用于鉴定嗜人按蚊的dna条形码标准基因及应用

文档序号:9882407阅读:330来源:国知局
用于鉴定嗜人按蚊的dna条形码标准基因及应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术领域,特别涉及一种用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基 因及应用。
【背景技术】
[0002] 目前,国内外对媒介生物的分类鉴定主要依靠传统的形态学分类手段。该方法主 要针对成虫阶段,对卫生监管实际工作中捕获的其他发育阶段(幼虫、蛹等)的媒介生物则 受到限制;对外部形态相似的近缘种媒介生物的鉴定,形态学分类方法的准确度偏低;另 外,实际工作中经常会采集到不完整的样品,形态学方法对残缺样品的鉴定遇到很多困难。 在口岸检疫工作中,如果截获的是幼虫、卵、蛹等非成虫虫态,通常需要将其培养成成虫后 再进行鉴定,整个检疫鉴定过程时间长达数周,也经常会采集到不完整的样品,形态学方法 对残缺样品的鉴定遇到很多困难,大大地加长了通关周期,影响贸易往来。
[0003] 近代分子生物学技术的兴起,为古老的昆虫学科注入了新的活力。在昆虫学研究 领域,分子生物学技术主要应用于系统演化及分类鉴定两方面。昆虫系统演化的研究是从 分子水平上找出其种间的DNA序列的特异性差异,主要目的为探索昆虫种、属间的相对亲缘 关系,同时也为昆虫的分子鉴定奠定了基础。
[0004] DNA分类是以生物的DNA序列的差异为依据,来区分生物物种并构建全新的分类学 系统(Tautz et al.,2002)。在生物分类中,以DNA序列作为生物物种识别的方法最初应用 于病毒、细菌和原生动物类群的研究中,后来这种方法广泛应用于物种多样性的调查研究 中,并积累了大量的数据和文献。2003年,DNA条形码概念首次提出:鉴定物种就如同使用商 品UPC条形码,使用扫描仪就能识别。它的原理是利用基因组DNA上一段标准的或者大家公 认的基因片段,作为分子靶标来进行种级水平的种类鉴定。DNA条形码序列与整个基因组 DNA相比要短得多,而且非常容易获得。因为C0I基因的通用引物可以很容易获得绝大多数 动物的5'端序列,加拿大圭尔夫大学的学者Hebert等提出利用C0I的特定区段来做DNA条 形编码的基础,用于物种识别(Hebert et al·,2003; Remigio & Herbert, 2003)。理论 上,DNA序列上的每个位点都有A、T、G、C四种可能,45个碱基的序列就可以区分开近10亿个 物种,这远远超过现存物种的总数,即使由于自然选择的原因,某些位点已经被固定,导致 组合数减少一些,但是现代分子技术可以很容易的扩增出几百个碱基的序列,足够区分所 有的物种(肖金花等,2004)。而且DNA序列属于数字信息,方便管理又具有可重复性,易于 交流和联合分析(Hebert et al·,2003)。
[0005] DNA条形码技术为物种的鉴定提供了新的手段,弥补了传统分类的诸多不足。尤其 适用于难以用形态分类特征进行鉴定的幼虫、卵等虫态。利用分子标记进行种类鉴定国际 上已有不少的尝试,国际上第一篇利用DNA条形码进行物种鉴定的是2003年Hebert,随后 Ball等(2005)尝试用分子条形码鉴别了 70多种水生蜉蝣,游中华等(2007)用线粒体⑶I鉴 别了入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马。肖金花等中国卫生检验杂志2011年3月第21卷 第3期Chinese Journal of Health Laboratory Technology,Mar 2011; Vol 21 No 3 615( 2004)综述了线粒体COI片段在物种鉴定方面的独特优点,并指出DNA条形码技术为生 物分类学的新动向。
[0006] 但由于目前DNA条形码数据库中种类不全,缺乏多个物种的标准DNA条形码参考序 列,致使DNA条形码鉴定技术达不到实际应用的目的。
[0007] 嗜人按蚊为疾病的重要传播媒介,不仅对间日疟原虫易感,而对恶性疟原虫也有 较高的易感性,是我国疟疾最主要传播媒介,同时也是马来丝虫病的重要媒介。在人工感染 试验中,它对班氏丝虫意识易感的。在检验检疫工作中,经常会截获的是幼虫、卵、蛹等非成 虫虫态,或者肢体残缺的样品通常需要将其培养成成虫后再进行鉴定,整个检疫鉴定过程 时间长达数周,也经常会采集到不完整的样品,形态学方法对残缺样品的鉴定遇到很多困 难。

【发明内容】

[0008] 本发明的首要目的是克服上述不足问题,提供一种用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形 码标准基因。
[0009] 本发明的另一目在于提供一种用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因的应用方 法。
[0010] 本发明为实现上述目的所采用的技术方案是:用于鉴定嗜人按蚊的DN A条形码 标准基因,其特征在于:所述用于鉴定嗜人按蚊的D N A条形码标准基因的核苷酸序列如 下所示: CGTCCTGACTTCGCCATCGCGGGACACATCTGCTGCTGTTTACTACTTGTCTGTCTTCGCGGCCTTTCAACAC AAGTTCCGAGATGCAAGCGATCGACGAGATCTCTCTTACACCTTTATGCACGACTGTGACGTGGTGACCAGCACCAA TCACTGCGTAATTTTCTGTTTGCCAAACTTCTAATTATAAGCGCTCAAGTATGTGTACGTCATGGAA。
[0011] -种所述用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因的应用,其特征在于:将所述的 用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因应用于鉴定待检标本中。
[0012] 进一步地,所述待检标本为非成虫虫态,残缺不全的虫体或成虫。
[0013] -种利用所述用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因鉴定嗜人按蚊的分子生物 学鉴定方法,其特征在于:包括如下步骤: (1) 提取待检标本的基因组DNA: (2) 使用如下的引物进行PCR扩增,得到PCR产物; 上游引物ACEquin: 5 ' - CCTTCTTGAATGGCTGTGGCA-3 ' ; 下游引物B1246s:5'_ TGGAGCCTCCTCTTCACGG-3' ; (3) 将PCR产物进行电泳分析,如果能扩增出目的条带,则提取该目的条带中的产区进 行测序,如果扩增出的产物没有目的条带,则能排除该待检标本为嗜人按蚊的可能性; (4) 测序得到的结果与所述的用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因的同源性在98% 以上时,则能判断待检标本为嗜人按蚊。
[0014] 进一步地,步骤(1)中所述的待检标本为非成虫虫态、残缺不全的虫体或成虫。
[0015] 进一步地,步骤(2冲所述的PCR的条件为:94°C预变性5min;94°C 30s,50°C 30s, 72°C 2min,35个循环;72°C 延伸2min; 步骤(2)种所述的PCR的体系为:25yL PCR体系:2.5yL lOXbuffer(含Mg2+),2yL dNTPs(2 · 5 mmol/L),上下游引物lyL,Ο · 5yL Taq酶,lyL模板DNA,去离子水定容至25yL; 步骤(2)中所述的PCR在进行时设置阴性对照和阳性对照: 所述的阳性对照为权利要求1所述的用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因或含有 权利要求1所述的用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因的序列; 步骤(3)中所述的目的条带为在分子标记(DNA Marker)240bp条带位置的电泳带,或是 与阳性对照同一位置的电泳带。
[0016] 本发明适应国境口岸卫生检疫工作的实际需要,利用DNA条形码技术,针对嗜人按 蚊,建立一种相对稳定和准确的分子鉴定方法。可以对残缺样品进行鉴定,对嗜人按蚊与其 近缘种能够很好的区分鉴定,对嗜人按蚊非成虫阶段的能够进行准确的鉴定。对提高嗜人 按蚊分类鉴定的准确性、促进卫生监管工作的质量提升具有重要的促进作用。
【附图说明】
[0017] 图1为嗜人按蚊的分子生物学特异性鉴定的PCR产物电泳结果图,图中Μ为 DL2000marker,1 -6为嗜人按蚊基因组DNA。
[0018] 图2为用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因灵敏度实验电泳图,图中由左到 右,每一格为一个浓度,依次是ΠΓ1,ΚΓ 2,ΚΓ3,1〇Λ 1〇一5。
【具体实施方式】
[0019] 下面结合附图和实施例对本发明进行详细说明,但本发明并不局限于具体实施 例。 实施例
[0020] 一种用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因,该基因核苷酸序列(217bp)如下所 示: CGTCCTGACTTCGCCATCGCGGGACACATCTGCTGCTGTTTACTACTTGTCTGTCTTCGCGGCCTTTCAACAC AAGTTCCGAGATGCAAGCGATCGACGAGATCTCTCTTACACCTTTATGCACGACTGTGACGTGGTGACCAGCACCAA TCACTGCGTAATTTTCTGTTTGCCAAACTTCTAATTATAAGCGCTCAAGTATGTGTACGTCATGGAA。
[0021] 所述用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因的制备方法: (1)野外采集嗜人按蚊成虫或幼虫,实验室条件饲养至性状稳定。
[0022] (2)采用宝生物DNA提取试剂盒(TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.5.0试剂盒(Code No. 9765))提取嗜人按蚊DNA。
[0023] (3)DNA标准样品的制备:将测定浓度后的DNA按2此/管进行分装,每种核酸分子标 样分装100管,然后冻干,待用。
[0024] (4)取制备的DNA标准样品,加入5〇tiL的Tris EDTA(TE),溶解后作为模板使用,经 采用特异性进行PCR并测序,进行定性分析,与近缘种中华按蚊进行比较,确认所制备的DNA 标准样品为所述DNA条形码标准基因样品。
[0025]对所述用于鉴定嗜人按蚊的DNA条形码标准基因进行DNA完整性、均匀性、稳定性 测试: 1.DNA标准基因质量及完整性检测 取制备的DNA,进行凝胶电泳、纯度及浓度检测。
[0026] (1 )DNA完整性检测:直接法-用提取的DNA直接电泳检查,120V,1.5%琼脂糖凝胶电 泳,观察条带的完整性,检测结果条带完整,无弥散状,说明DNA条带完整性较好。
[0027] (2)DNA浓度及纯度检测:紫外分光光度计法-吸取lyL DNA用分光光度计测定 260nm和280nm的吸收值,然后根据0D26Q/0D28Q值判断DNA纯度,并根据0D 26Q计算其浓度。按以
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