一种羊笔料毛相关的标志物及其检测引物和应用

本发明涉及一种羊笔料毛相关的标志物及其检测引物和应用，具体涉及egr1基因多态性与羊笔料毛表型指标的关联性,通过检测egr1多态性区分笔料毛品质，属于分子生物学。

背景技术：

1、笔料毛作为羊的特异性状，并非是经人们有意识经过长期选择和培育所形成的。在发现笔料毛具有很高的经济价值之前，通常是作为羊的副产品，因此很多羊品种都能产生笔料毛，但是不同品种的羊所产的笔料毛品质差异很大。现有的研究报道认为，影响笔料毛的因素主要包括：生态环境、性别、年龄、体重等。长江三角洲白山羊所产的羊毛，毛色洁白、挺直有峰、具有光泽、弹性好，是制作高档毛笔的独特原料。

2、优质笔料毛种质资源的保护工作陷入了困境，导致目前长江三角洲白山羊生产优质笔料毛的个体越来越少，笔料毛性状逐年下降。因此，亟需开展长江三角洲白山羊笔料毛性状的研究，开发分子标记，为后续笔料毛型长江三角洲白山羊新品系的选育提供科学依据。

技术实现思路

1、为了克服现有技术的不足，本发明的目的包括但不限于提供一种羊笔料毛相关的基因egr1，该基因多态性作为鉴定笔料毛品质的标志物。

2、本发明的另一目的包括但不限于提供一种羊笔料毛相关的egr1基因多态性检测引物和应用。

3、为了实现上述目的，本发明采用了以下技术方案：

4、本发明提供一种与白山羊笔料毛品质相关的标志物，所述标志物为egr1基因，以山羊gcf_001704415.1为参考基因组，其核苷酸突变位点为egr1 g.60660680g＞c。

5、上述羊笔料毛的标志物中，所述egr1基因的野生型序列如seq id no:1所示，突变型序列如seq id no:2所示。

6、本发明提供一种羊笔料毛的标志物引物，所述标志物引物包括如seq id no:3所示的上游引物和如seq id no:4所示的下游引物。

7、本发明还提供上述与羊笔料毛相关的基因多态性标志物引物在检测笔料毛品质中应用。

8、该标志物可以判断白山羊笔料毛性状指标的好坏，从而判断笔料毛品质。

9、一种检测笔料毛品质的方法，包括以下步骤：

10、(1)以包含egr1基因的山羊基因组dna为模板，以引物对p1为引物，pcr扩增山羊egr1基因包含突变位点的片段，所述引物对p1为：

11、上游引物：5′ctggtaggtgctgttgaggg3′

12、下游引物：5′cttccctgagccacaaggc3′；

13、(2)pcr扩增后进行琼脂糖凝胶电泳，回收pcr产物；

14、(3)对pcr产物进行测序，检测egr1基因单核苷酸多态性位点的基因型，gg型白山羊笔料毛品质佳于gc型。

15、本发明的优点是通过本发明提供的特定引物扩增egr1目的片段，检测目的片段基因型，根据不同基因型，如gg型则判断笔料毛品质较好，gc型的笔料毛品质较差。该方法可以做到白山羊笔料毛品质的早期选择，在羔羊出生后直接判断笔料毛优劣，无须等到5-8月龄再进行判断，并且该方法操作简单、检测迅速便捷。

技术特征：

1.一种羊笔料毛相关的标志物，其特征在于，所述标志物为egr1基因，以山羊gcf_001704415.1为参考基因组，其核苷酸突变位点为egr1 g.60660680g＞c。

2.根据权利要求1所述一种羊笔料毛的标志物，其特征在于，所述egr1基因的野生型序列如seq id no:1所示，突变型序列如seq id no:2所示。

3.如权利要求1或2所述一种羊笔料毛的标志物引物，其特征在于，所述标志物引物包括如seq id no:3所示的上游引物和如seq id no:4所示的下游引物。

4.如权利要求3所述的标志物引物在检测笔料毛品质中应用。

5.一种检测笔料毛品质的方法，其特征在于，包括以下步骤：

技术总结
本发明提出了一种白山羊笔料毛相关的标志物，该标志物为EGR1，以山羊GCF_001704415.1为参考基因组，其核苷酸突变位点是EGR1g.60660680G＞C，EGR1野生型序列如SEQ ID NO:1所示，突变型序列如SEQ ID NO:2所示。该标志物可以判断白山羊笔料毛性状指标的好坏，从而判断笔料毛品质。

技术研发人员：吕晓阳,孙伟,薛刚,俞晓荣,施健飞,江峰,王洁,苏鹏伟,顾亦飞
受保护的技术使用者：扬州大学
技术研发日：
技术公布日：2024/4/17