用于检测癫痫发作和癫痫的生物标志物和方法与流程

文档序号:16989721发布日期:2019-03-02 00:52阅读:753来源:国知局
用于检测癫痫发作和癫痫的生物标志物和方法与流程

本申请主张2016年1月4日提交的美国临时申请号62/274,551和2016年1月4日提交的美国临时申请号62/274,578的权益,所述申请的完整内容通过引用并入本文。

政府支持

本发明是在美国国立卫生研究院授予的拨款号1r43ns079029-01a1下的政府支持进行的。政府可以具有本发明中的某些权利。

发明领域

癫痫性癫痫发作难以诊断,并且经常难以与具有相似表现的几种病况区分开,因此,癫痫发作的诊断经常是漫长、昂贵且不可靠的过程。预测模型(evoscoretm)使临床医生能够通过排除癫痫来快速对患者进行分类。预测模型将允许患者立即进行至最有可能导致有效治疗的诊断方案,节省大量时间和金钱,并使患者节约免于不必要的测试。

本教导通常涉及与炎症和癫痫发作相关的生物标志物,以及通过对来自受试者样品的定量数据集进行评分来表征生物学病况的方法以及本文所述的各个其他实施方案。

本申请涉及在所有临床设置中的癫痫发作和癫痫诊断和病因学分类的血液测试。在一些实施方案中,提供了指示癫痫发作或具有癫痫发作的倾向的个别生物标志物和生物标志物的组/阵列,包括用于检测癫痫发作的方法,用于评价治疗癫痫发作的有效性、具有癫痫发作的倾向或治疗导致癫痫发作的任何潜在病症的方法以及诊断试剂盒。在其他实施方案中,提供了预测模型,其提供预测与癫痫发作和癫痫相关的阶段性和强直性变化的定量和定性评分。该评分可用于通过提供数字“定量”或高、中或低“定性”或正或负“定性”来评定阶段性和强直性变化的等级和/或测量阶段性和强直性变化,划入或排除事件,评估患者生活质量和治疗有效性。

发明背景

癫痫发作和癫痫是非常常见的神经系统病症,其与显著的发病率、健康护理成本和甚至死亡率相关。癫痫是偏头痛、中风和阿尔茨海默氏症后第四常见的神经系统病症。癫痫是一种常见的神经系统疾病,其影响美国超过230万患者和全球6500万患者,具有巨大的经济负担。目前的估计是癫痫影响世界人口的大约1%。目前治疗癫痫的总活动病例的患病率为1780万,其中印度(750万),中国(490万)和美国(230万)领先于其他国家。癫痫护理的经济负担是巨大的,其中由适当诊断所需的测试贡献主要费用。据估计,美国的癫痫和癫痫发作引发直接和间接成本的176亿美元的估计每年成本。为具有癫痫发作的患者提供护理的主要限制是缺乏诊断性血液测试以将临床事件鉴定为癫痫发作而不是其他病症,诸如短暂性脑缺血发作、昏厥、睡眠障碍和精神性事件。

由自发性和复发性癫痫发作定义的癫痫是一种非常普遍的公共健康问题。也称为“癫痫发作病症”,直到患者已具有两次不是由已知的医学病况引起的癫痫发作之后才诊断出癫痫。在70%的新病例中,没有原因是明显的。大约30-50%的已具有单次无端癫痫发作的人将发展复发性癫痫发作(癫痫)。三分之一的具有癫痫的患者忍受不受控制的癫痫发作,因为没有可用的治疗对他们起作用。

尽管许多研究已致力于开发新的抗癫痫药物(aed),但“金标准”诊断方案–其经常取决于eeg-一直保持不变和不足。当患者呈现疑似癫痫发作时,诊断该事件是否由癫痫或另一病症引起的过程最经常是漫长且昂贵的。患者经历漫长的检查,其通常包括血液测试、成像研究、eeg和视频eeg(在可获得的情况下)。在其他医疗病况被“排除”的情况下,诊断经常是排除者之一;并且如果eeg记录癫痫性癫痫发作“事件”,则通常进行癫痫的明确诊断,尽管其通常在住院患者癫痫监测单元中漫长和昂贵的停留期间发生。

除了与健康系统长期接触相关的高成本之外,目前的癫痫诊断状态代表了另一个关键问题:在不存在良好的早期诊断分类工具的情况下,因其他潜在病况而经历怀疑的癫痫发作的患者可能用aed错误地过度治疗或治疗不足,在此时间期间,他们的潜在病况实际上仍未得到治疗,同时他们经历不期望的药物副作用。因此,患者的病况(无论癫痫与否)的及时诊断仍然是重要的未满足的医疗需求。

癫痫诊断方法

准确诊断癫痫是非常有挑战性和耗时的,因为临床医生很少观察到实际的癫痫发作,而且存在许多不同类型的癫痫发作和癫痫综合征,其具有不同的表现。此外,其他神经系统病症可以模拟癫痫发作,导致错误诊断,不适当的治疗(其具有显著的潜在不良事件),不正确的预后以及显著的医疗护理资源的浪费。临床事件,诸如运动障碍,例如震颤、抽动、运动障碍、昏厥/晕厥、短暂性脑缺血发作(tia)、睡眠障碍/异睡症和躯体精神障碍(somatiformpsychiatricdisorders)可以甚至被经验丰富的临床医生误认为是癫痫发作。对癫痫发作进行明确诊断对于长期患者健康和结果至关重要,这将导致早期治疗,随后的随访和监测、咨询和支持。目前,获得癫痫发作或癫痫的明确诊断对于患者是昂贵且不方便的,因为它可能需要住院患者评估和一系列昂贵的测试。癫痫的诊断多年来依赖于广泛昂贵且经常繁琐的医学神经学评估,其包括:

·“金标准”测试是脑电图(eeg)。如果在记录期间捕获癫痫发作,则癫痫发作活动将在eeg上显示为快速尖峰波。脑损伤,即肿瘤、中风,可以引起正常电脑节律的减慢。eeg的挑战在于其通常作为事后测定进行,即在临床事件结束后进行,并且实际上可能是正常的。连续eeg是在医院进行以获得延长的模式并试图在发生时“捕获”癫痫发作的24小时eeg。这需要昂贵的住院患者医院停留,并且无法确切知道在停留期间是否会发生临床事件。显然,这为门诊和急诊室(ed)设置中的护理人员提供了重大的后勤挑战,因为大多数患者在事件已结束后来到ed并且仅收集历史信息;单次癫痫发作的明确诊断基本上是不可能的,并且充其量是经验性的。eeg充其量只有约30%至50%的敏感度(测量正确鉴定的阳性比例)和50%特异性。

·病史,以确定围绕首次癫痫发作样事件、事件的持续时间和频率以及发病年龄的情况。经常,患者或护理人员无法给出准确诊断所需的细节水平。由于护理人员不在场或未能保持准确记录的事实,缺失的信息通常包括发病时间和事件持续时间。癫痫发作样事件是患者、护理人员和反应者的创伤性事件,其中第一反应是照顾患者而不是跟踪诊断所必需的时机或其他信息。

·实验室研究,包括全血计数(cbc)、化学代谢组(cmp)和毒理学筛选测试。这些不能诊断“癫痫发作”本身,而是可以提供解释神经功能障碍的线索。催乳素水平的测量是不可靠的。eeg用于评估几种类型的脑部病症。

·mri是一种用于创建脑部的图像或扫描的技术。mri扫描可用于检查人的脑部结构。mri扫描本身不能确定该人是否具有癫痫,但当与其他信息一起考虑时,可以帮助临床医生确定癫痫是否是癫痫发作样事件的可能原因。

·pet扫描可用于定位引起癫痫发作样事件的脑部部分,因为其可为临床医生提供关于身体中的细胞如何发挥功能的额外信息。尽管pet扫描在一些情况下是有帮助的,但它们通常显示与癫痫无关的异常,并且不那么经常是诊断过程的一部分。

·腰椎穿刺是一种通过针吸抽取脊髓周围流体并在实验室中分析的程序。进行其以排除感染,诸如脑膜炎或脑炎,作为癫痫发作样事件的原因。

及时诊断:未满足的需求

在临床事件被查明为癫痫性癫痫发作之前,诊断过程可能花费几个月,并且临床护理经常主要是经验性的,其基于支持但不是明确的证据–经常导致诊断和治疗不足或过度。因此,及时且准确的癫痫发作诊断仍然是未满足的医疗需求。诊断过程不仅长,而且对健康护理系统有很大的负担,仅在美国,癫痫诊断方法的每年数据总计超过150亿美元。因此,我们在几乎每种临床设置中对癫痫发作的临床评估中的一个关键缺口是癫痫发作的准确诊断血液测试,其可用于单次或复发事件以鉴定脑部活动中的阶段性和强直性变化。可以设想许多临床情景,其中癫痫发作的临床诊断测试对于解释患者的临床状况是宝贵的:1)个体在家中塌下后被带到ed;2)个体被发现困惑且街上徘徊;3)住院患者具有短暂情节的无反应或精神状态改变;4)没有eeg、ct或mri可容易得到的第三世界国家的患者。一种可以提供临床事件的即时和明确的解释且具有可操作的结果的简单的血液测试将是一个巨大的诊断进展,并且可以朝向(“划入”)或远离(“排除”)癫痫指导进一步研究,节省资源、时间和费用。简而言之,对癫痫发作的简单血液测试将是一项重大创新。

准确诊断癫痫是非常有挑战性和耗时的,因为临床医生很少观察到癫痫发作,且存在许多不同类型的癫痫发作和癫痫综合征,其具有不同的表现。癫痫的诊断多年来依赖于“金标准”,以包括患者病史(包括全血计数和化学代谢概况)和脑电图(eeg)。一旦分析这些,临床医生还可以在可用的情况下进行磁共振成像(mri)和连续视频eeg(veeg)。额外诊断技术可以包括正电子发射断层摄影(pet)扫描和腰椎穿刺(脊椎穿刺)。使用金标准eeg诊断癫痫的主要挑战是eeg对癫痫的灵敏度低(范围在25-56%之间)的事实。特异性更好,但也在78-98%变化-因为特异性取决于阅读eeg的医生的技能。此外,尽管通常足以适当诊断癫痫发作病症,但对于具有癫痫的患者,eeg可以表现为持续正常。实际上,在我们的研究中,eeg被证明具有37-55%的灵敏度,98-99%的特异性,98%的ppv和64-66%的npv,这证实了在诊断癫痫发作时需要进行使灵敏度最大化的测试。

重要的是,如上所述,尽管患者正在经历数月的癫痫诊断操作,但他们通常进行一段时间的aed药物试验和错误,以确定哪种药物(如果有的话)控制其癫痫发作。特别是当考虑aed的副作用负担和一些情况下致畸后果时,这种不必要的药物成本是巨大的,并且当与长诊断过程组合时,对健康护理系统的负担很大,仅在美国,癫痫诊断方法的每年数据总计超过150亿美元。

为了简化癫痫诊断,已观察到癫痫发作后催乳素水平升高。催乳素应用于癫痫发作诊断的进一步临床评估表明,如果在癫痫发作的10至20分钟之间收集样品,则催乳素仅仅是癫痫发作的可行生物标志物。此外,催乳素仅适用于癫痫发作的子集,包括原发性或继发性全身性强直-阵挛性癫痫发作和颞叶起源的部分复杂性癫痫发作。因此,可行性的短窗口(之后数分钟),以及诊断灵敏度、特异性和准确度不足,排除了催乳素作为实际的癫痫发作生物标志物,并且如果如今在临床设置中曾经使用,则很少。

炎症和癫痫发作之间的联系

癫痫发作在癫痫发作开始的脑组织中诱发炎性反应。例如,在顽固性癫痫患者的切除脑标本中可能存在强烈的炎性反应,包括关键的促炎细胞因子和趋化因子诸如肿瘤坏死因子α(tnfα、白介素-8(il-8)、白介素-6(il-6)和干扰素γ(ifnγ)的表达。在小鼠癫痫发作模型中也已检测到tnfα、il-8、il-6和ifnγ水平的增加,突出了这样的观点:脑中的炎性过程有助于癫痫发作的发病机制和慢性癫痫病灶的建立。同样在癫痫发作后立即在癫痫发作患者的脑脊液中检测到这些细胞因子中的许多。几种细胞因子受体亚型的表达也在神经元和星形胶质细胞上被上调,表明活化的细胞内信号传导的机制,突出了脑中细胞因子的自分泌和旁分泌作用。细胞因子和经典神经递质诸如谷氨酸和gaba之间的功能性相互作用表明这些相互作用是确立的细胞因子介导的神经元兴奋性变化的基础、因此促进癫痫发作的可能性。还有明显的证据证明急性癫痫发作可以诱导血-脑屏障通透性增加。已显示该作用促进活化的t细胞和巨噬细胞进入脑组织,促进脑中的炎性反应,并助长脑特异性炎性细胞因子和趋化因子向外周血液中的渗漏。

icam5是一种神经元糖蛋白,其仅在脑中表达,并经由t细胞移动性和趋化作用的抑制而作为抗炎蛋白发挥功能。icam5局限于神经元中的胞体和树突,并且其在树突丝状伪足中富集,在更成熟的树突棘中表达较少。icam5具有复杂的结构,其具有9个外部免疫球蛋白结构域,随后是跨膜和细胞质结构域。外部部分结合β1-和β2-整联蛋白和基质蛋白玻连蛋白,而其跨膜结构域结合早老素且细胞质结构域结合α-辅肌动蛋白和细胞质蛋白的erm家族。当切割和释放时,icam5变成可溶形式(sicam5)并且可以释放至细胞外空间和血液中。sicam5强烈刺激神经突向外生长。在免疫电子显微镜研究中,发现icam5位于锥体细胞树突的突触后棘的表面膜,但不位于海马ca1区的轴突末端的表面膜。通过用抗icam5抗体或重组sicam5蛋白阻断icam5,抑制海马中的schaffer侧支-ca1突触的长时程增强(ltp)。这些观察结果表明sicam5介导的细胞-细胞相互作用作为ltp发展的关键步骤的作用。随后的研究显示,sicam5可以充当白细胞与脑中的神经元结合的主要粘附分子。在一个小群组中,在具有颞叶癫痫的患者的脑脊液和血清中报道sicam5水平增加,在多发性硬化症或阿尔茨海默氏病中则没有报道变化。nmda受体的活化通过金属蛋白酶(mmp)介导的icam-5切割促进树突棘发育,并有助于神经元兴奋性。另外,证明了sicam5在调节小鼠脑炎模型中脑中趋化因子产生中发挥关键作用。使用单细胞记录发现,icam-5胞外域刺激ampa微型兴奋性突触后电流(mepsc)的频率而非幅度的增加。使用生物素化和沉淀测定,已发现icam-5胞外域引起glua1、但非glua2、ampar亚基的膜水平增加。发现icam-5相关的glua1磷酸化增加。同时,icam-5引起glua1表面染色沿着树突的增加,而不引起树突棘数量的增加。这表明sicam-5增加谷氨酸能传递并且可能受脑网络活动变化的影响。

tarc(胸腺和活化调节的趋化因子;ccl17)是一种趋化因子(即细胞因子,其负责t和b淋巴细胞、单核细胞、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞在过敏和其他炎性状态下的运动),其主要在胸腺和血液单核细胞中表达。tarc作为促炎细胞因子和淋巴细胞化学引诱物发挥功能,其特异性结合t细胞上的ccr4受体并诱导t细胞系中的趋化性。由于tarc结合ccr4,因此其被认为是th2型趋化因子。tarc由多种细胞类型(包括树突细胞、内皮细胞、角质形成细胞和成纤维细胞)产生。血清tarc水平已被显示是特应性皮炎(影响儿童和成人的皮肤的炎性病症)中的疾病活动的有用测定。实际上,tarc是一种确定的炎症的全身变阻物。tarc在脑中的脉络丛中表现出低水平表达,但神经元或星形胶质细胞表达最少。然而,由于癫痫发作,对血浆tarc表达的变化知之甚少。

tnf-α是一种分泌的细胞因子,其已牵涉于一定范围的神经系统病症,包括中风、阿尔茨海默氏病、癌症和孤独症。许多研究已经检查了实验性癫痫模型系统以及人类样品(包括csf和血清)中的tnfα水平。大鼠中的红藻氨酸诱导的癫痫发作诱导海马中tnf-α的表达。在具有自发性癫痫发作的狗中,tnf-α水平在csf中升高,并且在小鼠癫痫发作模型中操纵tnf-α信号传导级联可以减弱癫痫发作。tnf-α水平在具有颞叶癫痫的患者中稳健升高,表明它是脑中炎症的广泛标志物,尤其是在癫痫发作的设置中。

如本文所示,所述发明改善了本领域的缺陷。实际上,基于实验模型和具有癫痫的人中炎症和癫痫发作之间的联系,患者血浆中的初始蛋白质组学筛选用于探测与炎性细胞因子相关的一组生物标志物,其被假设在我们的研究中响应于癫痫发作表现出阶段性或强直性变化。据推测,特定血浆蛋白水平的可测量变化可以产生癫痫发作的诊断血液测试。在20名癫痫患者的群组中,通过基线(癫痫发作前)和癫痫发作后24小时(通过eeg记录在emu中记录)时的多重elisa分析血浆样品。发现与正常对照相比,在癫痫发作患者中胸腺和活化调节的趋化因子(tarc或ccl17)与细胞间粘附分子5(sicam5或端脑素(telencephalin))的可溶性同种型的比率是统计学差异的。随后,发现与对照个体相比,已患有癫痫发作的患者中的血浆tnfα水平也是统计学显著差异的。在另一组131名进入癫痫监测单元的神经病学患者和30名正常对照中,在癫痫发作前和癫痫发作后1小时至超过72小时分析患者样品,并设计可以区分癫痫和非癫痫事件血浆样品的涉及tnfα、tarc和sicam5的算法。

发明概述

在一个实施方案中,本发明包括evoscore,一种基于血液的诊断测试,其有效地筛选来自患者的血浆以鉴定癫痫发作后所选蛋白的可测量变化。三种与炎性过程相关的蛋白,tarc、sicam5和tnf-α,用于生成具有相关评分的预测算法(evoscore预测模型tm),其可以转化为癫痫发作的诊断测试。该算法(其组合蛋白水平与患者人口统计学特征),已经以强大的诊断性能表明,具有癫痫发作和癫痫的患者中的阶段性和强直性变化(急性和慢性)的预测-既排除患者,又划入具有癫痫发作和癫痫的患者,具有随着时间和随着治疗过程监测患者的能力。evoscore可用于所有临床和健康护理设置中。

在一个实施方案中,本发明包括用于诊断哺乳动物受试者中的癫痫和/或癫痫发作的方法。在一些实施方案中,所述方法可以包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂接触的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括使所述获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括使所述获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tnf-α的表达水平的诊断试剂接触的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括比较sicam5、tarc和tnf-α的浓度与正常对照浓度的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括比较sicam5、tarc和tnf-α的浓度比与正常对照浓度比的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括诊断哺乳动物受试者中的癫痫的步骤。

在一个实施方案中,本发明包括用于诊断哺乳动物受试者中的癫痫和/或癫痫发作的方法,其可以包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括使所述获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tnf-α的表达水平的诊断试剂接触的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括比较tarc和tnf-α的浓度与正常对照浓度的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括比较tarc和tnf-α的浓度比与正常对照浓度比的步骤。在一些实施方案中,所述方法可以包括诊断哺乳动物受试者中的癫痫的步骤。

在一个实施方案中,本发明包括用于为患者生成定量数据的试剂盒。在一些实施方案中,所述试剂盒可以包括能够测量取自患者的血浆或血清样品中可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂。在一些实施方案中,所述试剂盒可以包括能够测量取自患者的血浆或血清样品中tarc的表达水平的诊断试剂。在一些实施方案中,所述试剂盒可以包括能够测量取自患者的血浆或血清样品中tnf-α的表达水平的诊断试剂。在一些实施方案中,所述试剂盒可以包括用于比较sicam-5、tarc和tnf-α的表达水平与正常对照的表达水平的分析单元。

在一个实施方案中,本发明包括用于对样品评分的系统,所述系统比较sicam5、tarc和tnf-α的表达水平与正常对照以确定癫痫。

在一个实施方案中,本发明包括具有软件的计算机,其中所述软件比较sicam5、tarc和tnf-α的表达水平与正常对照以确定癫痫。

在一个实施方案中,本发明包括治疗sicam5、tarc和tnf-α的血浆或血清表达水平或其组合的比率相对于正常对照改变的患者中的癫痫发作病症的方法,所述方法包括向患者施用癫痫的疗法。

附图简述

当结合附图阅读时,将更好地理解本发明的前述概述以及以下详述。

图1说明不同类型的癫痫发作的标准。

图2说明算法的目标和最终可操作结果。

图3说明通过逻辑回归从对个别事件诊断(24小时)建模获得的roc曲线。

图4说明通过逻辑回归从对患者诊断(24小时)建模获得的roc曲线。

图5说明通过逻辑回归从对患者诊断(24小时)建模获得的roc曲线。

图6说明分类树算法使用分类和回归树算法正确地对来自对照样品的癫痫发作事件进行分层的性能。

图7说明通过多元逻辑回归(包括由分类树分析定义的风险组)从对个别事件诊断(24小时)建模获得的roc曲线。

图8说明通过多元逻辑回归(包括由分类树分析定义的风险组)从对个别事件诊断(所有小时)建模获得的roc曲线。

图9说明通过多元逻辑回归(包括由分类树分析定义的风险组)从对患者诊断(24小时)建模获得的roc曲线。

图10说明通过多元逻辑回归(包括由分类树分析定义的风险组)从对患者诊断(24小时)建模获得的roc曲线。

图11说明通过多元逻辑回归(包括由分类树分析定义的风险组)从对门诊患者结果建模获得的roc曲线。

发明详述

在癫痫中,在癫痫发作开始的区域内生成免疫反应。在几种不同的组织损伤类型(诸如结节性硬化症(tsc)和内侧颞叶硬化症(mts))中,促炎细胞因子诸如il-1β、il-6、tnf-α、fas和fas-配体被活化。此外,存在补体固定和沉积、改变的血-脑屏障通透性和巨噬细胞浸润。炎症可以生成各种各样的下游效应,包括il-1β产生的上调,tlr4、nfκb、mtor和mapk级联的活化,活化的淋巴细胞、小胶质细胞和巨噬细胞的吸引,以及星形胶质细胞生理学的改变。此外,还可以调节与抗炎细胞因子的相对平衡,表明细胞因子如il-4、il-10和il-13的水平的变化。不受理论所束缚,这些变化可以是导致癫痫发作、由癫痫发作引起的疾病过程的结果,和/或是癫痫发作的结果(参见图1)。所开发的诊断测试和算法能够区分癫痫发作与无癫痫发作,以及癫痫与正常(参见图2)。本申请解决了本领域中对与癫痫发作相关的标志物的需求。

如本文所用,缩写“a1at”和“a1at”是指α1-抗胰蛋白酶,也称为丝氨酸蛋白酶抑制肽酶抑制剂,进化枝a(α-1抗蛋白酶、抗胰蛋白酶),成员1。

术语“包含”和“包括”可互换使用,除非另有说明。

术语“隐原性”在本文中用于指未知来源的癫痫发作或癫痫。

术语“阶段性”在本文中用于指与立即或突发事件或癫痫发作直接相关的血液生物标志物的变化。血液中的变化是短暂的,并在事件后的特定时间段内消退。

术语“强直性”在本文中用于指与患者的首要病况相关的血液生物标志物的持续或恒定变化。所述水平可与对照受试者中的那些区分,并且不会基于患者是否已经历有其病况的症状的事件而显著波动。

术语“急性”在本文中用于指与立即或突发事件或癫痫发作直接相关的血液生物标志物的变化。血液中的变化是短暂的,并在事件后的特定时间段内消退。

术语“慢性”在本文中用于指与患者的首要病况相关的血液生物标志物的持续或恒定变化。所述水平可与对照受试者中的那些区分,并且不会基于患者是否已经历有其病况症状的事件而显著波动。

术语“疾病”、“病症”或“病况”在本文中用于指被认为或诊断为导致、引起或影响癫痫发作的任何表现、症状或表现或症状的组合。该术语包括但不限于创伤、炎性和自身免疫反应、生理学畸形和遗传缺陷。

缩写“gm-csf”是指粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子。

缩写“hgf”是指肝细胞生长因子。

缩写“icam-1”是指细胞间粘附分子1。

术语“猝发的”是指生理状态或事件,诸如癫痫发作。

术语“指示(indicative)”(或“指示(indicativeof)”)涵盖预测(包括倾向)和检测(接近发生癫痫发作),并且除非另有说明,否则涵盖该术语的实施方案旨在限定和涵盖特定于预测、特定于检测以及用于预测以及用于检测过去或当前事件的实施方案。结合术语“倾向”使用术语指示仅旨在强调过去事件相比于未来事件的倾向的证据,但仅使用指示旨在涵盖倾向,除非另有说明。

缩写“bdnf”是指脑源性神经营养因子。

缩写“mcp-1”是指单核细胞趋化蛋白-1,也称为趋化因子(c-c基序)配体2(ccl2)或其变体。

缩写“mdc”是指巨噬细胞源性细胞因子,也称为c-c基序趋化因子22(ccl-22)或其变体。

缩写“mip-1β”是指巨噬细胞炎性蛋白-1β,也称为趋化因子c-c基序配体4(ccl-4)或其变体。

缩写“ip-10”是指干扰素γ诱导的蛋白10、小诱导型细胞因子b10、c-x-c基序趋化因子10(cxcl10)或其变体。

嗜酸性粒细胞趋化因子,也称为嗜酸性粒细胞趋化因子-1,是指趋化因子(c-c基序)配体11(ccl11)或其变体。

嗜酸性粒细胞趋化因子-3是指趋化因子(c-c基序)配体26(ccl26)或其变体。

术语“样品”在本文中用于指血浆或血清样品,除非另有说明。在本文所述的每个实施方案中,血浆的使用被认为是独立于血浆或血清的替代物的实施方案。在本文所述的每个实施方案中,血清的使用被认为是独立于血浆或血清的替代物的实施方案。在本文所述的每个实施方案中,根据本领域中用于获得样品和分析样品的常规技术考虑使用另一种生物样品,包括但不限于脑脊髓液(csf),通过切除获得的组织样品,唾液和尿液。可以在使用前处理样品,例如从血液制备血浆,稀释粘性流体等。处理方法可以涉及过滤,蒸馏,提取,浓缩,失活干扰组分,添加试剂等。

术语“癫痫发作”和“癫痫”可互换使用,除非另有说明,否则癫痫的临床诊断需要两次无端的癫痫发作。术语癫痫也可以通过对提交本申请时所理解的癫痫发作的理解或理论来定义。癫痫包括且不限于所有形式的癫痫。

术语“受试者”、“个体”和“患者”在本文中可互换用于指从中采集样品的哺乳动物,除非另有说明。该术语旨在涵盖对于人特定的实施方案。受试者、个体或患者可能患有、有风险或怀疑具有有癫痫发作或有癫痫发作症状的病症的倾向。该术语还包括用于食物或作为宠物繁殖的家畜,包括马、牛、绵羊、猪、猫、狗和动物园动物。用于治疗的典型受试者包括易患、患有或已患有一次或多次癫痫发作的人。具体而言,用于根据本发明的治疗的合适受试者是易患或已患有一次或多次癫痫发作的人。

缩写“tarc”是指'胸腺和活化调节的趋化因子',并且在本文中可与趋化因子(c-c基序)配体17(ccl17)互换使用。

术语“端脑素(telencephalin)”、“tln”、“icam-5”和“icam5”在本文中可互换使用。

术语“倾向”,例如“具有癫痫发作的倾向”,意指事件(例如癫痫发作发生或复发)的合理医学概率。该术语还涵盖在持续治疗之前、之后或期间可以发生此类事件的频率。

如本文所用,术语“治疗(treat)”或“治疗(treating)”是指用于部分或完全减轻、改善、缓解、抑制、预防在任何临床环境中特定病况(例如癫痫发作或癫痫发作相关的病症)的一种或多种症状或特征,延迟其发作,降低其严重程度和/或降低其发生率的任何方法。治疗可以出于降低发生与病况相关的病理学的风险的目的施用于没有表现出病况的体征和/或仅表现出病况的早期体征的受试者。因此,取决于受试者的状态,该术语在本发明的一些方面可以指预防病况,并且包括预防病况的发作或预防与病况相关的症状。该术语还包括维持病况和/或症状,使得病况和/或症状的严重程度不会进展。治疗可以以急性或慢性方式进行。该术语还指在患有病况之前降低病况或与这种病况相关的症状的严重程度。这种在患病前预防或减轻病况的严重程度是指向在施用时未患有该病况的受试者施用疗法。预防还包括预防病况的复发、其频率或与这种病况相关的一种或多种症状。术语“治疗”和“治疗性”是指治疗的行为,因为“治疗”如上所定义。干预的目的是对抗该病况并包括施用疗法以预防或延迟症状或并发症的发作,或减轻症状或并发症,或消除病况。例如,治疗可用于改善与病症相关的症状或其频率(例如,癫痫发作的频率)。

术语“结节性硬化症”、“结节性硬化症复合症”和缩写/首字母缩略词“ts”和“tsc”在本文中可互换使用。

缩写“vcam-1”是指血管细胞粘附分子1。

缩写“vegf-a”是指血管内皮生长因子a。

sicam5

icam-5是相对于健康患者,在癫痫患者的血浆或血清中差异分布的神经元源性蛋白。可溶性icam-5(也称为sicam5、sicam-5或其变体)响应于炎症通过金属蛋白酶从icam-5切割。出乎意料的是,相对于健康患者,在癫痫发作患者的情况下发现sicam-5表达改变。sicam-和/或组合,sicam-5/tarc和/或sicam5/tnf-α比率与健康对照相比改变。

在一个实施方案中,提供了多肽表达组或阵列,所述组或阵列包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的可溶性icam-5(sicam-5)的探针,其中sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照改变表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

tarc

tarc也是一种有效的标志物,相对于健康患者,其在癫痫患者的血浆或血清中差异分布,并且显示其在癫痫发作患者中升高。在一个实施方案中,tarc和/或组合,sicam-5/tarc和/或tnf-α/tarc比率与健康对照相比改变。

在另一个实施方案中,提供了多肽表达组或阵列,所述组或阵列包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针,其中tarc的血浆或血清浓度相对于健康对照改变表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

tnf-α

tnf-α也是一种有效的标志物,相对于健康患者,其在癫痫患者的血浆或血清中差异分布,并且显示其在癫痫发作患者中升高。在一个实施方案中,tnf-α和/或sicam-5/tnf-α和/或tnf-α/tarc比率与健康对照相比改变。

在另一个实施方案中,提供了多肽表达组或阵列,所述组或阵列包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中tnf-α的血浆或血清浓度相对于健康对照改变表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

sicam-5和tarc

还提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针,其中sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化和/或tarc的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

sicam-5和tnf-α

还提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中sicam-5的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

tarc和tnf-α

还提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中tarc的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。浓度可以在预测模型中作为数值或对数浓度。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

sicam-5、tarc和tnf-α

还提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中sicam-5的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化和/或tarc的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度(相对于健康对照)的变化表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

在另一个实施方案中,提供了用于预测或检测癫痫发作的方法,其包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂接触,和使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触,和使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,单独采用、组合(所述标志物中的任何两种)或所有三种一起共同采用,sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化和/或tarc的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化表明癫痫发作已发生或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

sicam5/tarc比率

在进一步实施方案中,提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针,其中测试受试者中的sicam-5的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tarc的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或sicam-5/tarc的比率相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化是相对于健康对照改变,并且表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

sicam-5/tnf-α比率

在进一步实施方案中,提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中测试受试者中的sicam-5的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或sicam5/tnf-α的比率相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化是相对于健康对照改变,并且表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

tarc/tnf-α比率

在进一步实施方案中,提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中测试受试者中的tarc的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tnf-α/tarc的比率相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化是相对于健康对照改变,并且表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

比率的组合

在进一步实施方案中,提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中测试受试者中的sicam-5的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tarc的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或sicam-5/tarc和/或tnf-α/tarc和/或sicam5/tnf-α的比率相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化是相对于健康对照改变,并且表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。在预测模型中,该比率可以用作线性或对数单位,和/或可以用作倒数。

单独量度和比率的组合

在进一步实施方案中,提供了多肽或阵列,其包含能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的sicam-5的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tarc的探针和能够结合哺乳动物受试者的血浆或血清中的tnf-α的探针,其中测试受试者中的sicam-5的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tarc的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化和/或tnf-α的血浆或血清浓度相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化、sicam-5/tarc和/或tnf-α/tarc和/或sicam5/tnf-α的比率相对于对照(健康、非癫痫/非癫痫发作)的变化是相对于健康对照改变,并且表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。可以使用单独浓度和比率的任何组合。

可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

患者人口统计学特征

在另一个实施方案中,当组合sicam5、tarc和tnf-α的任何生物标志物浓度和/或sicam-5/tarc和/或tnf-α/tarc和/或sicam5/tnf-α的生物标志物浓度的比率的任何组合时,患者人口统计学或与患者相关的其他特征,包括但不限于年龄、性别和/或种族,可以表明,与相对正常或健康对照相比,癫痫发作已发生或具有癫痫发作的倾向。

当与患者人口统计学特征组合时,可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

其他生物标志物

icam-5是相对于健康患者,在癫痫患者的血浆或血清中差异分布的神经元源性蛋白。可溶性icam-5(也称为sicam5、sicam-5或其变体)响应于炎症通过金属蛋白酶从icam-5切割。出乎意料的是,相对于健康患者,在癫痫发作患者的情况下发现sicam-5表达改变。和/或sicam-5/tarc和/或sicam5/tnf-α比率与健康对照相比改变。额外的有用的标志物包括单独或组合的il-1β、il-2、il-8和ifn-γ。还有额外有用的标志物包括单独或组合的il-6、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子、tarc、tnf-α、物质p和前列腺素e2、神经生长因子(ngf)、ccl-5(rantes)、单核细胞趋化蛋白(mcp-1)、单核细胞炎性蛋白(mip-1α)。探针可以进一步包括单独或组合的α1at、vcam-1、icam-1、hgf和vegf-a。探针还可以包括补体级联的一种或多种组分,例如c1q、c3c和c3d。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

tarc也是一种有效的标志物,相对于健康患者,其在癫痫患者的血浆或血清中差异分布,并且显示其在癫痫发作患者中升高。tarc和/或sicam-5/tarc和/或tnf-α/tarc比率与健康对照相比改变。额外的有用的标志物包括单独和/或组合的il-1β、il-2、il-8和ifn-γ。还有额外有用的标志物包括单独或组合的il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和tnf-α。探针可以进一步包括α1at、vcam-1、icam-1、hgf和vegf-a。探针还可以包括补体级联的组分(例如c1q、c3c和c3d)的探针。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

tnf-α也是一种有效的标志物,相对于健康患者,其在癫痫患者的血浆或血清中差异分布,并且显示其在癫痫发作患者中升高。tnf-α和/或sicam-5/tnf-α和/或tnf-α/tarc比率与健康对照相比改变。额外的有用的标志物包括单独或组合的il-1β、il-2、il-8和ifn-γ。还有额外有用的标志物包括单独或组合的il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和tarc。探针可以进一步包括α1at、vcam-1、icam-1、hgf和vegf-a。探针还可以包括补体级联的组分(例如c1q、c3c和c3d)的探针。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

本发明的组或阵列还可以包括一种或多种能够结合il-2、il-6、il-8、il-1β和ifn-γ中的一种或多种的探针,其中一种或多种的血浆或血清浓度相对于健康对照改变表明癫痫发作或具有癫痫发作的倾向。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在又进一步实施方案中,本文所述的多肽表达组或阵列可以包括一种或多种能够结合il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和tnf-α的探针,其中il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α中的一种或多种的血浆或血清浓度(相对于健康个体)改变表明具有癫痫发作的倾向。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在另一个实施方案中,提供了用于预测或检测癫痫发作的方法,其包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂接触,和使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触,和使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化和/或tarc的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化和tnf-α的血浆或血清浓度相对于健康对照的变化表明癫痫发作已发生或具有癫痫发作的倾向。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

所述方法还可以包括使血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测il-2、il-6、il-8、il-1β和/或ifn-γ的表达水平的诊断试剂接触,其中il-2、il-6、il-8、il-1β和ifn-γ中的一种或多种的血浆或血清浓度相对于健康对照的改变表明具有癫痫发作的倾向。又进一步,所述方法可以包括使血浆或血清样品与能够测量或检测il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α中的一种或多种的表达水平的诊断试剂接触,其中il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和tnf-α中的一种或多种的血浆或血清浓度相对于健康对照改变表明癫痫发作已发生或具有癫痫发作的倾向。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在又另一个实施方案中,提供了用于评价癫痫发作或有癫痫发作症状的病症的治疗的有效性的方法,所述方法包括使在治疗前获得自哺乳动物受试者的第一血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)和/或tarc和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,和使在治疗后获得自哺乳动物受试者的第二血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)和/或tarc和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中第二血浆或血清样品中sicam-5的血浆或血清浓度相对于第一血浆或血清样品改变和/或第二血浆或血清样品中tarc的水平相对于第一血浆或血清样品改变和/或第三血浆或血清样品中tnf-α的水平相对于第一血浆或血清样品改变表明癫痫发作或有癫痫发作症状的病症中治疗的有效性。所述方法还可以包括使第一血浆或血清样品和第二血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中第二血浆或血清样品中的il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的浓度相对于第一血浆或血清样品改变表明癫痫发作或有癫痫发作症状的病症的治疗的有效性。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在又进一步实施方案中,提供了用于确定一种或多种癫痫发作是否由炎症导致的方法,其包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂接触,和/或使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触,其中sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照改变和/或tarc的血浆或血清浓度改变表明癫痫发作的炎性基础或组分。所述方法还可以包括使血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中血浆或血清样品中的il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的浓度改变表明癫痫发作的炎性基础或组分。可用于本发明并且可以提供关于抗炎反应的信息的还有额外标志物包括单独或组合的il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在还有其他实施方案中,提供了用于确定癫痫发作是否可能在受试者中发生的方法,其包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂接触,和/或使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触,其中sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照改变和/或tarc的血浆或血清浓度改变表明具有癫痫发作的倾向。所述方法还可以包括使血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中血浆或血清样品中的il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的浓度改变表明具有癫痫发作的倾向。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在还有其他实施方案中,提供了用于确定癫痫发作是否可能在受试者中发生的方法,其包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测可溶性icam-5(sicam-5)的表达水平的诊断试剂接触,和/或使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中sicam-5的血浆或血清浓度相对于健康对照改变和/或tnf-α的血浆或血清浓度改变表明具有癫痫发作的倾向。所述方法还可以包括使血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中血浆或血清样品中的il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的浓度改变表明具有癫痫发作的倾向。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在还有其他实施方案中,提供了用于确定癫痫发作是否可能在受试者中发生的方法,其包括使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tarc的表达水平的诊断试剂接触,和/或使获得自哺乳动物受试者的血浆或血清样品与能够测量或检测tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中tarc的血浆或血清浓度相对于健康对照改变和/或tnf-α的血浆或血清浓度改变表明具有癫痫发作的倾向。所述方法还可以包括使血浆或血清样品与一种或多种能够测量或检测il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的表达水平的诊断试剂接触,其中血浆或血清样品中的il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子和/或tnf-α的浓度改变表明具有癫痫发作的倾向。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

对于选择的任何生物标志物,可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

在上述的进一步实施方案中,癫痫发作可以与颞叶癫痫相关。在一个进一步实施方案中,颞叶癫痫可以是内侧颞叶硬化症(mts)。在其他实施方案中,癫痫发作可以与结节性硬化症复合症(tsc)相关。

在进一步实施方案中,癫痫发作可以根据如下进行分类:国际抗癫痫联盟的癫痫发作类型的操作分类,其位于以下网址:www.ilae.org/visitors/centre/documents/classificationseizureilae-2016.pdf。

在上述的还有其他特定进一步实施方案中,癫痫发作可以是隐原性的。在进一步实施方案中,癫痫发作不与对病原体的免疫反应相关。

本文描述的实施方案(包括探针和探针的组/阵列)可用于检测癫痫发作是否已经发生(或可能发生)。它们也可用于预测进一步癫痫发作的可能性。另外,它们可用于预测癫痫发作是否可能在脑损伤或头部创伤后发生。它们还可用于鉴定癫痫发作是否是炎性过程的结果。此外,它们可用于评价治疗是否有效。

通过非限制性实例的方式,以下多肽组或阵列是本申请的实施方案(术语改变、升高和改变是指癫痫患者中的表达水平相比于健康受试者中的表达水平):

•sicam-5;

•tarc;

•tnf-α;

•sicam-5、tarc;

•sicam-5、tnf-α;

•tarc、tnf-α;

•sicam-5、tarc、tnf-α。

其他多肽组或阵列是本申请的实施方案,并且可以包括以上和另外以下中的一种或多种:

•il-6、il-8、il-2、il-1β、ifn-γ、il-10、il-12p70、fas、fas-配体、mcp-1、mdc、mip-1β、gm-csf、mcp-4、ip-10、bdnf、嗜酸性粒细胞趋化因子-3、嗜酸性粒细胞趋化因子;

•il-1受体拮抗剂、il-4、il-10、il-11、il-13、白血病抑制因子、干扰素-α、il-6和tgf-β家族成员(tgf-β1至-β5)。

可以通过常规技术从患者获得样品。这些技术可以包括机构审查委员会(irb)批准的方案涵盖的那些,包括血液、尿液、唾液和csf。在一个实施方案中,样品使用柠檬酸钠进行抗凝。在一个进一步实施方案中,通过将样品例如以5,000g(g=重力)在4℃下离心15分钟来制备血浆。对照也可以购自商业供应商。

在血浆中待定量的多肽的水平(浓度)可以通过本领域已知的许多方法中的任一种获得,该具体程序不是对本文实施方案的限制。例如,可以使用elisa、间接elisa、夹心elisa、竞争elisa和多重和便携式(m&p)elisa。待检测的抗原(多肽或标志物)特异性的探针可以商业获得或通过本领域已知的技术设计。在用于sicam-5检测的一个实施方案中,蛋白g亲和纯化的小鼠单克隆抗人icam-5抗体用作捕获抗体。单探针和多探针试剂盒可得自商业供应商,例如mesoscalediscovery。这些试剂盒包括本文实施例中提到的试剂盒。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

本文还描述了治疗或预防哺乳动物受试者或患者中的癫痫发作或有癫痫发作症状的病症的方法,其包括递送sicam-5。在一个进一步实施方案中,所述哺乳动物是人。还提供了sicam-5用于治疗或预防哺乳动物受试者中的癫痫发作或有癫痫发作症状的病症的用途,和在制备其药物的用途。鉴于icam-5在端脑神经元的表面上表达(即,定位于脑),可以实现治疗或预防而没有不希望的全身作用。

可以通过本领域技术人员已知的技术静脉内或经由脑脊髓内液(csf内)进行治疗或预防。还可以通过任何其他合适的方式,包括通过用合适的载体或赋形剂鼻内递送至csf,进行递送。

其他应用

在本发明的一些实施方案中,可以利用如本文所述的形成基于血液的诊断测试的生物标志物和算法,诸如evoscore,用于癫痫发作预测;抗癫痫药物(aed)临床试验资格、终点和有效性;多种诊断组合,包括eeg、mri、基因组学、遗传学和蛋白质组学、伴随诊断;和基于炎症的治疗和反应的潜在鉴定。在一些实施方案中,本文所述的基于血液的诊断测试可用于确定事件中生物标志物水平的绝对变化以及患者中生物标志物随时间的相对变化。在一些实施方案中,用药物良好控制的已知癫痫患者中的本文描述的基于血液的诊断测试中的生物标志物和算法可用于制备相应的评分,并且使用者可以确定评分是否与aed反应性相关并且通过扩展,预测随后的突发性癫痫发作和医疗难治性。类似地,本文所述的基于血液的诊断测试可用于预测新鉴定的癫痫患者中的aed反应,以快速评价治疗反应。在一些实施方案中,在癫痫手术后的医学难治性患者中,可以提供本文所述的基于血液的诊断测试,其可预测手术成功。在一些实施方案中,本文所述的基于血液的诊断测试可用于评价在例如头部损伤或中风之后具有癫痫发作风险的患者,以确定他们的癫痫发作风险是否增加。此外,在aed临床试验中存在一种重要的潜在用途,以确保更稳健的登记标准,导致更快、更小的试验,允许新药更早地到达患者。在一些实施方案中,本文所述的基于血液的诊断测试可用作个性化医学诊断,以允许以限定的间隔随时间治疗和跟踪癫痫发作和癫痫,以建立对疗法的个性化反应、有效性、控制和预测未来事件,以改善患者生活质量,并减轻对健康护理系统的负担。在某些实施方案中,本发明的前述基于血液的诊断测试是evoscore。

测试方法

将血液从人神经病学患者或正常对照收集至含有k2edta作为抗凝剂的淡紫色顶部真空采血管血液收集管(bdbiosciences)中。将血液收集管倒置8次,且然后置于4℃的湿冰上10-15分钟,然后离心。将血液在4℃下以1000rcf离心10分钟。将血浆上清液等分至无菌的2ml微量管(sarstedt,i型)中,并在-70℃至-80℃冷冻。

使用来自mesoscalediscovery(msd)(gaithersburg,md)的定制三重板和msdsectorimager2400,在夹心elisa中用电化学发光检测测量人血浆中tnf-α、tarc和icam5的水平。我们从msd购买multi-spot96孔custom4spot板(tnf-a、tarc、icam5,bsa)msdelisa板和tnf-α和tarc包被/捕获抗体。icam5包被/捕获抗体购自r&dsystems(mab1950)。对于所有孵育步骤,用粘性板密封物(denvilleb1212-4s)密封板,并在室温(rt)下在微量滴定板振荡器(denville210a#c0210)上旋转(400rpm)来进行孵育。在所有洗涤步骤中,清空孔,且然后用175μl含有0.05%tween-20(fisherbp337-500)的磷酸盐缓冲盐水(pbs)(denvillecp4390-48)(pbst)洗涤三次。所有血液产品和污染的材料都用最低最终浓度为10%的漂白剂去污。采用反向移液以避免在整个测定过程中产生气泡。

为了运行样品,将定制板从4℃移除并使其平衡至室温30至60分钟。将未结合的位点用150μl/孔的封闭溶液(pbs中的10%胎牛血清(fbs)(mediatech35-016-cv))封闭,孵育2小时,且然后洗涤。

tnf-α和tarc蛋白标准品购自msd,且重组人icam-5蛋白标准品购自r&dsystems(1950-m5-050)。将校准蛋白稀释于5%fbs/pbs中的25%马血浆(用k2edta制备innovativeresearchihr-n以便与淡紫色顶管含量协调)中。tnf-α和tarc的三重标准曲线起始浓度为2500pg/ml,icam5的起始浓度为50,000pg/ml,并将其以1:5稀释。将100μl标准品一式两份铺板,包括不含蛋白的复制孔组。将人血浆样品在5%fbs/pbs中1:4稀释至25%样品的最终浓度,并铺板100μl。将标准品和样品孵育3小时,并在添加抗体之前洗涤板。

生物素化的抗人icam5抗体购自r&dsystems(baf1950)。链霉抗生物素蛋白-sulfotag和sulfotag标记的抗人tnf-α和tarc抗体购自msd。将一抗稀释至1:50,并将链霉抗生物素蛋白-sulfotag在1%牛血清白蛋白(fisherbp1605-100)/pbs中1:500稀释。将一抗和链霉抗生物素蛋白-sulfotag一步孵育90分钟。与两步孵育相反,msd测定的特异性允许单步检测孵育。然后在显色和读数之前洗涤板。

将4xmsd读数缓冲液t用消毒的反渗透h2o稀释至2x。通过向每个孔中添加150μlrt2x读取缓冲液t来使板显色,且然后立即在与msddiscoveryworkbench4.0软件偶联的msdsectorimager2400上读取。msddiscoveryworkbench4.0软件用于确定血浆样品的蛋白浓度,并且将pg/ml结果乘以4以解释1:4血浆样品稀释度。

患者登记

进行一项临床试验,以确定evoscore是否可以有效和准确地用于诊断具有癫痫发作的患者,并确立诊断的阈值。所有住院患者和门诊患者受试者均为18岁或以上且认知上能够给予知情同意。18-20岁的受试者提供了同意,并且合法授权的代表代表他们给予同意。这些研究没有种族或性别限制,并且所有符合条件的患者都被招募以确保没有选择偏差。

进入癫痫监测单元(emu)的住院患者被邀请每天早上给予15ml血液的单个样品,并且在癫痫发作或癫痫发作样事件之后给予额外15ml血液样品。将住院患者受试者的evoscore结果与他们在其emu停留期间的所有个别事件诊断以及他们的emu停留结束时他们的最终患者诊断进行比较。

门诊患者只有在他们在门诊患者神经病学诊所首次就诊以评估其疑似癫痫发作时才有资格参加研究;这些患者尚未将其事件诊断为癫痫或非癫痫。门诊患者受试者为研究提供了单一的15ml血液样品,并且研究小组在他们加入研究后约6个月收集了与其诊断操作相关的所有可用临床信息。六个月后,一组独立神经科医生评估他们的相关病史并“诊断”受试者,并将该诊断与evoscore结果进行比较,以确定诊断准确度(两名癫痫学家之间的一致性是足够的)。

21岁及以上的陪同患者至癫痫中心预约的受试者被认为是正常对照,并且如果他们在认知上能够提供知情同意,未被诊断为具有癫痫,并且没有由于任何原因服用任何抗癫痫药物,就有资格参加该研究。总体登记总共401名研究受试者。从住院患者emu和门诊患者神经病学诊所登记240名门诊患者、131名住院患者和额外30名对照。对于住院患者和门诊患者受试者,平均年龄为36.5(范围18-82)岁,且52%为女性(n=209)。

个别事件诊断(ied)和患者诊断(pd)的解释

住院患者开始并结束他们在emu的停留。门诊患者从神经病学门诊患者诊所招募,但一些回来留在emu。对于留在emu中的所有患者,检查emu报告并且记录任何在临抽血前观察到的神经事件的时间。还记录事件的描述,并且神经学家独立地诊断每个个别事件(个别事件诊断)。事件被表征为非癫痫事件(ied0)、癫痫事件(具有阳性eeg)(ied1)、不清楚的诊断事件(ied2)或未记录事件(当在emu停留期间的emu报告中没有任何事件记录时)(ied3)。当没有就事件诊断达成一致时,咨询emu报告并达成共识。如果无法达成共识,则该事件被评定为不清楚的诊断(ied2)。个别事件诊断被认为是对阶段性变化的评估。个别事件诊断也可称为事件诊断。

在emu报告的“癫痫诊断”部分中记录的最终总体患者诊断用于每个患者的患者诊断(pd)。患者接受非癫痫(pdo)、癫痫(pd1)、癫痫+其他非癫痫病况pd2)或不清楚的诊断(pd3)的诊断。患者诊断被认为是对强直性变化的评估。

预测模型和评分

如本文所用,“预测模型”(该术语可以在本文中与“多变量模型”或简称“模型”同义使用)是使用统计算法或用于对数据集进行分类的算法开发的数学构建体。预测模型可以提供解释函数;例如,可以通过利用一种或多种统计算法或方法将观察数据的数据集转换成受试者的疾病活动或疾病状态的有意义的确定来产生预测模型。本文开发的基于生物标志物的浓度和比率和或与患者人口统计学特征组合的算法鉴定与癫痫发作事件相关的阶段性和强直性变化(急性和慢性)。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。

出于以下目的中的一种或多种,预测模型可用于所有临床设置中:(a)划入或排除癫痫发作;(c)通过预测癫痫发作将何时继续发生以及癫痫发作是否将继续发生来评价患者生活质量;和(c)治疗剂或治疗方案随时间控制癫痫发作的能力。

如本文所用,“评分”是经选择以提供受试者病况的变量或特征的定量量度和/或辨别、区分或以其他方式表征受试者病况的值或一组值。包括评分的值可以基于,例如,获得自受试者或临床参数或临床评价或其任何组合的一种或多种样品成分的测量的量。在某些实施方案中,所述评分可以推导自单个组成参数或评价,而在其他实施方案中,所述评分推导自多个成分、参数和/或评价。所述评分可以基于或推导自解释函数,例如,使用本领域已知的任何小心的(carious)统计算法推导自特定预测模型的解释函数。“评分的变化”可以指评分的绝对变化,例如,从一个时间点至下一个时间点,或者评分的百分比变化,或者每单位时间的评分的变化。例如,本文提及的评分可以通过本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)来提供。

该评分可用于通过提供数字“定量”或高、中或低“定性”或正或负“定性”或其他形式以传达癫痫发作和癫痫的鉴定中的阶段性和/或强直性变化的结果来评定阶段性和强直性变化的等级和/或测量阶段性和强直性变化,划入或排除事件,评估患者生活质量和治疗有效性。

预测模型和评分可以与任何当前的标准诊断技术(包括eeg和mri)组合使用,以开发最终的患者诊断。当与其他标准诊断技术组合时,预测评分将在灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值方面增加改进的准确度。

算法目标、阈值和可操作的结果

本文所述的基于血液的诊断测试中包括的评分算法(例如,evoscore)通过以下方法开发:(a)对于癫痫发作与否的个别事件诊断:分类树和回归分析和/或多元逻辑回归,其可以包括通过分类树分析定义的风险组;和(b)对于癫痫与否的患者诊断:逻辑回归和多元逻辑回归,包括通过分类树分析定义的风险组。

用于癫痫发作与否的个别事件诊断和癫痫与否的患者诊断的evoscore算法和方法被确定为浓度的可测量变化、浓度的自然对数标度变化、生物标志物的比率和tarc、sicam5和tnf-α的标度浓度的比率的函数,并且可以包括患者身体特征,包括年龄、性别和处方信息。

所有这些方法和结果都产生满足诊断测试临床和市场表现以及准确度目标的算法。设计算法的预测结果以使灵敏度和真阳性率最大化,并使假阴性率最小化,并使准确度和正确分类的最大化。特异性和真阴性率也可以最大化,且假阳性最小。

可以设置阈值或定量边界以使个别诊断值最大化和/或优化诊断值(包括灵敏度、特异性以及正和负预测值)的组合。算法的不同实施方案可以根据算法的目标使用不同的阈值。阈值可以最终确定如何解释评分,因为个别测试评分可用于通过提供数字“定量”或高、中或低“定性”或正或负“定性”来评定阶段性和强直性变化的等级和/或测量阶段性和强直性变化,划入或排除事件,评估患者生活质量和治疗有效性。通过性能所需的诊断精确度的一种或多种特征的最大化和/或优化来驱动阈值的最终选择。

图1定义算法的目标和最终可操作结果。

组合诊断和治疗方法

为了实现个别受试者的最大治疗益处,重要的是能够在任何特定时间特异性定量和评价受试者的疾病负担,确定治疗对疾病活动的影响,并预测未来结果。本教导的实施方案鉴定多种血清生物标志物,用于准确临床评价具有急性和慢性疾病的受试者中的疾病活动。

目前癫痫的治疗方法包括且不限于治疗有效剂量的抗癫痫化合物,其选自苯妥英、磷苯妥英、咪达唑仑、普瑞巴林、布瓦西坦、peramepanel、卢非酰胺、盐酸鲁拉西酮、卡马西平、氯巴占、氯硝西泮、地西泮、双丙戊酸钠、醋酸艾司利卡西平、乙琥胺(ethosuxemide)、依佐加滨、非尔氨酯、加巴喷丁、拉考沙胺、拉莫三嗪、左乙拉西坦、劳拉西泮、奥卡西平、苯巴比妥、扑米酮、噻加宾、托吡酯、丙戊酸、唑尼沙胺、基于大麻的药物及其药学上可接受的盐、前药和衍生物。新的治疗方法目前正在开发,并且适用于诊断评估,并且可以是组合诊断和治疗方法。

在一些实施方案中,本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)可以评估用药物良好控制的已知癫痫患者,以确定评分是否与aed反应性相关,并且通过延伸,确定evoscore的变化是否预测随后的突破性癫痫发作和医疗难治性。在一些实施方案中,本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)可以预测新鉴定的癫痫患者中的aed反应,以快速评价治疗反应。在一些实施方案中,本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)可用于在癫痫手术后的医学难治性患者中评价,以确定评分是否可以预测手术成功。在一些实施方案中,本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)可用于评价在例如头部损伤或中风之后具有癫痫发作风险的患者,以确定他们的癫痫发作风险是否增加。在一些实施方案中,本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)可用作个性化医学诊断,以允许以限定的间隔随时间治疗和跟踪癫痫发作和癫痫,以建立对治疗的个性化反应、有效性、控制和预测未来事件,以改善患者生活质量,并减轻对健康护理系统的负担。

在一些实施方案中,本发明的基于血液的诊断测试(例如,evoscore)可以与本文所述的eeg、mri和其他诊断方法组合使用。

在其他实施方案中,单独的evoscore,或evoscore与如本文所述的其他生物标志物和/或其他临床测试的组合,可用于其他神经疾病/适应症,包括偏头痛、创伤性脑损伤、中风、感染和对病原体的免疫反应、自身免疫反应、免疫反应、肿瘤和其他具有炎症组分和/或作用的神经疾病/适应症。

试剂盒

在一个实施方案中,本发明提供了包含多肽表达组或阵列的诊断试剂盒。所述试剂盒也可以是预测性的,可用于确定癫痫发作或癫痫发作的复发的即将发生的风险,或用于评价复发风险。所述试剂盒还可以含有用于抽血的注射器和/或小瓶。所述试剂盒可以含有一种或多种对应于所述组或阵列的多肽标志物的探针。所述试剂盒还可以含有基于化学发光、发光或等效技术的elisa板。还可以提供多重和便携式(m&p)elisa作为实施方案的试剂盒的一部分。还有其他合适的组分将是本领域技术人员已知的,并且在此涵盖。试剂盒可以包括用于呈现诊断结果的软件、计算机和仪器。

本发明的其他方面提供了试剂盒,所述试剂盒包含:(a)测定、(b)说明书、(c)用于执行本发明的方法的计算机或计算机系统,或(d)在其他实施方案中,形成本发明的方法的一部分的算法。

其他实施方案包含以试剂盒形式包装在一起用于进行本教导的任何测定的生物标志物检测试剂。在某些实施方案中,所述试剂盒包含寡核苷酸,其基于与生物标志物核酸的同源性和/或互补性而特异性鉴定一种或多种生物标志物核酸。所述寡核苷酸序列可以对应于生物标志物核酸的片段。例如,所述寡核苷酸长度可以大于:200、150、100、50、25、10或少于10个核苷酸。在其他实施方案中,所述试剂盒包含针对由生物标志物核酸编码的蛋白的抗体。本教导的试剂盒还可以包含适体。所述试剂盒可以在单独的容器中含有核酸或抗体、对照制剂(阳性和/或阴性)和/或可检测标记物。所述试剂盒中可以包括用于进行测定的说明书,包括任选地用于生成评分的说明书。所述测定可以呈本领域已知的elisa形式。

软件、仪器和计算机

可以使用工程改造用于执行这种任务的软件手动或自动执行预测模型。所选生物标志物的浓度的分析可以手动进行,或者另外可以使用工程改造用于执行这种任务的软件进行分析。在优选实施方案中,算法形成本发明的预测方法的一部分,分析所选生物标志物的浓度以呈现诊断结果或评分。所述算法可以经由工程改造的软件手动或自动执行。工程改造的软件可以是读取所选生物标志物的浓度的仪器的一部分,或者可以是外部计算机的一部分。在其他实施方案中,将前述软件加载至计算机上。所述计算机还与直接来自仪器的仪器输入数据手动或自动连接。可以采用个别测量值并使用线性或对数单位或通过使用线性或对数单位的比率个别或以任何组合进行分析,其使用和/或不使用患者人口统计学特征。也可以使用线性或对数单位的比率的倒数。在一些实施方案中,所述计算机属于最终使用者,而在其他实施方案中,提供计算机或处理器作为试剂盒的一部分。在优选实施方案中,工程改造的软件指示计算机(a)访问含有来自仪器的数据的文件,以及(b)使用本发明的算法分析这些数据。在其他实施方案中,工程改造的软件以使用者友好的格式呈现结果,用于解释诊断结果。

在一些实施方案中,本发明的方法和系统可以体现为一个或多个计算机执行的过程,其用于执行一个或多个这样的计算机执行的过程的,并且还可以以有形存储介质(即,非暂时性的计算机可读介质)的形式体现,所述有形存储介质含有计算机程序或其他机器可读指令(此处为“计算机程序”),其中当计算机程序被加载至计算机或其他处理器(此处为“计算机”)和/或由计算机执行时,所述计算机成为用于实施一个或多个过程的装置。用于含有这种计算机程序的存储介质包括例如软盘和软盘、光盘(cd)-rom(无论是否可写)、dvd数字盘、ram和rom存储器、计算机硬盘驱动器和备用驱动器、外部硬盘驱动器、固态驱动器、“拇指”驱动器以及由计算机可读的任何其他存储介质。一个或多个过程也可以以计算机程序的形式实现,例如,无论是存储在存储介质中还是经传输介质诸如电导体、光纤或其他光导体传输,或者通过电磁辐射传输,其中当计算机程序被加载至计算机和/或由计算机执行时,所述计算机成为用于实施一种或多种过程的装置。一个或多个过程可以在通用微处理器上或在专门配置为实施一个或多个过程的数字处理器上实施。当采用通用微处理器时,计算机程序代码配置微处理器的电路以产生特定的逻辑电路排列。计算机可读的存储介质包括可由计算机本身或由另一机器读取的介质,所述另一机器读取计算机指令用于将那些指令提供给计算机用于控制其操作。

实施例

现在参考以下实施例,其与以上描述一起以非限制性方式说明本发明的某些实施方案。提供这些实施例仅用于说明的目的,并且本文涵盖的公开内容决不应被解释为限于这些实施例,而是应被解释为涵盖由于本文提供的教导而变得明显的任何和所有变化。

实施例1:患者人口统计学和生物标志物数据:住院患者、门诊患者和正常对照

住院患者、门诊患者和正常对照显示于表1中。单独的生物标志物(包括tarc和sicam5),以及生物标志物的比率tnfα/tarc和tnfα/sicam5被证明在正常对照和事件诊断之间、正常对照和患者诊断1之间以及正常对照和患者诊断1和2之间具有统计学显著差异(p<0.05)。这些生物标志物和生物标志物的比率可以单独使用或组合使用,用于确定癫痫发作与否和癫痫与否。

表1:患者人口统计学和特征

实施例2:通过逻辑回归进行事件诊断(24小时)

逻辑回归模型结果可用于将事件分类为癫痫发作/癫痫或无事件。数据含有事件的24小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化和患者身体特征(包括年龄和性别)的函数。

当比较具有癫痫发作的阶段性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的24小时内抽血的患者,evoscore表明0.8707的接受者操作特征(roc)auc,其具有0.7739至0.9675的95%置信区间,89.3%的诊断灵敏度(设计用于最大化),75.9%的特异性,78.1%的阳性预测值,88%的阴性预测值和82.5%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表2和图3中。

表2.通过逻辑回归的事件诊断(24小时)的结果。

最大正确分类的

灵敏度和特异性的最大总和

实施例3:患者研究:通过逻辑回归的72小时内的事件诊断

多变量逻辑回归模型结果可用于将事件分类为癫痫发作/癫痫或无事件。数据含有事件的72小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化和患者身体特征(包括年龄和性别)的函数。

当比较具有癫痫发作的阶段性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的72小时内抽血的患者,evoscore表明0.8452的rocauc,其具有0.7552至0.9353的95%置信区间,84.4%的诊断灵敏度(设计用于最大化),72.4%的特异性,82.6%的阳性预测值,75%的阴性预测值和79.7%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表3中。

表3.通过逻辑回归的事件诊断(24小时)的结果。

实施例4:通过逻辑回归进行患者诊断(24小时)

逻辑回归模型结果可用于将患者分类为癫痫发作/癫痫或正常,包括来自癫痫、癫痫加其他原因和正常对照的数据。数据含有事件的24小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化和患者身体特征(包括年龄和性别)的函数。

当比较具有癫痫发作和癫痫的强直性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的24小时内抽血的患者,evoscore表明0.8339的rocauc,其具有0.7456至0.9221的95%置信区间,90.9%的诊断灵敏度(设计用于最大化),69%的特异性,90.9%的阳性预测值,69%的阴性预测值和85.9%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表4和图4中。

表4.通过多变量逻辑分析的患者诊断(24小时)的结果。

最大正确分类的

灵敏度和特异性的最大总和

实施例5:通过逻辑回归进行患者诊断(24小时)

多变量逻辑回归模型结果可用于将患者分类为癫痫发作/癫痫或正常,包括来自癫痫和正常对照的数据。数据含有事件的24小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化和患者身体特征(包括年龄和性别)的函数。

当比较具有癫痫发作和癫痫的强直性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的24小时内抽血的患者,evoscore表明0.8587的rocauc,其具有0.7754至0.9421%的95%置信区间,95.2%的诊断灵敏度(设计用于最大化),62.1%的特异性,87.8%的阳性预测值,81.8%的阴性预测值和86.6%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表5和图5中。

表5.通过多变量逻辑分析的患者诊断(24小时)的结果。

最大正确分类的

灵敏度和特异性的最大总和

实施例6:通过逻辑回归的门诊患者分析

对于门诊患者,在evoscore采样之后,收集基于对六个月的临床护理数据的评审的独立专家组的诊断,并进行计算。保留三名独立的委员会认证的癫痫学家,以评审在emu的诊断评估并证实癫痫发作的诊断。癫痫学家小组为该分析提供了其对可能的癫痫或可能非癫痫事件的最佳估计,并且该小组的两名成员之间的一致意见将是足够的并被视为共识或赞同的诊断。

对于我们的3名独立评审员中的至少2名的小组赞同诊断的门诊患者,evoscore将80-91%的门诊患者准确地诊断为癫痫患者-其中给出了清楚的癫痫诊断;当应用于所有来者,包括存在最少数据和“不清楚”癫痫或正常的门诊患者时,evoscore在82-83%的病例中诊断癫痫方面赞同评审者的共识。这表明测试和预测算法连同住院患者数据在所有临床设置中都有效。

实施例7:通过分类树分析在24小时内的事件诊断

使用分类和回归树算法来对患者样品和对照样品进行分层,并且进而,如果未知来源的事件是癫痫发作或替代来源的事件,则提供预测值。可以使用信息增益(熵)或最佳拟合(基尼不纯度)来构建分类树。数据含有事件的24小时内收集的样品。

使用0.2的基尼不纯度截止值和最多两个水平的分类树深度,分类树将26种样品正确地鉴定为具有癫痫发作的高风险,将16种样品正确地鉴定为不确定的(在图中归类为中等风险)和将18种样品正确地鉴定为不是癫痫发作事件。在被鉴定为癫痫发作事件的26种样品中,84.6%被正确分类。相应地,18个非癫痫发作事件中的88.9%被正确鉴定。分类树显示于图6中。

实施例8:通过多元逻辑回归(包括通过分类树分析定义的风险组)进行事件诊断(24小时)

多元逻辑回归模型,包括通过分类树分析定义的风险组。结果将事件分类为癫痫发作/癫痫或无事件。数据含有事件的24小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化的函数。

当比较具有癫痫发作的阶段性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的24小时内抽血的患者,evoscore表明0.9273的rocauc,其具有0.862至0.993的95%置信区间,93.9%的诊断灵敏度(设计用于最大化),83.3%的特异性,86.1%的阳性预测值,92.6%的阴性预测值。结果概述于表6和图7中。

表6.事件诊断(24小时)的结果。

使用0.5的预测概率的模型

其中

实施例9:通过多元逻辑回归(包括通过分类树分析定义的风险组)在所有时间进行事件诊断

多元逻辑回归模型,包括通过分类树分析定义的风险组。结果将事件分类为癫痫发作/癫痫或无事件。数据含有事件后的所有时间收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化的函数。

当比较具有癫痫发作的阶段性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件后所有时间抽血的患者,evoscore表明0.9500的rocauc,其具有0.911至0.990的95%置信区间,93.1%的诊断灵敏度(设计用于最大化),73.3%的特异性,87.1%的阳性预测值,84.6%的阴性预测值和86.4%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表7和图8中。

表7.所有时间的事件诊断的结果。

使用0.52的预测概率的模型

实施例10:通过多元逻辑回归(包括通过分类树分析定义的风险组)进行患者诊断(24小时)

多元逻辑回归模型,包括通过分类树分析定义的风险组。结果将患者分类为癫痫发作/癫痫或正常,包括来自癫痫、癫痫加其他原因和正常对照的数据。数据含有事件的24小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化的函数。

当比较具有癫痫发作和癫痫的强直性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的24小时内抽血的患者,evoscore表明0.8512的rocauc,其具有0.770至0.933的95%置信区间,86.4%的诊断灵敏度(设计用于最大化),56.7%的特异性,88%的阳性预测值,53.1%的阴性预测值和80%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表8和图9中。

表8.患者诊断(24小时)的结果。

使用0.7的预测概率的模型

实施例11:通过多元逻辑回归(包括通过分类树分析定义的风险组)进行患者诊断(24小时)

多元逻辑回归模型,包括通过分类树分析定义的风险组。结果将患者分类为癫痫发作/癫痫或正常,包括来自癫痫和正常对照的数据。数据含有事件的24小时内收集的样品。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化的函数。

当比较具有癫痫发作和癫痫的强直性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于在事件的24小时内抽血的患者,evoscore表明0.8574的rocauc,其具有0.776至0.939的95%置信区间,91.5%的诊断灵敏度(设计用于最大化),56.7%的特异性,86.9%的阳性预测值,68%的阴性预测值和83.1%的准确度(设计用于最大化)。结果概述于表9和图10中。

表9.患者诊断(24小时)的结果。

使用0.68的预测概率的模型

实施例12:通过多元逻辑回归(包括通过分类树分析定义的风险组)进行门诊患者分析。

对于门诊患者,在evoscore采样之后,收集基于对六个月的临床护理数据的评审的独立专家组的诊断,并进行计算。保留三名独立的委员会认证的癫痫学家,以评审在emu的诊断评估并证实癫痫发作的诊断。癫痫学家小组为该分析提供了其对可能的癫痫或可能非癫痫事件的最佳估计,并且该小组的两名成员之间的一致意见将是足够的并被视为共识或赞同的诊断。

对于3名独立评审员中的至少2名的小组赞同诊断的门诊患者,当应用于所有来者,包括存在最少数据和“不清楚”癫痫或正常的门诊患者时,evoscore在77.7%的病例中诊断癫痫方面赞同评审者的共识。这表明测试和预测算法连同住院患者数据在所有临床设置中都有效。

实施例13:通过多元逻辑回归(包括通过分类树分析定义的风险组)的门诊患者模型。

多元逻辑回归模型,包括通过分类树分析定义的风险组。结果将共识评审的患者分类为癫痫发作/癫痫或正常对照。evoscore算法被确定为tarc、sicam5和tnf-α的浓度的可测量变化以及患者人口统计学特征(包括年龄和性别)的函数。

当比较具有癫痫发作和癫痫的阶段性和可测量的变化的患者与正常对照时,对于抽血的患者,evoscore表明0.8200的rocauc,其具有0.731至0.909的95%置信区间,86.4%的诊断灵敏度(设计用于最大化),70%的特异性,92.3%的阳性预测值,和55.3%的阴性预测值。结果概述于表10和图11中。

表10.门诊患者模型

实施例14:eeg和evoscore

表明eeg具有37%的灵敏度,99%的特异性,98%的ppv和68%的npv。我们发现eeg可能错过癫痫发作事件,导致癫痫患者的显著的假阴性和相应的潜在治疗不足。我们的结果反映该测试的公认范围(25-58%的灵敏度和78%-98%的特异性)。当评估阶段性变化与eeg时,evoscore表明更好的灵敏度和阴性预测值,以及接近等同的特异性和阳性预测值。evoscore可以与eeg组合用于患者诊断和治疗。此外,evoscore可以与如本文定义的其他诊断和测试方法组合使用。

实施例15:技术再现性和质量控制

已经证实:

1)血浆样品的反复冻融不影响tarc、sicam5和tnfα水平

2)相同样品的测试-测试再现性接近100%

3)改变血浆稀释度不会改变相对tarc、sicam5和tnfα水平

4)长期储存(最长达1年)不会改变tarc、sicam5和tnfα水平

5)该测试可以在约6小时内最佳运行,但可以针对实验室环境中的各种工作流程进行优化

6)批次与批次变异性是最小的

7)完整的方法已经优化为“标准操作程序”,以确保批次与批次的一致测定技术。

实施例:概述

基于以上实施例:(1)单独的生物标志物(包括tarc和sicam5),以及生物标志物的比率tnfα/tarc和tnfα/sicam5被证明在正常对照和事件诊断之间、正常对照和患者诊断1之间以及正常对照和患者诊断1和2之间具有统计学显著差异(p<0.05)。这些生物标志物和生物标志物的比率可以单独使用或组合使用,用于确定癫痫发作与否和癫痫与否;(2)在24小时,evoscore可以告知癫痫发作和正常对照个体之间的差异(“阶段性变化”);(3)在24小时,evoscore可以告知癫痫患者和正常对照个体之间的差异(“强直性变化”);(4)在评价癫痫发作和正常对照之间的阶段性变化时,evoscore至少等于或好于eeg;(5)evoscore可以与eeg和或用于诊断和治疗评价的其他测试组合使用;(6)在240名患者的“所有来者”门诊患者分析中,evoscore可以在83%的病例中鉴定具有癫痫发作的患者;且(7)对于从事件起大于24小时(包括72小时或更长时间的潜力)所取的样品,evoscore可以告知癫痫发作和正常对照之间(“阶段性变化”)以及癫痫患者和正常对照之间(“强直性变化”)的差异;和(8)该测试对于在任何临床或健康护理设置以及实验室条件下运行是稳健的。

应理解,为了清楚起见在单独实施方案的上下文中描述的本发明的某些特征也可以在单个实施方案中组合提供。相反,为了简洁起见在单个实施方案的上下文中描述的本发明的各种特征也可以单独或以任何合适的子组合提供。

本文提供的数学系数和算法是说明性和示例性的,并且仅出于说明的目的而提供。本文涵盖的公开内容决不应被解释为限于系数和算法的这些实例,而是应该被解释为涵盖由于本文提供的教导而变得显而易见的任何和所有变化。具体而言,由于使用不同的临床数据,替代系数和算法可能变得显而易见。

尽管本发明已经结合其具体实施方案进行描述,但显然许多替代方案、修改和变化对于本领域技术人员是显而易见的。因此,旨在涵盖落入所附权利要求的精神和广泛范围内的所有此类替代方案、修改和变化。本说明书中提及的所有出版物、专利和专利申请均在本文通过引用以其整体并入本说明书中,其程度如同每个单独的出版物、专利或专利申请被具体和单独地指出通过引用并入本文一样。另外,本申请中任何参考文献的引用或标识不应被解释为承认这种参考文献可用作本发明的现有技术。

本文列出的任何文件(包括但不限于任何专利、专利申请、出版物和网站)在此通过引用以其整体并入本文。尽管这些发展已经参考具体实施方案公开,但显而易见的是,本领域技术人员在不脱离所述发展的真实精神和范围的情况下设计了本发明的其他实施方案和变化。所附权利要求包括此类实施方案及其变化。

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