本发明涉及生物,尤其是涉及m6a甲基转移酶复合物相关基因的sirna及其应用。
背景技术:
1、m6a(6-甲基腺嘌呤,n6-methyladenosine)甲基化,即在rna腺苷酸(a)第六位的n上发生甲基化修饰,是真核生物rna中最常见的一种转录后修饰,约占rna甲基化修饰的80%左右。
2、m6a rna甲基化是一个动态可逆的修饰过程,该过程需要在m6a甲基转移酶复合物(编码器,writers)、m6a去甲基化酶(消码器,erasers)和m6a读取蛋白(读码器,readers)的参与下催化形成。
3、m6a甲基转移酶复合物(编码器,writers)以s-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,催化rna上的m6a甲基化修饰形成,主要组分有甲基转移酶样蛋白3(mettl3)、甲基转移酶样蛋白14(mettl14)、wilms肿瘤1相关蛋白(wtap)、rna结合基序蛋白15(rbm15)、rna结合基序蛋白15b(rbm15b)及病毒样m6a转移酶相关蛋白(virma或kiaa1429)等。
4、mettl3是第一个发现的甲基转移酶,为该复合体的核心亚基,起主要的催化作用。mettl14本身不具有甲基转移能力,但能与mettl3以1:1的比例结合,形成稳定的异源二聚体,作为rna结合支架,变构激活并增强mettl3催化活性。wtap具有稳定核心复合物的功能,可以促进mettl3-mettl14复合物定位于富含mrna剪切因子和出核转运因子的核小斑。rbm15、rbm15b、kiaa1429也是m6a甲基转移酶复合物的组成部分,结合并募集复合物至特定位点,影响甲基化修饰过程。
5、m6a甲基化修饰主要在mrna前体的剪接、3’端加工、核输出、翻译调节、mrna衰变、mrna的稳定性、环状rna翻译和mirna加工等多个过程中发挥作用,其动态可逆的变化控制对细胞的生长和分化具有重要的调节作用,使得m6a及修饰蛋白的异常在多种重大疾病的发生过程中扮演重要角色。例如,以mettl3和mettl14为主的m6a编码器发挥着促进肿瘤细胞生长、存活和侵袭的作用;mettl3高表达促进包括肝癌、乳腺癌及膀胱癌在内的多种癌症的发生发展;m6a甲基化可以调控造血干细胞定向分化、调控精子发生等。然而目前并没有针对m6a甲基转移酶的靶向治疗药物,因此,开发针对m6a甲基转移酶相关基因靶点的药物尤为迫切。
6、sirna(小干扰rna)是一段与靶基因序列同源的、长度在20-25nt的双链rna,可以特异性地引起具有相同序列的mrna的降解,从而阻断相应基因的表达,进而治疗该基因引起的各类疾病。
7、现有的技术中,目前并没有针对m6a甲基转移酶的靶向治疗药物,本发明针对m6a甲基转移酶相关基因设计sirna并有效干扰基因表达,有望突破m6a甲基转移酶相关基因引起的疾病治疗方面的瓶颈。
技术实现思路
1、针对现有技术存在的不足,本发明的目的是提供m6a甲基转移酶复合物相关基因的sirna及其应用,其针对m6a甲基转移酶设计特异性sirna作为靶向治疗药物,sirna寡聚核酸组合可以有效抑制包含mettl3、mettl14、wtap、rbm15、rbm15b、kiaa1429在内的甲基转移酶的表达,抑制其生物学功能的发挥。
2、本发明的上述发明目的是通过以下技术方案得以实现的:
3、m6a甲基转移酶复合物相关基因的sirna,包含mettl3、mettl14、wtap、rbm15、rbm15b、kiaa1429在内的甲基转移酶的sirna寡聚核酸组合。
4、作为本发明的进一步的技术方案:所述sirna为一种核酸分子,包括gp-mettl3-6、gp-mettl3-8、gp-mettl14-2、gp-mettl14-4、gp-mettl14-6、gp-mettl14-8、gp-wtap-1、gp-wtap-2、gp-wtap-3、gp-wtap-4、gp-rbm15-10、gp-rbm15b-3、gp-kiaa1429-1、gp-kiaa1429-3、gp-kiaa1429-5、gp-kiaa1429-6。
5、作为本发明的进一步的技术方案:所述核酸分子为双链rna分子。
6、作为本发明的进一步的技术方案:所述gp-mettl3-6由如下序列的正义链和反义链组成:
7、正义链:5’-gauugaguuauuuggacgatt-3’,
8、反义链:5’-ucguccaaauaacucaauctt-3’;
9、所述gp-mettl3-8由如下序列的正义链和反义链组成:
10、正义链:5’-caguggaucuguugugauatt-3’,
11、反义链:5’-uaucacaacagauccacugtt-3’。
12、作为本发明的进一步的技术方案:所述gp-mettl14-2由如下序列的正义链和反义链组成:
13、正义链:5’-guuuagcugacagauuugatt-3’,
14、反义链:5’-ucaaaucugucagcuaaactt-3’;
15、所述gp-mettl14-4由如下序列的正义链和反义链组成:
16、正义链:5’-ggacuucauucaugcuaautt-3’,
17、反义链:5’-auuagcaugaaugaagucctt-3’;
18、所述gp-mettl14-6由如下序列的正义链和反义链组成:
19、正义链:5’-agauaaggaaugagugauatt-3’,
20、反义链:5’-uaucacucauuccuuaucutt-3’;
21、所述gp-mettl14-8由如下序列的正义链和反义链组成:
22、正义链:5’-gggaugauauuaugaaguutt-3’,
23、反义链:5’-aacuucauaauaucauccctt-3’。
24、作为本发明的进一步的技术方案:所述gp-wtap-1由如下序列的正义链和反义链组成:
25、正义链:5’-gugaacuggaacagacuaatt-3’,
26、反义链:5’-uuagucuguuccaguucactt-3’;
27、所述gp-wtap-2由如下序列的正义链和反义链组成:
28、正义链:5’-cuggaaguuuacgccugautt-3’,
29、反义链:5’-aucaggcguaaacuuccagtt-3’;
30、所述gp-wtap-3由如下序列的正义链和反义链组成:
31、正义链:5’-cugagugccuggaaguuuatt-3’,
32、反义链:5’-uaaacuuccaggcacucagtt-3’;
33、所述gp-wtap-4由如下序列的正义链和反义链组成:
34、正义链:5’-ggaacagacuaaagacaaatt-3’,
35、反义链:5’-uuugucuuuagucuguucctt-3’。
36、作为本发明的进一步的技术方案:所述gp-rbm15-10由如下序列的正义链和反义链组成:
37、正义链:5’-guacacaagauuucuggaatt-3’,
38、反义链:5’-uuccagaaaucuuguguactt-3’。
39、作为本发明的进一步的技术方案:所述gp-rbm15b-3由如下序列的正义链和反义链组成:
40、正义链:5’-ccacgucuaugcauauccutt-3’,
41、反义链:5’-aggauaugcauagacguggtt-3’。
42、作为本发明的进一步的技术方案:所述gp-kiaa1429-1由如下序列的正义链和反义链组成:
43、正义链:5’-gaagccuggaauaugaugatt-3’,
44、反义链:5’-ucaucauauuccaggcuuctt-3’;
45、所述gp-kiaa1429-3由如下序列的正义链和反义链组成:
46、正义链:5’-ggaagaaggugaagaggautt-3’,
47、反义链:5’-auccucuucaccuucuucctt-3’;
48、所述gp-kiaa1429-5由如下序列的正义链和反义链组成:
49、正义链:5’-ggaucaagguccagauaaatt-3’,
50、反义链:5’-uuuaucuggaccuugaucctt-3’;
51、所述gp-kiaa1429-6由如下序列的正义链和反义链组成:
52、正义链:5’-gaagucaguagcuuauaautt-3’,
53、反义链:5’-auuauaagcuacugacuuctt-3’。
54、如上述的m6a甲基转移酶复合物相关基因的sirna在m6a甲基转移酶相关基因引起的疾病治疗方面的应用。
55、如上述的m6a甲基转基酶复合物相关基因的sirna的检测试剂盒,包含mettl3、mettl14、wtap、rbm15、rbm15b、kiaa1429的引物。
56、作为本发明的进一步的技术方案:所述mettl3由如下序列的上游引物和下游引物组成:
57、上游引物:5’-gggaccctgacagatgatgag-3’,
58、下游引物:5’-tccgaatgatgcgttgca-3’;
59、所述mettl14由如下序列的上游引物和下游引物组成:
60、上游引物:5’-agacactggacatagacctcaga-3’,
61、下游引物:5’-cctttagcctgatgagctccc-3’;
62、所述wtap由如下序列的上游引物和下游引物组成:
63、上游引物:5’-ggaagtttacgcctgatagcc-3’,
64、下游引物:5’-tcaagttgtgcaatacgtccct-3’;
65、所述rbm15由如下序列的上游引物和下游引物组成:
66、上游引物:5’-tggtcatgatcattgtccgtg-3’,
67、下游引物:5’-gtcagcgccaagttttctctc-3’;
68、所述rbm15b由如下序列的上游引物和下游引物组成:
69、上游引物:5’-aaagaccacacttctgggagc-3’,
70、下游引物:5’-ttgatgcgtcgtgtgacct-3’;
71、所述kiaa1429由如下序列的上游引物和下游引物组成:
72、上游引物:5’-ctggagtcatcaggtgaccctt-3’,
73、下游引物:5’-catcagcaagcacataggcagt-3’。
74、如上述的m6a甲基转移酶复合物相关基因的sirna在检测试剂盒方面的应用。
75、综上所述,本发明包括以下至少一种有益技术效果:
76、本发明公开了一种m6a甲基转移酶复合物相关基因的sirna及其应用,其针对m6a甲基转移酶设计特异性sirna作为靶向治疗药物,sirna寡聚核酸组合可以有效抑制包含mettl3、mettl14、wtap、rbm15、rbm15b、kiaa1429在内的甲基转移酶的表达,抑制其生物学功能的发挥。