技术特征：
1.一种真菌微生物组作为胃癌诊断的标志物的应用，其特征在于，所述真菌微生物组包含cystobasidium,cutaneotrichosporon,apodus,apiotrichum,simplicillium,lecanactis,rhizopus,rhodotorula,exophiala和sarocladium中的任意一种或几种的组合，其中，真菌微生物为真菌中门水平、属水平以及种水平中的一种或以上。2.权利要求1所述的标志物的应用，其特征在于，所述真菌微生物的筛选方法为：通过提取组织中的dna，进行its测序和读数分类学注释，判断胃癌患者与健康对照之间的所述真菌微生物的差异度和/或相似性，得到真菌微生物标志物。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述组织包括胃癌组织、癌旁组织和健康胃组织。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述its测序的过程为：(1)提取组织中的dna；(2)使用its引物进行建库和pcr扩增；(3)使用nanodrop 2000紫外分光光度计和1％的琼脂糖凝胶电泳检测pcr产物的浓度和纯度；(4)利用illumina miseqpe 300测序仪进行测序。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，步骤(2)中的its引物为：上游引物its3f：gcatcgatgaagaacgcagc，下游引物its4r：tcctccgcttattgatatgc。6.根据权利要4所述的应用，其特征在于，所述的读数分类学注释过程为：(1)删除错配、缺失和重复的序列，只允许2个核苷酸错配；(2)使用uparse.7将相似性97％以上的分类单元(otu)聚集为相同otu；(3)使用qiime计算α多样性，包括chao1、物种和pd_whole_tree；(4)使用lefse方法对gc和hc组差异表达的真菌进行分析。7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，使用受试者工作曲线roc分析真菌标志物，分析工具为excel和graphpad 8.0。8.一种用于胃癌诊断的试剂盒，其特征在于，包含能够检测出权利要求1所述的标志物所属真菌的试剂。
技术总结
本发明公开了一种真菌微生物组作为胃癌诊断的标志物的应用，所述的真菌微生物组选自真菌中门水平、属水平以及种水平中的一种或以上。通过对GC组织、癌旁组织和健康(HC)胃组织进行真菌DNA的ITS测序和读数的分类学注释，总共生成450万个有效标签，分成了1631个分类单元(OTUs)，鉴定到了10个门水平和301个属水平的真菌亚群。GC组中Basidiomycota与Ascomycota的比例增加，同时GC中高表达的Cystobasidium,Cutaneotrichosporon,Apodus,Apiotrichum,Simplicillium,Lecanactis,Rhizopus,Rhodotorula,Exophiala,Sarocladium可以作为胃癌诊断的真菌微生物组标志物，并且与胃癌的发生和发展密切相关。并且与胃癌的发生和发展密切相关。并且与胃癌的发生和发展密切相关。
技术研发人员：杨平 李智洋 徐志鹏
受保护的技术使用者：南京鼓楼医院
技术研发日：2022.04.21
技术公布日：2022/7/29