本发明涉及信息应用,尤其涉及一种基于三色高通量测序数据计算方法。
背景技术:
1、随着高通量测序成本的降低,生物大数据对于传统的数据存储、分析和解释的要求越来越高,将这些数据和成果进行系统整合并应用于医疗实践才刚刚开始。目前,实验室的电脑设备还不具备存储和处理大数据的基础设施和能力。三色高通量测序的过程中需要使用多个设备进行数据的获取,最后将数据进行分析,在三色高通量测序的过程涉及大量的数据处理以及分析。
2、现有的高通量测序技术产生的dna序列数据长度较短,而且数据量非常大,三色测序技术不但像2色测序技术一样加快了测序速度,而且碱基信号没有被分开检测,测序长度不但不受影响还会增加,从而提高了测序效率及测序通量,在使用三色检测技术的过程中面对的数据量比2色的还要多,现有的实验室测序仪器采集数据后需要与一台电脑连接,然后多台电脑相互之间进行数据的传输,然后将数据通过互联网saas数据分析平台分析,此过程中,由于数据是从多个主体中产生传输,所以在数据整理汇总,以及后续分析的过程中会面临着数据安全以及数据完整度的问题,当然由于数据量,数据传输速度以及数据的处理分析速度也面临挑战,为解决此问题研发一种基于三色高通量测序数据计算方法。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种基于三色高通量测序数据计算方法,以解决三色高通量测序过程中由于数据量大,数据处理过程中数据处理速度慢安全性差的问题。
2、本发明提供一种基于三色高通量测序数据计算方法,包括;
3、获取三色测序检测设备的测试数据以及高通量基因测序基础数据,将获取的所述三色测序检测设备的测试数据与所述高通量基因测序基础数据构建三色高通量测序数据库;
4、采集实验室基因测试需求信息以及第三方基因检测平台检测标准参数;
5、将采集的所述实验室基因测试需求信息与所述第三方基因检测平台检测标准参数进行匹配,若匹配成功则将实验室基因待检测数据进行区块链存证,生成与实验室基因待检测数据对应的实验室基因待检测数据存证哈希值,将所述实验室基因待检测数据与所述实验室基因待检测数据存证哈希值传输至第三方基因检测平台进行基因检测;
6、所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据进行基因检测分析,得到第三方基因检测结果;
7、将所述第三方基因检测结果数据通过预设隐私计算模型进行加密后传输至实验室端,实验室端通过预设隐私计算模型对数据进行解密,得到测序数据处理结果。
8、进一步地,获取三色测序检测设备的测试数据以及高通量基因测序基础数据,将获取的所述三色测序检测设备的测试数据与所述高通量基因测序基础数据构建三色高通量测序数据库,包括;
9、所述三色测序检测设备包括第一检测设备、第二检测设备、第三检测设备以及第四检测设备,对所述第一检测设备、第二检测设备、第三检测设备以及第四检测设备建立检测设备标签,根据所述检测设备标签获取设备采集数据标准参数,将所述设备采集数据标准参数与所述检测设备标签建立对应关系。
10、进一步地,采集实验室基因测试需求信息以及第三方基因检测平台检测标准参数,包括;
11、将所述第三方基因检测平台检测标准参数进行数据归类,得到每个第三方基因检测平台检测标准参数,构建第三方基因检测平台标准参数信息库;
12、提取所述第三方基因检测平台标准参数信息库内的特征数据,根据所述第三方基因检测平台标准参数信息库内的特征数据,构建第三方基因检测平台标准参数检索部。
13、进一步地,所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据进行基因检测分析,得到第三方基因检测结果,包括;
14、所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据进行基因检测分析,包括第一分析组以及第二分析组,
15、所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据传输至所述第一分析组以及所述第二分析组,得到第一分析组反馈数据以及第二分析组反馈数据;
16、将所述第一分析组反馈数据与所述第二分析组反馈数据进行对比,得到基因检测分析验证数据。
17、进一步地,将所述第三方基因检测结果数据通过预设隐私计算模型进行加密后传输至实验室端,实验室端通过预设隐私计算模型对数据进行解密,得到测序数据处理结果,包括;
18、将所述第三方基因检测平台的数据接口与实验室端的数据接口与外部隐私计算设备接口进行对接,外部隐私计算设备接口在收到实验室端发送的隐私计算请求后,外部隐私计算设备通过预设的隐私计算模型对实验室端的所述实验室基因待检测数据进行隐私计算,然后传输至所述第三方基因检测平台,第三方基因检测平台通过向外部隐私计算设备发送数据解密请求,外部隐私计算设备对所述实验室基因待检测数据进行解密,所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据进行分析后,通过向外部隐私计算设备发送请求后,外部隐私计算设备将第三方基因检测平台的数据分析结果传输至实验室端并进行解密。
19、进一步地,将所述实验室基因待检测数据与所述实验室基因待检测数据存证哈希值传输至第三方基因检测平台进行基因检测,包括;
20、在所述实验室端与所述第三方基因检测平台端建立通信切换策略,当所述实验室端与所述第三方基因检测平台数据传输速率低于预设值时,则启用所述通信切换策略,所述通信切换策略包括,第一通信方式为有线宽度网络传输、第二通信方式为5g通信传输以及第三通信方式6g通信传输,当第一通信方式数据传输速率低于预设值时,则切换至第二通信方式,若第二通信方式数据传输速率低于预设值时,则切换至第三通信方式。
21、本发明的有益效果如下:本发明提供的一种基于三色高通量测序数据计算方法,获取三色测序检测设备的测试数据以及高通量基因测序基础数据,将获取的所述三色测序检测设备的测试数据与所述高通量基因测序基础数据构建三色高通量测序数据库,采集实验室基因测试需求信息以及第三方基因检测平台检测标准参数,将采集的所述实验室基因测试需求信息与所述第三方基因检测平台检测标准参数进行匹配,若匹配成功则将实验室基因待检测数据进行区块链存证,生成与实验室基因待检测数据对应的实验室基因待检测数据存证哈希值,将所述实验室基因待检测数据与所述实验室基因待检测数据存证哈希值传输至第三方基因检测平台进行基因检测,所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据进行基因检测分析,得到第三方基因检测结果,将所述第三方基因检测结果数据通过预设隐私计算模型进行加密后传输至实验室端,实验室端通过预设隐私计算模型对数据进行解密,得到测序数据处理结果。通过建立数据传输通信切换策略,将实验室端各基因检测设备的传输至云端服务器进行数据分析,避免本地电脑运行速度慢分析耗时长,以及对数据进行隐私计算保证数据的安全性。解决了三色高通量测序过程中由于数据量大,数据处理过程中数据处理速度慢安全性差的问题。
1.一种基于三色高通量测序数据计算方法,其特征在于,包括;
2.如权利要求1所述的基于三色高通量测序数据计算方法,其特征在于,获取三色测序检测设备的测试数据以及高通量基因测序基础数据,将获取的所述三色测序检测设备的测试数据与所述高通量基因测序基础数据构建三色高通量测序数据库,包括;
3.如权利要求1所述的基于三色高通量测序数据计算方法,其特征在于,采集实验室基因测试需求信息以及第三方基因检测平台检测标准参数,包括;
4.如权利要求1所述的基于三色高通量测序数据计算方法,其特征在于,所述第三方基因检测平台将所述实验室基因待检测数据进行基因检测分析,得到第三方基因检测结果,包括;
5.如权利要求1所述的基于三色高通量测序数据计算方法,其特征在于,将所述第三方基因检测结果数据通过预设隐私计算模型进行加密后传输至实验室端,实验室端通过预设隐私计算模型对数据进行解密,得到测序数据处理结果,包括;
6.如权利要求1所述的基于三色高通量测序数据计算方法,其特征在于,将所述实验室基因待检测数据与所述实验室基因待检测数据存证哈希值传输至第三方基因检测平台进行基因检测,包括;