非编码RNA的预测方法与流程

文档序号:15020387发布日期:2018-07-25 00:34阅读:761来源:国知局

本发明一种非编码RNA的预测方法,属于生物信息学领域。



背景技术:

转录组主要由mRNA所组成,而高通量测序技术的发展和ENCODE项目为我们揭开了一个完全不同的世界。非编码RNA才是真正的主角。除了那些众所周知的RNA(如tRNA、rRNA),许多不同类型的调控RNA也进入研究者的视线。

长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们不编码蛋白。lncRNA的表达受到发育调控,是组织和细胞特异的。相当一部分lncRNA只位于细胞核内。它们包含许多类型的转录本,在结构上类似mRNA,有时也转录成编码基因的反义转录本。lncRNA被认为执行了重要的调控功能,也与疾病发展息息相关。



技术实现要素:

本发明目的是提供一种非编码RNA功能预测方法,该非编码RNA功能预测方法通过使用公共数据库获取数据,使用深度卷积神经网络训练数据从而形成分类器,再对真实测序数据进行预测。

本发明是通过以下技术手段实现的:

本发明的非编码RNA功能预测方法,包括训练数据模块、深度卷积神经网络模块和测序数据模块。

进一步,所述训练数据模块从公共数据库中获取测序数据。

进一步,所述深度神经网络用于构建分类器。

进一步,所述测序数据来自于真实样本的测序结果。

本发明的有益效果:本发明的非编码RNA功能预测方法,可对真实样本的测序数据进行预测。

附图说明

图1是本发明非编码RNA功能预测方法的原理示意框图。

具体实施方式

下面结合附图对本发明作进一步详细描述。

如图1所示,本发明的非编码RNA功能预测方法,包括训练数据模块、深度卷积神经网络模块和测序数据模块。所述训练数据来自于公开数据库;所述深度卷积神经网络用于从训练数据中构建分类器;所述测序数据来自于真实样本的测序结果。本发明的非编码RNA功能预测方法,可对真实样本的测序数据进行预测。

本行业的技术人士应该了解,本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和说明书中描述的只是用于说明本发明的原理,在不脱离本发明原理和范围的前提下,本发明还可有各种变化和改进,这些变化和改进都属于要求保护的本发明范围内。

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