基因编辑纯合体检测数据管理方法及信息平台与流程

1.本发明涉及作物育种数字化管理技术领域，尤其涉及一种基因编辑纯合体检测数据管理方法及信息平台。


背景技术：

2.近年来，基因编辑技术被广泛用于水稻、小麦、玉米、烟草和马铃薯等作物的基因组修饰，以实现作物在抗性、品质、产量、育性等方面的遗传改良。随着烟草基因编辑育种素材创制和筛选的持续推进，获得了批量纯合体编辑素材且还在不断增加和丰富。为研究基因编辑素材及其功能基因，项目组开展了纯合体编辑素材的表型鉴定、转录组分析、代谢组分析等研究，获得了纯合体编辑素材的大量检测数据。
3.由于纯合体编辑素材研究过程中涉及素材种植、样品采集、样品检测、数据存储及统计分析等多个步骤，每个步骤均由各专业的不同技术人员负责；此外，纯合体编辑素材研究还需要进行不同年份、不同区域的试验；因此该项研究的试验步骤多、专业要求高、人员组成广、时间跨度长，若不对纯合体编辑素材检测数据进行有效管理，会延缓从纯合体编辑素材到品系培育的进程。
4.因此，亟需一种基因编辑纯合体检测数据管理方法及信息平台。


技术实现要素：

5.本发明的目的是提供一种基因编辑纯合体检测数据管理方法及信息平台，以解决上述现有技术中的问题，能够为批量纯合体编辑素材的检测数据管理和精细筛选提供技术支持。
6.本发明提供了一种基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，包括：
7.对烟草基因编辑素材进行编码管理；
8.根据烟草基因编辑素材的编码管理结果，利用移动操作终端对待测纯合体素材进行采样管理，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息；
9.利用信息平台对待测纯合体素材进行样品检测管理；
10.利用所述信息平台对待测纯合体素材的样品检测数据进行检测数据管理。
11.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述对烟草基因编辑素材进行编码管理，具体包括：
12.基于预先建立的编码体系，采用二维码标签作为烟草基因编辑素材的编码载体，对烟草基因编辑素材进行编码管理。
13.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述根据烟草基因编辑素材的编码管理结果，利用移动操作终端对待测纯合体素材进行采样管理，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息，具体包括：
14.利用移动操作终端对待测纯合体素材上的二维码标签进行扫描，得到待测纯合体素材的二维码扫描结果；
15.根据二维码扫描结果，在移动操作终端上选择与所述待测纯合体素材对应的检测指标，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息。
16.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述利用信息平台对待测纯合体素材进行样品检测管理，具体包括：
17.通过所述移动操作终端将所述待测纯合体素材对应的采样信息上传至信息平台；
18.通过所述信息平台上进行派样送检，并接收对应样品检测人员所采集的与检测指标对应的样品检测数据。
19.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述样品检测人员采集与检测指标对应的样品检测数据的方法包括主动上传，所述主动上传具体包括：
20.样品检测人员将纯合体素材的检测数据按照格式要求填入预制表单；
21.样品检测人员将填写后的预制表单上传至信息平台。
22.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述样品检测人员采集与检测指标对应的样品检测数据的方法包括被动采集，所述被动采集具体包括：
23.采用移动操作终端实时扫描待测纯合体素材上的二维码标签；
24.样品检测人员所采集的相应的样品检测数据输入移动操作终端；
25.移动操作终端将样品检测数据实时传送至信息平台。
26.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述利用所述信息平台对待测纯合体素材的样品检测数据进行检测数据管理，具体包括：
27.将待测纯合体素材的各类检测数据存储在所述信息平台上；
28.所述信息平台按照预设分类标准，对各类检测数据进行分类管理。
29.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理方法，其中，优选的是，所述基因编辑纯合体检测数据管理方法，还包括：
30.对所述信息平台所存储的各类检测数据，进行统计分析管理，具体包括：
31.基于预先建立的数据统计方法，对所述信息平台上所存储的各类检测数据进行统计分析，并展示统计分析结果。
32.本发明还提供一种采用上述方法的基因编辑纯合体检测数据管理信息平台，包括：
33.编码管理模块、信息采集模块和数据平台，所述信息采集模块分别与所述编码管理模块和所述数据平台连接，其中：
34.所述编码管理模块用于对烟草基因编辑素材进行编码管理；
35.所述信息采集模块用于根据烟草基因编辑素材的编码管理结果，对待测纯合体素材进行采样管理，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息；
36.所述信息采集模块用于根据烟草基因编辑素材样品检测管理，并对待测纯合体素材的样品检测数据进行存储和管理。
37.如上所述的基因编辑纯合体检测数据管理信息平台，其中，优选的是，所述基因编辑纯合体检测数据管理信息平台还包括数据处理模块和通信模块，其中，
38.所述数据处理模块与所述数据平台连接，用于对所述信息平台所存储的各类检测数据进行统计分析管理，
39.所述信息采集模块和所述数据处理模块与所述数据平台通过所述通信模块连接，
所述通信模块用于将所述信息采集模块获取的采样信息传输至所述数据平台，并将所述数据处理模块的统计分析数据传输至所述数据平台。
40.本发明提供一种基因编辑纯合体检测数据管理方法及信息平台，针对烟草基因编辑素材纯合体研究过程中产生的大量数据，基于编辑素材编码体系，通过对多年份、多试验区域的批量纯合体素材从素材种植到样品采集、再到样品检测、再到数据存储及统计分析等多个步骤进行全流程管理，实现了纯合体编辑素材的多源异构检测数据的有效管理。本发明根据各类检测数据和统计分析结果，可将纯合体编辑素材与对照素材的检测数据进行对比，将同一纯合体素材的不同年份、不同试验区域的检测数据进行对比，展示统计分析结果，为纯合体编辑素材的精细筛选和后续品系培育提供了数据支撑和技术支持。
附图说明
41.为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合附图对本发明作进一步描述，其中：
42.图1为本发明提供的基因编辑纯合体检测数据管理方法的实施例的流程图；
43.图2为本发明提供的基因编辑纯合体检测数据管理信息平台的实施例的结构框图。
具体实施方式
44.现在将参照附图来详细描述本公开的各种示例性实施例。对示例性实施例的描述仅仅是说明性的，决不作为对本公开及其应用或使用的任何限制。本公开可以以许多不同的形式实现，不限于这里所述的实施例。提供这些实施例是为了使本公开透彻且完整，并且向本领域技术人员充分表达本公开的范围。应注意到：除非另外具体说明，否则在这些实施例中阐述的部件和步骤的相对布置、材料的组分、数字表达式和数值应被解释为仅仅是示例性的，而不是作为限制。
45.本公开中使用的“第一”、“第二”：以及类似的词语并不表示任何顺序、数量或者重要性，而只是用来区分不同的部分。“包括”或者“包含”等类似的词语意指在该词前的要素涵盖在该词后列举的要素，并不排除也涵盖其他要素的可能。“上”、“下”等仅用于表示相对位置关系，当被描述对象的绝对位置改变后，则该相对位置关系也可能相应地改变。
46.在本公开中，当描述到特定部件位于第一部件和第二部件之间时，在该特定部件与第一部件或第二部件之间可以存在居间部件，也可以不存在居间部件。当描述到特定部件连接其它部件时，该特定部件可以与所述其它部件直接连接而不具有居间部件，也可以不与所述其它部件直接连接而具有居间部件。
47.本公开使用的所有术语(包括技术术语或者科学术语)与本公开所属领域的普通技术人员理解的含义相同，除非另外特别定义。还应当理解，在诸如通用字典中定义的术语应当被解释为具有与它们在相关技术的上下文中的含义相一致的含义，而不应用理想化或极度形式化的意义来解释，除非这里明确地这样定义。
48.对于相关领域普通技术人员已知的技术、方法和设备可能不作详细讨论，但在适当情况下，技术、方法和设备应当被视为说明书的一部分。
49.如图1所示，本实施例提供的基因编辑纯合体检测数据管理方法在实际执行过程
中，具体包括如下步骤：
50.步骤s1、对烟草基因编辑素材进行编码管理。
51.具体地，基于预先建立的编码体系，采用二维码标签作为烟草基因编辑素材的编码载体，对烟草基因编辑素材进行编码管理。
52.本发明采用二维码标签作为编码载体对编辑素材进行唯一性的管理和溯源。
53.步骤s2、根据烟草基因编辑素材的编码管理结果，利用移动操作终端(pda)对待测纯合体素材进行采样管理，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息。
54.在本发明的基因编辑纯合体检测数据管理方法的一种实施方式中，所述步骤s2具体可以包括：
55.步骤s21、利用移动操作终端对待测纯合体素材上的二维码标签进行扫描，得到待测纯合体素材的二维码扫描结果。
56.步骤s22、根据二维码扫描结果，在移动操作终端上选择与所述待测纯合体素材对应的检测指标，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息。
57.本发明通过二维码标签和移动操作终端，扫描待测纯合体素材的二维码，并在pda上选择相应的检测类型，自动上传至信息平台。
58.步骤s3、利用信息平台对待测纯合体素材进行样品检测管理。
59.在本发明的基因编辑纯合体检测数据管理方法的一种实施方式中，所述步骤s3具体可以包括：
60.步骤s31、通过所述移动操作终端将所述待测纯合体素材对应的采样信息上传至信息平台。
61.步骤s32、通过所述信息平台上进行派样送检，并接收对应样品检测人员所采集的与检测指标对应的样品检测数据。
62.本发明在一种实施方式中，所述样品检测人员采集与检测指标对应的样品检测数据的方法包括主动上传，所述主动上传具体包括：
63.样品检测人员将纯合体素材的检测数据按照格式要求填入预制表单；
64.样品检测人员将填写后的预制表单上传至信息平台。
65.本发明在一种实施方式中，所述样品检测人员采集与检测指标对应的样品检测数据的方法包括被动采集，所述被动采集具体包括：
66.采用移动操作终端实时扫描待测纯合体素材上的二维码标签；
67.样品检测人员所采集的相应的样品检测数据输入移动操作终端；
68.移动操作终端将样品检测数据实时传送至信息平台。
69.步骤s4、利用所述信息平台对待测纯合体素材的样品检测数据进行检测数据管理。
70.在本发明的基因编辑纯合体检测数据管理方法的一种实施方式中，所述步骤s4具体可以包括：
71.步骤s41、将待测纯合体素材的各类检测数据存储在所述信息平台上。
72.步骤s42、所述信息平台按照预设分类标准，对各类检测数据进行分类管理。
73.在具体实现中，可以按照样品的检测类型进行分类管理。需要说明的是，本发明对分类管理的分类标准不作具体限定。
74.在本发明的一种实施方式中，所述基因编辑纯合体检测数据管理方法，还包括：
75.步骤s5、对所述信息平台所存储的各类检测数据，进行统计分析管理。
76.具体而言，基于预先建立的数据统计方法，对所述信息平台上所存储的各类检测数据进行统计分析，并展示统计分析结果。
77.本发明在一种实施方式中，可将纯合体编辑素材与对照素材的检测数据进行对比，将同一纯合体素材的不同年份、不同试验区域的检测数据进行对比，展示统计分析结果。
78.其中，数据统计方法例如可以为t检验、方差分析、卡方检验、回归分析、相关分析、聚类分析、判别分析、因子分析、时间序列分析等。可以通过sas、spss、matlab、excel等统计软件来实现。统计分析结果的展现方式可以为列表、饼状图、柱状图等。需要说明的是，本发明对数据统计方法及统计分析结果的展现方式不作具体限定。
79.本发明实施例提供的基因编辑纯合体检测数据管理方法，针对烟草基因编辑素材纯合体研究过程中产生的大量数据，基于编辑素材编码体系，通过对多年份、多试验区域的批量纯合体素材从素材种植到样品采集、再到样品检测、再到数据存储及统计分析等多个步骤进行全流程管理，实现了纯合体编辑素材的多源异构检测数据的有效管理。本发明根据各类检测数据和统计分析结果，可将纯合体编辑素材与对照素材的检测数据进行对比，将同一纯合体素材的不同年份、不同试验区域的检测数据进行对比，展示统计分析结果，为纯合体编辑素材的精细筛选和后续品系培育提供了数据支撑和技术支持。
80.相应地，如图2所示，本发明还提供一种基因编辑纯合体检测数据管理信息平台，包括：
81.编码管理模块1、信息采集模块2和数据平台3，所述信息采集模块2分别与所述编码管理模块1和所述数据平台3连接，其中：
82.所述编码管理模块1用于对烟草基因编辑素材进行编码管理；
83.所述信息采集模块2用于根据烟草基因编辑素材的编码管理结果，对待测纯合体素材进行采样管理，得到所述待测纯合体素材对应的采样信息；
84.所述信息采集模块2用于根据烟草基因编辑素材样品检测管理，并对待测纯合体素材的样品检测数据进行存储和管理。
85.进一步地，所述基因编辑纯合体检测数据管理信息平台还包括数据处理模块4和通信模块5，其中，
86.所述数据处理模块4与所述数据平台3连接，用于对所述信息平台所存储的各类检测数据进行统计分析管理，
87.进一步地，所述信息采集模块2和所述数据处理模块4与所述数据平台3通过所述通信模块5连接，所述通信模块5用于将所述信息采集模块2获取的采样信息传输至所述数据平台3，并将所述数据处理模块4的统计分析数据传输至所述数据平台3。
88.进一步地，本发明在一些实施方式中，所述信息采集模块2和所述数据处理模块4可以搭载在移动操作终端(pda)，通过移动操作终端来对素材种植试验区内素材进行表型性状的采集。
89.本发明实施例提供的基因编辑纯合体检测数据管理信息平台，针对烟草基因编辑素材纯合体研究过程中产生的大量数据，基于编辑素材编码体系，通过对多年份、多试验区
域的批量纯合体素材从素材种植到样品采集、再到样品检测、再到数据存储及统计分析等多个步骤进行全流程管理，实现了纯合体编辑素材的多源异构检测数据的有效管理。本发明根据各类检测数据和统计分析结果，可将纯合体编辑素材与对照素材的检测数据进行对比，将同一纯合体素材的不同年份、不同试验区域的检测数据进行对比，展示统计分析结果，为纯合体编辑素材的精细筛选和后续品系培育提供了数据支撑和技术支持。
90.至此，已经详细描述了本公开的各实施例。为了避免遮蔽本公开的构思，没有描述本领域所公知的一些细节。本领域技术人员根据上面的描述，完全可以明白如何实施这里公开的技术方案。
91.虽然已经通过示例对本公开的一些特定实施例进行了详细说明，但是本领域的技术人员应该理解，以上示例仅是为了进行说明，而不是为了限制本公开的范围。本领域的技术人员应该理解，可在不脱离本公开的范围和精神的情况下，对以上实施例进行修改或者对部分技术特征进行等同替换。本公开的范围由所附权利要求来限定。