一种L-氨基酸脱氨酶的突变体及其制备方法与应用与流程

文档序号:15626482发布日期:2018-10-09 23:06阅读:261来源:国知局

本发明涉及一种l-氨基酸脱氨酶的突变体及其制备方法与应用,属于基因工程领域。



背景技术:

l-氨基酸脱氨酶是一种能够催化l-氨基酸生成α-酮酸的氧化还原酶。一直以来,有着大量对其研究与报道,大多数关于该酶的三维结构、底物特异性。近年来,有关利用该酶生物转化生产α-酮酸逐渐引起研究人员的注意,拥有着广泛的应用前景。由于该酶定位在细胞膜当中,酶与细胞膜上的电子传递链相关,在转化l-氨基酸生成α-酮酸的过程中,电子经过电子传递链传递给细胞色素氧化酶,使分子氧还原为水,过程不产生过氧化氢,有利于转化保持在一个温和的环境下持续进行,这为异源表达氨基酸脱氨酶转化l-亮氨酸生产α-酮异己酸提供了可能。

然而目前利用该酶转化生产α-酮异己酸的产量和转化率都较低,还不能够达到工业化生产的要求,因需要进一步提高α-酮异己酸的产量和转化率。先前有关研究团队开发的一种rbs优化提高α-酮异己酸产量的方法,虽然能够提高α-酮异己酸的产量,但转化率太低(刘龙,陈坚,堵国成,李江华,宋阳.一种rbs优化提高α-酮异己酸产量的方法.申请号201510575189.1)。因此,为提高α-酮异己酸的产量和转化率,增强其工业应用价值,急需提高l-氨基酸脱氨酶对l-亮氨酸的催化效率。



技术实现要素:

本发明要解决的第一个技术问题是提供一种l-氨基酸脱氨酶的突变体,含有seqidno.1所示的氨基酸序列。

本发明的第二个目的是提供一种编码所述l-氨基酸脱氨酶的突变体的基因。

在本发明的一种实施方式中,所述基因含有seqidno.2所示的核苷酸序列。

本发明的第三个目的是提供一种提高l-氨基酸脱氨酶对l-亮氨酸的催化效率的方法,所述方法是将奇异变形杆菌(proteusmirabilis)来源的l-氨基酸脱氨酶的第436位的氨基酸苏氨酸thr突变成丙氨酸ala。

在本发明的一种实施方式中,所述奇异变形杆菌(proteusmirabilis)来源的l-氨基酸脱氨酶的genbank登录号为aaa8675,含有474个氨基酸。

本发明的第四个目的是提供一种构建所述突变体的方法,是在奇异变形杆菌(proteusmirabilis)l-氨基酸脱氨酶同源建模的基础上,通过结构分析确定突变位点;设计定点突变的突变引物,以携带l-氨基酸脱氨酶基因的pet20b载体为模板进行定点突变构建突变质粒t436a-pet20b,将突变后的质粒转化大肠杆菌bl21(de3)细胞,挑选验证后得到阳性单克隆t436a。

本发明的第五个目的是提供一种提高α-酮异己酸产量的方法,是利用所述的l-氨基酸脱氨酶突变体菌株作为全细胞催化剂,转化含l-亮氨酸的底物得到α-酮异己酸。

本发明的一种实施方式中,将含有20~25g/l全细胞、100~120g/l底物的体系在30~35℃反应18~22h生成α-酮异己酸。

在本发明的一种实施方式中,所述转化在20mm的tris缓冲液中进行。

本发明的一种实施方式中,所突变体菌株全细胞的按如下方式收集获得:将种子培养液按照2%的接种量接种到发酵培养基中,37℃培养至od600为0.6-0.8,添加终浓度为0.4mm的iptg,25℃诱导12h,收集细胞。

本发明的一种实施方式中,用于培养菌株的种子培养基每升含有:蛋白胨10g,酵母粉5g,氯化钠10g,蒸馏水定容。

本发明的一种实施方式中,用于发酵的发酵培养基每升含有:蛋白胨12g,酵母提取物24g,甘油4ml,磷酸二氢钾2.31g,磷酸氢二钾16.42g。

本发明还要求保护所述突变体在发酵生产中的应用。

本发明的有益效果:本发明提供了一种具有高效催化l-亮氨酸生产α-酮异己酸的l-氨基酸脱氨酶突变体及其制备办法与应用。突变体t436a对l-亮氨酸的催化效率比原l-氨基酸脱氨酶提高了72.7%,α-酮异己酸的产量达到106.2g/l,底物摩尔转化率为97.7%。本转化方法较化学法相比,具有反应条件温和,目标产物单一,易于分离,对环境友好等优势,且工艺简单,便于控制,易于推广应用。

附图说明

图1奇异变形杆菌(proteusmirabilis)l-氨基酸脱氨酶突变体纯化sds-page电泳图;泳道1:标准分子量蛋白;泳道2:空白对照;泳道3:t436a纯化制品。

图2奇异变形杆菌(proteusmirabilis)l-氨基酸脱氨酶突变体催化生成α-酮异己酸产量。□:出发酶wt;■:突变体t436a。

具体实施方式

lb培养基:蛋白胨10g,酵母粉5g,氯化钠10g,蒸馏水定容到1l。

发酵培养基:(tb培养基):蛋白胨12g,酵母提取物24g,甘油4ml,磷酸二氢钾2.31g,磷酸氢二钾16.42g,蒸馏水定容到1l。

样品制备:取1ml转化后的转化溶液,在12,000rpm下离心5min,取上清液稀释后,经过0.45μm滤膜过滤,过滤液供液相色谱分析。

α-酮异己酸的含量测定:戴安高效液相色谱仪(配紫外可见检测器),采用伯乐aminexhpx-87h(300×7.8mm,9μm)色谱柱,流动相为浓度2.5mmol/l的稀硫酸,流动相经0.22μm滤膜过滤,超声脱气,流速为0.6ml/min,柱温为40℃,在紫外检测波长205nm下检测。

实施例1奇异变形杆菌(proteusmirabilis)l-氨基酸脱氨酶突变体的制备方法

以连接有奇异变形杆菌l-氨基酸脱氨酶编码基因pma(基因序列seqidno.3所示)的pet20b质粒(简写为pma-pet20b)为模板,利用t436a的突变引物通过一次pcr得到大小为1422bp左右的产物,将pcr产物通过dpnⅰ处理后转化大肠杆菌jm109感受态细胞,挑选转化子测序验证。

突变引物如下所示(方框为突变位点):t436a突变引物对:

上述pcr体系均为:

上述pcr条件均为:

95℃预变性3min,95℃变性3min然后进入以下循环:98℃变性10s,55℃退火5s,72℃延伸1min40s;34个循环;72℃延伸10min,4℃保温。

测序结果表明除了所需要的突变位点外,没有出现随机突变,因此突变质粒t436a-pet20b构建成功。

实施例2:奇异变形杆菌(proteusmirabilis)l-氨基酸脱氨酶突变体的表达纯化方法。

将突变体t436a-pet20b转化至大肠杆菌bl21(de3)细胞,挑选转化子进行测序验证。将验证后的阳性转化子在lb培养基中37℃培养过夜,后接入tb发酵培养基37℃培养至3h左右用终浓度为0.4mm的iptg诱导,降温至25℃培养12h。

收集发酵液,4℃,8000rpm离心20min收集菌体。将收集的细胞在洗涤液中超声,洗涤液组分:500mmnaci,20mmtrisph8.0,0.05%w/vtritonx-100,20mm咪唑。细胞裂解物16,000g离心30min,上清液过0.45μm膜后加到载到用洗涤液预平衡的镍螯合柱上,然后再用20倍柱体积的洗涤液洗涤柱子除去杂质,然后用30ml洗脱液洗脱目标蛋白,洗脱液组分:500mmnaci,20mmtrisph8.0,500mm咪唑。然后再将洗脱后的蛋白用脱盐柱进一步纯化,再用30kda的超滤管离心浓缩,得纯化的l-氨基酸脱氨酶突变体。纯化结果如图1所示,纯化后l-氨基酸突变体达到电泳纯,表观分子量52kda。

实施例3:奇异变形杆菌(proteusmirabilis)l-氨基酸脱氨酶突变体对l-亮氨酸的催化效率

催化反应体系为20ml,包括终浓度为20g/l的重组大肠杆菌全细胞、115g/l底物l-亮氨酸、20mm的tris缓冲液(ph8.0),在200rpm30℃下保温20h后取样经hplc分析。催化效率通过生成产物的量来计算。其结果如图2所示。突变体t436a催化12h后可达到87.5g/l,催化20h后产量可以达到106.2g/l,转化率达到97.7%。

虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。

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<110>江南大学

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