本发明涉及生物检测领域,尤其涉及用于样本的核酸释放扩增组合物、扩增方法、试剂盒及其应用。
背景技术:
1、当前市面上大部分常见的核酸检测试剂形式为液体形态,使用时需要将液体组分1和组分2化冻后,按一定比例混合均匀,再加入经提纯后的样本核酸后进行扩增,此种操作流程需要在专业的pcr实验室进行配液、提取、加样、扩增,过程繁琐、需要经培训的专业人员操作。
2、随着冻干技术在核酸试剂上的广泛应用,目前已有产品采用全组分预混冻干粉或冻干球扩增试剂形式,使用时需先加入复溶液复溶冻干试剂,再加入提纯的核酸,亦或是直接取提纯的核酸复溶冻干试剂,再进行扩增反应。虽然这种冻干试剂形式减少了配液的过程,但样本的提纯操作仍需要大量的手工步骤和专业人员来完成,而且加入复溶液复溶冻干试剂的步骤也会增加人员操作,因复溶后试剂占一定体积,加入核酸样本的量也受到限制。
3、以上技术方案的操作流程有两种,一是样本采集入保存液,取部分样本液加入释放剂裂解,再加入液体扩增试剂中进行扩增;二是样本采集入高浓度裂解剂的释放剂中裂解,高浓度裂解剂加入过多会直接影响下游pcr扩增,因此操作时需先配制液体试剂,仅能取少量样本液加入液体试剂中进行扩增,扩增灵敏度不高。第一种操作流程需要配液、多次转管操作,加入样本液的体积也有一定限制,手工操作步骤较多,灵敏度难以提升。第二种操作流程需要手工配液、加入样本液的体积有一定限制,灵敏度难以提升。
技术实现思路
1、有鉴于此,本发明提供了用于样本的核酸释放扩增组合物、扩增方法、试剂盒及其应用。本发明通过改变释放剂配方组分,降低对下游扩增的抑制,同时采用全组分预混干燥试剂形态,调整干燥试剂组分含量,使原本复杂的操作流程简化为拭子样本加入释放剂中裂解,取部分样本裂解液直接加入干燥试剂中,上机扩增。干燥试剂可实现常温储运使用。
2、为了实现上述发明目的,本发明提供了以下技术方案:
3、本发明提供了用于样本的核酸释放扩增组合物,包括:扩增干试剂和释放剂;
4、所述释放剂包括:裂解剂、rna酶抑制剂和0.2~16.04mm蛋白抑制剂;
5、所述裂解剂包括:10~50mm的强碱、0.1~6%(v/v)的非离子表面活性剂、0.002~0.6%(m/v)的离子表面活性剂;
6、所述扩增干试剂包括:扩增试剂和冻干保护剂。
7、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述扩增试剂包括:4.8~120mm的tricine、3.8~120mm的kcl和0.54~15mm的mgcl2。
8、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括棉子糖、松三糖、β-环糊精、甘露醇、bsa和peg20000。
9、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:2~9%(w/v)的棉子糖、0.5~4%(w/v)的β-环糊精、0.5~9%(w/v)的甘露醇、0.3~3.5%(w/v)的bsa和0.5~6%(w/v)的peg20000。
10、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:2.5~8%(w/v)的棉子糖、1~3.5%(w/v)的β-环糊精、1~8%(w/v)的甘露醇、0.5~3%(w/v)的bsa和1~5%(w/v)的peg20000。
11、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:2%(w/v)、5%(w/v)或9%(w/v)的棉子糖。
12、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:0.5%(w/v)、3%(w/v)或4%(w/v)的β-环糊精。
13、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:0.5%(w/v)、6%(w/v)或9%(w/v)的甘露醇。
14、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:0.3%(w/v)、1%(w/v)或3.5%(w/v)的bsa。
15、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:0.5%(w/v)、3.5%(w/v)或6%(w/v)的peg20000。
16、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述干燥保护剂包括:5%(w/v)的棉子糖、3%(w/v)的β-环糊精、6%(w/v)的甘露醇、1%(w/v)的bsa和3.5%(w/v)的peg20000。
17、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述扩增干试剂还包括:缓冲液、酶、引物和/或探针中的一种或多种。
18、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述释放剂稀释扩增干试剂中的酶、引物、探针的终浓度至:
19、每扩增反应包括0.2~0.6μm的靶序列引物探针组,3~20u的taq dna聚合酶、200u的逆转录酶和/或rtth酶和/或bst酶。
20、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中所述强碱包括koh和/或naoh;
21、所述非离子表面活性剂包括聚氧乙烯月桂醚和/或tritonx-100;
22、所述离子表面活性剂包括十二烷基硫酸钠;
23、rna酶抑制剂包括2~100μg/ml的聚乙烯磺酸钠和/或0.5~3mm的金属离子螯合剂。
24、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中所述聚氧乙烯月桂醚的别名为4-(1,1,3,3-四甲基丁基)苯基-聚乙二醇,t-辛基苯氧基聚乙氧基乙醇,聚乙二醇叔辛基苯醚,线性分子式:t-oct-c6h4-(och2ch2)xoh,x=9-10)。
25、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述蛋白抑制剂包括厄多司坦和/或tcep。
26、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述tcep的别名为三(2-羧乙基)膦)。
27、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述裂解剂包括:40mm的naoh、3%(v/v)的聚氧乙烯月桂醚和0.02%(m/v)的sds;或
28、40mm的naoh、3%(v/v)的聚氧乙烯月桂醚、0.02%(m/v)的sds和4%(v/v)的tritonx100。
29、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述rna酶抑制剂包括:55μg/ml的聚乙烯磺酸钠。
30、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述蛋白抑制剂包括:4mg/ml的厄多司坦和/或0.2mm的tcep。
31、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述裂解剂还包括:扩增剂、防腐剂和/或消泡剂中的一种或多种。
32、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述扩增剂包括:4%(w/v)的海藻糖和1.5mg/ml的bsa。
33、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述防腐剂包括:0.05%(v/v)的nan3。
34、在本发明的一些实施方案中,上述核酸释放扩增组合物中,所述消泡剂包括:0.3%(v/v)的se-15。
35、本发明还提供了上述核酸释放扩增组合物在制备核酸检测和/或扩增的试剂盒中的应用。
36、本发明还提供了核酸扩增的方法,以核酸释放扩增组合物与待测样本混合后,取部分混合液作为核酸模板加入扩增干试剂中进行核酸扩增;
37、所述混合不包括与保存液混合的步骤;
38、所述核酸扩增包括pcr或等温扩增。
39、在本发明的一些实施方案中,上述方法中,所述核酸为病毒的核酸。
40、在本发明的一些实施方案中,上述方法中,所述病毒为新型冠状病毒。
41、在本发明的一些实施方案中,上述方法中,所述待测样本与所述扩增试剂的体积比为(1~5):(2~1)。
42、在本发明的一些实施方案中,上述方法中,所述待测样本与原液体试剂的体积比值应为1:2~5:1。
43、在本发明的一些实施方案中,上述方法中,所述原液体试剂指冻干球扩增试剂在冻干前呈液体状态的试剂。
44、在本发明的一些实施方案中,核酸扩增的方法中,所述混合液稀释扩增干试剂中的酶、引物、探针的终浓度至:
45、每扩增反应包括0.2~0.6μm的靶序列引物探针组,3~20u的taq dna聚合酶、200u的逆转录酶和/或rtth酶和/或bst酶。
46、本发明还提供了核酸检测试剂盒,包括上述核酸释放扩增组合物以及可接受的助剂或载体。
47、在本发明的一些实施方案中,上述试剂盒中,还包括:dntp混合物、mg2+、甜菜碱、kcl、酶组合物和/或扩增缓冲液中的一种或多种。
48、在本发明的一些实施方案中,上述试剂盒中,还包括:0.15mm dntp混合物、2.5mmmg2+、50mm kcl和/或3m甜菜碱中的一种或多种。
49、在本发明的一些实施方案中,上述试剂盒中,所述酶组合物包括:5u taq dna聚合酶、200u逆转录酶、0.5u或40u ung酶,或10u rtth酶,或8ubst酶。
50、在本发明的一些实施方案中,上述试剂盒中,所述扩增缓冲液包括:2.5%tween20/tween80。
51、在本发明的一些实施方案中,上述试剂盒中,所述mg2+以氯化镁或硫酸镁的形式添加。
52、本发明还提供了冻干球的制备方法,包括:取所述扩增试剂配制成预混液,使用自动化分液设备将预混液滴入冻干容器内,滴液体积可为15μl~50μl,再将含有预混液的冻干容器放入冻干机内冻干。
53、在本发明的一些实施方案中,上述制备方法中,所述冻干程序包括:预冻保温阶段:-40℃2小时,抽真空;一次干燥阶段:-30℃9小时;二次干燥阶段:15℃2小时,35℃4小时。
54、本发明还提供了风干形式的扩增试剂的制备方法:取所述扩增试剂配制成预混液,使用自动化分液设备将预混液滴入容器表面,滴液体积可为5nl~30μl,再将滴有风干试剂的风干容器敞口放置于相对湿度低于rh30%的车间风干30min,或放置于鼓风干燥箱中45℃烘干5小时。
55、在本发明的一些实施方案中,上述试剂盒中,所述引物包括:引物1~引物4中的一种或多种;
56、所述引物1具有如seq id no:1所示的序列:ccctgtgggttttaca cttaa。
57、所述引物2具有如seq id no:2所示的序列:acgattgtgcatcag ctga。
58、所述引物3具有如seq id no:3所示的序列:ccgtctgcggtatgt ggaaaggttatg。
59、所述引物4具有如seq id no:4所示的序列:ggggaacttctc ctgctagaat。
60、在本发明的一些实施方案中,上述探针包括:探针1和/或探针2;
61、所述探针1具有如seq id no:5所示的序列:cagacattttgctct caagctg。
62、所述探针2具有如seq id no:6所示的序列:ttgctgctgcttgac agatt。
63、本发明提供了试剂盒,包括:
64、
65、本发明提供了用于样本的核酸释放扩增组合物,包括:扩增干试剂和释放剂;
66、所述释放剂包括:裂解剂、rna酶抑制剂和0.2~16.04mm蛋白抑制剂;
67、所述裂解剂包括:10~50mm的强碱、0.1~6%(v/v)的非离子表面活性剂、0.002~0.6%(m/v)的离子表面活性剂;
68、所述扩增干试剂包括:扩增试剂和冻干保护剂。
69、本发明通过改变释放剂配方组分,降低对下游扩增的抑制,同时采用全组分预混干燥试剂形态,调整干燥试剂组分含量,使原本复杂的操作流程简化为拭子样本加入释放剂中裂解,取部分样本裂解液直接加入干燥试剂中,上机扩增。干燥试剂可实现常温储运使用。