获得高产油棕榈植物的方法

文档序号:1530147阅读:352来源:国知局
专利名称:获得高产油棕榈植物的方法
技术领域
本申请涉及获得高产植物的方法,更具体地,涉及获得在生产棕榈油方面高产的油棕榈植物的方法。
背景技术
非洲油棕Elaeis guineensis Jacq.是重要的油-食物作物。油棕榈是雄雌同株,即单株植株产生雄花和雌花。油棕以雌雄异花序为特征。雄花序由许多的小穗状花序组成,可具有超过100,000个花。油棕通过昆虫或风天然地异花传粉。雌花序是肉穗花序,在多刺的穗状花序上可包含数以千计的花。每束带有500至4000个果实。油棕榈的果实是无柄的核果。形状为球形至卵形或细长形。果实由外果皮、含棕榈油的中果皮和环绕核的内果皮构成。 油棕由于其高产和棕榈油的高品质而重要。关于产量,油棕榈是最高产的油-食物作物。最近每公顷每年的平均产量为3. 67吨,已知的最好后代每公顷每年生产约10吨。油棕也是已知利用太阳光的能量生产油的最高效植物。关于品质,种植油棕为了中果皮中生产的棕榈油和核中生产的棕榈仁油。尤其是,棕榈油是平衡油,具有几乎均等的饱和脂肪酸55%,包含45%的棕榈酸)和不饱和脂肪酸45%),棕榈油包含β-胡萝卜素。棕榈仁油比中果皮油更饱和。两种油都含低量游离脂肪酸。目前棕榈油和棕榈仁油的每年联合产量约5千万吨。由于全球人口的增加和人均油和脂肪消费的增加,预计将来其需求会显著增加。虽然油棕榈是最高产的油-食物作物,但是目前油棕榈作物的产量远低于其理论最高值。而且,传统的鉴定潜在的在杂交中使用以产生高产后代的高产棕榈的方法需要在许多年的期间培植棕榈并测量它们的油的产量,这需要时间,并且是劳力密集型。此外,传统的繁殖用于产油的油棕榈的育种技术也需要时间,并且是劳力密集型。尤其是因为多数多产的并且商业性相关的棕榈表现出杂种表型,由此使通过直接的杂交来繁殖不切实际。因此,存在通过改善获得和鉴定高产棕榈的方法来改善油棕榈产量的需要。转基因方法提供了潜在的解决广泛的提高植物产量的需要问题的方法。例如,通过引入来源于其它物种的抗虫基因的转基因改变例如大豆和棉花等作物作为提高作物产量的方法现在已熟知。此外,通过在植物中增加或产生特定蛋白的活性来增加植物产量的方法也已公开,例如,Sch0n等人的W02010/0466221。然而,作物的转基因修饰引起潜在的对关于对个人和生态系统的非故意毒害影响的潜在关注。蛋白质包含对基因组全部蛋白质的研究,也提供了解决广泛的提高植物产量的问题的潜在方法。例如,如Mackintosh等的3Proteomisc2273_88 (2003)所描述,相当于使用敏感荧光标记染料的双向凝胶电泳的差异双向电泳技术(DIGE),已成功用在水稻和向日葵中的蛋白表达分析中,如 Teshima 等的 Regulatory Toxicology & Pharmacology (articlein press)和 Hajduch 等的 6Journal of Proteome Research 3232-41 (2007)分别描述。在水稻中,这种方法用于区分不同的栽培种,也用于比较变应原蛋白的表达。在向日葵中,若干在种子油性状领先着已经被鉴定用来进一步研究。然而,考虑到水稻、向日葵和油棕在遗传和代谢上的许多差别,并且蛋白表达的高度特异的性质,对于通过改善获得和鉴定高产棕榈的方法来提高油棕榈的产量,不能期望水稻和向日葵中的这些研究有用。

发明内容
提供了一种获得高产油棕榈植物的方法。所述方法包括测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织的蛋白的水平。该蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻(Ricinus coinmunis)假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖_1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700 同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17 的同源蛋白、绿藻 CCE9901 (Ostreococcuslucimarinus-CCE9901)预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓(Physcomitrella patens)亚种 预测蛋白的同源蛋白、杨树(Populus trichocarpa)预测蛋白的同源蛋白、葡萄(Vitisvinifera)假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体(protein transporter)、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基A、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂I丐蛋白(Iipocalin)和北美云杉(Picea sitchensis)的未知蛋白的同源蛋白构成的组。该方法还包括判定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平之间是否有差异。该方法还包括基于上述差异,选择所述亲本油棕榈植物的后代以获得高产油棕榈植物。本发明还提供了预测试验油棕榈植物油产量的方法。该方法包括测定试验油棕榈植物果实的中果皮组织中的蛋白水平。该蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白构成的组。该方法还包括测定试验油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平之间是否有差异。该方法还包括基于上述差异,预测所述试验油棕榈植物的油产量。
本发明还提供了一种用于获得高产油棕榈植物的试剂盒。所述试剂盒包含检测蛋白的抗体,所述蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP,甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白构成的组。所述试剂盒还包括参照油棕榈植物果实的中果皮组织的提取物。 上述公开的方法和试剂盒基于有利的蛋白组组合,以便在目前的油棕榈育种群体中鉴定高产和低产性状标记,从而加快鉴定高产棕榈和常规育种技术的速度,由此产生高产后代。本发明的应用包括鉴定高产亲本棕榈植物用于产生高产后代,并预测试验棕榈的棕榈油油产量,在这两种情况下,都不需要历经数年期间收集来自棕榈的油产量数据。同样,虽然上述方法和试剂盒很适合用于传统的育种技术,从而提供在不依赖转基因的情况下加快获得高产棕榈的速度的基础,但是上述方法和试剂盒也可应用于提高通过组织培养或转基因方法的繁殖效率。


图1是对应于高产棕榈Η2的中果皮蛋白和低产棕榈hi的中果皮蛋白的荧光差异双向凝胶电泳(“DIGE”)分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后12周检测。图2是对应于高产棕榈H4的中果皮蛋白和低产棕榈h6的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后12周检测。图3是对应于高产棕榈H6的中果皮蛋白和低产棕榈h9的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后12周检测。图4是对应于高产棕榈H2的中果皮蛋白和低产棕榈hi的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后16周检测。图5是对应于高产棕榈H4的中果皮蛋白和低产棕榈h6的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后16周检测。图6是对应于高产棕榈H6的中果皮蛋白和低产棕榈h9的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后16周检测。图7是对应于高产棕榈H2的中果皮蛋白和低产棕榈hi的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后18周检测。图8是对应于高产棕榈H4的中果皮蛋白和低产棕榈h6的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后18周检测。
图9是对应于高产棕榈H6的中果皮蛋白和低产棕榈h9的中果皮蛋白的DIGE分析凝胶的扫描图,两者都在授粉后18周检测。图1OA至图1OM是文中鉴定的45个特定差异表达的蛋白序列的列表,缩写为单字
母氨基酸格式。
具体实施例方式本申请涉及获得高产油棕榈植物的方法,预测试验油棕榈植物油产量的方法和用于获得高产油棕榈植物的试剂盒。如文中公开,油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平可用于获得高产油棕榈植物和预测试验油棕榈植物的油产量。在这方面,可用的蛋白包括5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖_1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白。因而,本申请提供了获得高产油棕榈植物的方法,该方法包括测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白中一种的水平、判定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平之间是否有差异,及基于该差异选择亲本油棕榈植物的后代,以获得高产油棕榈植物。此外,本申请提供了预测试验油棕榈植物的油产量的方法,该方法包括测定试验油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白中一种的水平;判定试验油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中该蛋白的水平之间是否有差异;及基于该差异,预测试验油棕榈植物的油产量。此外,本申请提供了用于获得高产油棕榈植物的试剂盒,该试剂盒包括检测上述蛋白中一种的水平的抗体和参照油棕榈植物果实的中果皮组织的提取物。定义如文中使用的术语“亲本油棕榈植物”表示在实施如文中公开的获得高产油棕榈植物或使用如文中公开的试剂盒获得高产油棕榈植物的过程中,已经产生、正在产生或将产生的后代来自的油棕榈植物。如文中使用的术语“试验油棕榈植物”表示实施如文中公开的预测植物油产量的方法过程中,对其已经进行、正在进行和将进行测定其果实的中果皮组织中蛋白的水平的步骤的油棕榈植物。如文中使用的术语“参照油棕 榈植物”表示在测定油棕榈产量性状中用作比较基础的油棕榈植物。例如,取决于特定应用的背景,参照油棕榈植物可为生产大量棕榈油、平均量棕榈油和少量的棕榈油。例如,参照油棕榈植物可为每公顷每年生产10、9、8、7、6、5、4、3、2或I吨棕榈的油棕榈植物。如文中使用与文中公开的方法和试剂盒有关的术语“低产量”、“高产量”和“油产量”是指棕榈油植物的果实的中果皮组织中的棕榈油产量。如文中使用的术语“同系物(homologs) ”和“同源的”是指具有高度相似的DNA序列的两个或更多个基因,或者具有高度相似的氨基酸序列的两个或更多个蛋白。基于有例如 60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高的序列相似性,这样的基因或蛋白可被认为“同源”。术语同系物和同源的包含这样高度相似的基因或蛋白。这样基因或蛋白或起源于单种物种,从而可代表该物种的结构上和功能上相似的基因或蛋白;这样基因或蛋白或起源于不同的物种,从而代表来自共同祖先的直向同源基因或同源蛋白。·获得高产油棕榈植物的方法如上述,提供了一种获得高产油棕榈植物的方法。该方法包括(i)测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平,( )判定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平是否有差异;和(iii)基于该差异,选择亲本油棕榈植物的后代,获得高产油棕榈植物。蛋直根据该方法,蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白构成的组。在一些实施方式中,所述5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶包含序列1,所述脱落胁迫成熟蛋白包含序列2,所述肌动蛋白6包含序列3,所述肌动蛋白E包含序列4,所述生物素羧化酶前体包含序列5,所述咖啡酸O-甲基转移酶包含序列6,所述过氧化氢酶2包含序列7,所述保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白包含序列8,所述微纤维蛋白类似蛋白包含序列9,所述黄素氧还蛋白样醌还原酶I包含序列10,所述果糖二磷酸醛缩酶包含序列11,所述3-磷酸甘油醛脱氢酶包含序列12,所述H0825G02. 11的同源蛋白包含序列13,所述核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基包含序列14,所述LealP包含序列15,所述甲硫胺酸合成酶蛋白包含序列16,所述线粒体过氧化物还原酶包含序列17,所述0s02g0753300同源蛋白包含序列18,所述0s05g0482700同源蛋白包含序列19,所述0sl2g0163700同源蛋白包含序列20,所述0SJNBb0085F13. 17同源蛋白包含序列21,所述绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白包含序列22,所述小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白包含序列23,所述杨树预测蛋白的同源蛋白包含序列24,所述葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白包含序列25,所述新生多肽相关的复合物α包含序列26,所述脯氨酸亚氨基肽酶包含序列27,所述蛋白输送体包含序列28,所述水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白包含序列29,所述Ran GTP酶结合蛋白包含序列30,所述叶绿体磷酸丙糖异构酶包含序列31,所述V型质子ATP酶催化亚基A包含序列32,所述核糖核酸酶活性A的调节物包含序列33,所述逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白包含序列34,所述核糖体蛋白LlO包含序列35,所述短链型脱氢酶包含序列36,所述温度诱导的脂钙蛋白包含序列37,和所述北美云杉的未知蛋白的同源蛋白包含序列38。上述蛋白可以根据功能分类,例如脂质代谢、非脂质代谢和代谢以外的功能。例如生物素羧化酶的前体和果糖二磷酸醛缩酶的首要功能是脂质代谢。相反,5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、3_磷酸甘油醛脱氢酶、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、甲硫胺酸合成酶蛋白、脯氨酸亚氨基肽酶、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基A主要在非脂质代谢中起作用。相反,剩余的蛋白脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌 动蛋白Ε、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、H0825G02. 11的同源蛋白、LealP、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白主要在非代谢能力中起作用。因此,在一些实施方式中,上述蛋白是选自由生物素羧化酶前体和果糖二磷酸醛缩酶构成的组中的主要在脂质代谢中起作用的蛋白。此外,在一些实施方式中,上述蛋白是选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、3_磷酸甘油醛脱氢酶、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、甲硫胺酸合成酶蛋白、脯氨酸亚氨基肽酶、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基A构成的组中的主要在非脂质代谢中起作用的蛋白。此外,在一些实施方式中,上述蛋白是选自由脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白Ε、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、H0825G02. 11的同源蛋白、LealP、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300的同源蛋白、0s05g0482700的同源蛋白、0sl2g0163700 的同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17 的同源蛋白、绿藻 CCE9901 (OstreococcusIucimarinus-CCE9901)的预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、蛋白输送体、水稻粳稻种群的推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白组成的组中的首要功能是非代谢功能的蛋白。蛋白水平的测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中一个上述蛋白的水平可由来源于中果皮组织的蛋白制备物测定,例如中果皮蛋白的天然制备物、中果皮蛋白的最低限度提纯的制备物或中果皮蛋白的高度纯化的制备物。该制备物可包括总的中果皮蛋白、或中果皮蛋白的子集,如可溶蛋白、不可溶蛋白、等电点在PH 4 7的蛋白,或具有更高或更低等电点的蛋白。中果皮组织本身可在其来自的果实授粉后(“授粉后”)的任何时刻,例如授粉后11 19周、授粉后11 17周、授粉后15 19周、授粉后11 13周、授粉后15 17周、授粉后17 19周、授粉后12周、授粉后16周或授粉后18周在果实的特定发育阶段获得和检测。蛋白水平可表述为绝对定量的术语,例如单位质量的中果皮组织中的蛋白质量;或表述为相对术语,例如蛋白信号的强度相对于参照信号的强度。在一些实施方式中,根据本领域中熟知的方法,检测亲本油棕榈植物果实的中果皮组织蛋白的水平通过抗体类检测来进行,例如免疫印迹、斑点印迹或酶标记免疫吸附测定法。抗体类检测可通过使用例如由上述蛋白得到的单克隆或多克隆抗体来进行。抗体可通过本领域中熟知的方法制备或从商业厂商获得。该抗体类检测可定量地进行。在一些实施方式中,根据已知的方法,检测亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白水平的步骤通过荧光类检测,例如样品中总蛋白用CyDye标记,然后通过例如DIGE预备凝胶分析来分离和检测蛋白来进行。在一些实施方式中,对多于一种的上述蛋白测定其水平。例如在一些实施方式中,对2种至38种上述蛋白的组合测定其水平。又例如,在一些实施方式中,测定2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38中上述蛋白组合的水平。以测定上述蛋白的两种组合的水平为例,在一些实施方式中,测定5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶和下列蛋白中的一种的水平脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶的前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白。在其它实施方式中,测定上述蛋白的每一其它可能组合的水平。判定蛋白水平间的差异 判定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白中一种蛋白的水平与参照油 棕榈植物果实的中果皮组织中该蛋白的水平间是否有差异的步骤通过比较该蛋白的各个水平,例如如上文所述通过抗体类检测或荧光类测定的,并检查它们之间的差别来进行。在一些实施方式中,认为这样的比较揭示了生物学上和/或统计学上的显著差别,例如,基于亲本油棕榈植物的中果皮组织中蛋白的水平比参照油棕榈植物的中果皮组织中蛋白的水平高(或者低),例如大于1.1倍、1. 25倍、1. 5倍、2倍、4倍或更多倍,具有例如< 0. 025、<0. 05或<0.1的P值。对普通技术人员显而易见的是,可使用软件用于判定和比较信号强度来使这种比较变得方便,例如,使用Image Quant软件(版本6. O, AmershamBioSciences),接着用 DeCyderTM 2D 软件版本 6. 5 (Amersham BioScience)生物变异分析。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平。例如,在一些实施方式中,差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中脱落胁迫成熟蛋白的水平高于授粉后15至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中脱落胁迫成熟蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中脱落胁迫成熟蛋白的水平高于授粉后16或18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中脱落胁迫成熟蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白6的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白6的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白6的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白6的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白E的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白E的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16或18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白E的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中肌动蛋白E的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中生物素羧化酶的前体的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中生物素羧化酶前体的水平。例如,在一些实施方式中,差异是授粉后16或18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中生物素羧化酶的前体的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中生物素羧化酶前体的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中咖啡酸O-甲基转移酶的水平低于授粉后11至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中咖啡酸O-甲基转移酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中咖啡酸O-甲基转移酶的水平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中咖啡酸O-甲基转移酶的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中咖啡酸O-甲基转移酶的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中咖啡酸O-甲基转移酶水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中过氧化氢酶2的水平高于授粉后11至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中过氧化氢酶2的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中过氧化氢酶2的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中过氧化氢酶2的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中过氧化氢酶2的水平高于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中过氧化氢酶2的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中微纤维蛋白类似蛋白的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中微纤维蛋白类似蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中微纤维蛋白类似蛋白的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中微纤维蛋白类似蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平低于授粉后11至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平低于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中果糖二磷酸醛缩酶的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中果糖二磷酸醛缩酶的水平。例如,在一些实施方式中,差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中果糖二磷酸醛缩酶的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中果糖二磷酸醛缩酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中3-磷酸甘油醛脱氢酶的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中3-磷酸甘油醛脱氢酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中3-磷酸甘油醛脱氢酶的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中3-磷酸甘油醛脱氢酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中H0825G02. 11的同源蛋白的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中H0825G02. 11的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中H0825G02. 11的同源蛋白的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中H0825G02. 11的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后17至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基的水平高于授粉后17至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基的水平高于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中LealP的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中LealP的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中LealP的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中LealP的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中甲硫胺酸合成酶蛋白的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中甲硫胺酸合成酶蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中甲硫胺酸合成酶蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中甲硫胺酸合成酶蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中线粒体过氧化物还原酶的水平高于授粉后11至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中线粒体过氧化物还原酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中线粒体过氧化物还原酶的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中线粒体过氧化物还原酶的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中线粒体过氧化物还原酶的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中线粒体过氧化物还原酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0s02g0753300的同源蛋白的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0s02g0753300的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0s02g0753300的同源蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0s02g0753300的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0s05g0482700的同源蛋白的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0s05g0482700的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0s05g0482700的同源蛋白的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0s05g0482700的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0sl2g0163700的同源蛋白的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0sl2g0163700的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16或18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0sl2g0163700的同源蛋白的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0sl2g0163700的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0SJNBb0085F13. 17的同源蛋白的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0SJNBb0085F13. 17的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中0SJNBb0085F13. 17的同源蛋白的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中0SJNBb0085F13. 17的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白的水 平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中杨树预测蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后11至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中杨树预测蛋白的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中杨树预测蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中杨树预测蛋白的同源蛋白的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中杨树预测蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中杨树预测蛋白的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白的同源基因的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中新生多肽相关的复合物α的水平高于授粉后11至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中新生多肽相关复合物α的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中新生多肽相关的复合物α的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中新生多肽相关的复合物α的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中新生多肽相关的复合物α的水平高于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中新生多肽相关的复合物α的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中脯氨酸亚氨基肽酶的水平高于授粉后15至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中脯氨酸亚氨基肽酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中脯氨酸亚氨基肽酶的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中脯氨酸亚氨基肽酶的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中脯氨酸亚氨基肽酶的水平高于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中脯氨酸亚氨基肽酶的水平。
在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织蛋白输送体的水平低于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白输送体的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白输送体的水平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白输送体的同源基因的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织Ran GTP酶结合蛋白的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中Ran GTP酶结合蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中Ran GTP酶结合蛋白的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中Ran GTP酶结合蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中叶绿体磷酸丙糖异构酶的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中叶绿体磷酸丙糖异构酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中叶绿体磷酸丙糖异构酶的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中叶绿体磷酸丙糖异构酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中V型质子ATP酶催化亚基A的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中V型质子ATP酶催化亚基A的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中V型质子ATP酶催化亚基A的水平高低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中V型质子ATP酶催化亚基A的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖核酸酶活性A的调节物的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖核酸酶活性A的调节物的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16或18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖核酸酶活性A的调节物的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖核酸酶活性A的调节物的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织逆转录因子Pol多聚蛋白样同源蛋白的水平低于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白的水平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后11至13周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织核糖体蛋白LlO的水平低于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖体蛋白LlO的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖体蛋白LlO的水平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中核糖体蛋白LlO的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织短链型脱氢酶的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中短链型脱氢酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16或18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中短链型脱氢酶的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中短链型脱氢酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中温度诱导的脂钙蛋白的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中温度诱导的脂钙蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中温度诱导的脂钙蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中温度诱导的脂钙蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中上述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中北美云杉的未知蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中北美云杉的未知蛋白的同源蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中北美云杉的未知蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中北美云杉的未知蛋白的同源蛋白的水平。在一些实施方式中,对多于一种上述蛋白测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异。例如,在一些实施方式中,对上述蛋白中2种至38种的组合测定上述差异。又例如,在一些实施方式中,对上述蛋白中的2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种、11种、12种、13种、14种、
15种、16种、17种、18种、19种、20种、21种、22种、23种、24种、25种、26种、27种、28种、
29种、30种、31种、32种、33种、34种、35种、36种、37种或38种的组合,例如每个可能的组合测定其差异。诜择后代基于亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异选择亲本油棕榈植物的后代以获得高产油棕榈植物的步骤可通过,例如基于该差异选择用于繁殖的亲本油棕榈植物,并将该植物与另一种油棕榈植物,例如对上述蛋白中的一种也表现出相同或相似差异的另一种油棕榈植物杂交来进行;或通过常规育种技术以获得对应于高产油棕榈植物的后代。如本领域熟知,果实类型是对油棕榈育种和油棕榈商业生产至关重要的油棕榈中的单遗传特征。具体地,具有两种显著果实类型中任一种的油棕榈通常通过杂交用于育种和种子生产,以便产生可用于商业生产油的棕榈(也称为“商业种植材料”或“农业生产植物”)。第一果实类型是dura (基因型sh+sh+),且特征在于具有相应于果实的28 35%重量的厚壳,并且在果实核周围没有黑纤维环。对于dura果实,中果皮与果实的比例范围为50%至60%,可提取的油含量与束重量(bunch weight)的比例是18 24%。第二果实类型是pisifera(基因型sh-sh-),其特征为没有壳,壳的退化器官表现为环绕小核的纤维环。因而,对于pisifera果实,中果皮与果实的比例为90%至100%。中果皮油与束(bunch)与dura相比为16 28%。然而,由于在发育早期大多数束发育不全,pisifera通常雌性不育。Dura和pisifera杂交可产生第三果实类型tenera (基因型sh+sh_)。Tenera果实具有占果实重量8 10%的相当于O. 5 4mm厚的薄壳,其周围是黑纤维特征环。对于tenera果实,中果皮占果实的比例相当高,在60 80%的范围内。商业tenera棕榈虽然平均束重量较低,但是通常比dura产生更多的果实束。其可提取的油与束的比例在20 30%的范围内,在三种果实类型中最高,因此tenera通常用作商业种植材料。用在东南亚中的Dura棕榈育种种群包括Serdang Avenue、Ulu Remis(混合了一些 Serdang Avenue 材料)、Johor Labis 和 Elmina estate,包括 DeliDumpy,以上这些都来源于Deli dura。用作种子生产的pisifera育种群体通常归类为Yangamb1、AVROS、Binga和URT。其它dura和pisifera育种群体在非洲和南美使用。因此,在一些实施方式中,亲本油棕榈植物是选自由Deli dura、Serdang Avenuedura、Ulu Remis dura>Johor Labis dura和Elmina estate dura构成的组中的dura掠榈。或者,在一些实施方式中,亲本油棕榈植物是选自由Yangambi pisifera、AVROS pisifera、Binga pisifera 和 URT pisifera 构成的组中的 pisifera 掠榈。油棕榈育种首要目的是为优良的tenera商用种植材料的生产,选择改善的亲本dura育种原种棕榈和pisifera育种原种棕榈。虽然为克隆的繁殖的组织培养使用得到持续发展,但是这样的材料大部分以种子的形式。通常,亲本dura育种群体通过在选择的dura棕榈间杂交产生。基于果实类型的单基因遗传,100%生成的棕榈是dura。经过数年的产量记录及束特征和果实特征的确认,基于表型,选择dura用于育种。相反,pisifera棕榈通常雌性不育,因而其育种群必须通过选择的tenera间杂交或通过选择的tenera和选择的pisifera杂交产生。TeneraX tenera杂交可产生25 %的dura、50 %的tenera和25% 的 pisifera。TenerXpisifera 杂交可产生 50% 的 tenera 和 50% 的 pisifera。然后,pisifera的产量潜力通过与原种dura的后代检验间接测定,即dura和pisifera杂交产生tenera,然后随着时间测定tenera果实的产量表型。由此,基于其tenera后代的性能,选择具有优良常规结合能力的pisifera。选择的亲本间的相互杂交也通过进入下一育种周期的后代来进行。这使得引入新基因到育种程序中以增加遗传多样性。使用该总体方案,在其他特征中,就新鲜果束的高产量及高的油与束之比(薄的壳,厚的中果皮)高的早期产量(早熟)和良好的油品质而言,优选的选择目标为每单位面积的高油产量。因而,在一些实施方式中,亲本油棕榈植物是dura育种原种植物,后代包括选自由dura育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组中的油棕榈植物,且高产油棕榈植物选自由dura育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组。例如,在一些实施方式中,以产生改善的dura育种原种的目的实施该方法,在这种情况下,亲本dura育种原种植物与另一种dura育种原种植物杂交,以便在后代中直接获得高产棕榈植物,这些高产棕榈植物也将是dura育种原种植物。又例如,在一些实施方式中,以产生改善的tenera农业生产植物的目的实施该方法,在这种情况下,亲本dura育种原种植物与Pi sif era育种原种植物杂
交以在后代中直接获得高产油棕榈植物,这些高产棕榈植物也将为tenera农业生产植物。或者,在一些实施方式中,亲本油棕榈植物是tenera育种原种植物,其后代包括选自由tenera育种原种植物、pisifera育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组中的油棕榈植物,且高产油棕榈植物选自由tenera育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组。例如,在一些实施方式中,以产生改善的tenera育种原种的目的实施该方法,在这种情况下,亲本tenera育种原种植物与另一种tenera育种原种植物杂交,以在后代中直接获得tenera高产棕榈植物,其中,25%将为dura,50%将为tenera,25%将为pisifera。又例如,在一些实施方式中,以产生改善的tenera农业生产植物的目的实施该方法,其中亲本tenera育种原种植物与pisifera育种原种植物杂交,以产生对应于50% tenera和50% pisifera的后代。这个杂交产生的pisifera又被用作用于产生tenera农业生产植物的pisifera育种原种。后代植物可通过常规方法栽培,例如幼苗可在预苗圃(Pre-Nursery)和苗圃装置的聚乙烯袋中栽培,培育约12个月,然后作为幼苗种植,选择已知或预测表现出高产的后代进一步培植。由前述可知,选择亲本油棕榈植物后代的步骤也可基于亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中多于一种蛋白的水平和参照油棕榈植物果实的中果皮组织中这些蛋白的水平间的差异,以便获得高产油棕榈植物。例如,在一些实施方式中,上述选择步骤基于关于上述蛋白中2至38种的组合的差异。又例如,在一些实施方式中,上述选择步骤基于关于上述蛋白中的2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种、11种、12种、13种、14种、15种、
16种、17种、18种、19种、20种、21种、22种、23种、24种、25种、26种、27种、28种、29种、
30种、31种、32种、33种、34种、35种、36种、37种或38种的组合,例如每种可能的组合的差异。附加的蛋白在一些实施方式中,除了对一种或多种上述蛋白测定上述差异外,还对选自由17. 6kDa类I小热激蛋白、ABCl家族蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶、谷胱甘肽-S-转移酶、谷胱甘肽-S-转移酶Θ、磷脂酶D和VIER F-Box蛋白2构成的组中的一种或多种其它蛋白测定上述差异。在一些实施方式中,17. 6kDa类I小热激蛋白包含序列39,ABCl家族蛋白包含序列40,谷胱甘肽过氧化物酶包含序列41,谷胱甘肽-S-转移酶包含序列42,谷胱甘肽-S-转移酶Θ包含序列43,磷脂酶D包含序列44和VIER F-Box蛋白2包含序列45。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平间的差异是授粉后15至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中17. 6kDa类I小热激蛋白的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中17. 6kDa类I小热激蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16或18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中17. 6kDa类I小热激蛋白的水平高于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中17. 6kDa类I小热激蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中ABCl家族蛋白的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果 实的中果皮组织中ABCl家族蛋白的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中ABCl家族蛋白的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中ABCl家族蛋白的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽过氧化物酶的水平高于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽过氧化物酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽过氧化物酶的水平高于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽过氧化物酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平间的差异是授粉后11至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平低于授粉后11至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后12周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平低于授粉后12周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平。又例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平。作为另一个实例,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平低于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平间的差异是授粉后17至19周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶Θ的水平高于授粉后17至19周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶Θ的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶Θ的水平高于授粉后18周参照油棕榈植物果实的中果皮组织中谷胱甘肽-S-转移酶Θ酶的水平。在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白的水平间的差异是授粉后15至17周亲本油棕榈 植物果实的中果皮组织中磷脂酶D的水平低于授粉后15至17周参照油棕榈植物果实的中 果皮组织中磷脂酶D的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后16周亲本油棕 榈植物果实的中果皮组织中磷脂酶D的水平低于授粉后16周参照油棕榈植物果实的中果 皮组织中磷脂酶D的水平。
在一些实施方式中,亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白水平与参照油 棕榈植物果实的中果皮组织中其它蛋白水平的差异是授粉后17至19周亲本油棕榈植物果 实的中果皮组织中VIER F-Box蛋白2的水平高于授粉后17至19周参照油棕榈植物果实 的中果皮组织中VIER F-Box蛋白2的水平。例如,在一些实施方式中,上述差异是授粉后 18周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中VIER F-Box蛋白2的水平高于授粉后18周参照 油棕榈植物果实的中果皮组织中VIER F-Box蛋白2的水平。
获得棕榈由的方法
技术领域
本发明也公开了一种从高产油棕榈植物获得棕榈油的方法。该方法包括如上文解 释的获得高产油棕榈植物的步骤和从高产油棕榈植物的果实分离棕榈油的步骤。分离棕榈 油的步骤可通过常规的方法进行,例如收获果实束,接着在24小时内从其新鲜和没有伤的 果实中分离棕榈油。
预测试验油棕榈植物油产暈的方法
如上所述,本发明还提供了一种预测试验油棕榈植物油产量的方法。该方法包括 (i)测定试验油棕榈植物油果实的中果皮组织中蛋白的水平;(ii)判定试验油棕榈植物果 实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间是否 有差异;和(iii)基于该差异,预测检测的油棕榈植物油产量。
如在获得高产油棕榈植物的方法中所用的上述蛋白也用在预测试验油棕榈植物 油油产量的方法中。
除了对试验油棕榈植物代替对亲本油棕榈植物测定果实中果皮组织中蛋白的水 平,测定试验油棕榈植物油果实的中果皮组织中蛋白的水平也可如上文所述相似地进行, 例如,基于双向荧光差异凝胶电泳、抗体类检测、免疫印迹检测或斑点印迹检测,和/或对 多于一种的上述蛋白进行。
判定试验油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的 中果皮组织中蛋白的水平间是否有差异的步骤也可如上文所述进行,例如基于试验油棕榈 植物油的中果皮蛋白的水平比参照油棕榈植物的中果皮蛋白的水平高(或者低),例如大 于1.1倍、1. 25倍、1. 5倍、2倍、4倍或更多倍,具有例如< O. 025、<0. 05或< O.1的p值。 而且,上述差异可基于对每个具体蛋白的上述任一具体差异,例如,在一些实施方式中,试 验油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋 白的水平间的差异是授粉后11至13周试验油棕榈植物果实的中果皮组织中5-甲基四氢 蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平高于授粉后11至13周参照油棕榈植物 果实的中果皮组织中5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平。此 外,可对多于一种蛋白水平测定其差异。
预测步骤例如,可基于试验油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油 棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平间的差异量,和/或基于蛋白表达水平和产量间的相关性来进行。预测步骤也可基于例如与多于一种蛋白相关的差异来进行。
获得高产油棕榈植物的试剂盒
如上文所述,本申请还提供了一种用于获得高产油棕榈植物的试剂盒。该试剂盒 包括(i)用于检测蛋白的抗体,和(ii)参照油棕榈植物果实的中果皮组织的提取物。如用 于获得高产油棕榈植物的方法中的上述蛋白也用在获得高产油棕榈植物的试剂盒中。同样 如上所述,上述蛋白的抗体可通过本领域熟知的方法制备或从商业厂商获得。
在一些实施方式中,上述试剂盒进一步包括说明抗体用法的操作指南,用于判定 亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组 织提取物中蛋白的水平之间是否有差异。测定是否有这种差异的步骤也可如上文所述地进 行。在一些实施方式中,试剂盒还进一步包括说明基于所述差异选择所述亲本油棕榈植物 后代以获得高产油棕榈植物的操作指南。选择亲本油棕榈植物的后代的步骤也可如上文所 述地进行。此外,在一些实施方式中,该试剂盒还进一步包括用于检测至少另一种蛋白的至 少另一种抗体。
以下实施例用于说明的目的,并不是要限制权利要求的范围。
实施例1
双向差异凝胶电泳和蛋白鉴定
MM
目标包括鉴定包括高产性状和低产性状的和在果实发育过程中在油棕榈中果皮 组织中差异表达的蛋白。
Tffe
筛选群体
使用两个油棕榈植物筛选群体,高产筛选群体和低产筛选群体,每个包括3个单 独的棕榈植物。上述筛选群体来自Serdang Avenue dura (至少75 %的Serdang Avenue dura)和 AVROS pisifera (至少 75% 的 AVROS pisifera)的杂交以产生 tenera 后代。更具 体地,高产筛选群体来自先前已确定能生产相对高产量的棕榈油,具体的每年每公顷超过 10吨棕榈油,从而具有高产表型,也称为H表型的油棕榈植物群体。低产筛选群体来自先前 已确定生产相对低产量的棕榈油,具体的每年每公顷低于6吨棕榈油,从而具有低产性状, 也称为h表型的油棕榈植物群体。高产群体和低产群体的产量测定通过可靠的油棕种植者 收集的4年统计数据来定义。对于高产筛选群体,其三个高产棕榈称为H2、H4和H6。对于 低产筛选群体,其三个低产棕榈称为hl、h6和h9。
比较
将3个高产棕榈筛选群体和3个低产棕榈筛选群体的每个在3个时间点取样,即 授粉后12周(时间“a”)、授粉后16周(时间“b”)和授粉后18周(时间“c”),以提供下 列对比
1、高产(12周)对低产(12周)(也称为“Ha对ha”)
2、高产(16周)对低产(16周)(也称为“Hb对hb”)
3、高产(18周)对低产(18周)(也称为“He对he”)
4、高产(12周)对高产(16周)(也称为“Ha对Hb”)
5、高产(12周)对高产(18周)(也称为“Ha对He”)
6、低产(12周)对低产(16周)(也称为“ha对hb”)
7、低产(12周)对低产(18周)(也称为“ha对he”)
具体地,中果皮组织在每个时间点从每个棕榈的幼果获得。作为参照,虽然胚乳中油的沉积在授粉后大约12周开始并在授粉后16周几乎完成,但是中果皮中油的沉积在授粉后大约15周开始并持续到授粉后约20周直至果实成熟。选择授粉后12周、16周和18 周时间点是因为授粉后12周标志着胚乳中油的沉积但是先于中果皮中油的沉积的开始, 授粉后16周标志着授粉后跟随油的生物合成启动中果皮中最高的转录水平,授粉后18周标志着转录水平将预期随着果实成熟下降。
蛋白样品的制备
根据He 等,7Forestry Studies in China 20, 20-23 (2005)的改进的蛋白提取方法,在授粉后12周、16周和18周从来自三个高产棕榈植物的每一个和三个低产棕榈植物的每一个的油棕榈幼果中提取中果皮总蛋白的样品。这些蛋白样品在2-D细胞溶解缓冲液(30mM Tris-HCl, pH 8. 8,包含7M尿素、2M硫脲和4 % CHAPS)中再次悬浮。混合物在 4°C超声波降解,然后室温摇动30分钟。样品在HOOOrpm离心30分钟,并收集上清液。用 Bio-Rad蛋白检测方法(Bradford,1976)测量上清液部分的蛋白浓度。
内部标准
混合等量的每个样品的蛋白制作内部标准,即在授粉后12周、16周和18周三个时间点的每个时间点来自三个高产棕榈中的每一个和三个低产棕榈中的每一个的中果皮总蛋白样品。该内部标准用于匹配和校准通过不同凝胶的蛋白图案,从而排除凝胶间差异的问题。这种方法能用相关的统计显著性确保定量样品间的差异。样品间蛋白的定量比较基于每个蛋白斑点与它自己凝胶内的内部标准的相对变化做出。
CyDye 标记
对于每个样品,30 μ g蛋白与1. O μ I稀释的CyDye混合,黑暗中在冰上放置30分钟。每个成对比较的样本分别用Cy3和Cy5标记。内部标准用Cy2标记。通过对每个样品加入1. Oy I的IOmM赖氨酸,并将样品于黑暗中在冰上培养另外15分钟来终止标记反应。 然后将该三个标记过的样品混合在一起。将2Χ 2-D样品缓冲液(8Μ尿素、4% CHAPS、20mg/ ml DTT、2%载体两性电解质(pharmalyte)和痕量溴酚蓝)、100 μ I泡涨液和再水化缓冲液 (7Μ尿素,2Μ硫脲,4%CHAPS、20mg/ml DTT、I %载体两性电解质和痕量溴酚蓝)加入上述标记混合物以得到250 μ I的总体积。将样品混合均匀并分离(spun down)。然后样品加到放在条支架中的固定相pH梯度凝胶(“IPG”)条上。
差异凝胶电泳凝胶
设计差异凝胶电泳(“DIGE”)分析凝胶包含合适的样品配对,以便促进在后试验部分的凝胶分析。制备如下总共9个具有样品配对的DIGE凝胶
凝胶1:H2a、hla和内部标准
凝胶2 :H4a、h6a和内部标准
凝胶3 :H6a、h9a和内部标准
凝胶4 :H2b、hlb和内部标准
凝胶5 :H4b、h6b和内部标准
凝胶6 :H6b、h9b和内部标准
凝胶1:H2c、hlc和内部标准
凝胶8 :H4c、h6c和内部标准
凝胶9 :H6c、h9c和内部标准
相应地,凝胶I 3、凝胶4 6和凝胶7 9分别对应于在授粉后12周、16周和 18周的高产棕榈对低产棕榈的比较。
等电点聚焦和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
标记样品加到pH 4 7的IPG条上之后,按照Amersham BioScience, 2-DElectrophoresis !Principles and Methods, pp43_72 (2004)的已知方案,进行等电点聚焦(“ffiF”)。一完成IEF,IPG条就在新配置的平衡缓冲液-l(50mM Tris-HCl.pH 8.8, 包含6M尿素、30%甘油、2% SDS、痕量溴酚蓝和10mg/ml DTT)中培养15分钟,并轻轻摇动。 然后IPG条在新配置的平衡缓冲液-2 (50mM Tris-HCl.pH 8. 8,包含6M尿素、30%甘油、2% SDS、痕量溴酚蓝和45mg/ml DTT)中漂洗10分钟,并轻轻摇动。IPG条在SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(“SDS-PAGE”)凝胶电泳缓冲液中漂洗,然后转移到12%的SDS-PAGE凝胶中。 SDS-PAGE凝胶在15 °C运行直至染料前端跑出凝胶。
图像扫描和数据分析
根据其已知的使用方法,用Typhoon TRIO(Amersham BioSciences)在 SDS-PAGE 后,立即扫描凝胶图像。然后,用Image Quant软件(版本6. O, Amersham BioScience)分 析扫描图像,接着,用DeCyderTM 2D软件版本6. 5 (Amersham BioScience)生物变异分析 (“BVA”)。
2D-DIGE分析凝胶结果
图1 9显示了 2D-DIGE分析凝胶的结果,分别对应于(l)H2a对hla、(2)H4a对 h6a、(3)H6a 对 h9a、(4)H2b 对 hlb、(5)H4b 对 h6b、(6)H6b 对 h9b、(7)H2c 对 hlc、(8) H4c 对h6c和(9) H6c对h9c的比较。
DIGE分析凝胶用于如下凝胶间的BVA分析
i)Hb 对 hb,对应于(H2b、H4b 和 H6b)对(hlb、h6b 和 h9b)
^)他对1^,对应于(H2a、H4a 和 H6a)对(hla、h6a 和 h9a)
iii)Hc 对 hc,对应于(H2c、H4c 和 H6c)对(hlc、h6c 和 h9c)
iv) Ha 对 Hb 对 He,对应于(H2a、H4a 和 H6a)对(H2b、H4b 和 H6b)对(H2c、H4c 和 H6c)
v) ha 对 hb 对 hc,对应于(hla、h6a 和 h9a)对(hlb、h6b 和 h9b)对(hlc、h6c 和 h9c)
基于匹配用作对比的多个凝胶和进行蛋白丰度变化的统计学分析,BVA分析提供蛋白斑点差异表达的精确指示。为了在这个分析中测定统计显著性的目的,由于对于每个凝胶对凝胶比较的小的样本量(η = 3),所以使用P值< O.1。在这个分析中发现的差异性表达的蛋白的数目缩小至表达比例>1. 5倍差异的蛋白。凝胶中相应的蛋白斑点用肉眼交叉检验以确保良好质量/分辨率斑点而没有假的条痕。然后挑选筛选的斑点用于通过质谱分析(“MS”)鉴定。
根据这些方法,由一个或多个上述分析中通过2D-DIGE BVA分析的差异性表达检测到84个蛋白斑点,如图1-9所示,这些蛋白斑点被图住并标号。
通过MALD1-ToF/ToF,将上述84个斑点进一步缩小到61个斑点用于质谱分析鉴定。此处实行的选择标准基于i)在DIGE凝胶上斑点的可见度,ii)蛋白表达差异大于1. 5 倍;和iii)蛋白异形体的出现。在DIGE凝胶上不能清晰可见、具有小于1. 5倍的表达差异或基于其异形体已经被鉴定的冗余的候选斑点不被选择用于做进一步的分析。2D-DIGE预备凝胶
3个预备凝胶用三种CyDye标记运行。因为单个样品不能包含充足的蛋白,因此将来自各个棕榈的总蛋白样品混合以用于鉴定目的。选择用于预备凝胶的样品如下
凝胶1:H4a、h6a和其它Ha/ha的混合物
凝胶2 :H4b、h6b和其它Hb/hb的混合物
凝胶3 :H2c、hlc和其它Hc/hc的混合物
预备凝胶用于所有61个感兴趣的蛋白斑点的斑点挑选。对于每个挑选的斑点,相应的蛋白的身份通过MS鉴定。具体地,对每个蛋白进行MALD1-ToF/ToF,测定其肽段的氨基酸序列,将这些序列与NCBI的非冗余数据库比较,以鉴定最相近的同源蛋白,并根据最相近同源蛋白的身份,对蛋白进行鉴定。
该分析导致鉴定到对应于油棕榈蛋白的45个特异的蛋白鉴定,如表I所示,这些油棕榈蛋白与在油棕榈或其它物种中以前鉴定的蛋白同源;如表2所示,这些蛋白对高产棕榈或低产棕榈和/或在授粉后12周、16周和18周的时间点差异表达;从而这些油棕榈蛋白与油棕榈的高产/低产性状相关。具体地,61个蛋白斑点中,8个没有具可信度的产生的匹配,即8个蛋白中的每一个与在NCBI的非冗余数据库中最相近的同源蛋白间匹配的可信度指数分值低于80%。这8个蛋白斑点没有进一步考虑。另外,8个蛋白斑点产生重复的鉴定,即就其它蛋白斑点而言,这些鉴定是冗余的。这8个 蛋白斑点也没有进一步考虑。 剩余的45个特异蛋白鉴定对应于下列油棕榈蛋白5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶包含序列1、脱落胁迫成熟蛋白包含序列2、肌动蛋白6包含序列3、肌动蛋白E包含序列4、生物素羧化酶前体包含序列5、咖啡酸O-甲基转移酶包含序列6、过氧化氢酶2包含序列7、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白包含序列8、微纤维蛋白类似蛋白包含序列9、黄素氧还蛋白样醌还原酶I包含序列10、果糖二磷酸醛缩酶包含序列11、3_磷酸甘油醛脱氢酶包含序列12、H0825G02. 11的同源蛋白包含序列13、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基包含序列14、LealP包含序列15、甲硫胺酸合成酶蛋白包含序列16、 线粒体过氧化物还原酶包含序列17、0s02g0753300同源蛋白包含序列18、0s05g0482700 同源蛋白包含序列19、0sl2g0163700同源蛋白包含序列20、0SJNBb0085F 13. 17同源蛋白包含序列21、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白包含序列22、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白包含序列23、杨树预测蛋白的同源蛋白包含序列24、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白包含序列25、新生多肽相关的复合物α包含序列26、脯氨酸亚氨基肽酶包含序列27、 蛋白输送体包含序列28、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白包含序列29、 Ran GTP酶结合蛋白包含序列30、叶绿体磷酸丙糖异构酶包含序列31、V型质子ATP酶催化亚基A包含序列32、核糖核酸酶活性A的调节物包含序列33、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白包含序列34、核糖体蛋白LlO包含序列35、短链型脱氢酶包含序列36、温度诱导的脂钙蛋白包含序列37、北美云杉的未知蛋白的同源蛋白包含序列38、17. 6kDa类I小热激蛋白包含序列39、ABCl家族蛋白包含序列40、谷胱甘肽过氧化物酶包含序列41、谷胱甘肽-S-转移酶包含序列42、谷胱甘肽-S-转移酶Θ包含序列43、磷脂酶D包含序列44和 VIER F-Box蛋白2包含序列45。这45个蛋白的序列在图1OA-M中提供。应注意,序列标识号1、3 6、8 12、17 21、24 28、31 33、35 41、43和44对应于全长蛋白的氨基酸序列,如通过测定相应的mRNA转录本的核苷酸序列推导的那样,如同用MS鉴定,氨基酸序列自身通过基于蛋白的各种不连续的肽段的氨基酸序列来鉴定。相反,序列标识号2、 7、13 16、22、23、29、30、34、42和45对应于非全长蛋白序列,即相应的全长蛋白的N端或 C端序列尚未经测定,或者如同用MS测定的上述蛋白的各种不连续的肽段的氨基酸序列。
实施例2
45个独特差异性表达的蛋白的功能
如表I所示,基于预测的分子功能、参与的通路和酶学分类,注释实施例1中鉴定的45个独特差异性表达的蛋白。令人惊讶地,这45个蛋白中,只有3个与脂质代谢功能相关。这三个蛋白是磷脂酶D、生物素羧化酶前体和果糖二磷酸醛缩酶。此外,只有17个被成功地定位到所谓的KEGG通路,即根据KEGG (Kyoto基因和基因组百科全书)通路数据库,通过 http://www. genome, jp/keg/pathway. html (2010 年 11 月最新访问)获得,用于蛋白在碳水化合物、氨基酸、脂质、核苷酸、能量的代谢或次生代谢中起作用的通路。这17个蛋白包括3个上述的脂质代谢蛋白和5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、 咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、3_磷酸甘油醛脱氢酶、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/ 加氧酶的大亚基、甲硫胺酸合成酶蛋白、脯氨酸亚氨基肽酶、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基A、谷胱甘肽过氧化物酶、谷胱甘肽-S-转移酶、谷胱甘肽-S-转移酶Θ和VIER F-Box蛋白2。剩余的28个差异性表达的蛋白已知未参与油的生物合成。这些剩余的蛋白包括脱落胁迫成熟蛋白、 肌动蛋白6、肌动蛋白E、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、H0825G02. 11同源蛋白、LealP、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、 0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、 小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白、北美云杉的未知蛋白的同源蛋白、17. 6kDa类 I小热激蛋白和ABCl家族蛋白。
实施例3
各种45个独特差异件表汰的蛋白的斑点印迹类检测
MM
目标包括证实从实施例1的DIGE试验获得的在高产和低产油棕榈的更大群体中的蛋白前导(lead)。
Tffe
样品使用6个时间点即授粉后12周、14周、16周、18周、20周和22周获得的8 个高产棕榈的中果皮组织和8个低产棕榈的中果皮组织。
抗体如表3所描述,45个独特差异表达蛋白中的27个的抗体通过不同的供应商获得。
蛋白提取(TCA提取)将在-20°C预冷过的TCA提取缓冲液(包含10 %的 TCA(IOg)、0· 007% DTT (70mg)和丙酮(至 100ml),在 _20°C储存)(O. 2g+0. 5ml)加入到细粉形态的中果皮样品中。样品进一步用小型塑料研磨机研磨。将样品混合并充分磨碎。然后,加入另外的Iml缓冲液,样品在_20°C培养I小时。然后样品在4°C以最大速度(13. 2g) 离心分离15分钟。试管放置冰上,并用移液管移除上清液。加入1.8ml体积的洗脱缓冲液 (包含O. 007% DTT(70mg)和丙酮(至100ml),-20°C储存),重新悬浮颗粒,然后用移液管前端碾碎颗粒。样品在_20°C培养I小时。样品再次在4°C以最大速度离心分离15分钟。 移除上清液和洗脱步骤重复总共3次。样品粉末在冰上空气干燥30分钟。干燥的样品粉末在 500 μ I 的裂解 /USB 缓冲液(包含 9Μ 尿素(5. 4g),4% CHAPS (O. 4g) U % DTT (O. lg)、 I %两性电解质(ampholyte) pH 3 10 (250 μ I)、35mM Tris 喊(0. 0424g)和灭菌 MilliQ 水(至10ml),全部通过0.2 μπι孔径的膜过滤,并在-20°C储存)中再次悬浮。样品在37°C 培养I小时并持续摇动。样品在室温以最大速度离心分离15分钟。将上清液移入干净的试管,并在-80°C储存。颗粒在-80°C作为备份储存,用于进一步的使用。为进一步从颗粒中洗提蛋白,添加另外500 μ I的裂解/USB缓冲液,然后室温摇动培养颗粒I小时,备份上清液移入干净的离心管,最终在_80°C储存。
蛋白定量(Braford测试法)制备相当于蛋白备料(stock) 5倍稀释的样品用于定量。BSA备料的浓度是1.4 μ g/μ I。使用2倍连续稀释的6个点构造标准曲线。获得的样品浓度范围从O. 244 μ g/ μ I (最低)至2. 934 μ g/ μ I (最高)。已经测定蛋白备料的浓度后,通过将用于斑点印迹的PBS缓冲液(+10%甘油)用到膜上,制备最终浓度为O. 2 μ g/ μ I的可用备料(working stock) (330 μ I)。斑点印迹筛选
使用386针复制器的斑点印迹检测对于每个印迹,将硝化纤维切成2. 95英寸Χ4. 6英寸,并贴在单孔板上。一个板与膜在另一个空板上层叠,然后将压印导板 (stamping guide)层叠在这两块板上面。蛋白样品以两种浓度O. 20 μ g/μ I和O. 02 μ g/ μΚ οχ稀 释)制备。复制器浸入386孔板并且涡旋。提起复制器,并且将导销插入压印导板上的导向槽中。然后,压印斑点并吹干。当膜完全干时,压印步骤重复总共5个循环(由于复制器针释放0. 2 μ I样品,相当于每个斑点上压印0. 20 μ g或0. 02 μ g蛋白),每次涂布后将膜吹干。然后使膜风干过夜。膜从板上移除并切成适当大小(cut down to size)。 将膜加入原保护纸(original protective paper)之间保存,并存储在干燥环境的气密容器中直至使用。
筛选准备将单个上述膜夹在载玻片上,每个载玻片上两个膜,膜背面向内。将夹住的膜浸入充满低温的0.1 % PBS-T (pH 7.4)的容器中,并在磁力搅拌器上用约速度7搅拌 40分钟。然后用低温的0. 05% PBS-T替换0.1 % PBS-T,并持续洗涤15分钟。用新的低温 0. 05% PBS-T替换上述0. 05% PBS-T,持续搅拌7分钟,然后重复以上替换和搅拌步骤。
抗体培养将上述膜放置于干净的大小合适的培养容器中,并移除膜下面汇集的任何气泡。将Iml体积的PBS-T 0. 05%用移液管移到空白膜上,并使Iml抗体稀释于相应膜上的PBS-T 0.05%中。震动膜以确保膜的整个表面被覆盖。在用薄膜包裹以保持湿度之前用湿的c折纸(c-fold towel)覆盖上述容器。然后根据各个抗体的最佳条件,将前述膜在Belly Dancer实验室振荡器上4°C培养过夜或在室温培养2 3个小时。保留用过的浆液用于进一步的实验或将其弃于瓶中用于高压灭菌。将上述膜夹到载玻片上。前述膜在低温的O. 05% PBS-T中洗涤15分钟,然后在新的O. 05% PBS-T中洗涤两次,每次7分钟。将所得膜再放回干净的培养容器中以确保膜下面没有气泡汇集。将Iml体积的稀释于O. 05% PBS-T中的二抗加到每个膜。对于有背景信号的二抗,在室温下边摇动边用1%的BSA进行预吸附40分钟。容器以上述相似的方式覆盖,并在Belly Dancer实验室振荡器上在室温下培养2. 5个小时。弃去二抗,然后,重复上述洗涤步骤15分钟、7分钟和7分钟,每一循环用新的低温的O. 05% PBS-T0
显色(development)和记录将膜再放回培养容器中,确保膜下面没有气泡汇集, 并弹去膜上任何剩余的0.05% 83-1'。根据厂商指南用碱性磷酸酶(AP)缓冲液(100ml Tris[pH9. O]、150mM NaCl 和 ImM MgC12)制备新的 NBT/BCIP。将1. 5ml 体积的 NBT/BCIP 缓冲液加到每个膜上,然后在Belly Dancer实验室振荡器上培养直至阳性对照的紫色很好地显色(约30 45分钟)。通过在水中漂洗和浸泡膜终止反应。显色后的(developed) 膜用HP纸张扫描仪通过HP Director软件扫描(同时膜保持湿润),且产生的图像以TIFF 的格式保存。设定如下(a)高·亮:255 ; (b)阴影50 ; (c)中间色调2. 00 ; (d)锐化中等; (e)分辨率:150 ;和(f)白度:240。扫描的图像进一步用Adobe Photoshop CS84扩展版和 Olympus Micro软件加工以自动捕获和转化斑点密度为Microsoft Excel的电子数据表。 斑点-印迹免疫测定生成的数据用Mann Whitney统计测试分析。
MM.
如表4所示,斑点-印迹免疫测定的结果显示测定的27个蛋白中的11个表达的显著差异。具体地,在授粉后12周检测的中果皮中,发现蛋白咖啡酸O-甲基转移酶、叶绿体磷酸丙糖异构酶、ABCl家族蛋白、新生多肽相关的复合物α、谷胱甘肽过氧化物酶和果糖二磷酸醛缩酶差异性表达。在授粉后14周检测的中果皮中,发现新生多肽相关的复合物 α和核糖体蛋白LlO在高产棕榈和低产棕榈间差异性表达。在授粉后16周检测的中果皮中,发现叶绿体磷酸丙糖异构酶差异性表达。在授粉后20周检测的中果皮中,发现谷胱甘肽-S-转移酶Θ和小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白在高产植物和低产植物的中果皮中差异性表达。在授粉后22周检测的中果皮中,核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶蛋白的大亚基和17. 6kDa类I小热激蛋白在高产棕榈和低产棕榈间差异性表达。
工业应用
文中公开的方法和试剂盒用于获得高产油棕榈植物和预测试验油棕榈植物的油产,从而用于改善棕榈油的商业生产。
权利要求
1.一种获得高产油棕榈植物的方法,包括(i)测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平,其中所述蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖_1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、 甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V 型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白构成的组;( )判定所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平之间是否有差异;和(iii)基于所述差异,选择所述亲本油棕榈植物的后代以获得高产油棕榈植物。
2.如权利要求1所述的方法,其中,所述5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶包含序列1,所述脱落胁迫成熟蛋白包含序列2,所述肌动蛋白6包含序列3,所述肌动蛋白E包含序列4,所述生物素羧化酶前体包含序列5,所述咖啡酸O-甲基转移酶包含序列6,所述过氧化氢酶2包含序列7,所述保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白包含序列8, 所述微纤维蛋白类似蛋白包含序列9,所述黄素氧还蛋白样醌还原酶I包含序列10,所述果糖二磷酸醛缩酶包含序列11,所述3-磷酸甘油醛脱氢酶包含序列12,所述H0825G02. 11的同源蛋白包含序列13,所述核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基包含序列14,所述LealP包含序列15,所述甲硫胺酸合成酶蛋白包含序列16,所述线粒体过氧化物还原酶包含序列17,所述0s02g0753300同源蛋白包含序列18,所述0s05g0482700同源蛋白包含序列19,所述0sl2g0163700同源蛋白包含序列20,所述0SJNBb0085F13. 17同源蛋白包含序列21,所述绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白包含序列22,所述小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白包含序列23,所述杨树预测蛋白的同源蛋白包含序列24,所述葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白包含序列25,所述新生多肽相关的复合物α包含序列26,所述脯氨酸亚氨基肽酶包含序列27,所述蛋白输送体包含序列28,所述水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白包含序列29,所述Ran GTP酶结合蛋白包含序列30,所述叶绿体磷酸丙糖异构酶包含序列31,所述V型质子ATP酶催化亚基A包含序列32,所述核糖核酸酶活性A 的调节物包含序列33,所述逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白包含序列34,所述核糖体蛋白LlO包含序列35,所述短链型脱氢酶包含序列36,所述温度诱导的脂钙蛋白包含序列 37,和所述北美云杉的未知蛋白的同源蛋白包含序列38。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶水平。
4.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述脱落胁迫成熟蛋白的水平高于授粉后15至19周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述脱落胁迫成熟蛋白水平。
5.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述肌动蛋白6的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述肌动蛋白6水平。
6.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述肌动蛋白E的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述肌动蛋白E的水平。
7.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述生物素羧化酶前体的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述生物素羧化酶的前体水平。
8.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述咖啡酸O-甲基转移酶的水平低于授粉后11至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述咖啡酸O-甲基转移酶水平。
9.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述过氧化氢酶2的水平高于授粉后11至19周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述过氧化氢酶2水平。
10.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述蓖麻的保守假定蛋白的同源蛋白的水平。
11.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述微纤维蛋白类似蛋白的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述微纤维蛋白类似蛋白的水平。
12.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平低于授粉后11至19周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述黄素氧还蛋白样醌还原酶I的水平。
13.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述果糖二磷酸醛缩酶的水平高于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述果糖二磷酸醛缩酶的水平。
14.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述3-磷酸甘油醛脱氢酶的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述3-磷酸甘油醛脱氢酶的水平。
15.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述H0825G02. 11同源蛋白的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述H0825G02. 11同源蛋白的水平。
16.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后17至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基的水平高于授粉后17至19周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶 /加氧酶的大亚基的水平。
17.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述LealP的水平高于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述LealP的水平。
18.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述甲硫胺酸合成酶蛋白的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述甲硫胺酸合成酶蛋白的水平。
19.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述线粒体过氧化物还原酶的水平高于授粉后11至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述线粒体过氧化物还原酶的水平。
20.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0s02g0753300同源蛋白的水平高于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0s02g0753300同源蛋白的水平。
21.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0s05g0482700同源蛋白的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0s05g0482700同源蛋白的水平。
22.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0sl2g0163700同源蛋白的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0sl2g0163700同源蛋白的水平。
23.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0SJNBb0085F13. 17同源蛋白的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述0SJNBb0085F13. 17同源蛋白的水平。
24.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后15至 17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述绿藻CCE9901的预测蛋白的同源蛋白的水平。
25.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后11至 13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白的水平。
26.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述杨树预测蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后11至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述杨树预测蛋白的同源蛋白的水平。
27.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白的水平高于授粉后11至 13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白的水平。
28.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述新生多肽相关的复合物α的水平高于授粉后11至19周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述新生多肽相关的复合物α的水平。
29.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述脯氨酸亚氨基肽酶的水平高于授粉后15至19周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述脯氨酸亚氨基肽酶的水平。
30.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述蛋白输送体的水平低于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述蛋白输送体的水平。
31.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白的水平。
32.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织所述Ran GTP酶结合蛋白的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述Ran GTP酶结合蛋白的水平。
33.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述叶绿体磷酸丙糖异构酶的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述叶绿体磷酸丙糖异构酶的水平。
34.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述V型质子ATP酶催化亚基A的水平低于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述V型质子ATP酶催化亚基A的水平。
35.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述核糖核酸酶活性A的调节物的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述核糖核酸酶活性A的调节物的水平。
36.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述逆转录因子Pol多聚蛋白样同源蛋白的水平低于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白的水平。
37.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后11至13周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述核糖体蛋白LlO的水平低于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述核糖体蛋白LlO的水平。
38.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至19周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述短链型脱氢酶的水平高于授粉后11至13周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述短链型脱氢酶的水平。
39.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述温度诱导的脂钙蛋白的水平高于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述温度诱导的脂钙蛋白的水平。
40.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异是授粉后15至17周所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述北美云杉的未知蛋白的同源蛋白的水平高于授粉后15至17周所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述北美云杉的未知蛋白的同源蛋白的水平。
41.如权利要求1或2所述的方法,进一步包括(i)测定所述亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中的至少另一种蛋白的水平;( )判定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述另一种蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述另一种蛋白的水平之间是否有差异;和(iii)也基于与所述另一种蛋白水平的差异,选择所述亲本油棕榈植物的后代以获得高产油棕榈植物。
42.如权利要求1或2所述的方法,其中所述差异通过选自由双向荧光差异凝胶电泳、 基于抗体的检测、免疫印迹检测和斑点印迹检测构成的组中的技术测 定。
43.如权利要求1至42中任一项所述的方法,其中所述亲本油棕榈植物是dura育种原种植物;所述后代包括选自由dura育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组中的油棕榈植物;和所述高产油棕榈植物选自由dura育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组。
44.如权利要求1至42中任一项所述的方法,其中所述亲本油棕榈植物是tenera育种原种植物;所述后代包括一种选自由tenera育种原种植物、pisifera育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组中的油棕榈植物;且所述高产油棕榈植物选自由tenera育种原种植物和tenera农业生产植物构成的组。
45.一种从高产油棕榈植物获得棕榈油的方法,包括(i)用权利要求1至44中任一项所述的方法获得高产油棕榈植物;( )从所述高产油棕榈植物的果实分离棕榈油。
46.一种预测试验油棕榈植物油产量的方法,包括(i)测定试验油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平,其中所述蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶的前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、 3_磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖_1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP、甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、 0s05g0482700 同源蛋白、0sl2g0163700 同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17 同源蛋白、绿藻 CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子 pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白组成的组;( )判定所述检测的油棕榈植物果实的中果皮组织中所述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述个蛋白的水平之间是否有差异;和(iii)基于所述差异,预测所述试验油棕榈植物的油产量。
47.权利要求46所述的方法,其中,所述5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶包含序列1,所述脱落胁迫成熟蛋白包含序列2,所述肌动蛋白6包含序列3,所述肌动蛋白E包含序列4,所述生物素羧化酶前体包含序列5,所述咖啡酸O-甲基转移酶包含序列6,所述过氧化氢酶2包含序列7,所述保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白包含序列8,所述微纤维蛋白类似蛋白包含序列9,所述黄素氧还蛋白样醌还原酶I包含序列10,所述果糖二磷酸醛缩酶包含序列11,所述3-磷酸甘油醛脱氢酶包含序列12,所述H0825G02. 11的同源蛋白包含序列13,所述核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基包含序列14,所述LealP包含序列15,所述甲硫胺酸合成酶蛋白包含序列16,所述线粒体过氧化物还原酶包含序列17,所述0s02g0753300同源蛋白包含序列18,所述0s05g0482700同源蛋白包含序列19,所述0sl2g0163700同源蛋白包含序列20,所述0SJNBb0085F13. 17的同源蛋白包含序列21,所述绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白包含序列22,所述小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白包含序列23,所述杨树预测蛋白的同源蛋白包含序列24,所述葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白包含序列25,所述新生多肽相关的复合物α包含序列26,所述脯氨酸亚氨基肽酶包含序列27,所述蛋白输送体包含序列28,所述水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白包含序列29,所述Ran GTP酶结合蛋白包含序列30,所述叶绿体磷酸丙糖异构酶包含序列31,所述V型质子ATP酶催化亚基A包含序列32,所述核糖核酸酶活性A的调节物包含序列33,所述逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白包含序列34,所述核糖体蛋白LlO包含序列35,所述短链型脱氢酶包含序列36,所述温度诱导的脂钙蛋白包含序列37,和所述北美云杉的未知蛋白的同源蛋白包含序列38。
48.如权利要求46或47所述的方法,进一步包括(i)测定所述试验油棕榈植物果实的中果皮组织中的至少另一种蛋白的水平;( )判定所述试验油棕榈植物的中果皮组织中所述另一种蛋白的水平与所述参照油棕榈植物果实的中果皮组织中所述另一种蛋白的水平之间是否有差异;以及(iii)也基于与所述另一种蛋白水平的所述差异,预测所述试验油棕榈植物的油产量。
49.一种用于获得高产油棕榈植物的试剂盒,包括用于检测蛋白的抗体,所述蛋白选自由5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶、脱落胁迫成熟蛋白、肌动蛋白6、肌动蛋白E、生物素羧化酶前体、咖啡酸O-甲基转移酶、过氧化氢酶2、保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白、微纤维蛋白类似蛋白、黄素氧还蛋白样醌还原酶1、果糖二磷酸醛缩酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、H0825G02. 11同源蛋白、核酮糖-1,5- 二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基、LealP,甲硫胺酸合成酶蛋白、线粒体过氧化物还原酶、0s02g0753300同源蛋白、0s05g0482700同源蛋白、0sl2g0163700同源蛋白、0SJNBb0085F13. 17同源蛋白、绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白、小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白、杨树预测蛋白的同源蛋白、葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白、新生多肽相关的复合物α、脯氨酸亚氨基肽酶、蛋白输送体、水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白、Ran GTP酶结合蛋白、叶绿体磷酸丙糖异构酶、V型质子ATP酶催化亚基Α、核糖核酸酶活性A的调节物、逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白、核糖体蛋白L10、短链型脱氢酶、温度诱导的脂钙蛋白和北美云杉的未知蛋白的同源蛋白构成的组;和参照油棕榈植物果实的中果皮组织的提取物。
50.如权利要求49所述的试剂盒,其中,所述5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸酯-同型半胱氨酸甲基转移酶包含序列1,所述脱落胁迫成熟蛋白包含序列2,所述肌动蛋白6包含序列3,所述肌动蛋白E包含序列4,所述生物素羧化酶前体包含序列5,所述咖啡酸O-甲基转移酶包含序列6,所述过氧化氢酶2包含序列7,所述保守的蓖麻假定蛋白的同源蛋白包含序列8,所述微纤维蛋白类似蛋白包含序列9,所述黄素氧还蛋白样醌还原酶I包含序列10,所述果糖二磷酸醛缩酶包含序列11,所述3-磷酸甘油醛脱氢酶包含序列12,所述 H0825G02. 11的同源蛋白包含序列13,所述核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的大亚基包含序列14,所述LealP包含序列15,所述甲硫胺酸合成酶蛋白包含序列16,所述线粒体过氧化物还原酶包含序列17,所述0s02g0753300同源蛋白包含序列18,所述0s05g0482700 同源蛋白包含序列19,所述0sl2g0163700同源蛋白包含序列20,所述0SJNBb0085F13. 17 同源蛋白包含序列21,所述绿藻CCE9901预测蛋白的同源蛋白包含序列22,所述小立碗藓亚种预测蛋白的同源蛋白包含序列23,所述杨树预测蛋白的同源蛋白包含序列24,所述葡萄假定蛋白异形体I的同源蛋白包含序列25,所述新生多肽相关的复合物α包含序列26, 所述脯氨酸亚氨基肽酶包含序列27,所述蛋白输送体包含序列28,所述水稻粳稻种群推定的NBS-LRR抗病蛋白的同源蛋白包含序列29,所述Ran GTP酶结合蛋白包含序列30,所述叶绿体磷酸丙糖异构酶包含序列31,所述V型质子ATP酶催化亚基A包含序列32,所述核糖核酸酶活性A的调节物包含序列33,所述逆转录因子pol多聚蛋白样同源蛋白包含序列 34,所述核糖体蛋白LlO包含序列35,所述短链型脱氢酶包含序列36,所述温度诱导的脂钙蛋白包含序列37,和所述北美云杉的未知蛋白的同源蛋白包含序列38。
51.如权利要求49或50所述的试剂盒,其中所述试剂盒进一步包括说明抗体用法的操作指南,用于判定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中所述蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织提取物中所述蛋白的水平之间是否有差异。
52.如权利要求51所述的试剂盒,其中,所述试剂盒进一步包括说明基于所述差异选择所述亲本油棕榈植物后代以获得高产油棕榈植物的操作指南。
53.如权利要求49或50所述的试剂盒,进一步包括用于检测至少另一种蛋白的至少另一种抗体。
全文摘要
本发明提供了获得高产油棕榈植物的方法,所述方法包括测定亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平,测定该亲本油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平与参照油棕榈植物果实的中果皮组织中蛋白的水平之间是否有差异,和基于该差异选择亲本油棕榈植物的后代以获得高产油棕榈植物。本发明还提供了预测试验油棕榈植物油产量的方法和用于获得高产油棕榈植物的试剂盒。
文档编号C11B1/00GK102998456SQ20121011913
公开日2013年3月27日 申请日期2012年4月20日 优先权日2011年9月13日
发明者托尼·黄英强, 伦纳德·丹妮拉·杰弗里·戴姆, 叶万晋, 恩波泽雅, 李方晋, 伊努尔·马斯尼·彼特·欧斯曼, 哈瑞科萨那·欧·库拉瓦森格玛, 穆赫达·纳齐尔·巴斯瑞, 穆海密·穆罕默德 申请人:森达美马来西亚有限公司
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