用于鉴定降香品种的SSR分子标记的引物组及应用

本发明涉及分子生物学，具体涉及用于鉴定降香品种的ssr分子标记的引物组及应用。

背景技术：

1、降香檀(dalbergia odorifera t.chen)，为豆科(leguminosae)黄檀属(dalbergia)乔木，多年生木本植物，国产降香唯一来源树种。降香檀常作为园林绿化植物，其心材是传统珍稀名贵中药，具有行气活血、止痛、抗炎、抗菌等功效。同时，还是五属八类29种名贵红木之一，为古代道教的十大名香之一，被誉为“百香之首”。由于其心材具有巨大的经济和文化价值，导致野生资源遭受严重破坏趋于枯竭，被列为国家二级重点保护野生植物，2017年被列入《濒危野生动植物物种国际贸易公约》(cites)附录ii。

2、近三十余年降香檀人工种植面积暴增，除道地产区海南外，已在广东、广西、云南，浙江、四川、江西等地引种成功并大面积种植，全国总面积已达到60多万亩。苗期降香檀与海南黄檀等近缘物种相似，极难分辨，通常要到降香檀心材形成后才能通过心材颜色、外观等指标进行分辨。因降香檀心材形成缓慢，一般7-10年才开始形成，成材需三四十年以上，且只能砍树才能辨认心材，为广大种植户带来巨大经济损失。目前降香檀还未开展系统的选育工作，通过对海南降香檀资源调查发现，降香檀生长参差不齐，且心材产量和心材品质存在显著差异，民间一直有糠黎和油黎之分，这将成为制约降香檀人工林可持续发展的重要因素。如何快速鉴定降香檀品种目前没有很好的方法。

3、简单重复序列ssr(simple sequence repeats)标记是由1-8bp的核心序列串联重复多次组成的寡核苷酸序列，是发展比较成熟的一种以特异引物pcr为基础的分子标记技术。ssr标记具有多态性丰富、位点广泛覆盖基因组、片段简单、扩增容易且稳定、检测自动化等优点，非常适合物种的鉴定和品种选育。有研究利用ssr分子标记鉴定降香檀和其他黄檀属植物，但未见关于利用ssr分子标记进行不同地理区域降香品种鉴定的研究报道。

技术实现思路

1、鉴于现有技术的不足，本发明提出用于鉴定降香品种的ssr分子标记的引物组及应用。

2、本发明技术方案如下：

3、提供了一组用于鉴定降香品种的ssr分子标记的引物组，包括15对引物；

4、引物对1由seq id no.1和seq id no.2所示的序列组成；

5、引物对2由seq id no.3和seq id no.4所示的序列组成；

6、引物对3由seq id no.5和seq id no.6所示的序列组成；

7、引物对4由seq id no.7和seq id no.8所示的序列组成；

8、引物对5由seq id no.9和seq id no.10所示的序列组成；

9、引物对6由seq id no.11和seq id no.12所示的序列组成；

10、引物对7由seq id no.13和seq id no.14所示的序列组成；

11、引物对8由seq id no.15和seq id no.16所示的序列组成；

12、引物对9由seq id no.17和seq id no.18所示的序列组成；

13、引物对10由seq id no.19和seq id no.20所示的序列组成；

14、引物对11由seq id no.21和seq id no.22所示的序列组成；

15、引物对12由seq id no.23和seq id no.24所示的序列组成；

16、引物对13由seq id no.25和seq id no.26所示的序列组成；

17、引物对14由seq id no.27和seq id no.28所示的序列组成；

18、引物对15由seq id no.29和seq id no.30所示的序列组成。

19、另一方面，本发明还提供了所述引物组在降香品种鉴定中的应用。

20、进一步的，其可以用于苗期鉴定降香品种。

21、与现有技术相比，本发明的有益成果在于：

22、本发明提供的引物组可以用于筛选降香特异品种，为发现新的优质品种提供有效手段。利用该引物组可以将具有紫色心材的降香种苗和黄色心材的降香种苗区分开。

23、利用本发明的引物组，无需等到心材形成，在苗期即可准确鉴定出能结出紫色心材的降香种苗，鉴定准确率高，能够保证树木成材后心材品质好，明确种植品种，减少种植户种植十余年的风险，具有重大的经济效益，对区分油黎和糠黎，油黎品种的推广具有重大的现实意义。

技术特征：

1.用于鉴定降香品种的ssr分子标记的引物组，其特征在于，包括15对引物；引物对1由seq id no.1和seq id no.2所示的序列组成；

2.权利要求1所述的引物组在降香品种鉴定中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，在苗期鉴定降香品种。

技术总结
本发明提供用于鉴定降香品种的SSR分子标记的引物组及应用，先提取降香种苗的DNA，再用本发明特异SSR引物组进行PCR扩增，扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离条带，染色，即可根据分离出的条带情况鉴定出降香品种。利用上述引物组鉴定降香品种，无需等到心材形成，在苗期即可准确鉴定出降香优良品种，加快降香林木育种的速度，有效解决降香野生资源匮乏，心材形成周期长无法提前确定品种等问题，具有巨大的社会和经济效益。

技术研发人员：孟慧,李佳文,祝远静,何文杰,杨云
受保护的技术使用者：中国医学科学院药用植物研究所海南分所
技术研发日：
技术公布日：2024/1/15