提供药学信息的在线系统、方法和接口的制作方法

专利名称：：提供药学信息的在线系统、方法和接口的制作方法
技术领域：
：本发明涉及药学(pharmaceutical)产品开发，具体地说，涉及方便药学研究者工作的信息检索系统、方法和软件。
背景技术：
：在过去的半个世纪，医药工业开发了多种药品，对成千上万人的生活质量和健康产生了巨大的影响。该行业的研究人员相互分享见解和资料，经常使用公共和/或专用信息检索服务，经因特网访问研究论文、专利和其它重要信息。本发明者认识到与常规在线药学研究服务有关的一个问题涉及这些服务提供的信息的可访问性和管理。具体而言，许多服务为定义查询、查看搜索结果和提供有关功能提供其独特的用户接口(interface)。口、查询语言等等，而且要保持单独的帐户、密码等等。4因此，例如，对搜索专利和科学论文与财务新闻感兴趣的用户通常要使用三个单独的搜索服务，在三个单独的接口定义和提交三个单独的查询，在三个单独的结果列表中查看文档。另外，任何相关结果扩展到三个服务，使用户要将结果手动收集和组织成集中的方便形式。此外，一个或多个服务可提供用于获得新的或更新信息的一些自动或半自动进程。但是，更新进程相互是完全独立和不同的，这使方便和智能地聚合数据的问题变得更复杂。相应地，本发明者认识到需要提供跨不同信息资源执行药学研究的更佳方式。
发明内容为解决此需要和/或其它需要，除其它之外，本发明者设计了信息检索系统、方法和软件，允许用户定义和选择性显示包括多个同时显示portlet的两个或更多个药学研究网页，这些portlet包含了来自诸如专利、科学和财务数据库等单独数据库的信息。另外，系统允许用户单独配置每个portlet以提供更新的信息，并基于治疗标准同时定义用于两个或更多个portlet的输入或呈现过滤器。示范实施例包括用于以portlet的形式提供多个web服务的在线网站或门户。每个web服务提供一种不同内容类型，可供医药界特定类型知识工作者在每天的工作流中使用。每个portlet向用户推送当前的、新的或一般性知识(以自定义或标准化格式)，并随后提供针对各种类型用途的多个研究应用。一种类型的研究功能称为导引搜索。这是简单搜索格式的预设搜索，允许一般研究员只通过几次击键便执行格式正确的查询。另一个实施例通过各种图形或图表搜索工具提供化学式的可视化。一些实施例包括了解特定用户研究类型和/或从导引搜索概念自动扩展搜索查询的迭代式或语义服务；扩展内容吸引度、自动建议与当前和过去查询有关的新内容，通过支持或沖突研究补充过去的搜索结果，以及突5出显示或标记冲突或补充研究范围；根据功能实现推送概念；诠释空间内部组织/实验室电子笔记本；为药品行业的各种类型用户建立安全、匿名或社会性公共合作空间。图1是对应于本发明一个或多个实施例的在线药学研究系统100的方框图。图2-11是对应于本发明一个或多个实施例，在系统内采用的网页和/或portlet形式的各种图形用户接口复制本。图12另_对应于本发明一个或多个实施例的操作系统100示范方法流程图。具体实施例方式包含上述图形及随附权利要求书的本文档描述发明的一个或多个特定实施例。这些实施例不是限制而只是示范和示教本发明，以充分的细节示出和描述以便本领域的技术人员实现或实践本发明。因此，在适当之处，为避免混淆本发明，描述将忽略本领域技术人员熟知的某些信息。示范信息检索系统图1示出示范在线信息检索系统100，该系统可适用于包含本文所述的功能和/或性能。系统100包括一个或多个数据库110、一个或多个服务器120和一个或多个访问装置130。数据库110包括一组一个或多个专利数据库111、一组一个或多个科学文献数据库112、一组财务数据库113、一组化学数据库114、一组遗传或生物数据库115及一组新闻数据库116和一组其它数据库117。数据库110也可包括本文暗示或明确参考的其它类型数据库和/或数据。数据库110采取一个或多个电子、磁性或光数据存储装置的示范形式，关联。每个索引包括与对应文档地址、标识符和其它常规信息相关联的术语和短语。数据库内的数据以常规方式索引及按治疗类别索引，如癌症、CV/血液、皮肤病、内分泌/代谢、GI/营养、免疫/炎症、感染、肌肉骨骼/生长、神经病学/精神医学、生殖/GU、呼吸、感觉。数据库110经无线或有线通信网络耦合或能够耦合到服务器120，如本地网、宽域网、专用网或虚拟专用网。服务器120,—般代表一个或多个服务器，用于通过相关联的小应程(Applet)、ActiveX控制、远程调用对象或其它有关软件和数据结构，以网页形式或其它标记语言形式向各种"厚度"的服务客户提供数据。更具体地说，服务器120包括处理器模块121、存储器模块122、用户数据库123、主搜索模块124、辅助搜索模块125及用户接口模块126。处理器模块121包括一个或多个本地或分布式处理器、控制器或虚拟机。在示范实施例中，处理器模块121采取任何方便或所需的形式。存储器才莫块122采取一个或多个电子、磁性或光数据存储装置的示范形式，存储用户数据库123、搜索才莫块124、配置才莫块125及页面和portlet管理才莫块126。用户数据库123包括用户有关数据，用于控制、执行和管理账单到期付费或基于订阅的数据库110的访问。在示范实施例中，用户数据库123包括一个或多个首选数据结构，数据结构1231是其代表。数据结构1221包括客户或用户标识符部分1231A，在逻辑上与一个或多个页面和portlet配置首选项(preference)相关联，如首选项1231B、1231C和1231D。首选项1231B包括用户主页名称和对应的配置或定义。例如，在示范实施例中，用户可定义一个、两个或更多个特定的主页，每页包括一组可用内容特定portlet的用户portlet选择。首选项1231C包括用于一组两个或更多个内容特定portlet中每个portlet的portlet配置数据。下面更详细定义的示范portlet配置数据定义了portlet有关参数，如更新频率。首选项1231D包括其它配置数据，例如，影响或控制portlet放置的数据。搜索模块124包括机器可读和/或可执行指令集，以便一个或多个搜索引擎和有关用户接口组件在必要或需要时接收和处理针对一个或多个数据库110的查询，提供主页和portlet指定内容。在示范实施例中，与搜索模块124相关联的一个或多个搜索引擎提供布尔、术语频率-逆文本频率(tf-idf)、自然语言搜索性能。配置模块125包括机器可读和/或可执行指令集，以便一个或多个图形用户接口和其它支持软件允许用户配置和重新配置单独的主页和/或其构成portlet。页面和portlet才莫块126包括用于完全或部分定义诸如一个或多个主页等基于web用户接口的机器可读和/或可执行指令集。在示范实施例中，每个主页包括两个或更多个portlet,并且每个portlet通过无线或有线通信网络向诸如访问装置130等访问装置提供不同的内容类型和/或搜索接口。访问装置130—般代表一个或多个访问装置。在示范实施例中，访问装置130采取的形式为个人计算机、工作站、个人数字助理、移动电话或能够为有效用户接口提供服务器或数据库的任何其它装置。具体而言，访问装置130包括处理器才莫块131(—个或多个处理器(或处理电路))131、存储器132、显示器133、键盘134和图形指针或选择器135。处理器才莫块131包括一个或多个处理器、处理电路或控制器。在示范实施例中，处理器^f莫块131釆取任何方便或所需的形式。存储器132耦合到处理器^t块131。存储器132存储用于操作系统136、浏览器137和图形用户接口(GUI)138的代码(机器可读或可执行指令)。在示范实施例中，操作系统136釆取MicrosoftWindows操作系统某个版本的形式，并且浏览器137采取MicrosoftInternetExplorer某个版本的形式。操作系统136和浏览器137不但接收键盘134和选择器135的输入，而且支持在显示器133上的GUI138显现。在显现时，GUI138将数据与一个或多个交互式控制特性(或用户接口元素)关联呈现。在示范实施例中，每个这些控制特性采取超链接或其它浏览器兼容命令输入的形式，并且提供对具有导航或页面控制区1381和portlet区1382与1383的药学研究主页的访问和控制。(虽然图l示出区1381、1382和1383同时显示，但一些实施例在单独的时间显示它们。)导航区1381包括页面选择特性1381A、portlet控制或过滤特性1381B及页面配置特性1381C。在示范实施例中，页面选择特性1381A允许用户从预定义的主页列表中选择，每个主页具有两个或更多个portlet。一个或多个预定义的主页是基于用户数据库123中用户的配置数据的用户定义主页。Portlet控制特性1381B允许用户同时控制，作为portlet区138的一个方面。例如，在一个实施例中，控制特性基于指定的治疗类别过滤内容，如癌症、CV/血液、皮肤病、内分泌/代谢、GI/营养、免疫/炎症、感染、肌肉骨骼/生长、神经病学/精神医学、生殖/GU、呼吸、感觉。过滤选择特性可使用下拉菜单或单选按钮或复选框组实现。在选择治疗类别时，弹出框会显示，指示被过滤的portlet。在一些实施例中，弹出框允许用户选择过滤或不过滤哪些合格的portlet。点击"确定"后，弹出框会关闭，并且主页会刷新，根据该类别过滤所有适当的portlet。在示范实施例中，最后的治疗类别保持选定，因此，如果用户现在选择另一专业页面，则该页面会根据该最后选定的类别过滤。左边距中选定类别的按钮会突出显示，以提示用户过滤操作。在一些实施例中，过滤只用于当前主页或专业页面，使得选择另一页面将不会自动导致使用最后选定过滤器变量的过滤。视portlet内容而定，根据IDdb指示进行的过滤是直接或"隐式"进行。因此，对于包含药物净艮告的portlet,使用应用到净艮告的IDdb指示术语(治疗区)。对于包含新闻项(即，IDdb提示)的portlet，示范实施例为链接到新闻项的药物或专利使用IDdb指示。另外，"期刊集(Focusedjournals)"已直接编索引。示范实施例提供了可按治疗类别过滤的以下portlet:临床试验观察(ClinicalTrialsWatch)、合作/M&A(Collaborations/M&A)、药物阶段变化(DrugPhaseChanges)、期刊集(FocussedJournals),许可机会(LicensingOpportunities)、新化合物查看器(NewComponudViewer)、新药物(NewDrugs)。下表示出一纟且六个主页或专业页面和定义它们的portlet。专业页面生物学化学临床研许可和商CI大众SPECIALTY(Biolo-(Chemist究业兴趣PAGE(横向)gy)画ry)(Clinic(Licensing(GenerPORTLET(向-al&國al下)Research)Business)interes■t)新化合物查《《看器(NewCompoundViewer)药物(Drugs)《《《《《Thomson选《《《《《定特性(ThomsonselectedFeatures)期刊集《(Focusedjournals)合成方法(Synthetic10<table>tableseeoriginaldocumentpage11</column></row><table>专利公才艮(Patentsgazette)《《突发新闻(breakingnews)承《《《《《图3示出包括三个portlet的示范主页300的一部分新化合物查看portlet、新顺序查看器portlet和特性portlet。一些portlet具有多个部分或多个下拉选项，例如，新药物portlet具有"新药物"和"新更新药物"部分。对于每个部分，适当时只提供术语"未找到结果"。下面的才莫型示出用于新化合物查看器的一个示例。此portlet具有两个部分，并且下面的模型示出未找到任一部分的结果。图4示出示范合成方法portlet,可用于提示用户包含感兴趣的反应数据的新期刊。期刊列表已预定义，并且这些期刊的所有"最新化学反应(CCR)"记录已选定。源于任何选定文章的反应步骤图像将在portlet中从左向右滚动。源于数字的链接将引导用户到"结果摘要页面"。源于滚动反应的链接将引导用户到完整的报告。通过此portlet链接到CCR信息，提供了"化学索引(IndexChemicus)"内的化合物。因此，此portlet将允许用户不但查看反应数据，而且查看反应中涉及的特定化合物。"化学索引"集成到包括在数据库110内的T-Pharma化合物库中。因此，通过"合成方法"portlet查看这些化合物，用户随后将能够经"化学才艮告"(未示出)链接到特定化合物有关的其它内容。图5示出示范"快速结构搜索"portlet,它允许用户在用户定义的一段时间内执行只得到化学报告的匹配搜索或子结构搜索。在一些实施例中，允许其它类型的结果。示范搜索是针对"药学化合物注册"执行。此portlet的内容不根据业务范围或治疗区而变化。在结构框上任意处双击将打开"化学绘图软件包"(例如，ISISDraw),或者将允许用户导入预绘制结构。"活动"链接将引导用户到"作用词典"。该示范实施例使用的活动术语挑选器与剂型搜索页中使用的相同。由于完成了IDDB到DDF到PP到DWPIB部分活动手工代码到IC活动(activity)术语的索引术语映射，因此，单个活动术语允许搜索ThomsonPharma库的所有组成部分。图6示出包括两个区的示范专利公报portlet:"公报头条"和"新专利"。公报头条是"最新专利公报"每周出版转成用于E)db的提示时创建的完整标题列表。这是形成每段标题的阶段；打印的"公^;，本身不提供这些标题。新专利是根据"公报"标准(A-E部分)分类的公报每周出版中的所有专利。还提供的是"公报"每周出版中的专利总数。每次CPG专利数据的新出版可用，并且头条(标题)写入以形成有关IDdb的提示时，portlet内容会默认刷新。专利^^艮portlet配置选项包括确定更新频率和重命名门户。图7示出包括三个专利前景区的示范"专利前景"portlet700的复制本"引用最多的药物作用(TopCitedDrugActions)"、热门治疗区(TopTherapyareas)和"热门专利权所有人(T叩Patentees)，，。引用最多的药物作用和热门治疗区是使用治疗区或作用关键字索引树的顶层创建。如果不止一个索引术语已应用到某个专利，则该专利在索引术语所属的每个区被统计一次。热门专利权所有人M于新专利的专利权受让人。如果某个专利具有多个专利权受让人，则该单个专利为每个专利权受让人统计一次。此portlet的内容将不根据专业页面上的治疗区或业务范围而变化。每次新的索引专利数据(PP/PFA)出版可用时，该portlet内容会默认刷新。图8示出示范药物Portlet800。Portlet800包括两个部分。第一部分将提示用户新药物净艮告。第二部分将提示用户现有药物才艮告的重大更新(即，结构添加或阶段变化)。该portlet内容将根据用户选择的治疗区变化。药物基于使用IDdb作用术语的活动和使用IDdb指示术语的治疗区，才艮才居"编辑"分类。源于此portlet内药物名称的所有链接将引导用户到相关药物才艮告。默认情况下，该portlet的第一部分示出按药物名称字母顺序排序的前三个结果。默认情况下，该portlet的第二部分示出按药物名称字母顺序排序的前五个结果。多个配置选项可用于portlet900(及其它portlet)。例如，用户可选择只收到特定结构、子结构新药物或类似性的提示。备选，用户可选择不按结构限制此portlet的内容。此处所示结构搜索功能将反映在剂型搜索页面上所示的功能。用户可选择将portlet内容限制为在特定治疗区内的新药物。如果用户想在示范实施例中监视两个治疗区，则用户可配置两个单独的portlet。用户可选择限制为不在广泛药物作用(broaddrugaction)区中的新药物。如果用户要这样做，则他们可选择单个高级活动区(作用索引树的顶部术语)。如果用户选择了某个活动区，则用户将可选择该特定活动区的特定作用。用户可选择任意数量的这些作用，或者可选择不限于特定作用。用户可选择将该portlet限于特定公司或特定组公司的新药物。用户可从提供的已提供公司列表中最多选择10个公司。备选，用户可选择不按公司进行限制。用于所有portlet的另一个选项是设置电子邮件提示。图9示出示范"新化合物查看器Portlet)900。此portlet提示用户添加到T-Pharma化合物库的新化合物。新化合物也将作为GIF图像沿portlet底部滚动。此portlet将以周而复始的每周方式显示7天数据。该portlet内容从源于化合物名称的原数据库源(例如，IDdb/DCR/DDF/"化学索引")链接和滚动结构得到，将引导用户到化学报告。用户在某个滚动结构上停止时，该结构将停止滚动。如果用户选择不将portlet内容限于特定治疗区(参见专业页面的左栏)，则默认情况下，portlet将显示前三个结果。显示的优先级为IDdb>PP/PFA>DDF>DCR>"化学索引"。换而言之，如果有所有产品的新化合物，则按字母顺序显示来自IDdb的前三个化合物。如果页没有新IDdb化合物，则按字母顺序显示前三个DDF化合物。(注意，按字母顺序显示不同于屏幕抓图。)根据如上相同标准区分优先顺序的前50个结构将以连续环的方式滚动。如果结构数量少于50,则以连续环的方式滚动所有结构。如果没有结构，则指示"无新化合物"。此portlet的内容可根据用户选择的治疗区变化。如果用户选择了将portlet内容限于特定治疗区，则指示索引用于为内容排序。单击结构(GIF)也将引导用户到"化学报告"(未示出)。用户在某个结构上停止时，该结构将停止滚动。结构从右到左滚动。"全部显示"链接引导用户到新化合物结果的完整列表，即，包含"化学报告"的"列表视图"屏幕(参见搜索结果规格)。默认情况下，列表根据上述用于portlet的相同标准排序。用户在"个性化(Personalise)"区中时，用于portlet配置页面的链^:显示在portlet顶部。用户可选择只收到特定结构、子结构新化合物的提示。备选，用户可选择不按结构限制此portlet的内容。此处所示结构搜索功能将反映剂型搜索页面上所示的功能。用户可选择将portlet内容限制为在特定治疗区内的新化合物。用户不可选择超过一个治疗区。注意，这是指示树上的所有顶部术语列表，而不是在主页上给出的治疗区列表。如果用户想监视两个治疗区，则用户可配置两个单独的portlet。图10示出示范"许可机会(LicensingOpportunities)"Portlet1000。此portlet提供最新的"许可机会提示(LicensingOpportunitiesAlert)"(通过主题"许可机会"选定)，并带有经菜单一次一天查看过去"5天"的选项。如果没有新提示，此门户显示消息"此日期无"许可机会，，项目"。如果一天公布不止一个提示，则所有，，提示"显示在该portlet中。象其它portlet—样，此门户可通过"治疗区"类别过滤。图11示出示范期刊集portlet1100，它显示了关注特定专业的以每两周为基础的新公布期刊。在示范实施例中，包括期刊集portlet的专业主页是"生物"、"化学"、"临床研究"、"大众兴趣"及任15何用户定义的主页。期刊集portlet可配置，以便用户可选择在新文章添加到数据库时他们可收到提示的最多60个期刊。用户能够从所有可用期刊(大约3500个)选择，并且也能够选择时间框以监视从2周到8周之间的新添加内容。用户也可配置此portlet以提供2、4和8周的更新频率。示范操作方法图12示出才喿作系统100的一个或多个示范方法的流程图1200。流程图1200包括方框1210-1240，它们在示范实施例中以连续顺序布置和描述。但是，其它实施例使用多个处理器或处理器类似装置或组成为两个或更多个虚拟机或子处理器的单个处理器，并行执行两个或更多个方框。其它实施例也可变更进程顺序，或者提供不同的功能分区以实现类似的结果。另外，其它实施例还将方框实现为两个或更多个互连的硬件模块，相关控制和数据信号在模块之间和通过模块传送。因此，示范流程适用于软件、硬件和固件实现。方框1210需要呈现药学研究主页。在示范实施例中，这要求用户引导诸如装置130等访问装置的浏览器到服务器120，然后登录到系统。成功登录后，基于web接口的一个或多个部分会从服务器120输出、存储在存储器112中，并由访问装置130显示，如包括两个或更多个portlet的主页139。方框1220需要配置一个或多个portlet。在示范实施例中，这要求在一个或多个portlet中更改更新频率参数或目标公司列表或与数据相关联的其它索引参数。方框1230需要保存具有刚配置portlet的主页。在示范实施例中，这要求通过指示在方框1220中所作更改的配置数据，更新用户信息以i"更^f吏用。方框1240需要过滤在主页的两个或更多个portlet中数据。在示范实施例中，这要求用户选择与两个或更多个portlet中数据相关联的16一个或多个治疗参数，如类别，并修改显示数据以排除不匹配治疗参数的数据。在一些实施例中，选择可用于排除匹配选定参数的数据。结论上述实施例只是为了示出和示教形成和使用本发明的一种或多种方式，而不是限制其广度或范围。涵盖实践或实现本发明示教所有方式的本发明实际范围只由一个或多个发布的专利权利要求书及其等效物限定。权利要求1.一种在线药学研究系统，包括一组两个或更多个数据库，包括专利数据库、科学文献数据库及财务信息数据库；以及服务器，所述服务器经计算机网络可操作地耦合到所述数据库及第一和第二客户访问装置，其中所述第一和第二客户访问装置分别与第一和第二用户相关联，并且所述服务器配置为向所述第一和第二客户访问装置提供第一和第二主页，其中每个所述主页包括至少第一和第二portlet，所述第一portlet配置为接收并呈现来自所述专利、科学文献和财务信息数据库之一的信息，以及所述第二portlet配置为接收并呈现来自所述专利、科学文献和财务数据库中另一个的信息。2.如权利要求1所述的系统，其中所述服务器与包括用于所述相应第一和第二用户的第一和第二首选项的用户数据库在操作上相关联，并且所述第一和第二主页分别根据所述第一和第二首选项配置。3.如权利要求1所述的系统，其中所述服务器配置成为每个所述第一和第二用户提供多个主页。4.如权利要求1所述的系统，还包括与所述服务器相关联的用户数据库，其中所述用户数据库包括用于所述第一和第二用户的第一和第二记录，每个记录在逻辑上将所述记录对应的用户与多个主页标识符相关联，并且每个主页标识符在逻辑上与多个portlet标识符或portlet配置相关联。5.—种方法，包括呈现具有多个药学相关的portlet的主页；从用户接收识别治疗类别的输入；以及响应于识别的治疗类别，〗务改两个或更多个所述药学相关portlet的内容。6.如权利要求5所述的方法，其中所述portlet之一包括专利数据，并且所述portlet中的另一个包括财务数据。全文摘要一种在线药学研究系统包括用于提供用户可配置主页的服务器，每个主页具有用于不同类型药学数据的一组两个或更多个portlet。主页包括治疗过滤技术，允许用户例如基于治疗类别过滤两个或更多个portlet。文档编号G06F17/30GK101490673SQ200780006624公开日2009年7月22日申请日期2007年1月3日优先权日2005年12月30日发明者I·塔申请人:汤姆森环球资源公司