一种改造BZLF1和改造LMP1的融合基因及其应用的制作方法

文档序号:17537937发布日期:2019-04-29 14:11阅读:284来源:国知局
一种改造BZLF1和改造LMP1的融合基因及其应用的制作方法

本发明涉及微生物技术领域,具体说是一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因及其应用。



背景技术:

研究表明,eb病毒(epstein-barrvirus,ebv)的感染与鼻咽癌、胃癌的发生关系密切,即刻早期基因(bzlf1)的表达可诱导病毒从潜伏期进入裂解期,所编码的蛋白是一种转录激活因子,eb病毒感染宿主细胞包括潜伏期和裂解期,在eb病毒阳性肿瘤细胞中,病毒一般处于潜伏期,其潜伏存在及其dna与宿主细胞整合是导致肿瘤细胞发生的重要原因,人工诱导病毒由潜伏期进入裂解期,导致肿瘤细胞裂解死亡,有望成为治疗eb病毒相关肿瘤的新手段和新方法。将bzlf1重组后,感染ebv阳性肿瘤细胞,可以诱导肿瘤细胞中处于潜伏期的eb病毒进入裂解期,并开启病毒复制基质,导致eb病毒阳性肿瘤细胞裂解死亡,达到特异性杀伤肿瘤细胞的作用,但是现有的即刻早期基因(bzlf1)转录频率低,庸余序列多,影响了bzlf1的表达。

潜伏膜蛋白1(latentmembraneproteinl,lmp1)是eb病毒编码的一种癌蛋白,能够组成激活各种信号通路,从而导致细胞生长不受控制,向癌细胞转化和对肿瘤的微环境造成影响,而羧基端功能区是lmp1癌基因的功能区,删除这个区域,lmp1将失去对b细胞转化的能力,对lmp1基因进行改造,去除其在致癌过程中起决定作用的c末端部分氨基酸,使其不再具有致癌性,但是仍然具有良好的免疫原性。

卡介苗(bcg)是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗,具有增强巨噬细胞活性,加强巨噬细胞杀灭肿瘤细胞的能力,活化t淋巴细胞,增强机体细胞免疫的功能,但是目前还未有研究将预防其他癌症的基因与其融合的报道,使卡介苗的功能单一。

如何将去除致癌部分基因、加入增强子的lmp1与去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因融合,并且增强机体的细胞免疫反应,同时发挥lmp1与bzlf1基因诱导潜伏期ebv进入裂解期复制的作用,从而协同杀伤ebv阳性肿瘤细胞是目前亟待解决的问题;此外,将该基因序列在现有疫苗中复制并表达,制备既能够预防、治疗鼻咽癌又具有较高安全性的转化bcg疫苗,达到一次接种预防两种疾病的目的也是我们亟待解决的问题。



技术实现要素:

为解决上述问题,本发明的目的是提供一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因及其应用。

本发明为实现上述目的,通过以下技术方案实现:

一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因,是将去除致癌基因、加入增强子的lmp1与去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因进行融合得到;

改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的基因序列为:

atgatggacccaaactcgacttctgaagatgtaaaatttacacctgacccataccaggtgccttttgtacaagcttttgaccaagctaccagagtctatcaggacctgggagggccatcgcaagctcctttgccttgtgtgctgtggccggtgctgccagagcctctgccacaaggccagctaactgcctatcatgtttcaaccgctccgactgggtcgtggttttctgcccctcagcctgctcctgagaatgcttatcaagcttatgcagcacctcagctgttcccagtctccgacataacccagaatcaacagactaaccaagccgggggagaagcacctcaacctggagacaattctactgttcaaacagcagcagcagtggtgtttgcttgccccggggctaaccaaggacaacagctagcagacattggtgttccacagcctgcaccagtggctgccccggcacgacgcacacggaaaccacaacagccagaatcgctggaggaatgcgattctgaactagaaataaagcgatacaagaatcgggtggcttccagaaaatgccgggccaagtttaagcaactgctgcagcactaccgtgaggtggctgctgccaaatcatctgaaaatgacaggctgcgcctcctgttgaagcagatgtgcccaagcctggatgttgactccattatccgccggacaccagatgttttacacgaggatctcttaaatttctaaatggaacacgacctt

本发明还包括一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的构建方法:包括以下步骤:

①将去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因以上游引物p1和下游引物p2进行扩增,电泳纯化,得到bzlf1*dna片段;

去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因序列为:

atgatggacccaaactcgacttctgaagatgtaaaatttacacctgacccataccaggtgccttttgtacaagcttttgaccaagctaccagagtctatcaggacctgggagggccatcgcaagctcctttgccttgtgtgctgtggccggtgctgccagagcctctgccacaaggccagctaactgcctatcatgtttcaaccgctccgactgggtcgtggttttctgcccctcagcctgctcctgagaatgcttatcaagcttatgcagcacctcagctgttcccagtctccgacataacccagaatcaacagactaaccaagccgggggagaagcacctcaacctggagacaattctactgttcaaacagcagcagcagtggtgtttgcttgccccggggctaaccaaggacaacagctagcagacattggtgttccacagcctgcaccagtggctgccccggcacgacgcacacggaaaccacaacagccagaatcgctggaggaatgcgattctgaactagaaataaagcgatacaagaatcgggtggcttccagaaaatgccgggccaagtttaagcaactgctgcagcactaccgtgaggtggctgctgccaaatcatctgaaaatgacaggctgcgcctcctgttgaagcagatgtgcccaagcctggatgttgactccattatccgccggacaccagatgttttacacgaggatctcttaaatttctaa;

上游引物p1:5′-ggaattcatgatctaatggactgacc-3′;其中gaattc为ecori酶切位点

下游引物p2:5′-gctgccgccaccgccgcttccgccaccgccgcttccaccgccaccgaaatttaagagatcctc-3′;

②将去除致癌基因、加入增强子的lmp1基因以上游引物p3和下游引物p4进行扩增,电泳纯化,得到lmp1*dna片段;

去除致癌基因、加入增强子的lmp1基因序列为:

上游引物p3:5′-ggtggcggtggaagcggcggtggcggaagcggcggtggcggcagcatggaacacgaccttgagagg-3′;

下游引物p4:5′-cgcgtcgacttagtcatagtagcttagctg-3′;其中gtcgac为sal1酶切位点;

③以步骤①所得bzlf1*dna片段和步骤②所得lmp1*dna片段为模板,以上游引物p1和下游引物p4进行重叠延伸pcr,得到融合基因片段;

反应条件:95℃预变性2min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸1.5min共30个循环,最后72℃延伸8min;

④将步骤③所得融合基因片段冷却至20~30℃,加入taq酶、datp,放入pcr仪中在72℃下延伸45分钟,将其顺利与pmvs穿梭质粒连接,产物进行电泳检测后,进行纯化,得到改造bzlf1和改造lmp1的融合基因。

本发明还包括一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗,其特征在于:是由改造bzlf1和改造lmp1的融合基因序列引入pmvs穿梭质粒上,然后与bcg感受态细胞电转复苏后获得。

优选的,包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗,其特征在于:将包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗通过卡那霉素抗性筛选,得到稳定的无卡那霉素抗性的bcg疫苗。

本发明相比现有技术具有以下优点:

本发明将去除致癌基因、加入增强子的lmp1与去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因进行融合,构建的融合基因能够同时发挥lmp1和bzlf1基因诱导潜伏期ebv进入裂解期复制的作用,从而协同杀伤ebv阳性肿瘤细胞;另一方面,本发明将融合基因连接在pmvs穿梭质粒上,并在bcg及其子代中复制和表达,得到了既能预防鼻咽癌发生又具有较高安全性的转化bcg疫苗;该转化bcg疫苗能够分泌eb病毒lmp1(去除致癌部分)与bzlf1的融合蛋白,有效的激活机体免疫系统,产生特异性抗体和有效的细胞免疫应答,在预防结核病的同时,具有杀伤鼻咽癌细胞,很好的预防治疗肿瘤的作用。

本发明优选的转化bcg疫苗无抗生素抗性,在制备过程中为了能够筛选出成功导入穿梭质粒pmvs卡介苗菌体,而人为的在pmvs质粒载体中加入了卡那霉素抗性,但是疫苗在用于临床治疗和预防鼻咽癌的过程中,人为引进的卡那霉素抗性可能会使疫苗使用者产生卡那霉素耐药性,使用quikchange(agilent,beijing,china)定点突变试剂盒,将卡那霉素抗性位点突变,并通过将结核分枝杆菌菌体在无抗性的米氏培养基中传3代,选择在能在无抗性的米氏培养基上生长,而在卡那霉素抗性培养基上不生长的菌株,得到稳定的无卡那霉素抗性的bcg疫苗,从而避免了患者在治疗过程中出现卡那霉素耐药性。

附图说明

图1为对eb病毒阳性肿瘤的预防作用实验中各组的肿瘤生长趋势示意图;

图2为对eb病毒阳性肿瘤的预防作用实验中各组的肿瘤重量示意图;

图3为对eb病毒阳性肿瘤的预防作用实验中各组的肿瘤大小示意图;

图4为对eb病毒阳性肿瘤的治疗作用实验中各组的肿瘤体积示意图;

图5为对eb病毒阳性肿瘤的治疗作用实验中各组的肿瘤重量示意图。

具体实施方式

以下结合具体实施例来对本发明作进一步的描述。

实施例

一、一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因,是将去除致癌基因、加入增强子的lmp1与去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因进行融合得到;

改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的基因序列为:

atgatggacccaaactcgacttctgaagatgtaaaatttacacctgacccataccaggtgccttttgtacaagcttttgaccaagctaccagagtctatcaggacctgggagggccatcgcaagctcctttgccttgtgtgctgtggccggtgctgccagagcctctgccacaaggccagctaactgcctatcatgtttcaaccgctccgactgggtcgtggttttctgcccctcagcctgctcctgagaatgcttatcaagcttatgcagcacctcagctgttcccagtctccgacataacccagaatcaacagactaaccaagccgggggagaagcacctcaacctggagacaattctactgttcaaacagcagcagcagtggtgtttgcttgccccggggctaaccaaggacaacagctagcagacattggtgttccacagcctgcaccagtggctgccccggcacgacgcacacggaaaccacaacagccagaatcgctggaggaatgcgattctgaactagaaataaagcgatacaagaatcgggtggcttccagaaaatgccgggccaagtttaagcaactgctgcagcactaccgtgaggtggctgctgccaaatcatctgaaaatgacaggctgcgcctcctgttgaagcagatgtgcccaagcctggatgttgactccattatccgccggacaccagatgttttacacgaggatctcttaaatttctaaatggaacacgacctt

二、一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的构建方法,包括以下步骤:

①将去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因以上游引物p1和下游引物p2进行扩增,电泳纯化,得到bzlf1*dna片段;电泳采用1%琼脂糖凝胶;

去除庸余序列、加入增强子的bzlf1基因序列为:

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上游引物p1:5′-ggaattcatgatctaatggactgacc-3′;其中gaattc为ecori酶切位点;

下游引物p2:5′-gctgccgccaccgccgcttccgccaccgccgcttccaccgccaccgaaatttaagagatcctc-3′;

②将去除致癌基因、加入增强子的lmp1基因以上游引物p3和下游引物p4进行扩增,电泳纯化,得到lmp1*dna片段;电泳采用1%琼脂糖凝胶;

去除致癌基因、加入增强子的lmp1基因序列为:

上游引物p3:5′-ggtggcggtggaagcggcggtggcggaagcggcggtggcggcagcatggaacacgaccttgagagg-3′;

下游引物p4:5′-cgcgtcgacttagtcatagtagcttagctg-3′;其中gtcgac为sal1酶切位点;

③以步骤①所得bzlf1*dna片段和步骤②所得lmp1*dna片段为模板,以上游引物p1和下游引物p4进行重叠延伸pcr,得到融合基因片段;

反应条件:95℃预变性2min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸1.5min共30个循环,最后72℃延伸8min;

④将步骤③所得融合基因片段冷却至20~30℃,加入taq酶0.4μl、datp(50mol/l)2μl,放入pcr仪中在72℃下延伸45分钟,将其顺利与pmvs穿梭质粒连接,(pmvs穿梭质粒相当于载体),产物在1%琼脂糖凝胶中进行电泳检测后,进行纯化,纯化采用u-niq-5pcr产物纯化试剂盒(上海生工产品)进行,得到改造bzlf1和改造lmp1的融合基因zlp1。

三、一种包含上述改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗,是由改造bzlf1和改造lmp1的融合基因序列引入pmvs穿梭质粒上,然后与bcg感受态细胞电转复苏后获得,具体步骤包括:

感受态bcg的制备:bcg在middlebrook7h9培养基35℃摇床培养(转速为200rpm),待培养液od600为0.6时将bcg菌液加入离心管中,冰浴2hr,将bcg菌液加入离心管中,在冰盒中预冷2hr,4℃离心,10000rpm×2min,丢弃上清液;用原始体积的0.1,预冷的浓度为10%甘油重悬菌体,重复上述操作6次,弃上清,加入原始体积的0.02的10%甘油重悬菌体,即得到bcg感受态细菌;

取5×106个bcg感受态细菌,然后将纯化的pmvs-zlp1质粒用电穿孔法转化bcg,电穿参数为:0.4cm的电穿孔杯,电压2.5kv电容25μf,电阻1000ω,作用时间11.6毫秒,37℃下培养10小时后取100μl涂布在含50ug/ml卡那霉素的middlebrook7h10固体培养基的离心试管内斜面上,37℃继续培养直至发现克隆;3~4周后挑选阳性克隆,先进行抗酸染色初步鉴定,然后在含60mlmiddlebrook7h9培养基的离心试管里摇床生长。

pmvs-zlp1质粒的构建步骤:

首先,质粒pmv261购自中国质粒载体菌株细胞株基因保藏中心(北京),将合成后的bcg-ag85b信号肽基因克隆到pmv261载体并测序鉴定,信号肽基因及质粒pmv261分别用bamh和ecori双酶切,pmv261载体酶切后加入小牛肠碱性磷酸酶1u,于37℃去磷酸化处理1h,经酚:氯仿(1:1)抽提、无水乙醇沉淀、70%乙醇洗涤,溶于te中。然后加入5μl(等量)的ligationsolutionι,t4dna连接酶1μl,纯水补足至总体积10μl,于16℃进行连接反应30min(或4℃过夜反应),构建重组质粒pmvs;将质粒pmvs用ecori和sali进行双酶切,再将eb病毒融合基因序列zlp1插入至pmvs中,得到重组质粒:pmvs-zlp1;

四、无卡那霉素抗性、包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗的制备

将包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗通过卡那霉素抗性筛选,得到稳定的无卡那霉素抗性的包含融合基因的bcg疫苗,具体的筛选步骤为:

人为引进的卡那霉素抗性可能会使疫苗使用者产生卡那霉素耐药性,使用quikchange(agilent,beijing,china)定点突变试剂盒,将卡那霉素抗性位点突变,并通过将结核分枝杆菌菌体在无抗性的米氏培养基中传3代,选择在能在无抗性的米氏培养基上生长,而在卡那霉素抗性培养基上不生长的菌株,得到稳定的无卡那霉素抗性的bcg疫苗,从而避免了患者在治疗过程中出现卡那霉素耐药性。

五、包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗(以下简称rbcg)对eb病毒阳性肿瘤的预防作用

对实验小鼠c57bl/6(鼠源性瘤)在进行肿瘤接种前30d,连续3次进行疫苗接种,中间间隔10d,免疫时采用右肋腹侧皮下注射的方式进行,设pbs组、bcg组、含空载体pmvs的bcg组、pmvs-zlp1质粒组、含目的基因的rbcg组,每组5只。在最后一次免疫后10天接种肿瘤细胞。在接种肿瘤细胞后40天断颈处死小鼠,手术剥离肿瘤并测定各种数据。肿瘤细胞接种后,观察其生长情况,当可触及时,记成瘤时间,如表1所示;每间隔1天测量其垂直长径及短径,计算其体积,记录其生长趋势,得到图1,肿瘤体积公式为:垂直长径x(垂直短径)2x0.5,第30天(按接种肿瘤起)处死小鼠,称取瘤重,得到图2,各组的肿瘤大小示意图如图3所示。

表1各组免疫小鼠皮下接种肿瘤细胞的成瘤时间

注:*表示与对照组相比,差异显著(p≤0.05)

由图1可以看出,在接种12天时各组的肿瘤细胞开始生长,其中接种14天时肿瘤体积开始不同,在22天时pbs组肿瘤体积最大,依次为pmvs-zlp1质粒组、bcg组、含空载体pmvs的bcg组,肿瘤最小的为rbcg组,并且rbcg组的肿瘤在14天至22天增加的体积不大,可见,本发明的包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗对肿瘤细胞具有很好的预防作用。

由图2和图3可以看出,接种包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗后,eb病毒阳性肿瘤重量和体积均增加较小,可以看出本发明的包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗对肿瘤细胞具有很好的预防作用。

六、包含改造bzlf1和改造lmp1的融合基因的bcg疫苗(以下简称rbcg)对小鼠肿瘤的治疗作用

5组小鼠接种eb病毒阳性肿瘤细胞,分别于接种gt39肿瘤细胞后第9d和15d进行免疫。bcg组、pmvs-zlp1质粒组、含空载体pmvs的bcg组和含目的基因的rbcg组各组在接种后13d,平均肿瘤体积分别为0.38±0.16(cm3)、0.72±0.14(cm3)、0.42±0.11(cm3)和0.21±0.18(cm3),均小于pbs对照组平均瘤体积0.8±0.25(cm3)(p<0.05),如图4所示,在肿瘤细胞接种28天后处死小鼠剥离肿瘤,称量肿瘤的重量,如图5所示,经计算得出rbcg组肿瘤体积和瘤重与pbs对照组相比显著减小(p<0.05),上述研究表明rbcg对eb病毒阳性肿瘤细胞治疗作用显著,bcg组、转空载体bcg组(pmv261+bcg)对肿瘤细胞早期有治疗作用,晚期不明显。

序列表

<110>济宁医学院

<120>一种改造bzlf1和改造lmp1的融合基因及其应用

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<212>dna

<213>人类疱疹病毒4型(humanherpesvirus6)

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