1.一种用于选择多核苷酸的方法,所述方法包括:
i)提供包括多核苷酸的混合物的样品;以及
ii)基于呈球状形式的多核苷酸的大小来选择多核苷酸。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,步骤(i)进一步包括处理所述样品,使得所述样品中的多核苷酸采用球状形式。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中,在步骤(i)中所述样品中的所述多核苷酸最初是非球状形式。
4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,进一步包括:
iii)处理选择的多核苷酸,使得所述选择的多核苷酸采用非球状形式。
5.根据权利要求3或权利要求4所述的方法,其中,所述非球状形式是延伸形式。
6.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述球状形式是其中所述多核苷酸耐剪切的凝聚形式。
7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述选择的多核苷酸比未选择的多核苷酸更长或更短。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,选择多核苷酸包括通过滤器过滤所述样品。
9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述选择的多核苷酸被所述滤器保留并且所述未选择的多核苷酸穿过所述滤器。
10.根据权利要求8所述的方法,其中,所述选择的多核苷酸穿过所述滤器并且所述未选择的多核苷酸被所述滤器保留。
11.根据权利要求8至10中任一项所述的方法,其中,所述滤器是膜滤器。
12.根据权利要求8至11中任一项所述的方法,其中,所述滤器具有的孔径从约0.01μm至约100μm。
13.根据权利要求8至12中任一项所述的方法,其中,所述膜滤器是针筒式滤器。
14.根据权利要求8至13中任一项所述的方法,其中,所述滤器材料包括以下或由以下组成:硝酸纤维素、乙酸纤维素、尼龙、聚醚砜、再生纤维素和/或聚四氟乙烯。
15.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,步骤(i)包括处理所述样品,使得所述样品中的所述多核苷酸采用球状形式,其中所述处理包括使所述样品与凝聚介质接触。
16.根据权利要求15所述的方法,其中,使所述样品与凝聚介质接触不会引起所述样品中的所述多核苷酸沉淀。
17.根据权利要求15或权利要求16所述的方法,其中,所述凝聚介质是包括亲水性聚合物的盐溶液。
18.根据权利要求17所述的方法,其中:
i)所述亲水性聚合物是聚酯或多糖,任选地,其中所述亲水性聚合物是具有的分子量为2000da至12000da的聚乙二醇;和/或
ii)所述盐溶液包括(i)族或(ii)族金属盐,任选地其中所述金属盐是金属卤化物。
19.根据权利要求17或权利要求18所述的方法,其中:
i)所述凝聚介质中的所述聚合物浓度为约10mg/ml至约200mg/ml;和/或
ii)所述凝聚介质中的所述盐浓度为约0.1m至约1m。
20.根据前述权利要求中任一项所述的方法,包括以下作为步骤(iii):处理所述选择的多核苷酸,使得所述选择的多核苷酸采用非球状形式,其中所述处理包括使所述多核苷酸与延伸介质接触。
21.根据权利要求20所述的方法,其中,所述延伸介质中的盐的浓度低于所述凝聚介质中的盐的浓度,以及任选地其中所述延伸介质中的聚合物的浓度低于所述凝聚介质中的聚合物的浓度。
22.根据权利要求20或权利要求21所述的方法,其中选择多核苷酸包括通过滤器过滤所述样品并且其中所述延伸介质通过所述滤器洗脱所述选择的多核苷酸。
23.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述多核苷酸是dna、rna或dna/rna杂合体。
24.根据权利要求23所述的方法,其中,所述多核苷酸是双链dna。
25.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述样品:
a)包括pcr反应的产物;和/或
b)包括dna文库;和/或
c)包括基因组dna;和/或
d)包括内切核酸酶消化的产物。
26.根据前述权利要求中任一项所述的方法,进一步包括将测序衔接子附连至所述选择的多核苷酸。
27.一种根据权利要求26所述的方法,其中将(i)核酸操作酶和/或(ii)膜锚和/或跨膜孔锚附连至所述测序衔接子;并且所述方法任选地进一步包括使所述选择的多核苷酸与所述跨膜孔接触。
28.一种用于表征多核苷酸的方法,所述方法包括:
i)进行根据前述权利要求中任一项所述的方法;
ii)使跨膜孔与所述选择的多核苷酸接触;
iii)施加跨所述跨膜孔的电势差;以及
iv)进行一种或多种测量,这些测量指示相对于所述跨膜孔移动的多核苷酸的一种或多种特征,以及从而表征所述多核苷酸。
29.根据权利要求28所述的方法,其中,所述方法包括当所述多核苷酸相对于所述跨膜孔移动时,测量通过所述跨膜孔的电流。
30.根据权利要求28或权利要求29所述的方法,其中,所述多核苷酸的所述一种或多种特征包括所述多核苷酸的序列。
31.根据权利要求28至30中任一项所述的方法,其中,所述选择的多核苷酸的平均读取长度比初始样品的平均读取长度更长。
32.一种用于分离多核苷酸的试剂盒,包括:
-滤器;其中所述滤器任选地如权利要求11至14中任一项所述;以及
-凝聚介质;其中所述凝聚介质任选地如权利要求17至19中任一项所述;
并且任选地进一步包括
-延伸介质,其中所述延伸介质任选地如权利要求21所述。
33.一种根据权利要求32所述的试剂盒,进一步包括:
-测序衔接子;和/或
-膜锚或跨膜孔锚;和/或
-核酸操作酶;和/或
-用于核酸操作酶的燃料和/或辅因子;和/或
-洗涤溶液,所述洗涤溶液不包括用于核酸操作酶的燃料和/或辅因子。