乳腺癌预后相关miRNA组合物及其在制备乳腺癌预后预测诊断产品中的应用

本发明实施例涉及生物，特别涉及一种乳腺癌预后相关mirna组合物及其在制备乳腺癌预后预测诊断产品中的应用。

背景技术：

1、乳腺癌中约70％为雌激素受体(estrogen receptor,er)阳性乳腺癌。内分泌治疗结合手术、化疗和放疗，显著改善了er阳性乳腺癌患者的临床结局。然而，仍有部分er阳性的乳腺癌患者因耐药出现复发或转移，导致乳腺癌患者病情进展和不良预后。因此，仍需要寻找新的预测er阳性乳腺癌患者预后和治疗靶点的生物标志物。

2、微小rna(mirna)是长度约为20-24个核苷酸的非编码单链rna，可通过与靶基因的3'－非翻译区(3'-untrnaslated region,3'-utr)碱基配对结合，抑制靶基因的信使rna(mrna)的翻译过程或降解mrna从而调节靶基因的表达。目前，已有研究证实在er阳性乳腺癌的发生发展过程中mirna的表达水平发挥重要作用。因此，急需开发出一组可用以评估乳腺癌预后并可能指导其治疗方案的选择的风险预测和评分系统。

技术实现思路

1、本发明实施例目的是提供一种乳腺癌预后相关mirna组合物及其在制备乳腺癌预后预测诊断产品中的应用，可提高er阳性乳腺癌患者预后预测的敏感性和特异性，可方便快捷地识别er阳性乳腺癌高风险患者，同时，以mirna为靶点的药物有望成为肿瘤靶向治疗的一种新手段。

2、为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

3、在本发明实施例的第一方面，提供了一种乳腺癌预后相关mirna组合物，所述乳腺癌预后相关mirna组合物由mir-30a、mir-31、mir-505和mir-887组成。

4、在本发明实施例的第二方面，提供了一种乳腺癌预后相关mirna组合物的检测产品，包括检测所述乳腺癌预后相关mirna组合物在乳腺癌组织中的表达水平的产品。

5、进一步地，所述检测产品包括：乳腺癌预后相关mirna组合物的探针和引物；

6、所述探针能够通过分子杂交分别与所述乳腺癌预后相关mirna组合物进行基因结合产生杂交信号，所述引物能够通过基于pcr的技术对所述乳腺癌预后相关mirna组合物进行扩增。

7、还可以设计一种乳腺癌预后相关mirna组合物的检测试剂盒，所述试剂盒包括所述的探针和引物，还包括：

8、阳性对照品；

9、阴性对照品；

10、内标基因的特异性引物及探针；所述内标基因包括gapdh，actb和gusbtfrc中的一种。

11、本发明的试剂盒中，除了针对上述引物或基因探针之外，还可以追加含有用于pcr反应、试样的rna分离和cdna的合成的本领域公知的工具和/或试剂。本发明的试剂盒可以根据需要追加含有用于各成分的混合的管、微孔板和记载使用方法的指示资料等。

12、在本发明实施例的第三方面，提供了一种所述的乳腺癌预后相关mirna组合物、所述的乳腺癌预后相关mirna组合物的检测产品在建立预测乳腺癌预后风险预测系统中的应用。

13、在本发明实施例的第四方面，提供了一种预测乳腺癌预后风险预测系统，所述预测系统的计算公式如下：

14、其中，

15、所述基因i包括mir-30a、mir-31、mir-505和mir-887；

16、所述基因i的表达水平为乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平；

17、所述基因i的系数为将乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平进行cox多因素回归分析后获得。

18、由于不同的样本，不同的检测手段所获得的表达水平不同，因此所测得的基因i的系数会有所不同。

19、作为一种具体的实施方式，本发明实施例中基因i的系数中基因mir-30a、mir-31、mir-505和mir-887的系数分别为-0.323、-0.376、0.317、0.503。

20、具体地，风险评分＝(-0.323×mir-30a exp)+(-0.376×mir-31exp)+0.317×mir-505exp+0.503×mir-887exp。上述公式中，exp为相应的mirna的表达水平；

21、进一步地，所述乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平的测定方法包括pcr、基因芯片、二代高通量测序、panomics或nanostring宏基因组测序中的任意一种或至少两种的组合。

22、在本发明实施例的第五方面，提供了所述预测系统在制备预测乳腺癌风险产品中的应用，所述系统的输入变量为所述的乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平，即可获得乳腺癌风险的预测分值。

23、在本发明实施例的第六方面，提供了一种乳腺癌预后风险预测系统，所述系统包括：

24、处理器和存储器，所述存储器耦接到所述处理器，所述存储器存储指令，当所述指令由所述处理器执行时使用以下步骤：

25、将乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平输入所述预测系统中，获得乳腺癌预后风险预测分值。

26、在本发明实施例的第七方面，提供了一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时使用以下步骤：

27、根据输入的乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平输入所述预测系统中，经过计算获得乳腺癌预后风险预测分值。

28、在本发明实施例的第八方面，提供了一种乳腺癌预后预测诊断产品，包括：

29、乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平测定产品；

30、或所述的乳腺癌预后风险预测系统或所述的计算机可读存储介质。

31、本发明实施例中的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

32、本发明实施例提供的乳腺癌预后相关mirna组合物及其在制备乳腺癌预后预测诊断产品中的应用，多变量cox回归分析显示本发明开发的由mir-30a、mir-31、mir-505和mir-887组成的预后评分系统明显优于其他研究报道的基因评分系统。基于4个与er阳性乳腺癌预后相关的mirna表达的风险评分，并结合临床病理因素，通过cox回归分析构建了mirna－临床预测模型。相比于单个mi-rna，该模型能提高er阳性乳腺癌患者预后预测的敏感性和特异性，更准确地预测患者预后，在患者选择个体化治疗方案方面具有重要的参考价值。

技术特征：

1.一种乳腺癌预后相关mirna组合物，其特征在于，所述乳腺癌预后相关mirna组合物由mir-30a、mir-31、mir-505和mir-887组成。

2.一种乳腺癌预后相关mirna组合物的检测产品，其特征在于，包括检测权利要求1所述乳腺癌预后相关mirna组合物在乳腺癌组织中的表达水平的产品。

3.根据权利要求2乳腺癌预后相关mirna组合物的检测产品，其特征在于，所述检测产品包括：乳腺癌预后相关mirna组合物的探针和引物。

4.一种权利要求1所述的乳腺癌预后相关mirna组合物、权利要求2-3所述的乳腺癌预后相关mirna组合物的检测产品在建立预测乳腺癌预后风险预测系统以及制备乳腺癌预后预测诊断产品中的应用。

5.一种预测乳腺癌预后风险预测系统，其特征在于，所述预测系统的计算公式如下：

6.根据权利要求5所述的一种预测乳腺癌预后风险预测系统，其特征在于，所述乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平的测定方法包括pcr、基因芯片、二代高通量测序、panomics或nanostring宏基因组测序中的任意一种或至少两种的组合。

7.一种权利要求5-6任一所述预测系统在制备预测乳腺癌风险产品中的应用，其特征在于，所述系统的输入变量为权利要求1所述的乳腺癌预后相关mirna组合物的表达水平，即可获得乳腺癌风险的预测分值。

8.一种乳腺癌预后风险预测系统，其特征在于，所述系统包括：

9.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时使用以下步骤：

10.一种乳腺癌预后预测诊断产品，其特征在于，包括：

技术总结
本发明公开了一种乳腺癌预后相关miRNA组合物及其在制备乳腺癌预后预测诊断产品中的应用，所述乳腺癌预后相关miRNA组合物由miR‑30a、miR‑31、miR‑505和miR‑887组成。本发明基于4个与ER阳性乳腺癌预后相关的miRNA表达的风险评分，并结合临床病理因素，通过Cox回归分析构建了miRNA－临床预测模型。相比于单个mi‑RNA，该模型能提高ER阳性乳腺癌患者预后预测的敏感性和特异性，更准确地预测患者预后，在患者选择个体化治疗方案方面具有重要的参考价值。

技术研发人员：张京伟,杨燕,魏蕾,田毅浩,李俊,万慧芳,胡美顺
受保护的技术使用者：武汉大学中南医院
技术研发日：
技术公布日：2024/1/14