用于进行白血病诊疗的系统的制作方法

文档序号:33762881发布日期:2023-04-18 18:33阅读:46来源:国知局
用于进行白血病诊疗的系统的制作方法

本技术涉及一种疾病诊疗系统。特别是用于进行白血病诊疗的系统。该系统能够根据药物在个体特异性疾病模型中的表现而预测药物对患者的治疗效果,并通过个性化检测来追踪治疗的效果。


背景技术:

1、白血病是一种造血系统恶性增殖性疾病,通常指因白血病细胞大量增殖、累积所引起的一类疾病。由于白血病分型和预后过程的复杂性,为了获得更好的治疗效果,对白血病的精准诊断和相应的治疗势在必行。

2、已有许多证据表明,标准化的化疗对大量患者无效。几乎100%的患者在被确诊患有白血病后都将首先接受标准化的化疗。以儿童白血病为例,标准化疗方案仅第一阶段就包括了使用8种化疗药物,且每种药物的给药时间都有严格规定,总疗程长达1年。化疗的成功是进行其他后续治疗的前提,例如骨髓移植。然而该标准化的化疗方案对至少约25%的白血病患儿无效,其结果便是这一人群高达85%的死亡率。造成这种情况最主要的原因,便是患者的个体差异。而标准化治疗方案无视了这种个体差异,对不同的患者个体提供相同的治疗方案。其结果必然是:无法区分联合化疗中的有效药物和无效药物;因无效化疗药物对患者身体造成巨大伤害;不能了解引起耐药性的机理;对于耐药的患者,临床上采取加大给药剂量、更高强度化疗的方法,潜在增加对患者的伤害;无法提供体现患者个体差异的治疗方案。

3、另一方面,检测癌细胞残留(mrd,minimal residual disease)对评估治疗的效果和预测癌症复发有非常重要的作用。国际上,通常以万分之一为界,超过万分之一的癌细胞残留意味着很大的癌症复发几率。提前检测到癌细胞,意味着准确地把握病情,进行更及时的治疗,从而提高患者存活的机率。

4、目前,检测癌细胞残留的主要手段是采取流式细胞技术,也就是进行细胞水平的检测。细胞水平检测的精度上限仅为万分之一,并且该方法容易受到细胞分化和克隆选择的影响,稳定性不佳。此外,这种方法无法在实际临床检测上快速、稳定、高效地应用,具有很大的局限性。


技术实现思路

1、本技术提供了一种用于进行白血病诊疗的系统。本技术所提供的系统能够快速、可靠、和/或稳定地反映出白血病患者中白血病细胞的存在和/或比例。此外,本技术所提供的系统能够为后续的白血病治疗方案提供可靠的参考。本技术所提供的系统能够用于候选药物筛选。此外,本技术的系统可被用于对受试者进行个性化诊断和治疗。例如,本技术的系统和方法能够通过构建受试者特异性人源化疾病模型及伴随性检测,而为受试者推荐特异性的候选药物和治疗方案。

2、一方面,本技术提供了用于进行白血病诊疗的系统,所述的系统包括:a)建模模块,其用于构建受试者特异性人源化疾病模型,所述受试者为白血病患者;b)至少一个检测模块,其用于检测所述受试者中白血病细胞的存在和/或比例。所述建模模块可包括:a1)样品单元,其包含源自所述受试者的白血病细胞悬浮液,所述悬浮液中白血病细胞的密度为2x107/ml至5x107/ml;a2)辐射单元,其包含放射性处理装置,用于对适当的免疫缺陷型小鼠进行放射性处理;a3)接种单元,其用于将所述白血病细胞悬浮液接种到经所述辐射单元处理的免疫缺陷型小鼠中。所述至少一个检测模块可包括:b1)扩增单元,其包含能够特异性扩增靶标基因的试剂,以获得靶标特异性扩增产物。

3、在某些实施方式中,所述的系统还包括c)候选药物筛选模块。所述候选药物筛选模块可包括第一候选药物组和第二候选药物组;其中所述第一候选药物组包括选自下组的一种或多种药物:长春新碱、地塞米松、左旋天冬酰胺酶、拓扑异构酶抑制剂、嘌呤核苷类衍生物、蛋白酶体抑制剂、mtor抑制剂、达沙替尼、抗体类药物、全反式维甲酸、dna损伤诱导剂、叶酸还原酶抑制剂、去乙酰基抑制剂、多受体酪氨酸激酶抑制剂、细胞毒性药物和维甲酰酚胺。所述第二候选药物组可包括选自下组的一种或多种药物:蛋白激酶抑制剂、细胞凋亡调节剂、dna分解剂、细胞分裂抑制剂、mdm2类致癌基因抑制剂、抗体类药物和其他化疗药物附加剂。

4、在某些实施方式中,所述系统中的所述建模模块还包括a4)分离单元,所述分离单元包含单核细胞分离液,用于离心分离所述受试者的白血病细胞。

5、在某些实施方式中,所述系统中的所述建模模块还包括a5)t细胞去除单元,其用于去除源自非t细胞型白血病受试者的样品中的t细胞,从而得到所述白血病细胞悬浮液。

6、在某些实施方式中,所述单核细胞分离液为ficoll,且所述离心分离为密度梯度离心分离。

7、在某些实施方式中,所述白血病细胞悬浮液中包含rpmi细胞培养基。

8、在某些实施方式中,被去除的所述t细胞为cd3阳性t细胞。在某些实施方式中,所述t细胞去除单元含有包含cd3抗体的磁珠。在某些实施方式中,所述t细胞去除单元还包含高磁场。

9、在某些实施方式中,所述白血病为急性淋巴细胞性白血病,且所述免疫缺陷型小鼠为nsg小鼠。在某些实施方式中,所述白血病为急性髓性白血病,且所述免疫缺陷型小鼠为mistrg小鼠。

10、在某些实施方式中,所述放射性处理装置为x射线辐射装置,且其产生的辐射剂量为200cgy至300cgy。在某些实施方式中,所述放射性处理装置为x射线辐射装置,且其产生的辐射剂量为550cgy至650cgy。

11、在某些实施方式中,所述系统中的所述辐射单元被设置为在预定的接种时间之前的12-24小时内对所述免疫缺陷型小鼠进行所述放射性处理。

12、在某些实施方式中,所述免疫缺陷型小鼠的年龄为5-7周。

13、在某些实施方式中,所述系统中的所述所述建模模块还包括a6)红外照射及加热单元,用于对所述免疫缺陷型小鼠进行红外灯照射及加热。

14、在某些实施方式中,所述系统中的所述建模模块还包括a7)监测单元,用于监测来自所述受试者的白血病细胞在经接种的所述免疫缺陷型小鼠体内的生长情况。在某些实施方式中,所述监测单元包括检测所述小鼠外周血中hucd45+、hucd19+、hucd3+、和/或hucd33+细胞的比例的试剂和装置。

15、在某些实施方式中,所述系统中的所述建模模块还包括a8)脾脏处理单元,该脾脏处理单元包括分离元件、破碎元件及悬浮元件,当经接种的所述小鼠外周血中hucd45+、hucd19+、hucd3+、和/或hucd33+细胞的比例至少为50%时,可通过所述分离元件分离所述小鼠的脾脏,通过所述破碎元件破碎经分离的所述小鼠的脾脏以获得脾脏细胞,并通过所述悬浮元件将所述脾脏细胞制备为所述白血病细胞悬浮液。

16、在某些实施方式中,所述系统中的所述建模模块还包括a9)液氮,用于冷冻储存所述白血病细胞悬浮液。

17、在某些实施方式中,所述候选药物筛选模块还包括监测单元,用于监测来自所述受试者的白血病细胞在经接种的所述免疫缺陷型小鼠体内的生长情况。在某些实施方式中,所述监测单元包括检测所述小鼠外周血中hucd45+、hucd19+、hucd3+、和/或hucd33+细胞的比例的试剂和装置,所述监测单元可被设置为,当该比例达到1%-5%时,提示可向所述小鼠施用候选药物。

18、在某些实施方式中,所述监测单元包括检测所述小鼠外周血中hucd45+、hucd19+、hucd3+、和/或hucd33+细胞的比例的试剂和装置,所述监测单元可被设置为,在药物施用后,持续监测所述hucd45+、hucd19+、hucd3+、和/或hucd33+细胞在所述小鼠外周血细胞中所占比例的变化,并依据该变化提示所述候选药物的效力。

19、在某些实施方式中,所述监测单元被设置为:当施用所述候选药物后,监测到所述hucd45+、hucd19+、hucd3+、和/或hucd33+细胞在所述小鼠外周血细胞中所占比例保持低于1%、并维持该比例至少2周时,则提示所述候选药物为有效。

20、在某些实施方式中,所述第一候选药物组包括选自下组的一种或多种药物:长春新碱、地塞米松、左旋天冬酰胺酶、拓扑替康、氯法拉滨、卡非佐米、替西罗莫司、达沙替尼、硼替佐米、cd19抗体、全反式维甲酸、阿霉素、氨甲叶酸、saha、舒尼替尼、环磷酰胺和维甲酰酚胺。

21、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述蛋白激酶抑制剂包括选自下组的一种或多种药物:azd8055、mln0128、gsk690693、mk-2206、sar245408、rapamycin、mln0128、selumetinib、azd6244、pci-32765、ibrutinib、sgi-1776、dinaciclib、vs-4718、sorafenib、sunitinib和azd1480。

22、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述细胞凋亡调节剂包括选自下组的一种或多种药物:abt-263(navitoclax)、abt-199(venetoclax)、lcl161和birinapant。

23、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述dna分解剂包括选自下组的一种或多种药物:pr-104、cytarabine(cpx-351)、daunorubicin(vyxeos)和temozolomide。

24、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述细胞分裂抑制剂包括选自下组的一种或多种药物:eribulin、ispinesib和alisertib。

25、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述mdm2类致癌基因抑制剂包括选自下组的一种或多种药物:mk-8242(sch 900242)和rg7112。

26、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述抗体类药物包括选自下组的一种或多种药物:sar3419。

27、在某些实施方式中,所述第二候选药物组中的所述其他化疗药物附加剂包括选自下组的一种或多种药物:alvespimycin,at13387,pf-03084014,ro-4929097,mln4924,pg11047,cx-5461,bmn-673,selinexor,bortezomib,curaxin和cbl0137。

28、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括长春新碱,且所述长春新碱适于根据如下要求施用于所述受试者特异性人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为0.5mg/kg,每周施用一次且持续施用3-6周。

29、在某些实施方式中,其中所述第一候选药物组中包括氨甲叶酸,且所述氨甲叶酸适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为3-6mg/kg,每两周施用一次,且持续施用6-10周。

30、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括地塞米松,且所述地塞米松适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为10-20mg/kg,每日施用一次且持续施用3-6周。

31、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括阿霉素,且所述阿霉素适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过静脉注射施用,每次施用量为0.5-3mg/kg,每周施用一次且持续施用3-6周。

32、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括左旋天冬酰胺酶,且所述左旋天冬酰胺酶适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为500-2000ku/kg,每日施用一次且持续施用3-6周。

33、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括拓扑替康,且所述拓扑替康适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为0.1-5mg/kg,每日施用一次且持续施用2-8周,给药两周后停药一周。

34、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括氯法拉滨,且所述氯法拉滨适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为10-100mg/kg,每日施用一次且持续施用3-6周。

35、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括卡非佐米,且所述卡非佐米适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过静脉注射施用,每次施用量为0.1-10mg/kg,每周施用二次且持续施用3-6周。

36、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括替西罗莫司,且所述替西罗莫司适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为5-50mg/kg,每日施用一次且持续施用1-3周。

37、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括达沙替尼,且所述达沙替尼适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过口服施用,每次施用量为5-50mg/kg,每日施用一次且持续施用2-6周。

38、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括硼替佐米,且所述硼替佐米适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为0.1-20mg/kg,每周施用二次且持续施用4-8周。

39、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括sar3419,且所述sar3419适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为0.5-50mg/kg,每周施用一次且持续施用4-8周。

40、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括全反式维甲酸,且所述全反式维甲酸适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为0.5-10mg/kg,每周施用一次且持续施用2-6周。

41、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括saha,且所述saha适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为100-500mg/kg,每日施用一次且持续施用3-6周。

42、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括舒尼替尼,且所述舒尼替尼适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过口服施用,每次施用量为10-100mg/kg,每日施用一次且持续施用2-6周。

43、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括环磷酰胺,且所述环磷酰胺适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为30-300mg/kg,每日施用一次且持续施用2-6周。

44、在某些实施方式中,所述第一候选药物组中包括维甲酰酚胺,且所述维甲酰酚胺适于根据如下要求施用于所述白血病人源化疾病模型:适于通过腹腔注射施用,每次施用量为20-200mg/kg,每日施用一次且持续施用2-6周。

45、在某些实施方式中,所述白血病包括b细胞急性淋巴细胞白血病和/或t细胞急性淋巴细胞白血病。

46、在某些实施方式中,所述靶标基因包括选自下组的一种或多种基因、其片段或其变体:igh、igk、t细胞受体a、t细胞受体d、t细胞受体b、t细胞受体g和tal 1。

47、在某些实施方式中,所述靶标基因包括igh基因重排,且所述能够特异性扩增靶标基因的试剂包括选自下述的一组或多组引物组合:1)正向引物:vh1/7,反向引物:jh cons;2)正向引物:vh2,反向引物:jh cons;3)正向引物:vh3,反向引物:jh cons;4)正向引物:vh4,反向引物:jh cons;5)正向引物:vh5,反向引物:jh cons;6)正向引物:vh6,反向引物:jh cons;7)正向引物:dh1、dh4、dh5及dh7,反向引物:jh cons;8)正向引物:dh2,反向引物:jh cons;9)正向引物:dh3,反向引物:jh cons;和10)正向引物:dh6,反向引物:jh cons。

48、在某些实施方式中,所述引物jh cons包含选自下组的序列:seq id no.19所示的序列;和seq id no.20所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vh1/7包含选自下组的序列:seq id no.1所示、seq id no.2所示和seq id no.3所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vh2包含选自下组的序列:seq id no.4所示、seq id no.5所示和seq id no.6所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vh3包含选自下组的序列:seq id no.7所示、seq idno.8所示和seq id no.9所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vh4包含选自下组的序列:seq id no.10所示、seq id no.11所示和seq id no.12所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vh5包含选自下组的序列:seq id no.13所示、seq id no.14所示和seq idno.15所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vh6包含选自下组的序列:seq id no.16、seq id no.17所示和seq id no.18所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh1包含选自下组的序列:seq id no.21所示和seq id no.22所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh2包含选自下组的序列:seq id no.23所示和seq id no.24所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh3包含选自下组的序列:seq id no.25所示和seq id no.26所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh4包含选自下组的序列:seq id no.27所示和seq id no.28所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh5包含选自下组的序列:seq id no.29所示和seqid no.30所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh6包含选自下组的序列:seq idno.31所示和seq id no.32所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dh7包含选自下组的序列:seq id no.33所示和seq id no.34所示的序列。

49、在某些实施方式中,所述靶标基因包括igk基因重排,且所述能够特异性扩增靶标基因的试剂包括选自下述的一组或多组引物组合:1)正向引物:vk1,反向引物:kdel;2)正向引物:vk2,反向引物:kdel;3)正向引物:vk3,反向引物:kdel;和4)正向引物:intronrss,反向引物:kdel。

50、在某些实施方式中,所述引物vk1包含选自下组的序列:seq id no.35所示和seqid no.36所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vk2包含选自下组的序列:seq idno.37所示和seq id no.38所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vk3包含选自下组的序列:seq id no.39所示和seq id no.40所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vk4包含选自下组的序列:seq id no.41所示和seq id no.42所示的序列。在某些实施方式中,述引物intron rss包含选自下组的序列:seq id no.43所示和seq id no.44所示的序列。在某些实施方式中,所述引物kdel包含选自下组的序列:seq id no.45所示和seq id no.46所示的序列。

51、在某些实施方式中,所述白血病包括b细胞急性淋巴细胞白血病,所述靶标基因包括t细胞受体区域的基因重排;所述t细胞受体区域的基因包括选自下组的一个或多个:t细胞受体a、t细胞受体d、t细胞受体b和t细胞受体g;且所述能够特异性扩增靶标基因的试剂包括选自下述的一组或多组引物组合:1)正向引物:vd2,反向引物:dd3;2)正向引物:dd2,反向引物:dd3;3)正向引物:vd2,反向引物:ja29;4)正向引物:vd2,反向引物:ja9、ja29、ja30、ja48、ja49、ja52、ja54、ja55、ja56、ja57、ja58、ja59和ja61;5)正向引物:vg1,反向引物:jg1和jg2;6)正向引物:vg2,反向引物:jg1和jg2;7)正向引物:vg4,反向引物:jg1和jg2;8)tcrb多引物组合a;9)tcrb多引物组合b;和10)tcrb多引物组合c。

52、在某些实施方式中,所述引物vg1包含选自下组的序列:seq id no.47所示和seqid no.48所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vg2包含选自下组的序列:seq idno.49所示和seq id no.50所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vg4包含选自下组的序列:seq id no.53所示和seq id no.54所示的序列。在某些实施方式中,所述引物jg1包含选自下组的序列:seq id no.55所示和seq id no.56所示的序列。在某些实施方式中,所述引物jg2包含选自下组的序列:seq id no.57所示和seq id no.58所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vd2包含选自下组的序列:seq id no.61所示和seq id no.62所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dd2包含选自下组的序列:seq id no.65所示和seq idno.66所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dd3包含选自下组的序列:seq id no.67所示和seq id no.68所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja9包含选自下组的序列:seqid no.71所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja29包含选自下组的序列:seq idno.72所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja30包含选自下组的序列:seq id no.73所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja48包含选自下组的序列:seq id no.74所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja49包含选自下组的序列:seq id no.75所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja52包含选自下组的序列:seq id no.76所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja54包含选自下组的序列:seq id no.77所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja55包含选自下组的序列:seq id no.78所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja56包含选自下组的序列:seq id no.79所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja57包含选自下组的序列:seq id no.80所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja58包含选自下组的序列:seq id no.81所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja59包含选自下组的序列:seq id no.82所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja61包含选自下组的序列:seq id no.83所示的序列。

53、在某些实施方式中,所述多引物组合a包含选自下组的一个或多个序列:seq idno.86所示、seq id no.87所示、seq id no.88所示的序列、seq id no.89所示、seq idno.90所示、seq id no.91所示、seq id no.92所示、seq id no.93所示、seq id no.94所示、seq id no.95所示、seq id no.96所示、seq id no.97所示、seq id no.98所示、seq idno.99所示、seq id no.100所示、seq id no.101所示、seq id no.102所示、seq id no.103所示、seq id no.104所示、seq id no.105所示、seq id no.106所示、seq id no.107所示、seq id no.108所示、seq id no.111所示、seq id no.112所示、seq id no.113所示、seqid no.114所示、seq id no.115所示、seq id no.116所示、seq id no.118、seq id no.122所示和seq id no.123所示的序列。

54、在某些实施方式中,所述多引物组合b包含选自下组的一个或多个序列:seq idno.86所示、seq id no.87所示、seq id no.88所示、seq id no.89所示、seq id no.90所示、seq id no.91所示、seq id no.92所示、seq id no.93所示、seq id no.94所示、seq idno.95所示、seq id no.96所示、seq id no.97所示、seq id no.98所示、seq id no.99所示、seq id no.100所示、seq id no.101所示、seq id no.102所示、seq id no.103所示、seq id no.104所示、seq id no.105所示、seq id no.106所示、seq id no.107所示、seqid no.108所示、seq id no.117所示、seq id no.119所示、seq id no.120所示和seq idno.121所示的序列。

55、在某些实施方式中,所述多引物组合c包含选自下组的一个或多个序列:seq idno.109所示、seq id no.110所示、seq id no.111所示、seq id no.112所示、seq idno.113所示、seq id no.114所示、seq id no.115所示、seq id no.116所示、seq idno.117所示、seq id no.118所示、seq id no.119所示、seq id no.120所示、seq idno.121所示、seq id no.122所示和seq id no.123所示的序列。

56、在某些实施方式中,所述白血病包括t细胞急性淋巴细胞白血病,所述靶标基因包括t细胞受体区域的基因重排;所述t细胞受体区域的基因包括选自下组的一个或多个:t细胞受体a、t细胞受体d、t细胞受体b和t细胞受体g;且所述能够特异性扩增靶标基因的试剂包括选自下述的一组或多组引物组合:1)正向引物:vd1,反向引物:jd1;2)正向引物:vd2,反向引物:jd1;3)正向引物:vd3,反向引物:jd1;4)正向引物:vd2,反向引物:dd3;5)正向引物:dd2,反向引物:dd3;6)正向引物:dd2,反向引物:jd1;7)正向引物:vd2,反向引物:ja29;8)正向引物:vd2,反向引物:ja9、ja29、ja30、ja48、ja49、ja52、ja54、ja55、ja56、ja57、ja58、ja59和ja61;9)正向引物:vg1,反向引物:jg1和jg2;10)正向引物:vg2,反向引物:jg1和jg2;11)正向引物:vg3,反向引物:jg1和jg2;12)正向引物:vg4,反向引物:jg1和jg2;13)正向引物:sildb,反向引物:taldb1;14)tcrb多引物组合a;15)tcrb多引物组合b;和16)tcrb多引物组合c。

57、在某些实施方式中,所述引物vg3包含选自下组的序列:seq id no.51所示和seqid no.52所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vd3包含选自下组的序列:seq idno.63所示和seq id no.64所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vg1包含选自下组的序列:seq id no.47所示和seq id no.48所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vg2包含选自下组的序列:seq id no.49所示和seq id no.50所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vg4包含选自下组的序列:seq id no.53所示和seq id no.54所示的序列。在某些实施方式中,所述引物jg1包含选自下组的序列:seq id no.55所示和seq id no.56所示的序列。在某些实施方式中,所述引物jg2包含选自下组的序列:seq id no.57所示和seq idno.58所示的序列。在某些实施方式中,所述引物vd2包含选自下组的序列:seq id no.61所示和seq id no.62所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dd2包含选自下组的序列:seqid no.65所示和seq id no.66所示的序列。在某些实施方式中,所述引物dd3包含选自下组的序列:seq id no.67所示和seq id no.68所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja9包含选自下组的序列:seq id no.71所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja29包含选自下组的序列:seq id no.72所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja30包含选自下组的序列:seq id no.73所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja48包含选自下组的序列:seq id no.74所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja49包含选自下组的序列:seqid no.75所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja52包含选自下组的序列:seq idno.76所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja54包含选自下组的序列:seq id no.77所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja55包含选自下组的序列:seq id no.78所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja56包含选自下组的序列:seq id no.79所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja57包含选自下组的序列:seq id no.80所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja58包含选自下组的序列:seq id no.81所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja59包含选自下组的序列:seq id no.82所示的序列。在某些实施方式中,所述引物ja61包含选自下组的序列:seq id no.83所示的序列。

58、在某些实施方式中,所述多引物组合a包含选自下组的一个或多个序列:seq idno.86所示、seq id no.87所示、seq id no.88所示、seq id no.89所示、seq id no.90所示、seq id no.91所示、seq id no.92所示、seq id no.93所示、seq id no.94所示、seq idno.95所示、seq id no.96所示、seq id no.97所示、seq id no.98所示、seq id no.99所示、seq id no.100所示、seq id no.101所示、seq id no.102所示、seq id no.103所示、seq id no.104所示、seq id no.105所示、seq id no.106所示、seq id no.107所示、seqid no.108所示、seq id no.111所示、seq id no.112所示、seq id no.113所示、seq idno.114所示、seq id no.115所示、seq id no.116所示、seq id no.118所示、seq idno.122所示和seq id no.123所示的序列。

59、在某些实施方式中,所述多引物组合b包含选自下组的一个或多个序列:seq idno.86所示、seq id no.87所示、seq id no.88所示、seq id no.89所示、seq id no.90所示、seq id no.91所示、seq id no.92所示、seq id no.93所示、seq id no.94所示、seq idno.95所示、seq id no.96所示、seq id no.97所示、seq id no.98所示、seq id no.99所示、seq id no.100所示、seq id no.101所示、seq id no.102所示、seq id no.103所示、seq id no.104所示、seq id no.105所示、seq id no.106所示、seq id no.107所示、seqid no.108所示、seq id no.117所示、seq id no.119所示、seq id no.120所示和seq idno.121所示的序列。

60、在某些实施方式中,所述多引物组合c包含选自下组的一个或多个序列:seq idno.109所示、seq id no.110所示、seq id no.111所示、seq id no.112所示、seq idno.113所示、seq id no.114所示、seq id no.115所示、seq id no.116所示、seq idno.117所示、seq id no.118所示、seq id no.119所示、seq id no.120所示、seq idno.121所示、seq id no.122所示和seq id no.123所示的序列。

61、在某些实施方式中,所述引物vd1包含选自下组的序列:seq id no.59所示和seqid no.60所示的序列。在某些实施方式中,所述引物jd1包含选自下组的序列:seq idno.69所示和seq id no.70所示的序列。在某些实施方式中,所述引物sildb包含选自下组的序列:seq id no.84所示的序列。在某些实施方式中,所述引物taldb1包含选自下组的序列:seq id no.85所示的序列。

62、在某些实施方式中,所述白血病为b细胞急性淋巴细胞白血病。在某些实施方式中,所述白血病为t细胞急性淋巴细胞白血病。

63、在某些实施方式中,所述系统中的所述检测模块还包括鉴定单元,该鉴定单元包含用于鉴别所述靶标特异性扩增产物的试剂和装置,从而鉴别出所述靶标特异性扩增产物中源自所述受试者的白血病细胞的特征性扩增产物。

64、在某些实施方式中,所述鉴定单元包含对所述靶标特异性扩增产物进行凝胶电泳分离所需的试剂和装置。

65、在某些实施方式中,所述系统中的所述检测模块还包括分析单元,该分析单元包含用于分析所述特征性扩增产物的试剂和装置,从而获得特异于所述受试者的白血病细胞的特征性基因序列。

66、在某些实施方式中,所述分析单元包含对所述特征性扩增产物进行核酸测序及序列分析所需的试剂和装置。

67、在某些实施方式中,所述分析单元包括鉴定所述特征性扩增产物的核酸序列中保守性核酸序列及受试者特异性核酸序列所需的试剂和装置,从而获得特异于所述受试者白血病细胞的特征性基因序列。

68、在某些实施方式中,所述系统中的所述检测模块还包括识别单元,该识别单元包含能够特异性识别和/或扩增所述受试者的所述特征性基因序列的试剂和装置,从而判断所述受试者中残留白血病细胞的存在和/或比例。

69、在某些实施方式中,所述识别单元包含特异性扩增特异于所述受试者白血病细胞的特征性基因序列的试剂或装置。

70、在某些实施方式中,所述识别单元还包含与非特征性基因序列结合的探针以及能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置。

71、在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自下组中的一种或多种基因的核酸序列:igh、igk、t细胞受体a、t细胞受体d、t细胞受体b、t细胞受体g和tal 1。

72、在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自igh的核酸序列,且所述能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置包含选自下组的序列:seq id no.124所示、seq idno.125所示、seq id no.126所示、seq id no.127所示、seq id no.128所示、seq idno.129所示、seq id no.130所示和seq id no.131所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自igh的核酸序列,且所述与非特征性基因序列结合的探针包含选自下组的序列:seq id no.173所示、seq id no.174所示、seq id no.175所示、seq idno.176所示、seq id no.177所示、seq id no.178所示、seq id no.179所示和seq idno.180所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自igk的核酸序列,且所述能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置包含选自下组的序列:seq id no.132所示、seq id no.133所示、seq id no.134所示、seq id no.135所示、seq id no.136所示、seq id no.137所示、seq id no.138所示、seq id no.139所示、seq id no.140所示和seqid no.141所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自igk的核酸序列,且所述与非特征性基因序列结合的探针包含选自下组的序列:seq id no.181所示、seqid no.182所示、seq id no.183所示、seq id no.184所示、seq id no.185所示、seq idno.186所示、seq id no.187所示、seq id no.188所示、seq id no.189所示和seq idno.190所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自t细胞受体g的核酸序列,且所述能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置包含选自下组的序列:seq idno.142所示、seq id no.143所示、seq id no.144所示、seq id no.145所示、seq idno.146所示、seq id no.147所示、seq id no.148所示、seq id no.149所示、seq idno.150所示和seq id no.151所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自t细胞受体g的核酸序列,且所述与非特征性基因序列结合的探针包含选自下组的序列:seq id no.191所示、seq id no.192所示、seq id no.193所示、seq id no.194所示、seq id no.195所示、seq id no.196所示、seq id no.197所示、seq id no.198所示、seqid no.199所示和seq id no.200所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自t细胞受体d和/或t细胞受体a的核酸序列,且所述能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置包含选自下组的序列:seq id no.152所示、seq id no.153所示、seq idno.154所示、seq id no.155所示、seq id no.156所示和seq id no.157所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自t细胞受体d和/或t细胞受体a的核酸序列,且所述与非特征性基因序列结合的探针包含选自下组的序列:seq id no.201所示、seq idno.202所示、seq id no.203所示、seq id no.204所示、seq id no.205所示和seq idno.206所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自t细胞受体b的核酸序列,且所述能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置包含选自下组的序列:seq idno.158所示、seq id no.159所示、seq id no.160所示、seq id no.161所示、seq idno.162所示、seq id no.163所示、seq id no.164所示、seq id no.165所示、seq idno.166所示、seq id no.167所示、seq id no.168所示、seq id no.169所示和seq idno.170所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自t细胞受体b的核酸序列,且所述与非特征性基因序列结合的探针包含选自下组的序列:seq id no.207所示、seq id no.208所示、seq id no.209所示、seq id no.210所示、seq id no.211所示、seq id no.212所示、seq id no.213所示、seq id no.214所示、seq id no.215所示、seqid no.216所示、seq id no.217所示、seq id no.218所示和seq id no.219所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自tal 1的核酸序列,且所述能够扩增非特征性基因序列的试剂或装置包含选自下组的序列:seq id no.171所示和seq id no.172所示的序列。在某些实施方式中,所述非特征性基因序列包括源自tal 1的核酸序列,且所述与非特征性基因序列结合的探针包含选自下组的序列:seq id no.220所示和seq idno.221所示的序列。

73、在某些实施方式中,所述检测系统包括2个或2个以上的检测模块,其中至少一个检测模块用于在所述受试者接受治疗之前检测其中白血病细胞的存在和/或比例,且其中至少一个检测模块用于在所述受试者接受该治疗之后检测其中白血病细胞的存在和/或比例。

74、在某些实施方式中,所述检测模块包括治疗提示单元,其根据所检测的受试者中白血病细胞的存在和/或比例提示对相应受试者采用的后续治疗方案。

75、在某些实施方式中,当所检测的受试者中白血病细胞的比例为1/104以下时,所述治疗提示单元提示所述治疗成功且无需进行额外治疗。在某些实施方式中,当所检测的受试者中白血病细胞的比例为1/104以上时,所述治疗提示单元提示所述治疗不完善且需要进行其它治疗或提高治疗强度。在某些实施方式中,当所检测的受试者中白血病细胞的比例为1/104以上且1/103以下时,所述治疗提示单元提示可对所示受试者进行骨髓移植手术。在某些实施方式中,当所检测的受试者中白血病细胞的比例为1/103以上时,所述治疗提示单元提示不适于对所述受试者进行骨髓移植手术,且应继续对所述受试者进行其它治疗或提高治疗强度。

76、在某些实施方式中,所述其它治疗选自所述候选药物筛选模块的所述监测单元提示为有效的所述候选药物,或者与其功能和/或效力相仿的疗法和/或药物。

77、本领域技术人员能够从下文的详细描述中容易地洞察到本公开的其它方面和优势。下文的详细描述中仅显示和描述了本公开的示例性实施方式。如本领域技术人员将认识到的,本公开的内容使得本领域技术人员能够对所公开的具体实施方式进行改动而不脱离本技术所涉及发明的精神和范围。相应地,本技术的附图和说明书中的描述仅仅是示例性的,而非为限制性的。

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