一种鉴别NADC30-likePRRSV的PCR检测试剂盒的制作方法_2

文档序号:9838708阅读:来源:国知局
2-l,2-2,2-3)。 4、重复性试验结果 PRRSV NADC30-like (TJnh株)、HP-PRRSV(TJM-F92株)、Classical-PRRSV(VR2332株) 经3次重复RT-PCR扩增,均能扩出大小分别为628bp、93化P及102化P左右的目的条带,表明 本发明具有良好的重复性。
[0026] 5、临床样品检测结果 对2014-2016年送检的342份PRRSV疑似样品检测,结果检出NADC30-1化e PRRSV共11 份,HP-PRRSV共62份,Classical-PRRSV共21 份,阳性率分别为3.2%,18.1%,6.14%(图3)。检 测结果与I抓XX ELISA检测试剂盒检测结果相比较,相比试剂盒化ISA检测,本发明多检出 6份,其余样品检测符合率为100%;详见下表:
=、结论: (1)本发明试剂盒能够从发病临床病料中鉴别诊断NADC30-like PRRSV,且还可同时对 HP-PRRSV或Classical-PRRSV不同类型病毒混合感染进行鉴别诊断。
[0027] (2)本发明试剂盒具有特异性强,对临床常见CSFV、PRV、PCV2、PPVJEV、BVDV、SIV 病毒PCR均无特异扩增。
[002引 (3)本发明试剂盒具有高敏感性,对PRRSV NADC30-like (TJnh株)、册-PRRSV (TJM-F92株)、Classica^PRRSV(VR2332株)的最小DNA 检出量分别为 2.1pg、3.4pg、4.5pg。
【附图说明】: 图 1 特异性试验结果;其中 1-10 分别为 TJnh、TJM-F92、VR2332、CSFV、PRV、PCV2、PPV、 JEV、BVDV、SIV;M: IOObp Ladder,从上向下依次为:2000,1000,900,800,700,600,500,400, 300,200,100; 图2为敏感性试验结果;其中图2-1 PRRSV NADC30-like (Unh株)敏感性试验结果,1-5号浓度依次为21化旨、219旨、2.19旨、0.219旨、0.0219旨;图2-2册斗31?5¥(1'厕斗92株)敏感性 试验结果,1-5号浓度依次为340pg、34pg、3.4pg、0.34pg、0.034pg;图2-3 Classical-PRRSV (VR2332株)敏感性试验结果,1-5号浓度依次为450pg、45pg、 M:IOObp Ladder, 从上向下依次为:2000,1000,900,800,700,600,500,400,300,200,100; 图3为部分阳性样品RT-PCR扩增结果;其中1-18号为部分临床阳性样品,其中5号为 Classical-PRRSV, 1016bp; 10,17号为NADC30-like PRRSV,623bp(17号为NADC30-like PRRSV与HP-PRRSV混合感染);其余为HP-PRRSV,926bp;M: IOObp Ladder,从上向下依次为: 2000,1000,900,800,700,600,500,400,300,200,100; 图4为A、B场临床样品RT-PCR检测结果:其中I:A场采集临床样品;2 :B场采集临床样品 3:试剂盒阳性对照;4:Marker IOObp Ladder;5:HP-PRRSV(TJM-F92株)阳性对照;6:试剂盒 阴性对照,
【具体实施方式】: 下面通过具体的实施方案叙述本发明。除非特别说明,本发明中所用的技术手段均为 本领域技术人员所公知的方法。另外,实施方案应理解为说明性的,而非限制本发明的范 围,本发明的实质和范围仅由权利要求书所限定。对于本领域技术人员而言,在不背离本发 明实质和范围的前提下,对运些实施方案中的物料成分和用量进行的各种改变或改动也属 于本发明的保护范围。
[0029] 实施例1: NADC30-1 ike PRRSV临床样品检测 1、样品准备 A场采集临床样品,B场采集临床样品,PRRSV NADC30-like (TJnh株),HP-PRRSV(TJM-F92株),生理盐水空白对照。
[0030] 2、RNA 提取 取样品20化L,分别加入Trizol Reagent 600化,振荡混匀,室溫作用5 min,后加入 200化氯仿,振荡混匀,室溫作用5 minD4 °C、12 000 r/min离屯、10 min,取上清至新的 1.5 mL离屯、管中,加等体积异丙醇,颠倒混匀,室溫放置15 minn4 °C、12 000 r/min离屯、 10 min,弃上清;500化75%乙醇洗涂。4 °C,12 000 r/min离屯、10 min,自然干燥,加20 化DEPC水溶解。
[0031 ] 3、CDNA 合成 反应体系为(总体积20化):SXbuffer 化URandom primer 化L,dNTPs(2.5 mmol/ L)化L,MgC12 化L,RNase Inhibito;r(40 U/uL) 0.5 化,M-MuLV Reverse Transc;rip1:ase (5 UAiUO.S 化,RNA 模板 10 化。反应条件为:30 °C 10 min,42 °C 解育 I h,95 °C 5 min,4 C保存备用。
[0032] 4、RT-PCR 扩增 PCR反应体系为20 yL:10XPCR buffer 2 化,dNTPs(2.5 mmol/L)2 化,Mgcl2 I 化, 上、下游引物各I化jTaq (5 UAiL)0.5化,cDNA模板5化,加去离子水至20化,混合 均匀,同时设立阴性和阳性对照。PCR反应条件:95°C5min; 94°C40s,56°C 30s,72°C Imin,共 30个循环;最后72 °C延伸lOmin。
[0033] 5、结果判定 结果判定通过观察样品PCR扩增产物电泳检测图,根据有无特异性扩增产物的目的条 带出现来判定。
[0034] 电泳步骤如下: (1)配制50X TAE电泳缓冲液(P册.5):称取Tris-碱242g,冰醋酸57.Ig, NasEDTA* 2出0 18. 61g,去离子水调整体积到1L。
[003引(2)制胶:将50 X TAE电泳缓冲液稀释50倍,配制成1 X TAE电泳缓冲液,称取0. Sg琼 脂糖微波炉加热,使其溶于IOOmL的1 X TAE电泳缓冲液中,加入10化漠化乙锭(Img/mL)。 [0036] (3 )电泳:调节电压至80V,电泳时间20min。
[0037] (4)观察结果:本次电泳结果图如附图4所示,点样顺序从左至右依次为: 1: A场义集临床样品; 2:B场采集临床样品 3:PRRSV NADC30-like (Unh株)阳性对照; 4:Marker IOObp Ladder; 5: HP-PRRSV (T JM-F9 2株)阳性对照; 6:空白对照,即生理盐水; 从电泳结果可看出,阳性对照出现特异性扩增条带,阴性对照无扩增条带,实验成立。 故判定A场采集临床样品无特异性扩增条带,为PRRSV NADC30-like感染阴性;B场采集临床 样品有特异性扩增条带,为PRRSV NADC30-like感染阳性。
【主权项】
1. 一种用于鉴别猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒的特异性引物,其特征在于它的 上游引物序列为:5-ATGTTGTGCTTCCTGGGGTTG-3, 下游引物序列为:5-CTTGACAGGGAGCTGCTTGA-3 所述的猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒包括:HP-PRRSV,Classical-PRRSV,NADC30-like PRRSV〇2. -种用于鉴别猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒的特异性引物的PCR试剂盒,其特征在 于所述试剂盒主要包括权利要求1所述的特异性引物、PCR Buffer、dNTPs、rTaq酶、Marker 及阳性和阴性标准品,其特异性引物: 上游引物序列为:5-ATGTTGTGCTTCCTGGGGTTG-3, 下游引物序列为:5-CTTGACAGGGAGCTGCTTGA-3。3. 采用权利要求2所述的PCR试剂盒进行检测的方法,其特征在于按如下的步骤进行: (1) 提取待测样品的核酸; (2) 以特异性引物对检测样品进行PCR扩增反应; (3) 扩增反应结束后,进行琼脂糖凝胶电泳; (4) 观察电泳检测图,根据特异性目的条带判定结果。4. 权利要求2所述的PCR试剂盒检测方法,其特征在于:反应总体积为25yL,包括10 X Buffer 2.5yL,dNTPs 2. OyL,上游引物1. OyL下游引物1. OyL,rTaq酶0.5yL,待测样品的核 酸4.0yL,超纯水补至总体积25yL;所述扩增反应的反应条件为:95°C预变性5min,94°C变 性 30s,56°C 退火 30s,72°C 延伸 458,30个循环,72°(:延伸1〇11^11。5. 权利要求2所述的PCR试剂盒检测方法,其特征在于:步骤中所述特异性扩增产物的 大小为NADC30-like PRRSV 628bp、HP-PRRSV 931bp、Classical-PRRSV 1021bp。6. 权利要求2所述鉴别猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒的特异性引物的PCR试剂盒在检 测临床样品NADC30-like PRRSV感染方面的应用。
【专利摘要】本发明提供了一种鉴别NADC30-like?PRRSV?的PCR检测试剂盒及检测方法。所述试剂盒主要包括特异性引物和PCR反应试剂,所述特异性引物还能够同时检测HP-PRRSV及Classical-PRRSV。本发明针对NADC30-like?PRRSV提供了一种快速、敏感、特异PCR检测试剂盒和检测方法,为NADC30-like?PRRSV早期快速诊断及其综合防控提供了基础。
【IPC分类】C12Q1/68, C12Q1/70, C12N15/11
【公开号】CN105603127
【申请号】CN201610192662
【发明人】孙英峰, 李志 , 路超, 韩伟, 王利丽, 杨春蕾, 任卫科, 田向学, 李富强, 张莉, 李秀丽, 付永利, 于海霞, 张立新, 李泽青
【申请人】天津市畜牧兽医研究所
【公开日】2016年5月25日
【申请日】2016年3月30日
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