一种免疫组库数据分析方法及终端的制作方法

文档序号:9376069阅读:568来源:国知局
一种免疫组库数据分析方法及终端的制作方法
【技术领域】
[0001]本发明涉及计算机技术领域,尤其涉及一种免疫组库数据分析方法及终端。
【背景技术】
[0002]免疫组库包括个体内的所有特异性不同的T淋巴细胞和B淋巴细胞克隆总和。T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)是特异性识别抗原和介导免疫应答的分子,TCR/BCR的多样性直接反应了机体免疫应答的状态。免疫组库在疫苗和医药的发展、生物标志物的发现、最小残余疾病检测、自身免疫性疾病的研究以及移植后监测等都具有应用价值。在实际应用中,现有的一些平台在对免疫组库数据进行处理时,只能对免疫组库数据做简单序列的识别,不能对免疫组库数据进行更进一步的分析(例如,不能进行V、D和J基因频率分布分析,免疫多样性分析,高克隆CDR3(即互补决定区3)序列频率检验,CDR3长度分布分析,V、D和J基因组合分析,Ig链类型的比例分析和多Ig链类型共同序列分析等),从而不能使用户全面评估免疫组库的状况,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。

【发明内容】

[0003]本发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法及终端,有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。
[0004]本发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法,所述方法包括:
[0005]接收针对第一样本的第一分析指令,所述第一分析指令携带所述第一样本的注释文件,所述注释文件包括所述第一样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、CDR3序列和Ig链的类型,所述第一样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列;
[0006]响应所述第一分析指令,根据所述第一样本的注释文件,生成并输出针对所述第一样本的整体分析图,所述整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。
[0007]本发明实施例还公开了一种终端,所述终端包括:
[0008]接收模块,用于接收针对第一样本的第一分析指令,所述第一分析指令携带所述第一样本的注释文件,所述注释文件包括所述第一样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、⑶R3序列和Ig链的类型,所述第一样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列;
[0009]输出模块,用于响应所述第一分析指令,根据所述第一样本的注释文件,生成并输出针对所述第一样本的整体分析图,所述整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。
[0010]在本发明实施例中,终端将接收针对第一样本的第一分析指令,该第一分析指令携带第一样本的注释文件;终端将响应第一分析指令,根据第一样本的注释文件,生成并输出针对第一样本的整体分析图,该整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。可见,实施本发明实施例有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。
【附图说明】
[0011]为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0012]图1是本发明实施例公开的一种终端防盗方法的流程示意图;
[0013]图2是本发明实施例公开的另一种终端防盗方法的流程示意图;
[0014]图3是本发明实施例公开的另一种终端防盗方法的流程示意图;
[0015]图4是本发明实施例公开的一种终端的结构示意图;
[0016]图5是本发明实施例公开的另一种终端的结构示意图;
[0017]图6为本发明实施例公开的V基因频率分布图;
[0018]图7为本发明实施例公开的D基因频率分布图;
[0019]图8为本发明实施例公开的J基因频率分布图;
[0020]图9为本发明实施例公开的⑶R3的长度分布图;
[0021]图10为本发明实施例公开的免疫多样性分析图;
[0022]图11为本发明实施例公开的Ig链类型比例分布图。
【具体实施方式】
[0023]下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
[0024]本发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法及终端,有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。以下分别进行详细说明。
[0025]请参见图1,图1为本发明实施例公开的一种免疫组库数据分析方法的流程示意图。如图1所示,该免疫组库数据分析方法可以包括以下步骤。
[0026]S101、接收针对第一样本的第一分析指令,该第一分析指令携带该第一样本的注释文件。
[0027]本发明实施例中,终端接收针对第一样本的第一分析指令,该第一分析指令携带该第一样本的注释文件。其中,该终端可包括但不限于智能手机、平板电脑、笔记本电脑、台式电脑等终端。该终端的操作系统可包括但不限于Android操作系统、1S操作系统、Symbian (塞班)操作系统、Black Berry (黑莓)操作系统和Windows操作系统等等,本发明实施例不做限定。
[0028]本发明实施例中,第一分析指令携带第一样本的注释文件,其中,该注释文件包括第一样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、⑶R3序列和Ig链的类型;其中,该第一样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列。
[0029]S102、响应该第一分析指令,根据该第一样本的注释文件,生成并输出针对该第一样本的整体分析图,该整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。
[0030]本发明实施例中,终端接收第一分析指令之后,将响应该第一分析指令,根据该第一样本的注释文件,生成并输出针对该第一样本的整体分析图。
[0031]可选的,终端接收第一分析指令之后,将响应该第一分析指令,根据第一样本的注释文件中包括的V基因种类,生成并输出第一样本的V基因频率分布图;该V基因频率分布图用于指示第一样本包括的各V基因种类所具有的数量,即用于指示第一样本的V基因有哪些种类,各种类的数量有多少。如图6所示,图6为V基因频率分布图。
[0032]可选的,终端接收第一分析指令之后,终端将响应该第一分析指令,根据第一样本的注释文件中包括的D基因种类,生成并输出第一样本的D基因频率分布图;该D基因频率分布图用于指示第一样本包括的各D基因种类所具有的数量,即用于指示第一样本的D基因有哪些种类,各种类的数量有多少。如图7所示,图7为D基因频率分布图。
[0033]可选的,终端接收第一分析指令之后,终端将响应该第一分析指令,根据第一样本的注释文件中包括的J基因种类,生成并输出第一样本的J基因频率分布图;该J基因频率分布图用于指示第一样本包括的各J基因种类所具有的数量,即用于
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