本发明涉及一种用于鉴定细菌和真菌群体感应自诱导物的基于密度依赖关系的方法及实例,适用于生物医学、农业、生物技术等领域。
背景技术:
1、群体感应(quorum sensing, qs)在微生物间的通讯中发挥着关键作用。识别群体感应自诱导物对于理解微生物间的通讯和开发新的疗法具有重要意义。尽管目前已有某些方法用于研究群体感应,但这些方法可能存在局限性,比如仅适用于部分真菌和细菌的自诱导物发现。因此,一种可适用于所有真菌和细菌的自诱导物发现的通用方法十分必要。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种基于密度依赖关系的细菌和真菌群体感应自诱导物鉴定方法及实例。具体步骤包括:
2、选取有代表性的细菌和真菌种类作为研究对象,如丁香假单胞菌(细菌)和真菌链格孢菌;
3、采集生长过程中的细菌和真菌样本,并对其进行代谢物组分析,生成代谢组谱图;
4、分析代谢物的浓度与微生物个体密度之间的关系,筛选出随着细菌或真菌生物量增加而浓度同时增加的次级代谢产物作为潜在自诱导物;
5、利用生物学实验验证筛选出的潜在自诱导物的群体感应活性。
6、本发明的优点在于,提供的方法适用于所有真菌和细菌的自诱导物发现,有助于深入了解微生物交流,为开发医学及生物技术策略提供了新途径。实例采用丁香假单胞菌和真菌链格孢菌作为模型,通过代谢组学分析和生物学实验等步骤,成功获得了自诱导物活性的化合物。
7、实施方式
8、以下将结合具体实施方式对本发明进行详细描述,以便更好地理解本发明。
9、实施方式1
10、采用丁香假单胞菌作为研究对象,选取生长过程中的样本,将其进行代谢物组分析,并生成代谢组谱图。通过分析代谢物的浓度与细菌个体密度之间的关系,筛选出随着细菌生物量增加而浓度同时增加的次级代谢产物,如4-羟基脯氨酸作为潜在自诱导物。最后,利用生物学实验验证筛选出的潜在自诱导物4-羟基脯氨酸的群体感应活性。
11、实施方式2
12、选择真菌链格孢菌作为研究对象,采集生长过程中的真菌样本,并进行代谢物组分析,生成代谢组谱图。分析代谢物浓度与真菌个体密度之间的关系,筛选出随着真菌生物量增加而浓度同时增加的次级代谢产物,如l-色氨酸作为潜在自诱导物。最后,应用生物学实验验证筛选出的潜在自诱导物l-色氨酸的群体感应活性。
1.一种基于密度依赖关系的细菌和真菌群体感应自诱导物鉴定方法,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的方法,所述步骤1中的有代表性的可培养的细菌和真菌。
3.根据权利要求1所述的方法,所述步骤4中通过生物学实验获得的自诱导物活性的化合物。
4.本发明的详细描述和实施方式主要用于说明本发明的实施范围,而并非对本发明的保护范围做出限定。对于本领域的技术人员来说,许多变化和修饰都很明显,这些变化和修饰应认为附在本发明所附的权利要求范围内。