序列测定系统的制作方法

文档序号:11311268阅读:159来源:国知局
序列测定系统的制造方法与工艺

本实用新型涉及序列测定技术领域,尤其涉及一种序列测定系统。



背景技术:

序列测定,即测序,包括核酸序列的测定。目前市面上的测序平台包括一代测序平台、二代测序平台和三代测序平台。

利用基于生化反应进行序列测序的平台在序列测定的过程中,需要在反应装置上进行生化反应,例如需要利用液路系统将不同的试剂一起或先后引入到芯片上进行反应。目前,为使平台中的液路系统紧凑高效,液路系统均采用第一阀来切换输入/输出试剂。

目前市售的第一阀,由于其结构特点,在不同试剂切换时均不可避免的出现不同程度的试剂交叉或混入,即试剂交叉污染。试剂交叉污染会影响反应的进行,特别是对于那些反应本身所需的试剂量很小的反应,比如单分子测序,试剂的交叉污染是致命的。

因此,如何降低或者避免液路中的试剂交叉污染,成为待解决的问题。



技术实现要素:

本实用新型实施方式旨在至少解决相关技术中存在的技术问题之一或者至少提供一种有用的商业选择。基于以下对第一阀的结构的拆分研究发现以及设想,发明人作出本实用新型。

目前市面上的第一阀,也称为进样阀、多位阀、旋转阀或回转阀,作为样品采集、液体进样或流路转换等的部件。其组成一般包括定子和转子,通过定子和转子的紧密结合,能够形成有效密封。

第一阀具有公共口,公共口为不同流路液体进或出都会经过的端口,公共口设在定子和/或转子上,定子和/或转子上具有一个或多个其它端口。通过转子的旋转,能够实现转子与定子通路的连接,从而连通了公共口与其他端口,以达到选择进样或分流的功能。第一阀的一般构型/标准构型为多通选择型,即在运行过程中,仅有一个端口与公共口连通。

公共口和其它端口的连通,一般需要通过设置在转子上的一个或几个公共结构来连通。当该公共结构中有液体时,由于转子的旋转、转子和定子连接的密封界面的相对活动,不可避免地公共结构中的至少一部分液体会被带到公共结构之外的地方,即流路转换时,会不可避免的使下一流路液体中带有上一流路的液体,而后续若反方向流路转换,又会使混有上一流路液体的下一流路液体被带到下下流路的液体中;如此,即使微量混入,产生的交叉污染难以控制、影响难以预估。

发明人在对比分析手动结果以及上机测定的结果时,反复试验及查看装置系统的各个部件关联、以及基于以上对第一阀的结构的拆分研究,确定以上的、由于流路转换时公共结构中的至少一部分液体掺入到下一流路即下一反应过程,即试剂的交叉污染,对序列测定结果产生不利的难以预料的影响。为此,本实用新型实施方式提供一种序列测定系统。

本实用新型实施方式的一种序列测定系统,对序列测定反应进行控制,所述序列测定反应包括第一生化反应,所述第一生化反应采用第一试剂在反应装置上进行。所述序列测定系统包括控制装置和流体装置,所述控制装置连接所述流体装置,所述流体装置包括阀体组件和驱动组件。所述阀体组件包括第一阀和第二阀,所述第一阀和所述反应装置连接,所述第一阀包括可连通的定子和转子,所述第一阀具有公共口,所述定子上具有多个端口,所述转子上具有连通槽,通过转动所述转子可以使所述公共口和至少一个所述端口通过所述连通槽连通,所述多个端口包括第一端口,所述第二阀可直接连接所述第一端口、所述第一试剂和/或第一缓冲液。

上述序列测定系统中,可在旋转转子前,使第一缓冲液流入第一阀,使得连通槽中的液体在旋转转子前被第一缓冲液替代,或者说,在第一阀的转子旋转之前,利用对目标序列测定反应无影响的第一缓冲液代替了连通槽中的第一试剂,避免了在转子旋转过程中连通槽中原有的试剂被带到定子和转子的连接界面的其它位置,进而回避了切换不同试剂时交叉污染的风险。

本实用新型实施方式的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出,部分将从下面的描述中变得明显,或通过本实用新型实施方式的实践了解到。

附图说明

本实用新型实施方式的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施方式的描述中将变得明显和容易理解,其中:

图1是本实用新型实施方式的序列测定系统的功能模块示意图;

图2是本实用新型实施方式的对序列测定反应进行控制的方法的流程示意图;

图3是本实用新型实施方式的序列测定系统的结构示意图;

图4是本实用新型实施方式的第一阀的端口、连通槽和公共口的关系示意图;

图5是本实用新型实施方式的阀体组件的结构示意图;

图6是本实用新型实施方式的测试平台的结构示意图;

图7是本实用新型实施方式的测试平台所得到的一组测试数据的示意图;

图8是本实用新型实施方式的测试平台所得到的另一组测试数据的示意图;

图9是本实用新型实施方式的测试平台所得到的不同的测试数据的对比示意图;

图10是本实用新型实施方式的对序列测定反应进行控制的方法的另一流程示意图。

具体实施方式

下面详细描述本实用新型的实施方式,所述实施方式的示例在附图中示出,其中自始至终相同或类似的标号表示相同或类似的元件或具有相同或类似功能的元件。下面通过参考附图描述的实施方式是示例性的,仅用于解释本实用新型,而不能理解为对本实用新型的限制。

在本实用新型的描述中,需要理解的是,术语“第一”、“第二”仅用于描述目的,而不能理解为指示或暗示相对重要性或者隐含指明所指示的技术特征的数量。由此,限定有“第一”、“第二”的特征可以明示或者隐含地包括一个或者更多个所述特征。在本实用新型的描述中,“多个”的含义是两个或两个以上,除非另有明确具体的限定。

在本实用新型的描述中,需要说明的是,除非另有明确的规定和限定,“连接”应做广义理解,例如,可以是固定连接,也可以是可拆卸连接,或一体地连接;可以是机械连接,也可以是电连接或可以相互通信;可以是直接相连,也可以通过中间媒介间接相连,可以是两个元件内部的连通或两个元件的相互作用关系。对于本领域的普通技术人员而言,可以根据具体情况理解上述术语在本实用新型中的具体含义。

下文的公开提供了许多不同的实施方式或例子用来实现本实用新型的不同结构。为了简化本实用新型的公开,下文中对特定例子的部件和设定进行描述。此外,本实用新型可以在不同例子中重复参考数字和/或参考字母,这种重复是为了简化和清楚的目的,其本身不指示所讨论各种实施方式和/或设定之间的关系。

本实用新型实施方式所称的“序列测定”同核酸序列测定,包括DNA测序和/或RNA测序,包括长片段测序和/或短片段测序。所称的“序列测定反应”同测序反应。一般地,在核酸序列的测定中,通过一轮测序反应能够测定一个碱基或者一个特定类型的碱基,所称碱基选自A、T、C、G和U中的至少一种。在边合成边测序和/或边连接边测序的测序反应中,所称的一轮测序反应包括延伸反应(碱基延伸)、信息收集(拍照/图像采集)和基团切除(cleave)。所称的“核苷酸类似物”即底物,也称为终止子(terminator),为A、T、C、G和/或U的类似物,能够遵循碱基互补原则与特定类型的碱基配对、同时能够终止下一个核苷酸/底物结合到模板链上。

请参图1至图3,本实用新型实施方式提供一种序列测定系统300,对序列测定反应进行控制,序列测定反应包括第一生化反应,第一生化反应采用第一试剂11在反应装置40上进行。

序列测定系统300包括流体装置100,流体装置100包括阀体组件10和驱动组件50。

阀体组件10包括第一阀20和第二阀30,第一阀20和反应装置40连接,第一阀20包括可连通的定子和转子,第一阀20具有公共口,定子上具有多个端口,转子上具有连通槽21,通过旋转转子可以使公共口和至少一个端口通过连通槽21连通,多个端口包括第一端口22,第二阀30可直接连接第一端口22、第一试剂11和/或第一缓冲液60。

上述序列测定系统中,可在旋转转子前,使第一缓冲液60流入第一阀20,使得连通槽21中的液体在旋转转子前被第一缓冲液60替代,或者说,在第一阀20的转子旋转之前,利用对目标序列测定反应无影响的第一缓冲液60代替了连通槽21中的第一试剂11,避免了在转子旋转过程中连通槽21中原有的试剂被带到定子和转子的连接界面的其它位置,进而回避了切换不同试剂时交叉污染的风险。

具体地,由于第一端口22连接有第二阀30,使得第一试剂11和第一缓冲液60可选择地经第二阀30进入第一端口22,因此,在旋转转子前,可使第一缓冲液60代替了连通槽21中的第一试剂11,进而达到预期效果。例如,序列测定系统可按以下步骤进行输液:

S11,使第一端口22通过连通槽21和公共口连通;

S12,使第二阀30连通第一试剂11和第一端口22;

S13,利用驱动组件50使第一试剂11依次经第二阀30和第一阀20进入反应装置40,以进行第一生化反应;

S14,在旋转转子之前,使第二阀30连通第一缓冲液60和第一端口22;

S15,利用驱动组件50使第一缓冲液依次流经第二阀30和第一阀20。

在某些实施方式中,序列测定系统300包括控制装置302,控制装置302连接阀体组件10和驱动组件50,控制装置302用于控制阀体组件10和驱动组件50的运行。

具体地,控制装置302可控制第一阀20的转子的旋转,和第二阀30的开启和关闭,及控制驱动组件50使第一试剂11和第一缓冲液60进入第二阀30和第一阀20。

在某些实施方式中,反应装置40可为芯片,反应装置40承载有样品。请结合图3,反应装置40包括第一单元41和第二单元42,每个单元均包括多条通道(channel),可分别在第一单元41的通道和第二单元42的通道进行不同类型的序列测定反应,第一单元41的通道内的序列测定反应与第二单元42通道内的序列测定反应是错开的、不同步的、相互不影响的。例如,在需要对第一单元41上的样品进行生化反应时,流体装置100会向第一单元41输送反应用的试剂,此时,不会使相同试剂进入第二单元42,反之亦然。

在本实用新型实施方式中,请参图3,每个单元对应连接有一个第一阀20。具体地,第一阀20的公共口连通对应的单元,使得从第一阀20的公共口输出的试剂能够进入对应的单元进行生化反应。如此,可加快序列测定的进程。

在某些实施方式中,在进行序列测定反应前,反应装置40的第一单元41和第二单元42的通道的表面上已固定有待序列测定的样品,待序列测定的样品例如是具有双链或单链结构的DNA链。

第一试剂11与第二阀30之间、第一缓冲液60与第二阀30之间、端口与第二阀30之间、第二阀30与第一阀20之间和/或第一阀20与反应装置40之间可通过软管连接及连通,如此,软管可使液路的配置更灵活。

在某些实施方式中,第一阀20可为多通阀。在某些实施方式中,第二阀30可为三通阀,例如三通电磁阀,三通电磁阀的常闭口和常开口分别连接着需要加入的试剂和缓冲液。在某些实施方式中,第一阀20可为旋转阀,如此,对序列测定反应进行控制的序列测定系统300的应用范围广。

在本实用新型实施方式中,“直接连接”指的是,第二阀30与第一端口22之间、第二阀30与第一试剂11之间、第二阀30与第一缓冲液60之间通过管路连接,第二阀30与第一端口22之间、第二阀30与第一试剂11之间、第二阀30与第一缓冲液60之间没有其它阀或者中间组件。

在某些实施方式中,公共口开设在定子上,多个端口围绕公共口设置,且公共口与连通槽21的一端对应连通。在另一些实施方式中,公共口开设在转子上,且位于连通槽21的一端。

在本实用新型实施方式中,步骤S11在步骤S12之前实施,在其它实施方式中,步骤S12可在步骤S11之前实施,或步骤S11与步骤S12可同时实施。

所称的缓冲液为能一定程度维持液体pH在特定范围的溶液,为弱酸、弱碱和/或中性溶液。在某些实施方式中,第一缓冲液为不影响第一生化反应和/或序列测定反应的其它生化反应的溶液。

一般地,第一阀20的密封基本是靠定子和转子之间的端面密封,在旋转转子时,连通槽21内的剂液会在定子和转子之间的密封面有残留。如图4所示,在进行第一生化反应时,第一试剂11经作为第一端口22的端口1、连通槽21和公共口0进入反应装置40。而在需要进行其它生化反应时,在连通槽21内的第一试剂11没清洗时,当旋转转子从端口1转到端口2时,连通槽21内的第一试剂11会残留在端口1和端口2之间的区域上(如图4中的三角形区域),这些残留的第一试剂11会随着转子的旋转而污染经其它端口进入的其它试剂。所以,请参图3和图5,在定子的端口外连接有三通阀,在旋转转子前,使三通阀连通第一缓冲液11和第一端口22,和利用驱动组件50使第一缓冲液60依次流经第二阀和第一阀20,进而对连通槽21内残留的第一试剂11进行清洗,极大地改善了交叉污染的情况。可以理解,本实用新型示例中,第二阀30可包括三通阀V1-V8的一个或多个。第一端口22可包括端口1-8中的一个或多个。

以下以测试来说明改善前后的交叉污染性能。在这个测试中,第一阀20以旋转阀为例进行说明。

首先,选取市场上现有的两款旋转阀,并搭建测试平台如图6所示,利用测试平台评估两款旋转阀(下称旋转阀A1和旋转阀B1)的交叉污染性能。请结合图5,选择紧邻的端口1,2和8作为测试,端口1连接着荧光试剂1,端口2和端口8均是缓冲液,反应装置flow cell有两条平行的通道A和B,测试操作细节如下:

(1)选择反应装置flow cell的通道A,利用驱动组件50使荧光试剂1流过通道A,然后顺时针旋转转子,以切换端口,使连通槽21连通端口2和公共口0,利用驱动组件50使过量的缓冲液经端口2进入旋转阀,保证旋转阀包括公共口0和连通槽21在内的液路内的荧光试剂1全部清洗干净;

(2)将液路切换到反应装置flow cell的通道B,先使用单分子荧光检测系统拍下通道B的背景,统计荧光点数n1;然后逆时针旋转转子,使连通槽21切换连通到端口8,即端口8和公共口0连通,利用驱动组件50使一定量的缓冲液经端口8进入旋转阀并流到反应装置flow cell的通道B,使用单分子荧光检测系统拍摄通道B同样的区域,统计荧光点数n2;

(3)由于经端口2和端口8进入旋转阀的是缓冲液,无荧光点,因此n2-n1即可视为旋转阀从端口1切换到端口2(顺时针)再切换到端口8(逆时针)的过程中引起的交叉污染,n2-n1即荧光点数的增加一定是荧光试剂1混合到经端口8进入的缓冲液中而被检测到的荧光点数,因此该数值可以评估旋转阀切换时的交叉污染严重程度。

图7所示是8组测试的原始数据,可以看到,无论是旋转阀A1还是旋转阀B1,都无法避免试剂的交叉污染,由于该污染发生在旋转转子时,因此通入荧光试剂1后,即使连通槽21切换到端口2进行旋转阀清洗后再切换到端口8,也始终无法避免荧光试剂1混合到经端口8进入的缓冲液而产生污染,因此,普通的清洗流程也无法彻底解决问题。需要说明的是,图7中,在同一个测试组别所示的柱状图中,左边的柱状图表示旋转前n1的数据,右边的柱状图表示旋转后n2的数据。

本实用新型实施方式中,在旋转转子前,使第二阀30连通第一缓冲液60和第一端口22,及利用驱动组件50使第一缓冲液60依次流经第二阀30和第一阀20,可改善上述交叉污染情况。具体地,请参图5,以第二阀30为三通电磁阀为例进行说明。三通电磁阀的常闭口和常开口分别连接着需要加入的试剂和缓冲液,举例说明,电磁阀V1上电(此时端口1连通试剂1),当试剂1被驱动组件50引入旋转阀之后,立马关闭电磁阀V1(此时端口1连通缓冲液),利用驱动组件50使小量的缓冲液(依据管路情况确定具体的量)清洗掉的连通槽21内残留有的试剂1,这样清洗之后,再旋转转子切换不同端口时已经不会再有试剂1残留在旋转阀的端面上,虽然残留的是缓冲液,但缓冲液对生化反应无影响,此序列测定系统300可以大大降低或者说避免了由于旋转阀旋转引起的试剂交叉污染。

同样地,使用单分子荧光检测系统,评估改善后的交叉污染情况,原始数据如图8所示。改善前后的n2-n1的比较如图9所示。由图9所知,可以看出,相比于之前的旋转阀A1和B1,本实用新型实施方式的序列测定系统300使得旋转阀的交叉污染得到非常明显的改善,本实用新型实施方式的序列测定系统300从源头上杜绝试剂交叉污染,非常适合应用在对微量交叉污染非常敏感的场合,比如单分子基因测序仪系统。需要说明的是,图8中,在同一个测试编号所示的柱状图中,左边的柱状图表示旋转前n1的数据,右边的柱状图表示旋转后n2的数据。图9中,在同一个测试组别所示的柱状图中,左边的柱状图表示改善后的n2-n1的数据,中间的柱状图表示改善前旋转阀A1的n2-n1的数据,右边的柱状图表示改善前旋转阀B1的n2-n1的数据。

在某些实施方式中,请参图10,序列测定反应包括第二生化反应,第二生化反应采用第二试剂12在反应装置40上进行,阀体组件10包括第三阀31,多个端口包括第二端口23,第三阀31可直接连接第二端口23、第二试剂12和/或第二缓冲液。

如此,本实用新型实施方式的序列测定系统可应用于在序列测定反应中需进行多个不同类型的生化反应,扩大了本实用新型实施方式的序列测定系统的应用范围。

具体地,本实施方式的序列测定系统可按以下步骤进行输液:

S16,旋转转子使连通槽21连通第二端口23和公共口;

S17,使第三阀31连通第二试剂12和第二端口23;

S18,利用驱动组件50使第二试剂12依次经第三阀31和第一阀20进入反应装置40,以进行第二生化反应;

S19,在旋转转子之前,使第三阀31连通第二缓冲液和第二端口23;

S20,利用驱动组件50使第二缓冲液依次流经第三阀31和第一阀20。

具体地,在本实用新型示例中,请结合图5,第二端口23可包括端口1-8中的一个或多个,第三阀31可包括三通阀V1-V8中的一个或多个。需要指出的是,第二阀30和第三阀31应选择三通阀V1-V8中的不同阀。第一端口22和第二端口23应选择端口1-8中的不同端口。

需要说明的是,第二缓冲液为不影响第一生化反应的溶液,第一缓冲液60为不影响第二生化反应的溶液。在本实用新型实施方式中,“直接连接”可参照以上实施方式的解释。

在本实用新型图3的示例中,第二缓冲液和第一缓冲液60为同一缓冲液。当然,第二缓冲液和第一缓冲液也可选择为不同的缓冲液。在一个例子中,第一缓冲液和第二缓冲液为同一种缓冲液,为“150mM HEPES、150mM NaCl、pH=7.0”的缓冲液,对序列测定反应不影响。

在某些实施方式中,第一阀20的定子的其中一个端口70可与外界空气连通,以方便引入空气对管路进行除剂液。

在本实用新型实施方式中,步骤S16在步骤S17之前实施,在其它实施方式中,步骤S17可在步骤S16之前实施,或步骤S16与步骤S17可同时实施。

在某些实施方式中,第一生化反应包括延伸反应。

具体地,延伸反应是基于碱基互补、将特定底物连接到待序列测定的样品上,以及利用底物上带有的可检测基团来测定结合上的底物的类型,以测定序列。在一个例子中,可检测基团包括荧光基团,会在特定波长的激光下发出荧光。

在本实用新型实施方式中,所称的第一试剂为终止子试剂,即反应底物,包括A、T、C和G碱基类似物,具体地,所称的碱基类似物即终止子的结构为A/T/C/G-终止基团-连接单元-发光基团,即,所称的第一试剂为包含A-终止基团-连接单元-发光基团的试剂(下称A试剂)、包含T-终止基团-连接单元-发光基团的试剂(下称T试剂)、包含C-终止基团-连接单元-发光基团的试剂(下称C试剂)和/或包含G-终止基团-连接单元-发光基团的试剂(下称G试剂)。其中的终止基团为光和/或化学可断裂基团,通过连接单元(linker)使底物带有发光基团。

在一个具体例子中,四种终止子所带的发光基团是一样的结构或者被激发时发出一样颜色的可检测光,四种碱基类似物分别盛放在不同的试剂瓶中。序列测定时,依次加入A、T、C和G终止子中的一种,每四种终止子反应称为一个循环。盛放不同终止子的试剂瓶通过三通阀、第一阀与反应装置连接。

以下结合图5来说明本实用新型的一个例子中,上述试剂的添加过程。

在图5中,试剂1为A试剂,试剂2为T试剂,试剂3为C试剂,试剂4为G试剂。在进行延伸反应时,三通阀V1上电,三通阀V2-V8关闭,端口1连通A试剂,连通槽21连通端口1和公共口0,驱动组件50使A试剂经三通阀V1和第一阀20进入反应装置40内进行反应,在旋转转子前,三通阀V1关闭,端口1连通缓冲液,驱动组件50使缓冲液流经三通阀V1和第一阀20。在后续需更换添加的T试剂、C试剂、G试剂和/或其它试剂时,旋转转子使连通槽21连通公共口0和对应的端口即可,并按照上述的过程进行。

在某些实施方式中,第二生化反应包括基团切除。

具体地,添加不同结构的终止子到反应装置40内时,需将上一结构的终止子上的发光基团切除后再添加另一结构的终止子。例如,请结合上述例子,在添加完A试剂到反应装置40内时,可利用发光装置(如激光器)发出激发光至反应装置40,以激发发光基团发出荧光,并利用成像装置拍照以采集荧光,并形成图像以进行序列测定。拍照完成后,需将A试剂的发光基团切除后再添加其它试剂。进一步地,在该例子中,试剂5为切除用的试剂(下称切除试剂)。因此,在某些实施方式中,序列测定系统300包括成像装置102,成像装置102用于对所述序列测定反应进行拍照。

拍照完成后,当添加切除试剂时,旋转转子,使连通槽21连通端口5和公共口0,三通阀V5上电,三通阀V1-V4和V6-V8关闭,端口5连通切除试剂,驱动组件50使切除试剂经三通阀V5和第一阀20进入反应装置40内进行切除反应,在旋转转子前,三通阀V5关闭,端口5连通缓冲液,驱动组件50使缓冲液流经三通阀V5和第一阀20。

在某些实施方式中,延伸反应利用连接酶和/或聚合酶进行。

在某些实施方式中,第二生化反应包括加帽。

具体地,所称的加帽主要为保护基团切除后暴露出来的基团/键。在一个例子中,第一生化反应包括延伸反应,第二生化反应包括基团切除,通过光和/或化学切除可断裂基团后,暴露出来的基团为巯基,通过加帽如通过加入烷基化试剂,能够保护巯基不被氧化。

请结合上述例子,进一步地,在该例子中,试剂6为加帽所添加的试剂(下称加帽试剂)。当添加加帽试剂时,旋转转子,使连通槽21连通端口6和公共口0,三通阀V6上电,三通阀V1-V5和V7-V8关闭,端口6连通加帽试剂,驱动组件50使加帽试剂经三通阀V6和第一阀20进入反应装置40内进行加帽反应,在旋转转子前,三通阀V6关闭,端口6连通缓冲液,驱动组件50使缓冲液流经三通阀V6和第一阀20。

需要指出的是,在某些实施方式中,第一试剂可包括对序列测定中的生化反应没影响的试剂,此时,在该试剂经第二阀和第一阀20进入反应装置40后,并在旋转转子前,并不需要用冲液或缓冲液流经第二阀和第一阀20,如此,可节省序列测定反应的时间。

在某些实施方式中,驱动组件50包括泵,泵通过反应装置40连通公共口。

如此,使用泵可实现对试剂和缓冲液的驱动,序列测定系统300的控制较简单。

具体地,在本实用新型示例中,泵包括第一泵51和第二泵52,第一泵51通过第一单元41连通其中一个第一阀20的公共口,第二泵52通过第二单元42连通另一个第一阀20的公共口,利用第一泵51使第一试剂和第一缓冲液依次经第二阀30和第一阀20进入第一单元41,利用第二泵52使第一试剂和第一缓冲液依次经第二阀30和第一阀20进入第二单元42。

如此,利用第一泵51和第二泵52可分别实现将第一阀20输出的剂液输入至第一单元41和/或第二单元42,方便操作。

具体地,第一泵51和第二泵52分别管道连接第一单元41和第二单元42,例如,通过软管连接。

第一泵51通过第一单元41连通其中一个第一阀20的公共口,第二泵52通过第二单元42连通另外一个第一阀20的公共口,工作时,第一泵51向第一单元41提供负压,以使第一单元41获取第一试剂和/或与第一阀20的端口连接的其它剂(包括缓冲液和/或其它试剂)进行生化反应和/或清洗,在第一单元41获取完剂液后,第一泵51停止提供负压。

第一泵51使什么剂液进入第一单元41,取决于:1)连通槽21连通哪个端口;和2)对于与连通槽21连通的那个端口(下称连通端口),与连通端口连接的三通阀使连通端口与哪种剂液连通。例如,请结合图5,连通槽21连通端口1,与端口1连接的三通阀V1使端口1与试剂1连通,则第一泵51提供负压时,试剂1经三通阀V1和第一阀20进入第一单元41。

类似地,第二泵52的运行可参第一泵51的运行。

进一步地,在某些实施方式中,驱动组件50还包括第四阀53、第五阀54和废液瓶55。第四阀53管道连接于第一泵51和第一单元41之间,同时还管道连接废液瓶55。第五阀54管道连接于第二泵52和第二单元42之间,同时还管道连接废液瓶55。

第一泵51经第四阀53连通第一单元41或废液瓶55,从而第一泵51抽取第一单元41内已经完成序列测定反应的废液后,可以向废液瓶55注射废液,从而使得第一泵51进行下一次向第一单元41提供负压,以进行序列测定反应。第五阀54与第四53结构相同设置,在此不再赘述。在一些例子中,第四阀53和第五阀54均可为三通阀。

在某些实施方式中,流体装置100包括控制单元,控制单元电连接阀体组件10和驱动组件50以控制阀体组件10和驱动组件50运行。

如此,可实现阀体组件10和驱动组件50的自动化控制,进而提高效率。

具体地,在本实用新型示例中,控制单元电连接第一阀20、第二阀30、第三阀31和驱动组件50,以控制第一阀20、第二阀30、第三阀31和驱动组件50运行。控制单元可以是包括单片机、计算机处理器、或中央控制处理器等装置,利用控制单元控制第一阀20、三通阀V1-V8和驱动组件运行,实现流体装置100自动运行,提高效率。

在某些实施方式中,当序列测定系统300包括控制装置302时,控制单元可接收控制装置302的控制信号,并根据控制信号对阀体组件10、驱动组件50和流体装置100的其它部件进行控制。如此,这样能够将控制装置302的部分功能由控制单元来执行实现,减少了控制装置302的载荷。在某些实施方式中,控制单元和控制装置302可集成在一个部件、模块或装置中,以提高序列测定系统300的集成度,降低成本。

在某些实施方式中,请结合图3和图5,多个端口分布呈圆形,公共口与圆形同心设置。

如此,呈圆形分布的多个端口和公共口与圆形同心设置保证了旋转转子时连通槽21与对应的端口和公共口连通的准确性。

在某些实施方式中,请结合图3和图5,连通槽21呈线形。如此,可减少剂液在连通槽21内流动路径,进而实现保证快速测序。

具体地,呈线形的连通槽21,能够以较短的路径连通位于连通槽21两端的端口和公共口。在本实用新型示例中,线形为直线形。

请参图1,本实用新型实施方式提供一种对序列测定反应进行控制的装置302,装置302包括:

存储装置304,用于存储数据,数据包括计算机可执行程序;

处理器306,用于执行计算机可执行程序,执行计算机可执行程序包括完成上述任一实施方式的方法。

本实用新型实施方式的一种计算机可读存储介质,用于存储供计算机执行的程序,执行程序包括完成上述任一实施方式的方法。计算机可读存储介质可以包括:只读存储器、随机存储器、磁盘或光盘等。

在本说明书的描述中,参考术语“一个实施方式”、“某些实施方式”、“示意性实施方式”、“示例”、“具体示例”、或“一些示例”等的描述意指结合所述实施方式或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本实用新型的至少一个实施方式或示例中。在本说明书中,对上述术语的示意性表述不一定指的是相同的实施方式或示例。而且,描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任何的一个或多个实施方式或示例中以合适的方式结合。

在流程图中表示或在此以其他方式描述的逻辑和/或步骤,例如,可以被认为是用于实现逻辑功能的可执行指令的定序列表,可以具体实现在任何计算机可读存储介质中,以供指令执行系统、装置或设备(如基于计算机的系统、包括处理器的系统或其他可以从指令执行系统、装置或设备取指令并执行指令的系统)使用,或结合这些指令执行系统、装置或设备而使用。就本说明书而言,"计算机可读存储介质"可以是任何可以包含、存储、通信、传播或传输程序以供指令执行系统、装置或设备或结合这些指令执行系统、装置或设备而使用的装置。

应当理解,本实用新型的各部分可以用硬件、软件、固件或它们的组合来实现。在上述实施方式中,多个步骤或方法可以用存储在存储器中且由合适的指令执行系统执行的软件或固件来实现。例如,如果用硬件来实现,和在另一实施方式中一样,可用本领域公知的下列技术中的任一项或他们的组合来实现:具有用于对数据信号实现逻辑功能的逻辑门电路的离散逻辑电路,具有合适的组合逻辑门电路的专用集成电路,可编程门阵列(PGA),现场可编程门阵列(FPGA)或其它电路结构等。

此外,在本实用新型各个实施方式中的各功能单元可以集成在一个处理模块中,也可以是各个单元单独物理存在,也可以两个或两个以上单元集成在一个模块中。上述集成的模块既可以采用硬件的形式实现,也可以采用软件功能模块的形式实现。所述集成的模块如果以软件功能模块的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,也可以存储在一个计算机可读取存储介质中。

尽管上面已经示出和描述了本实用新型的实施方式,可以理解的是,上述实施方式是示例性的,不能理解为对本实用新型的限制,本领域的普通技术人员在本实用新型的范围内可以对上述实施方式进行变化、修改、替换和变型。

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