用于通过质谱法高度多路复用地定量肽类的方法以及用于其的标记试剂的制作方法
【专利摘要】在此披露了对于肽类的多路复用定量有用的同量异位标记试剂组。这些同量异位标记试剂组包括至少两种同量异位标记试剂的一个集合，该集合具有相同标称质量但不同同位素取代以及因此不同精确质量的第一和第二信息基团。这些标记的样品的质谱分析使用能够充分分辨该第一和第二信息基团的离子的质量分析器，如轨道阱质量分析器，来进行。以上说明的试剂组可以提供相对于常规标记试剂组扩展的、在信息离子定量试验中的一定程度的多路复用，从而减少分析所要求的色谱运行的次数并且改进样品处理量。
【专利说明】用于通过质谱法高度多路复用地定量肽类的方法以及用于 其的标记试剂 相关申请的交叉引用 本申请要求于2012年10月5日提交的美国临时专利申请系列号61/645, 311 "用于 通过质谱法高度多路复用地定量肽类的方法以及用于其的质量标记（MethodforHighly MultiplexedQuantitationofPeptidesbymassSpectrometryandMassLabels Therefor) "的优先权权益，这个临时专利申请通过引用以其全文结合在此D 发明领域
[0001] 本发明总体上涉及用于利用同量异位质量标记通过质谱法多路复用地定量肽类 的方法，并且更具体地涉及对于提供改进的样品多路复用能力而言有用的一组同量异位质 量标记和使用此类质量标记组的方法。 发明背景
[0002] 同量异位质量标签或标记是一种用于通过质谱法确定跨过多个样品的一种给定 的肽的相对丰度的方法。每个样品，典型地代表一个独特的生物条件，与一种标记试剂的一 个不同的同量异位变体进行反应。将这些样品混合在一起并且通过MS/MS进行分析。当 将一种给定的肽（从所有条件收集的同量异位分子）分离并且碎裂时，从这些不同的标记 试剂产生的信息离子（r印orterions)具有不同的标称质量，这鉴别每种肽的来源并且 允许跨过样品的肽的相对定量。同量异位质量标记试剂组是从赛默飞世尔科技公司以商 品名串联质量标签（TMT)、并且从ABSciex公司以商品名用于相对和绝对定量的同量异 位标签（iTRAQ)可商购的。同量异位质量标签的结构和利用已经广泛地描述于现有技术 专利（参见，例如，Schmidt等人的美国专利号7, 816, 304和Thompson等人的美国专利号 7, 732, 378,这些专利的披露内容均通过引用结合在此）以及科学文献（参见，例如，Ross等 人，"使用胺反应性同量异位标记试剂的酿酒酵母中的多路复用蛋白质定量（Multiplexed ProteinQuantitationinSaccharomycescerevisiaieUsingAmine-reactiveIsobaric TaggingReagents)"，分子与细胞蛋白组学（Molecular&CellularProteomics)， 3 (12)，pp. 1154-1167(2004);和Dayon等人，"使用6路同量异位标签通过MS/MS的人 类脑脊髓液中蛋白质的相对定量（RelativeQuantificationofProteinsinHuman CerebrospinalFluidsbyMS/MSUsing6_PlexIsobaricTags)"，分析化学（Analytical Chemistry)，Vol. 80,pp. 2921-2931 (2008))中。
[0003] 相当多的努力已经投入到增加该同量异位质量标签系统的"多路复用"能力中。例 如，该"六路复用TMT"试剂组具有超过"四路复用iTRAQ"试剂组的额外价值，因为它允许 用户用更少的色谱运行来比较更多的样品。该系统的多路复用能力最终受限于可供用于同 位素取代的同量异位试剂的信息区域中的原子数量和与引入大量的同位素取代相关联的 困难和成本。
[0004] 授予Schaefer的美国专利申请
【发明者】R·A·小格罗斯, J·布雷斯罗 申请人:萨默费尼根有限公司