基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法与流程

文档序号:34159702发布日期:2023-05-14 19:07阅读:38来源:国知局
基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法与流程

本发明涉及数据分析领域,尤其涉及一种基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法。


背景技术:

1、随着精准治疗时代的到来,越来越多的针对特定致癌位点/基因通路的靶向药物或靶向治疗被研发,二代测序技术ngs(next-generation sequencing)逐渐成为临床医生或医学检验医生常用的检测手段,以辅助支持传统的病理分型及检测方法的不足。二代测序技术ngs数据可检测单核苷酸变异(single-nucleotide variant,snv/single-nucleotide polymorphism,snp)、短片段插入/缺失突变、重排、拷贝数变异(copy numbervariation,cnv)、肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,tmb)、微卫星不稳定(microsatellite instability,msi)、同源重组修复缺陷(homologous recombinationdeficiency,hrd)等,对肿瘤/疾病治疗预测和预后都发挥着重要作用。

2、现有技术中,ngs的应用主要包括先由医院或医学检验所采集患者样本构建测序文库、对文库测序,再将这些ngs数据递交第三方进行分析;或者医院或医学检验所仅负责采集患者样本,将样本递交第三方进行建库、测序和分析。可以看出ngs文库送测方和ngs数据分析存在割裂性,这种割裂性导致分析结果的延迟性,ngs文库送测方无法进行实时分析处理;且由于ngs文库送测方在接收到分析结果后没有针对性地与患者进行整合、归纳,导致查询困难、无法及时跟踪持续治疗的患者。

3、因此,在应用ngs的同时如何对其进行本地化数据分析可视化是一个亟待解决的问题。


技术实现思路

1、鉴于上述现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法,旨在解决现有在应用ngs时无法对其进行本地化数据分析可视化的问题。

2、本发明的技术方案如下:本发明提供一种基于本地化的数据分析可视化交互系统,包括:本地化数据管理系统、本地化数据分析和结果展示系统、设置及管理系统、服务器;本地化数据分析和结果展示系统包括:数据分析模块、数据可视化展示模块以及数据自定义报告模块;其中,数据分析模块,用于将不同捕获试剂流程提供给用户,以基于用户选择的捕获试剂流程建立分析任务;设置及管理系统包括:服务器监控模块、流程配置模块以及用户管理模块;其中,流程配置模块包括不同捕获试剂流程的配置。

3、于本发明的一实施例中,本地化数据管理系统,与本地化数据分析和结果展示系统连接,以及与服务器连接;用于将输入信息传递给本地化数据分析和结果展示系统、服务器处理;本地化数据分析和结果展示系统,与服务器连接,用于将分析任务传输给服务器;并接收服务器分析的结果;设置及管理系统,与本地化数据管理系统连接、与本地化数据分析和结果展示系统连接,以及与服务器连接;用于提供配置和监控服务。

4、于本发明的一实施例中,数据分析模块具体用于:当用户选择捕获试剂流程时,基于捕获试剂流程,确定对应的捕获试剂盒;基于捕获试剂盒,从本地化数据管理系统中获取使用捕获试剂盒建库后测序得到的测序数据信息;基于捕获试剂流程、测序数据信息以及预设的捕获试剂流程相应的参数建立分析任务;将分析任务传输至服务器进行分析;接收服务器分析的结果,传输至数据可视化展示模块进行展示。

5、于本发明的一实施例中,本地化数据管理系统包括:患者管理模块、样本管理模块以及数据管理模块;患者管理模块中,一个患者信息关联样本管理模块中的一个或多个样本信息,或不关联任何样本信息;样本管理模块中,一个样本信息关联患者管理模块中的一个患者信息;数据管理模块中,一个或多个测序数据信息关联样本管理模块中的一个样本信息,或不关联任何样本信息;其中,测序数据信息是基于样本信息使用捕获试剂盒进行建库后测序得到的。

6、于本发明的一实施例中,数据分析模块还用于:将分析任务传输至服务器进行分析后,实时监控分析任务,按监控状态将分析任务分类,包括:排队中、运行中、失败以及完成。

7、于本发明的一实施例中,捕获试剂流程对应的环节包括:质控、突变分析、融合分析、拷贝数变异分析、微卫星不稳定分析、肿瘤突变负荷分析和同源重组分析中的一个或多个。

8、于本发明的一实施例中,数据可视化展示模块具体用于:在接收到服务器分析的结果后,接收用户对测序数据信息的第一选择,以及接收用户对环节的第二选择;基于第一选择、第二选择,以及结果,进行对应的结果展示。

9、本发明提供一种基于本地化的数据分析可视化交互方法,包括:获取用户选择的捕获试剂流程;基于捕获试剂流程,确定对应的测序数据信息;基于捕获试剂流程、测序数据信息以及预设的捕获试剂流程相应的参数,确定分析结果。

10、于本发明的一实施例中,确定分析结果后,还包括:获取用户对测序数据信息的第一选择、以及用户对捕获试剂流程对应的环节的第二选择;基于第一选择、第二选择,以及分析结果,进行对应的结果展示。

11、本发明提供一种存储介质,存储有程序指令,其中,程序指令被执行时实现基于本地化的数据分析可视化交互方法的步骤。

12、如上,本发明的基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法,具有以下有益效果:

13、(1)缩短ngs文库送测方和ngs数据分析之间的传递、反馈时间,便于实时跟进处理。

14、(2)能够接洽ngs的快速发展,承载多角度、个性化的数据分析需求;给予用户选择项,以灵活的方式得到更贴近的分析结果。

15、(3)在本地建立闭环流程,包括了取样、建库、测序、分析及报告,便捷的同时能带来直接的经济收益,发展前景良好。



技术特征:

1.一种基于本地化的数据分析可视化交互系统,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的数据分析可视化交互系统,其特征在于,所述本地化数据管理系统,与所述本地化数据分析和结果展示系统连接,以及与所述服务器连接;用于将输入信息传递给所述本地化数据分析和结果展示系统、所述服务器处理;

3.根据权利要求2所述的数据分析可视化交互系统,其特征在于,所述数据分析模块具体用于:

4.根据权利要求3所述的数据分析可视化交互系统,其特征在于,所述本地化数据管理系统包括:患者管理模块、样本管理模块以及数据管理模块;

5.根据权利要求3所述的数据分析可视化交互系统,其特征在于,所述数据分析模块还用于:

6.根据权利要求3所述的数据分析可视化交互系统,其特征在于,所述捕获试剂流程对应的环节包括质控、突变分析、融合分析、拷贝数变异分析、微卫星不稳定分析、肿瘤突变负荷分析和同源重组分析中的一个或多个。

7.根据权利要求6所述的数据分析可视化交互系统,其特征在于,所述数据可视化展示模块具体用于:

8.一种基于本地化的数据分析可视化交互方法,其特征在于,包括:

9.根据权利要求8所述的数据分析可视化交互方法,其特征在于,所述确定分析结果后,还包括:

10.一种存储介质,存储有程序指令,其中,所述程序指令被执行时实现如权利要求8或9所述的基于本地化的数据分析可视化交互方法的步骤。


技术总结
本发明公开一种基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法,系统包括:本地化数据管理系统、本地化数据分析和结果展示系统、设置及管理系统、服务器;本地化数据分析和结果展示系统包括:数据分析模块、数据可视化展示模块以及数据自定义报告模块;其中,数据分析模块,用于将不同捕获试剂流程提供给用户,以基于用户选择的捕获试剂流程建立分析任务;设置及管理系统包括:服务器监控模块、流程配置模块以及用户管理模块;其中,流程配置模块包括不同捕获试剂流程的配置。本发明的基于本地化的数据分析可视化交互系统及方法,能够缩短NGS文库送测方和NGS数据分析之间的传递、反馈时间,便于实时跟进处理。

技术研发人员:蒋才,程陶然,朱文鑫,尹书剑
受保护的技术使用者:纳昂达(南京)生物科技有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/1/12
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