靶向人类LTβR基因的反义核酸及其应用

文档序号:35152510发布日期:2023-08-18 07:18阅读:52来源:国知局
靶向人类LTβR基因的反义核酸及其应用

本发明涉及反义核酸(asos),尤其涉及靶向人类ltbr基因的反义核酸及其在沉默人类ltβr基因表达或反义调节淋巴毒素β受体表达中的应用,属于靶向人类ltβr基因的反义核酸及其应用领域。


背景技术:

1、肿瘤坏死因子(tnf)超家族分子淋巴毒素α1β2和light是多种感染或非感染性炎症活动的重要驱动因素。在炎症过程中,活化的淋巴细胞表达淋巴毒素α1β2和light,二者与淋巴毒素β受体(ltβr,tnf超家族受体成员之一,在上皮细胞、基质细胞和髓样细胞上表达,在淋巴细胞上不表达)相互作用,激活标准或非标准nf-κb信号通路,诱导趋化因子、细胞因子或粘附分子表达,如ccl2、cxcl8和cxcl13等,招募和激活炎性细胞,活化的炎性细胞分泌il6、il13、tgf-β,诱导一系列炎症和组织重塑。阻断ltβr受体被证明可以减轻炎症活动,同时阻止炎症诱导的各种组织纤维化和癌变,降低组织病变和原发性肿瘤的发生。

2、反义核酸(asos)是分子生物学领域的一种强有力的工具,也是研究广泛的治疗药物。asos通过碱基互补配对触发多种调控机制,例如通过rnase h酶切割asos和靶mrna之间的dna-rna双链中的rna链,从而导致靶mrna的降解,实现高度特异性和选择性的基因表达沉默。为了改善asos的药理学特性,对骨架和2’-核糖进行多种化学修饰。硫代磷酸(ps)修饰提高了asos的核酸酶稳定性、分布和细胞摄取效率;2’-ome和2’-moe修饰可进一步提高核酸酶抗性和结合亲和力,并减少免疫刺激,但会阻止rnase h的识别;gamper是两侧各具有3-6个2’-修饰核苷酸的硫代磷酸反义核酸,该策略不仅具有2’修饰的优势,同时可实现rnase h介导的靶mrna切割。

3、ltβr参与多种疾病的发生和发展过程。light等配体通过结合肺上皮细胞组成性表达的ltβr强烈诱导哮喘和特发性肺纤维化等肺部炎症的发展;同时,标准或非标准nf-κb信号通路参与了各种肝病如代谢性肝病、自身免疫性肝病和病毒性肝炎的发病过程;另外,ltβr水平在人体癌细胞系有所升高,在ltβr炎症介导的肿瘤形成过程、akt/β-连环蛋白和notch细胞通路活动中都起到关键作用。因此,ltβr在多种癌症如肝癌、鼻咽癌、前列腺癌等方面也是非常有潜力的治疗靶点。


技术实现思路

1、本发明的目的之一是提供靶向人类ltβr基因的反义核酸;

2、本发明的目的之二是将所述的靶向人类ltβr基因的反义核酸应用于制备沉默人类ltβr基因表达的药物或制备反义调节淋巴毒素β受体表达的药物或制剂;

3、本发明的上述目的是通过以下技术方案来实现的:

4、本发明首先提供了靶向人类ltβr基因的反义核酸,所述反义核酸的核苷酸序列选自(1)或(2)中的任何一种核苷酸序列

5、(1)seq id no.1-seq id no.40中的任何一种核苷酸序列;

6、(2)与ltβr基因相应靶标序列位置至少85%互补的核苷酸序列;优选的,与ltβr基因相应靶标序列位置至少90%互补的核苷酸序列;更优选的,与ltβr基因相应靶标序列位置至少95%互补的核苷酸序列;最优选的,与ltβr基因相应靶标序列位置100%互补的核苷酸序列。

7、优选的,所述的反义核酸的核苷酸序列选自seq id no.5-seq id no.13、seq idno.15-seq id no.29、seq id no.31-seq id no.37、seq id no.39-seq id no.40中的任何一种,更优选的,所述的反义核酸的核苷酸序列选自seq id no.4-8、seq id no.10-11、seq id no.16、seq id no.24、seq id no.28或seq id no.32中的任何一种,最优选的,所述的反义核酸的核苷酸序列为seq id no.8或seq id no.10。

8、本发明针对人类ltβr转录本1设计出40条长度为20nt的asos,在ltβr mrna水平对这40条asos进行初步筛选;根据ltbr mrna水平的筛选结果可见,除了seq id no.1、seqid no.2、seq id no.3、seq id no.4、seq id no.14、seq id no.30以及seq id no.38对于人类ltbr基因的沉默效率较低以外,其它的33条aso序列对于人类ltbr基因均有较好的沉默效率,其中seq id no.4、seq id no.5、seq id no.6、seq id no.7、seq id no.8、seq idno.10、seq id no.11、seq id no.16、seq id no.24、seq id no.28以及seq id no.32对于人类ltbr基因的沉默效率均较高,尤其是以seq id no.8以及seq id no.10的沉默效率最佳。

9、为了改善该反义核酸(asos)的药理学特性,本发明对这些反义核酸的骨架和2’-核糖进行多种化学修饰,其中,为了提高这些反义核酸的核酸酶稳定性、分布和细胞摄取效率,本发明对这些反义核酸进行了部分或全部硫代磷酸(ps)修饰;为了提高这些反义核酸的核酸酶抗性和结合亲和力并减少免疫刺激,本发明可以对这些反义核酸的核苷进行各种修饰,包括但不限于,骨架修饰:硫代磷酸(ps、ps2)、肽核酸(pnas)、四甲基胍(tmg)、吗啡啉(ppmo)等;糖环修饰:2’-o-甲基(2’-ome)、2’-甲氧乙基(2’-moe)、2’-氟(2’-f)、锁核酸(lna)、限制性乙烷基(cet)、4’-c-乙烯基桥联(ena)、三环dna(tcdna)、zip核酸(zna)等;碱基修饰:5’-r(卤素、甲基、炔基)修饰的u、3’-甲基修饰的u、5’-甲基修饰的c、6’-甲基修饰的a或肌苷等.

10、进一步的,本发明将进行了硫代磷酸(ps)修饰的反义核酸的两侧各进行3-6个2’-修饰核苷酸,不仅具有修饰反义核酸的结合力的优势,同时可实现rnase h介导的靶mrna切割。

11、作为本发明的一种优选的具体实施方案,本发明将seq id no.8或seq id no.10进行了硫代磷酸(ps)修饰分别得到了ps-8或ps-10,将ps-8或ps-10的5’和3’端各6个碱基再进行2’-ome修饰,命名为gapmer-8和gapmer-10,把ps-8和gapmer-8的第8位g突变为a,第10位g突变为c,第12位g突变t,作为错配序列ps-8-mis(seq id no.41)和gapmer-8-mis(seq id no.42)。根据试验结果可见,ps-8、ps-10、gapmer-8和gapmer-10对ltβr基因mrna表达沉默具有明显的时间效应,ps-8、gapmer-8在80nm转染浓度下,随着孵育时间的延长,沉默效果逐渐增强,在24小时达到最大沉默效果。ps-10、gapmer-10起效较快,在转染6小时后即可达到最大沉默效果。;ps-8、gapmer-8和ps-10也具有明显的浓度效应,在孵育48h后,随着转染浓度由20nm提高至40nm、80nm,沉默效果逐渐增强,gapmer-10在此浓度区间无浓度效应。

12、由此,本发明提供的靶向人类ltβr基因的反义核酸能够应用于制备沉默人类ltβr基因表达的药物或者应用于制备反义调节淋巴毒素β受体表达的药物,这些药物能够阻断ltβr受体,可以减轻炎症活动,同时阻止炎症诱导的癌变,降低原发性肿瘤的发生。

13、按照本领域的常规制剂手段,可以将本发明提供的靶向人类ltβr基因的反义核酸制备成相应的沉默人类ltβr基因表达的药物或阻断ltβr受体的临床制剂。

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