使用分类预测物鉴别胖和瘦动物的方法

文档序号:5110905阅读:1013来源:国知局

专利名称::使用分类预测物鉴别胖和瘦动物的方法
技术领域
:本发明一般地涉及在动物中差别表达的基因,尤其与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因。相关领域的描述在科学界普遍接受的是,基因在动物发育中起作用,且基因表达的调节在有些影响动物的健康和舒适的疾病或状况的发展中起关键作用。类似地,基因的差别表达是这样的疾病和状况的发展中的一个因素,已经认为基因表达^t式的评价对于在分子水平理解这样的疾病和状况的发展和控制是至关重要的。为了进一步理解基因和它们与疾病的关系,已经为研究差别基因表达开发了许多方法,例如,DNA微阵列、表达标记测序(EST)、基因表达的系列分析(SAGE)、减除杂交法、mRNA的减除克隆和差异展示(DD)、RNA-任意引发的PCR(RAP-PCR)、代表性差别分析(RDA)、二维凝胶电泳、质谱法和基于抗体蛋白结合的蛋白微阵列。尚未彻底研究与瘦动物相比胖动物中的基因表达。因此,仍然需要鉴别与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因和由这些基因编码的蛋白。这些基因、蛋白和它们的片段可以用于预测动物可能变胖,诊断动物为肥胖,筛选物质以确定它们是否可能用于调控动物脂肪组织的量,和使用这样的物质来调控动物脂肪组织的量。胖动物可以定义为具有多余的身体脂肪组织的那些动物。一般而言,重量超过它们理想体重的15%的人、犬(canines)和猫(felines)等动物^皮认为是肥胖的。动物肥胖的最常见原因是食物的过量消耗,后者导致卡路里的过量摄入。但是,存在增加动物肥胖的机会的其它因素,例如,生活方式、健康、饮食习惯、品种、卵巢切除和阉割。并且,由于代谢速率和体育活动的普遍减少,动物变胖的发生率通常随着年龄而增加。调查估计,在美国25%的就诊兽医诊所的狗胖至过>11巴胖点。研究已经证实,胖动物明显更易处于关节炎、心脏病、呼吸系统疾病、糖尿病、膀胱癌、甲状腺功能减退症和胰腺炎等疾病的危险中。难以调控动物脂肪组织的量,包括预防动物变胖或治疗胖动物以减少动物的脂肪组织的量或治疗痩动物以增加动物的脂肪组织的量。增加动物脂肪组织的量通常包含增加消耗的食物的量。最有效且最容易的预防动物变胖或减少动物脂肪的量的方式是饮食限制和锻炼。但是,经常难以确保饮食和锻炼计划的依从性。其它方法包括使用药物例如苯丁胺、芬氟拉明、西布曲明、奥利司他和苯丙醇胺。不幸地,这些药物具有副作用。例如,施用芬氟拉明和苯丁胺来治疗人肥胖症,可以导致人的心脏瓣膜损害。西布曲明可以增加血压,奥利司他可能具有使人不快的胃肠副作用。鉴于处理动物脂肪组织的现有方法的问题,仍然需要新的方法和组合物,它们可以用于预测动物可能变胖,i貪断动物为月巴胖,筛选物质以确定它们是否可能用于调控动物脂肪组织的量,和使用这样的物质来调控动物脂肪组织的量。发明概述因此,本发明的一个目的是,提供与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因或基因片l爻。本发明的另一个目的是,提供与瘦动物相比在胖动物中差别表达的两种或多种多核苷酸或多肽的组合。本发明的另一个目的是,提供适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的两种或多种多核苷酸或多肽探针的组合物,和含有这些探针的装置例如基质阵列。ii本发明的另一个目的是,提供用于检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的差别表达的方法和组合物。本发明的另一个目的是,提供测量测试物质对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达镨(profile)的影响的方法,作为筛选测试物质以确定它是否可能用于调控动物脂肪组织的量的方法。本发明的另一个目的是,提供预测动物可能变胖或诊断动物为肥胖的方法。本发明的另一个目的是,提供用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达或用于调控动物脂肪组织的量的方法和组合物。使用295个多核普酸探针的新颖组合,实现了一个或多个这样的其它目的,这些探针代表254种与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因和基因片段。这些多核苷酸用于生产组合物、探针、基于探针的装置,和测定与瘦动物相比在胖动物中差别表达的多核苷酸的状态的方法,所述方法用于实现上述目的,例如,预测和诊断与动物脂肪组织有关的状况,和筛选物质以确定它们是否可能用于调控动物脂肪组织的量。这样的物质在鉴别出来以后,可以用于调控动物脂肪组织的量。本发明也提供了包含探针组合、使用探针的装置、以及物质的不同试剂盒。本发明的另一个目的是,提供使用"分类预测物(classpredictor)"基因语来区分胖和瘦动物的方法。分类预测物技术可以用于促进动物体型的临床诊断,例如,分类预测可以用于基于血液的测试中,以作出关于动物是胖还是瘦或具有变胖或变瘦的倾向的阳性测定。使用本文鉴定的65个多核苷酸探针的新颖组合,可以实现本文公开的这个和其它目的,使用从胖和瘦动物采取的血样,这些探针可以作为胖和瘦动物的分类预测物。这些分类预测物基因可以用于例如开发基于血液的测试试剂盒,以预测动物是否胖或具有变胖的倾向,或它们可以用于预测瘦动物是否可以维持它的痩度。分类预测物也可以用于定义动物的身体状况评分,这样可以在兽医临床中具有多种有用用途。本发明的另一个目的是,提供使用分类预测物基因谱来精确鉴别胖动物、并在生化水平跟随它们的进展、并指示它们的基因表达谱是否与胖瘦一致的方法。本发明的另一个目的是,提供通过施用一种或多种活性成分来体内调12控动物中脂肪组织的量的方法,所述活性成分体外证实会调控参与脂肪代谢的基因的表达。本发明的其它目的包括,本文公开的多核苷酸、探针、活性成分和分类预测物数据在生产本文所述的组合物、装置和试剂盒中的应用,所述组合物、装置和试剂盒例如用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达,或用于调控动物脂肪组织的量,用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达,和用于预测或诊断动物的身体状况评分,包括将瘦动物与胖动物区分开,和在用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的方法中,用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达,用于测量测试物质对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达谱的影响,用于筛选测试物质以确定它是否可能用于调控动物脂肪组织的量,用于预测动物可能变胖或诊断动物为肥胖,或用于调控动物脂肪组织的量。本领域技术人员可以容易地明白本发明的其它和进一步的目的、特征和优点。发明详述定义术语"动物"是指具有脂肪组织的人或其它动物,包括禽、牛、犬、马、猫、hicrine、鼠、羊和猪。当该术语用于比4支胖和瘦动物的上下文中时,比较的动物是相同物种的动物,且可能属于相同的种族或品种。在优选的实施方案中,动物是犬或猫,最优选犬。术语"抗体"是指结合特定抗原的任意免疫球蛋白,包括IgG,IgM,IgA,IgD,和IgE抗体。该术语包括多克隆的、单克隆的、单价的、人源化的、异缀合物,具有多表位特异性的抗体组合物,嵌合的、双特异性的抗体,双抗体(diabodies),单链抗体,和抗体片段例如Fab、Fab,、F(ab,)2和Fv,其它抗原-结合片段。术语"阵列"是指基质上至少两个探针的有序排列。至少一个探针是对照或标准品,且至少一个探针是诊断探针。基质上约2至约40,000个探针的排列确保探针和样品多核苷酸或多肽之间形成的每个标记的复合物的大小和信号强度各自是可区分的。术语"身体状况评分,,(BCS)是指基于动物的身体大小和形状进行身体组成分析的方法。几种方法是技术人员已知的,例如,在美国专利号6,691,639和标题为"小动物临床营养(SmallAnimalClinicalNutrition)"的参考文献第4版第13章(ISBN0-945837-05-4)中公开的方法。术语"体重指数"(BMI)是指动物的体重(按kg计算)除以它的身高(按米计算)的平方。本文使用的术语"分类预测物"是指使用监督的(supervised)学习方法建立的基因组、蛋白组(proteomic)或代谢组(metabolomeic)-潘,所述监督的学习方法采用下述算法,例如,4旦不限于,来自一组预定样品("训练集合,,)的WeightedVoting、ClassNeighbors、K-NearestNeighbors和SupportVectorMachines,以建立然后可以用于分类新样品("测试集合"的预测规则。术语"DEXA"是指身体组成分析双能量X射线吸收光度法。术语"差别表达,,或"差别表达的,,是指增加的或增量调节的基因表达,或指减少的或减量调节的基因表达,如通过样品中转录的信使RNA或翻译的蛋白的量的缺乏、存在或至少2倍变化所测得的。应用于动物的术语"胖"是指使用保健提供者和其它技术人员已知的技术和方法测得具有多余量的身体脂肪组织的任意动物,或易于发展多余量的身体脂肪组织的动物。如果与普通群体中的平均动物相比,动物具有发展多余的脂肪组织的倾向或更高的可能性,则该动物易于变胖。一般而言,不限制该定义,在下述情况下认为动物肥胖(l)动物具有25或更高(认为在一些表征动物状况的方法中包括"超重,,和"过度月巴胖,,的数字)的BMI,(2)动物的重量比保健专业人员或相关技术人员定义的它的"理想"体重高15%或更多,(3)通过DEXA测得动物的身体脂肪百分比是27o/。或更高,或(4)技术人员使用在"小动物临床营养,,第4版第13章(ISBN其它Bcs方法测得的它的等同:标。g、'、;"5'术语"胖相关基因"是指由SEQIDNO:l-295答别的(identified)所有基因或基因的子集,尤其在本文中鉴别为与瘦动物相比在胖动物中差别表达的254种基因。当用作差别基因表达的度量时,术语"倍"是指动物中的基因表达量,它与相比较的动物中的基因表达量相比,是基因表达的多倍或分数,例如,胖动物与瘦动物相比较。例如,在动物中的表达量是在相比较的动物中的314倍的基因具有3倍差别基因表达,在动物中的表达量是在相比较的动物中的1/3的基因也具有3倍差别基因表达。术语"片段"是指(l)寡核苷酸或多核苷酸序列,它是完整序列的一部分,且对于特定用途具有与完整多核普酸序列相同或类似的活性,或(2)肽或多肽序列,它是完整序列的一部分,且对于特定用途具有与完整多肽序列相同或类似的活性。这样的片段可以包含任意数量的认为适用于特定用途的核苷酸或氨基酸。一般而言,寡核普酸或多核苷酸片段含有至少约10、50、100或1000个来自完整序列的核香酸,多肽片段含有至少约4、10、20或50个来自完整序列的连续氨基酸。该术语包括片段的多核普酸和多肽变体。术语"基因"是指参与产生多肽的DNA的完整或部分片段,包括在编码区之前和之后的区域(先导物和尾)和在各个编码片段(外显子)之间的插入序列(内含子)。该术语包括可与基因编码序列的互补序列杂交的任意DNA序列。术语"在胖动物中差别表达的基因"是指,与瘦动物相比,该基因在胖动物的组织中表达的mRNA的量或从mRNA翻译的基因产物的量或多或少地可才全测到不同。术语"同源物"是指(l)多核苷酸,包括来自相同或不同动物物种的多核苷酸,其与SEQIDNO:1-295鉴别的多核苷酸具有大于30%、50%、70%、或90%序列相似性,且具有相同或基本上相同的性质,其执行与完整多核苷酸相同或基本上相同的功能,或具有在严格条件下与SEQIDN〇:l-295鉴别的多核苷酸特异性杂交的能力,或(2)多肽,包括来自相同或不同动物物种的多肽,其与通过SEQIDNO:l-295鉴别的多核普酸的表达鉴别的多肽具有大于30%、50%、70%、或90%序列相似性,且具有相同或基本上相同的性质,其执行与完整多肽相同或基本上相同的功能,或具有特异性地结合通过SEQIDNO:l-295筌别的多核苷酸的表达鉴别的多肽的能力。使用技术人员已知的方法,例如Karlin和Altschul的算法(Proc.Natl.Acad.Sci.USA87:2264-2268(1990)),可以测定两个多肽序列或两个多核苷酸序列的序列相似性。这样的算法整合在Altschul等人的NBLAST和XBLAST程序中(J.Mol.Biol.215:403-410(1990》。为了得到用于比较目的的有空位的比对,可以如Altschul等人(Nucl.AcidsRes.25:3389-3402(1997))所述使用GappedBlast。当使用BLAST和GappedBLAST程序时,使用各个程序(例如,XBLAST和NBLAST)的缺省参数。参见http:〃丽.ncbi.nlm.nih.gov。术语"杂交复合物"是指,当一个多核苷酸的噤呤与互补多核苷酸的嘧啶进行氢键键合,例如,5'-A-G-T-C-3,碱基与3'-T-C-A-G-5,配对时,在样品多核苷酸之间形成的复合物。互补程度和核香酸类似物的使用,会影响杂交反应的效率和严才各性。术语"与......相结合"是指,在下述情况下将药物、食品或其它物质施用给动物(l)在组合物、尤其食品组合物中一起,或(2)在大致相同的时间或周期地,使用相同或不同的施用途径,以相同或不同的频率,分开地。"周期地"是指,以对于特定物质可接受的剂量日程施用该物质。"大致相同的时间"通常是指在相同的时间或在彼此约72小时内施用该物质(食品或药物)。"与......相结合"特別包括这样的施用方案,其中施用药物等物质规定的期间,并不确定地施用本发明的组合物。应用于动物的术语"瘦"是指使用保健提供者和其它技术人员已知的技术和方法测得不胖的任意动物。一般而言,不限制该定义,在下述情况下认为动物是痩的(l)动物具有小于25的BMI,或(2)动物的重量比保健专业人员或相关技术人员定义的它的"理想"体重小15%或更多,(3)通过DEXA测得动物的身体脂肪百分比小于27%,或(4)技术人员使用在"Sma11AnimalClinicalNutrition"第4版第13章(ISBN0-945837-05-4)中公开的方法测得动物具有3或更低的身体状况评分,或使用其它BCS方法测得的它的等同指标。术语"调控动物脂肪组织的量"是指,造成动物丟失脂肪组织,造成动物增加脂肪组织,或如果动物易于增加或丢失脂肪组织,造成动物维持动物脂肪组织的量。因而,调控动物脂肪组织的量包括,预防瘦动物变胖,和治疗胖动物以减少动物脂肪组织的量,以及在适当情况下治疗瘦动物以增加脂肪组织,例如,当治疗技术人员测得体重过轻需要增加脂肪组织的痩动物时。可以使用常规方法来评判动物脂肪组织的量,以及测定动物的瘦肌肉质量和/或骨矿物质含量,在这样的评判中可能关心的信息。术语"多核苷酸"或"寡核苷酸"是指核苷酸的聚合物。该术语包括DNA和RNA(包括cDNA和mRNA)分子,无论是单链的还是双链的,如果是单链的,包括它的线性或环状形式的互补序列。在适用于序列时,该术语也包括片段、变体、同源物和等位基因,它们具有与原始序列相同或基本上相同的性质,并执行相同或基本上相同的功能。当比对时序列可以是完全互补的(没有错配),或可以具有最高达约30%的序列错配。优选地,对于多核苷酸,链含有约50至10,000个核苷酸、更优选约150至3,500个核苷酸。优选地,对于寡核香酸,链含有约2至100个核苷酸、更优选约6至30个核苷酸。多核苦酸或寡核苦酸的精确大小依赖于多种因素和多核苷酸或寡核苷酸的特定用途和用法。该术语包括合成的、从天然来源分离和纯化的核苷酸聚合物。术语"多核苦酸"包括"寡核普酸"。术语"多肽"、"肽,,或"蛋白"是指氨基酸的聚合物。该术语包括天然存在的和非天然存在的(合成的)聚合物,和其中将一个或多个M酸置换为人工化学才莫仿物的聚合物。该术语也包括片段、变体和同源物,它们具有与原始序列相同或基本上相同的性质,并执行相同或基本上相同的功能。该术语包括任意长度的聚合物,优选含有约2至1000个氨基酸的聚合物、更优选约5至500个氨基酸。该术语包括合成的、从天然来源分离和纯化的氨基酸聚合物。术语"探针"是指(l)寡核普酸或多核苷酸,无论是RNA还是DNA,在纯化的限制酶消化物中天然存在或合成地生成,其能用具有与探针互补的序列的多核苷酸退火或特异性杂交,或(2)肽或多肽,其能特异性结合特定蛋白或蛋白片段,基本上排除其它蛋白或蛋白片段。寡核苷酸或多核苷酸探针可以是单链或双链的。探针的精确长度依赖于许多因素,包括温度、来源和用途。例如,对于诊断用途,依赖于耙序列的复杂性,寡核苷酸探针通常含有约10-100、15-50或15-25个核苷酸。在某些诊断用途中,多核苷酸探针含有约100-1000、300-600个核苷酸,优选约300个核苷酸。选择的本文的探针与特定靶序列的不同链"基本上"互补。这意味着探针必须因此,探针序列不需要反映耙物的精确互补序列。例如,非互补的核普酸片段可以结合在探针的5,或3,末端,探针序列的剩余部分与靶序列互补。或者,非互补的碱基或更长的序列可以散布在探针中,条件是,探针序列与耙多核香酸的序列具有足够的互补性,以与靶多核苷酸特异性地退火。肽或多肽探针可以是蛋白或肽特异性结合的任意分子,包括DNA(对于DNA结合蛋白)、抗体、细胞膜受体、肽、辅因子、凝集素、糖、多糖、细胞、细胞膜、细胞器和细胞器膜。术语"样品"是指含有例如多核苷酸、多肽、抗体、代谢物等的任意动物组织或流体,包括含有DNA和RNA的细胞和其它组织。实例包括脂17肪、血液、软骨、结締组织、上皮、淋巴、肌肉、神经、唾液等。样品可以是固体或液体,可以是DNA、RNA、cDNA、体液例如血液或尿、细胞、细胞制品或可溶级分或其介质等分试样、染色体、细胞器等。术语"单个包装"是指,试剂盒的组分物理地伴有一个或多个容器,且视作生产、分配、销售或使用的单位。容器包括、但不限于,袋、盒子、瓶子、收缩罩包装、钉上的(stapled)或以其他方式添附(affixed)的组分,或它们的组合。单个包装可以是物理伴随的单个食品组合物的容器,使得它们被视作生产、分配、销售或使用的单位。术语"有用的变化,,是指(l)对于多核苷酸,该多核苷酸的互补序列;该多核苷酸和它的互补序列的同源物;该多核苷酸的变体,它的互补序列,和它的同源物;和该多核苷酸的片l殳,它的互补序列,它的同源物,和它的变体,和(2)对于多肽,该多肽的同源物;该多肽和它的同源物的变体;和该多肽的片段,它的同源物,和它的变体。术语"虚拟包装"是指,试剂盒的组分伴有一种或多种物理或虚拟试剂盒组分的说明,它指导使用者如何得到其它组分,例如,在含有一种组分的袋子中,和指导使用者访问网站、交流记录的信息、观察可视信息或联系保健提供者或教员以得到如何使用试剂盒的说明的指南。术语"标准品"是指(l)在测试胖动物时含有来自瘦动物的组织的对照样品,或在测试瘦动物时含有来自胖动物的组织的对照样品,或(2)含有来自瘦或胖实验动物的组织的对照样品,所述实验动物尚未暴露于在对应的瘦或胖动物中检测的测试物质,以测定测试物质是否会造成差别基因表达,在它应用的上下文中适用时。术语"严格条件,,是指(l)在42。C,在含有0.1%牛血清白蛋白、0.1%Ficoll、0.1%聚乙烯吡咯烷酮、50mM磷酸钠緩冲液pH6.5(含有750mMNaCl,75mM柠檬酸钠)的50%(体积/体积)甲酰胺中杂交,(2)在42。C,在50%曱酰胺、5xSSC(0.75MNaCl,0.075M柠檬酸钠)、50mM磷酸钠(pH6.8)、0.1%焦磷酸钠、5x登哈特溶液、声处理的鲑精DNA(50lug/ml)、0.1%SDS和10%硫酸葡聚糖中杂交;在42°C在0.2xSSC和0.1%SDS中洗涤,或在50。C用0.015MNaCl、0.0015M柠檬酸钠、0.1%Na2SO4洗涤,或采用类似的低离子强度和高温洗涤剂和类似的变性剂的类似方法。术语"物质,,是指潜在地可用于诊断、预测或调控动物脂肪组织的量的元素、化合物、分子或其混合物或任意其它物质,包括任意药物、化学18实体或生物学实体。术语"siRNA"是指,当siRNA与基因在相同细胞中表达时,可以形成减少或抑制该基因的表达的双链RNA的多核苷酸。该术语包括由互补链形成的双链RNA。杂交形成双链分子的siRNA互补部分通常具有实质的或完全的一致性。通常,siRNA含有至少约15-50个核苷酸,双链siRNA含有约15-50个》咸基对,优选约20-30个核苷酸和^咸基对。术语"特异性结合"是指两个分子之间特殊的且精确的相互作用,这依赖于它们的结构、尤其它们的分子侧基。例如,调节蛋白向DNA分子的大沟中的嵌入,两个单链核酸之间沿着主链的氢键结合,或蛋白表位和激动剂、拮抗剂或抗体之间的结合。术语"特异性杂交"是指充分互补序列(有时称作"基本上互补的")的两个单链多核苦酸之间的结合,以在本领域通常使用的预定条件下允许这样的杂交。例如,该术语可以指多核苷酸探针与在根据本发明的一个方除多核苷酸探针^与非互补序列的单链;核苷酸的杂交。'i术语"变体"是指(l)多核苷酸序列,其含有来自(或针对)多核苷酸序列的一个或多个核苷酸的任意置换、变化、修饰、替换、缺失或添加,且具有与原始序列相同或基本上相同的性质,并执行相同或基本上相同的功能,和(2)多肽序列,其含有来自(或向)多肽序列的一个或多个氨基酸的任意置换、变化、修饰、替换、缺失或添加,且具有与原始序列相同或基本上相同的性质,并执行相同或基本上相同的功能。该术语因此包括单核苷酸多态性(SNPs)和等位基因变体,并包括多肽中的保守和非保守的氨基酸置换。该术语也包括多核苷酸或多肽的化学衍生作用,和在适当时用非天然存在的核香酸或氨基酸置换核苷酸或氨基酸。本发明不限于本文所述的特定方法、方案和试剂,因为它们可以变化。此外,本文使用的术语仅用于描述特定实施方案的目的,无意限制本发明的范围。如在本文和所附权利要求书中所使用的,单数形式"一个(a,an)"、"一种,,和"该,,包括复数形式,除非上下文另有清楚说明,例如,"一个变体"包括多个变体。此外,定义的术语包括在适当的语法上下文中使用的术语的变化,例如,术语"特异性地结合"包括"特异性结合"和该术语的其它形式。类似地,词语"包含,,、"包括"应当包括性地而不是排除性地解释。除非另有定义,本文使用的所有技术和科学术语和任意缩写字具有与本发明领域的普通技术人员的通常理解相同的含义。尽管与本文所述类似或等同的任意组合物、方法、产品或其它工具或材料可以用于实现本发明,在本文中描述了优选的组合物、方法、产品或其它工具或材料。在本文中引用或提及的所有专利、专利申请、出版物和其它参考文献以法律允许的程度通过参考引用并入本文。这些参考文献的讨论仅意在总结其中作出的断言。没有承认任何这样的专利、专利申请、出版物或参考文献或其任意部分与本发明的现有技术相关,特别地保留置疑这样的专利、专利申请、出版物和其它参考文献的准确度和适当性的权利。在一个方面,本发明提供了与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因或基因片段(本文中定义的"基因")。本发明是基于295个多核苦酸的发现,它们代表254个与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因。通过使用AffymetrixGeneChip⑧技术比较来自诊断为胖的动物的脂肪组织中基因的表达和来自诊断为瘦的动物的脂肪组织中基因的表达,鉴别出了所述基因。多核苷酸显示在序列表中,且在表1中描述为SEQIDNO:l-295。表1也在第2列显示了Affymetrix探针标识号(本文中"APIN"),在第3列显示了表达倍数(胖/瘦),在第4列显示了最高BLAST命中的登录号,在第5列显示了人序列的最高BLAST命中的登录号(列描述也适用于表2和3)。使用技术人员已知的方法,可以从BLAST数据库得到推定的或实际的基因功能的描述。一般而言,通过下述方式测定推定的或实际的基因功能(l)鉴别与瘦动物相比在胖动物中具有2倍或更大的基因表达的每个基因的APIN,(2)通过将APIN输入可公开得到的Affymetrix数据库(它将AIPN号与序列相关联),测定每个这样的基因的核苷酸序列,和(3)将核苷酸序列输入国立卫生研究院提供的BLAST数据库,并从得到的与数据库中的同源序列的序列匹配,确定推定的或实际的基因功能。表4显示了为对应的SEQIDNO的最高BLAST命中登录号得到的基因描述,表5显示了对应的SEQIDNO的人序列登录号的最高BLAST命中的基因描述。基于几个标准,将多核苷酸分组。首先,基于表达分析将多核苷酸分成3组,所述表达分析测定胖和瘦动物之间的差别基因表达量或倍数差别基因表达。组1对应由SEQIDNO:l-295鉴别的多核苷酸。这些多核苷酸与瘦动物相比在胖动物中差别表达了至少2倍。组2对应由SEQIDNO:1-70鉴别的多核苷酸。这些多核苷酸与瘦动物相比在胖动物中差别表达了至少202.5倍。组3对应由SEQIDNO:l-25鉴别的多核普酸。这些多核苦酸与瘦动物相比在胖动物中差别表达了至少3倍。其次,基于它们的功能将多核苷酸分组。组4对应在表2中鉴别的多核苷酸。这些多核苷酸与动物中的脂类和葡萄糖代谢途径有关。第三,基于它们的关联性将多核苷酸分组。组5对应在表3中鉴别的多核苷酸。与瘦动物相比,这些多核苷酸被鉴别为与胖动物特别相关,因为当进行差别表达分析时,通过超过一个探针鉴别出它们。通过测量鉴别为胖的犬的脂肪组织中基因表达与鉴别为瘦的犬的脂肪组织中基因表达的差异,鉴别多核苷酸和基因。基因表达的变化可以通过技术人员已知的任意方法来测定。一般而言,通过测量转录(测定基因生成的mRNA的量)或测量翻译(测定基因生成的蛋白的量),测定基因表达的变化。为了定量多核苷酸和蛋白,可以使用技术人员已知的任意方法,测定由基因生成的RNA或蛋白的量。一般而言,使用聚合酶链式反应(PCR)(包括、但不限于,反转录-PCR(RT-PCR)和定量实时PCR(qPCR))、RNA酶保护术、RNA印迹法和其它杂交方法,测定RNA表达。测量的RNA通常是mRNA或反转录的mRNA形式。使用各种比色和光谱测定和诸如lowry测定、双缩脲测定、荧光测定、比浊方法、双金鸡宁酸(bicinchoninic)测定、蛋白芯片技术、红外吸收、水合茚三酮、bradford测定、和紫外吸收等方法,测定蛋白或多肽表达。在一个优选的方法中,使用可从Affymetrix公司购买的Affymetrix犬-1和犬-2基因芯片和关于使用这样的芯片测定基因表达的说明书,测定基因表达的变化。一般而言,通过测量至少一个基因的表达,测定与瘦动物相比胖动物中的差别基因表达。优选地,测量两个或多个差别表达的基因的表达,以提供基因表达模式或基因表达图谱。更优选地,测量许多差别表达的基因的表达,以提供关于更重要的基因表达^t式或图谱的额外信息。多核苷酸、基因、由多核苷酸和基因编码的蛋白和基于所述序列的互补序列、同源物、变体或片段可用于与动物脂肪组织的量有关的许多预测和-珍断测定中,并可用于筛选测试物质以测定该物质是否可用于调控动物脂肪组织的量。从本文包含的发明描述可以明白其它用途。在另一个方面,本发明提供了一种组合,其包含与瘦动物相比在胖动物中差别表达的两种或多种多核苷酸、或通过与瘦动物相比在胖动物中差别表达的两种或多种多核苷酸的表达而生成的两种或多种蛋白。在一个实施方案中,该组合包含两种或多种多核苷酸或从选自SEQIDNO:l-295的多核苷酸表达的蛋白。在另一个实施方案中,该组合包含两种或多种多核苦酸或从选自SEQIDNO:1-70的多核苷酸表达的蛋白。在另一个实施方案中,该组合包含两种或多种多核苷酸或/人选自SEQIDNO:l-25的多核苷酸表达的蛋白。在另一个实施方案中,该组合包含两种或多种多核苷酸或从选自在表2中鉴别的SEQIDNO的多核苷酸表达的蛋白。在另一个实施方案中,该组合包含两种或多种多核苷酸或从选自在表3中鉴别的SEQIDNO的多核苷酸表达的蛋白。在另一个实施方案中,该组合包含这样的多核普酸的有用的变化。优选地,该组合包含多种多核苷酸或从多核苷酸表达的蛋白,在适用于特定组和用途时,通常约10、20、50、100、200或更多种多核苷酸或蛋白。当该组合包含一种或多种片段时,片段可以是保留原始多核苷酸或蛋白的性质和功能的任意大小,优选原始多核苷酸或蛋白的约30%、60%、或90%。多核普酸和蛋白可以来自任意动物,优选犬和猫,最优选犬。在另一个方面,本发明提供了一种组合物,其包含两种或多种适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的寡核苷酸或多核苷酸探针。在一个实施方案中,所述探针包含选自SEQIDNO:l-295的多核苷酸。在另一个实施方案中,所述探针包含选自SEQIDNO:1-70的多核苷酸。在另一个实施方案中,所述揮:4十包含选自SEQIDNO:l-25的多核苷酸。在另一个实施方案中,所述探针包含选自在表2中鉴别的SEQIDNO的多核苷酸。在另一个实施方案中,所述探针包含选自在表3中鉴别的SEQIDNO的多核苷酸。在另一个实施方案中,所述探针包含这样的多核苷酸的有用的变化。所述探针含有足够数量的核苷酸,以基本上排它地特异性地与适当的互补多核苷酸杂交。优选地,所述探针包含至少约10、15、20、25或30个核苷酸。在有些实施方案中,所述探针含有多个核苷酸,且包含至少约30、50、70、90或100个核苦酸,或更多。探针可以包含本发明的全长功能基因。优选地,该组合物包含适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的多个多核苷酸探针,通常约10、50、200、500、IOOO或2000,或更多个探针。多核普酸探针使用技术人员已知的方法制备或得到,例如,从核苷酸体外合成,从天然来源分离和纯化,或本发明基因的酶切割。在另一个方面,本发明提供了一种装置,其适用于检测与瘦动物相比22在胖动物中差别表达的多种基因的表达。该装置包含基质,所述基质具有多个在已知位置添附(affixed)到基质上的本发明的寡核苷酸或多核苷酸探针。该装置基本上是本文所述寡核苷酸或多核苷酸探针的固定化形式。该装置可用于基因和多核苷酸和它们的表达模式和图谱的快速且特异性的检测。通常,这样的探针连接在基质或类似的固体支持物上,将含有一种或多种多核苷酸(例如,基因、PCR产物、连接酶链反应(LCR)产物、使用扩增技术已经合成的DNA序列,或其混合物)的样品暴露于探针,使得样品多核苦酸可以与探针杂交。可以标记探针、样品多核苷酸、或二者,通常使用荧光团或其它标记例如抗生蛋白链菌素,并使用技术人员已知的方法;险测。如果标记样品多核苷酸,通过4企测结合的焚光,可以;险测杂交。如果标记一果针,杂交通常通过标记淬灭来4企测。如果标记纟笨针和样品多核普酸二者,杂交通常通过监视由两个结合的标记的接近产生的颜色转移来检测。许多种标记策略和标记是技术人员已知的,尤其对于萸光标记。优选地,将探针固定化在基质上,所述基质适用于形成与本领域已知的那些相当的阵列(已知几种名称,包括DNA微阵列、基因芯片、生物芯片、DNA芯片和基因阵列)。在另一个方面,本发明提供了一种组合物,其包含两种或多种适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的肽或多肽探针。在一个实施方案中,所述探针包含肽或多肽,其特异性结合由一种或多种多核苷酸的表达而生成的蛋白,所述多核苷酸包含选自SEQIDNO:l-295的序列。在另一个实施方案中,所述探针包含肽或多肽,其特异性结合由一种或多种多核苷酸的表达而生成的蛋白,所述多核苷酸包含选自SEQIDNO:1-70的序列。在另一个实施方案中,所述探针包含肽或多肽,其特异性结合由一种或多种多核苷酸的表达而生成的蛋白,所述多核苷酸包含选自SEQIDNO:l-25的序列。在另一个实施方案中,所述探针包含肽或多肽,其特异性结合由一种或多种多核苷酸的表达而生成的蛋白,所述多核苷酸选自在表2中鉴别的SEQIDNO。在另一个实施方案中,所述探针包含肽或多肽,其特异性结合由一种或多种多核苷酸的表达而生成的蛋白,所述多核苷酸选自在表3中鉴别的SEQIDNO。在另一个实施方案中,所述探针包含肽或多肽,其特异性结合由这样的多肽的一种或多种有用的变化的表达而生成的蛋白。所述探针含有足够数量的氨基酸,以特异性地结合适当多肽。优选地,所述撰:针包含至少约4、10、20、40或80个氨基酸。在有些实施方案中,所述探针含有多个氨基酸,且包含至少约100个或更多个氨基酸。探针可以包含从本发明鉴别的全长功能基因的表达衍生的全长功能蛋白。优选地,本发明提供了适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的多个多肽探针,更优选约10、50、100、500或1000或更多个这样的探针的集合。在一个实施方案中,所述探针是抗体,优选单克隆抗体。多肽探针可以根据常规方法制备,例如,使用为本发明的多核苷酸提供的核苷酸序列数据和本领域已知的方法。这样的方法包括、但不限于,从细胞直接分离多肽,分离或合成编码多肽的DNA或RNA并使用DNA或RNA生产重组产物,从单个氨基酸化学合成多肽,和通过化学切割已有的多肽来生产多肽片段。在另一个方面,本发明提供了一种装置,其适用于检测与痩动物相比在胖动物中差别表达的多个基因的表达。该装置包含基质,所述基质具有多个在已知位置固定到基质上的本发明的肽或多肽探针。该装置基本上是本文所述肽或多肽探针的固定化形式。该装置可用于蛋白和它们的表达才莫式的快速且特异性的检测。通常,这样的探针连接在基质上,将含有一种或多种蛋白的样品暴露于探针,使得样品蛋白可以与探针杂交。可以标记和检测探针、样品蛋白、或二者,通常使用技术人员已知的荧光团或其它试剂。一般而言,用于阅读多核苷酸微阵列的相同方法和仪器使用可用于蛋白阵列。优选地,将探针固定化在适用于形成阵列的基质上。测定样品中蛋白的量或浓度的方法是技术人员已知的。这样的方法包括放射免疫测定、竟争-结合测定、蛋白印迹分析和ELISA测定。就使用抗体的方法而言,多克隆和单克隆抗体是合适的。这样的抗体可以是对蛋白、蛋白表位或蛋白片段免疫特异性的。本发明的有些实施方案使用抗体来检测和定量由本发明的多核苷酸的表达生产的蛋白。尽管蛋白可以通过免疫沉淀、亲和分离、蛋白印迹分析、蛋白阵列等来检测,优选的方法使用ELISA技术,其中将抗体固定化在固体支持物上,并将靶蛋白或肽暴露于固定化的抗体。可以使用已知的方法来标i己纟采4十或l&物或二者。在有些实施方案中,使用用于检测多核苷酸或多肽的探针阵列,观察与痩动物相比在胖动物中差别表达的多个基因的表达^t式或图谱。在一个实施方案中,可以使用寡核苷酸或多核苷酸探针的阵列,然而另一个实施24方案可以使用特异性结合本发明的差别表达的基因产物的抗体或其它蛋白的阵列。这样的阵列可以商业上得到,或它们可以使用技术人员已知的方法定制,例如,在固体支持物上原位合成,或通过微印刷技术将预先合成的探针结合在固体支持物上。在不同的实施方案中,定制多核苷酸或多肽探针阵列,以特异性地检测由本发明的差别表达的基因生成的转录物或蛋白。在一个实施方案中,定制多核苷酸或多肽探针阵列,以特异性地检测由在表2中鉴别的两种或多种多核苷酸或基因生成的转录物或蛋白。这些探针用于检测动物中与脂类和葡萄糖代谢途径有关的基因。在另一个实施方案中,定制多核苷酸或多肽探针阵列,以特异性地^r测由在表3中鉴别的两种或多种多核苦酸或基因生成的转录物或蛋白。这些探针用于检测与瘦动物相比与胖动物特别有关的基因。在另一个方面,本发明提供了检测样品中与痩动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的差别表达的方法。该方法包t:(a)使包含多个与瘦动物相比在胖动物中差别表达的多核苷酸探针的组合与样品中的多核苷酸杂交,以形成一种或多种杂交复合物;(b)任选地,使包含多个与痩动物相比在胖动物中差别表达的多核苷酸探针的组合与标准品中的多核苷酸杂交,以形成一种或多种杂交复合物;(c)检测来自样品和任选的来自步骤(b)的标准品的杂交复合物;和(d)比较来自样品的杂交复合物和来自标准品的杂交复合物,其中标准品和样品之间杂交复合物的量的差异指示着样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达。在不同的实施方案中,多个多核苷酸採:针选自SEQIDNO:l-295(具有2倍或更多的差异),SEQIDN〇:l-70(具有2.5倍或更多的差异),SEQIDNO:l-25(具有3倍或更多的差异),在表2中鉴别的多核苷酸(具有2倍或更多的差异),在表3中鉴别的多核苷酸(具有2倍或更多的差异),和这样的多核苷酸的有用的变化(组具有适当倍数)。这些多核苷酸用于制备探针,所述探针与样品多核苷酸杂交形成杂交复合物,检测后者,并与标准品的杂交复合物相比较。在有些实施方案中,在杂交之前扩增样品多核苷酸。在有些实施方案中,探针与基质结合,优选在阵列中。步骤(b)和步骤(c)的一部分是任选的,并在要进行两个或多个测试系统的相对同时比较时使用。但是,在一个优选的实施方案中,用于比较的标准品是基于以前使用该方法得到的数据。将这些探针暴露于样品,以形成杂交复合物,检测后者,并与标准品的杂交复合物相比较。来自样品和标准品的杂交复合物的之间的差异指示着样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的多核苷酸和基因的差别表达。在一个优选的实施方案中,制备探针,以特异性地检测由本发明鉴别的一种或多种基因或基因片段生成的多核苷酸或其片段。检测杂交复合物的方法是技术人员已知的。在一个实施方案中,所述方法另外包含,在杂交之前将动物或样品暴露于测试物质。然后,比较指示着测试物质是否改变了样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因、尤其胖相关基因的表达。在另一个方面,本发明提供了检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达的方法。该方法包含(a)在允许探针和蛋白之间发生特异性结合的条件下,使包含多个多肽探针的组合与样品中的蛋白反应,其中探针结合的蛋白与瘦动物相比在胖动物中差别表达;(b)任选地,在允许探针和蛋白之间发生特异性结合的条件下,使包含多个多肽探针的组合与标准品中的蛋白反应,其中探针结合的蛋白与瘦动物相比在胖动物中差别表达;(c)检测样品和任选的来自步骤(b)的标准品中的特异性结合;和(d)比较样品和标准品中的特异性结合,其中标准品和样品中的特异性结合之间的差异指示着样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达。在不同的实施方案中,多个多肽探针是特异性地结合由选自下述SEQIDNO的一种或多种多核苷酸的表达而生成的蛋白的探针SEQIDNO:l-295(具有2倍或更多的差异),SEQIDNO:1-70(具有2.5倍或更多的差异),SEQIDNO:l-25(具有3倍或更多的差异),在表2中鉴别的多核苷酸(具有2倍或更多的差异),在表3中鉴别的多核苷酸(具有2倍或更多的差异),和这样的多核苷酸的有用的变化(组具有适当倍数)。这些多核苷酸用于制备探针,所述探针特异性地结合蛋白,检测后者,并与标准品的蛋白相比较。在有些实施方案中,所述探针结合基质,优选在阵列中。在一个实施方案中,所述探针是抗体。步骤(b)和步骤(c)的一部分是任选的,并在要进行两个或多个测试系统的相对同时比较时使用。但是,在一个优选的实施方案中,用于比较的标准品是基于以前使用该方法得到的数据。将这些探针暴露于样品,以形成特异性结合,一企测后者,并与标准品的特异性结合相比较。来自样品和标准品的特异性结合之间的差异指示着样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的蛋白和基因、尤其胖相关基因的差别表达。在一个优选的实施方案中,制备探针,以特异性地检测由本发明鉴别的一种或多种基因或基因片段生成的多核苷酸或其片段。在一个实施方案中,所述方法另外包含,在使多肽与蛋白反应之前,将动物或样品暴露于测试物质。然后,比较指示着测试物质是否改变了样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因、尤其胖相关基因的表达。在另一个方面,当尝试响应于脂肪组织调控方案来调控动物脂肪组织的量时,检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的方法用于监视动物的进展。在调控方案期间,间隔地、优选设置间隔(setinterval)地进行该方法,并通过比较在调控方案期间两个或多个点时该方法的结果,监视动物的进展。从比较得到的与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达的变化,或基因表达^f莫式的变化,或任何变化的缺失,指示着调控方案的功效。例如,可以监^L用于减少动物脂肪组织的量的脂肪组织调控方案,如果与痩动物相比在胖动物中差别表达的基因、尤其胖相关基因的基因表达量响应于方案中的刺激而随时间下降,则证实是有效的。类似地,增加瘦或过瘦动物的脂肪组织的方案会增加这样的基因的表达。调控方案可以是调控动物脂肪组织的量的任意计划,例如饮食、锻炼、药物或其它类似的方案。在另一个方面,本发明提供了测量测试物质对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的影响的方法,和筛选测试物质以确定它是否可能用于调控动物脂肪组织的量的方法。所述方法包含,(a)通过测量在没有测试物质存在下测试系统中选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物,测定第一表达语;(b)通过测量在有测试物质存在下测试系统中选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物,测定第二表达谱;和(c)比较第一表达谱和第二表达谱。与第一表达谱相比第二表达谱变化了2倍或更多,指示着所述测试物质会影响与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达,且所述测试物质可能用于调控动物脂肪组织的量。在一个优选的实施方案中,与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因是胖相关基因,所述变化是第一表达谱和第二表达谱之间至少两个基因的表达变化了2倍或更多。本发明也提供了27使用该方法鉴别的物质。在一个实施方案中,所述多核普酸选自SEQIDNO:1-70或其有用变化,所述变化是2.5倍或更高。在另一个实施方案中,所述多核苷酸选自SEQIDNO:l-25或其有用变化,所述变化是3倍或更高。在另一个实施方案中,所述多核苷酸是在表2或表3中鉴别的那些或其有用变化,所述变化是2倍或更高。在一个实施方案中,测试系统是体外测试系统例如组织培养物、细胞提取物或细胞系。在另一个实施方案中,测试系统是体内测试系统,即动物例如犬。在其它实施方案中,测试系统是间接体内(exvivo)组织系统或计算机(insilico)系统。测试物质可以是可能对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的多核苦酸或基因、尤其胖相关基因具有影响的任意物质。测试物质包括、但不限于,氨基酸;蛋白,肽,多肽,核酸,寡核苷酸,多核苷酸,小分子,大分子,维生素,矿物质,单糖;复合糖;多糖;碳水化合物;中链甘油三酉旨(MCTs);三酰基甘油酯(TAGs);n-3(co-3)脂肪酸,包括DHA、EPA、ALA;n-6(co-6)脂肪酸,包括LA、Y-亚麻酸(GLA)和ARA;SA,缀合的亚油酸(CLA);胆碱来源例如卯磷脂;脂溶性维生素,包括维生素A和其前体例如类胡萝卜素(例如P-胡萝卜素),维生素D来源例如维生素D2(麦角钙化醇)和维生素D3(胆钓化甾醇),维生素E来源例如生育酚(例如a-生育酚)和生育三烯酚类,和维生素K来源例如维生素&(叶绿醌)和维生素K2(曱萘醌);水溶性维生素包括B维生素例如核黄素,烟酸(包括烟酰胺和烟酸),维生素B6,泛酸,叶酸,生物素和维生素B12;和维生素C(抗坏血酸);抗氧化剂,包括有些在上面列出的维生素,尤其维生素E和C;以及生物类黄酮例如儿茶素,槲皮素和茶黄素;醌例如泛醌;类胡萝卜素例如番茄红素和番茄黄质;白藜芦醇;和a-硫辛酸;L-肉毒碱;D-杼檬烯;葡糖胺;S-腺苷基蛋氨酸;和壳聚糖。在一个优选的实施方案中,测试物质是可以加入食品中或作为添加剂消费的营养物。实例包括、但不限于,脂肪酸例如co-3脂肪酸(例如,DHA和EPA)和co-6脂肪酸(例如ARA)、肉毒碱、蛋氨酸、维生素C、维生素E和维生素D。在一个优选的实施方案中,使用在2005年3月2日提交的共同未决的美国临时专利申请号60/657980和要求它的优先权的任意后续美国或外国专利申请中公开的方法,可以鉴别出用于影响与瘦动物相比在胖动物中28差别表达的基因、尤其胖相关基因的表达的物质。在另一个方面,本发明提供了预测动物可能变胖或诊断动物为肥胖的方法。该方法包含,测定与一种或多种瘦动物相比在该动物中是否差别表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸、或一种或多种特异性结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸生产的蛋白的多肽。如果比较指示着与瘦动物相比多核苷酸在该动物中差别表达了2倍或多倍,则测定该动物可能变胖或测定为肥胖。在不同的实施方案中,预测或诊断是基于选自下述的多核苷酸SEQIDNO:1-70,SEQIDNO:l-25,在表2中鉴别的序列,在表3中筌别的序列,或这些多肽的有用变化。用于比较的瘦动物的表达谱可以从一种或多种瘦动物得到,其与来自瘦动物表达谱数据库的待测动物的表达i普同时得到。优选地,随时间积累的瘦动物表达谱数据库可用作参照。使用技术人员已知的方法(其中的一些在本文中描述),通过^^测多核苷酸或多肽,可以测定多核苷酸或多肽是否差别表达。在另一个方面,本发明提供了操作基因组或动物、尤其非人动物的基因组的表达的方法。该方法包含,破坏与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达,优选使用用选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸构建的寡核普酸或多核苷酸。本领域技术人员已知操作基因组的方法。这样的方法包括,转基因的和敲除的动物的生产,和转录或翻译的破坏。在一个实施方案中,一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸用于制备可用于破坏或"敲除,,动物中的对应的内源基因的构建体。该方法会生成具有该基因座的无效突变的动物。在其它实施方案中,所述动物表现出与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达的减少或完全消除。本发明也提供了使用该方法生成的动物。在不同的实施方案中,使用一种或多种选自SEQIDNO:l-70、SEQIDNO:l-25、在表2中鉴别的序列、在表3中鉴别的序列、或这些序列的有用变化的多核苷酸,操作基因组。转基因动物优选地是哺乳动物,例如,啮齿动物例如小鼠和大鼠,但是可以是其它哺乳动物例如猫和犬。本领域技术人员已知操作基因组的表达的方法。这样的方法包括,使用反义或siRNA分子,和使用这样的分子破坏基因组的翻译或转录。在一个实施方案中,一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷可以用于在功能上破坏翻译的短(小)干扰RNA(siRNA)。简而言之,反义分子通过结合DNA和阻止转录,siRNA通过RNA干扰(RNAi)或转录后基因沉默(PTGS),可以抑制基因表达。siRNA分子靶向同源mRNA分子,通过切割siRNA分子所跨区域内的mRNA分子进行破坏。因此,能耙向和切割从胖相关基因转录的mRNA的siRNA可以用于降低或消除一个或多个这样的基因的表达。在其它实施方案中,能结合DNA的反义分子和能靶向和切割从选自组2、组3、组4或组5多核苷酸或基因的一个或多个多核普酸或基因转录的mRNA的siRNA,可以用于降低或消除一个或多个这样的基因的表达。在优选的实施方案中,从选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸的转录物,构建siRNA。在另一个方面,本发明提供了适用于操作动物的基因组的组合物。该组合物包含一种或多种物质,后者干扰与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达。优选地,所述物质包含结合一种或多种基因或它们的转录产物、并干扰它们的复制、转录或翻译的寡核苷酸或多核苷酸,最优选使用选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸构建的寡核苷酸或多核香酸。在不同的实施方案中,所述物质包含反义分子或siRNA。在另一个方面,本发明提供了调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达的方法,或调控动物脂肪组织的量的方法,其包含,给动物施用基因表达或组织调控量的组合物,其包含DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一种或多种。在优选的实施方案中,所述组合物包含,按每千克体重每天的毫克(mg/kg/天)计算,DHA的量为约1至约30,优选约3至约15;EPA的量为约1至约30,优选约3至约15;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的量为约4/2至约30/45,优选约9/6至约18/12;ALA的量为约10至约100,优选约30至约60;LA的量为约30至约600,优选约60至约300;ARA的量为约5至约50,优选约15至约30;SA的量为约3至约60,优选约6至约30;和CLA(作为对照)的量为约6至约120,优选约12至约60。组合物可以以该组合物适合的任意方式或形式施用给动物。优选地,组合物以食物组合物或添加剂的形式经口施用给动物。食物组合物可以是任意形式,例如,30本领域已知的营养平衡的食物组合物,例如动物的干食物、半湿食物和湿食物,所述动物尤其是伴侣动物例如猫和犬动物。添加剂包括诸如片剂、胶凝剂和类似形式的剂型。在另一个方面,组合物与一种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质联合施用。所述药物或物质包括、但不限于,抑制食欲、增加代谢或干扰特定营养物(尤其来自食物)的吸收的物质。实例包括、但不限于,奥利司他(阻断脂肪分解和吸收),减食名臾剂例如疏酸右苯丙胺(抑制食欲),厌食剂例如芬氟拉明和苯丁胺、西布曲明和苯丙醇胺。在另一个方面,本发明提供了适用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达、或调控动物脂肪组织的量的组合物。该组合物包含基因表达或组织调控量的DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一种或多种。在不同的实施方案中,所述组合物包含,按mg/kg/天计算,DHA的量足以施用给动物约1至约30;EPA的量足以施用给动物约1至约30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的量足以施用给动物约4/2至约30/45;ALA的量足以施用给动物约10至约100;LA的量足以施用给动物约30至约600;ARA的量足以施用给动物约5至约50;SA的量足以施用给动物约3至约60;和CLA(作为对照)的量足以施用给动物约6至约120。这样的物质可以用于调控动物脂肪组织的量。优选地,所述物质影响多个这样的基因的表达。在一个实施方案中,所述组合物另外包含一种或多种调控动物脂肪組织的量的药物或其它物质。在另一个方面,本发明提供了筛选用于包含在一个或多个组或小组中的动物的方法。该方法包含,测定动物的下述表达(a)选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸,或(b)多肽,其中的每一种多肽特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸生成的蛋白,和基于表达图谱将动物分配到组中。所述组可以是任意有用的组,优选在研究实验、试验、临床试验或其它类似范畴中涉及的那些组。例如,所述组可以是在需要一个或多个对照组和一个或多个治疗组的研究实验或临床试-验中涉及的组。在一个实施方案中,所述对照组包含瘦动物,所述治疗组包含胖动物,或在另一个实施方案中反之。可以测定许多动物的表达图谱,基于图谱的结果将动物分配到对照组或治疗组中,即,将与标准相比差别表达了2倍或更多的动物分配到胖组,将与标准相比差别表达了231倍或更少的动物分配到瘦组。当测试潜在的药物或其它物质的减少动物脂肪组织的量的能力时,该方法特别适用于将动物分配到临床试验中。在另一个方面,本发明提供了计算机系统,其适用于操作关于与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的数据。该系统包含,含有信息的数据库,所述信息可以鉴别瘦动物和/或胖动物中一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苦酸的表达水平、和/或特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸生成的蛋白的多肽的表达水平,和与数据库交互作用的用户界面,尤其用于输入、操作和观察不同动物或分类或动物(例如瘦或胖动物)的信息。在一个实施方案中,数据库另外含有鉴别由一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸编码的一种或多种多肽的活性水平的信息。在另一个实施方案中,所述数据库另外包含一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸的序列信息。在其它实施方案中,所述数据库含有描述一个或多个动物物种中的基因的推定描述的其它信息。该计算机系统是能含有和操作数据并与用户交互作用的任意电子装置,例如,典型的计算机或设计成便于使用本发明和输出关于动物的状态的结果的分析仪器。在另一个方面,本发明提供了使用计算机系统或本发明来呈现信息的方法,所述信息会鉴别与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达。该方法包含,比较来自样品的从选自SEQIDNO:l-295的多核普酸表达的两种或多种多核苷酸或蛋白的表达水平与计算机系统中该多核苷酸或蛋白的表达。在另一个方面,本发明提供了试剂盒,其适用于测定测试系统中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的差别表达。该试剂盒包含,在单个包装中的分离的容器中或在一个虚拟包装中的分离的容器中的、与用途和试剂盒组分相适宜的、两个或多个适用于才企测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的探针,所述探针包含(a)选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸,或(b)多肽,其特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸生成的蛋白,和下述的至少一种(l)关于如何使用本发明的探针的说明书;(2)使用探针必需的试剂和仪器;(3)适用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的組合物;(4)适用于破坏与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的组合物;(5)适用于调控动物脂肪组织的量的食物组合物;和(6)—种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质。在一个优选的实施方案中,所述探针与基质结合,优选在阵列中。当所述试剂盒包含虚拟包装时,试剂盒限于在虚拟环境中的说明书以及一种或多种物理的试剂盒组分。在一个实施方案中,试剂盒含有揮:针和/或其它物理组分,关于使用探针和其它组分的说明书可以通过因特网得到。试剂盒可以含有其它项目,例如用于混合样品的装置、探针和试剂和使用该试剂盒的装置,例如,试管或混合器具。在另一个方面,本发明提供了用于交流信息或说明的工具,所述信息和说明是关于下述(1)至(13)中的一种或多种(l)使用本发明的多核苷酸,检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达,(2)使用本发明的多核苷酸,测量测试物质对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的影响,(3)使用本发明的多核苷酸,筛选测试物质以确定它是否可能用于调控动物脂肪组织的量,(4)使用本发明的多核苷酸,预测动物可能变胖或诊断动物为肥胖,(5)使用本发明的多核苷酸,操作非人动物的基因组或动物基因组的表达,(6)使用本发明的多核苷酸,调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因、尤其胖相关基因的表达,或调控动物脂肪组织的量,(7)使用本发明的多核苷酸,筛选用于包含在一个或多个组中的动物,(8)使用本发明的多核苷酸,使用计算机系统操作关于与痩动物相比在胖动物中差别表达的基因、尤其胖相关基因的数据,(9)单独地或与本发明的其它要素组合地,给动物施用本发明的物质(10)使用本发明的物质,调控动物脂肪组织的量,(ll)使用本发明的计算机系统,(12)使用本发明的试剂盒,和(13)使用本发明的方法和组合物以及一种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质。该工具包含含有信息或说明的文件、数字存储介质、光存储介质、声音呈现或视觉显示。在某些实施方案中,交流工具是含有这样的信息或说明的显示网站、视觉显示、报摊、小册子、产品标签、包装说明、广告、传单、公告、录音磁带、录像带、DVD、CD-ROM、计算机可读芯片、计算机可读卡、计算机可读盘、计算机内存或它们的组合。有用的信息包括下述的一种或多种(l)促进动物的健康和痊愈的方法,和(2)如果动物保健提供者具有关于本发明和它的使用的问题,他们使用的交流信息。有用的说明包括关于使用探针的技术,关于进行基因表达测定的说明,和物质的施用量和频率。交流工具可以用于指示使用本发明的利益。本文公开了本发明的典型优选实施方案,尽管采用了特定的术语,它们仅仅普通的且描述性的含义使用,不用于限制目的,因为在考虑本文包含的教导后,可能实现本发明的许多改进和变化。下面的实施例可以进一步解释本发明,尽管应当理解,这些实施例仅仅为了解释目的而包括,无意限制本发明的范围,除非另有特别说明。实施例材料和方法/人组织分离核糖核酸(RNA)将已经收集、在液氮中冷冻并融化的组织样品匀浆化,并使用TRIzolRNA提取方法进行处理,以生成良好质量RNA,然后进行进一步基因组分析。材料水,液氮,冷冻的犬或猫组织,TRIzol裂解试剂,氯仿最小量99%、异丙醇,70%乙醇(用无水乙醇和去离子的、无RNA酶的水制备),RNA酶Zap⑧,去离子水,RNA贮藏溶液⑧,购自Ambion。装置Ultra-TurraxT25功率匀浆器,BeckmanCoulterAllegra25R离心机,Eppendorf离心机,镊子,解剖刀,硬切面即切板,1.5mL无DNA酶和RNA酶的/无菌的微量离心管,50mL无DNA酶和RNA酶的/无菌的一次性聚丙烯试管,P1000、P200、P20、P10和P2RaininPipetman吸量管,用于P1000、P200、P20、P10和P2吸量管的过滤器吸管端,无DNA酶和RNA酶的/无菌的、且无绒的抹布。准备用4mLTRIzol⑧准备50mL聚丙烯试管(为RNA分离选择的每种组织各一个试管)。组织匀浆化给能容纳液氮的容器装上3-4勺子液氮。立即将一片冷冻的组织置于前述容器中(组织应当大约是豌豆大小),将组织置于适当标记的50mL聚丙烯试管中(其已经含有4mLTRIzol)。立即使用Ultra-TurraxT25Power匀浆器开始匀浆化。在最高设置(6)匀浆化10-15秒。在水上冷却样品另外10-15秒,然后重复。继续到组织充分匀浆化,溶液成浑法状。完全匀浆化后,盖好50mL试管,返回水上。在室温温育匀浆化的组织5分钟,然后进行分离操作。34RNA分离通常遵循与TRIzol⑧试剂一起提供的Invitrogen说明书中的操作。在4个1.5mL微量离心管中,将匀浆化的样品分离成4个lmL等分试样。向每个lmL等分试样中加入200uL氯仿。盖好试管,涡旋15秒,然后上下摇动。得到粉红色乳状液体。在室温温育试管2-3分钟。在14,000rpm和4。C离心试管15分钟。将水相(顶层)转移至无菌的1.5mL微量离心管。要转移至新试管的水相的典型体积是约500uL。确信不要转移任何中间相或下相。通过向含有水层的每个微量离心管中加入500uL异丙醇,从溶液中沉淀RNA。上下摇动试管至少20秒。在室温温育样品10分钟。在14,000rpm、在4°C离心样品10分钟。通过抽吸液体并确信不会丢失沉淀,小心地取出上清液。加入lmL70。/。乙醇来洗涤沉淀。通过轻打试管(或在工作台上面轻敲试管)来移动沉淀,并晃动来混合。在8,200rpm、在4°C离心5分钟。通过抽吸液体并确信不会丢失沉淀,小心地取出上清液。使用无绒抹布小心地吸收多余的乙醇,确保沉淀物是干燥的。将沉淀物重新悬浮于30uLRNA贮藏溶液。通过洗液轻轻混合,直到RNA回到溶液中,然后保藏在-80。C。可能需要在低速涡旋样品几秒,以促进RNA的重新悬浮。如果这是必要的,在冷冻之前使用微量离心机沉淀样品。RNA清洁遵循在RNeasyMini手册中给出的操作。使用RNeasyMini试剂盒从在OptiCell室中培养的细胞分离RNA使用从哺乳动物细胞系培养的细胞来分离良好质量的RNA,然后用于将来的下游基因组分析。与细胞培养有关的所有工作都在严格的无菌条件下进行。试剂10XPBS,去离子的1120,无水乙醇,RNA贮藏溶液,卩-巯基乙醇,RNA酶Zap,緩冲液RLT,和緩冲液RWl和緩冲液RPE(在RNeasyMmi试剂盒中提供)。装置/材料RNeasyMini试剂盒,QIAshredder旋转柱,OptiCell刀,20mL无菌注射器,OptiCell尖,细胞刮棒,P1000Pipetman吸量管,Rainin,P200Pipetman吸量管,Rainin,100-lOOuL过滤式吸量管尖,l-200uL过滤式吸量管尖,无菌转移吸量管,55mL无菌溶液盆,1.5mL无菌微量离心管,和Eppendorf微量离心机。溶液緩冲液RLT(在RNeasyMini试剂盒中提供的原液);-在开始实验前,每lOmL緩沖液RLT加入lOOuLP-疏基乙醇。70%乙醇通过将3535mL无水乙醇加入15mL去离子的、无RNA酶的水中,制备50mL70l乙醇。1XPBS:无RNA酶的水。使用.22um过滤器过滤溶液。操作从OptiCell室取出细胞(一次处理一个OptiCell)。在显微镜下检查细胞,以确保细胞在分离RNA之前是活的。取出并抛弃细胞培养基。使用OptiCell刀切掉顶膜,将细胞暴露于下膜上。用1XPBS洗涤细胞粘附的膜3次。吸量600uL緩冲液RLT溶液(含有p-巯基乙醇)到细胞粘附的膜的中心。使用细胞刮棒,将緩冲液RLT轻轻涂布在膜的整个表面上,然后将液体收集在一个角中。吸出整个体积的緩冲液RLT,并置于QIAshredder旋转柱中。RNA分离在14,000rpm离心QIAshredder旋转柱2分钟。排空旋转柱,但是保留收集管和它的内容物。将600uL70%乙醇加入收集管,并通过洗液混合均匀(现在的总体积=1.2mL)。将600uL细胞裂解物转移至RNeasymini柱,在14,000rpm离心15秒。抛弃流出物,但是保留收集管和旋转柱。将剩余体积的细胞裂解物(600uL)转移至旋转柱,重复离心。抛弃流出物,但是保留收集管和旋转柱。将700uL緩冲液RWl加入旋转柱。在14,000rpm离心15秒来洗涤柱子。抛弃流出物和收集管。将旋转柱转移至一个新的2mL收集管,向柱中加入500uL緩冲液RPE。在14,000rpm离心15秒。抛弃流出物,保留收集管/柱。向柱中加入另外500uL緩冲液RPE。在14,000rpm离心2分钟。将旋转柱转移至1.5mL收集管。向^圭胶膜直接添加30uLRNA贮藏溶液,在14,000rpm离心1分钟,以洗脱RNA。在-70。C贮存最终的RNA。RNA6000Nano测定使用Agilent2100生物分析仪和RNA6000Nano测定,分析从培养的哺乳动物细胞、淋巴细胞或组织分离的RNA的质量。试剂RNA6000Nano凝胶基质,RNA6000Nano染料浓缩物,RNA6000Nano标记,(所有上述试剂都包含在Agilent的RNA6000Nano测定试剂盒中),RNA6000梯度剂(ladder),RNA酶Zap和无RNA酶的水,购自Ambion。装置/其它材料AgilentChipPrimingStation,Agilent,RNA6000芯片,Agilent,电极清洁剂,P2,P10、P200,和P1000RaininPipetman吸量管,无菌的、无DNA酶/RNA酶的过滤式吸量管尖,1.5mL樣史量离心管,无菌的、涡旋式IKA涡旋混合仪,微量离心机,和加热块。操作操作提供在ReagentKitGuide,RNA6000Nano测定,2003年11月版,AgilentTechnologies中。遵循指南给出的操作,采用下述改进制备凝胶,第17页-而不是将过滤的凝胶分离成各65uL的等分试样,将原料过滤的凝胶保持在原始的微量离心管中,根据需要等分65uL。装载RNA6000Nano标记,第22页-向将来不含有样品的每个样品孔加入luL无RNA酶的水(替代RNA6000Nano标记)。这不仅保留使用的标记的量,而且用作阴性对照,以观察试剂未被污染,包括无RNA酶的水。装载梯度剂和样品,第23页-在71。C热变性样品和RNA6000梯度剂另外30秒(共2.5分钟)。开始ChipRun,第26页-从测定菜单中选择"EukaryoteTotalRNANano"选项。AffymetrixGenechip表达分析4吏用可从Affymetrix,Inc.,SantaClara,CA95051商业得到的Affymetrix犬1和犬2GeneChip⑧阵列,分析基因表达。将全RNA逆转录成cDNA。cDNA用于制备cRNA,将后者分段,用作GeneChip杂交的探针。洗涤基因芯片,用Affymetrix激光扫描仪测量杂交信号。然后验证和标准化杂交数据,用于将来分析。材料Affymetrix提供了大部分试剂和试剂盒。在Affymetrix手册中列出但是没有在试剂盒中提供的其它试剂可以个别地得到(细节参见GeneChipExpressionAnalysisTechnicalManual(701021Rev.4)),RNA酶Zap⑧和去离子水。装置Eppendorf微量离心机,1.5mL无DNA酶和RNA酶的/无菌的微量离心管,50mL无DNA酶和RNA酶的/无菌的一次性聚丙烯试管,P1000、P200、P20、P10和P2RaininPipetman吸量管,无DNA酶和RNA酶的/无菌的、用于P1000、P200、P20、P10和P2吸量管的过滤器吸管端,和Peltier热循环仪PTC-200。操作完全遵循在GeneChipExpressionAnalysisTechnicalManual(AffymetrixCopyright1999-2003)中描述的所有操作。使用5微克总RNA用于第一链cDNA合成。使用Peltier热循环仪PTC-200或加热块用于反应和探针变性中的温度控制。使用具有BioAnalyer2100的RNANanoDrop芯片进行质量控制。使用100格式(Midi阵列)用于M因芯片。实施例1测定来自胖和瘦动物的脂肪组织样品之间的差别基因表达从使用常规方法诊断为"胖,,或"瘦"的16(3瘦和13胖)只犬动物得到脂肪组织样品。基于使用常规方法的DEXA测量,或基于5点身体状况评分系统,确定动物的"胖度"或"瘦度"。例如,如果具有2或2.5的身体状况评分和/或27%或更低的DEXA总身体脂肪百分比,认为该动物是瘦的。如果具有4或更高的身体状况评分和30%或更高的总身体脂肪百分比,认为该动物肥胖。所有组织样品在从动物取出后,立即在液氮中快速冷冻。根据常规方法,使用Affymetrix"犬-2"M因芯片分析组织,以便确定哪个基因(如果存在的话)与瘦动物相比在胖动物中差别表达。使用GeneSpring和R-Bioconductor软件,比较和分析来自胖和瘦样品的数据。对于要指定为"存在"的任意给定基因,必须表现出有待进一步详察的表达水平的2-倍变化。此外,也选择仅在一种条件下存在且在其它组中"缺少"或"边缘的"的基因用于进一步详察。在下表中提供了结果表1:与瘦动物相比在胖动物脂肪组织中差别表达至少2倍的基因且123451Cfa.6562.1.A1—at6.48XM—516142BC0652712CfaAffx.26065.1.S1—at3.94XM画—547914AF1111673CfaAffx.2782.1.S1—s—at3.78XM_—538649AJ2434254CfaAffx.2790.1.S1—s—at3.66XM_538649BC073983Cfa.18367.1.SI—at3.19NM—001032284AC0134186Cfa.90391.Al—at3.07XM—547914BX6471047CfaAffx.7975.1.SI—at3.06NM一182490NM—1824908CfaAffx.24964.1.S1—at3.05XM-543892NM—0328039Cfa.3011.1.Al一a—at0.33XM-画782177AC00522710CfaAffic.14652.1.SI—at0.33XM848392BT02009811Cfa.15689.1.A1—at0.33XM—_844220AC02055012CfaAffx.2909.1.S1—at0.33XM-538880NM—00411713CfaAffx.4844.1.S1—s—at0.33XM-_538481BT01976614Cfa.12840.1.A1at0.32BC034770AL15782315CfaAffx.4097.1.S1—s—at0.32XM—539427BC04023916CfaAffic.20841.1.S1—at0.31XM—537163AC10739417Cfa.15420.l.Al—at0.3NM—077876AC06195818CfaAffx.l7336.1.S1—s—at0.28AJ575592雇—00109319CfaAffk.4844.1.S1—at0.26XM_538481BT01976620Cfa.8932.1.A1—at0.25AB089806AC00643121Cfa.15612.l.Al一at0.24■019AC07383822CfaAffk.ll概l.Sl一at0.21XM—850381NM—19853823CfaAffx.20763.1.S1—at0.16XM—719217AC09001824CfaAffe.732.1.S1—x—at0.14NM—181756AK09535125CfaAffit.732.1.S1—at0.12NM—181756NM—18175626Cfa.2343.1.Sl一at2.97XM—532944CR61712927Cfa.l3082.1.A1—s—at2.83D38312AC07202228Cfa.9807丄A1—at2.77NM—005458AL59150229CfaAffx.4729.1.Sl_at2.76XM—532014NM—00369230Cfa.l213.1.Sl_s—at2.73X97226BC01614731Cfa.l5795.1.Al一s一at2.66XM—582039X5368332Cfa.14576.l.Al—at2.65Z73942AK09723233Cfa.3851.1.S1—s—at2.64NM—001003297M2822634CfaAffx.19953.l.Sl一s一at2.63AY342349AB02313535CfaAffx.l8514.1.S1—at2.63XM—547393BC05892236CfaAffx.l7954.1.S1—at2.6XM—545023NM—02409037Cfa.3093.1.A1—at2.59AJ011893AC01868038Cfa.l9016.1.S1—at2.58XM—843279BC06163739CfaAffx.28084.1.S1—sat2.58NM—001005255NM—00562340CfaAffx.l9953.1.S1—at2.53AC150702AL10979741Cfa.1980.l.Sl一at2.52BC014339雇—13878642Cfa.13370.l.Al—at0.4NM—001021464AL35695443Cfa.l5388丄Sl一at0.4XM—532002AF13183644Cfa.7478丄A1—s—at0.4BC028417丽—00109345Cfa.3749.1.S1—at0.4NM—001003220NM一OO100662446CfaAffx.7949.1.S1—s—at0.39AK023099NM—01338047CfaAffx.52.1.Sl一at0.39AF159295X0320548Cfa.4556.3.A1—x—at0.39L36871BC07376549CfaAffx.4308.1.Slat0.39XM—861344NM—0014983950Cfa.16772.l.Al—at0.38AF488410AB060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at0.42XM548431NM—004059287CfaAffe.ll552丄S1—s_at0.41XM_533773BC017772288Cfa.13150.1.A1—at0.41丽-177737AC044787289CfaAffx.ll212.1.S1—s—at0.41XM—540544AL832391290CfaAffx.1928.l.Sl一at0.41XM-541178NM—032532291Cfa.ll092.1.A1—at0.41NM—021197AC009123292CfaAffx.19304.1.SI—at0.41XM846272AC079151293CfaAffx.5035.1.Sl—s一at0.41XM858105CR625459294Cfa.3648.1.Slat0.41XM517428AC006320295Cfa.lll04.1.Slat0.41XM535184AC083886表2:与瘦动物相比在胖动物的脂肪组织中差别表达的与脂类和葡萄糖代谢有关的基因1234555CfaAffx.929U.Sl—s一at0,,38AB020887CR62650860Cfa.8843.1.A1—s—at0.■37XM—8474卯AY88909081Cfa.l6947丄A1—at2..31XM—543596AL512286112Cfa.825.1.S2—at2..08AY357941AL606517133CfaAffx.25283.1.Sl_.at0,,5XM—846648AF186379204Cfa.204.1.S1—s—at0..49U91844U01120188CfaAffx.2004.1.S1—s—at0.47XM—531894NM一OO1017372212CfaAffx.27879.1.S1—■s—at0.46XM—542108BC047591216Cfa.14057.1.A1—at0..46XM—536086丽一003413232CfaAffx.15436.1.SI—.at0.45XM—543027BC019898240CfaAffx.22832.1.S1—.s—at0.45XM—536069丽—032726274CfaAffe.8051.1.S1—at0.43XM—844206BC102460295Cfa.lll04.1.S1—at0.41XM—535184AC08388611Cfa.15689.1.A1—at0.■33XM—844220AC020550241Cfa.2282.1.Sl一at0.■45XM—539427A譜642815CfaAffx.4097.1.Sl一s一at0.32XM—539427BC04023944Cfa.7478.1.A1—s一at0,.4BC028417NM一00109318CfaAffx.l7336.1.Sl_—s_at0.28AJ575592丽一00109365CfaAffx.l7376.1.Sl一-S一at0.36AJ575592NM一00109366Cfa.l5138.1.A1—at0.36NM—001093AC007637124Cfa.3358.1.S1—at2.03NM—024090AK02703136CfaAffx.17954.l.Sl一—at2.6XM—545023NM一024090285Cfa.l286.1.A1—at0.42XM—583309CR59985367Cfa.lOl.l.Sl—s—at0.35XM—533208BC00018562CfaAffx.l6813.1.S1——at0.37XM—533208NM一00187670CfaAffx.22979.1.Sl一管s一at0.34XM—533208AJ420748182Cfa.ll839.1.A1—s—at0.48XM—535129BC064978157CfaAffk.l4411.1.Sl_—at0.49XM—535129BC064978183Cfa.l2915.1.Alat0.48NM145693AC01245647243Cfa.10854.1.SI—at0.45XM—532878AL513550273CfaAfk.6374.1.Slsat0.43XM851910AB168681表3:鉴别为相对于瘦动物与胖动物特别相关的基因(组5)123456Cfa.9039.1.A1—at3.07XM_—547914BX6471042CfaAffx.26065.1.Sl一at3.94XM_—547914AF1111673CfaAffk.2782.1.S1—s—at3.78XM_—538649AJ2434254CfaAffk.2790.LSl—s—at3.66XM_—538649BC073983274CfaAffx.8051.1.Sl一at0.43XM_844206BC102460295Cfa.lll04.1.S1—at0.41XM_—535184AC08388611Cfa.15689.l.Al—at0.33XM—844220AC02055068Cfa.12375.l.Al—at0.35XM——538880BC04260512CfaAffx.2909.1.S1—at0.33XM_—538880雇—004117241Cfa.2282.1.S1—at0.45XM_—539427AK09642815CfaAffx.4097.1.Sl一s—at0.32XM539427BC04023944Cfa.7478.1.Al一s—at0.4BC028417雇—00109318CfaAffx.l7336.1.S1—s—at0.28AJ575592NM—00109365CfaAffx.l7376.1.Sl一s—at0.36AJ575592雇—00109366Cfa.15138.l.Al—at0.36NM—001093AC00763713CfaAffic.4844丄S1—s—at0.33XM一538481BT01976619CfaAffx.4844.1.S1—at0.26XM—_538481BT019766138Cfa.12746.1.SIat0.5XM——538481AC09384025CfaAffx.732.1.S1—at0.12NM—181756NM—18175624CfaAffk.732.1.S1—x—at0.14雇-画181756AK095351124Cfa.3358.1.S1—at2.03NM-匿0240卯AK02703136CfaAffx.l7954.1.S1—at2.6XM-545023NM—02409056CfaAffx.25065.LSl—at0.38画-001003220NM—00647445Cfa.3749.1.S1—at0.4雇-001003220NM—001006624261CfaAffx.25065.1.S1—s—at0.44丽-_001003220AF03042849CfaAffx.4308.1.S1—at0.39XM_—861344NM—00149857CfaAffx.4309.1.Sl一s一at0.38XM_—861358NM—00149863CfaAffx.7431.1.Slat0.37XM_533636BC08055148244CfaAffx.7437.1.S1—s—at0.45XM—.533636AB054067285Cfa.l286.1.Al一at0.42XM—.583309CR59985367Cfa.lOl.l.Sl—s—at0.35XM—533208BC00018562CfaAffx.l6813.1.S1—at0.37XM__533208NM—00187670CfaAffx.22979.1.S1—s—at0.34XM—匿533208AJ42074878Cfa.l5094.1.S1—a_at2.37XM一533973AL13696285Cfa.l5094.2.Sl一a一at2.22XM-—847625AC10746492CfaAffx.l8323.1.Sl_at2.17XM_—536545NM—00310579Cfa.20568丄S1—at2.36NM一003105NM—003105125CfaAffic.l8323.1.S1—s一at2.03XM_—536545U6097594CfaAffe.11365.lSl—at2.16XM画—535242AF059617114CfaAffx.ll365.1.S1—s—at2.07XM—854900NM—006622158Cfa.12167.l.Al—at0.49XM_-857472CR614711159CfaAffx.9452.1.Sl一s一at0.49XM_-857591U06117182Cfa.11839.l.Al一s一at0.48XM_535129BC064978157CfaAffx.l4411.1.S1—at0.49XM一—535129BC064978185Cfa.4590丄Sl一s一at0.48XM——848228NM—017680186Cfa.533.1.S1—at0.48丽画001034309AY358329205CfaAffx.3284.1.S1—at0.47XM_—846138NM_018965206CfaAffx.3283.1.S1—at0.47XM_—874820AY204749184Cfa.4465.2.S1—s—at0.48XM845215NA230CfaAffx.21066.1.S1—s—at0.46XM8442%NA207Cfa.18689.l.Sl一at0.47XM—534893CR749334231Cfa.l8689.1.S1—s—at0.46XM—_534893BC040071160Cfa.6037.1.S1—s—at0.49XM—534893CR749334242CfaAffx.26949.1.S1—at0.45XM-—547958AL137735228CfaAffe.26949.1.S1—s—at0.46XM——547958AL132642245Cfa.3664.1.S1—s—at0.45NM-001003173AC004485246Cfa.15462.l.Al—at0.45雨-001003173AL161729183Cfa.l2915丄A1—at0.48NM-145693AC012456243Cfa.l0854.1.S1—at0.45XM532878AL513550273CfaAffx.6374丄S1—s—at0.43XM—851910AB168681275CfaAffx.9808.1.S1—at0.43XM534351AL035668276Cfa.7153.1.A1—s—at0.43XM—534351AL035668187CfaAffx.3714.1.Slat0.48XM541288AL16239049277Cfa.l5136.1.Sl一at0.43画—匿001206AL162390208Cfa.l6744.1.Sl一at0.47XM-—873620AL162390203Cfa.1213U.Al—at0.47XM--548431Y17448229CfaAffic.30657.1.Sl一at0.46XM-匿548431画—004059204CfaAffx.30657.1.S1—s—at0.47XM-—548431画—004059286Cfa.l7433.1.Slsat0.42XM548431NM004059表4:基因描述-最高BLAST命中登录号SEOIDNO基因描述-最高BLAST命中登录号1预测的黑猩猩,类似于假定蛋白ARM(LOC460002),mRNA2预测的家犬,类似于原癌基因蛋白c-fos(细胞癌基因fos)(GO/Gl开关调节蛋白7),转录物变体1(LOC490792),mRNA3预测的家犬,类似于早期生长响应蛋白1(EGR-l)(Krox-24蛋白)(ZIF268)(神经生长因子-诱导的蛋白A)(NGFI-A)(转录因子ETR103)(锌指蛋白225)(AT225),转录物变体2(LOC481528),mRNA4预测的家犬,类似于早期生长响应蛋白1(EGR-1)(Krox-M蛋白)(ZIF268)(神经生长因子-诱导的蛋白A)(NGFI-A)(转录因子ETR103)(锌指蛋白225)(AT225),转录物变体2(LOC481528),mRNA5人类胸腺生成素(TMPO),转录物变体3,mRNA6预测的家犬,类似于原癌基因蛋白c-fos(细胞癌基因fos)(G0/G1开关调节蛋白7),转录物变体1(LOC490792),mRNA7人类锌指蛋白227(ZNF227),mRNA8预测的家犬,类似于溶质载体家族7(阳离子氨基酸运载体,y+系统),成员3(LOC486765),mRNA9预测的紫色球海胆,类似于CG31108-PA(LOC582217),部分mRNA10预测的家犬,类似于血清/糖皮质激素调节的激酶2同种型卩(LOC610835),mRNA11预测的家犬,类似于植烷酰-辅酶A羟化酶前体(LOC478001),mRNA12预测的家犬,类似于FK506-结合蛋白5(肽酰-脯氨酰顺反式异构酶)(PPIase)(旋转异构酶)(51kDaFK506-结合蛋白)(FKBP-51)(54kDa孕酮受体-相关的的亲免素)(FKBP54)(P54)(FF1抗原)(HSP90-结合亲免素)(..。(LOC481759),mRNA13预测的家犬,类似于肝瘤-相关的钙信号转导物1前体(主要胃肠肿瘤-相关的蛋白GA733-2)(上皮细胞表面抗原)(上皮糖蛋白)(EGP)(腺癌-相关的抗原)(KSA)(KS1/4抗原)..。(LOC481360),mRNA14人类,克隆IMAGE:5171802,mRNA5015预测的家犬,类似于[丙酮酸脱氢酶[硫辛酰胺]]激酶同工酶4,线粒体前体(丙酮酸脱氢酶激酶同种型4)(LOC482310),mRNA16预测的家犬,类似于niban蛋白同种型2(LOC480041),mRNA17秀丽隐杆线虫BMP受体相关的蛋白家族成员(bra-l)(bra-l)mRNA,完整cds18乙酰-辅酶A羧化酶2的人类mRNA(ACACB基因)19预测的家犬,类似于肿瘤-相关的钙信号转导物1前体(主要胃肠肿瘤-相关的蛋白GA733-2)(上皮细胞表面抗原)(上皮糖蛋白)(EGP)(腺癌-相关的抗原)(KSA)(KS1/4抗原)..。(LOC481360),mRNA20小鼠Murrl和U2afl-rsl基因,部分和完整cds21空肠弯曲杆菌81-176(pflA)基因,完整cds,orfl和orf2,部分cds22预测的家犬,类似于suprabasin(LOC612650),mRNA23约氏疟原虫yoelii菌林17XNL假定蛋白(PY04060)mRNA,部分cds24人类锌指蛋白233(ZNF233),mRNA25人类锌指蛋白233(ZNF233),mRNA26预测的家犬假定LOC130733(LOC475737),mRNA27人类bcl6基因,5,侧翼区28人类G蛋白-偶联的受体51(GPR51),mRNA29预测的家犬,类似于具有EGF-样和两个卵泡抑素-样结构域1的跨膜蛋白,转录物变体1(LOC612942),mRNA30孤细胞核受体dNGFI-B蛋白的家犬mRNA31预测的牛推定的MIP1-卩蛋白(L0C414347),mRNA32小GTP-结合蛋白的L.japonicusmRNA,RAB7C33家犬趋化因子(C-C基序)配体2(CCL2),mRNA34家犬诱导型T-细胞辅助刺激因子(ICOS)mRNA,完整cds35预测的家犬层粘连蛋白(33(LOC442953),mRNA36预测的家犬,类似于ELOVL家族成员6,长链脂肪酸(FEN1/Ek)2,SUR4/Elo3-样,酵母)(LOC487900)的延伸,mRNA37细胞周期蛋白D3.1蛋白(CycD3.1)的烟草mRNA38预测的家犬,类似于蛋白C14orfl19(LOC607014),mRNA39家犬趋化因子(C-C基序)酉己体8(CCL8),mRNA40稻(日本品种-組)染色体11克隆B1"6E08,完整序列41人类跨膜4L6家族成员18,mRNA(cDNA克隆MGC:23935IMAGE:3828466),完整cds42裂殖酵母972h-异亮氨酸-tRNA连接酶(SPBC8D2.06),部分mRNA43预测的家犬,类似于原肌球调节蛋白1,转录物变体1(LOC474771),mRNA44人类乙酰-辅酶A羧化酶P,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4824130),完整cds514546474849505152535455565758596061626364656667686970家犬podoplanin(PDPN),mRNA人类cDNAFLJ13037fis,克隆NT2RP3001268,高度类似于人类锌指蛋白ZNF228(ZNF228)mRNA人类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Kp78剪接变体CTAK75amRNA,完整cds家犬IgA重链恒定区基因,部分cds预测的家犬,类似于谷氨酸-半胱氨酸连接酶催化亚基(y-谷氨酰基半胱氨酸合成酶)(y-ECS)(GCS重链),转录物变体3(LOC609822),mRNA人类细胞周期蛋白-依赖性的激酶抑制剂mRNA,部分cds预测的家犬,类似于ATP酶,H+运输,溶酶体42kDa,VI亚基C同种型2,转录物变体4(LOC475667),mRNA预测的牛,类似于千扰素调节因子4(IRF-4)(淋巴细胞特异性的千扰素调节因子)(LSIRF)(NF-EM5)(多发性骨髓瘤癌基因1),转录物变体2(LOC506141),mRNA预测的家犬,类似于ARV1同源物,转录物变体1(LOC488975),mRNA预测的家犬视网膜母细胞瘤1(RBI),mRNA家犬解偶联蛋白2的ucp2mRNA,完整cds家犬podoplanin(PDPN),mRNA预测的家犬,类似于谷氨酸-半胱氨酸连接酶催化亚基(y-谷氨酰基半胱氨酸合成酶)(y-ECS)(GCS重链),转录物变体4(LOC609822),mRNA家犬免疫球蛋白y重链CmRNA,完整cds预测的家犬,类似于X-连接的neuroligin4,转录物变体1(LOC607406),mRNA预测的家犬,类似于载脂蛋白C-I前体(Apo-CI)(ApoC-I),转录物变体2(LOC476437),mRNA预测的小鼠假定蛋白LOC628198(LOC628198),mRNA预测的家犬肉毒i威棕榈酰转移酶I同种型(CPT1),mRNA预测的家犬,类似于缺氧-可诱导的因子-3a同种型a(LOC476429),mRNA预测的家犬,类似于claudin10同种型b,转录物变体1(LOC476963),mRNA乙酰-辅酶A羧化酶2的人类mRNA(ACACB基因)人类乙酰-辅酶A羧化酶(3(ACACB),mRNA预测的家犬肉毒石威棕榈酰转移酶I同种型(CPT1),mRNA预测的家犬,类似于FK506-结合蛋白5(肽酰-脯氨酰顺反式异构酶)(PPIase)(旋转异构酶)(51kDaFK506-结合蛋白)(FKBP-51)(54kDa孕酮受体-相关的的亲免素)(FKBP54)(P54)(FF1抗原)(HSP90-结合亲免素)(..。(LOC481759),mRNA预测的家犬,类似于NOV蛋白同源物前体(NovH)(肾胚细胞瘤过表达的基因蛋白同源物)(LOC475083),mRNA预测的家犬肉毒石成棕榈酰转移酶I同种型(CPT1),mRNA5271NitellajaponicaATP合酶(3亚基的色质体atpB基因,部分cds,菌林:S09072人类溶质载体家族26,成员7(SLC26A7),转录物变体1,mRNA73预测的家犬,类似于NHP2-样蛋白1(高迁移率组-样核蛋白2同源物1)([U4/U6.U5]三-snRNP15.5kDa蛋白)(精子特异性的抗原1)(受精抗原1)(FA-1),转录物变体2(LOC609886),mRNA74预测的家犬,类似于转录因子j皿-B(LOC484927),mRNA75预测的家犬,类似于胶原a1(III)链前体,转录物变体3(LOC478835),mRNA76预测的家犬,类似于细胞分裂周期7有关的蛋白激酶(CDC7有关的激酶)(HsCdc7)(huCdc7)(LOC479955)'mRNA77人类含有亮氨酸富集重复序列的17(LRRC17),转录物变体1,mRNA78预测的家犬,类似于在非转移性细胞1中表达的,蛋白(NM23A)(核苷二磷酸激酶)(LOC476767),mRNA79人类sortilin有关的受体,含有L(DLR类)A重复序列的(SORLl),mRNA80家犬抗肌萎缩蛋白(DMD)mRNA,5'非翻译区,或者剪接的81预测的家犬,类似于胆固醇25-羟化酶(LOC486470),mRNA82预测的家犬假定蛋白LOC612422(LOC612422),mRNA83预测的家犬醛缩酶C,转录物变体4(LOC480622),mRNA84豌豆核糖体蛋白L34同源物(RPL34)mRNA,完整cds85预测的家犬,类似于在非转移性细胞1中表达的,蛋白(NM23A)(核苷二磷酸激酶)(LOC609873),mRNA86家犬血清淀粉状蛋白A蛋白(SAA)mRNA,部分cds87TPA:人类染色体17中间SMS-REP低-拷贝重复序列,基因组序列88预测的牛,类似于肝素-结合EGF-样生长因子(LOC522921),mRNA89人类含有BTB(POZ)结构域的11(BTBD11),转录物变体3,mRNA卯预测的家犬,类似于G-蛋白信号传递l(RGSl)的调节物(早期响应蛋白1R20)(B-细胞激活蛋白BL34),转录物变体2(LOC488585),mRNA91预测的牛,类似于核分布基因E同源物1(LOC508088),mRNA92预测的家犬,类似于含有sortilin有关的受体的LDLR类A重复序列的前蛋白原(LOC479408),mRNA93预测的家犬,类似于锚蛋白重复序列结构域26(LOC609691),mRNA94预测的家犬,类似于马球样激酶2,转录物变体1(LOC478063),mRNA95预测的家犬,类似于跨膜4L6家族成员l(肿瘤-相关的抗原L6)(膜组分,表面标记1)(M3S1)(LOC477107),mRNA96预测的家犬,类似于含有亮氨酸富集重复序列的39,转录物变体1(LOC"0141),mRNA97人类核纤层蛋白Bl(LMNB1),mRNA98预测的家犬,类似于reelin同种型b,转录物变体1(LOC483273),mRNA99预测的家犬,类似于含有egf-样模块的,粘蛋白-样,激素受体-样序列2同种型d(LOC484897),mRNA100预测的牛,类似于BTG2蛋白(NGF-可诱导的蛋白TIS21)(LOC539364),mRNA101预测的家犬,类似于锚蛋白重复序列结构域26(LOC491592),mRNA102食蟹猴睾丸cDNA克隆QtsA-13105,类似于人含有犰狳重复序列的2(ARMC2),mRNA,RefSeq:NM—032131.3103预测的牛,类似于含有甘油磷酸二酯磷酸二酯酶结构域的4(LOC525172),mRNA104预测的家犬,类似于立即早期响应2(LOC484917),mRNA105预测的家犬,类似于干扰素y诱导型蛋白47(LOC481471),mRNA106人类KIAA0040(KIAA0040),mRNA107预测的家犬假定蛋白LOC612422(LOC612422),mRNA108预测的家犬,类似于小诱导型细胞因子A3-样1前体(扁桃体淋巴细胞LD78卩蛋白)(LD78-p(1-70))(G0/G1开关调节蛋白19-2)(G0S19-2蛋白)(PAT464.2)(LOC480600),mRNA109人类曱状腺激素受体,卩(成红细胞白血病病毒(v-erb-a)癌基因同源物2,禽类),mRNA(cDNA克隆MGC:126110IMAGE:40033200),完整cds110约氏痴原虫yoelii菌抹17XNL假定蛋白(PY01308)mRNA,部分cds111预测的家犬,类似于丝裂原-激活的蛋白激酶激酶6同种型1,转录物变体3(LOC480454),mRNA112人类葡萄糖运载体14短同种型mRNA,完整cds;或者剪接的113预测的牛,类似于LAG1长寿保证同源物5,转录物变体2(LOC530T76),mRNA114预测的家犬,类似于马球-样激酶2,转录物变体3(LOC478063),mRNA115玉蜀黍黑粉菌521假定蛋白(UM05082.1),mRNA116推定的分泌的、鬈毛有关的蛋白2的家犬mRNA(sfrp2基因)117来自4的人类BAC克隆RP11-216H12,完整序列118家犬MHC类Ib基因(DLA-79)基因,完整CDS119预测的家犬,类似于过氧化物酶体的肌氨酸氧化酶(PSO)(L-哌啶酸盐氧化酶)(L-哌啶酸氧化酶)(LOC491177),mRNA120预测的家犬,类似于纺锤体装配异常蛋白6(LOC490142),mRNA121预测的家犬,类似于中性粒细胞明胶酶-相关的lipocalin前体(NGAL)(P25)(MMP-9的25kDaa-2-微球蛋白有关的亚基)(lipocalin2)(癌基因24p3),转录物变体2(LOC491320),mRNA122预测的家犬,类似于骨髓的/淋巴的或混合性白血病5,转录物变体11(LOC476542),mRNA页123人类claudin4,mRNA(cDNA克隆MGC:1778IMAGE:3349211),完整cds124人类ELOVL家族成员6,长链脂肪酸(FEN1/Ek)2,SUR4/Elo3-样,酵母)的延伸(ELOVL6),mRNA125预测的家犬,类似于含有sortilin有关的受体的LDLR类A重复序列前蛋白原(LOC479408),mRNA126预测的家犬,类似于fem-l同源物b(LOC478352),mRNA127预测的家犬,类似于含有FXYD结构域的离子转移调节剂6(LOC610831),mRNA128预测的家犬假定LOC481916(LOC481916),mRNA129预测的家犬,类似于F46E10.1a(LOC480551),mRNA130人类基因组DNA,染色体18克隆:RP11-883A18,完整序列131预测的家犬,类似于BE10.2(LOC475247),mP、NA132家犬T细胞受体卩链hcvb3(hcvb3)mRNA,部分cds133预测的家犬,类似于过氧化物酶体增殖激活的受体,y,共活化物1a,转录物变体1(LOC479127),mRNA134预测的家犬,类似于LIM和衰老细胞抗原-样结构域1,转录物变体1(LOC474540),mRNA135预测的牛,类似于硫酸乙酰肝素D-葡糖氨基3-0-磺基转移酶2(LOC532099),部分mRNA136预测的牛,类似于磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,I型,(3同种型2,转录物变体1(LOC537654),mRNA137家犬二氢二醇脱氢酶(二聚的)(DHDH),mRNA138预测的家犬,类似于肿瘤-相关的钩信号转导物1前体(主要胃肠肿瘤-相关的蛋白GA733-2)(上皮细胞表面抗原)(上皮糖蛋白)(EGP)(腺癌-相关的抗原)(KSA)(KS1/4抗原)..。(LOC481360),mRNA139家犬葡萄糖-6-磷酸酶mRNA,完整cds140宽吻海豚IgM重链mRNA,完整cds141预测的家犬,类似于肌酸激酶,线粒体1B前体,转录物变体3(LOC478277),mRNA142预测的黑猩猩激酶有关的蛋白,telokin(LOC460640),mRNA143人类血清/糖皮质激素调节的激酶2,mRNA(cDNA克隆IMAGE:2988475),含有移码错-口妖144爪蟾遍在转录的tetratricopeptide重复序列基因,Y-连接的,mRNA(cDNA克隆MGC:82191IMAGE:3401210),完整cds145预测的家犬,类似于互补序列组分1,q亚组分,y多肽(LOC487382),mRNA146预测的家犬,类似于ARV1同源物,转录物变体1(LOC488975),mRNA147家犬氧化亚氮合酶2A(可诱导的,肝细胞)(NOS2A),mRNA55148预测的牛,类似于F-框蛋白44同种型1(LOC505957),mRNA149预测的家犬,类似于PRKC,细胞祠亡,WT1,调节剂(LOC611487),mRNA150预测的家犬,类似于互补序列Clq亚组分,A链前体(LOC478194),mRNA151家犬triadin同种型3mRNA,完整cds152预测的家犬,类似于CG13624-PC,同种型C,转录物变体2(LOC612888),mRNA153预测的家犬,类似于CG4774-PA,同种型A,转录物变体2(LOC607530),mRNA154人类neuropilin2(NRP2)基因,完整cds,或者剪接的155预测的家犬,类似于Tetraspanin-5(Tspan-:5)(跨膜4超家族成员9)(Te仃aspanNET-4),转录物变体2(LOC478486),mRNA156预测的家犬,类似于IgX链恒定区(LOC607541),mRNA157预测的家犬,类似于丙酮酸脱氢酶磷酸酶前体(LOC477941),mRNA158预测的家犬,类似于黄噤呤脱氢酶/氧化酶,转录物变体3(LOC483028),mRNA159预测的家犬,类似于黄。票呤脱氢酶/氧化酶,转录物变体8(LOC483028),mRNA160预测的家犬,类似于a-2-巨球蛋白前体(a-2-M)(LOC477699),mRNA161预测的家犬假定LOC480209(LOC480209),mRNA162预测的家犬磺基转移酶家族,胞质的,IB,成员I(SULTIBI),mRNA163预测的家犬,类似于水通道3(LOC611792),mRNA164Petuniaintegrifolia亚种inflataS2自交不亲和性核糖核酸酶(S2-RNA酶)和S2-基因座F-框蛋白(SLF2)基因,完整cds165预测的家犬,类似于蛋白C14orfl03同源物(LOC480428),mRNA166人类mRNA;cDNADKFZp686G0638(来自克隆DKFZp686G0638)167人类含有B-框和SPRY结构域的(BSPRY),mRNA168预测的褐鼠细胞凋亡染色质凝聚诱导物1(预测的)(Acini—预测的),mRNA169预测的家犬,类似于Elafin前体(弹性酶-特异性的抑制齐'])(ESI)(皮肤-衍生的antileukoproteinase)(SKALP)(WAP4-二硫化物核心结构域蛋白14)(蛋白酶抑制剂WAP3)(LOC477241),mRNA170预测的家犬,类似于半胱氨酸蛋白酶抑制剂9-样前体(LOC485559),mRNA171稻(日本品种-组)基因组DNA,染色体1,完整序列172预测的173预测的174预测的家犬dystonin,转录物变体16(DST),mRNA家犬,类似于酸性磷酸酯酶6,溶血磷脂酸的(LOC475822),mRNA家犬,类似于含有2同种型2的视紫红质抑制蛋白结构域,转录物变体3(LOC609柳),mRNA175预测的176预测的177预测的家犬,类似于ATP-结合盒,亚家族A成员1(LOC481651),mRNA家犬,类似于前髓细胞性白血病锌指蛋白,转录物变体3(LOC489398),mRNA家犬,类似于蛋白C9orf72同源物,转录物变体1(LOC481569),mRNA56178预测的家犬,类似于丝裂原-激活的蛋白激酶激酶激酶5(LOC491765),mRNA179预测的家犬,类似于锌指蛋白403,转录物变体4(LOC480594),mRNA180人类tetratricopeptide重复序列结构域25,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4831078),完整cds181层粘连蛋白a2亚基前体变体蛋白的人类mRNA182预测的家犬,类似于丙酮酸脱氢酶磷酸酶前体(LOC477941),mRNA183人类脂质1(LPIN1),mRNA184预测的家犬,类似于免疫球蛋白X-样多肽1前体(免疫球蛋白有关的14.1蛋白)(免疫球蛋白co多肽)(X5)(CD179b抗原)(LOC608248),mRNA185预测的家犬,类似于Asporin前体(LOC610685),mRNA186牛,类似于Asporin前体(牙周膜相关的蛋白1)(PLAP-1)(MGC128677),mRNA187预测的家犬,类似于转录因子BTEB1(基础转录元件结合蛋白l)(BTE-结合蛋白l)(GC框结合蛋白1)(Krueppel-样因子9)(LOC484n2),mRNA188预测的家犬,类似于溶质栽体家族27(脂肪酸运载体),成员6(LOC474666),mRNA189构巢曲霉FGSCA4假定蛋白(AN4185.2),mRNA190预测的家犬,类似于NADP-依赖性的视黄醇脱氢酶/还原酶(LOC488391),mRNA191野猪表皮生长因子前体(EGF)mRNA,完整cds192家犬IgA重链恒定区基因,部分cds193金属硫蛋白-II的家犬mRNA,完整cds194预测的家犬,类似于互补序列组分1,q亚组分,(3多肽前体(LOC487381),mRNA195预测的家犬,类似于锌指蛋白660(LOC491422),mRNA1%预测的家犬,类似于SH3结构域蛋白D19,转录物变体1(LOC482645),mRNA197预测的家犬,类似于DRE1蛋白(LOC478647),mRNA198食蟹猴mRNA,克隆QnpA-12979:类似于人类神经上皮细胞转化基因1(NET1),mRNA,NM—005863.2199人类亮氨酰/半胱氨酰氨肽酶(LNPEP),转录物变体2,mRNA200人类腺苷一磷酸脱氨酶(同种型E)(AMPD3),转录物变体l,mRNA201预测的家犬生育酚(a)转移蛋白(TTPA),mRNA202预测的家犬,类似于原肌球调节蛋白1,转录物变体1(LOC474771),mRNA203预测的家犬,类似于犬尿素--酮戊二酸转氨酶I(犬尿素氨基转移酶I)(KATI)(谷氨酰胺-苯基丙酮酸转氨酶)(谷氨酰胺转氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-缀合物p-裂合酶)(LOC491310),mRNA204预测的家犬,类似于犬尿素-酮戊二酸转氨酶I(犬尿素氨基转移酶I)(KATI)(谷氨酰胺--苯基丙酮酸转氨酶)(谷氨酰胺转氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-缀合物卩-裂合酶)(LOC491310),mRNA205预测的家犬,类似于在髓样细胞2前体上表达的触发受体(在单核细胞2上表达的触发受体)(TREM-2)(LOC608965),mRNA206预测的牛,类似于在髓样细胞2前体上表达的触发受体(在单核细胞2上表达的触发受体)(TREM-2),转录物变体2(LOC506467),mRNA207预测的家犬,类似于a-2-巨球蛋白前体(a-2-M)(LOC477699),mRNA208预测的牛,类似于转录因子BTEB1(基础转录元件结合蛋白1)(BTE-结合蛋白1)(GC框结合蛋白1)(Krueppel-样因子9),转录物变体3(LOC539139),mRNA209CBF表达2(ICE2)基因的大麦亚种vulgare品种Morex诱导物,部分cds210预测的家犬,类似于Y54E10A.6(LOC489622),mRNA211猩猩mRNA;cDNADKFZp469L0319(来自克隆DKFZp469L0319)212预测的家犬,类似于胰岛素受体前体(IR)(CD220抗原)(LOC484990),mRNA213预测的家犬,类似于环指蛋白150(LOC607611),mRNA214人类cDNA克隆MGC:51010IMAGE:5270267,完整cds215预测的家犬基质金属蛋白酶-2(MMP-2),mRNA216预测的家犬,类似于酰基辅酶A合成酶长链家族成员3,转录物变体1(LOC478927),mRNA217黑腹果蝇CG18211-PA①Try)mRNA,完整cds218预测的家犬,类似于视黄酸受体响应物(他佐罗汀诱导的)1同种型1(LOC612298),mRNA219在转移性前列腺癌mRNA中增量调节的人类蛋白,完整cds220预测的家犬,类似于Krueppel-样因子5(肠富集的krueppel-样因子)(结肠krueppel-样因子)(转录因子BTEB2)(基础转录元件结合蛋白2)(BTE-结合蛋白2)(GC框结合蛋白2)...,转录物变体3(LOC612788),mRNA221预测的家犬,类似于NOV蛋白同源物前体(NovH)(肾胚细胞瘤过表达的基因蛋白同源物)(LOC475083),mRNA222预测的家犬,类似于干扰素有关的发育调节剂1,转录物变体2(LOC482408),mRNA223预测的家犬,类似于BTG3蛋白(Tob5蛋白)(在神经上皮区域蛋白中富含的),转录物变体2(LOC487695),mRNA224牛仅同源结构域的蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:127764IMAGE:7963031),完整cds225预测的家犬,类似于蛋白C9orf72同源物,转录物变体1(LOC481569),mRNA226预测的家犬,类似于解蛋白酶激活的受体3前体(PAR-3)(凝血酶受体-样2)(凝结因子II受体-样2)(LOC607963),mRNA227硕大利什曼原虫菌林Friedlin假定蛋白(LMJ—1048)mRNA,部分cds228预测的家犬,类似于含有锚蛋白重复序列和SOCS框的蛋白2(预测的),转录物变体1(LOC490836),mRNA229预测的家犬,类似于犬尿素-酮戊二酸转氨酶I(犬尿素氨基转移酶I)(KATI)(谷氨酰胺-苯基丙酮酸转氨酶)(谷氨酰胺转氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-缀合物P-裂合酶)(LOC491310),mRNA230预测的家犬,类似于免疫球蛋白X-样多肽1前体(免疫球蛋白有关的14.1蛋白)(免疫球蛋白co多肽)(X5)(CD179b抗原)(LOC607558),mRNA231预测的家犬,类似于a-2-巨球蛋白前体(a-2-M)(LOC477699),mRNA232预测的家犬,类似于磷脂转移蛋白前体(脂质转移蛋白II)(LOC485903),mRNA233预测的家犬,类似于WD重复序列结构域66,转录物变体2(LOC477466),mRNA234人类丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶2-样1,mRNA(cDNA克隆MGC:26665IMAGE:4797767),完整cds235家犬IgA重链恒定区基因,部分cds236猫CD8抗原,卩多肽(CD8B),mRNA237预测的黑猩猩RAN结合蛋白2(LOC459477),mRNA238预测的家犬,类似于ERBB2相互作用蛋白同种型7(LOC478082),mRNA239丙氨酸乙醛酸氨基转移酶2同源物1的人类mRNA,剪接形式1(AGXT2L1基因)240预测的家犬,类似于磷脂酶C,54(LOC478910),mRNA241预测的家犬,类似于[丙酮酸脱氢酶[硫辛酰胺]]激酶同工酶4,线粒体前体(丙酮酸脱氲酶激酶同种型4)(LOC482310),mRNA242预测的家犬,类似于含有锚蛋白重复序列和SOCS框的蛋白2(预测的),转录物变体1(LOC490836),mRNA243预测的家犬,类似于脂质1,转录物变体1(LOC475670),mRNA244预测的家犬,类似于缺氧-可诱导的因子-3a同种型a(LOC476429),mRNA245家犬金属硫蛋白1X(MT1X),mRNA246家犬金属碌^蛋白1X(MT1X),mRNA247预测的家犬,类似于UDP-N-乙酰基-a-D-半乳糖胺:多肽N-乙酰基氨基半乳糖基转移酶-样2(LOC477056),mRNA248人类WNK赖氨酸缺陷的蛋白激酶3(WNK3),转录物变体2,mRNA249家犬IgA重链恒定区基因,部分cds250预测的家犬,类似于肌球蛋白-3(肌球蛋白重链A)(MHCA)(LOC474713),mRNA251预测的家犬,类似于在肾细胞癌(LOC607380)中减量调节的,mRNA252预测的家犬,类似于中心体纺锤极有关的蛋白(LOC477902),mRNA253预测的家犬,类似于骨调控蛋白前体(Osteoadherin)(OSAD)(硫酸角质素蛋白聚糖骨调控蛋白)(KSPG骨调控蛋白)(LOC610693),mRNA254爪蟾MGC83953蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:83953IMAGE:6862234),完整cds255预测的家犬假定LOC4卯496(LOC4卯496),mRNA256预测的家犬,类似于WAP4-二硫化物核心结构域1前体(LOC489682),mRNA257互补序列組分6的猩猩C6基因,部分cds258预测的家犬,类似于锚蛋白重复序列,家族A(RFXANK-样),2,转录物变体3(LOC47,7),mRNA259约氏痴原虫yoelii菌林17XNL假定蛋白(PY02022)mRNA,部分cds260猩猩mRNA;cDNADKFZp470P1633(来自克隆DKFZp470P1633)261家犬podoplanin(PDPN),mRNA262猩猩mRNA;cDNADKFZp46810813(来自克隆DKFZp46810813)263含有人类锌指DHHC-型的17(ZDHHC17),mRNA264预测的家犬,类似于ATP酶,H+运输,溶酶体42kDa,VI亚基C同种型2,转录物变体3(LOC475667),mRNA265预测的家犬,类似于氨肽酶噪呤霉素敏感的(LOC480538),mRNA266预测的家犬,类似于CG7245-PA(LOC481865),mRNA267预测的褐鼠,类似于DDI(预测的)(LOC291580),mRNA268VSGP/F-spondin的牛mRNA,完整cds269野猪雌激素磺基转移酶(STE),mRNA270人类Kallmann综合征1序歹'J(KALl),mRNA271预测的家犬,类似于肉瘤抗原NY-SAR-41(LOC479946),mRNA272预测的牛,类似于锌指蛋白420(LOC512882),mRNA273预测的家犬,类似于脂质1,转录物变体4(LOC475670),mRNA274预测的家犬,类似于植烷酰-辅酶A羟化酶前体(LOC607509),mRNA275预测的家犬,类似于骨形态形成蛋白2前体(BMP-2)(BMP-2A),转录物变体1(LOC477162),mRNA276预测的家犬,类似于骨形态形成蛋白2前体(BMP-2)(BMP-2A),转录物变体1(LOC477162),mRNA277人类Kmppel-样因子9(KLF9),mRNA278预测的279预测的280预测的家犬假定LOC474886,转录物变体2(LOC474886),mRNA家犬,类似于在髓样细胞-样4上表达的触发受体(LOC608975),mRNA家犬,类似于解蛋白酶激活的受体3前体(PAR-3)(凝血酶受体-样2)(凝结因子II受体-样2)(LOC607963),mRNA281预测的282预测的283预测的284预测的285预测的家犬,类似于WD重复序列结构域66,转录物变体2(LOC477466),mRNA家犬,类似于干扰素有关的发育调节剂1,转录物变体1(LOC482408),mRNA家犬,类似于锌指蛋白283(LOC613011),mRNA家犬,类似于在髓样细胞-样1上表达的触发受体(LOC474898),mRNA牛,类似于肉毒城O-棕榈酰转移酶I,线粒体肝同种型(CPTI)(CPTI-L)(肉毒碱棕榈酰转移酶1A)(LOC506812),部分mRNA60286预测的家犬,类似于犬尿素-酮戊二酸转氨酶I(犬尿素氨基转移酶I)(KATI)(谷氨酰胺-苯基丙酮酸转氨酶)(谷氨酰胺转氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-缀合物p-裂合酶)(LOC491310),mRNA287预测的家犬假定LOC476569(LOC476569),mRNA288小鼠表达的序列AI854703(AI854703),mRNA289预测的家犬,类似于再生有关的肌肉蛋白酶同种型b(LOC483426),mRNA290预测的家犬,类似于含有纤连蛋白III型结构域1(LOC484061),mRNA291人类WAP4-二硫化物核心结构域1(WFDC1),mRNA292预测的家犬,类似于CG1530-PA(LOC609071),mRNA293预测的家犬,类似于糖蛋白(跨膜)nmb同种型b前体,转录物变体3(LOC482355),mRNA294预测的黑猩猩,类似于sprouty同源物l,FGF信号传递的拮抗剂;sprouty,果蝇,同源物1(FGF信号传递的拮抗剂);sprouty(果蝇)同源物1(FGF信号传递的拮抗剂)(LOC461476),mRNA295预测的家犬,类似于植烷酰-辅酶A羟化酶前体(LOC478000),mRNA表5:基因描述-人序列登录号的最高BLAST命中SEOIDNO基因描述-人序列登录号的最高BLAST命中1人类含有犰狳重复序列9,mRNA(cDNA克隆MGC:74894IMAGE:6165433),完整cds2人类jun二聚化蛋白基因,部分cds;cfos基因,完整cds;和未知基因3早期生长响应蛋白1的人类EGR1基因4人类早期生长响应1,mRNA(cDNA克隆MGC:88036IMAGE:6188360),完整cds5人类12BACRPU-181C3(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列6人类mRNA;cDNADKFZp686J04124(来自克隆DKFZp686J04124)7人类锌指蛋白227(ZNF227),mRNA8人类溶质载体家族7(阳离子氨基酸运载体,y+系统),成员3(SLC7A3),mRNA9来自14q24.3的人类PAC克隆RP5-1003N18,完整序列10人类血清/糖皮质激素调节的激酶2mRNA,完整cds11来自2的人类BAC克隆RP11-198M19,完整序列12人类FK506结合蛋白5(FKBP5),mRNA13合成构建体人类肿瘤-相关的钙信号转导物1mRNA,部分cds14染色体6上的来自克隆RP3-510O8的人DNA序列含有FK506结合蛋白5(FKBP51)的FKBP5基因的5'末端,4个新基因(包括FLJ25390),1个UMP-CMP(尿甙一磷酸-胞啶一磷酸)激酶假基因,胰腺辅脂肪酶的CLPS基因,1个新基因和两个CpG岛的5'末端,61完整序列15人类丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶4,mRNA(cDNA克隆MGC:5281IMAGE:3047987),完整cds16来自4的人类BAC克隆RP11-617I14,完整序列17人类染色体3克隆RP11-6B7,完整序列18人类乙酰-辅酶A羧化酶卩(ACACB),mRNA19合成构建体人类肿瘤-相关的钙信号转导物1mRNA,部分cds20人类12BACRP11-451H11(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列21来自2的人类BAC克隆RP11-398G12,完整序列22人类suprabasin(SBSN),mRNA23人类3BACRP11-1D19(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列24人类cDNAFLJ38032fis,克隆CTONG2013352,中等类似于锌指蛋白22825人类锌指蛋白233(ZNF233),mRNA26人类(人)胎盘Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DI004YK2427人类3BACRP11-211G3(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列28染色体9上的来自克隆RP11-199C17的人DNA序列含有TBC1结构域家族的TBC1D2基因的5,末端,成员2(PARIS1,PARIS-1,DKFZP761D1823,DKFZp761D1823),G蛋白-偶联的受体51的GPR51基因的3'末端(HG20,GABBR2,GPRC3B,GABABR2)和I个CpG岛,完整序列29人类具有EGF-样和两个卯泡抑素-样结构域1的跨膜蛋白(TMEFF1),mRNA30人类细胞核受体亚家族4,組A,成员1,转录物变体l,mRNA(cDNA克隆MGC:9485IMAGE:3921259),完整cds31人LAG-lmRNA32人类cDNAFLJ39913fis,克隆SPLEN2018643,高度类似于可能的G蛋白-偶联的受体APJ33编码单核细胞分泌蛋白mRNA的人JE基因,完整cds34激活-可诱导的淋巴细胞免疫调节分子AILIM的人类mRNA,完整cds35人类cDNA克隆IMAGE:5175186,含有移码错误36人类ELOVL家族成员6,长链脂肪酸(FEN1/Ek)2,SUR4/Elo3-样,酵母)的延伸(ELOVL6),mRNA37来自4的人类BAC克隆RP11-384E2,完整序列38人类染色体14开放读码框119,mRNA(cDNA克隆MGC:74723IMAGE:5532778),完整cds39人类趋化因子(C-C基序)配体8(CCL8),mRNA40染色体Xpll.3-11.4上的来自克隆RP5-1172N10的人DNA序列含有X染色体泛素特异性的蛋白酶9的USP9X基因的3,末端(fatfacets-样果蝇),1个新基因和1个CpG岛,完整序列41人类跨膜4L6家族成员18(TM4SF18),mRNA42染色体13上的来自克隆RP11-520F24的人DNA序列含有HNRPA1(异源核内核糖核蛋白Al)假基因,ELL有关的RNA聚合酶II,延伸因子(ELL2)假基因和核糖体蛋白L37(RPU7)假基因,完整序列43人类克隆25081原肌球调节蛋白inRNA序列44人类乙酰-辅酶A羧化酶(3(ACACB),mRNA45人类podoplanin(PDPN),转录物变体3,mRNA46人类锌指蛋白228(ZNF228),mRNA47人18S核糖体RNA48人类cDNA克隆MGC:88772IMAGE:4765168,完整cds49人类谷氨酸-半胱氨酸连接酶,催化亚基(GCLC),mRNA50pl6/CDKN2A的人类基因,完整cds51人类ATP酶,H+运输,溶酶体42kDa,VI亚基C同种型2(ATP6V1C2),mRNA52人类干扰素调节因子4,mRNA(cDNA克隆MGC:23069IMAGE:4861223),完整cds53人类ARVI同源物(酵母)(ARV1),mRNA54染色体13上的来自克隆RP11-174I10的人DNA序列含有视网膜母细胞瘤1(包括骨肉瘤)的RB1基因的3'末端和1个新基因的5'末端,完整序列55人类(人)T细胞(Jurkat细胞系)CotlO-标准化的全长cDNA克隆CS0DJ010YA1556人类podoplanin(PDPN),转录物变体1,mRNA57人类谷氨酸-半胱氨酸连接酶,催化亚基(GCLC),mRNA58NA59人类克隆DNA44205NLGN4(UNQ365)mRNA,完整cds60合成构建体人类克隆FLH025847.01X栽脂蛋白C-I(APOCl)mRNA,完整cds61来自2的人类BAC克隆RP11-197H3,完整序列62人类肉毒碱椋榈酰转移酶1A(肝)(CPT1A),编码线粒体蛋白的核基因,转录物变体l,mRNA63人类缺氧谦导因子3,a亚基,mRNA(cDNA克隆MGC:99497IMAGE:6250259),完整cds64人类claudm10(CLDN10),转录物变体l,mRNA65人类乙酰-辅酶A羧化酶p(ACACB),mRNA66人类12q24BACRCPI11-443D10(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列67人类肉毒碱棕榈酰转移酶1A(肝),转录物变体2,mRNA(cDNA克隆MGC:1772IMAGE:3352642),完整cds6368人类FK506结合蛋白5,mRNA(cDNA克隆MGC:34489IMAGE:4539929),完整cds69人类NOVH蛋白mRNA,完整cds70肉毒碱O-棕榈酰转移酶1的人类部分CPT1A基因,启动子区,CDS和剪接变体a和b71人类染色体19,粘粒R31341,完整序列72人类溶质载体家族26,成员7(SLC26A7),转录物变体1,mRNA73小鼠17天胚胃cDNA,RIKEN全长富集的文库,克隆:I920056H18产物:NHP2-样蛋白1(高迁移率组-样核蛋白2同源物1)([U4/U6.U5]三-snRNP15.5kDa蛋白)(OTK27)同源物[人类],全插入序列74人类junB原癌基因(JUNB),mRNA75人类染色体8,克隆RP11-734H6,完整序列76Cdc7有关的激酶的人类mRNA,完整cds77人类含有亮氨酸富集重复序列的17(LRRC17),转录物变体l,mRNA78染色体13上的来自克隆RP11-273F15的人DNA序列含有类似于NADH脱氢酶3(NADH脱氲酶,亚基3(复合物I))(MTND3)的一部分的假基因和在(NME1)(NM23,NM23-H1)中表达的非转移性细胞1蛋白(NM23A)假基因,完整序列79人类sortilin有关的受体,L(DLR类)含有A重复序列的(S0RL1),mRNA80抗肌萎缩蛋白(5'区,或者剪接的}[人,小脑Purkinje神经元,mRNA部分,320核苷酸]81染色体X上的来自克隆RP11-45J1的人DNA序列含有prefoldin4(PFDN4)假基因,1个新基因和1个CpG岛的5'末端,完整序列82人类染色体8,克隆CTD-3071K10,完整序列83食蟹猴脑cDNA,克隆QccE-21970,类似于人醛缩酶C,果糖-二璘酸(ALDOC),mRNA,RefSeq:画—005165.184人类染色体17,克隆193hl8,完整序列85来自4的人类BAC克隆RP11-1191J2,完整序列86基因SAA1、血清淀粉状蛋白Al的人类完整开放读码框cDNA克隆RZPDo834A0126D;完整cds,没有终止密码子87TPA:人类染色体17邻近的SMS-REP低-拷贝重复序列,基因組序列88人类白喉毒素受体(肝素-结合表皮生长因子-样生长因子)(DTR)基因,完整cds89人类含有BTB(POZ)结构域的11(BTBD11),转录物变体3,mRNA90G-蛋白信号传递1的人类调节剂,mRNA(cDNA克隆MGC:9198IMAGE:3916789),完整cds91人类nudE核分布基因E同源物1(构巢曲霉),mRNA(cDNA克隆MGC:1075IMAGE:3140369),完整cds92人类sortilin有关的受体,L(DLR类)含有A重复序列的(S0RL1),mRNA93人类染色体5克隆RP11-1152B5,完整序列94人类血清-可诱导的激酶mRNA,完整cds95人类mRNA;cDNADKFZp313N1532(来自克隆DKFZp313N1532)96人类含有亮氨酸富集重复序列的39(LRRC39),mRNA97人类核纤层蛋白Bl(LMNB1),mRNA98人类reelin(RELN),转录物变体2,mRNA99人类cDNAFLJ41271fis,克隆BRAMY2036396100染色体1上的来自克隆RP11-134P9的人DNA序列含有1个新基因的3'末端,1个新基因,BTG家族的BTG2基因,成员2和l个CpG岛,完整序列101染色体10上的来自克隆RP11-145E8的人DNA序列含有l个新基因(KIAA1074),YME1-样1(酿酒酵母)的YME1L1基因的3,末端和1个CpG岛,完整序列102食蟹猴睾丸cDNA克隆QtsA-13105,类似于人含有犰狳重复序列的2(ARMC2),mRNA,RefSeq:蘭—032131.3103人类染色体17,克隆CTD-3193K9,完整序列104人转录因子ETR101mRNA,完整cds105染色体22上的来自克隆CTA-343C1的人DNA序列,完整序列106人类(人)的胎盘Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DI069YJ22107染色体20上的来自克隆RP4-727110的人DNA序列含有1个新基因,ESTs,STSs和GSSs,完整序列108人类CC趋化因子配体4L2f(CCL4L)mRNA,CCL4L-2等位基因,完整cds,或者剪接的109人类曱状腺激素受体,p(成红细胞白血病病毒(v-erb-a)癌基因同源物2,禽类),mRNA(cDNA克隆MGC:126110IMAGE:40033200),完整cds110人类3BACRP11-211G3(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列111人MAP激酶激酶MEK6(MEK6)mRNA,完整cds112染色体1上的来自克隆RP11-182110的人DNA序列含有肛门激酶1(一种蛋白酪氨酸激酶)的JAK1基因的5,末端,NADH脱氢酶(泛醌)1a亚复合物49kDa(NDUFA4)假基因,SIPL蛋白(SIPL)假基因,l个新基因的一部分,溶质栽体家族2(促进的葡萄糖运载体)成员14(SLC2A14)假基因和1个CpG岛,完整序列113人类12BACRP4-605O3(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列114人类马球-样激酶2(果蝇)(PLK2),mRNA115染色体6上的来自克隆RP11-497F24的人DNA序列,完整序列116人类cDNAFLJ36603fis,克隆TRACH2015180,高度类似于绻曲蛋白-2117来自4的人类BAC克隆RP11-216H12,完整序列118MHC类I抗原的人类HLA-C基因,CW*15021等位基因,外显子1-865119人类L-哌梵酸氧化酶(LPIPOX)mRNA,完整cds120人类mRNA;cDNADKFZp686C24224(来自克隆DKFZp686C24224)1"合成构建体人类lipocalin2(癌基因24p3)mRNA,部分cds122预测的人类假定蛋白FLJ10707(FLJ10707),mRNA123人类claudin4,mRNA(cDNA克隆MGC:1778IMAGE:3349211),完整cds124人类cDNA:FLJ23378fis,克隆HEP16248125人类gp250前体,mRNA,完整cds126人类fem-1同源物b(秀丽隐杆线虫),mRNA(cDNA克隆MGC:19792IMAGE:3840453),完整cds127人XIST基因,多噪呤-嘧啶重复序列区128人类氨基酰化酶1-样2,mRNA(cDNA克隆IMAGE:5262663),部分cds129人类假定蛋白FLJ20920,mRNA(cDNA克隆MGC:19867IMAGE:4577089),完整cds130人类基因组DNA,染色体18克隆:RP11-883A18,完整序列131人类假定蛋白LOC392636,mRNA(cDNA克隆MGC:131748IMAGE:6152531),完整cds132的T-细胞受体p可变区的人类部分BV03SlJ2.2基因133人类配体效应调控物-6(LEM6)mRNA,完整cds134预测的人类,类似于LIM和衰老细胞抗原-样结构域1(LOC440895),mRNA135人类染色体16克隆CTA-237H1,完整序列136人类磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,I型,P(PIP5K1B),转录物变体2,mRNA137人类二氢二醇脱氢酶(二聚的)(DHDH),mRNA138来自4的人类BAC克隆RPll-43303,完整序列139人葡萄糖-6-磷酸酶mRNA,完整cds140人类(人)成神经细胞瘤的人全长cDNA克隆CS0DD006YL02141人类肌酸激酶,线粒体1B(CKMT1B),编码线粒体蛋白的核基因,mRNA142人类cDNAFLJ45560fis,克隆BRTHA3003417143染色体20ql3.12上的来自克隆RPl-138B7的人DNA序列含有1(3)mbt-样(果蝇)的L3MBTL基因的3'末端,血清/糖皮质激素调节的激酶2的SGK2基因,C20orf9基因的5'末端(NGD5,CGI-53),1个HSPC194假基因和1个CpG岛,完整序列144人类染色体15,克隆RP11-253M7,完整序列145人类Clq-CmRNA,完整cds146人类ARV1同源物(酵母)(ARV1),mRNA147染色体ll上的来自克隆RP23-215H18的小鼠DNA序列含有1个新基因和人动力蛋白基因丝重多肽9(DNAH9)的可能定向进化同源基因的3'末端,完整序列148人类mRNA;cDNADKFZp781J0852(来自克隆DKFZp781J0852)149基因PAWR、PRKC、细胞凋亡的、WT1调节剂的人类完整开放读码框cDNA克隆RZPDo834F0920D;完整cds,包括终止密码子150人类互补序列组分1,q亚组分,a多肽,mRNA(cDNA克隆MGC:294卯IMAGE:4850418),完整cds151NA152人类cDNAFLJ16122fis,克隆BLADE2008995153人类染色体20开放读码框155(C20orfl55),mRNA154人类neuropilin2(NRP2)基因,完整cds,或者剪接的155人类染色体4克隆RP11-603B8,完整序列156NA157人类蛋白磷酸酶2C,镁-依赖性的,催化亚基,mRNA(cDNA克隆IMAGE:6158636),部分cds158人类(人)胎盘Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DI070YL04159人黄噪呤脱氢酶(XDH)mRNA,完整cds160人类mRNA;cDNADKFZp779B086(来自克隆DKFZp779B086)161人类(人)胎盘Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DI068YG02162人类磺基转移酶家族,胞质的,1B,成员1(SULT1B1),mRNA163染色体9^ji的来自克隆RPll-311H10的人DNA序列含有X-框结合核转录因子1的NFX1基因的3'末端,水通道7和3的AQP7和AQP3基因,l个新基因,核仁RNA-相关的蛋白a,p和Y的基因,和l个CpG岛,完整序列164染色体6p21.2-21.3上的来自克隆RP3-340B19的人DNA序列含有桶状蛋白1的TULP1基因,l个新基因,核糖体蛋白S15A(RPS15A)和L36(RPL36)假基因,FK506结合蛋白5(FKBP51)的FKBP5基因的3'末端和两个CpG岛,完整序列165人类cDNAFLJ30638fis,克隆CTONG2002721,轻微类似于空泡蛋白分选有关的蛋白VPS13166人类细胞色素P450,家族26,亚家族B,多肽1(CYP26B1),mRNA167来自4的人类BAC克隆RP11-678H22,完整序列168人类染色体ll,克隆RP13-25N22,完整序列169染色体20ql2-13.12上的来自克隆RP1-172H20的人DNA序列含有皮肤-衍生的蛋白酶抑制剂3(SKALP)的PI3基因,精液凝固蛋白I的SEMG1基因,精液凝固蛋白II的SEMG2基因,完整序列170人类半胱氨酸蛋白酶抑制剂9-样(小鼠),mRNA(cDNA克隆MGC:34724IMAGE:5163974),完整cds171NA172人类dystonin(DST),转录物变体leA,mRNA173人类(人)B细胞(Ramos细胞系)Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DL009YM2067174含有人类视紫红质抑制蛋白结构域的2,转录物变体l,mRNA(cDNA克隆MGC:26574IMAGE:4817429),完整cds175人类cDNAFLJ14958fis,克隆PLACE4000052,高度类似于人类ATP盒结合运栽体1(ABCl)mRNA176含有人类锌指和BTB结构域的16,转录物变体2,mRNA(cDNA克隆MGC:24卯8IMAGE:4944546),完整cds177人类染色体9开放读码框72,mRNA(cDNA克隆MGC:86985IMAGE:5298741),完整cds178人类丝裂原-激活的蛋白激酶激酶激酶15(MAP3K15),mRNA179人类喉癌有关的蛋白1mRNA,完整cds180人类tetratricopeptide重复序列结构域25,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4831078),完整cds181层粘连蛋白a2亚基前体变体蛋白的人类mRNA182人类蛋白磷酸酶2C,镁-依赖性的,催化亚基,mRNA(cDNA克隆IMAGE:6158636),部分cds183来自2的人类BAC克隆RP11-48409,完整序列184NA185人类asporin(LRR类1)(ASPN),mRNA186人类克隆DNA34392ASPN(UNQ215)mRNA,完整cds187染色体9上的来自克隆RP11-386J22的人DNA序列含有染色体5-样1(酵母)(SMC5,KIAA0594)的SMC5结构维护的SMC5L1基因,基础转录元件结合蛋白1(BTEB,KLF9)的BTEB1基因和3个CpG岛,完整序列188人类溶质载体家族27(脂肪酸运载体),成员6(SLC27A6),转录物变体2,mRNA189人类染色体3克隆RP11-189A1,完整序列190人类脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员9(DHRS9),转录物变体2,mRNA191人类截短的表皮生长因子(P-尿抑胃素)(EGF)基因,完整cds192人类cDNA克隆MGC:88772IMAGE:4765168,完整cds193来自Y的人类PAC克隆RP1-85D24,完整序列194人类互补序列组分1,q亚组分,(3多肽,mRNA(cDNA克隆MGC:17227IMAGE:4212848),完整cds195人类染色体3克隆RP11-944L7,完整序列196人类SH3结构域蛋白D19(SH3D19),mRNA197人类mRNA;cDNADKFZp686E15208(来自克隆DKFZp686E15208)198食蟹猴mRNA,克隆QnpA-12979:类似于人类神经上皮细胞转化基因1(NET1),mRNA,醒—005863.2199染色体20pll.21-ll.23上的来自克隆RP5-1025A1的人DNA序列含有乙酰-辅酶A合成酶(AMP形成)-样的ACAS2L基因的5'部分,视觉系统同源框1(斑马鱼)同源物(CHXIO-样)的VSX1基因,变体Ll和SI和4个CpG岛,完整序列200人类染色体ll,克隆RP11-68C8,完整序列201人类生育酚(a)转移蛋白(维生素E缺乏的共济失调(Friedreich-样)),mRNA(cDNA克隆IMAGE:4593015),部分cds202人类cDNAFLJ32190fis,克隆PLACE6002102203人类CCBL1基因,最后两个外显子204人类半胱氨酸缀合物-(3裂合酶;胞质的(谷氨酰胺转氨酶K,kyneurenine氨基转移酶)(CCBL1),mRNA205在髓样细胞2(TREM2)上表达的人类触发受体,mRNA206人类染色体21开放读码框24同种型7(C21orf24)mRNA,完整cds207人类mRNA;cDNADKFZp779B086(来自克隆DKFZp779B086)208染色体9上的来自克隆RP11-386J22的人DNA序列含有染色体5-样1(酵母)(SMC5,KIAA0594)的SMC5结构维护的SMC5L1基因,基础转录元件结合蛋白1(BTEB,KLF9)的BTEB1基因和3个CpG岛,完整序列209来自4的人类BAC克隆RP11-642E20,完整序列210人类含有亮氨酸富集重复序列的47(LRRC47),mRNA211人类翻译起始因子2(MTIF2)基因,外显子6-9;线粒体产物的核基因212人类胰岛素受体,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4823710),部分cds213人类环指蛋白150(RNF150),mRNA214人类染色体5克隆CTC-361G14,完整序列215人类基质金属肽酶2(明胶酶A,72kDa明胶酶,72kDaIV型胶原酶),mRNA(cDNA克隆MGC:2313IMAGE:3161383),完整cds216人类Zic家族成员3heterotaxy1(奇数配对的同源物,果蝇)(ZIC3),mRNA217来自2的人类BAC克隆RP11-395A12,完整序列218人类基因組DNA,染色体18克隆:RP11-815J4,完整序列219在转移性前列腺癌mRNA中增量调节的人类蛋白,完整cds220人类Kmppel-样因子5(肠的),mRNA(cDNA克隆MGC:52153IMAGE:5454169),完整cds221人类(人)HeLa细胞Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DK004YO15222人类千扰素有关的发育调节剂l(IFRDl),转录物变体l,mRNA223人类(人)HeLa细胞Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DK0I0YA19224人类仅同源结构域的蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:20820IMAGE:4335211),完整cds225染色体9上的来自克隆RP11-27J8的人DNA序列含有千扰素k前体(IFNK)的基因,l个新基因(FLJ13204)的5,UTR,l个新基因,包括FLJ25077和FLJ11109(MGC23980)和2CpG岛,完整序列226人类凝固因子1I受体-样2(F2RL2)基因,完整cds227染色体20ql2上的来自克隆RP4-753D4的人DNA序列含有蛋白酪氨酸磷酸酶受体T型的PTPRT基因的一部分和1个新基因,完整序列228来自人类(人)染色体14的文库RPCI-ll的人染色体14DNA序列BACR-131H24,完整序列229人类半胱氨酸缀合物-p裂合酶;胞质的(谷氨酰胺转氨酶K,kyneurenine氨基转移酶)(CCBIJ),mRNA230NA231人类a-2-巨球蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:47683IMAGE:6056126),完整cds232人类磷脂转移蛋白,转录物变体l,mRNA(cDNA克隆MGC:30183IMAGE:4992839),完整cds233人类WD重复序列结构域66(WDR66),mRNA234丙氨酸乙醛酸氨基转移酶2同源物1的人类mRNA,剪接形式1(AGXT2L1基因)235人类免疫球蛋白a2m(l)重链恒定区基因,部分cds236NA237来自2的人类BAC克隆RP11-348G16,完整序列238人类erbb2相互作用蛋白(ERBB2IP),转录物变体2,mRNA239丙氨酸乙醛酸氨基转移酶2同源物1的人类mRNA,剪接形式1(AGXT2L1基因)240人类磷脂酶C,54(PLCD4),mRNA241人类cDNAFLJ39109fis,克隆NTONG2005137,高度类似于[丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)]激酶同工酶4,线粒体前体(EC2.7.1.99)242人类mRNA;cDNADKFZp586M2121(来自克隆DKFZp586M2121)243染色体6上的来自克隆RP11-98I9的人DNA序列含有六异戊二烯基二羟基苯曱酸酯曱基转移酶的基因,线粒体前体(COQ3),SR富集的蛋白的基因(FU14992),泛素特异性的蛋白酶45的USP45基因,类似于泛素羧基末端水解酶16(EC3丄2.15)的l个新蛋白的基因的3'末端和两个CpG岛,完整序列244缺氧-可诱导的因子-3a的人类HIF-3AmRNA,完整cds245来自7的人类BAC克隆CTB-118E13,完整序列246染色体9q22.1-22.33上的来自克隆RPl1-43505的人DNA序列含有修补同源物的PTCH基因,l个新基因,类似于金属硫蛋白蛋白(MT1)的1个新蛋白的基因和3个CpG岛,完整序列247人类mRNA;cDNADKFZp31312220(来自克隆DKFZp31312220);完整cds248人类WNK赖氨酸缺陷的蛋白激酶3(WNK3),转录物变体1,mRNA249人类免疫球蛋白a2m(l)重链恒定区基因,部分cds70250食蟹猴睾丸cDNA克隆:QtsA-11169,类似于人假定蛋白C9orf93,mRNA,NM—173550.1251食蟹猴脑cDNA,克隆QflA-10289,类似于人TU3A蛋白(TU3A),mRNA,RefSeq:NM—007177.1252人类中心体和纺锤极有关的蛋白1(CSPP1),mRNA253人类骨调控蛋白(OMD),mRNA254人类12BACRP11-424C20(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列255具有序列相似性59的人类家族,成员A(FAM59A),mRNA256人类ps20WAP-型4-二石克化物核心结构域蛋白mRNA,完整cds257人类染色体5克隆CTC-428111,完整序列258人类染色体5克隆CTC-229P9,完整序列259人类染色体8,克隆RP13-895A16,完整序列260来自人类(人)的染色体14的文库RPCI-ll的人染色体14DNA序列BACR-442G21,完整序列261人类肺I型细胞膜-相关的蛋白hTla-2(hTla-2)mRNA,完整cds262NA263染色体13上的来自克隆RP11-90M2的人DNA序列含有基因FU10956,HSPC126蛋白(DRIP36)的基因,1个类似于聚合酶(RNA)II(DNA指导的)多肽K的新基因,7.0kDa(POLR2K),1个新基因和两个CpG岛,完整序列264人类ATP酶,H+运输,溶酶体42kDa,VI亚基C同种型2(ATP6V1C2),mRNA265人类氨肽酶噤呤霉素敏感的(NPEPPS),mRNA266预测的人类,类似于dJ22117.2(具有EGF-样和层粘连蛋白G结构域的新蛋白)(LOC442228),mRNA267人类染色体5克隆CTC-575N7,完整序列268来自4的人类BAC克隆RP11-308K2,完整序列269人类染色体5克隆RP11-270H9,完整序列270ADMLX—,定的粘附分子[人,mRNA,4121核普酸,2的区段2]271含有人类巻曲螺旋结构域的18,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4686590),部分cds272人类,克隆RP11-44B13,完整序列273食蟹猴睾丸cDNA克隆QtsA-14119,类似于人脂质1(LPIN1),mRNA,RefSeq:NM—145693.1274牛植烷酰-辅酶A鞋化酶[人雷夫叙姆病],mRNA(cDNA克隆MGC:127428IMAGE:7949271),完整cds275染色体20pl2.1-13上的来自克隆RP5-859D4的人DNA序列含有骨形态形成蛋白2的BMP2基因,1个新基因和1个CpG岛,完整序列276染色体20pl2.1-13上的来自克隆RP5-859D4的人DNA序列含有骨形态形成蛋白2的71BMP2基因,1个新基因和1个CpG岛,完整序列277染色体9上的来自克隆RP11-386J22的人DNA序列含有染色体5-样1(酵母)(SMC5,KIAA0594)的SMC5结构维护的SMC5L1基因,基础转录元件结合蛋白1(BTEB,KLF9)的BTEB1基因和3个CpG岛,完整序列278人类染色体6开放读码框81(C6orf81),mRNA279染色体10上的来自克隆RP11-401F24的人DNA序列含有基因FLJ20909,1个新蛋白(MGC35403)的基因,1个新基因(LOC219731),无义转录物同源物(酵母)(FLJ38872)的UPF2调节剂的UPF2基因的3'末端和4个CpG岛,完整序列280人类凝固因子II受体-样2(F2RL2)基因,完整cds281人类WD重复序列结构域66,mRNA(cDNA克隆MGC:33630IMAGE:4826893),完整cds282食蟹猴睾丸cDNA,克隆QtsA-18294,类似于人千扰素有关的发育调节剂1(IFRDl),mRNA,RefSeq:NM—001550.1283预测的人类锌指蛋白283(ZNF283),mRNA284染色体6上的来自克隆RPl-238023的人DNA序列含有1个新基因的一部分,在髓样细胞2(TREM2)上表达的触发受体的基因,l个新基因,l个新基因的一部分,1个类似于可溶的腺苷酸环化酶(SAC)的假基因,完整序列285人类(人)HeLa细胞Cot25-标准化的全长cDNA克隆CS0DK009YI05286人类半胱氨酸缀合物-(3裂合酶;胞质的(谷氨酰胺转氨酶K,kyneurenine氨基转移酶)(CCBL1),mRNA287人类染色体3开放读码框14,mRNA(cDNA克隆MGC:22227IMAGE:4307022),完整cds288人类染色体15克隆CTD-2270N23map15q21,完整序列289人类mRNA;cDNADKFZp667H2312(来自克隆DKFZp667H2312)2卯含有人类纤连蛋白III型结构域的1(FNDC1),mRNA291人类染色体16克隆RP11-486L19,完整序列292来自2的人类BAC克隆RP11-178D14,完整序列293人类(人)成年脑的全长cDNA克隆CS0DN005YJ09294来自7的人类PAC克隆RP5-839024,完整序列295人类3BACRP11-364F11(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列实施例2测定不同物质或成分对犬细胞系中的基因表达的影响使用Affymetrix尤基因芯片犬-1和犬-2来测定不同测试物质或成分(例如MCTs;TAGs;ALA;EPA;DHA;亚油酸;硬脂酸(SA),缀合的72亚油酸(CLA),GLA;花生四烯酸;卵磷脂;维生素A,维生素D,维生素E,维生素K,核黄素,烟酸,维生素B6,泛酸,叶酸,生物素维生素C,儿茶素,槲皮素,茶黄素;泛醌;番茄红素,番茄黄质;白藜芦醇;a-^L辛酸;L-肉毒碱;D-柠檬烯;葡糖胺;S-腺苷基蛋氨酸;壳聚糖,含有这些化合物中的一种或多种的不同材料和它们的不同组合)对4个犬细胞系和适当对照中的基因表达的影响。每种成分测试两个浓度,如对表6所示的选择的样品成分所解释的。在两个浓度中的高者的溶剂用作对照。使用4个犬细胞系CCL34(肾),CRL1430(胸腺),CCL183(骨)(从美国组织培养物中心得到)和CTAC(甲状腺)(参见,从犬外周淋巴细胞纯化的效应纟田胞中NK活性的测量,VeterinaryImmunologyandImmunopathology,35(1993)239-251)。用特定浓度的成分处理过的细胞系称作"处理",未处理的样品称作"对照"。词语"基因"和"探针"在该方法中同义地使用。使用与Affymetrix芯片一起提供的说明书,测量处理细胞系和对照的基因表达。对于任意给定的处理,基因表达数据测得为"增量"或"减量"调节。基因被"增量"或"减量"的确定是基于倍数变化,后者计算为每个单个探针的治疗强度/对照强度。如果它的值<1/1.5(对于跨所有4个细胞系的分析)或<1/2(对于细胞系内的分析),认为倍数变化是减量调节的;如果它>1.5(对于跨所有4个细胞系的分析)或>2(对于细胞系内的分析),则被增量调节。另外,如果发现(call)它仅存在于比较的条件(处理或对照)之一中,且在另一个中"缺少,,或"是边缘的",且倍数变化根据使用的软件是显著的,认为探针对于进一步详察是显著的。从进一步分析中排除在两个处理中表现得以相反反向调节的探针。使用GeneSpring7.0版(GS)软件(AgilentCorporation)分析原始数据,并使用R-Bioconductor(RB)免费软件验证。两个软件包用于计算来自从Affymetrix仪器产生的CEL文件的探针强度。分別使用R-Bioconductor和GeneSpring软件,计算每个探针的存在/缺少/边缘调用和P值。两个方案用于数据分析。首先,"跨细胞系"和"在单个细胞系内"。在第一个方案中,选择基因用于评分,条件是,发现它们在所有细胞系之间是显著的和共同的。"跨细胞系"会产生具有最小噪音的最高置信度数据,并可以提供关于哪个基因受单个成分影响的最佳可能线索。在第二个方案中,仅仅对根据两个软件包在单个细胞系的两个处理中表现出显著倍数变化的那些基因评分。从这些实验得到的数据的样品如表7所示。表7显示了处理物质(列1)、探针(数据连接)(歹'J2)、方向(列3)、最佳BLAST注解(统计地测定)(歹'J4)、和人登录号(歹'J5)之间的关联。测试的所有成分的信息储存在数据库中用于参考。基于犬的生理条件(诊断为胖)和来自表1-7的信息的比较,即注意受测试物质或成分的影响、且与瘦犬相比还在胖犬中差别表达的基因,认为可用于选择和制备胖犬的食物组合物的营养配方含有一种或多种下述量的下述成分(按每天每千克体重的毫克数(mg/kg/天)计算的体内量)是基于从体外使用的量的外推,例如DHA-约1至约30;EPA-约1至约30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)-约4/2至约30/45;ALA-约10至约100;LA-约30至约600;ARA-约5至约50;和SA-约3至约60。基于这些数据,可以制备含有一种或多种这样的成分的食物组合物和有关的饮食,并用于调节与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因。这样的调节会造成动物脂肪组织的量的调控,因此,在一个实施方案中,促进向希望的或正常的(更瘦)状态的转移,并促进动物的更好的健康和幸福。表6:在犬细胞系中测试的成分、物质DHAEPAEPA/DHACombo1.5:1比例(象在鱼油中)a亚麻酸亚油酸花生四滩酸硬脂酸缀合的亚油酸浓度10.005mg/ml(5微克/ml)0.005mg/ml(5孩i克/ml)0.015mg/mlEPA&0.010mg/mlDHA(共计0.025mg/ml)0.05mg/ml(50微克/ml)0.1mg/ml(100微克/ml)0.025mg/ml(25孩i克/ml)0.01mg/ml(10微克/ml)0.02mg/ml(20孩吏克/ml)浓度20.025mg/ml(25微克/ml)0.025mg/ml(25微克/ml)0.030mg/mlEPA&0.02mg/mlDHA(共计0.050mg/ml)0.1mg/ml(100孩i克/ml)0.5mg/ml(500微克/ml)0.05mg/ml(50微克/ml)0.05mg/ml(50微克/ml)0.1mg/ml(100微克/ml)溶剂ETOHETOHETOHETOHETOHETOHETOHMEOH表7:在有列出的成分存在下来自犬细胞系的表达谱结果且12345DHA1582387_at减量家犬I型碘化曱状腺氨酸脱珙酶(dioAC027016l)mRNA,完整cdsDHA1582824—at增量预测的家犬肉毒碱棕榈酰转移酶BC000185I同种型(CPT1),mRNADHA1584133—at增量预测的家犬,类似于动力蛋白,BC038344胞质的,重多肽2(LOC479461),mRNA74DHA1584742atDHA1584951atDHA1585355atDHADHA1586474—at1587029atDHA1587141at增量DHADHA1587268—at1587328atDHA1587418atDHADHA1587734—at1588058atDHA1588088—atDHA1589548—atDHA1590835—atDHA1591083—atDHA1591971—atDHA1592507at增量染色体9上的来自克隆AL591206RP11-151J10的人DNA序列含有1个新基因(FLJ20060)(含有FLJ12卯2,KIAA1574)的5,末端,脂肪分化有关的蛋白(ADRP)的ADFP基因增量预测的家犬,类似于亲脂素CR605429(Adipophilin,脂肪分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA增量预测的家犬,类似于AdipophilinCR597463(脂肪分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA减量小鼠RIKENcDNA1500031L02基AC078834因(150003lL02Rik),mRNA增量人类12BACRP11-545P7(RoswellAC089999Park癌症研究所人BAC文库)完整序列预测的家犬,类似于SEC14-样蛋CR456571白2(a-生育酚有关的蛋白)(TAP)(hTAP)(上清蛋白因子)(SPF)(鲨雄转移蛋白)(LOC477539),mRNA增量家犬尿酸盐氧化酶(UOX)mRNA,NA完整cds增量人类mRNA;cDNAAP001324DKFZp68601232(来自克隆DKFZp68601232)减量预测的家犬,类似于RPGR-相互AJ417060作用蛋白1同种型b(LOC475400),mRNA增量预测的家犬,类似于Na/Pi协同BC017952转运蛋白4(LOC478741),mRNA减量含有人类toll-白介素1受体(TIR)结BCO32474构域的接头蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:40573IMAGE:5216171),完整cds增量人类缺氧-可诱导的蛋白2,mRNABC008573(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds减量小鼠染色体14克隆RP24-304G19,AC115282完整序列减量人类白介素8受体,(3假基因,AC055863mRNA(cDNA克隆IMAGE:5450999),具有表观的受限的内含子增量人类克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds增量预测的家犬,类似于互补序列ClsAKO55183(LOC486714),mRNA减量人类强啡肽原(PDYN),mRNABC02633475DHA1593226-—at增量DHA1593388_at减量DHA15935卯—_at减量DHA1593831_at减量DHA1594976—画at增量DHA1596448__at增量DHA1596711—_at减量DHA1597677——at增量DHA1597789_—at增量DHA1597832—_at减量DHA1598607—at减量DHA1598932_匿at减量DHA1599339—at减量DHA1599453——at减量DHA1600090—at增量DHA1601347—_at减量DHA1602156一at增量DHA16027卯__at增量DHA1602966——at减量DHA1603771—_at减量DHA1604372——at增量染色体9上的来自克隆AL358074RP11-423C15的人DNA序列含有丝裂原-激活的蛋白激酶有关的蛋白1的MAPKAP1基因的5'末端,1个新基因,PBX3基因f的5'末端预测的家犬,类似于含有SDA1BC063797结构域的1(LOC478431),mRNA人类淋巴细胞接头蛋白,mRNAAB208911(cDNA克隆IMAGE:4861744),完整cds预测的家犬,类似于网才各蛋白重BC015854链1(CLH-17)(LOC480578),mRNA预测的牛,类似于谷氨酸受体,ALO35698metabo加pic1(LOC540485),mRNA预测的家犬,类似于精子有关的AK095036抗原16(LOC478899),mRNA人类cDNA:FLJ21199fis,克隆AK024852COL00235人类,克隆IMAGE:5271096,mRNAAC012516人类12BACRP11-337L12(RoswellAC130404Park癌症研究所人BAC文i)完整序列人类假定蛋白LOC92558NM—207311(LOC92558),mRNA预测的家犬,类似于含有硫氧还AC099518蛋白结构域的蛋白6(硫氧还蛋白-样蛋白2)(Txl-2)(LOC485685),mRNA预测的家犬,类似于AL354836SAP90/PSD-95有关的蛋白2(LOC488556),mRNA家犬克隆RP81-117B1,完整序列NA预测的家犬LOC475099NA(LOC475099),mRNA预测的家犬,类似于SEC22囊泡AY405366运输蛋白-样2(LOC478590),mRNA汉森德巴利酵母CBS767,NADEHA0D14146g预测的mRNAmKIAA4184蛋白的小鼠mRNAAL590139人类芳烃受体核转位分子(ARNT)AC115282基因,完整cds来自连锁群21中的克隆ALWOWlDKEYP-75A7的斑马鱼DNA序列,完整序列家犬克隆RP81-117B1,完整序列NA预测的家犬LOC475665AY411810(LOC475665),mRNADHA1605486at增量EPA1583329—at减量EPA1583403at增量EPA1584742at增量EPA1584951—at增量EPA1585292—at增量EPA1585355—at增量EPA1586420—at减量EPA1587196—at增量EPA1587428—at减量EPA1588088—at增量EPA1589797—at减量EPA1589829—s—at减量EPA1590407—s—at增量EPA1591083—at增量EPA1592920—at减量EPA1593146—s—at增量EPA1593677—at减量EPA1594091—at减量EPA1594227at增量人类丙酮酸脱氢酶激酶4mRNA,3,AK096428非翻译区,部分序列人类,,类似于分泌的蜷曲有关的蛋AC018634白4,克隆IMAGE:4828181,mRNA野猪肉毒碱棕榈酰转移酶ImRNA,AK172798编码线粒体蛋白的核基因,完整cds染色体9上的来自克隆AL591206RP11-151J10的人DNA序列含有1个新基因(FLJ20060)(含有FLJI2卯2,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有关的蛋白(ADRP)的ADFP基因预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR605429分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA人类曱基CpG结合蛋白2(Rett综合AF030876征)(MECP2),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR597463分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA人类RAB37,成员RAS癌基因家BC016615族(RAB37),mRNA预测的家犬LOC475684NM—147223(LOC475684),mRNA染色体6上的来自克隆AL589740RP11-436D23的人DNA序列含有1个新基因的一部分,完整序列人类缺氧-可诱导的蛋白2,mRNABC008573(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds人类染色体15克隆RP1卜344A16AC0卯651map15q21.3,完整序列预测的牛,类似于ATP-依赖性的AC004486DNA螺旋酶Q4(RecQ蛋白-样4)(RecQ4)(L0C515289),部分mRNA人类整联蛋白-连接的激酶1(ILK)AJ404847基因,完整cds人类克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds人类12BACRP11-407P2(RoswellAC090013Park癌症研究所人BAC文库)完整序列人类Kruppel-样因子11(KLF11),BC063286mRNA预测的家犬,类似于假定蛋白AB070003(LOC475308),mRNA预测的家犬,类似于FLJ23129蛋NM_024763白同种型1(LOC479538),mRNA人类RNA结合基序蛋白,X-连接的AK096015EPA1594231—at增量EPA1594415—at减量EPA1594824—at减量EPA1594939—at增量EPA1595021—at减量EPA1595265—at增量EPA1595301_at增量EPA1596553—s—at减量EPA1597390_at减量EPA1597801—at减量EPA1597802—at减量EPA1598585—at减量EPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPA1599557at减量1599565—at减量1599601s—at减量1600959—at增量1601005—at减量1602471at减量1603225—at增量1603875—at减量EPA1604439—at减量EPA1604600—at减量(RBMX),mRNA野猪肽酰-脯氨酰顺反式异构酶ANA(PPIA),mRNA预测的牛,类似于GTP酶,IMAPAP001675家族成员4(免疫-相关的蛋白4)(免疫-相关的核苦酸1蛋白)(hIANl)(MSTP062)(LOC510751),mRNA人类染色体16克隆CTA-233A7,AC130449完整序列人类染色体8,克隆RP11-813L8,AC090133完整序列氯化钠协同转运蛋白的牛mRNA,NM_000339部分YarrowialipolyticaCLIB99,NG—001333YALI0C20339g预测的mRNA骨骼肌丰富的蛋白的人mRNAACII3382人类染色体16开放读码框55AK056168(C16orf55),mRNA预测的家犬,类似于Ataxin-10(脊AY400068髓小脑共济失调类型IO蛋白)(脑蛋白E46同源物)(LOC474467),mRNA人类,克隆IMAGE:4822875,mRNAAL442128来自12的小鼠BAC克隆AL078583RP23-451I11,完整序列人类S164基因,部分cds;PS1和AC011306假定蛋白基因,完整cds;和S171基因,部分cds预测的家犬,类似于假定蛋白AY414168MGC12103(LOC481489),mRNA染色体lpl3-14.3上的来自克隆AL139175RP4-615P17的人DNA序列,完整序列预测的家犬,类似于雄性增强的AY403773抗原-牛(LOC474906),mRNA预测的家犬,类似于IgA重^l恒NA定区(LOC480452),mRNA预测的家犬LOC47卯25XM—372592(LOC479025),mRNA人类cDNA克隆IMAGE:4797645,AC073120部分cds捻转血矛线虫小随体Hcms51序列AC008429人类cDNAFU33460fis,克隆AC010092BRAMY2000653,高度类似于人类搅乱-样激酶1(TLK1)mRNA人类mRNA;cDNAAL137346DKFZp761M0111(来自克隆DKFZp761M0111)人类mRNA;cDNADKFZp686K122AC01073378EPA1605028—at减量EPA1605486at增量EPA1605654at增量EPA1605669s—at增量DHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPA1582781—at增量1583031—at增量1583254—x—at减量1583403—at增量1584742at增量DHA/158495latEPA1585033—at1585339at1586172at1586287at1586614at1586695at1587254at1587413at增量减量减量1585355—at增量减量减量减量减量减量增量(来自克隆DKFZp686K122)家犬分泌的B7-l蛋白(CD80)基因,NA或者剪接的外显子4和完整cds人类丙酮酸脱氢酶激酶4mRNA,3'AK096428非翻译区,部分序列含有小鼠mbt结构域的1,mRNAAK028503(cDNA克隆MGC:2卯00IMAGE:2646754),完整cds人类cDNAFLJ38323fis,克隆AK095642FCBBF3024623,轻微类似于人类C2H2(Kruppel-型)锌指蛋白mRNA家犬L-型Ca通道a1亚基mRNA,AF465484部分cds家犬成纤維细胞生长因子-8NM_006119(FGF陽8)mRNA,部分cds牛克隆11^八0£:7961516胸腺素0-4-X02493样mRNA,完整cds野猪肉毒碱椋榈酰转移酶ImRNA,AKl72798编码线粒体蛋白的核基因,完整cds染色体9上的来自克隆AL591206RP11-151J10的人DNA序列含有1个新基因(FU20060)(含有FLJ12902,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有关的蛋白(ADRP)的ADFP基因预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CRM5429分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于KIAA2025AL121983蛋白(LOC480065),mRNAUDP-GalNAc:pGlcNAc(31,3-氨基AL672237半乳糖基转移酶的人类mRNA,多肽2变体蛋白预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR597463分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA人类染色体11,克隆RP11-348A11,AC131263完整序列转录因子COUP-TFI的牛mRNAAC106818(COUP-TFI基因)预测的家犬,类似于F-框蛋白BC037320SEL10(LOC475465),mRNA人类RAD51-样1(酿酒酵母)BX161515(RAD51L1),转录物变体2,mRNA预测的家犬双面激酶1(JAK1),AC008785mRNAAC005996医蛭中间丝gliarinmRNA,完整cdsDHA/1587813—s—at增量EPA—DHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPA1589293—at1589678_s—at1589929—at1590942—at1591029—at1591083—at1591601at1591782—at1592123—at1592160—at1592915—s—at1593146—s—at1593855—at1593993—at1594205at减量增量减量减量增量增量减量增量减量减量增量增量减量减量增量DHA/1594291—s—at减量EPA1594379—x—at增量1594413—at增量1594564—at增量1594848—at增量预测的黑猩猩,类似于dJ109F14.3AL160175(新颖的推定的环指蛋白)(LOC472236),mRNAKIAA1804蛋白的人类mRNA,部AB058707分cdsBK001411人类克隆almRNA序列人类溶质载体家族34(磷酸钠),成AC145098员1,mRNA(cDNA克隆IMAGE:5182821),具有表观的受限的内含子人神经生长因子-2样蛋白(NTN2L)AC106820基因,完整cds预测的人类KIAA0146蛋白AC023991(KIAA0146),mRNA人类克隆DNA22780NL2ACO10323(UNQ171)mRNA,完整cds染色体9上的来自克隆RP11-787B4AL691426的人DNA序列含有妊娠-相关的血浆蛋白A的PAPPA基因的5'末端,1个新基因和1个CpG岛,完整序列预测的牛,类似于假定蛋白AC069335(LOC514986),部分mRNA预测的家犬,类似于波形蛋白AY891766(LOC477991),mRNA预测的家犬,类似于纤维蛋白原BC070246a/a-E链前体(LOC475473),mRNA预测的家犬,类似于假定蛋白BC004501MGC33867(LOC478228),mRNA人类Kmppel-样因子ll(KLFll),BC063286mRNAAL353710猫克隆RP86-117J4,完整序列来自7的黑猩猩BAC克隆AC004949RP43-75I2,完整序列预测的黑猩猩,类似于推定的转DQ048939录因子ZNF131(LOC461893),mRNA预测的家犬,类似于曱基巴豆酰-BC014897辅酶A羧化酶2(J3)(LOC47謂l),mRNA猫生长阻止和DNA损伤-可诱导AL136120的蛋白45(GADD45),mRNA人类细胞色素P450,家族26,亚家AC007002族B,多肽1(CYP26B1),mRNA人类丝氨酸棕榈酰转移酶,亚基IIAF111168基因,完整cds;和未知基因预测的黑猩猩假定蛋白AC073263XP一513164(LOC456583),mRNA80DHA/1596238—atEPADHA/1594939—at增量人类染色体8,克隆RP11-813L8,AC0卯133EPA完整序列DHA/1595083—at减量预测的家犬,类似于假定蛋白AK055530EPAMGC18257(LOC474943),mRNADHA/1595280—at减量人类mRNA;cDNAAL355298EPADKFZp686N1929(来自克隆DKFZp686N1929)DHA/1595481—at减量预测的家犬LOC478639NM—002492EPA(LOC478639),mRNADHA/1595587—at减量预测的家犬,类似于copineVIIIBC048260EPA(LOC477646),mRNADHA/1595673—at减量预测的家犬,类似于含有SDA1BC048351EPA结构域的1(LOC478431),mRNADHA/1596041—at减量人类mRNA;cDNAAL354707EPADKFZp686115205(来自克隆DKFZp686115205)增量预测的家犬,类似于棕榈酰-蛋白AL110128硫酯酶2同种型a前体(LOC474856),mRNADHA/1596301—at减量染色体4上的来自克隆RP23-440D4AC000007EPA的小鼠DNA序列,完整序列DHA/1597387—at增量预测的家犬,类似于a-N-乙酰基BC032398EPA葡萄糖胺酶前体(N-乙酰基-a-葡萄糖胺酶)(NAG)(LOC490965),mRNADHA/1597847—at增量预测的原鸡,类似于泛素特异性AC098935EPA的蛋白酶37(LOC424217),mRNADHA/1599572—at减量预测的家犬,类似于ORF2NAEPA(LOC475183),mRNADHA/1599950—at减量预测的家犬,类似于雄性增强的AL136304EPA抗原-牛(LOC474906),mRNADHA/1600310—at减量预测的家犬,类似于piggyBac转AK223"6EPA座因子衍生的1(LOC488322),mRNADHA/1600683—at减量NAEPA家犬克隆RP81-391L22,完整序列DHA/1601351—at增量NAEPA家犬,克隆XX-25A1,完整序列DHA/1601383—at增量预测的家犬,类似于推定的GTP-BT007509EPA结合蛋白RAY-样(Rab-样蛋白4)(LOC474517),mRNADHA/1601782—at减量人类内酰胺酶,|32,mRNA(cDNAAC022731EPA克隆IMAGE:3452575)DHA/1602033—at减量预测的牛,类似于G蛋白-偶联的AL44M67EPA受体23(LOC539738),mRNADHA/1602162—at减量来自2的人类BAC克隆AC093850EPARP11-489P15,完整序列DHA/1603521—at减量人类cDNAFU33134fis,克隆BC017798EPAUMVEN2000453,轻樣i类似于小鼠胎儿珠蛋白诱导因子mRNA81DHA/1603534—at减量EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPAALA1603559—s_at减量1603658—s—at增量DHA/1603674—at减量EPA一1605317—at1605486—at1605832—at1605935—at1582455at减量增量减量减量减量ALA1584508—at减量ALA1584742at增量ALA1584951—at增量ALA1585266—at减量ALA1585355—at增量ALA1585515—at增量ALA1585553—at减量ALA1586185—at增量ALA587312—at增量ALA1587413—at增量ALA1587838—at减量预测的家犬,类似于蛋白酪氨酸AL592064磷酸酶,受体类型,Q同种型l前体(LOC482581),mRNA预测的家犬,类似于神经活性有AY413卯5关的环指蛋白(LOC475470),mRNA人类mRNA;cDNADKFZp451E012AL834247(来自克隆DKFZp451E012);完整cds人类cDNAFLJ13648fis,克隆AK023710PLACE1011340,轻樣i类似于人类應3隱BmRNA人类染色体16克隆CTD-2337L2,AC093509完整序列人类丙酮酸脱氢酶激酶4mRNA,3'AK096428非翻译区,部分序列人类mRNA;cDNADKFZp451J152AK097112(来自克隆DKFZp451J152);完整cdsAK024964NFI-B蛋白的小鼠mRNA,完整cds家犬I型胶原前al(I)链(COLIAI)AB209597mRNA原,完整cds预测的黑猩猩LOC464838AK122763(LOC464838),mRNA染色体9上的来自克隆AL591206RP11-15U10的人DNA序列含有1个新基因(FU20060)(含有FLJI2卯2,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有关的蛋白(ADRP)的ADFP基因预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR605429分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于FLJ20859蛋BC005053白(LOC475396),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR597463分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA预测的家犬LOC476210AF303134(LOC476210),mRNA预测的家犬,类似于结合腕蛋白BC032361-N(LOC4卯335),mRNA预测的家犬,类似于假定蛋白AC093611LOC90637(LOC480809),mRNA预测的家犬LOC491404ACI24862(LOC491404),mRNA医蛭中间丝gliarinmRNA,完整cdsAC005996人类成纤维细胞生长因子13AL031386(FGF13),转录物变体1B,mRNA82ALA1588093_at减量ALA1588502—at减量ALA1589017—at增量ALA15%554—at增量ALA1591083—at增量ALA1591749—at增量ALA1592201—at增量ALA1593146—s—at增量ALA1593222—at增量ALA1593224—at增量ALA1593710—at增量ALA1593836—at增量ALA1595172—s—at增量ALA1595533—at增量ALA1595722—at增量ALA1595801—at增量ALA1596406—at增量ALA1599614—at增量ALA1600037_at减量ALA1600155—at增量ALA1600793at增量人类假定蛋白FLJ20507,mRNABC039892(cDNA克隆MGC:47628IMAGE:5725347),完整cdscAMP效应元件结合蛋白5同种型AB209262卩变体蛋白的人类mRNA微管-相关的蛋白2同种型2变体蛋AB209330白的人类mRNA预测的家犬,类似于ATP/GTP结AC025842合蛋白1(LOC479034),mRNA人类克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds家犬天然抗性有关的巨噬细胞蛋白AY400098(NRAMP1),mRNA来自Ghanagag蛋白(gag)基因的AL929410HIV-2菌林A1G1612,部分cds人类Krappel-林因子11(KLFll),BC063286mRNA染色体IO上的来自克隆AL139243RP11-439D8的人DNA序列含有1个新基因,Hermansky-Pudlak综合征1的HPS1基因,类肝素酶2的HPSE2基因的3'末端和1个CpG乌,完整预测的家犬,类似于hemojuvelinAL138842同种型a(LOC475830),mRNA预测的牛,类似于谷胱甘肽还原AY338490酶(LOC506406),部分mRNA家犬克隆RP81-142A6,完整序列NA预测的家犬,类似于甘油醛-3-磷NA酸脱氢酶(LOC47卯78),mRNA染色体10上的来自克隆AL355315RP11-548K23的人DNA序列含有锚蛋白重复序列结构域2的ANKRD2基因(伸展响应肌肉),6个新基因,磷脂酰肌醇4-激酶的基因人类染色体17,克隆AC015920CTD-3022L24,完整序列人类cDNAFLJ34120fis,克隆AK091439FCBBF3009541猩猩mRNA;cDNADKFZp459C032AC023795(来自克隆DKFZp459C032)预测的家犬LOC477772AL365364(LOC477772),mRNA人类,克隆IMAGE:5294477,mRNAAC007163预测的家犬LOC479296AC011389(LOC479296),mRNA黑腹果蝇CG18408-PA,同种型AAL157781(CAP)mRNA,完整cdsALA1601394—x—at增量ALA1602423—at减量ALA1602589—at增量ALA1603636—at减量ALA1604861—at减量ALA1605047—at减量ALA1605187at增量ALA1605429—at减量ALA1605486at增量LA1582385—at减量LA1582824at增量LA1583273—s—at减量LA1584258at增量LA1584677—at减量LA1584742at增量LA1584951—at增量预测的家犬,类似于泛素-特异性AC022167的蛋白酶7同种型(LOC479854),mRNA预测的家犬,类似于千扰素调节AC078880因子2结合蛋白1(LOC484433),mRNAMustelavison酪氨酸氨基转移酶基NA因,完整cds染色体20ql3.1-13.2上的来自克隆AL031674RP4-715N11的人DNA序列含有两个推定的新基因,ESTs,STSs和GSSs,完整序列人类染色体5克隆CTB-53I9,完整AC008680序列染色体IO上的来自克隆AL713895RP11-10C13的人DNA序列含有曱状腺激素受体相互作用物8(KIAA1380,DKFZp761F0118)的TRIP8基因的5'末端和1个新基因的3'末端(FLJ1染色体9上的来自克隆RP11-8N6的人DNA序列含有母系胚胎亮氨酸拉链激酶(KIAA0175)的MELK基因的3'末端,完整序列染色体1上的来自克隆RPll-45817的人DNA序列含有锌指的ZA20D1基因的5'末端,含有A20结构域的1,核糖体蛋白L6(RPL6)假基因,VPS45A基因人类丙酮酸脱氢酶激酶4mRNA,3'非翻译区,部分序列家犬Na+-依赖性的谷氨酸运载体(GLAST),mRNA预测的家犬肉毒^s咸棕榈酰转移酶I同种型(CPT1),mRNA人类mRNA;cDNADKFZp761G179(来自克隆DKFZp761G179)人类calsyntenin2,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4130487),部分cds预测的黑猩猩,类似于半胱氨酸蛋白酶抑制剂T(LOC469901),mRNA染色体9上的来自克隆RP11-151J10的人DNA序列含有1个新基因(FU20060)(含有FLJ12902,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有关的蛋白(ADRP)的ADFP基因预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR605429AL442063AL358073AK096428D26443BC000185BC008990BC007943BC02糊6AL591206LALA1585355at1585417at1585604at增量增量减量LA1585686_at增量LA1586295—at减量LA1588088—at增量LA1589569—at减量LA1591083at增量LA1592172at增量LA1594511—s—at增量LA1594801—at减量LA1594973—at增量LA1595021_at减量LA1595753—at减量LA1596117—at减量LA1600646—at减量LA1600703at增量LA1601942—at减量分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪CR597463分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA小鼠微管有关的一氧化物酶,AC105754calponin和含有LIM结构域的3,mRNA(cDNA克隆IMAGE:30637988),部分cds染色体IO上的来自克隆AL121927RP11-175J10的人DNA序列含有转化、含酸性巻曲螺旋的蛋白1(TACC1)假基因和线粒体NADH脱氢酶1(MTNDl)假基因预测的类似于冷-可诱导的CR625198RNA-结合蛋白(富含甘氨酸的RNA-结合蛋白CIRP)(A18hnRNP)(LOC507120),mRNA在卵巢癌1中减量调节的人类,BC027860mRNA(cDNA克隆MGC:34368IMAGE:5228947),完整cds人类缺氧-可诱导的蛋白2,mRNABC008573(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds预测的家犬,类似于雄性精子细BC039825胞-相关的激酶(LOC478721),mRNA人类克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds来自7的人类BAC克隆AC004543CTB-17C20,完整序列人类RGM结构域家族,成员B,AK054622mRNA(cDNA克隆IMAGE:3852164)人类HMGIC融合伴侣-样2AY309920(LHFPL2)mRNA,完整cds预测的家犬LOC478197AL031387(LOC478197),mRNA氯化钠协同转运蛋白的牛mRNA,NM一000339部分人类CrkRSmRNA,完整cdsCR954985小鼠piccolo(突触前细胞基质蛋白)AP001266(Pclo),mRNA人类mRNA;cDNADKFZp547F213AC103736(来自克隆DKFZp547F213)预测的家犬,类似于未被苯并咪AC012391唑3同源物(LOC477857)抑制的出芽,mRNA预测的家犬,类似于具有序列相ACO2635885LA1603578—at减量LA1605486—at增量LA1605822—at减量ARA1582824—at增量ARA1582851—at增量ARA1582999—at减量ARA1583403—at增量ARA1584742—at增量抗原ARA1584951—at增量ARA1585355—at增量ARA1586047—s—at减量ARA1586172—at减量ARA1586185—at增量ARA1586281at增量ARA1587792—at增量ARA1588088—at增量ARA1588903—at增量似性20的家族,成员A(LOC480458),mRNA预测的家犬,类似于CD63(LOC474391),mRNA人类丙酮酸脱氢酶激酶4mRNA,3'非翻译区,部分序列人二肽酰氨肽酶样蛋白mRNA,完整cds预测的家犬肉毒碱棕榈酰转移酶I同种型(CPT1),mRNA褐鼠细胞核受体亚家族l,组D,成员1,mRNA(cDNA克隆MGC:72288IMAGE:5598020),完整cds家犬细胞周期蛋白-依赖性的激酶抑制剂(WAFl)mRNA,部分cds野猪肉毒碱棕榈酰转移酶ImRNA,编码线粒体蛋白的核基因,完整cds染色体9上的来自克隆RP11-151J10的人DNA序列含有1个新基因(FLJ20060)(含有FLJ12902,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有关的蛋白(ADRP)的ADFP基因预测的家犬,类似于亲脂素分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素分化有关的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA染色体11上的来自克隆RP23-348N2的小鼠DNA序列含有蛋白磷酸酶3调节的亚基Ba同种型(鈣调神经磷酸酶B,I型)的Ppp3rl基因的5'末端,核糖体蛋白人类染色体11,克隆RP11-348A11,完整序列预测的家犬,类似于假定蛋白LOC90637(LOC480809),mRNA预测的黑猩猩,类似于含有DEP结构域的蛋白5(LOC458777),mRNA预测的牛,类似于磷酸甘油酸激酶1(LOC533730),部分mRNA人类缺氧-可诱导的蛋白2,mRNA(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds人类mRNA;cDNADKFZp68612148(来自克隆DKFZp68612148)CR609892AK096428M96859BC000185BC047875AY399342AK172798AL591206(脂肪CR605429(脂肪CR597463AL512655AC131263AC093611BX640828AL049589BC008573U3299686ARA1590656—at增量ARA1590755—at减量ARA1591083—at增量ARA1592286—s—at减量ARA1592610—at减量ARA1592947—at增量ARA1593146—s—at增量ARA1593254—at减量ARA1593907—s—at减量ARA1594108—at增量ARA1594939—at增量ARA1595334—at减量ARA1595495—s—at增量ARA1595956—at增量ARA1596476—at减量ARA1596787—at减量ARA1597116at增量ARA1598013—at增量ARA1598063at增量ARA1598902—at增量ARA1599787—at增量预测的家犬,类似于染色质clAY404349(LOC476640)的SWI/SNF有关的基质-相关的肌动蛋白-依赖性的调节剂,mRNA来自7的人类BAC克隆AC102953RP11-1246CI9,完整序列人类克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds人类克隆DNA77624SHATr/JAM3BC057284(UNQ859)mRNA,完整cds人类cDNA克隆IMAGE:4611512,BC071790部分cds人类假定蛋白FLJ11795AC016585(FLJ11795),mRNA人类Kruppel-样因子ll(KLFll),BC063286mRNA预测的家犬,类似于6-磷酸果糖AL020"1-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶1(6PF-2-K/Fru-2,6-P2ASE肝同工酶)(LOC491903),mRNA预测的牛,类似于26S蛋白酶体ALO34553非-ATP酶调节的亚基10(26S蛋白酶体调节的亚基p28)(Gankyrin)(LOC535414),mRNA假定蛋白的原鸡mRNA,克隆15klAC100847人类染色体8,克隆RP11-813L8,AC090133完整序列人类mRNA;cDNAAL031290DKFZp779M1134(来自克隆DKFZp779M1134)MustelavisonNADH脱氢酶亚基5NA(ND5)基因,完整cds;线粒体产物的线粒体基因预测的原鸡,类似于KIAA1389AC025467蛋白(LOC421523),mRNA稻(日本品种-组)染色体11克隆Z84490OSJNBb0071K13,完整序列人类CASK相互作用蛋白2(CA皮AC100787月夫2),mRNA预测的家犬,类似于胞质的多腺BX538213苦酸化元件结合蛋白4(LOC479287),mRNA预测的家犬,类似于InaD-样蛋白BC021135同种型1(LOC479550),mRNA预测的褐鼠,类似于proacrosin-AC112198结合蛋白(LOC500316),mRNA人类cDNA克隆IMAGE:3878708,BC009735部分cds人类,克隆IMAGE:4821877,AL03570387ARA1599851一atARA1601092—atARA1601561—atARA1601912—atARA1602749—atARA1603093—atARA1603151—atARA1603452—s—atARA1603454—atARA1603839—atARA1604372—atARA1604969—atARA1605486—atSACfa.10737.1.Al—atSACfa.10872.1.AlatSASACfa.12323.1.Al—atCfa.12533.1.AlatSACfa.12594.1.Al—atSACfa.12839.1.Al—atSACfa.l7.1.S1—s—atSACfa.17302.1.SIsatmRNA,邢分cds预测的原鸡蜷曲-3(FZ-3),mRNAAC092040人类TRIAD1I型mRNA,完整cdsAF099149预测的家犬,类似于RIKENAL357374cDNA2010100012(LOC477215),mRNA小鼠表达的序列AW538196AL359494(AW538196),mRNA来自4的人类BAC克隆AC108866RP11-44D21,完整序列人类基因组DNA,染色体1lq克AP003083隆:RP11-179B7,完整序列褐鼠染色体20,主要组织相容性复AL033380合物,从40BACs,菌4朱BrownNorway(BN/ssNHsd)装S己,RTln单倍型;区段7/11人类cDNA克隆IMAGE:4611044,AC006211部分cds类似于细胞色素c氧化酶亚基VIbAL158068的牛mRNA,部分cds,克隆ORCS10538预测的褐鼠转录因子EB(预测的)BX284687(Tcfeb—预测的),mRNA预测的家犬LOC475665AY411810(LOC475665),mRNA人类染色体17,克隆AC005332hRPK.147—L—13,完整序列人类丙酮&脱氢酶激酶4mRNA,3'AK096428非翻译区,部分序列预测的家犬,类似于HP1-BP74,AL663074转录物变体4(LOC478203),mRNA人类Kruppel-样因子11,mRNACR591795(cDNA克隆MGC:71570IMAGE:30343877),完整cds预测的家犬,类似于血管生成素-ACOIO323样4蛋白(LOC476724),mRNA预测的牛,类似于胰岛素诱导的AC144438基因1同种型1(LOC511899),mRNA人类G蛋白-偶联的受体17,mRNAAC096920(cDNA克隆MGC:35264IMAGE:5174146),完整cds预测的家犬,类似于nexilin同种AC103591型s(LOC490202),mRNA家犬器官阴离子运输多肽ANM—134431(OATPA)mRNA,部分cds预测的家犬,类似于含有普列克NM—015549底物蛋白同源性结构域的,家族G,成员3(LOC611460),mRNA曰里曰里曰一里量旦里量旦里量量曰里量量量量量量量量量量量增增减减增增增减增减增减增减增增增增减增减SASASASASASASASASASASASASASASASASASACfa.17415.1.减量Sl—s—atCfa.l7931丄减量SI—s—atCfa.1854.1.A增量1—atCfa.18958.1.减量SIatCfa.19447.1.SI—atCfa.19635.1.SIat减量减量Cfa.19704.1.减量SI—atCfa.20892丄增量SIsatCfa.21023.1.增量SI—atCfa.2282.1.S增量1atCfa.394.1.Al增量—x—atCfa.431.1.Al增量—atCfa.431.2.Al增量—s—atCfa.5582.1.A减量1—atCfa.6339.1.A增量1—atCfa.6361.1.A减量1—atCfa.6482.1.A减量1—atCfa.6915.1.A减量1at预测的家犬,类似于调鈣素基因XM—088459启动子区域有关的蛋白(LOC607434),mRNA预测的家犬,类似于vonNM—022834Willebrand因子A结构域有关的蛋白同种型1(LOC607112),mRNA人类脂肪酸去饱和酶1(FADS1),AP002380mRNA预测的家犬,类似于含有OCIABC003409结构域的1,转录物变体3(LOC475140),mRNA人类核纤层蛋白Bl(LMNB1),NM_005573mRNA假定蛋白的Lotuscomiculatusvar.AF165140japonicus基因,完整和部分cds,克隆:BAC259.12D-1预测的牛,类似于免疫有关的AC006276GTP酶家族,Ql(LOC616834),mRNA预测的家犬,类似于外切核苷三CR936765磷酸二磷酸水解酶6(NTPD酶6)(CD39抗原-样2)(LOC485564),mRNA预测的家犬,类似于含有非-POUAL5卯762结构域的,八聚体-结合的,转录物变体11(LOC612773),mRNA预测的家犬,类似于[丙酮酸脱氢AK096428酶[硫辛酰胺]]激酶同工酶4,线粒体前体(丙酮酸脱氢酶激酶同种型4)(LOC482310),mRNA预测的家犬,类似于60S核糖体NM—000984蛋白L23a(LOC478212),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪AL591206分化有关的蛋白)(ADRP),转录物变体4(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪NM—001122分化有关的蛋白)(ADRP),转录物变体1(LOC474720),mRNA二重氧化酶2前体变体蛋白的人类AB209010mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪NM—001122分化有关的蛋白)(ADRP),转录物变体3(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于60S核糖体BX679664蛋白L17(L23),转录物变体4(LOC480221),mRNA预测的家犬假定蛋白LOC612422AL162191(LOC612422),mRNAAC073655人类12BACRP11-1105G289SACfa.7119.1.A减量1—s—atSACfa.743.2.Sl增量—a—atSACfa.7531.1.A增量1—atSACfa.7705.2.A减量1—s—atSACfa.79I.4.Al增量—atSACfa.9014.1.A减量1—atSACfa.9506.1.A增量1—atSACfa.9531.1.A减量1—atSACfa.9685.2.S增量1—a—atSACfa.9694.1.A减量1—atSACfaAffk.1102减量.l.Sl_atSACfaAffk.1296减量7.1.SI—atSACfaAffx.1359减量9.1.SI—atSACfaAffx.1447减量9.1.S1—atSACfaAffx.1459减量5.1.S1—s一atSACfaAffx.1520减量2.1.SIsatSACfaAffx.1630减量2.1.S1—x—atSACfaAffx.1649减量3.1.SIatSACfaAffx.1919增量(RoswellPark癌症研究所人BAC文库)完整序列预测的家犬,类似于coilinAC109357(LOC480564),mRNA预测的牛假定蛋白LOC614918BC001282(LOC614918),mRNA染色体ll上的来自克隆AC008732RP23-287B22的小鼠DNA序列含有1个CpG岛,完整序列预测的家犬,类似于染色质-特异NM—007192性的转录延伸因子大亚基,转录物变体2(LOC612874),mRNA预测的家犬,类似于核糖体蛋白NM_000986L24,转录物变体2(LOC478547),mRNA小鼠SNF8,ESCRT-II复合物亚基,AC091133同源物(酿酒酵母),mRNA(cDNA克隆IMAGE:5372918)人类缺氧-可诱导的蛋白2(HIG2)AF144755mRNA,完整cds人类cyclophilin有关的蛋白mRNA,AC092041完整cds预测的家犬短的串联的重复序列AL138960基因座PEZ20变体19(LOC476927),mRNA约氏疟原虫yoelii菌抹17XNL假定AL359317蛋白(PY00634)mRNA,部分cds预测的家犬,类似于RAB5B,成BC065298员RAS癌基因家族,转录物变体3(LOC474394),mRNA家犬隔离cOR5D23嗅觉感受器家AF399364族5亚家族D基因,部分cdsNicotianabenthamiana克隆6-272NA未知的mRNA预测的家犬,类似于蛋白AK223603KIAA0652(LOC483632),mRNA预测的家犬,类似于二酰基甘油NM—201532激酶;(LOC611321),mRNA预测的家犬,类似于多配体聚糖-4AK222695前体(双栖蛋白聚糖)(SYND4)(Ryudocan核心蛋白)(LOC485893),mRNA预测的家犬,类似于锌指蛋白25AB169501(LOC611218),mRNA预测的牛,类似于磷脂酰肌醇4-AL079340激酶(3(Ptdlns4-激酶)(PI4K(3)(PI4K-卩)(NPIK)(PI4K92)(LOC613348),mRNA人类肌萎缩侧索硬化2(青少年)NM_02091990SASASASASASASASASASASASASASASASASA7.1.SI—atCfaAffic.19206.1.SI—atCfaAffk.197.1.S1—s—atCfaAffx.20515丄S1satCfaAffx.2332O.l.Sl一atCfaAffx.23784丄Sl一s—atCfaAffe.23872.1.SIsatCfaAffx.25844丄Sl一atCfaAffx.2830l.l.Sl—s—atCfaAffx.2896.l.Slat减量减量增量CfaAffx.2118减量2.1.S1—s一atCfaAffic.2128减量0.1.SIatCfaAffk.2208减量2.1.S1—s—atCfaAffic.2256减量0.1.SIat减量减量增量CfaAffx.2404增量0.1.SIat增量增量减量CfaAffx.2985增量8.1.Sl_s—atCfaAffx.3314增量.1.S1—atCfaAffx.4425增量.l.Slat(ALS2),mRNA黄酮类化合物3,-羟化酶的IpomoeaBX647478nilMagenta基因,完整cds预测的家犬bZIP蛋白,转录物变NM—003204体1(LCR-F1),mRNA预测的家犬,类似于蛋白酪氨酸AL110210磷酸酶,非-受体类型23(LOC609220),mRNA预测的家犬,类似于CG4699-PA,BC098376同种型A,转录物变体4(LOC480489),mRNA预测的家犬,类似于丝裂原-激活BC035576的蛋白激酶激酶激酶14(NF-k(3-诱导的激酶)(丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶NIK)(HsNIK)(LOC490926),mRNA预测的家犬,类似于含有锌指XM—370654CCCH类型的12A(LOC489416),mRNA预测的家犬,类似于Cullin-5BC063306(CUL-5)(加压素-激活的钙-活动受体)(VACM-1)(LOC489422),mRNA预测的家犬,类似于RAD52BBC032114(LOC480794),mRNA预测的家犬,类似于醛脱氢酶4A1BC023600前体(LOC612452),mRNA预测的家犬,类似于切割刺激因AL136747子,3前-RNA亚基2,tau(LOC486459),mRNA预测的家犬,类似于丝氨酸/苏氨NA酸激酶11相互作用蛋白(LOC488541),mRNA预测的家犬假定LOC22889,转录AK1704卯物变体1(LOC612936),mRNA预测的家犬,类似于血管生成素-AK222489样4蛋白(LOC476724),mRNA预测的家犬,类似于丝裂原-激活NM—006116的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白l(TAKl-结合蛋白1),转录物变体1(LOC481245),mRNA预测的家犬,类似于黑素瘤普遍BC110874存在的突变的蛋白(LOC612320),mRNA预测的家犬,类似于亲脂素(脂肪NM_001122分化有关的蛋白)(ADRP),转录物变体4(LOC474720),mRNA预测的家犬,类似于锌指蛋白329NM_024620(LOC484234),mRNASASASASASASASASASASACfaAffx.4438增量.l.SlatCLACLACLACLACLACLACfaAffx.5367.l.Sl一atCfaAffx.654.1.S1—atCfaAffk.668.1.S1—atCfaAffe.67031.S1atCfaAffx.7845.1.S1—s—atCfaAfiZ8861.1.S1—atCfaAffx.9083.l.Sl_atCfaAffx.9353.l.SlsatCfa.11267.1.Al—atCfa.11358.1.Al—atCfa.11413.1.Al一atCfa.11483.1.AlatCfa.12323.1.Al—atCfa.l284.1.S1at减量增量减量减量CfaAffx.7822减量.l.Slsat增量增量增量减量SACfaAffx.9845增量.1.S1—s—atCLACfa.10478.1.增量Alat减量减量减量CLACfa.11868.1.减量Alat增量增量预测的家犬,类似于含有FERMAB023184和PDZ结构域的1(LOC481614),mRNA预测的家犬,类似于claudin6CR614114(LOC4卯048),mRNA预测的人类,类似于核糖体蛋白XM—499342S27(LOC442598),mRNA人类Kazal类型丝氨酸蛋白酶抑制NM—001001剂5-样2(SPINK5L2),mRNA325预测的家犬,类似于pummo同源AK093847物2,转录物变体6(LOC607618),mRNA预测的家犬,类似于含有FYVE-BCi06940指的Rab5j支应蛋白rabenosyn-5(LOC484642),mRNAAJ222700TSC-22蛋白的人类mRNA人类假定LOC387790AK095089(LOC387790),mRNA预测的家犬,类似于FLJ20859蛋AKI55096白同种型2(LOC475396),mRNA预测的家犬,类似于染色质-特异NM_007192性的转录延伸因子大亚基,转录物变体1(LOC612874),mRNA预测的家犬,类似于含有亮氨酸NM一l44999富集重复序列的45(LOC483375),mRNA预测的牛,类似于11型肌醇-1,4,5-ACO05691三磷酸5-磷酸酶前体(磷酸肌醇5-磷酸酶)(5PTase)(75kDa肌醇多确酸-5-裤酸酶)(LOC538291),部分mRNA人类cDNA克隆IMAGE:4456146,BC024645部分cds人类溶质载体家族20(磷酸运载AF170802体),成员2(SLC20A2),mRNA来自2的人类BAC克隆AC016673RP11-17N4,完整序列DaniorerioPOU结构域,类4,转录AL138810因子1,mRNA(cDNA克隆MGC:77341IMAGE:6967996),完整cds预测的家犬,类似于含有普列克AL132640底物蛋白同源性结构域的,家族H(具有MyTH4结构域)成员1(LOC480363),mRNA预测的家犬,类似于血管生成素-AC010323样4蛋白(LOC476724),mRNA人类mRNA;cDNADKFZp434C136AL133026(来自克隆DKFZp434C136)92CLACfa.13221.1.增量Al—atCLACfa.13649.1.减量Al—s一atCLACfa.13707.1.减量Al—atCLACfa.13930.1.减量Al—atCLACfa.14103.1.减量Al_atCLACfa.15679.1.增量Al—atCLACfa.19017.1.增量SI—atCLACfa.1935.1.A减量1—atCLACfa.20000.1.增量Sl一s一atCLACfa.20451.1.增量SI—atCLACfa.21599.1.增量SI—s—atCLACfa.2308.1.A增量1—atCLACfa.2586.1.S增量1—atCLACfa.3584.1.S增量l—s—atCLACfa.4761.1.S增量l一atCLACfa.4817.1.A减量l一atCLACfa.5394.1.A减量1—atCLACfa.5400.1.A减量1—atCLACfa.5759.1.A增量1at染色体Xq26.3-27.3上的来自克隆AL137840RP11-241012的人DNA序列含有1个新基因,完整序列预测的家犬,类似于钠-和氯化物-AK074468依赖性的运载体XTRP2(溶质载体家族6成员18)(LOC478631),mRNA预测的牛,类似于Ssu72RNA聚BC008070合酶IICTD磷酸酶同源物,转录物变体2(LOC614837),mRNA构巢曲霉FGSCA4假定蛋白AL031779(AN0430.2),mRNA拟南芥克隆RAFL15-15-K01AC09卯53(R20657)推定的细胞色素P450(Atlgl3150)mRNA,完整cds预测的家犬,类似于C10C5.4BC039170(LOC607282),mRNA预测的家犬,类似于CG5537-PA,AL137013转录物变体2(LOC480960),mRNA预测的家犬假定LOC481916AL590440(LOC481916),mRNA预测的家犬,类似于精子-相关的AC021754阳离子通道2同种型1(LOC609008),mRNA小鼠泛素-样4,mRNA(cDNA克隆AC012153MGC:19132IMAGE:4215699),完整cds预测的家犬,类似于平滑肌肌球BC040721蛋白重链ll同种型SMl-样,转录物变体3(LOC474586),mRNA小鼠piwi-样4(果蝇)(Piwil4),AC108065mRNA人类CDC14细胞分裂周期14同AY675321源物B(酿酒酵母)(CDC14B)基因,完整cds家犬促性腺素-释放激素受体NM—000406(GNRHR),mRNA预测的牛,类似于含有GATA锌AK125974指结构域的2A,转录物变体6(LOC508384),mRNA小鼠去氧肾上腺素NPHS1(Nphsl)AC024166基因,部分cds爪蟾MGC80410蛋白,mRNAAC012618(cDNA克隆MGC:80410IMAGE:5155047),完整cds人类谷胱甘肽过氧化物酶6(ol因子AY324826y)(GPX6),mRNA人类成纤维细胞生长因子5AC006441(FGF5)基因,完整cdsCLACfa.5949.1.A增量l—x—atCLACfa.6989.1.A减量1—atCLACfa.7584.1.A减量1—atCLACfa.7855.1.A增量1atCLACfa.8008.2.A增量1atCLACLACLACLACXACLACLACLACfa.8798.1.A1—atCaAffx.10853.1.SI—atCfaAffx.1228.1.S1—atCfaAffx.1321O.l.Sl—s—atCfaAffx.13599.1.SI—atCfaAffx.13793.1.SIatCfaAffx.18214丄Sl一s—atCfaAffx.18414.1.SIat增量增量减量增量减量减量CLACfaAffx.1700增量3丄S1sat增量减量CLACfaAffx.1892减量2.1.Sl一atCLACfaAffx.2416增量9.1.SIatCLACfaAffx.2467增量5.1.SIxat小鼠RIKENcDNA2500001K11基AC009230因(2500001KllRik),mRNAKIAA0297基因的人mRNA,部分AL589763cds家犬forssman合成酶mRNA,完整AC091826cds预测的家犬,类似于FKBP12-雷AL162595帕霉素复合物-相关的蛋白(FK506-结合蛋白12-雷帕霉素复合物-相关的蛋白l)(雷帕霉素靶蛋白)(RAPT1)(雷帕霉素的哺乳动物靶物)(MTOR),转录物变体2(LOC478232),mRNA预测的家犬,类似于激活Rap/RanGAP结构域-样1同种型1(LOC490653)的GTP酶,mRNA拟南芥Atlg50920mRNA序列预测的家犬cOR2AGl嗅觉感受器家族2亚家族AG-样(cOR2AGl),mRNALIM-同源结构域蛋白Lhx8的人类基因,部分cds人类嗅觉感受器,家族6,亚家族C,成员6(OR6C6),mRNANicotianabenthamiana克隆6-272未知的mRNA预测的紫色球海胆,类似于脱嘌呤/脱嘧咬内切核酸酶(44.7kD)(apn-l)(LOC592745),mRNA预测的家犬,类似于辅肌动蛋白,a2,转录物变体11(LOC479191),mRNA预测的家犬互补序列组分受体2(CR2),mRNA预测的家犬,类似于细胞色素P45024A1,线粒体前体(P450-CC24)(维生素D(3)24-鞋化酶)(1,25-二幾基维生素D(3)24-羟化酶)(24-OHase)(LOC485935),mRNA预测的家犬,类似于张力失常2,U18799扭转(常染色体隐性)(LOC488341),mRNA小鼠溶质载体家族6(神经递质运U76343载体,GABA),成员13,mRNA(cDNA克隆MGC:1卯82IMAGE:4195373),完整cds预测的家犬,类似于在非转移性BC000293细胞1中表达的,蛋白(NM"A)(核94AL137818AC007269AC090440AP002762NM—001005493NAAL391114CR593118AK223627S67623CLACLACfaAffx.2488.1.S1—atCfaAffk.29768.1.SIsat增量增量CLACfaAffx.4438增量.1.S1—atCLACfaAffic.6670增量.1.S1—atCLACfaAffic.7326减量.l.Slsat苦二磷酸激酶)(LOC611984),mRNA预测的家犬假定蛋白LOC612694AL583806(LOC612694),mRNA预测的家犬,类似于三分基序蛋BX255925白32(预测的)(LOC491233),mRNA预测的家犬,类似于含有FERMAB023184和PDZ结构域的1(LOC481614),mRNA预测的家犬,类似于^f效管有关的BC009972一氧化物酶,calponin和含有LIM结构域的1(LOC481958),mRNA预测的家犬,类似于富含F-框和NM—145032亮氨酸的重复序列蛋白13(LOC609997),mRNA实施例3可以用作胖和瘦动物的分类预测物的在胖和痩动物血液中差别表达的基因为了筒化临床和科学分析,并消除对使用固体组织样品的需要,所需固体组织样品必须从活动物活组织检查,可以从胖和瘦狗得到血液样品,并用于开发可以用于区分胖和瘦动物的"分类预测物"。分类预测是一种模式识别形式,其包含使用本领域技术人员熟悉的监督学习算法(例^口,WeightedVoting、ClassNeighbors、K-NearestNeighbors禾口SupportVectorMachines),以定义一组可以识别和区分2组或2类动物的基因或基因产物。开发分类预测物通常包含下述步骤训练步骤在该步骤中,使用两个明确定义的动物组或类(例如胖和瘦动物)来训练算法,以识别和区分它们。该步骤会产生基因的"分类预测物,,集合。一旦建立并验证了基因和/或基因产物的"分类预测物"组,它可以用于分类新的和未知的样品(在它们可利用时)。验证或测试步骤然后使用不同于在训练步骤中使用的样品的新样品,并允许算法使用它在训练步骤中已经学习到的知识来预测每种新样品所属的类,测试分类预测物的区分两个组的能力。95在我们的使用胖和瘦动物的研究中,根据本文上面提供的方法,使用Affymetrix犬-2GeneChip来测量从动物采取的血样中的基因表达水平,它们被常规地鉴别为临床上胖的(28只动物具有4或5的身体状况评分)或瘦的(12只动物具有2或2.5的身体状况评分)。GeneChip数据然后用于训练在软件程序GeneSpring(7.2版,AgilentTechnologies)中包含的训练算法(SupportVectorMachines),以产生分类预测物。因此,数据指示出65个表现出在胖和痩样品之间的差别表达水平的探针,"p"值为0.01(在应用假发现率校正后)(参见表8)。在表9中提供的RMA标准化的数据指示着与瘦动物相比在胖动物中的表达的倍数变化的强度,所以大于1的值指示着该基因在胖动物中增量调节,1的值指示着与痩动物相比在胖动物中的表达没有变化,小于1的值指示着该基因在瘦动物中的表达比胖动物强。因而,本文预见到这些探针和它们代表的基因和基因产物可以潜在地用作分类预测物,使用血样来鉴别胖和瘦动物,不需要使用脂肪组织样品。表8:代表可以使用血样来替代脂肪组织样品用作胖和瘦动物的分类预测物的基因的Affymetrix探针Affymetrix纟笨4十标识基于BLAST序列相似性的最高注解预测家犬,类似于a-synuclein同种型NACP140;转录物变1Cfa.l0128.1.Al一at体3(LOC478478);mRNA预测家犬,类似于ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白3;2Cfa.l0772.1.Al一at转录物变体5(LOC474477);mRNA3Cfa.11444.1.Al-_at人类dkl癌基因;完整cds预测家犬,类似于泛素C-末端水解酶UCH374Cfa.ll52.1.Al一s—at(LOC478958);mRNACfa.ll624.1.Al一at预测家犬,类似于4见黄醛结合蛋白1(LOC479039);mRNA预测家犬,类似于含有巻曲螺旋-螺旋-巻曲螺旋-螺旋结构域6Cfa.l3515.1.S1—匿at的蛋白3;转录物变体5(LOC607574);mRNA"7Cfa.l3669.1.A1.—at没有可得到的注解猩猩mRNA;cDNADKFZp468H0312(来自克隆8Cfa.l5521.1.Al—atDKFZp468H0312)预测家犬,类似于NADH脱氢酶(泛醌)1a亚复合物;11;9Cfa.l6699.1.S1—一s一at14.7kDa;转录物变体1(LOC476735);mRNA预测家犬,类似于ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白3;10Cfa.l7093丄S1—_at转录物变体2(LOC474477);mRNA11Cfa.l8024.1.S1—_s—at预测家犬,类似于MAK31-样蛋白(LOC479488);mRNA12Cfa.l945.1.A1—;at没有可得到的注解13Cfa.l9577.1.Sl_—at预测褐鼠,类似于假定蛋白FLJ25439(LOC502510);mRNA14Cfa.273.3.Alsat预测家犬,类似于NADH脱氢酶(泛醌)1(3亚复合物8;转96录物变体1(LOC477798);mRNA15Cfa.3698.1.A1—at家犬血管紧张素II类型2受体mRNA;部分cds16Cfa.3895.1.A1—s—at家犬Sec61p亚基(Sec61b);mRNA预测家犬,类似于NADH脱氢酶(泛醌)Fe-S蛋白6;13kDa17Cfa.4245丄S1—s—at(NADH-辅酶Q还原酶)(LOC478629);mRNA预测牛,类似于mal;T-细胞分化蛋白-样(LOC512289);18Cfa.4779.1.A1—atmRNA19Cfa.5440.1.A1—atMagnaporthegrisea70-15假定蛋白(MG04641.4)部分mRNA预测家犬,类似于生长分化因子3前体(LOC477702);20Cfa.5628.1.A1—s—atmRNA预测家犬,类似于甘油醛-3-磷酸脱氢酶(LOC481027);21Cfa.5672.1.A1—s—atmRNA人类mRNA;cDNADKFZp761M0111(来自克隆22Cfa.583.1.S1—atDKFZp761M0111)23Cfa.6307.1.A1—s—at预测家犬,类似于早老素增强子2(LOC476479);mRNA24Cfa.6307.1.A1—x—at预测家犬,类似于早老素增强子2(LOC476479);mRNA预测家犬,类似于脂联素受体2;转录物变体2(LOC477732);25Cfa.7730.1.Al一atmRNA预测家犬,类似于含有Kelch重复序列和BTB结构域的蛋白10(Kelch有关的蛋白l)(Kel-样蛋白23)(Sarcosin);转录物26Cfa.8497.1.Al一at变体3(LOC478784);mRNA预测家犬,类似于MADS盒转录增强子因子2;多肽C(肌27Cfa.卯73.1.A1—s—at细胞增强子因子2C);转录物变体30(LOC479155);mRNA28Cfa.9519.1.A1—at人类(人)胎儿脑的全长cDNA克隆CS0DF038YH13预测家犬,类似于溶质载体家族5(碘化物运载体);成员829CfaAffe.l1304.1.SI——at(LOC482626);mRNACfaAffx.l2600.1.Sl_-S—330tTRAM-蛋白的家犬mRNA31CfaAffx.12899.1.S1—at预测牛,类似于嗅觉感受器01r535(LOC510433);mRNACfaAffx.l3068丄Sl一—s一a32t家犬羧肽酶Bl(组织)(CPB1);mRNA33CfaAffiU3084.1.S1—_at小鼠嗅觉感受器MOR232-2基因;完整cdsCfaAffx.l3369.1.Sl—s_a34t预测家犬,类似于竭^C蛋白T(LOC612992);mRNA35CfaAffx.13927.l.Sl一—at预测家犬,类似于CG10510-PA(LOC477622);mRNACfaAffx.l3999.1.Sl一s一a预测家犬,类似于跨膜9超家族蛋白成员3前体;转录物变36t体5(LOC612786);mRNACfaAffx.14593.1.SI—_S—3预测家犬,类似于chromodomain螺旋酶DNA结合蛋白6;37t转录物变体1(LOC477230);mRNACfaAffx.16220.LSl—_s—a预测家犬,类似于跨膜4-结构域;亚家族A;成员6A同种38t型2(LOC612553);mRNACfaAffic.16368.1.SI——s一a39t信号识別蛋白受体的犬mRNACfaAffx.17233.1.SI_s—a40t预测家犬,类似于泛素-缀合酶E2G2(LOC611581);mRNA41CfaAffx.l8688.1.S1._at预测家犬假定蛋白LOC609372(LOC609372);mRNACfaAffx.l9132.1.Sl_s—a42t预测家犬,类似于uroplakin2(LOC610673);mRNA预测家犬,类似于YTH结构域蛋白1(与癌症推定自身抗原-1同源物有关的皮肌炎)(DACA-1同源物)(LOC485968》43CfaAffx.19769.1.SIatmRNA9744CfaAffic.20665丄S1—atCfaAffic.20740丄S1—s—a45t—46CfaAffx.2I676.1.Sl_at47CfaAffic.2327.1.S1—s—at48CfaAffx.23835丄S1—atCfaAffx.24356.1.S1—s一a49t50CfaAffx.24849.1.Slat51CfaAffe.25142.1.Slsa52CfaAffx.25751.1.Sl一atCfaAffx.26483.1.S1—s一a53tCfaAffx.28078.1.S1—s一a54t一55CfaAffx.28164.1.S1—at56CfaAffx.2860.1.S1—s—at57CfaAffx.28798.1.S1—atCfaAffx.29250丄S1—s一a58t59CfaAffx.32063.1.Slat60CfaAffx.360.1.Sl_s—at61CfaAffx.3860.1.S1—s—at62CfaAffk.604.1.Sl_at63CfaAffx.6669.LSl—at64CfaAffx.7079.1.SIat预测家犬,类似于含有修饰的结构域的1;转录物变体l(LOC491775);mRNA预测家犬,类似于解聚素和金属蛋白酶结构域23前蛋白原;转录物变体2(LOC607871);mRNA预测家犬,类似于铁蛋白轻链(铁蛋白L亚基)(LOC491829);mRNA预测家犬,类似于ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白3;转录物变体5(LOC474477);mRNA人类钙粘蛋白原15(PCDH15);mRNA预测家犬,类似于生长激素诱导型跨膜蛋白(真皮乳头衍生的蛋白2);转录物变体3(LOC479266);mRNA预测家犬,类似于嗅觉感受器7A5(嗅觉感受器TPCR92)(LOC610545);mRNA预测家犬,类似于肾钠-依赖性的磷酸盐运输蛋白2(钠/磷酸盐协同转运蛋白2)(Na(+)/Pi协同转运蛋白2)(肾钠-磷酸运输蛋白2)(肾Na(+)-依赖性的磷酸盐协同转运蛋白2);t食蟹猴脑cDNA;克隆:QflA-12135;类似于人妊娠素和adipoQ受体家族成员VI(PAQR6);mRNA;NM—024897.2家犬非转移性细胞2;在(NME2)中表达的蛋白(NM23B);mRNA预测家犬,类似于CD27-结合(Siva)蛋白同种型1(LOC612693);mRNA预观'J:家犬,类似于泛素-缀合酶E2A(泛素-蛋白连接酶A)(泛素载体蛋白A)(HR6A)(mHR6A)(LOC492095);mRNA预测家犬,类似于含有巻曲螺旋-螺旋-巻曲螺旋-螺旋结构域的蛋白3;转录物变体2(LOC607574);mRNA预测家犬,类似于发作相关的基因6(LOC491175);mRNA预测家犬,类似于CG4646-PA(LOC479563);mRNA没有可得到的注解预测家犬,类似于ADAMDEC1前体(解聚素和金属蛋白酶结构域-样蛋白decysin1)(ADAM-样蛋白decysin1)(LOC608742);mRNAKIAA1045蛋白的人类mRNA;部分cds预测家犬,类似于锌指蛋白91(HPF7;HTF10)(LOC484590);mRNA预测预测预测家犬,类似于孕酮膜结合蛋白(LOC476084);mRNA家犬TATA-框结合蛋白(LOC475040);mRNA家犬,类似于线粒体核糖体蛋白L48同种型165CfaAffx.9326丄Sl丄at(LOC476812);mRNA表9与瘦动物相比在胖动物中的分类预测物基因集合表达值基因与瘦动物相比在胖动物中的倍数变化Cfa.lOm.l.Alat1.178Cfa.l0772.1.Alat0.673Cfa.ll444.1.Alat1.167Cfa.ll52.1.Alsat0.68298<table>tableseeoriginaldocumentpage99</column></row><table>CfaAffx.28798.1.Slat1.066CfaAffic.29250.1.Slsat0.789CfaAffx.32063.1.Slat1.16CfaAffic.360.1.Slsat1.141CfaAffk.3860.1.Slsat1.163CfaAffii.604.1.Slat1.154CfaAffk.6669.1.Slat0.816CfaAffx.7079.1.SIat0.709CfaAffe.9326.1.Slsat0.794实施例4含有更高量的长链脂肪酸的饮食会促进体重减轻,且可以用于改编动物的基因表达,所以它会反映变瘦和潜在地维持瘦度的倾向从上面讨论的体外成分筛选得到的数据表明,有些富含长链脂肪酸的成分(参见表7)可能具有以促进动物整体的瘦度的方式影响参与脂肪代谢的基因的表达的潜力。这可以使用常规的计算机算法分析,通过分析从脂肪组织和上面讨论的成分测定得到的数据来测定。可用于这方面的算法的代码是本领域技术人员熟知的,且可以不经过过度实验来开发。下面提供了这样的代码的一个实例SELECTA.PROBE,TO—CHAR(AVG(DECODE(AEXPTDAY,'DO',GENE—NORM—INT,null))/AVG(DECODE(A.EXPTDAY,'D14',GENE—NORM—INT,null)),'99999.99999')FATLEAN—FC,STATS—T—TEST—INDEPU(A.EXPTDAY,GENE—NORM—INT)P—VALUE,B.TOPHITDEF,COUNT(DIS頂CTC.INGREDIENT),COUNT(DISTINCTD.INGREDIENT)FROMGERIATRICS—RNRM2A,TOP—PROBE—ANNOT2—3B,FILT—INDIV—CELLS—2C,FILT—ACROSS—4—CELLS—2DWHEREA.PROBE=B.PROBEANDA.PROBE=C.PROBE(+)ANDA.PROBE-D.PROBE(+)ANDUPPER(A.PROBE)NOTLIKE'AFFX%'GROUPBYA.PROBE,B.TOP一HIT一DEFHAVINGSTATS—T—TEST—INDEPU(A.EXPTDAY,GENE—NORM—INT)<=.01ANDAVG(DECODE(A.EXPTDAY,'DO',GENE—NORM—INT,null))/AVG(DECODE(A.EXPTDAY,'D14',GENE—NORM一INT,null))>=5ANDSUM(DECODE(PAMCALL,'P',1,0))=40ORDERBYPROBE为了证实在喂狗的饮食中包含亚麻酸或EPA/DHA(1.5:1)确实会影响狗的体重减轻,开发了3种高蛋白饮食,它们不含有添加的长链脂肪酸(饮食A)或含有添加的亚麻酸(基于100%干物质基础是约1%,饮食B)或EPA/DHA(1.5:1,约0.30%:0.20%)(饮食C),用于与已知会诱导狗的体重减轻的高纤维饮食相比较。在该研究中,在开始实验之前,45只临床上的胖狗都首先饲喂营养完整的对照饮食30天。在初期30天后,将狗随机分成4组。4组中的3组接受实-验饮食之一,一组接受作为对照的高纤维饮食一段时间,例如,4个月。结果表明,3种实验食物(饮食A、B和C)具有比高纤维食物明显更高的消化率。结果也表明,约38%的消耗含有EPA/DHA的食物的狗在90天时达到它们的体重减轻目标。令人感兴趣地,消耗EPA/DHA食物的狗也维持痩肌肉质量和骨矿物质含量。结果也表明,至少在临床水平,含有EPA/DHA的饮食可以象高纤维饮食一样有效地影响体重减轻。为了验证分类预测物探针集合和测试它的预测动物的胖度或瘦度的能力,将分类预测物探针集合(上面实施例3所述)应用于从参与上述实验的45只动物得到的基因表达数据(表达数据未显示)。分类预测物分析证实,45只动物中的41只(约卯%)在实^r开始时指定为"胖,,的动物事实上肥胖(差异可能是由于目前在临床上使用的常规身体状况评分系统的主观性质)。令人感兴趣地,饲喂上述4种饮食14天后,分类预测物分析指示着所有动物都表现出"瘦,,基因表达,无论饮食如何。在研究结束时,对照高纤维饮食的所有动物似乎都反映出"胖"基因表达,约25。/。的实验饮食A和B的动物反映出生化"瘦"基因表达,约40%101的饲喂含有EPA/DHA的饮食C的动物表现出生化"瘦"基因表达(参见表10)。表10:通过65-探针分类预测物预测的瘦动物近似百分比<table>tableseeoriginaldocumentpage102</column></row><table>实施例5可能的体重减轻维持实验基于上面讨论的体重减轻实验的结果,假设与饲喂其它实验和对照高纤维饮食的动物相比,饲喂含有EPA/DHA的々欠食的动物不仅体重减轻,而且会维持减轻更长的时间段。为了表征饮食A、B和C和高纤维饮食对体重减轻维持的影响,可以进行例如下述类型的实^^:可以给胖动物饲喂4种不同的饮食(如实施例4所述),直到它们达到最佳"瘦度"水平。然后可以将它们随机分成小组,继续饲喂与以前相同的实验饮食,或转换成营养平衡的、但是没有设计成诱导或维持体重减轻且不包含可察觉量的亚麻酸或EPA/DHA等的维持饮食。然后观察动物一段时间,例如,多达3个月,每天记录它们的体重,每周测定它们的身体状况评分,并使用常规的DEXA技术每月测定它们的身体脂肪百分比。权利要求1.一种组合,其包含(a)两种或多种选自SEQIDNO1-295或其有用变化的多核苷酸,或(b)通过表达两种或多种选自SEQIDNO1-295或其有用变化的多核苷酸而生成的两种或多种蛋白。2.权利要求1的组合,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:1-70或其有用变化。3.权利要求1的组合,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:l-25或其有用变化。4.权利要求l的组合,其中所述多核苷酸选自在表2中鉴别的SEQIDNO或其有用变化。5.权利要求l的组合,其中所述多核苷酸选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化。6.权利要求l的组合,其中所述多核苷酸是犬多核苷酸。7.—种组合物,其包含适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的两个或多个探针,所述探针包含(a)选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核普酸;或(b)多肽,其特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸而生成的蛋白。8.权利要求7的组合物,其中所述多核苷酸选自SEQIDN〇:l-70或其有用变化。9.权利要求7的组合物,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:l-25或其有用变化。10.权利要求7的组合物,其中所述多核苷酸选自在表2中鉴别的SEQIDNO或其有用变化。11.权利要求7的组合物,其中所述多核苷酸选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化。12.权利要求7的组合物,其中所述多核苷酸是犬多核苷酸。13.—种装置,其适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的多种基因的表达,该装置包括基质,所述基质具有多个在已知位置添附到基质上的探针,所述探针包含(a)选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸;或(b)多肽,其中的每一种多肽特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核普酸而生成的蛋白。14.权利要求13的装置,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:1-70或其有用变化。15.权利要求13的装置,其中所述多核普酸选自SEQIDNO:l-25或其有用变化。16.权利要求13的装置,其中所述多核苷酸选自在表2中鉴别的SEQIDNO或其有用变化。17.权利要求13的装置,其中所述多核苷酸选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化。18.权利要求13的装置,其中所述多核苷酸是犬多核普酸。19.权利要求13的装置,其中所述探针排列成阵列。20.权利要求13的装置,其中所述多肽探针是抗体。21.权利要求20的装置,其中所述抗体是单克隆抗体。22.检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的差别表达的方法,其包括(a)使包含多个选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸探针的组合与样品中的多核苷酸杂交,以形成一种或多种杂交复合物;(b)任选地,使包含多个选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸探针的组合与标准品中的多核苷酸杂交,以形成一种或多种杂交复合物;(c)检测来自样品和任选的来自步骤(b)的标准品的杂交复合物;和(d)比较来自样品的杂交复合物和来自标准品的杂交复合物,其中标准品和样品之间杂交复合物的量的2倍或更高的差异指示着样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达。23.权利要求22的方法,其中所述探针选自SEQIDNO:1-70或其有用变化,且倍数差异是2.5或更高。24.权利要求22的方法,其中所述探针选自SEQIDNO:l-25或其有用变化,且倍数差异是3或更高。25.权利要求22的方法,其中所述探针选自在表2中筌别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。26.权利要求22的方法,其中所述探针选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。27.权利要求22的方法,其中所述探针与基质结合。28.权利要求27的方法,其中所述探针是在阵列中。29.权利要求22的方法,其中当尝试响应于脂肪组织调控方案来调控动物脂肪组织的量时,间隔地对动物进行检测,并用于监岸见动物的进展。30.权利要求22的方法,其中所述探针是犬多核苷酸。31.权利要求22的方法,其进一步包括,在杂交之前将样品暴露于测试物质,其中与标准品的比较指示着测试物质是否改变了样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达。32.检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达的方法,其包括0)在允许探针和蛋白之间发生特异性结合的条件下,使包含多个多肽探针的组合与样品中的蛋白反应,其中探针结合的蛋白是通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核普酸来生产的;(b)任选地,在允许探针和蛋白之间发生特异性结合的条件下,使包含多个多肽探针的组合与标准品中的蛋白反应,其中探针结合的蛋白是通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸来生产的;(c)检测样品和任选的来自步骤(b)的标准品中的特异性结合;和(d)比较样品和标准品中的特异性结合,其中标准品和样品中的特异性结合之间的2倍或更高的差异指示着样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达。33.权利要求32的方法,其中所述探针选自SEQIDNO:1-70或其有用变化,且倍数差异是2.5或更高。34.权利要求32的方法,其中所述探针选自SEQIDNO:1-25或其有用变化,且倍数差异是3或更高。35.权利要求32的方法,其中所述探针选自在表2中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。36.权利要求32的方法,其中所述探针选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。37.权利要求32的方法,其中所述探针与基质结合。38.权利要求37的方法,其中所述探针是在阵列中。39.权利要求32的方法,其进一步包括,在脂肪组织调控方案期间,间隔地检测动物中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的差别表达,并通过观察基因表达的变化,测定该方案的有效性。40.权利要求39的方法,其中基因表达的减少指示着动物脂肪组织的减少。41.权利要求32的方法,其中所述探针是犬多肽。42.权利要求32的方法,其进一步包括,在使多肽与蛋白反应之前,将样品暴露于测试物质,其中与标准品的比较指示着测试物质是否改变了样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达。43.测量测试物质对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的影响的方法和筛选测试物质以确定它是否可能用于调控动物脂肪组织的量的方法,其包括(a)通过测量在没有测试物质存在下测试系统中一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸的转录或翻译产物,测定第一表达谱;(b)通过测量在有测试物质存在下测试系统中一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸的转录或翻译产物,测定第二表达谱;和(c)比较第一表达谱和第二表达谱,其中与第一表达谱相比第二表达语变化了2倍或更多,指示着测试物质会影响与瘦动物相比在胖动物中差别表达的多核香酸的表达,且该测试物质可能用于调控动物脂肪组织的量。44.权利要求43的方法,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:1-70或其有用变化,且倍数差异是2.5或更高。45.权利要求43的方法,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:l-25或其有用变化,且倍数差异是3或更高。46.权利要求43的方法,其中所述多核苷酸选自在表2中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。47.权利要求43的方法,其中所述多核苷酸选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。48.权利要求43的方法,其中测定表达谱使用了多种多核苷酸。49.权利要求48的方法,其中所述多核苷酸与基质结合。50.权利要求49的方法,其中所述探针是在阵列中。51.权利要求43的方法,其中从犬得到标准品和测试样品。52.通过权利要求42的方法鉴别的物质。53.预测动物可能变胖或诊断动物为肥胖的方法,其包括,测定与一种或多种痩动物相比在该动物中是否差别表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸,或一种或多种特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸而生成的蛋白的多肽,其中如果比较结果指示着与瘦动物相比多核苷酸或多肽在该动物中差别表达了2倍或多倍,则测定该动物可能变胖或测定为肥胖。54.权利要求53的方法,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:1-70或其有用变化,且倍数差异是2.5或更高。55.权利要求53的方法,其中所述多核苷酸选自SEQIDNO:l-25或其有用变化,且倍数差异是3或更高。56.权利要求53的方法,其中所述多核苷酸选自在表2中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。57.权利要求53的方法,其中所述多核苷酸选自在表3中鉴别的SEQIDNO或其有用变化,且倍数差异是2或更高。58.操作非人动物的基因组或动物基因组的表达的方法,其包括,破坏与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达。59.权利要求58的方法,其中通过"敲除"动物中的内源基因来破坏表达。60.权利要求58的方法,其中通过干扰转录或翻译来破坏表达。61.权利要求58的方法,其中使用用选自SEQIDN〇:l-295或其有用变化的多核苷酸构建的多核苷酸来破坏表达。62.使用权利要求58的方法生成的转基因动物。63.适用于操作动物的基因组的组合物,其包含一种或多种物质,所述物质干扰与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达。64.权利要求63的组合物,其中所述物质是反义分子或siRNA。65.权利要求63的组合物,其中所述物质是使用选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸构建的多核苷酸。66.调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的方法,或调控动物脂肪组织的量的方法,其包括,给动物施用基因表达或组织调控量的组合物,所述组合物包含DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一种或多种。67.权利要求66的方法,其中DHA的施用量为约1至约30;EPA的施用量为约1至约30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的施用量为约4/2至约30/45;ALA的施用量为约10至约100;LA的施用量为约30至约600;ARA的施用量为约5至约50;SA的施用量为约3至约60,都按mg/kg/天计算。68.权利要求66的方法,还包括给动物施用一种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质。69.适用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达或调控动物脂肪组织的量的组合物,其包含基因表达或组织调控量的DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一种或多种。70.权利要求69的组合物,其包含的DHA的量足以施用给动物约1至约30;EPA的量足以施用给动物约1至约30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的量足以施用给动物约4/2至约30/45;ALA的量足以施用给动物约10至约100;LA的量足以施用给动物约30至约600;ARA的量足以施用给动物约5至约50;SA的量足以施用给动物约3至约60,都按mg/kg/天计算。71.权利要求69的组合物,还包含一种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质。72.筛选用于包含在一个或多个组中的动物的方法,其包含测定下述物质在动物中的表达语(a)选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸,或(b)多肽,其中的每一种多肽特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸而生成的蛋白,并基于表达谱将动物分配到组中。73.权利要求72的方法,其中所述组是瘦和胖组,基于与标准品相比2倍或更多倍的差别表达将动物分配到胖组,基于与标准品相比小于2倍的差别表达将动物分配到瘦组。74.计算机系统,其适用于操作关于与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的数据,该系统包含,含有信息的数据库,所述信息可以鉴别瘦动物和/或胖动物中一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸表达水平、和/或特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核苷酸而生成的蛋白的多肽的表达水平;和与数据库交互作用的用户界面。75.生产适用于检测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的抗体的方法,其包括(a)在引发抗体反应的条件下,用通过表达一种或多种选自SEQIDNO:l-295或其有用变化的多核香酸而生产的多肽免疫动物;(b)分离动物抗体;和(c)用多肽筛选分离的抗体,从而鉴别出特异性地结合多肽的抗体。76.分离的和纯化的使用权利要求75的方法生成的抗体。77.试剂盒,其适用于测定测试系统中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的差别表达,该试剂盒包含,在单个包装中的分离的容器中或在虛拟包装中的分离的容器中的、与用途和试剂盒组分相适宜的、两个或多个适用于;^企测与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达的探针,所述探针包含(a)选自SEQIDN〇:l-295或其有用变化的多核苷酸,或(b)多肽,其特异性地结合通过表达一种或多种选自SEQIDNO:1-295或其有用变化的多核苷酸而生成的蛋白,和下述的至少一种(1)关于如何使用本发明的探针的说明书;(2)使用探针必需的试剂和仪器;(3)适用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的组合物;(4)适用于破坏与痩动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的组合物;(5)适用于调控动物脂肪组织的量的食物组合物;和(6)—种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质。78.权利要求77的试剂盒,其中所述探针与基质结合。79.权利要求78的试剂盒,其中所述探针是在阵列中。80.权利要求77的试剂盒,其中所述组合物包含DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一种或多种。81.用于交流信息或说明的工具,所述信息或说明是关于下述(l)至(13)中的一种或多种(1)使用本发明的多核苷酸,检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的表达,(2)使用本发明的多核苷酸,测量测试物质对与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的影响,(3)使用本发明的多核苷酸,篩选测试物质以确定它是否可能用于调控动物脂肪组织的量,(4)使用本发明的多核苷酸,预测动物可能变胖或诊断动物为肥胖,(5)使用本发明的多核苷酸,操作非人动物的基因组或动物基因组的表达,(6)使用本发明的多核苷酸,调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达或调控动物脂肪组织的量,(7)使用本发明的多核苷酸,筛选用于包含在一个或多个组中的动物,(8)使用本发明的多核苷酸,使用计算机系统操作关于与瘦动物相比在胖动物中差别表达的基因的数据,(9)单独地或与本发明的其它要素组合地,给动物施用本发明的物质,(10)使用本发明的物质,调控动物脂肪组织的量,(11)使用本发明的计算机系统,(12)使用本发明的试剂盒,和(13)使用本发明的方法和组合物以及一种或多种调控动物脂肪组织的量的药物或其它物质,该工具包含含有信息或说明的文件、数字存储介质、光存储介质、声音呈现或视觉显示。82.权利要求81的工具,其选自显示网站、视觉显示、报摊、小册子、产品标签、包装说明、广告、传单、公告、录音磁带、录像带、DVD、CD-ROM、计算机可读芯片、计算机可读卡、计算机可读盘、计算机内存或它们的组合。83.表1的多核苷酸数据在生产用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的组合物中的应用。84.表8和表9的分类预测物数据在生产用于调控与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的表达的组合物中的应用。85.表1的多核苷酸数据在生产用于诊断动物的身体状况评分的试剂盒中的应用。86.表8和表9的分类预测物数据在生产用于诊断动物的身体状况评分的试剂盒中的应用。全文摘要本发明公开了一种组合,其包含与瘦动物相比在胖动物中差别表达的两种或多种多核苷酸,或通过表达这样的多核苷酸生成的两种或多种蛋白。所述组合和基于该组合的探针用于预测动物可能变胖、诊断动物肥胖、筛选物质以确定它们是否可用于调控动物脂肪组织的量和检测样品中与瘦动物相比在胖动物中差别表达的一种或多种基因的差别表达。本发明也公开了使用分类预测物基因谱来鉴别胖和瘦动物的方法。文档编号C12Q1/68GK101490276SQ200780015879公开日2009年7月22日申请日期2007年3月2日优先权日2006年3月2日发明者K·G·弗里森,R·M·扬卡,S·B·马拉迪,S·W·K·阿尔-穆拉尼,W·D·舍恩赫尔,高向明申请人:希尔氏宠物营养品公司
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