发明领域本公开涉及新型ifn-γ信号传导途径靶基因靶向序列、新型分支寡核苷酸以及用于治疗和预防ifn-γ相关的白癜风的新方法。
背景技术:
1、白癜风是一种由cd8+细胞毒性t细胞介导的自身免疫性皮肤病,所述cd8+细胞毒性t细胞攻击黑素细胞并导致受影响的皮肤区域出现白斑。ifn-γ信号传导参与白癜风的发病机制。具体而言,自身免疫通过jak-stat途径激活表皮角质形成细胞中的ifn-γ信号传导,并诱导趋化剂cxcl9和cxcl10的表达,进而促进cd8+细胞毒性t细胞的进一步浸润以实现皮肤脱色。
2、目前还没有美国食品和药物管理局(u.s.food and drug administration)批准的用于白癜风治疗的药物。标签外治疗(off-label treatment)(包括光疗、局部类固醇和小分子药物)通常需要重复施用,不仅耗时,而且由于大剂量暴露可能与长期安全问题相关。最近在了解ifn-γ信号传导在白癜风中的致病作用方面的进展使得小分子jak抑制剂治疗具有可接受的功效,并显著改善了患者的生活质量。然而,那些jak抑制剂是“泛jak抑制剂”,其根据亚型jak1、jak2、jak3和tyk2阻断多种细胞因子受体信号传导。因此,具有长期功效和改善的选择性的针对ifn-γ信号传导的靶向治疗仍有待实现。
3、因此,需要减少参与ifn-γ信号传导的蛋白质的表达以治疗白癜风和相关病症。
技术实现思路
1、在一方面,本公开提供了一种靶向ifn-γ信号传导途径靶基因的寡核苷酸,所述ifn-γ信号传导途径靶基因选自由ifngr1、jak1、jak2或stat1组成的组,其包含与seq idno:1-96中的任一个基本上互补的序列。
2、在一方面,本公开提供了一种靶向ifn-γ信号传导途径靶基因的寡核苷酸,所述ifn-γ信号传导途径靶基因选自由ifngr1、jak1、jak2或stat1组成的组,其包含与seq idno:1-6中的任一个基本上互补的序列。
3、在另一方面,本公开提供了一种rna分子,其包含与seq id no:1-96中任一个的核酸序列基本上互补的序列。
4、在某些实施方案中,rna分子的长度为8个核苷酸至80个核苷酸(例如,8个核苷酸、9个核苷酸、10个核苷酸、11个核苷酸、12个核苷酸、13个核苷酸、14个核苷酸、15个核苷酸、16个核苷酸、17个核苷酸、18个核苷酸、19个核苷酸、20个核苷酸、21个核苷酸、22个核苷酸、23个核苷酸、24个核苷酸、25个核苷酸、26个核苷酸、27个核苷酸、28个核苷酸、29个核苷酸、30个核苷酸、31个核苷酸、32个核苷酸、33个核苷酸、34个核苷酸、35个核苷酸、36个核苷酸、37个核苷酸、38个核苷酸、39个核苷酸、40个核苷酸、41个核苷酸、42个核苷酸、43个核苷酸、44个核苷酸、45个核苷酸、46个核苷酸、47个核苷酸、48个核苷酸、49个核苷酸、50个核苷酸、51个核苷酸、52个核苷酸、53个核苷酸、54个核苷酸、55个核苷酸、56个核苷酸、57个核苷酸、58个核苷酸、59个核苷酸、60个核苷酸、61个核苷酸、62个核苷酸、63个核苷酸、64个核苷酸、65个核苷酸、66个核苷酸、67个核苷酸、68个核苷酸、69个核苷酸、70个核苷酸、71个核苷酸、72个核苷酸、73个核苷酸、74个核苷酸、75个核苷酸、76个核苷酸、77个核苷酸、78个核苷酸、79个核苷酸或80个核苷酸长度)。
5、在某些实施方案中,rna分子的长度为10至50个核苷酸(例如,10个核苷酸、11个核苷酸、12个核苷酸、13个核苷酸、14个核苷酸、15个核苷酸、16个核苷酸、17个核苷酸、18个核苷酸、19个核苷酸、20个核苷酸、21个核苷酸、22个核苷酸、23个核苷酸、24个核苷酸、25个核苷酸、26个核苷酸、27个核苷酸、28个核苷酸、29个核苷酸、30个核苷酸、31个核苷酸、32个核苷酸、33个核苷酸、34个核苷酸、35个核苷酸、36个核苷酸、37个核苷酸、38个核苷酸、39个核苷酸、40个核苷酸、41个核苷酸、42个核苷酸、43个核苷酸、44个核苷酸、45个核苷酸、46个核苷酸、47个核苷酸、48个核苷酸、49个核苷酸或50个核苷酸)。
6、在某些实施方案中,rna分子包含约15个核苷酸至约25个核苷酸长度。在某些实施方案中,rna分子的长度为15至25个核苷酸(例如,15个核苷酸、16个核苷酸、17个核苷酸、18个核苷酸、19个核苷酸、20个核苷酸、21个核苷酸、22个核苷酸、23个核苷酸、24个核苷酸或25个核苷酸长度)。
7、在某些实施方案中,rna分子具有与seq id no:143-244中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列。
8、在某些实施方案中,rna分子具有与表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列至少85%同一(例如,与表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一)的核酸序列。在某些实施方案中,rna分子具有与表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列至少90%同一(例如,与表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一)的核酸序列。在某些实施方案中,rna分子具有与表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列至少95%同一(例如,与表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列95%、96%、97%、98%、99%或100%同一)的核酸序列。在某些实施方案中,rna分子具有表10-15中陈述的序列中任一个的核酸序列。
9、在某些实施方案中,rna分子包含单链(ss)rna或双链(ds)rna。
10、在某些实施方案中,rna分子是包含有义链和反义链的dsrna。反义链可以包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列。例如,在某些实施方案中,反义序列与seq id no:1的核酸序列基本上互补。在某些实施方案中,反义序列与seq id no:2的核酸序列基本上互补。在某些实施方案中,反义序列与seq id no:3的核酸序列基本上互补。在某些实施方案中,反义序列与seq id no:4的核酸序列基本上互补。在某些实施方案中,反义序列与seq id no:5的核酸序列基本上互补。在某些实施方案中,反义序列与seqid no:6的核酸序列基本上互补。
11、在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列的至少10、11、12或13个连续核苷酸具有互补性的反义链。例如,在某些实施方案中,dsrna包含与seqid no:1-6中任一个的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段(例如,seq id no:1的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:2的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:3的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:4的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:5的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段或seqid no:6的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段)具有互补性的反义链。
12、在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列的15至25个连续核苷酸的区段具有互补性的反义链。例如,反义链可以与seq id no:1的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:2的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:3的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:4的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:5的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:6的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。
13、在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列具有至多3个错配的反义链。例如,相对于seq id no:1的核酸序列,反义链可以具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:2的核酸序列,反义链可以具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:3的核酸序列,反义链可以具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:4的核酸序列,反义链可以具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:5的核酸序列,反义链可以具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:6的核酸序列,反义链可以具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。
14、在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列完全互补的反义链。
15、在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列至少85%同一(例如,与seq id no:1-6中任一个的核酸序列85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一)的反义链。在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列至少90%同一(例如,与seq id no:1-6中任一个的核酸序列90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一)的反义链。在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列至少95%同一(例如,与seq id no:1-6中任一个的核酸序列95%、96%、97%、98%、99%或100%同一)的反义链。在某些实施方案中,dsrna包含具有seq id no:1-6中任一个的核酸序列的反义链。
16、在某些实施方案中,反义链和/或有义链包含约15个核苷酸至25个核苷酸长度。例如,在某些实施方案中,反义链和/或有义链的长度为15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个核苷酸。
17、在某些实施方案中,反义链长度为20个核苷酸。在某些实施方案中,反义链长度为21个核苷酸。在某些实施方案中,反义链长度为22个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为15个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为16个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为18个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为20个核苷酸。
18、在某些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸或16个核苷酸。
19、在某些实施方案中,反义链的长度为21个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸或16个核苷酸。
20、在一些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸或21个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸。
21、在一些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸或21个核苷酸,而有义链的长度为16个核苷酸。
22、在某些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸。
23、在某些实施方案中,反义链的长度为21个核苷酸,而有义链的长度为16个核苷酸。
24、在某些实施方案中,dsrna包含15个碱基对至20个碱基对(例如,15个碱基对、16个碱基对、17个碱基对、18个碱基对、19个碱基对或20个碱基对)的双链区域。在某些实施方案中,dsrna包含15个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含16个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含18个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含20个碱基对的双链区。
25、在某些实施方案中,dsrna包含平末端。在某些实施方案中,dsrna包含至少一个单链核苷酸突出端。在某些实施方案中,dsrna包含约2个核苷酸至5个核苷酸的单链核苷酸突出端。
26、在某些实施方案中,dsrna包含天然存在的核苷酸。
27、在某些实施方案中,dsrna包含至少一种修饰的核苷酸。
28、在某些实施方案中,修饰的核苷酸包括2'-o-甲基修饰的核苷酸、2'-脱氧-2'-氟修饰的核苷酸、2'-脱氧-修饰的核苷酸、锁定的核苷酸、脱碱基核苷酸、2'-氨基修饰的核苷酸、2'-烷基修饰的核苷酸、吗啉代核苷酸、氨基磷酸酯、包含非天然碱基的核苷酸或其混合物。
29、在某些实施方案中,dsrna包含至少一种修饰的核苷酸间键。
30、在某些实施方案中,修饰的核苷酸间键包含硫代磷酸酯核苷酸间键。在某些实施方案中,dsrna包含4-16个硫代磷酸酯核苷酸间键(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或16个硫代磷酸酯键联)。在某些实施方案中,dsrna包含8-13个硫代磷酸酯核苷酸间键(例如,9、10、11、12或13个硫代磷酸酯键联)。
31、在某些实施方案中,dsrna包含至少一种式i修饰的核苷酸间键:
32、
33、其中:
34、b是碱基配对部分;
35、w选自由o、och2、och、ch2和ch组成的组;
36、x选自由卤代基、羟基和c1-6烷氧基组成的组;
37、y选自由o-、oh、or、nh-、nh2、s-和sh组成的组;
38、z选自由o和ch2组成的组;
39、r是保护基;并且
40、是任选的双键。
41、在某些实施方案中,当w为ch时,为双键。
42、在某些实施方案中,当w选自由o、och2、och、ch2组成的组时,为单键。
43、在某些实施方案中,dsrna包含至少80%的化学修饰核苷酸(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的化学修饰核苷酸)。在某些实施方案中,dsrna为完全化学修饰的。在某些实施方案中,dsrna包含至少70%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的2'-o-甲基修饰)。
44、在某些实施方案中,dsrna包含约80%至约90%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。在某些实施方案中,dsrna包含约83%至约86%的2'-o-甲基修饰(例如,约83%、84%、85%或86%的2'-o-甲基修饰)。
45、在某些实施方案中,dsrna包含约70%至约80%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%或80%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。在某些实施方案中,dsrna包含约75%至约78%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%、76%、77%或78%的2'-o-甲基修饰)。
46、在某些实施方案中,反义链包含至少80%的化学修饰核苷酸(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的化学修饰核苷酸)。在某些实施方案中,反义链是完全化学修饰的。在某些实施方案中,反义链包含至少70%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的2'-o-甲基修饰)。在某些实施方案中,反义链包含约70%至90%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%的2'-o-甲基修饰)。在某些实施方案中,反义链包含约85%至约90%的2'-o-甲基修饰(例如,约85%、86%、87%、88%、89%或90%的2'-o-甲基修饰)。
47、在某些实施方案中,反义链包含约75%至约85%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%或85%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。在某些实施方案中,反义链包含约76%至约80%的2'-o-甲基修饰(例如,约76%、77%、78%、79%或80%的2'-o-甲基修饰)。
48、在某些实施方案中,有义链包含至少80%的化学修饰核苷酸(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的化学修饰核苷酸)。在某些实施方案中,有义链是完全化学修饰的。在某些实施方案中,有义链包含至少65%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的2'-o-甲基修饰)。在某些实施方案中,有义链包含100%的2'-o-甲基核苷酸修饰。
49、在某些实施方案中,有义链包含约70%至85%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%或85%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。在某些实施方案中,有义链包含约75%至约80%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约75%、76%、77%、78%、79%或80%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。
50、在某些实施方案中,有义链包含约65%至约75%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%或75%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。在某些实施方案中,有义链包含约67%至约73%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约67%、68%、69%、70%、71%、72%或73%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。
51、在某些实施方案中,有义链包含反义链和有义链之间的一个或多个核苷酸错配。在某些实施方案中,一种或多种核苷酸错配存在于有义链5'端的位置2、6和12。在某些实施方案中,核苷酸错配存在于有义链5'端的位置2、6和12。
52、在某些实施方案中,反义链包含5'磷酸酯、5'-烷基膦酸酯、5'亚烷基膦酸酯或5'烯基膦酸酯。
53、在某些实施方案中,反义链包含5'乙烯基膦酸酯。
54、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含交替的2'-甲氧基-核糖核苷酸和2'-氟-核糖核苷酸;(3)反义链5'端的位置2和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含交替的2'-甲氧基-核糖核苷酸和2'-氟-核糖核苷酸;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
55、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少70%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%或约85%至约90%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少65%的2'-o-甲基修饰(例如,约65%至约75%或约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
56、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少85%的2'-o-甲基修饰;(3)反义链5'端的位置2和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含100%的2'-o-甲基修饰;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
57、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰;(3)反义链5'端的位置4、5、6和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含100%的2'-o-甲基修饰;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
58、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少85%的2'-o-甲基修饰(例如,约85%至约90%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2和14处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(7)有义链3'端的位置7、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,有义链3'端的位置7、10和11处的核苷酸是2'-氟核苷酸);并且(8)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
59、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2、4、5、6和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2、6、14和16处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含100%的2'-o-甲基修饰;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
60、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2、6、14和16处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2、6、14和16处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少65%的2'-o-甲基修饰(例如,约65%至约75%的2'-o-甲基修饰);(7)有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸是2'-氟核苷酸);并且(8)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
61、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链包含与seq id no:1-6的核酸序列基本上互补的序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰;(3)反义链5'端的位置2、6、和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少80%的2'-o-甲基修饰;(7)有义链3'端的位置7、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;并且(8)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
62、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2、6、14、16和20处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2、6、14、16和20处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-7和19-20处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少65%的2'-o-甲基修饰(例如,约65%至约75%的2'-o-甲基修饰);(7)有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸是2'-氟核苷酸);并且(8)有义链5'端的位置1-2和14-15处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
63、在某些实施方案中,功能部分连接到反义链的5'端和/或3'端。在某些实施方案中,功能部分连接到有义链的5'端和/或3'端。在某些实施方案中,功能部分连接到有义链的3'末端。
64、在某些实施方案中,功能部分包含疏水部分。
65、在某些实施方案中,疏水部分选自由以下组成的组:脂肪酸、类固醇、开环类固醇、脂质、神经节苷脂、核苷类似物、内源性大麻素、维生素及其混合物。
66、在某些实施方案中,类固醇选自由胆固醇和石胆酸(lca)组成的组。
67、在某些实施方案中,脂肪酸选自由二十碳五烯酸(epa)、二十二碳六烯酸(dha)和二十二烷酸(dca)组成的组。
68、在某些实施方案中,维生素选自由胆碱、维生素a、维生素e及其衍生物或代谢物组成的组。
69、在某些实施方案中,维生素选自由视黄酸和α-生育酚琥珀酸酯组成的组。
70、在某些实施方案中,功能部分为肉豆蔻酸(myr)。在某些实施方案中,功能部分为三肉豆蔻酸(myr-t)。
71、在某些实施方案中,功能部分通过接头与反义链和/或有义链连接。
72、在某些实施方案中,接头包含二价或三价接头。
73、在某些实施方案中,二价或三价接头选自由以下组成的组:
74、
75、其中n为1、2、3、4或5。
76、在某些实施方案中,接头包含乙二醇链、烷基链、肽、rna、dna、磷酸二酯、硫代磷酸酯、氨基磷酸酯、酰胺、氨基甲酸酯或其组合。
77、在某些实施方案中,当接头是三价接头时,接头进一步连接磷酸二酯或磷酸二酯衍生物。
78、在某些实施方案中,磷酸二酯或磷酸二酯衍生物选自由以下组成的组:
79、
80、
81、其中x是o、s或bh3。
82、在某些实施方案中,有义链3'端的位置1和2的核苷酸,以及反义链5'端的位置1和2的核苷酸,通过硫代磷酸酯键与相邻的核糖核苷酸连接。
83、在一方面,本公开提供了一种用于抑制生物体中选自由ifngr1、jak1、jak2或stat1组成的组的ifn-γ信号传导途径靶基因的表达的药物组合物,其包含上述dsrna和药学上可接受的载体。
84、在某些实施方案中,dsrna将所述基因的表达抑制至少50%。在某些实施方案中,dsrna将所述基因的表达抑制至少80%。
85、在某些实施方案中,dsrna将趋化因子cscl9的表达减少至少20%至至少80%。
86、在一方面,本公开提供了一种用于抑制细胞中选自由ifngr1、jak1、jak2或stat1组成的组的ifn-γ信号传导途径靶基因表达的方法,所述方法包括:(a)将上述双链核糖核酸(dsrna)引入细胞中;和(b)将步骤(a)中产生的细胞维持足以获得基因的mrna转录物降解的时间,从而抑制细胞中基因的表达。
87、在一方面,本公开提供了一种治疗有需要的受试者的白癜风的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的与ifn-γ信号传导途径靶基因包含足够互补性的寡核苷酸,从而治疗受试者。
88、在某些实施方案中,ifn-γ信号传导途径靶基因选自由ifngr1、jak1、jak2或stat1组成的组。
89、在某些实施方案中,治疗方法包括施用治疗有效量的以上陈述的所述dsrna。
90、在某些实施方案中,dsrna通过静脉内(iv)注射、皮下(sq)注射或其组合施用。
91、在某些实施方案中,dsrna将所述基因的表达抑制至少50%。在某些实施方案中,dsrna将所述基因的表达抑制至少80%。
92、在某些实施方案中,dsrna将细胞因子cxcl9的表达减少至少20%至至少80%。
93、在一方面,本公开提供了包含调节序列的载体,所述调节序列与编码rna分子的核苷酸序列可操作地连接,所述rna分子与seq id no:1-6的核酸序列基本上互补。
94、在某些实施方案中,rna分子将所述基因的表达抑制至少50%。在某些实施方案中,rna分子将所述基因的表达抑制至少80%。
95、在某些实施方案中,rna分子将细胞因子cxcl9的表达减少至少20%至至少80%。
96、在某些实施方案中,rna分子包含ssrna或dsrna。
97、在某些实施方案中,dsrna包含有义链和反义链,其中反义链包含与seq id no:1-6的核酸序列基本上互补的序列。
98、在一方面,本公开提供了一种包含上述载体的细胞。
99、在一方面,本公开提供了一种重组腺相关病毒(raav),其包含上述载体和aav衣壳。
100、在一方面,本公开提供了包含两个或更多个rna分子(诸如各自包含15至40个核苷酸长度(例如,15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39或40个核苷酸长度)的两个或更多个rna分子)的分支rna化合物,其中每个rna分子包含具有与选自由ifngr1、jak1、jak2或stat1组成的组的ifn-γ信号传导途径基因mrna的区段基本上互补的核酸序列的部分。两个rna分子可以通过一个或多个独立地选自接头、间隔子和分支点的部分相互连接。
101、在某些实施方案中,分支rna分子包含ssrna和dsrna中的一种或两种。
102、在某些实施方案中,分支rna分子包含反义寡核苷酸。
103、在某些实施方案中,每个rna分子包含有包含有义链和反义链的dsrna,其中每个反义链独立地包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的序列。
104、在某些实施方案中,分支rna化合物包含彼此共价结合(例如,通过接头、间隔子或分支点)的本公开的任何上述方面或实施方案的rna分子的两个或更多个拷贝。
105、在某些实施方案中,分支rna化合物包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列的一部分。例如,分支rna化合物可以包含两个或更多个彼此共价结合(例如,通过接头、间隔子或分支点)的dsrna分子并且所述dsrna分子包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列的至少10、11、12或13个连续核苷酸具有互补性的反义链。例如,在某些实施方案中,dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段(例如,seq id no:1的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:2的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:3的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:4的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段、seq id no:5的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段或seq id no:6的核酸序列的10至25个连续核苷酸的区段)具有互补性的反义链。
106、在某些实施方案中,分支rna化合物中的每个dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列的15至25个连续核苷酸的区段具有互补性的反义链。例如,反义链可与seqid no:1的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:2的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:3的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:4的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:5的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。在某些实施方案中,反义链与seq id no:6的核酸序列的15个连续核苷酸、16个连续核苷酸、17个连续核苷酸、18个连续核苷酸、19个连续核苷酸、20个连续核苷酸、21个连续核苷酸、22个连续核苷酸、23个连续核苷酸、24个连续核苷酸或25个连续核苷酸的区段具有互补性。
107、在某些实施方案中,分支rna化合物中的每个dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列具有至多3个错配的反义链。例如,相对于seq id no:1的核酸序列,反义链可具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:2的核酸序列,反义链具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:3的核酸序列,反义链具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:4的核酸序列,反义链具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:5的核酸序列,反义链具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。在某些实施方案中,相对于seq id no:6的核酸序列,反义链具有0-3个错配(例如,0个错配、1个错配、2个错配或3个错配)。
108、在某些实施方案中,分支rna化合物中的每个dsrna包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列完全互补的反义链。
109、在某些实施方案中,分支rna化合物包含具有与seq id no:143-154中任一个的核酸序列中的一个或多个基本上互补的核酸序列的部分。
110、在某些实施方案中,rna分子包含反义寡核苷酸。
111、在某些实施方案中,每个rna分子包含15至25个核苷酸长度。
112、在某些实施方案中,反义链和/或有义链包含约15个核苷酸至25个核苷酸长度。例如,在某些实施方案中,反义链和/或有义链是15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个核苷酸长度。在某些实施方案中,反义链长度为20个核苷酸。在某些实施方案中,反义链长度为21个核苷酸。在某些实施方案中,反义链长度为22个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为15个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为16个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为18个核苷酸。在某些实施方案中,有义链长度为20个核苷酸。
113、在某些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸或16个核苷酸。
114、在某些实施方案中,反义链的长度为21个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸或16个核苷酸。
115、在一些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸或21个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸。
116、在一些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸或21个核苷酸,而有义链的长度为16个核苷酸。
117、在某些实施方案中,反义链的长度为20个核苷酸,而有义链的长度为15个核苷酸。
118、在某些实施方案中,反义链的长度为21个核苷酸,而有义链的长度为16个核苷酸。
119、在某些实施方案中,dsrna包含15个碱基对至20个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含15个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含16个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含18个碱基对的双链区。在某些实施方案中,dsrna包含20个碱基对的双链区。
120、在某些实施方案中,dsrna包含平末端。
121、在某些实施方案中,dsrna包含至少一个单链核苷酸突出端。在某些实施方案中,dsrna包含2个核苷酸至5个核苷酸的单链核苷酸突出端。
122、在某些实施方案中,dsrna包含天然存在的核苷酸。
123、在某些实施方案中,dsrna包含至少一种修饰的核苷酸。
124、在某些实施方案中,修饰的核苷酸包括2'-o-甲基修饰的核苷酸、2'-脱氧-2'-氟修饰的核苷酸、2'-脱氧-修饰的核苷酸、锁定的核苷酸、脱碱基核苷酸、2'-氨基修饰的核苷酸、2'-烷基修饰的核苷酸、吗啉代核苷酸、氨基磷酸酯或包含非天然碱基的核苷酸。
125、在某些实施方案中,dsrna包含至少一种修饰的核苷酸间键。
126、在某些实施方案中,修饰的核苷酸间键包含硫代磷酸酯核苷酸间键。在某些实施方案中,分支rna化合物包含4-16个硫代磷酸酯核苷酸间键。在某些实施方案中,分支rna化合物包含8-13个硫代磷酸酯核苷酸间键。
127、在某些实施方案中,dsrna包含至少一种式i修饰的核苷酸间键:
128、
129、其中:
130、b是碱基配对部分;
131、w选自由o、och2、och、ch2和ch组成的组;
132、x选自由卤代基、羟基和c1-6烷氧基组成的组;
133、y选自由o-、oh、or、nh-、nh2、s-和sh组成的组;
134、z选自由o和ch2组成的组;
135、r是保护基;并且
136、是任选的双键。
137、在某些实施方案中,当w为ch时,为双键。
138、在某些实施方案中,当w选自由o、och2、och、ch2组成的组时,为单键。
139、在某些实施方案中,dsrna包含至少80%的化学修饰核苷酸(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的化学修饰核苷酸)。在某些实施方案中,dsrna为完全化学修饰的。在某些实施方案中,dsrna包含至少70%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的2'-o-甲基修饰)。
140、在某些实施方案中,反义链包含至少80%的化学修饰核苷酸。
141、在某些实施方案中,反义链是完全化学修饰的。
142、在某些实施方案中,反义链包含至少70%的2'-o-甲基核苷酸修饰。在某些实施方案中,反义链包含约70%至90%的2'-o-甲基核苷酸修饰。在某些实施方案中,反义链包含约85%至约90%的2'-o-甲基修饰(例如,约85%、86%、87%、88%、89%或90%的2'-o-甲基修饰)。
143、在某些实施方案中,反义链包含约75%至约85%的2'-o-甲基核苷酸修饰(例如,约75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%或85%的2'-o-甲基核苷酸修饰)。在某些实施方案中,反义链包含约76%至约80%的2'-o-甲基修饰(例如,约76%、77%、78%、79%或80%的2'-o-甲基修饰)。
144、在某些实施方案中,反义链包含至少80%的化学修饰核苷酸。在某些实施方案中,有义链是完全化学修饰的。在某些实施方案中,有义链包含至少65%的2'-o-甲基核苷酸修饰。在某些实施方案中,有义链包含100%的2'-o-甲基核苷酸修饰。
145、在某些实施方案中,有义链包含反义链和有义链之间的一个或多个核苷酸错配。在某些实施方案中,一种或多种核苷酸错配存在于有义链5'端的位置2、6和12。在某些实施方案中,核苷酸错配存在于有义链5'端的位置2、6和12。
146、在某些实施方案中,反义链包含5'磷酸酯、5'-烷基膦酸酯、5'亚烷基膦酸酯、5'烯基膦酸酯或其混合物。
147、在某些实施方案中,反义链包含5'乙烯基膦酸酯。
148、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含交替的2'-甲氧基-核糖核苷酸和2'-氟-核糖核苷酸;(3)反义链5'端的位置2和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含交替的2'-甲氧基-核糖核苷酸和2'-氟-核糖核苷酸;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
149、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少70%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%或约85%至约90%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少65%的2'-o-甲基修饰(例如,约65%至约75%或约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
150、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少85%的2'-o-甲基修饰;(3)反义链5'端的位置2和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含100%的2'-o-甲基修饰;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
151、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰;(3)反义链5'端的位置4、5、6和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含100%的2'-o-甲基修饰;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
152、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少85%的2'-o-甲基修饰(例如,约85%至约90%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2和14处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(7)有义链3'端的位置7、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,有义链3'端的位置7、10和11处的核苷酸是2'-氟核苷酸);并且(8)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
153、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2、4、5、6和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2、4、5、6、14和16处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含100%的2'-o-甲基修饰;并且(7)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
154、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2、6、14和16处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2、6、14和16处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少65%的2'-o-甲基修饰(例如,约65%至约75%的2'-o-甲基修饰);(7)有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;并且(8)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
155、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰;(3)反义链5'端的位置2、6、和14处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;(4)反义链3'端的位置1-2至1-7处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少80%的2'-o-甲基修饰;(7)有义链3'端的位置7、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸;并且(8)有义链5'端的位置1-2处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
156、在某些实施方案中,dsrna包含反义链和有义链,每条链具有5'端和3'端,其中:(1)反义链具有与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的核酸序列;(2)反义链包含至少75%的2'-o-甲基修饰(例如,约75%至约80%的2'-o-甲基修饰);(3)反义链5'端的位置2、6、14、16和20处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,反义链5'端的位置2、6、14、16和20处的核苷酸可以是2'-氟核苷酸);(4)反义链3'端的位置1-7和19-20处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接;(5)反义链的一部分与有义链的一部分互补;(6)有义链包含至少65%的2'-o-甲基修饰(例如,约65%至约75%的2'-o-甲基修饰);(7)有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸不是2'-甲氧基-核糖核苷酸(例如,有义链3'端的位置7、9、10和11处的核苷酸是2'-氟核苷酸);并且(8)有义链5'端的位置1-2和14-15处的核苷酸通过硫代磷酸酯核苷酸间键相互连接。
157、在某些实施方案中,功能部分连接到反义链的5'端和/或3'端。在某些实施方案中,功能部分连接到有义链的5'端和/或3'端。在某些实施方案中,功能部分连接到有义链的3'末端。
158、在某些实施方案中,功能部分包含疏水部分。
159、在某些实施方案中,疏水部分选自由以下组成的组:脂肪酸、类固醇、开环类固醇、脂质、神经节苷脂、核苷类似物、内源性大麻素、维生素及其混合物。
160、在某些实施方案中,类固醇选自由胆固醇和石胆酸(lca)组成的组。
161、在某些实施方案中,脂肪酸选自由二十碳五烯酸(epa)、二十二碳六烯酸(dha)和二十二烷酸(dca)组成的组。
162、在某些实施方案中,维生素选自由胆碱、维生素a、维生素e、其衍生物和其代谢物组成的组。
163、在某些实施方案中,维生素选自由视黄酸和α-生育酚琥珀酸酯组成的组。
164、在某些实施方案中,功能部分通过接头与反义链和/或有义链连接。
165、在某些实施方案中,接头包含二价或三价接头。
166、在某些实施方案中,二价或三价接头选自由以下组成的组:
167、
168、其中n为1、2、3、4或5。
169、在某些实施方案中,接头包含乙二醇链、烷基链、肽、rna、dna、磷酸二酯、硫代磷酸酯、氨基磷酸酯、酰胺、氨基甲酸酯或其组合。
170、在某些实施方案中,当接头是三价接头时,接头进一步连接磷酸二酯或磷酸二酯衍生物。
171、在某些实施方案中,磷酸二酯或磷酸二酯衍生物选自由以下组成的组:
172、
173、其中x是o、s或bh3。
174、在某些实施方案中,有义链3'端的位置1和2的核苷酸,以及反义链5'端的位置1和2的核苷酸,通过硫代磷酸酯键与相邻的核糖核苷酸连接。
175、在一方面,本公开提供式(i)的化合物:
176、l—(n)n
177、(i)
178、其中
179、l包含乙二醇链、烷基链、肽、rna、dna、磷酸酯、膦酸酯、氨基磷酸酯、酯、酰胺、三唑或其组合,其中式(i)任选地还包含一个或多个分支点b,以及一个或多个间隔子s,其中
180、b在每次出现时独立地是多价有机物质或其衍生物;
181、s在每次出现时独立地包含乙二醇链、烷基链、肽、rna、dna、磷酸酯、膦酸酯、氨基磷酸酯、酯、酰胺、三唑或其组合;
182、n是2、3、4、5、6、7或8;并且
183、n是双链核酸,例如本公开的任何上述方面或实施方案的dsrna分子。在某些实施方案中,每个n的长度为15至40个碱基。
184、在某些实施方案中,每个n包含有义链和反义链;其中
185、反义链包含与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补的序列;并且
186、其中有义链和反义链各自独立地包含一种或多种化学修饰。
187、在某些实施方案中,化合物包含选自式(i-1)-(i-9)的结构:
188、
189、在某些实施方案中,反义链包含5'末端基团r,其选自由以下组成的组:
190、
191、
192、在某些实施方案中,所述化合物包含式(ii)的结构:
193、
194、其中
195、x在每次出现时独立地选自腺苷、鸟苷、尿苷、胞苷及其化学修饰的衍生物;
196、y在每次出现时独立地选自腺苷、鸟苷、尿苷、胞苷及其化学修饰的衍生物;
197、-代表磷酸二酯核苷间键;
198、=代表硫代磷酸酯核苷间键;并且
199、---在每次出现时独立代表碱基配对相互作用或错配。
200、在某些实施方案中,所述化合物包含式(iv)的结构:
201、
202、其中
203、x在每次出现时独立地选自腺苷、鸟苷、尿苷、胞苷及其化学修饰的衍生物;
204、y在每次出现时独立地选自腺苷、鸟苷、尿苷、胞苷及其化学修饰的衍生物;
205、-代表磷酸二酯核苷间键;
206、=代表硫代磷酸酯核苷间键;并且
207、---在每次出现时独立代表碱基配对相互作用或错配。
208、在某些实施方案中,l是结构l1:
209、
210、在某些实施方案中,r是r3并且n是2。
211、在某些实施方案中,l是结构l2:
212、
213、在某些实施方案中,r是r3并且n是2。
214、在一方面,本公开提供了一种用于具有式(vi)结构的治疗性核酸的递送系统:
215、l—(cna)n
216、(vi)
217、其中:
218、l包含乙二醇链、烷基链、肽、rna、dna、磷酸酯、膦酸酯、氨基磷酸酯、酯、酰胺、三唑或其组合,其中式(vi)任选地还包含一个或多个分支点b,以及一个或多个间隔子s,其中
219、b在每次出现时独立地包括多价有机物质或其衍生物;
220、s在每次出现时独立地包含乙二醇链、烷基链、肽、rna、dna、磷酸酯、膦酸酯、氨基磷酸酯、酯、酰胺、三唑或其组合;
221、每个cna独立地是包含一种或多种化学修饰的载体核酸;
222、每个cna独立地包含seq id no:1-6中任一个的核酸序列的至少15个连续核苷酸;并且
223、n是2、3、4、5、6、7或8。
224、在某些实施方案中,递送系统包含选自式(vi-1)-(vi-9)的结构:
225、
226、
227、在某些实施方案中,每个cna独立地包含化学修饰的核苷酸。
228、在某些实施方案中,递送系统还包含n个治疗性核酸(na),其中每个na与至少一个cna杂交。
229、在某些实施方案中,每个na独立地包含至少16个连续核苷酸。
230、在某些实施方案中,每个na独立地包含16-20个连续核苷酸。
231、在某些实施方案中,每个na包含至少2个核苷酸的未配对突出端。
232、在某些实施方案中,突出端的核苷酸通过硫代磷酸酯键连接。
233、在某些实施方案中,每个na独立地选自由以下组成的组:dna、sirna、mirna拮抗剂(antagomir)、mirna、间隙体(gapmer)、混合体(mixmer)和指导rna。
234、在某些实施方案中,每个na与seq id no:1-6中任一个的核酸序列基本上互补。
235、在一方面,本公开提供了一种抑制生物体中的ifn-γ信号传导途径靶基因的表达的药物组合物,所述药物组合物包含上述化合物或上述系统和药学上可接受的载体。
236、在某些实施方案中,所述化合物或系统将syngr3基因的表达抑制至少50%。在某些实施方案中,所述化合物或系统将syngr3基因的表达抑制至少80%。
237、在某些实施方案中,所述化合物或系统将细胞因子cxcl9的表达减少至少20%至至少80%。
238、在一方面,本公开提供了一种用于抑制细胞中ifn-γ信号传导途径靶基因表达的方法,所述方法包括:(a)将上述化合物或上述系统引入细胞中;和(b)将步骤(a)中产生的细胞维持足以获得基因的mrna转录物降解的时间,从而抑制细胞中基因的表达。
239、在一方面,本公开提供了一种治疗有需要的受试者的白癜风的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的上述化合物或上述系统。
240、在某些实施方案中,dsrna通过静脉内(iv)注射、皮下(sq)注射或其组合施用。
241、在某些实施方案中,dsrna将所述基因的表达抑制至少50%。在某些实施方案中,dsrna将所述基因的表达抑制至少80%。
242、在某些实施方案中,dsrna将细胞因子cxcl9的表达减少至少20%至至少80%。