技术总结
本发明公开了一种SAM及BAM文件CIGAR域的压缩及解压还原方法、系统和介质，本发明从压缩前的预处理出发，将一个操作符的CIGAR域数据编码为第一指定内容，跳转执行步骤A6）；将两个操作符的CIGAR域数据编码为只包含其中一个操作符及其数字部分的第二指定内容，将三个及以上操作符的CIGAR域数据编码省略第一个操作符M及其数字部分“\d+M”、最后一个操作符的操作符M得到第三指定内容，结合CIGAR域的特性进行预处理，从而可将CIGAR域的内容按照一定规则预处理以实现CIGAR域的高倍压缩，具有预处理高效快速、压缩比高、压缩效果好的优点，本发明可适用于SAM文件、BAM文件两种格式，具有应用范围广的优点。
技术研发人员：徐霞丽;李根;冯博伦;黄能超;赵丽霞;马丑贤;王振国;杨耀
受保护的技术使用者：人和未来生物科技(长沙)有限公司
技术研发日：2019.08.26
技术公布日：2020.01.17