增强子RNA功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用

本发明涉及于基因工程及肿瘤医学领域，具体涉及一种增强子rna功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用。

背景技术：

1、结直肠癌作为一种常见的消化道恶性肿瘤，严重威胁我国人民的健康，其发病率和死亡率在我国恶性肿瘤中分别位列第三位和第二位。随着人口老龄化的加剧以及居民生活方式和饮食结构的改变，我国结直肠癌的发病率和死亡率呈现逐年上升趋势，成为我国亟待解决的重大公共卫生问题。目前，针对结直肠癌最有效的筛查方法是粪便隐血检查(fit)结合结肠镜检查。但是，这些方法存在检出率不高以及患者接受度不高等弊端。因此，需要更加便捷精准的方法对结直肠癌的高危个体开展筛查和早期诊断，提高患者的接受度更高，从而为国家节省大量的医疗支出。

2、近年来，以分子遗传学为基础的个体化筛查方案，成为结直肠癌高危人群筛查的重点。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)作为一类最常见的遗传变异，能够反映个体的遗传背景差异，已被证实与肿瘤的发生风险相关。迄今为止，全基因组关联研究(genome-wide association study，gwas)已经鉴别出了一系列与中国人群结直肠癌易感性密切相关的遗传变异位点。然而，鉴定出的大部分结直肠癌相关位点位于基因组的非编码区域，揭示这些统计学关联背后真正起作用的功能性遗传变异及其潜在的生物学机制仍然十分困难，为此，研究人员利用一种基于数量性状位点(quantitative traitloci，qtl)的分析方法系统挖掘真正的功能snp。非编码区域包含着许多顺式调控元件，其中增强子在基因表达调控中起着至关重要的作用。随着高通量测序技术的快速发展，活性增强子被发现可以转录出一种非编码rna，称为增强子rna(enhancer rna，erna)，它们能够激活增强子活性、促进增强子-启动子环的形成,从而激活下游基因的表达，人类的许多癌症和疾病都与erna的异常表达有关。此外，研究报道位于增强子上的遗传变异通过影响erna的产生，从而进一步影响疾病的发生。因此，在全基因组范围内系统鉴定影响erna表达的遗传变异(enhancer rna quantitative trait locus,ernaqtl)，是解析易感位点生物学功能的一个重要的切入点，同时鉴定出的snp标记可以应用于中国人群结直肠癌高危个体的识别、早期筛查和辅助诊断。

技术实现思路

1、本发明的目的在于克服现有技术的不足，本发明的目的是提供一种增强子rna功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用。

2、具体为增强子rna功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用。

3、检测试剂包括增强子rna功能性位点rs3094296的特异性扩增引物和特异性探针，所述特异性扩增引物序列为seq id no：1和seq id no：2，特异性探针序列为seq id no：3和seq id no：4。

4、本发明的有益效果为：本发明从分子生物学及基因诊断水平上，提供了筛选结直肠癌高危人群的技术方法。通过结合结直肠癌ernaqtls遗传图谱和大规模人群验证显示，rs3094296位点与中国人群的结直肠癌易感性相关。通过针对rs3094296位点进行巧妙的引物和探针设计，能够依靠荧光定量pcr，即可对正常人群进行rs3094296变异的检测，从而鉴别结直肠癌的高危人群，辅助结直肠癌患者的早期筛查及诊断。该技术方法设计巧妙、简易可行、结果准确可靠，可在各级医院进行推广，对于评估结直肠癌的患病风险提供了帮助，有助于临床上对该类人群进行结直肠癌筛查和早期干预。

技术特征：

1.增强子rna功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用。

2.根据权利要求1的应用，其特征在于，检测试剂包括增强子rna功能性位点rs3094296的特异性扩增引物和特异性探针，所述特异性扩增引物序列为seq id no：1和seq id no：2，特异性探针序列为seq id no：3和seq id no：4。

技术总结
本发明涉及增强子RNA功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用，基于前期大规模人群数据以及生物功能学实验，我们发现rs3094296位点与中国人群的结直肠癌易感性相关，其作用机制为rs3094296位点通过转录eRNA SENP7e来促进靶基因SENP7的表达，最终抑制癌细胞的增殖。通过对rs3094296位点进行精确地引物和探针设计，能够依靠荧光定量PCR，即可对正常人群进行rs3094296位点的检测，从而鉴别结直肠癌的高危人群。本技术方法设计巧妙、简易可行、结果准确可靠，对于结直肠癌患者的早期筛查及诊断提供了帮助，有助于临床上对该类人群进行早期干预。

技术研发人员：田剑波,缪小平,蔡祎旻,鲁泽群,金梦
受保护的技术使用者：武汉大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/16