一种HNRNPC-RARG-HNRNPC融合基因及其检测引物组和应用的制作方法

本发明属于医学检验领域，涉及一种hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因及其检测引物组和应用。

背景技术：

1、白血病是一种常见的血液疾病，它的发病率在近年来不断上升，给人们的生命健康带来了威胁。而在白血病的疾病因素中，基因的作用越来越受到人们的关注。急性早幼粒细胞白血病(apl)是一种独特的急性白血病亚型，在fab分类中称为aml-m3，其特点是恶性早幼粒细胞占优势，维甲酸受体α基因(rara)重排是apl典型的特征。

2、15号染色体和17号染色体之间相互易位形成pml-rarα融合基因，pml-rara竞争性控制维甲酸应答对转录产生负性影响，抑制其表达生理性配体的激活，并导致早幼粒细胞停滞分化。然而，也有一些罕见的患者缺乏rara基因重排，但他它们具有相同的形态学和免疫细胞化学特征，这类白血病也称为急性早幼粒细胞样白血病(apll)。近年来，在apll中发现了rarg和rarb重排。rarg基因是核激素受体超家族的成员，rarg基因位于12q13，与rarα和rarb具有高度的同源性。pml-rarα融合基因易位有助于对apl的诊断，因为它存在于98％以上的apl病例中，另有低于2％的apl患者为其他类型融合基因。检测pml-rarα融合基因是诊断apl的最特异、敏感的方法之一，也是apl治疗方案选择、疗效评价、预后分析和复发预测最可靠的指标。如一项中国发明专利“一种融合基因pml-rarα检测用试剂盒及其检测方法与应用”(公开日：2023.03.28，公开号：cn115851925)，pml-rarα融合基因进行检测。但对rarg融合仅见于少数apl患者，其伙伴基因为nup98、npm1、pml和cpsf6。目前为止，rarα基因研究比较成熟，但对于rarb和rarg重排知之甚少。

技术实现思路

1、基于上述缺点，本发明提供了新的急性早幼粒细胞白血病的融合基因及其应用。

2、因此本发明第一方面提供一种hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因，包括hnrnpc基因，所述hnrnpc基因的3号外显子与4号外显子之间插入有rarg基因的4-9号外显子。

3、所述融合基因包括第一融合位点与第二融合位点，所述第一融合位点位于seq idno.1所示的核酸片段中，所述第二融合位点位于seq id no.2所示的核酸片段中。

4、本发明第二方面提供一种hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的融合片段，所述融合片段包括seq id no.1和/或seq id no:2所示的核苷酸序列。

5、本发明第三方面提供一种检测急性早幼粒细胞白血病融合基因分型的引物组，所述引物组特异识别hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因或其融合片段。

6、所述引物组包括序列seq id no.3～6所示的引物。

7、本发明第四方面提供一种检测急性早幼粒细胞白血病融合基因分型的试剂盒，包括上述的引物组，和/或上述的融合片段。

8、本发明第五方面提供一种以非疾病诊断和/或治疗为目的的检测急性早幼粒细胞白血病融合基因分型方法，所述急性早幼粒细胞白血病融合基因分型为hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因分型，所述方法包括使用上述引物组或使用上述试剂盒对待测样本进行聚合酶链式反应。

9、本发明第六方面提供检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的检测物或如上所述的融合片段在制备急性早幼粒细胞白血病融合基因分型检测产品中的应用。

10、所述hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因为上述融合基因；所述检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的检测物特异性识别hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因或其融合片段。

11、所述检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的检测物包括权利要求上述引物组，或上述试剂盒。

12、本发明的有益效果在于：

13、1.本申请披露一种新的融合基因hnrnpc-rarg-hnrnpc，并特异性设计检测引物对，用于检测白血病新的分型。

14、2.本申请的引物对是对原有rarg易位性白血病融合基因引物的补充，扩展了rarg易位性白血病融合基因的类型，增加了pcr方法诊断白血病的检出率，提高了检测的准确度。

15、3.本申请检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的方法只需要进行1次多重pcr扩增即可完成，操作简单方便，检测周期短，能够更好的满足临床样本检测的使用需求。

16、4.本申请可为非诊断治疗目的的白血病分型检测、为白血病的治疗方案制定和预后评估提供中间参考依据。

技术特征：

1.一种hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因，包括hnrnpc基因，所述hnrnpc基因的3号外显子与4号外显子之间插入有rarg基因的4-9号外显子。

2.根据权利要求1所述的hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因，其特征在于：所述融合基因包括第一融合位点与第二融合位点，所述第一融合位点位于seq id no.1所示的核酸片段中，所述第二融合位点位于seq id no.2所示的核酸片段中。

3.一种hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的融合片段，所述融合片段包括seq id no.1和/或seq id no:2所示的核苷酸序列。

4.一种检测急性早幼粒细胞白血病融合基因分型的引物组，所述引物组特异识别hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因或其融合片段。

5.根据权利要求4所述的引物组，其特征在于：所述引物组包括序列seq id no.3～6所示的引物；

6.一种检测急性早幼粒细胞白血病融合基因分型的试剂盒，包括权利要求4或5任一项所述的引物组，和/或权利要求3所述融合片段。

7.一种以非疾病诊断和/或治疗为目的的检测急性早幼粒细胞白血病融合基因分型方法，其特征在于：所述急性早幼粒细胞白血病融合基因分型为hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因分型，所述方法包括使用权利要求4-5任一项所述引物组或使用权利要求6所述试剂盒对待测样本进行聚合酶链式反应。

8.检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的检测物或如权利要求3所述的融合片段在制备急性早幼粒细胞白血病融合基因分型检测产品中的应用。

9.如权利要求8所述的应用，其特征在于，所述hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因为权利要求1或2所述融合基因；和/或，所述检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的检测物特异性识别hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因或其融合片段。

10.如权利要求8所述的应用，其特征在于，所述检测hnrnpc-rarg-hnrnpc融合基因的检测物包括权利要求4-5任一所述引物组，或权利要求6所述试剂盒。

技术总结
本发明提供一种HNRNPC‑RARG‑HNRNPC融合基因及其检测引物组和应用，所述HNRNPC‑RARG‑HNRNPC融合基因包括HNRNPC基因，所述HNRNPC基因的3号外显子与4号外显子之间插入有RARG基因的4‑9号外显子。所述引物组特异识别HNRNPC‑RARG‑HNRNPC融合基因或其融合片段。本发明还提供一种检测HNRNPC‑RARG‑HNRNPC融合基因的方法，对待测样本进行聚合酶链式反应并通过电泳判断结果。本申请发现了一种新的融合基因HNRNPC‑RARG‑HNRNPC，并特异性设计检测引物对，可用于检测白血病新的分型，制备急性早幼粒细胞白血病融合基因分型检测产品。

技术研发人员：苏燕辉,曹文治,张瑜,魏超,李琰,叶茂,邓小净,黄士昂,朱晓燕
受保护的技术使用者：上海新培晶医学检验所有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/3/17