函数。在一个实例中,优选的方法是相比于对数归一化数据的配对函数方法。对数归一化是对微阵列数据的标准的数据转换,因为当离开机器时,该数据遵循对数正态分布。应用对数转换将数据转变成过程友好的标准数据。个体被选择,以包括被诊断为具有感兴趣的一种或更多种状况的个体以及健康的个体。状况通常是医学状况、兽医学状况或其他健康状态状况,并可包括任何疾患、疾病、疾病的阶段、疾病亚型、疾病的严重程度、不同预后的疾病等,并且在当前实例中,将包括至少一些具有inSIRS的个体和一些具有ipSIRS的个体。在这方面,个体还通常经历允许临床鉴定状况的临床评估,以及任何评估或状况的指示形成参考数据的部分。测量的生物标志值将取决于被评估的主要状况,以便,例如,在确定受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性的情况下,使用的生物标志将是如以上讨论的LAMP1、CEACAM4、PLAC8和PLA2G7。在收集后,参考数据可被储存在数据库211中,允许这被处理系统201随后检索,用于随后分析,或可被直接提供至处理系统201,用于分析。作为以上过程的部分,在步骤2410,测量值使用传统现有技术来验证,以确保测量已被成功进行,并因此是有效的。在步骤2420,每个个体通常与参考群体被分配为一组。组可以以任何适当的方式来定义,并且可基于以下来定义:状况的存在、不存在、程度、阶段、严重程度、预后或进展的指示的任一个或更多个,其他测试或测定,或者与个体相关的测量的生物标志。例如,组的第一选择可以是鉴定患有SIRS的个体的一个或更多个组,患有ipSIRS的个体的一个或更多个组,以及患有inSIRS的一个或更多个组。对于患有其他状况的个体,还可定义另外的组。组可包括重叠的组,所以例如,可期望定义健康个体及具有SIRS个体的组,其中被进一步定义以区分inSIRS患者与ipSIRS患者,以及inSIRS或ipSIRS的不同程度,这些组共同具有SIRS,但各组患者在临床医师是否已确定感染的存在与否方面不同。另外,进一步细分可基于个体的特征、表型性状、测量方案等来进行,因此组可基于这些参数性来定义,使得患有状况的个体的多个组被定义,其中每个组涉及不同的表型性状、测量方案等。然而,应该理解,不同组的鉴定可以以其他方式来进行,例如基于参考个体的生物学样品内的生物标志的特定活性,并因此,提及状况不意图限制并且可根据要求使用其他信息。进行分类为组的方式可取决于优选的实施而变化。在一个实例中,这可由处理系统201自动进行,例如,使用无监督方法诸如主成分分析(PCA),或监督的方法诸如k-均值或自组织映射(SOM)。可选择地,这可通过允许操作者检查图形用户界面(GUI)上呈现的参考数据并使用适当的输入命令定义各自组,由操作者手动地进行。在步骤2430,确定代表各自指示物值的第一导出的生物标志值和第二导出的生物标志值。第一和第二指示物值In1、In2分别基于第一生物标志和第二生物标志的浓度的比率、以及第三生物标志和第四生物标志的浓度的比率来确定:In1=(PLA2G7\/PLAC8)In2=(CEACAM4\/LAMP1)在步骤2440,指示物值然后被用来建立指示物参考,所述指示物参考然后被用于分析对受试者测量的指示物值,以建立受试者具有状况的可能性。特别地,用于每个参考组的指示物值被统计分析,以建立指示每个组的指示物值的范围或分布,且示例性分布示于图26中,如在下面更详细讨论的。另外的实例现将参考图25A和25B来描述。在该实例中,在步骤2500,样品从受试者获得。取决于将被确定的生物标志值的性质,样品可以是任何适合的样品,诸如外周血样品等。在步骤2505,样品经历制备,允许这被提供至测量装置并用于在步骤2510的定量过程中。出于该实例的这种目的,定量过程包括PCR扩增,其中测量装置是PCR机器,尽管其他适合的技术可被使用。在这种情况下,在步骤2515对于四种生物标志的每个,确定扩增倍数At(PLA2G7)、At(PLAC8)、At(CEACAM4)、At(LAMP1),其中扩增倍数从测量装置转移至处理系统201,允许处理系统210进行对应的生物标志值的分析。因此,在步骤2520,处理系统201使用扩增倍数计算比。在这方面,当扩增倍数代表对数值时,比通过使扩增倍数相减来确定,如将被本领域技术人员理解的。因此,在该实例中,指示物值将被如下确定:In1=At(PLA2G7)-At(PLAC8)In2=At(CEACAM4)-At(LAMP1)在步骤2525,处理系统201通过将用于指示物值的比率组合来确定指示物,如下:In=In1+In2在步骤2530处理系统201然后将指示物值与一个或更多个各自指示物参考进行比较。如先前所述,指示物参考对于参考群体来导出,并被用来指示受试者患有inSIRS或ipSIRS的可能性。为了实现此,参考群体基于临床评估被分为具有\/不具有状况或状况的严重程度、风险或进展阶段的量度的组,这然后被用来评估能够区分组或提供严重程度、风险或进展阶段的量度的阈值指示物值。比较通过将指示物与对参考群体中每个组确定的指示物分布进行比较来确定。在当前实例中,存在两个参考组,其中一个对应于被诊断为具有inSIRS的个体,且另一个为被诊断为具有ipSIRS的个体。在这种情况下,比较的结果可被用来确定个体具有ipSIRS而不是inSIRS的可能性,取决于优选的实施,这可使用许多不同的方法来实现。参考分布的实例示于图26中,其显示了对于包含inSIRS和ipSIRS样品两者的参考群体,指示物值的分布。密度(y轴)描述了常见评分在参考群体中如何分布的。在图26中,对于inSIRS群体的最常见值在范围1至8中,且对于ipSIRS群体的最常见值大多在范围5至13中。例如,让我们假设,对于新的样品计算的指示物值为4。在inSIRS群体中的4的值具有在该值的高密度(A),而ipSIRS群体具有在该值的低密度(B),意味着该样品更可能是inSIRS。相反,如果样品具有10的指示物评分,在ipSIRS参考群体中的该值具有高密度(C),而inSIRS群体具有低密度(D),意味着具有10的指示物值的该样品属于ipSIRS群体是更可能的。在实践中,该过程可通过基于评分带确定基本概率来进行。对于给定的评分带(即4-6),具有SIRS或脓毒症的个体的比例被计算。例如,如果在4和6之间的评分的40%是脓毒症,则如果受试者具有在4和6之间的指示物值,他们具有脓毒症的40%概率。因此,对于在参考分布内的给定的范围,属于一个组或另一个组(SIRS\/脓毒症)的概率可简单地是该组在范围内的比例。替代性技术是标准的贝叶斯方法。在这种情况下,该技术使用inSIRS评分的分布、ipSIRS评分的分布和受试者的指示物值。在该实例中,标准评分或等同物被用来生成指示物值属于inSIRS分布的概率:pr(inSIRS),且单独地指示物值属于ipSIRS分布的概率:pr(ipSIRS)。给定个体分布,贝叶斯方法被用来生成ipSIRS的概率。因此,考虑到对于两个或更多个组(即inSIRS\/ipSIRS)的导出的生物标志分布,对于单个未知样品进入每个分布的成员资格的概率可使用例如标准评分(z-评分)来计算(p-值)。然后,对于每个分布的p-值可使用例如贝叶斯规则或任何其他概率计算方法(包括频率学或经验或机器学习方法)被组合成对于每个分类(即inSIRS\/ipSIRS)的整体概率。因此,在指示物值已被导出并与指示物分布进行比较后,该比较的结果被处理系统201用来在步骤2535计算受试者具有ipSIRS的可能性,这被用来在步骤2540生成结果的表示,该表示在步骤2545被提供以展示,例如,向临床医师或医学从业者。这可通过在客户装置上展示表示来实现,诸如电子邮件、仪表盘指示等的一部分。表示的实例示于图27A和27B中。在该实例中,表示2700包括相对于线性标度2720移动的指示器2710。该线性标度被分成指示受试者是否患有水平1、2、3或4的区域2721、2722、2723、2724。对应的指示物数值在步骤2730展示,带有对应值是否代表在步骤2740所示的SIRS(inSIRS)或脓毒症(ipSIRS)的可能性的指示。评分的字母数字指示在步骤2751连同在步骤2752生物受试者具有脓毒症的相关概率一起被示出。如在该实例中所示的,指示器位于其中的线性标度的区域被突出显示,其中最不可能变为灰色的诊断试图使其中受试者所处标度变得完全清楚。这导致这样的表示,其当在步骤2545显示时,容易让临床医师容易理解并做出快速诊断。从以上应该理解,可提供用于在评估生物受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性中使用的方法,所述方法包括,在一个或更多个处理装置中:a)确定一对生物标志值,该对生物标志值选自由以下组成的组:i)第一对生物标志值,其指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度;ii)第二对生物标志值,其指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度;b)使用该对生物标志值确定指示所述多核苷酸表达产物的浓度的比率的指示物;c)从数据库检索先前被确定的第一指示物参考和第二指示物参考,所述第一指示物参考和所述第二指示物参考基于由第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物来确定,所述组之一由被诊断为具有该医学状况的个体组成;d)将所述指示物与所述第一指示物参考和所述第二指示物参考进行比较;e)使用所述比较的结果来确定指示所述受试者具有所述医学状况的概率;以及,f)生成所述概率的表示,所述表示被展示给用户,以允许所述用户评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性。相似地,可提供用于确定生物受试者具有inSIRS或ipSIRS的可能性的设备,所述设备包括:a)取样装置,其获得从生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)测量装置,其定量在所述样品内的多核苷酸表达产物,以确定一对生物标志值,该对生物标志值选自由以下组成的组:i)第一对生物标志值,其指示PLA2G7基因和PLAC8基因的多核苷酸表达产物的浓度;ii)第二对生物标志值,其指示CEACAM4基因和LAMP1基因的多核苷酸表达产物的浓度;c)至少一种处理装置,其:i)接收来自所述测量装置的该对生物标志值的指示;ii)使用所述生物标志值,使用所述第一多核苷酸表达产物和所述第二多核苷酸表达产物的浓度的比率确定指示物;以及,iii)将所述指示物与至少一个指示物参考进行比较;以及,iv)使用所述比较的结果确定所述受试者具有所述至少一种医学状况的可能性;以及,v)生成用于展示给用户的指示物和可能性的表示。可被提供的一种另外的方法包括区分生物受试者中的inSIRS和ipSIRS,所述方法包括:a)获得从显示SIRS的临床体征的生物受试者采集的样品,所述样品包含多核苷酸表达产物;b)在测量装置中:i)扩增在所述样品中的至少一些多核苷酸表达产物;ii)确定代表获得定义水平的多核苷酸表达产物需要的扩增程度的扩增量,包括:(1)用于PLA2G7基因和PLAC8基因的第一对多核苷酸表达产物的扩增量;(2)用于CEACAM4基因和LAMP1基因的第二对多核苷酸表达产物的扩增量;c)在处理系统中:i)检索所述扩增量;ii)通过以下确定指示物:(1)通过确定用于所述第一对的所述扩增量之间的差异确定指示所述第一对多核苷酸表达产物的浓度的比率的第一导出的生物标志值;(2)通过确定用于所述第二对的所述扩增量之间的差异确定指示所述第二对多核苷酸表达产物的浓度的比率的第二导出的生物标志值;(3)通过将所述第一导出的生物标志值和所述第二导出的生物标志值相加确定所述指示物;iii)从数据库检索先前被确定的第一指示物参考和第二指示物参考,其中所述第一指示物参考和所述第二指示物参考是对第一组参考群体和第二组参考群体确定的指示物的分布,所述第一组和所述第二组由分别被诊断为具有inSIRS和ipSIRS的个体组成;iv)将所述指示物与所述第一指示物参考和所述第二指示物参考进行比较;v)使用所述比较的结果来确定所述受试者被分类在所述第一组或所述第二组内的可能性;vi)生成至少部分地指示所述指示物和所述概率的表示;以及,vii)向用户提供所述表示,以允许所述用户评估生物受试者具有至少一种医学状况的可能性。另外,可提供一种用于确定在评估生物受试者具有至少一种医学状况的存在、不存在、程度或预后的可能性中使用的指示物的方法,所述方法包括:a)确定多个生物标志值,每个生物标志值指示对所述生物受试者的至少一种对应的免疫系统生物标志测量或导出的值,并且至少部分地指示在从所述受试者采集的样品中的所述免疫系统生物标志的浓度;b)使用所述多个生物标志值的组合确定所述指示物,其中:i)至少两种生物标志具有位于互相关性范围内的关于至少一种状况的互相关性,所述互相关性范围在±0.9之间;以及,ii)所述指示物具有大于或等于代表所述指示物诊断至少一种状况的存在、不存在、程度或预后的能力的性能阈值的性能值,所述性能阈值指示至少0.3的解释方差。遍及本说明书和以下的权利要求书,除非上下文另有要求,词语“包括(comprise)”,以及词形变化诸如“包括(comprises)”或“包括(comprising)”,应被理解为暗示包括列举的整数或整数的组或步骤,但不排除任何其他整数或整数的组。本领域技术人员应当理解,许多变化和修改将变得明显。对本领域技术人员变得明显的所有这样的变化和修改,应该被认为落入本发明宽广描述出现之前的精神和范围内。...
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