一种环状RNAcirc_0051246及其在诊断胃癌中的应用的制作方法

文档序号:35383400发布日期:2023-09-09 11:44阅读:50来源:国知局
一种环状RNAcirc_0051246及其在诊断胃癌中的应用的制作方法

本发明涉及分子生物学领域,具体涉及一种环状rna作为胃癌分子标志物的应用。


背景技术:

1、胃癌是常见的消化系统肿瘤,其发病率和死亡率分别位于全球恶性肿瘤的第5位和第4位。是全球癌症相关死亡的主要原因,但据报道大多数病例在亚洲国家。由于不典型的早期症状和筛查的缺乏,大多数胃癌患者在诊断时已经是晚期。尽管在过去几十年中,胃癌的临床诊断和治疗策略方面取得了巨大进步,但大多数亚洲国家的gc年龄标准化5年生存率仍低于30%。胃癌预后不良的主要原因是治疗后复发和转移。癌症干细胞是肿瘤中一小部分具有较强自我更新能力和无定向分化能力的细胞,虽然数量少却在肿瘤的发生发展、复发和转移中起着重要作用。因此进一步探索胃癌进展过程中调控干细胞无限增殖转移的分子机制和有效的分子标志物,可能会为胃癌治疗策略提供新的思路,对提高患者生存率改善预后至关重要。

2、环状rnas(circrnas)是由前体mrna(pre-mrna)转录本的“反向剪接”产生的一个没有5’到3’极性或3’polya尾的共价闭合环状结构的非编码rna。自然环状rna已被证实是一种丰富而稳定的rna分子,在rna调控网络中起着不可或缺的作用。研究表明,在常见恶性肿瘤和罕见恶性肿瘤中均可观察到circrna表达失调。此外,许多研究表明,位于细胞质中的circrna通常充当mirna“海绵”,在转录后调控水平发挥其生物学功能。

3、microrna(mirna)是一种单链、小的非编码rna分子,包含20-25个核苷酸。然而,与靶mrna的碱基配对主要依赖于mirna 5’端的7或8个核苷酸(称为“种子序列”),大多数mirna通过种子序列与靶基因的3’-非翻译区结合,导致靶转录抑制和/或mrna降解。mir-375是mirnas家族中高度保守的一员,是一种多功能mirna,参与胰岛细胞的生长和分化、胰岛素的产生以及各种肿瘤的进展。

4、目前现有技术中关于环状rnas调控胃癌发生发展的研究有限,许多circrna与胃癌的关联性仍有待进一步的研究。


技术实现思路

1、为解决上述技术问题,本发明包括以下几个方面:

2、本发明的第一方面提供一种用于诊断胃癌的分子标志物,所述分子标志物为环状rna circ_0051246。

3、优选的,所述环状rna circ_0051246在circ-rna数据库中的全称为hsa_circ_0051246,其定位于chr19:42373768-42375484,由rps19转录而来,所述环状rna circ_0051246的序列如seq id no.1所示。

4、

5、

6、其中斜体碱基为目的序列。

7、优选的,所述胃癌为人胃腺癌。

8、更优选的,所述人胃腺癌为sgc 7901人胃腺癌。

9、本发明的第二方面提供一种检测分子标志物表达水平的试剂在制备诊断胃癌的产品中的应用,所述分子标志物为环状rna circ_0051246。

10、优选的,所述环状rna circ_0051246在circ-rna数据库中的全称为hsa_circ_0051246,其定位于chr19:42373768-42375484,由rps19转录而来,所述环状rna circ_0051246的序列如seq id no.1所示。

11、优选的,所述胃癌为人胃腺癌。

12、更优选的,所述人胃腺癌为sgc 7901人胃腺癌。

13、本发明的第三方面提供一种分子标志物的抑制剂在制备治疗胃癌的药物中的应用,所述分子标志物为环状rna circ_0051246。

14、优选的,所述环状rna circ_0051246在circ-rna数据库中的全称为hsa_circ_0051246,其定位于chr19:42373768-42375484,由rps19转录而来,所述环状rna circ_0051246的序列如seq id no.1所示。

15、优选的,所述抑制剂为特异性干扰环状rna circ_0051246的shrna或者mir-375模拟物。

16、优选的,所述shrna选自shrna#1、shrna#2或shrna#3,其靶序列信息分别如seq idno.2、seq id no.3或seq id no.4所示。

17、5’-gcctcattcgtaacggccgca-3’(seq id no.2,shrna#1)

18、5’-attcgtaacggccgcaaactg-3’(seq id no.3,shrna#2)

19、5’-aattgcctcattcgtaacggc-3’(seq id no.4,shrna#3)

20、优选的,表达shrna#1所需shdna的正义链序列为seq id no.5,反义链序列为seqid no.6。

21、优选的,表达shrna#2所需shdna的正义链序列为seq id no.7,反义链序列为seqid no.8。

22、优选的,表达shrna#3所需shdna的正义链序列为seq id no.9,反义链序列为seqid no.10。

23、5’-ccgggcctcattcgtaacggccgcactcgagtgcggccgttacgaatgaggctttttg-3’

24、(seq id no.5)

25、5’-aattcaaaaagcctcattcgtaacggccgcactcgagtgcggccgttacgaatgaggc-3’

26、(seq id no.6)

27、5’-ccggattcgtaacggccgcaaactgctcgagcagtttgcggccgttacgaattttttg-3’

28、(seq id no.7)

29、5’-aattcaaaaaattcgtaacggccgcaaactgctcgagcagtttgcggccgttacgaat-3’

30、(seq id no.8)

31、5’-ccggaattgcctcattcgtaacggcctcgaggccgttacgaatgaggcaatttttttg-3’

32、(seq id no.9)

33、5’-aattcaaaaaaattgcctcattcgtaacggcctcgaggccgttacgaatgaggcaatt-3’

34、(seq id no.10)

35、优选的,所述mir-375模拟物的序列seq id no.11所示。

36、

37、

38、其中斜体碱基为目的序列。

39、优选的,所述胃癌为人胃腺癌。

40、更优选的,所述人胃腺癌为sgc 7901人胃腺癌。

41、本发明产生的技术效果:

42、本发明意外发现,mirna-375与has_circ_0051246(circ_0051246)在胃癌中的表达具有关联性,circ_0051246可以作为mir-375的分子海绵促进胃癌的增殖转移。本发明为早期胃癌的筛查提供了新的分子标志物,对进一步提高现有胃癌临床诊治水平具有积极的意义。

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